You are on page 1of 17

21/10/15

Universidade Estadual de Feira de Santana UEFS


Departamento de Cincias Biolgicas
Curso - Agronomia

Caractersticas Quantitativas
So em geral afetadas por muitos genes com um pequeno
efeito no fentipo

GENTICA QUANTITATIVA

Aula 15
BIO 136 Princpios de Gentica e Evoluo
Profa. Adriana Rodrigues Passos

NVEL HIERRQUICO DO TEMA EM ESTUDO

Cromossomos E DNA E informao


gentica (genes) E mitose e meiose

Os mtodos da GQ no so criados para identificar genes


e gentipos individuais
Utiliza-se de previses estatsticas baseadas em grupo de
indivduos

Conceitos
Gentipo
Fentipo
Locus (plural= loci)
Alelos
Indivduo homozigoto
Indivduo heterozigoto
Caracterstica dominante
Caracterstica recessiva

variao na expresso dos


genes

21/10/15

Como explicar essa variao?

Caractersticas qualitativas e quantitativas

Mendel

TIPOS DE VARIVEIS

Caractersticas qualitativas

Qualitativa
Classes fenotpicas distintas e facilmente separveis
Segregao descontnua

Classes fenotpicas distintas e facilmente separveis


Caractersticas apresentam segregao descontnua

Quantitativa
Fentipos extremos e intermedirios
Segregao contnua

Estudadas por Mendel


Geralmente governada por poucos genes (herana monognica)

21/10/15

Carter simples: Cor de flores


Ervilha: Pisum sativum
Codominncia ou

Efeito aditivo

Cor da ervilha
Cor da vagem
Forma da vagem

Caractersticas quantitativas

Distribuio descontnua

Caractersticas quantitativas

Classes fenotpicas descritas continuamente

Componentes de produo e resistncia durvel


s doenas

Caractersticas apresentam segregao contnua

Densidade bsica da madeira

Governada por muitos genes (herana polignica ou multifatorial)

Produo de semente
Volume cilndrico do tronco com casca

QTLs
Atuao de fatores ambientais afetando o fentipoE um nico gentipo
produz uma gama de fentipos

Comprimento de copa
Largura de copa
N0 mdio de ramos nos trs primeiros verticilos
Desrama natural

21/10/15

Atuao de fatores ambientais afetando o fentipoE


UM NICO GENTIPO PRODUZ UMA GAMA DE FENTIPOS

Caracterstica mais complexa: 3 locos


com efeito aditivo (trigo)

A expresso desses marcadores podem ser


alteradas por epistasia e interaes pleiotrpicas

Caractersticas de herana complexa:


efeitos genticos e no genticos
Efeitos genticos
em caractersticas
quantitativas

21/10/15

Tipos de caractersticas quantitativas


Tipos de caractersticas quantitativas

Caractersticas mersticas

Caractersticas com limiar

N0 limitado de fentipos distintos

Fentipo est presente ou ausente

Medidas em nmeros inteiros

A expresso depende de uma suscetibilidade adjacente

Tamanho de uma ninhada de camundongos


Quando maior que um valor de limiar, uma determinada caracterstica expressa

DIFERENAS ENTRE AS CARACTERSTICAS


QUANTITATIVAS E QUALITATIVAS

QUANTITATIVAS
So

controladas por muitos


pares de genes;
O efeito individual do gene
sobre a caracterstica
pequeno;
Sofrem grande influncia do
ambiente (P = G + E);
Tm distribuio fenotpica
contnua;

QUALITATIVA
So

controladas por poucos


pares de genes (geralmente
um);
O efeito individual do gene
sobre a caracterstica grande;
Sofrem pequena ou nenhuma
influncia do ambiente (P = G);
Tm distribuio fenotpica
discreta;

Mtodos estatsticos para anlise de


caractersticas quantitativas

21/10/15

Consideraes
Utiliza-se parmetros estatsticos e matemticos (mdias,
freqncias, varincias, correlao, etc.)

Distribuio de freqncias
Variao fenotpica em um grupo
Grfico das freqncias (n0 ou propores) de fentipos diferentes

A espcie (histrico, estrutura floral, modo de reproduo,


disperso)
Inferncias biolgicas (pretenso, objetivo (s), metas)
Critrios de seleo aplicados (parmetros biomtricos medio e anlise de dados biolgicos)
Anlise multivariada

Mdia
Amostras e populaes

D informaes sobre o centro da distribuio


Representatividade da amostra

Colees de indivduos REPRESENTATIVOS


Usar medidas feitas na amostra para descrever a populao

Distribution of height in 5000 British women:

Mean = 63.1 inches


1500
1250

Representatividade da amostra

1000
750
umber of Women
500
250
0

56 58 60 62 64 66 68 70 72
Height (inches)

In this graph, the column designated "62" includes all individuals with heights
between 61 and 63 inches, "64" includes all individuals with heights between 63
and 65 inches, and so on.

