Antologa de Bioqumica.

Ciclo escolar 2009-2010

UNIDAD 1. CAMPO DE ESTUDIO DE LA BIOQUMICA. LA BIOQUMICA SE
ENCARGA DEL ESTUDIO DE LA VIDA A NIVEL MOLECULAR.
Propsito: Conocer el campo de estudio de la bioqumica.
Bohinski, Robert C. Bioqumica
(Versin en espaol de Ramn Elizondo Mata, UNAM)
Addison-Wesley Iberoamericana, 1991,739 pp.
CAMPO DE ESTUDIO DE LA BIOQUMICA
La qumica- es decir, la ciencia que estudia las propiedades de la materia y los
cambios que sta sufre- se divide en varias reas o campos que se traslapan
unos con otros: qumica orgnica, qumica inorgnica, fisicoqumica, qumica
analtica y otras. Como su nombre implica, la bioqumica estudia la qumica de
la vida en todas sus manifestaciones- animales, plantas, bacterias, etc.- e
incluso los virus que infectan a los seres vivos. La razn por la que se hizo
hincapi en las divisiones clsicas de la qumica es resaltar la extensa base de
la bioqumica, que es parte orgnica (en su mayora), en parte inorgnica, en
parte fsica y en parte analtica.
Hoy en da, la bioqumica se reconoce como una de las principales reas de la
qumica y es a la biologa lo que las matemticas a la fsica.
El avance de la bioqumica ha sido tan amplio y expansivo que en la actualidad
ya se aceptan diversas reas de especializacin: bioenergtica, biologa
molecular, bioqumica de las membranas, bioqumica de las protenas,
bioqumica de las plantas, neurobioqumica, qumica analtica y otras ms, as
como subespecialidades de cada campo.
Repaso de la teora molecular
Todos los organismos vivientes estn formados por sustancias qumicas de dos
tipos: inorgnicas y orgnicas. As, el primer enunciado de la unidad bioqumica
en el cual se har hincapi es:
Todos los organismos estn formados por los mismos tipos de
sustancias, ms o menos en idnticas proporciones, que realizan los
mismos tipos de funciones generales.
De hecho, en todos los organismos hay un compuesto inorgnico especfico
que constituye la sustancia ms importante para la vida: el agua.
Las principales clases de sustancias orgnicas_ protenas, cidos nucleicos,
carbohidratos y lpidos_ se conocen en general como biomolculas.
Casi todas las molculas estn formadas por slo seis elementos, todos de
naturaleza no metlica: oxgeno, carbono, hidrgeno, nitrgeno, fsforo y
azufre.
El estudio de estas biomolculas orgnicas esenciales es el meollo de la
bioqumica.
Cmo se sintetizan en la clula viva?
Cmo las degrada la clula?
De qu manera se relaciona su degradacin con la produccin de energa
qumica til dentro de la clula?
Cmo se produce esta energa?

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Cules son los mecanismos de interconversin de estas sustancias?
En que forma entran y salen de la clula?
Cmo se aslan en el laboratorio?
De qu modo se sintetizan en el laboratorio?
Cul es su estructura molecular?
Qu funciones especficas realizan?
Cul es la explicacin de su funcionamiento en trminos de su estructura
molecular?
De que manera se controlan los genes cromosmicos para que regulen la
individualidad bioqumica de un organismo?
Cmo es posible modificar la informacin gentica de un organismo a travs
de manipulaciones en el laboratorio?
En que forma se comunican qumicamente las clulas entre s?
Cules son las explicaciones del estado anormal, es decir, de las condiciones
patolgicas, incluso de las enfermedades mentales?
Cmo funcionan los antibiticos, los agentes antivirales, las sustancias
psicotrpicas, los agentes inmunosupresores y otros medicamentos?
Qu diferencias bioqumicas existen entre las clulas normales y las
cancerosas?
Qu procesos bioqumicos permiten explicar la transformacin de una clula
normal en una cancerosa?
De que manera puede mejorar el diagnstico mdico con el uso de criterios
bioqumicos precisos?
En que forma regulan las hormonas las actividades de un organismo y de que
otros mecanismos disponen las clulas para autorregularse?
Regresando a la composicin qumica de las clulas vivas, conviene consultar
ahora la tabla 1.1 aunque los datos corresponden a la composicin estimada
de la bacteria unicelular Escherichia coli, los valores no difieren mucho de los
otros organismos, incluso del ser humano. Sin embargo, en el nivel celular la
composicin de una clula de E.coli es muy diferente a la de un hepatocito, la
cual es distinta a su vez de la de un adipocito, y as sucesivamente.
Con base en los datos de la tabla 1.1 se pueden establecer otras
generalizaciones interesantes.
Las clulas contienen una mayor variedad de protenas que de cualquier otra
sustancia.
Alrededor del 50 % de la materia slida de una clula est formada por
protenas (15 % del peso hmedo)
Las clulas contienen mucho ms molculas de protenas que de DNA.
La mayor biomolcula de la clula es el DNA.
E.coli y otras bacterias similares slo poseen un cromosoma, es decir, una sola
molcula de DNA. (La relacin 1:1 entre los cromosomas y las molculas de
DNA significa que cada clula diploide del ser humano contiene en su ncleo
46 molculas diferentes de DNA.)
Alrededor del 99 % de las molculas de la clula son de H 2O.
Segn el punto seis de la lista, cabe decir que la ciencia de la bioqumica slo
se relaciona con el 1 % de las molculas especficas que conforman ese 1 % y
la totalidad de los fenmenos qumicos en los cuales intervienen son
particulares en cada clula.

