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UNA ESTRUCTURA PARA EL CIDO DESOXIRRIBONUCLEICO.

Queremos proponer una estructura para la sal del cido desoxirribonucleico (ADN). Esta
tiene caractersticas novedosas que poseen un considerable inters biolgico. Pauling y
Corey han propuesto ya una estructura para el cido nucleico. Amablemente han puesto a
nuestra disposicin el manuscrito que estn a punto de publicar. Su modelo consiste en tres
cadenas entrelazadas, con los fosfatos cerca del eje de la fibra, y las bases en el exterior. En
nuestra opinin, esta estructura es insatisfactoria por dos razones: 1) Creemos que el
material que aparece en las imgenes de rayos X es la sal y no el cido. Sin los hidrgenos
de los cidos no queda claro que fuerzas mantendran unida la estructura, en especial,
cuando las cargas negativas de los fosfatos prximos al eje se repeleran entre si. 2)
Algunas de las distancias de Van der Waals seran demasiado pequeas. Otra estructura de
cadena triple ha sido propuesta tambin por Fraser (en prensa). En su modelo los fosfatos
estn en el exterior y las bases en el interior, unidas unas a otras por enlaces de hidrgeno.
Esta estructura, descrita de este modo, est bastante mal definida, y por esta razn no la
comentaremos.
Deseamos presentar una estructura diferente para la sal del cido desoxirribonucleico. Esta
estructura tiene dos cadenas helicoidales enrolladas alrededor del mismo eje (ver
diagrama). Hemos hecho las suposiciones qumicas ya conocidas, a saber, que cada cadena
est formada por dos grupos fosfodiester uniendo 9 residuos de -desoxirribofuranosa con
enlaces 3-5. Las dos cadenas (pero no sus bases) estn unidas por una pareja situadas
perpendicularmente al eje de la fibra. Ambas cadenas siguen hlices dextrgiras, pero
debido a los pares de bases ambas secuencias de tomos en las dos cadenas siguen sentidos
opuestos. Cada cadena se asemeja vagamente al modelo n 1 de Furberg, esto es, las bases
estn en el interior de la hlice y los fosfatos en el exterior. La disposicin del azcar y los
tomos cercanos se aproxima a la configuracin estndar de Furberg, estando los azcares
aproximadamente perpendiculares a las bases a las que estn unidas. Hay un residuo en
cada cadena cada 3.4 en la direccin z. Hemos supuesto un ngulo de 36entre 12 los
residuos adyacentes de la misma cadena, la distancia de los tomos de fsforo al eje de la
fibra es de 10. Como los fosfatos estn en el exterior, los cationes tienen fcil acceso a
ellos.
La estructura es abierta, y su contenido en agua es ms bien alto. Al reducir el contenido en
agua deberamos esperar que las bases se inclinaran de modo que la estructura podra
hacerse ms compacta.
La caracterstica novedosa de la estructura es la manera en que las dos cadenas se
mantienen unidas por las bases pricas y pirimidnicas. Los planos de las bases son
perpendiculares al eje de la fibra. Estn unidas en parejas, una base de una cadena forma
enlaces de hidrgeno con una base de la otra cadena, de modo que las dos se sitan al lado
una de otra con idntica coordinacin. Para que la unin tenga lugar una de la pareja debe
ser una purina y la otra una pirimidina. Los enlaces de hidrgeno se forman del siguiente
modo: la posicin 1 de la purina frente a la posicin 1 de la pirimidina y la posicin 6 de la
purina frente a la posicin 6 de la pirimidina.

Si se asume que las bases solo se encuentran en la estructura en la posicin tautomrica ms