21/10/15

Varincia e Desvio Padro

Tipos de varincia

Indica a variabilidade de um grupo de medidas (amplitude da distribuio)


Distribuies podem ter a mesma mdia mas varincias diferentes
DP descreve a variabilidade de uma medida

Varincia fenotpica: a varincia total da populao.


Inclui efeitos genticos e no genticos.
n= # classes

" f i xi

Varincia gentica: as varincia que devida s


diferenas genticas existente entre os indivduos
da populao. Exclui a variao causada por fatores
ambeintais.

i=1

x=

" fi
i

n= # classes

Var( x ) =

" fi xi
i=1

" f i #1
i

Varincia

fenotpica

VP
=


Varincia


gentica

VG
+


Varincia


ambiental

VE

Varincia

ambiental

VE
=


Varincia
Varincia Varincia


Pai 1

Pai 2
F1

VP1
+ VP2
+ VF1







3

Varincia gentica = Varincia aditiva + Varincia de dominncia




VG

VP

VA

VD

VA + VD + VE

O que significam Varincia gentica aditiva e Varincia


gentica de dominncia?

Varincia aditiva = Varincia F2 a soma das VRC1 e RC2



VA

2VF2 - (VRC1 +VRC2)


Varincia dominncia = Varincia F2 VA - VE


VD

VF2 - VA - VE

21/10/15

Valores genotpicos

Efeito aditivo

So as mdias dos valores fenotpicos de cada


classe genotpica:

Por exemplo, se uma amostra populacional foi
separada em trs classes genotpicas, AA, Aa e aa, As
mdias dos valores fenotpicos de cada gentipo ser
o seu valor genotpico:

AA

33,7


Aa


21,5


aa


17,4

AA

Aa

aa

O valor genotpico do heterozigoto a mdia dos valores


genotpicos dos homozigotos. Cada alelo a adiciona um
valor constante, da o nome.

AO GNICA ADITIVA

Efeito de dominncia

Supondo:
A = 5; a = 3

Aa

Valor genotpico

12
10
8
6
4
2
0
1

AA

Nmero de alelos favorveis no gentipo

Teremos:
Gentipo

aa

Aa

AA

Valor genotipico

10

aa

O valor genotpico do heterozigoto igual ao valor genotpico de um


dos homozigotos. O alelo A domina sobre o alelo a, bastando
haver um nico A para a manifestao do fentipo.

21/10/15

2) Dominncia completa:
Supondo:
A = 5; a = 3
Valor genotpico

12

Efeito parcialmente dominante

Desvio
atribudo
dominncia

10
8

AA

6
4

Aa

aa

Mdia(Aa, aa)

0
1

Nmero de alelos favorveis no gentipo

O valor genotpico do heterozigoto est entre a mdia dos


valores genotpicos dos homozigotos e o valor de um deles.

Teremos:
Gentipo

aa

Aa

AA

Valor genotipico

10

10

Efeito de Sobredominncia

Interaes de Sobredominncia
u

O heterozigoto superior
aos homozigotos.
Permite uma maior
participao dos efeitos de
dominncia no carter
testado.
Importante para a seleo
de hbridos

Milho
hbrido

aa

AA

Aa

O valor genotpico do heterozigoto superior ao valor genotpico de


um dos homozigotos.

21/10/15

Relao dos Tipos de Ao Gnica



Ao Aditiva

caracteriza-se por ter cada gentipo um valor prprio;

detectando melhor os diferentes gentipos, o que fundamental
importncia para a seleo;

a que apresenta maior amplitude de variao entre os valores
dos gentipos segregantes;

propociona melhor resposta seleo, pois neste caso, a
descendncia semelhante aos genitores selecionados.

Ao de dominncia

os gentipos diferentes tem valores iguais;

a distribuio dos valores tendem a ser mais compacta nos
gentipos segregantes;

A heterozigose faz com que gentipos selecionados segreguem
para tipos inferiores.

VARIAO GENTICA

Outros complicadores

Epistasia = interao entre alelos de locos diferentes

Pleiotropia = efeito de um loco sobre mais de um



carter

Herdabilidade

(segregao, recombinao e interao de genes)

Intensidade com que o fentipo


expressa o gentipo

Saber o quanto da variao em uma caracterstica quantitativa


devido a DIFERENAS GENTICAS e o quanto devido a
DIFERENAS AMBIENTAIS
Pode ser definida no sentido amplo ou no sentido restrito, situando-se
a diferena no numerador da frao que define a herdabilidade

HERDABILIDADE

10

21/10/15

HERDABILIDADE

A variao gentica ou ambiental?


u

Cultive indivduos de
populaes com diferentes
mdias fenotpicas em um
mesmo ambiente

Cultive indivduos com o


mesmo gentipo em
diferentes condies

Pergunta:
u

Se duas populaes tm mdias fenotpicas


diferentes, a causa tem natureza gentica ou
ambiental?
Nature vs. Nurture (Natureza ou criao?)
Como saber?

