REGULACIN DE LA EXPRESIN GNICA 2012

A partir de un mismo genoma, del generado en el cigoto, se pueden generar distintos tipos de
clulas en el humano y el cmo se produce esto, est explicado por la expresin diferencial:
Cundo: algunos se expresan en distintas etapas del desarrollo
Dnde: No todas las clulas expresan los mismos genes, cada tipo celular expresa un pool de genes.
Cmo: No todos se expresan igual siempre, el mismo gen se expresa de maneras distintas en etapas
diferentes del desarrollo. El splicing alternativo es un ejemplo de esto, ya que para el mismo gen se
pueden formar diferentes productos proteicos.
Cunto: Algunos genes se expresan en mayores o menores cantidades que el resto.
Segn estos parmetros la expresin de los genes se dividen en dos grupos:
1) Expresin constitutiva:
Genes housekeeping, son fundamentales para la sobrevivencia de cualquier tipo celular, y
cumplen funciones comunes en todas las clulas. En teora se expresan en igual cantidad en
todas las clulas. Por ejemplo: Genes que codifican para enzimas ribosomales.
2) Expresin regulada:
Genes que tienen control espacial (en algunos tipos celulares y otros no, o que en algunos
tipos celulares codifican para protenas de membrana y en otros, protenas de secrecin), y
control temporal (desarrollo diferencial, etapa del ciclo celular, expresin inducible).

Niveles de control de la expresin gnica:

Control pre-transcripcional: La cromatina tiene diferentes grados de condensacin y es

previo a la transcripcin. La cromatina ms condensada es la heterocromatina y la menos
condensada es la eucromatina, pero no toda la eucromatina necesariamente se expresa.
Control transcripcional: La decisin en los genes que se expresan son reguladas por
mecanismos transcripcionales que determinan en qu momento se expresa un gen
determinado. Por ejemplo: Los promotores de genes.
Control transcripcional: El transcrito primario (Pre ARNm), originado luego de la transcripcin
del ADN, debe pasar por controles post transcripcionales para formar un ARNm maduro.
Control en el transporte: No necesariamente todo el ARNm que fue sintetizado se
transportar al citoplasma para ser traducido.
Control traduccional: Al llegar al citoplasma, no necesariamente es traducido el ARNm
maduro que llega.

Una vez formada la protena, puede ser regulada por Modificaciones post-traduccionales,
Control de la degradacin proteica y Control en la destinacin de la protena.
Adems de todos los mecanismos de control ya expuestos, el ARNm puede ser controlado en el
desarrollo, ya que pueden ser inducidos a degradarse en momentos determinados en ciertos
momentos del desarrollo.
Todos estos mecanismos permiten:

Seleccionar los genes que se expresan

Regular la tasa de expresin gnica, es decir, la cantidad de genes expresados
Regular la naturaleza del producto.

A nivel cuantitativo, el mecanismo ms influyente es a Nivel de transcripcin.

>>CONTROL PRE-TRANSCRIPCIONAL<<

Factores epigenticos: Factores que modifican el fenotipo sin alterar la secuencia del ADN,
permiten regular la actividad gnica y se pueden transmitir la divisin celular (Mitosis y
Meiosis).
Mecanismos que influencian la estructura de la cromatina, facilitando o dificultando la
expresin de los genes, mediante descondensacin y condensacin respectivamente.
Mecanismos por modificaciones covalentes del ADN(Metilacin en C-G) y de histonas
Histonas (metilacin (K y R), acetilacin (K), fosforilacin (S y T), ubiquitinacin (K),
sumoilacin (K), ADP ribosilacin, glicosilacin, etc.)

ESTRUCTURA NUCLEAR
La cromatina en el interior del ncleo se encuentra rodeada por la envoltura nuclear. Esta cromatina
posee sectores que pueden transcribir y formar RNA, por lo cual es posible establecer que en el
interior del ncleo hay una compartimentalizacin funcional:

Heterocromatina: cromatina localizada en la regin perifrica del ncleo, la cual no posee

actividad de transcripcin La heterocromatina no se halla en la zona correspondiente a los
poros nucleares ya que de ser as, impedira el transporte mediante la carioteca.
Eucromatina: cromatina localizada en el centro del ncleo y mucho ms laxa que la
heterocromatina, lo que permite la transcripcin.

Adems, hallamos en el ncleo una-o ms- estructuras llamada nuclolo, en el cual se transcriben
los genes para las subunidades ribosomales y se ensamblan las subunidades ribosomales. Son
densas debido a la presencia de protenas (subunidades ribosomales).