plausible (es decir, en la forma ceto en lugar de la forma enol), nos encontramos entonces
con que solamente se pueden unir pares de bases concretos, estos pares son: adenina
(purina) con timina (pirimidina) y guanina (purina) con citosina (pirimidina).
En otras palabras, si una adenina es un miembro de la pareja, de cualquiera de las dos
cadenas, en este supuesto, el otro miembro debe ser la timina, de igual modo para la
citosina y la guanina. La secuencia de bases en una cadena no parecer tener restriccin.
Como quiera que slo se pueden formar pares de bases especficas, se deduce que, si damos
una secuencia de bases para una cadena la secuencia de la otra queda determinada
automticamente.
Se ha encontrado experimentalmente que la relacin entre el total de las adeninas y timinas
y la relacin entre guaninas y citosinas, est siempre prxima a la unidad es en cido
desoxirribonucleico.
Probablemente es imposible construir estas estructuras con el azcar ribosa en lugar de
desoxirribosa a causa de que el tomo extra de oxgeno podra dar lugar a contactos por
fuerzas de Van der Waals demasiado prximas.
Los datos de los rayos X publicados hasta ahora a cerca del cido desoxirribonucleico son
insuficientes para poner a prueba nuestra estructura de forma rigurosa. Todo lo ms que
podemos decir es que es bastante compatible con los datos experimentales, pero no debe ser
considerada como probada hasta que no haya sido analizada de nuevo con datos ms
exactos. Algunos de estos datos se darn en prximas comunicaciones. No conocamos al
detalle los resultados de los estudios de rayos X cuando vislumbramos la estructura, la cual
se basa principalmente, aunque no por entero, en los datos experimentales publicados y en
principios estereoqumicos.
No se nos escapa que el apareamiento especfico que hemos propuesto sugiere de inmediato
un posible mecanismo de copia para el material gentico.
Los detalles completos de la estructura, incluyendo las condiciones que hemos supuesto en
su construccin, junto con los valores de las coordenadas de los tomos, se publicarn ms
adelante.
Estamos en deuda con el Dr. Jerry Donohue por sus constantes consejos y crticas,
especialmente en lo referente a las distancias interatmicas . Nos ha sido de gran ayuda el
conocimiento general de los resultados experimentales no publicados y las ideas de Dr.
M.H.F. Wilkins, y la Dra. R.E. Franklin y sus colaboradores del Kings Collage de Londres.
Uno de nosotros (J.D.W.) ha sido ayudado (becado) por una Asociacin de la Fundacin
Nacional de Parlisis Infantil.

ESTRUCTURA MOLECULAR DE LA DESOXIPENTOSA EN LOS ACIDOS


NUCLEICOS

Mientras que las propiedades biolgicas de la desoxipentosa en los acidos nucleicos


sugieren una estructura molecular que contengan gran complejidad, estudios de difraccin
de rayos X descritos aqu (cf. astbury) muestran la configuracin molecular bsica tiene
gran simplicidad.
El propsito de esta comunicacin es describir, de forma preliminar, algunas de las pruebas
experimentales para la cadena de polinucleotidos y configuracin helicoidal, siendo
existentes en esta forma cuando est en su estado natural.

La estructura de la desoxipentosa en los cidos nucledos es el mismo en todas las especies


(aunque la base de nitrgeno en algunos se puede alterar considerablemente) de
nucleoprotena, extrados en las clulas, y purificado nucleado en el mismo grupo lineal de
cadenas de polinucleotidos puede paralelamente en distintos medios dar cristalino, semicristalino o de material paracristalino.
Orientado la desoxypentosa de material paracristalino de los cido nucleico (estructura B",
en la siguiente comunicacin de Franklin y gosling) da un diagrama de fiebre tal como se
muestra en la Fig. 1. (cf. ref. 4). Correspondi al internucleotido de la fiebre que se repiten
a lo largo del eje. Los 34 A, sin embargo, no se deben repetir polinucleotidos en
composicin, pero a la cadena configuracin repetir, lo que provoca fuertes como la
difraccin las cadenas.
Se puede demostrar (tambin trazos, no publicado) que la distribucin de intensidad en el
patrn de difraccin de una serie de puntos espaciados uniformemente a lo largo de una
hlice est dada por los cuadrados de las funciones de Bessel. Una hlice continua uniforme
da una serie de lneas de capa de separacin correspondiente al paso de hlice, la
distribucin de intensidad a lo largo de la lnea de capa ensima es proporcional al
cuadrado de JN, la funcin de Bessel de orden n.
Una lnea recta puede ser dibujada aproximadamente por el interior de cada uno de los
mximos funcin de Bessel y el origen. El ngulo de esta lnea hace con el ecuador es
aproximadamente igual al ngulo entre un elemento de la hlice y el eje de la hlice. Si una
unidad repite n veces a lo largo de la hlice habr una reflexin meridional (Jo2) en la lnea
de capa ensima. La configuracin helicoidal produce secundarios bandas en esta
frecuencia fundamental, siendo el efecto de reproducir la distribucin de intensidad sobre el
original alrededor del origen nuevo, en la lnea de capa ensima, correspondiente a C en la
fig. 2

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