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Queremos proponer una estructura para la sal del cido desoxirribonucleico (ADN). Esta
tiene caractersticas novedosas que poseen un considerable inters biolgico. Pauling y
Corey han propuesto ya una estructura para el cido nucleico. Amablemente han puesto a
nuestra disposicin el manuscrito que estn a punto de publicar. Su modelo consiste en tres
cadenas entrelazadas, con los fosfatos cerca del eje de la fibra, y las bases en el exterior. En
nuestra opinin, esta estructura es insatisfactoria por dos razones: 1) Creemos que el
material que aparece en las imgenes de rayos X es la sal y no el cido. Sin los hidrgenos
de los cidos no queda claro que fuerzas mantendran unida la estructura, en especial,
cuando las cargas negativas de los fosfatos prximos al eje se repeleran entre si. 2)
Algunas de las distancias de Van der Waals seran demasiado pequeas. Otra estructura de
cadena triple ha sido propuesta tambin por Fraser (en prensa). En su modelo los fosfatos
estn en el exterior y las bases en el interior, unidas unas a otras por enlaces de hidrgeno.
Esta estructura, descrita de este modo, est bastante mal definida, y por esta razn no la
comentaremos.
Deseamos presentar una estructura diferente para la sal del cido desoxirribonucleico. Esta
estructura tiene dos cadenas helicoidales enrolladas alrededor del mismo eje (ver
diagrama). Hemos hecho las suposiciones qumicas ya conocidas, a saber, que cada cadena
est formada por dos grupos fosfodiester uniendo 9 residuos de -desoxirribofuranosa con
enlaces 3-5. Las dos cadenas (pero no sus bases) estn unidas por una pareja situadas
perpendicularmente al eje de la fibra. Ambas cadenas siguen hlices dextrgiras, pero
debido a los pares de bases ambas secuencias de tomos en las dos cadenas siguen sentidos
opuestos. Cada cadena se asemeja vagamente al modelo n 1 de Furberg, esto es, las bases
estn en el interior de la hlice y los fosfatos en el exterior. La disposicin del azcar y los
tomos cercanos se aproxima a la configuracin estndar de Furberg, estando los azcares
aproximadamente perpendiculares a las bases a las que estn unidas. Hay un residuo en
cada cadena cada 3.4 en la direccin z. Hemos supuesto un ngulo de 36entre 12 los
residuos adyacentes de la misma cadena, la distancia de los tomos de fsforo al eje de la
fibra es de 10. Como los fosfatos estn en el exterior, los cationes tienen fcil acceso a
ellos.
La estructura es abierta, y su contenido en agua es ms bien alto. Al reducir el contenido en
agua deberamos esperar que las bases se inclinaran de modo que la estructura podra
hacerse ms compacta.
La caracterstica novedosa de la estructura es la manera en que las dos cadenas se
mantienen unidas por las bases pricas y pirimidnicas. Los planos de las bases son
perpendiculares al eje de la fibra. Estn unidas en parejas, una base de una cadena forma
enlaces de hidrgeno con una base de la otra cadena, de modo que las dos se sitan al lado
una de otra con idntica coordinacin. Para que la unin tenga lugar una de la pareja debe
ser una purina y la otra una pirimidina. Los enlaces de hidrgeno se forman del siguiente
modo: la posicin 1 de la purina frente a la posicin 1 de la pirimidina y la posicin 6 de la
purina frente a la posicin 6 de la pirimidina.