Cmo saben los segmentos de ADN en qu zona del ncleo se debe hallar? Eso
an no se conoce, se sabe qu tipo modificaciones sufre el ADN pero se
desconoce la causa de ellas. Es importante mencionar que cada cromosoma
ocupa un territorio discreto dentro del ncleo, lo que se conoce como
territorios cromosmicos. Los cromosomas ricos en genes tienden a ubicarse
ms hacia el centro del ncleo (eucromatina) y los cromosomas pobres en
genes, por lo general, se hallan en la periferia (heterocromatina). Adems, dentro de cada territorio
cromosmico hay distintos niveles de condensacin de la cromatina.
Los territorios cromosmicos no son rgidos, esto permite que haya
expresin diferencial de genes entre las clulas. Los genes que se estn
expresando, se exponen hacia la periferia del territorio cromosmico y
los genes que no se estn expresando, se encuentran enterrados en el
territorio cromosmico, para esto, se forman los llamados Loops de
cromatina, que son los genes que se proyectan al exterior del territorio
cromosmico.
En el siguiente ejemplo se muestra el cambio de localizacin de los genes cuando estos se estn
expresando o no en distintas clulas:
En verde, es posible diferenciar el territorio cromosmico del cromosoma que posee el gen
estudiado, a la izquierda se muestra en una clula que posee mayor transcripcin del gen y ste se
halla fuera de su territorio cromosmico (flecha amarilla), en cambio en la segunda imagen, en la
cual, la clula tiene un nivel de transcripcin mucho menor para el gen, ste se encuentra enterrado
en su territorio cromosmico

La formacin de loops puede cumplir varias funciones adicionales, por ejemplo:

Los genes que codifican para la - y -globina de la hemoglobina se encuentran en los cromosomas
16 y 11, si estos genes se transcribieran de manera independiente, podran generarse, por ejemplo
mil -globina y un milln de -globina, por tanto habra un desperdicio de energa al generar globina que no podr ser utilizada en la formacin de molculas de hemoglobina ya que la

proporcin entre - y -globina es equimolar, se ha visto que los loops de ambos genes en sus
respectivos cromosomas, se proyectan hacia una misma regin dentro del ncleo y su expresin es
coordinada gracias a lo que genera una cantidad muy similar de ambas protenas.
Adems de la expresin coordinada, los loops son importantes para el Gene kissing, lo que permite
es acercar secuencias regulatorias a secuencias reguladas. Por ejemplo, la presencia de enhancers
que se hallan en direccin 5 o 3 e incluso en otros cromosomas. Gracias al Gene kissing es posible
acercar al enhancer hacia la regin promotora del gen en cuestin. Est relacionado con la expresin
de genes odorantes (percepcin del aroma), cada neurona olfatoria percibe un solo aroma pero
pueden haber muchas que perciban el mismo olor.
Las neuronas MOR28(Cromosoma 14), M50(Cromosoma7), M71(Cromosoma 9) expresan expresan
diferentes receptores odorantes los cuales son regulados en los tres casos por el enhancer H, para
que este enhancer pueda regular la expresin de genes en diferentes cromosomas es necesaria la
formacin de loops cromosmicos que acerquen el gen al enhancer.

Se sabe que existen patrones de modificacin del ADN y de las histonas, que permiten oscilar entre
cromatina muy condensada, poco condensada y muy poco condensada, estos son:

Metilacin del ADN: Consiste en agregar un metilo en la posicin 5 de citosina para generar
5-metilcitosina y esta modificacin se producen en regiones ricas en nucletidos C-G
(conocidos como Islas CpG, la p representa el enlace fosfodiester entre C y G). Las islas CpG
se hallan generalmenente en regiones promotoras de gen, pero no en todos.
La metilacin bloquea los sitios de unin para los factores de transcripcin en los promotores
de algunos genes, mediante la unin de Protenas de unin a metil-citosinas (MeCP) a
Citosinas metiladas en regiones promotoras, tambin inducira la desacetilacin de las
histonas.