Efeitos genticos
e no genticos
em caracteres
quantitativos



Expressos em termos
de varincia gentica
e no gentica

Herdabilidade

No sentido amplo

ha2= 2G/2F

h2= coeficiente de herdabilidade

11

21/10/15

Herdabilidade
Smbolo = h;

No sentido restrito

Valores = 0 a 1;
Seleo de um carter a partir
do seu fentipo;

hr2= 2A/2F

<50% = alta >50% = baixa


h2= coeficiente de herdabilidade

GERAO
P1
P2
F1
F2
RC1F1
RC2F1

CLASSES
43 46 49 52 55 58 61 64 67
7 2
1 1 3 4 3 5 5
3 8 11 3
1 1 5 3 14 17 18 34 13
9 5
4 1 3 2 1 5 2

(intervalo: 3 cm)
70 73 76 79 82 85 88 N
3 3 3 5 4
27
22
9 2 4 3 2 1 3 49
32 29 14 6 34 1 3 225
7 1 2 3 5 1 4 37
2
20

X
72,67
54,73
69,32
68,55
73,24
59,20

2
45,92
28,21
70,22
88,16
70,69
52,48

1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1

64
64
64
64
64
64
64
67
67
70
70
70
73
73

12

21/10/15

Programa Genes;
Menu utilitrios;
Acesso genes edit
Declarar os
parametros;
Processar;

Varincia fenotpica: 88,16


p= F2
88,16

Varincia aditiva: 53,15


2A = 2. 2P2 (2RC1F1 + 2RC2F1)
2A = (2. 88,16 (70,69 + 52,48)
53,15

Varincia genotpica: 40,05


2G = 2F2 - 2E
2G =40,05

Herdabilidade no sentido amplo:


45,42%
h2a= 2G / 2P
h2a = 40,05 / 88,16 = 45,42%

VAR.FENOTPICA
VAR. DE AMBIENTE
VAR. GENOTPICA
VAR. ADITIVA
HERDABILIDADE AMPLA(%)
HERDABILIDADE RESTRITA h(%)

88,159643
48,118453
40,04119
53,145886
45,418957
60,28369

Considera todos os componentes da varincia


gentica;

h = G
P

Herdabilidade restrito: 60,28%


h2r= 2A / 2F2
h2r =53,15 / 88,16
60,28%

13

21/10/15

Tabela 1. Anlise de varincia dos caracteres Florescimento (FLO), nmero de racemos por planta (NR), comprimento de racemo
(CR), peso de racemo (PR), peso de frutos por racemo (PFR), peso de sementes por racemo (PSR), nmero de frutos por racemo
(NFR), nmero de sementes por racemo (NSR), estatura de planta (EP), estande (ESTD) e peso de sementes por planta (PSPL). Cruz
das Almas, 2007.

FV
GL
Blocos 4
Trat
4
Resduo 16
CV(%)
Mdia
2P
2 E
2G
h2

FLO
NR
CR
2,16 10,24 1,39
78,16* 79,80* 25,09*
0,41 13,22 4,71
1,33 24,81 9,31
48,08 14,65 23,3
15,63 15,96 5,01
0,08
2,64
0,94
15,55 13,31 4,07
99,47 83,43 81,21

PR
31,82
5141,9*
210,60
17,20
84,33
1028,38
42,12
986,26
95,9

QM
PFR
PSR
15,56
16,27
*
4233,19 1688,9*
143,31
61,31
16,06
16,61
74,54
47,12
846,63
337,79
28,66
12,26
817,97
325,53
96,61
96,37

NFR
2,94
233,59*
14,87
14,57
26,46
46,71
2,97
43,74
93,63

NSR
16,44
1618,3*
124,98
15,38
72,64
323,67
24,99
298,68
92,27

EP
ESTD
0,04 21,04
0,22* 37,64*
0,05 21,21
11,33 26,41
2,07 17,44
0,04
7,52
0,01
4,24
0,03
3,28
75,46 43,63

* Significativo a 5% de probabilidade pelo teste F

Ganho com a seleo

PSPL
0,01
0,11*
0,16
25,08
0,51
0,02
0,003
0,01
85

Houve diferena significativa entre as cultivares para os


caracteres avaliados, identificados atravs do quadrado mdio
esperado.

Os caracteres que apresentaram maior coeficiente de


herdabilidade foram o de florescimento e os caracteres PFR,
PSR e PR, indicando serem estes os caracteres mais
apropriados para a seleo de gentipos superiores, por serem
menos influenciados pelo efeito do ambiente no experimento
adotado.

