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Por su uso suelen utilizarse en las siguientes tres reas, sin embargo existen muchas
otras como la de finanzas, ciencias etc.
trmicos, como la desnaturalizacin. Por otra parte es el nico que ha salido airoso de la
mayora de las comparaciones con resultados experimentales que se han realizado.
Para comenzar definiremos la variable yn que indica la distancia entre las dos bases que
forman el n-simo par de la cadena de ADN. Ahora definiremos el modelo de Peyrard y
Bishop como el siguiente Hamiltoniano:
A partir de este bastar con utilizar las ecuaciones de Hamilton para encontrar las del
movimiento yn y su variable conjugada pn. El hamiltoniano es un objeto matemtico en
base al cual se escribe un sistema de ecuaciones diferenciales ordinarias de primer
orden. Es ms fcil de resolver que las ecuaciones de Lagrange que son de segundo
orden y est reduccin del orden del sistema se logra substituyendo variables de las
velocidades generalizadas por unas variables abstractas de momentum (tambin
conocidas como momentos conjugados). As por cada velocidad generalizada, hay un
momento conjugado correspondiente.
Ahora veamos lo que representa cada trmino.
El potencial V (y) describe la interaccin entre las bases de un par. Utilizaremos un
potencial de Morse para este fin porque representa de manera sencilla los
comportamientos fundamentales de los enlaces entre bases.