La modificacin de los patrones de metilacin se alteran en dos momentos importantes con

desmetilaciones globales: En la Gametognesis (luego de la formacin de las clulas
primordiales germinales) comienza una etapa de desmetilacin global del Genoma, luego se
remetila de manera distinta en hombres y mujeres. Por tanto, el patrn de metilacin es
distinto en espermatozoides y ovocitos. Por otra parte, en el desarrollo embrionario
temprano hay desmetilacin global del genoma sin embargo, la diferencia entre la
remetilacin del material gentico de los gametos se mantiene en esta etapa, luego se
remetila de manera distinta el genoma de acuerdo a si es genoma embrionario o
extraembrionario
Modificacin covalente de histonas: Existen cinco tipos de histonas (H1, H2A, H2B, H3, H4) la
H1 conecta un nucleosoma con el siguiente. Estas histonas sufren modificaciones covalentes
(Acetilacin, Metilacin, fosforilacin), algunas se asocian con activacin y otras con
inhibicin de la transcripcin.
Se plante la Hiptesis del cdigo de las histonas que dice que hay combinaciones de
modificaciones que tienen un significado funcional especfico. En general, la acetilacin de las
histonas se relaciona con el aumento de la actividad transcripcional
La propagacin de las histonas se puede propagar entre nucleosomas vecinos, para evitar
que todo el ADN se metile, existen secuencias denominadas insulators que separan
dominios activos de inactivos de la cromatina. (La metilacin de un insulator impide su
funcin)

Ejemplo de regulacin pre-transcripcional:

Control sobre un conjunto de
genes:
En la hemoglobina, existen
subunidades . Pero a lo largo del
desarrollo del individuo se
expresan genes que codifican para
protenas globinas distintas (En la
imagen de arriba hacia abajo,
siendo y los definitivos en el
adulto. Cada gen tiene su propio
promotor y adems, secuencias
enhancers que a lo largo de la
ontogenia modifica a qu gen est
regulando.

Cuando se expresa uno de los genes de la imagen (como el por ejemplo en el cromosoma 11) el
resto se halla metilado y el que se est expresando est desmetilado.

Mecanismos de exclusin allica:

En humanos y otros mamferos, existen varios genes en que se expresan slo el alelo paterno o slo
el alelo materno, pero no ambos. El otro alelo es reprimido. Son heredables durante la mitosis y hay
de dos tipos:
1) Independiente de los ejes cromosmicos: se puede inactivar independientemente el paterno
o el materno.
2) Dependiente de los ejes cromosmicos (imprinting genmico o impronta): inactivacin no es
al azar, grupos de genes en que todos van a expresar solo el paterno o el materno.
Dependiente del origen parental.
1. Independiente de los ejes cromosmicos
A) Inactivacin del cromosoma X: En hembras de mamferos uno de los dos cromosomas X se
inactiva.
En 1959 Murray Barr describe que en las hebras de mamferos se observaba una especie de
punto negro en la envoltura nuclear,
posteriormente se logr establecer que esta
zona ms densa era el corpsculo de Barr que
consista en un cromosoma X condensado.
Lyon postul una hiptesis que deca que uno
de los dos cromosomas X de las hebras de
mamferos se inactiva al azar en embriognesis
temprana. Adems, esta inactivacin quedaba
fijada, es decir, en las clulas hijas de una clula
va a mantenerse inactivo el mismo cromosoma
X. Si hay ms de 2 cromosomas X, se mantiene
slo uno activo y los otros se inactivan. Se
cumple que todos los X 1 se inactivan al azar. Generando un X activo por genoma diploide.
Se forma un individuo con un mosaico celular, donde hay regiones en las que est activado el
cromosoma X materno y otras donde est activado el paterno.
Ejemplos:
Enfermedad de Duchene es una enfermedad ligada a X recesiva, en la cual hay una mutacin en el
gen codificante para la Distrofina (gen ms grande en el genoma humano de unos 2,4 Megapb), se
genera por aparicin de nodos por mutaciones, debido a su tamao. Este gen codifica la distrofina
que ancla el citoesqueleto de la fibra muscular a una serie de protenas de la membrana que a su vez
anclan la membrana con la matriz extracelular.

Si se carece de esta protena, las personas nacen normales, pero el estrs del movimiento y de la
contraccin muscular comienza a destruir al msculo, por lo que no puede caminar a los 4 aos,
aproximadamente y generalmente mueren en la adolescencia o antes de los 20 aos.
Se piensa que si uno de los cromosomas X tiene mutacin, se van seleccionando: las clulas que
tienen el alelo ms funcional sobreviven, pero no hay una inactivacin selectiva, sta es al azar.

