III.

INTRODUCCIN AL METABOLISMO
1. Generalidades
2. Termodinmica de los compuestos fosforilados
3. Termodinmica de los sistemas vivos

CMO OBTIENEN LAS CLULAS LA ENERGA Y EL PODER

REDUCTOR A PARTIR DE SU ENTORNO?
CMO SINTETIZAN LAS CLULAS LOS COMPUESTOS
FUNDAMENTALES DE SUS MACROMOLCULAS Y CMO SE
SINTETIZAN POSTERIORMENTE LAS PROPIAS MACROMOLCULAS?

Stryer et al. 2003

QU ES EL
METABOLISMO?

Metabolismo
Proceso mediante el cual los seres vivos adquieren y utilizan
la energa libre que requieren para realizar sus funciones
Es una actividad celular muy coordinada en la que muchos
sistemas multienzimticos cooperan para:
(1) Obtener energa qumica a partir de la captacin de la
energa solar o degradando nutrientes ricos en energa
obtenidos del ambiente
(2) Convertir molculas nutrientes en las molculas
caractersticas de la propia clula
(3) Polimerizar los precursores monomricos en
macromolculas protenas, c. nucleicos, lpidos, carbohidratos
(4) Sintetizar y degradar biomolculas requeridas en funciones
celulares especializadas
Nelson y Cox, 2005

LOS ORGANISMOS VIVOS SE DIVIDEN EN DOS GRUPOS SEGN LA

FORMA QUMICA A TRAVS DE LA QUE OBTIENEN CARBONO
DEL MEDIO

Quimitrofos (hetertrofos)

Fottrofos (auttrofos)

EL CARBONO, OXGENO Y AGUA SE CICLAN CONSTANTEMENTE ENTRE

LOS MUNDOS HETEROTRFICOS Y AUTOTRFICO, CON LA ENERGA
SOLAR COMO FUERZA MOTRIZ DE ESTE PROCESO GLOBAL

Obtienen su
energa de la
degradacin de
nutrientes
orgnicos
producidos por
los auttrofos

Obtienen
su energa
de la luz
solar
Autotrfos
fotosintticos

Hetertrofos

Nelson y Cox, 2005

Metabolismo
Es la suma de todas las transformaciones qumicas que se
producen en una clula u organismo, a travs de una serie de
reacciones catalizadas enzimticamente que constituyen las
rutas metablicas
CARACTERSTICAS

CADA PASO = CAMBIO QUMICO ESPECFICO

(Eliminacin, transferencia o adicin de un tomo o grupo funcional)

PRECURSOR

INTERMEDIARIOS

(METABOLITOS)

PRODUCTO

Donde la serie de reacciones qumicas se encuentran interrelacionadas

y acopladas y que tienen por objeto producir compuestos necesarios
para la vida celular

Stryer et al. 2003

CATABOLISMO.- Conjunto de reacciones que

convierten molculas (como si fueran
combustibles) en energa utilizable (producen
energa)

METABOLISMO

Vas catablicas: son de tipo degradativo.

Qumicamente son procesos oxidativos.
Suelen producir energa

ANABOLISMO.-Conjunto de reacciones que requieren

energa para producir molculas complejas
Vas anablicas: son rutas de biosntesis.
Qumicamente son procesos reductores.
Requieren un aporte de energa externo.

A
N
A
B
O
L
I
S
M
O

M
E
T
A
B
O
L
I
S
M
O

ENERGA

C
A
T
A
B
O
L
I
S
M
O

ANABOLISMO

REGULACION
METABLICA
ENERGA
CATABOLISMO

REGULACIN
DEL
METABOLISMO

CANTIDAD

ACTIVIDAD
CATALTICA

DISPONIBILIDAD
(RECAMBIO, LOCALIZACIN)

Caractersticas de las vas metablicas

Una va metablica est formada por una serie de reacciones en una
secuencia especfica que en su conjunto es termodinmicamente
favorable
Sin embargo, algunas de estas reacciones de la va pueden requerir
energa y otras liberarla
Las vas pueden estar compartamentalizadas celularmente (organelos,
citosol, membranales)
Las reacciones van a estar mediadas por enzimas, por eso, van a ser
especficas
Las vas metablicas pueden ser regulables. No todas las reacciones
de la va pueden regularse.
Esta regulacin puede darse por disponibilidad del sustrato, por
mecanismos de regulacin enzimtica (alosterismo, fosforilacin,
retroalimentacin, sntesis de la enzima misma, etc.), por factores
termodinmicos
En su conjunto, las vas metablicas son reversibles PERO TIENEN
POR LO MENOS UN PASO IRREVERSIBLE (PASO LIMITANTE)

LAS REACCIONES DE UNA VA METABLICA SE PUEDEN

VER SEGN SUS CARACTERSTICAS TERMODINMICAS.
Las reacciones termodinmicamente pueden ser:
G GRANDE Y NEGATIVA La reaccin transcurre en el
sentido (EXERGNICAS)
G=0