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tabla 1.1 Composicin Qumica aproximada de una clula de E.coli
rpida
Porcentaje Peso molecular
Nmero
en peso
promedio
aproximado de
hmedo
(g/mol)
molculas por
a
total
clulab
Agua
70
18
4X1010
Protenas
15
10 000-100 000
2-3 X106
9c
RNA total 7 %
1
2.5 X 10
24
y DNA*
RNAd
6
RNA
5S
40 000c
30 000
ribosomal
RNA 16 S
500 000c
30 000
ribosomal
RNA 23 S
1X106c
30 000
ribosomal
RNA
de
25 000
400 000
transferencia
RNA
105-106
100 000
mensajero
Carbohidratos
3
150(excluyendo
2X108
y metabolitos
polmeros)
Lpidos
y
2
750
2.5X107
metabolitos
Iones
1
40
2.5X108
inorgnicos
(minerales)
Aminocidos
0.8
120
3X107
y metabolitos
Nucletidos y
0.8
300
1.2X107
metabolitos
Otros
0.4
150
1.5X107

en divisin
Tipos de
molculas
por clulab
1
2000-3000
1
1
1
1
40
1000
200
50
20
100
200
200

Los valores aproximados son aplicables a la mayor parte de los organismos

vivos que existen en un estado normal.
Los nmeros de algunos materiales varan en forma considerable de las clulas
bacterianas a las clulas de los organismos superiores.
Las sustancias correspondientes tienen mayores dimensiones en las clulas de
los organismos superiores.
En las clulas de las plantas y los animales existen otras clases de RNA.
Aunque en el estudio de la bioqumica se hace hincapi en las sustancias
orgnicas, tambin son importantes los elementos y compuestos inorgnicos
(los llamados minerales). De hecho, algunos de esos minerales son nutrientes
esenciales para todos los organismos y deben estar presentes en los alimentos
o en el medio circundante. Los elementos inorgnicos se encuentran en sus
formas inicas (Tabla I.2), de modo que existen como iones libres o estn
unidos a una sustancia orgnica, pero por ahora no se enumerarn los muchos

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y variados procesos en los cuales intervienen: simplemente se har un
enunciado cuya explicacin vendr ms adelante.
Las funciones vitales de ciertos iones inorgnicos
relacionadas con su efecto sobre la actividad de las protenas.

estn

Todos los minerales que se presentan en la tabla I.2 son nutrientes esenciales
para los seres humanos y, con excepcin del yodo, tambin para los dems
seres vivos. En diversos organismos se han detectado cantidades diminutas de
casi una docena de otros elementos. No obstante, la importancia de varios de
ellos an no queda clara, de modo que la investigacin en el campo de la
nutricin es muy intensa. Por ejemplo, hace poco los cientficos descubrieron
que el nquel (Ni), el silicio (Si) y el selenio (Se) son elementos esenciales,
aunque en cantidades diminutas, para varios organismos entre los que est el
ser humano.
TABLA I.2 Lista parcial de las sustancias inorgnicas con importancia biolgica
ELEMENTO (FORMA INICA)
Calcio (Ca+2)
Cloro (Cl-1)
Cobalto (Co+2)
Cobre (Cu+1, Cu+2)
Yodo (I-1) slo en vertebrados
Hierro (Fe+2, Fe+3)
Magnesio (Mg+2)
Manganeso (Mn+2)
Molibdeno (Mo+6)

ELEMENTO (FORMA INICA)

Fsforo (H2PO4-1, HPO4-2)
Potasio (K+1)
Sodio (Na+1)
Azufre (SO4-2, S-2)
Zinc (Zn+2)

La bioqumica es un campo muy extenso. De hecho, resulta apabullante hasta

para quienes ostentan el ttulo de bioqumicos profesionales.
La historia moderna de la humanidad est repleta de hechos notables y
admirables (y algunos no tan admirables) en las reas de la ciencia, la
ingeniera, la medicina, la agricultura, las comunicaciones, la exploracin
espacial, el avance social, la economa y las artes, y en el futuro se
acumularn muchos ms. Sin embargo, de todo el progreso previsible, el
mayor impacto puede provenir del anhelo de aprender cmo funcionan los
organismos vivos en trminos de las molculas que los integran, de la ulterior
manipulacin de esas molculas y, por consiguiente, de la manipulacin de
esas molculas y, por consiguiente, de la manipulacin del organismo en s.
Quiz esta aseveracin suene exagerada, pero este tipo de logros ya es una
posibilidad real en el futuro. La mdula de esa bsqueda es el conocimiento
bioqumico.
En este curso nos centraremos en los siguientes puntos o campos que
estudia la bioqumica:
1. Las molculas formadoras de las estructuras de las clulas.
2. La manera en que los seres vivos obtienen sus nutrientes y los
transforman en molculas capaces de formar parte de sus propias
estructuras.

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3. Los mecanismos a travs de los cuales los seres visos obtienen
energa para realizar sus procesos vitales.
4. Los procesos a travs de los cuales se comunican las clulas.
5. Los mecanismos involucrados en el almacenamiento y la
transmisin de la informacin gentica en los seres vivos.