Clulas con X mutado inactivo

Clulas con X mutado activo

Otro ejemplo de mosaico celular es por ausencia de glndulas sudorparas en mujeres heterocigotas
para un gen recesivo ligado a X.
Verde: Ausencia de glndulas
sudorparas

Un tercer ejemplo es el locus que codifica para el pigmento del pelaje en gatos, posee alelos para
pelaje naranjo y negro, los que son codominantes entre s, por lo que las hembras pueden expresar
ambos. (Blanco est en otro cromosoma).
Inactivacin:
El gen XIST (32 kb) se expresa slo en el cromosoma X que ser inactivado. Codifica para un RNA de
19 kb procesado y poliadenilado, el que cubre el cromosoma X por completo, sufriendo
modificaciones: metilacin, modificacin de las histonas como desacetilacin, metilacin, reemplazo
de histonas, etctera. De tal forma que alcanza una alta condensacin. Con lo que se inactiva un
cromosoma X, porque generalmente las especies hacen un balance en la expresin gnica, ya que
existen ms de 900 genes ms en las mujeres que en los hombres, porque el cromosoma X codifica

para ms de 1000 genes y el cromosoma Y codifica para menos de 100 genes. Pero este X que se
inactiva no lo hace completamente, hay genes que escapan del proceso de inactivacin, los que
estn fuera de la regin PAR, de tal forma que se exprese un nmero similar de genes en machos y
hembras.
Se ha visto que la inactivacin del cromosoma X involucra entre el 85-90% de los genes del mismo, o
sea, no se inactiva completamente. De la inactivacin escapan: Los genes de la regin PAR (que en el
brazo corto que es grande y hay una regin ms pequea en el brazo largo del cromosoma X) y
otros genes fuera de la regin PAR en el brazo corto.
Hay una alta riqueza de secuencias LINES en el cromosoma X, esta densidad es el doble al resto de
los cromosomas. Este RNA XIST al ser transcrito, se va depositando en estas secuencias LINES donde
los XIST actan ah. Los genes que escapan de la inactivacin del X estn en zonas con pocas
secuencias LINES, por lo tanto aparentemente los XIST inactivan primero los LINES y de ah van hacia
la vecindad.
En ratones se ha visto que la inactivacin del X en el trofoblasto no es al azar, sino que slo se
inactiva el cromosoma X paterno, pero no se sabe bien si es as en humanos.
B) Exclusin allica por reordenamiento programado de DNA: genes codificantes para
inmunoglobulinas y codificantes para linfocitos T sufren mecanismos de reordenamiento
(como splicing) pero a nivel del DNA, en un solo alelo.
C) Exclusin por mecanismos desconocidos: Ej: enhancer H.

2. Dependiente de los ejes cromosmicos

Impronta: No ocurre al azar y depende del origen cromosmico. Se establece en la Gametognesis
y se da en mamferos placentados, plantas e insectos.
La impronta se observ mediante la extraccin de un proncleo materno y se insert otro paterno,
generando un embrin diploide no viable con un desarrollo de placenta y anexos embrionarios
prcticamente normal, pero muy poco tejido embrionario. Al generar un cigoto diploide con
informacin proveniente slo de la madre se origina un embrin no viable con desarrollo de tejido
embrionario pero sin desarrollo de placenta. Ambos tipos de cigotos se comportan como tumores y
deben ser extrados. La razn de esto es la existencia de genes de expresin diferencial de acuerdo
al origen cromosmico.
Existe una patologa llamada Enfermedad de Angelman, en los cuales el 75% de ellos presentan una
delecin en el cromosoma 15 (transmitido por la madre), al observar el material gentico de
pacientes con otra patologa llamada Prade Willi, se encuentra la misma delecin en el cromosoma
15 (transmitido por el padre). Esto debido a que los genes que se ubican en el lugar de la delecin
presentan patrones de expresin gnica diferentes segn el progenitor.

Mapa de impronta en 15q11-q13:

Los genes en azul son transmitidos por el padre en forma no metilada. Los genes en gris estn
metilados en el padre o la madre, segn corresponda. Los genes en rojo son transmitidos por la
madre en forma no metilada y los genes en blanco son no metilados para ambos progenitores. Los
genes con impronta, son complementarios.
Los genes que son regulados por impronta (aproximadamente 80) y no estn metilados NO se
metilan y los que estn metilados NO se desmetilan (en etapas tempranas del desarrollo).
Causas de patologas con imprinting fallido:

Deleciones. prdida del alelo activo.