Ganho com a seleo

O efeito bsico da seleo alterar as freqncias allicas e


consequentemente as freqncias genotpicas
Mudana mdia que a seleo provoca na populao:
Diferena entre um valor fenotpico mdio da descendncia
dos indivduos selecionados e a mdia da populao
antes da seleo

A resposta a seleo diretamente proporcional h2 do carter e


presso de seleo aplicada
Aumentar o ganho com a seleo obter estimativas mais altas de
h2E controle eficiente das condies de ambiente
Observar base genticaE aplicao de seleo muito forte
( indivduos selecionados)

GANHO GENTICO

14

21/10/15

Ganho com a seleo

Ganho com a seleo

A variabilidade medida pelo desvio-padroE propriedade da


populao e do carter (grama, metro, etc.)

O coeficiente de herdabilidade extremamente til e necessrio


para a obteno das estimativas do ganho com a seleo

Mm = M0 x Gs

Se a resposta e o diferencial de seleo forem expressos em


desvio-padro fenotpicoE resposta generalizada (comparao de
caractersticas e populaes diferentes)

Diferentes mtodos de seleo podem ser comparados

Gs= h2 x Ds

%Gs= Gs/M0 x 100

Gs = ganho com a seleo


H2 = coeficiente de herdabilidade
(Ds) = diferencial de seleo Ds =
Ds = Ms - Mo

Quanto > h2 < influncia do ambiente

Ganho com a seleo

Ganho com a seleo


Uso do ndice de seleo no melhoramento florestal

Intensidade de seleo i pode ser determinada por meio das propriedades


de distribuio normal, em funo de uma proporo de indivduos selecionados
previamente, possibilitando a estimao do ganho

Seleo de prognies ou de plantas individuais

Conjunto de caracteres
Anlise de vrios caracteres de naturezas
diversas simultaneamente
ANLISE MULTIVARIADA

Z p
x

Identificao de gentipos superiores


i= n0 desvios-padroE mdia dos indivduos selecionados supera a mdia
da populao, ANTES DA SELEO (predio do ganho)

15

21/10/15

Localizao de genes que afetam caractersticas


quantitativas

Caractersticas quantitativas e QTLs localizados


Organismo
Tomate

Caracterstica quantitativa
slidos solveis
massa do fruto
pH do fruto
crescimento
forma do folheto
altura

Milho

altura
tamanho da folha
nmero de brotos
rigidez do folheto
nmero de espigas

11
7
1
5
9

Feijo comum nmero de ndulos

Porco

1
1
2

QTLs
Mapeamento
Marcadores moleculares

Nmero de Genes
Importante no estudo da herana dos caracteres quantitativos e,
tambm, no melhoramento de plantas e animais, principalmente no
que se refere estimativa de probabilidade de se obter
determinado gentipo em uma populao segregante;
Um dos modos de se estimar o nmero de genes envolvidos por
meio da frequncia com que so recuperados os fentipos extremos
para a caracterstica considerada na gerao F2;

gordura abdominal
gordura do traseiro mdio
crescimento tamanho do
intestino delgado

QTLs detectados
7
13
9
5
9
9

Camundongo epilepsia

Rato

hipertenso

Nmero de Genes

Requisitos para a aplicao desta expresso


Os genitores devem ser homozigticos e completamente
contrastantes, ou seja, todos os alelos efetivos devem estar em um
dos genitores e todos os no efetivos, no outro:
Ausncia de interao gnica:

Pouco empregado quando se tem muitos genes envolvidos e,


tambm, muito influenciados pelo ambiente;

Todos os genes devem ter efeitos iguais e aditivos sobre a


expresso fenotpica do carter;

Para contornar esta dificuldade, as mdias e varincias devem


ser empregadas;

Ausncia de ligao.

n = (P1 P2)2
8 x VGF2

16

21/10/15

Carvalho, F.I.F; Silva, S.A; Kurek, A. J; Marchioro, V. S.


Estimativas e implicaes da herdabilidade como estratgia de
seleo. Ed e grfica Universitria, Pelotas, RS, 99p;
u

CRUZ, C.D; REGAZZI, A.J. Modelos Biomtricos Aplicados Ao


Melhoramento Gentico. Viosa-MG: Editora da UFV. 1994. 253 p.
u

uS OUZA-SOBRINHO,

Fausto de et al . Estimativas de
repetibilidade para produo de matria seca em alfafa. Cienc.
Rural , Santa Maria, v. 34, n. 2, 2004 . Disponvel em: <http://
w w w . s c i e l o . b r / s c i e l o . p h p ?
script=sci_arttext&pid=S0103-84782004000200030&lng=pt&nrm=
iso>. Acesso em: 01
Dez
2007. doi: 10.1590/
S0103-84782004000200030

17

You might also like