Disomas uniparentales. Nmero normal de cromosomas, pero con dos copias
cromosmicas proceden de un mismo progenitor.
Mutaciones en el centro del imprinting. Mutaciones de la secuencia que regula la
metilacin (centro de imprinting).
Alteraciones de las metilaciones por mecanismos desconocidos presentes durante el
desarrollo embrionario (reproduccin asistida).
>>CONTROL TRANSCRIPCIONAL<<

La transcripcin puede ser aumentada o disminuda por factores intracelulares o molculas de

sealizacin.
Los promotores son secuencias necesarias para el inicio de la transcripcin, cuentan con una caja
TATA y elementos ro arriba.
Los Potenciadores o enhancers son secuencias reconocidas por activadores transcripcionales
Los Silenciadores son secuencias reconocidas por inhibidores transcripcionales.
En la mayora de los genes, existe ms de un promotor para un gen determinado, lo que permite la
expresin diferenciada de los genes, si esto ocurre, se generan productos proteicos diferentes de
acuerdo al factor de transcripcin que llega al ADN, ya que cada factor se une en un determinado
promotor. Un ejemplo de esto son los receptores de Glucocorticoides.

>>CONTROL POST-TRANSCRIPCIONAL<<
Aqu hallamos el procesamiento de los ARNm:
Adicin de capuchn (cap) en extremo 5 (7-metilguanosina ): Estabilidad
Remocin de intrones. Splicing:
Edicin de RNAs
Poliadenilacin (cola Poli A) en extremo 3: Estabilidad
1) Splicing
Proceso mediante el cual se remueven los intrones desde los pre-ARNm, habiendo un corte y
empalme de exones.
Se produce un corte en el borde exn-intrn, luego se une la primera Guanina del intrn con una
Adenina (sitio conservado) del sitio llamado punto de ramificacin producindose una especie de
horquilla.
Existen secuencias conservadas que son: Sitio dador y aceptor de Splicing y el punto de
ramificacin que son necesarios para el Splicing. Dicho proceso es realizado por el spliceosoma que
est formado por 5 ARNsn y 150 protenas.
2) Splicing Alternativo
Algunos ARNm pueden ser procesados en ms de una forma, generando ARNm diferentes con
distintas combinaciones de exones (70% de los genes en humanos). Un ejemplo de esto es que el
gen de la calcitonina en la tiroides produce dicha hormona, sin embargo, en el cerebro, produce un
pptido relacionado con calcitonina.
A medidas que los organismos son ms complejos poseen un mayor nmero de mecanismos de
regulacin. El Splicing alternativo es regulado en tejidos diferentes y durante el desarrollo, su
regulacin depende de:
1. La presencia de secuencias exnicas e intrnicas.
Enhancers de splicing exnicos (ESE) o intrnicos (ISE). Aumentan.
Silenciadores de splicing exnicos (ESS) o intrnicos (ISS).Reprimen.
2. Activadoras (protenas) y represores (ribonucleoprotenas) que regulan el splicing mediante la
unin a las secuencias especficas.
3) Edicin del ARN
Se cambia unnucletido por otro lo que altera el producto de la traduccin, por ejemplo en el hgado
la ApoProtenaB100 es formada por Splicing en sus clulas, en cambio en el intestino, dicho gen
sufre edicin de su ARN y se cambia una Adenosina por un Uracilo, por lo que cambia la Secuencia
producida, produciendo un codn de trmino antes, acortando la secuencia y produciendo la
ApoProtenaB48.
Lo ms comn en humanos es cambiar una Adenosina por una Inosina, la Inosina es reconocida
como si fuese Guanina, sobretodo en el Sistema Nervioso.

4) Procesamiento y mecanismo de accin de los ARN pequeos (ARNsn, small nuclear)

Son familias de ARN que permiten regular la expresin gnica en distintos niveles. Existen diversos
ARNsn, los ms importantes son los que controlar la estabilidad del ARN y otros que controlan la
velocidad de la traduccin. Son transcritos en el ncleo y modificados en el citosol. Los ARNsn que
presentan una alta complementariedad de bases con ARNm son susceptibles a ser degradados por
nucleasas y los menos complementarios envan el ARNm a cuerpos-P donde ocurre su
almacenamiento y posterior uso. L os ARNsn, por tanto, disminuyen la transcripcin gnica.
Tambin se pueden unir cuando estn siendo traducidos los ARNm y con ello, detienen la
traduccin.
Por: Luis Felipe Aravena.