EL SISTEMA ESTA EN
EQUILIBRIO

G GRANDE Y POSITIVA La reaccin transcurre en el

sentido opuesto
(ENDERGNICAS)

LAS REACCIONES CERCANAS AL EQUILIBRIO

G CERCANO A 0
- SON REVERSIBLES
- Las enzimas que las catalizan tienen una actividad muy
alta y por tanto la actividad de la enzima no es un factor
limitante de la va.
- Son reacciones fcilmente reversibles y su actividad
depende de la relacin de [sustrato] y [producto].
La direccionalidad va a depender de cambios de
[sustrato] y [producto].
- LAS REACCIONES CERCANAS AL EQUILIBRIO, POCAS
VECES REGULAN EL FLUJO DE LA VA METABLICA

LAS REACCIONES ALEJADAS DEL EQUILIBRIO

G GRANDES Y NEGATIVOS
- SON IRREVERSIBLES
- Son poco sensibles a la variacin de [sustrato] y [producto]
- Las enzimas suelen ser alostricas
- LAS REACCIONES ALEJANAS DEL EQUILIBRIO SON LAS
QUE MAYORMENTE REGULAN UNA VA METABLICA

TIPOS DE REACCIONES QUMICAS DEL METABOLISMO

TIPO DE REACCIN

DESCRIPCIN

Oxidacin-reduccin

Transferencia de electrones

Formacin de enlaces con

requerimiento de hidrlisis de
ATP

Formacin de enlaces covalentes (ej. C-C)

Isomerizacin

Reorganizacin de tomos para formar

ismeros

Transferencia de grupos

Transferencia de un grupo funcional de

una molcula a otra

Hidrlisis

Rompimiento de enlaces con intervencin

del agua

Adicin o eliminacin de grupos

funcionales

Poner grupos funcionales a dobles enlaces

o eliminacin para formar dobles enlaces

MOLCULAS FUNDAMENTALES
EN LAS REACCIONES METABLICAS

Cuatro molculas fundamentales

en las reacciones metablicas
Donador de energa

Almacenador de
Poder reductor

Acarreador de
grupos acilo

La hidrlisis de ATP o de un compuesto fosforilado es una reaccin

comn para obtener energa.

LA VARIACIN DE ENERGA LIBRE EN LA HIDRLISIS DEL ATP ES GRANDE Y

NEGATIVA

FUNDAMENTO QUMICO DE LA ELEVADA VARIACIN DE ENRGA LIBRE

ASOCIADA A LA HIDRLISIS DE ATP

1) La hidrlisis disminuye
la repulsin de carga

2) El producto (Pi)
est estabilizado por la
formacin de un
hbrido de resonancia

3) El producto se ioniza
inmediatamente

Otros compuestos
fosforilados que
transfieren su
fosfato en
reacciones
celulares que
requieren energa

Otros compuestos
fosforilados que
transfieren su
fosfato en
reacciones
celulares que
requieren energa
TIOESTER

ESTABILIDAD POR
TAUTOMERIZACIN

ESTABILIDAD POR
RESONANCIA

ESTABILIDAD POR
RESONANCIA

EN LAS REACCIONES DE HIDRLISIS CON VARIACIONES

DE ENERGA LIBRE ESTNDAR GRANDES Y NEGATIVAS
los
PRODUCTOS SON MS ESTABLES QUE LOS REACTIVOS
1) La tensin de enlace en los reactivos debida a repulsin
electrosttica queda liberada por la separacin de carga
(ATP)
2) Los productos se estabilizan por ionizacin
3) Los productos se estabilizan por isomerizacin
4) Estabilidad por resonancia

ENERGAS LIBRES ESTNDAR DE HIDRLISIS DE ALGUNOS

COMPUESTOS FOSFORILADOS Y DEL ACETIL-CoA (un tioster)

La hidrlisis de ATP o de un compuesto fosforilado es una reaccin

comn para obtener energa.
Esta reaccin se acopla energticamente a otra reaccin que la requiera

Reaccin exergnica

Reaccin exergnica

LAS VARIACIONES DE ENERGA LIBRE ESTNDAR

SON ADITIVAS

Este principio explica por qu una reaccin termodinmicamente

desfavorable (endergnica) puede ser impulsada en el sentido directo
acoplndola a una reaccin muy exergnica a travs de un
intermediario comn.

FLUJO DE GRUPOS FOSFORILO

REGULACIN DE UNA VA METABLICA

ENFOQUE TRADICIONAL VS. TEORA DEL CONTROL METABLICO
ENFOQUE TRADICIONAL
Una va tiene uno o muy pocos
pasos regulacin, que se llaman
pasos limitantes o

TEORA DEL CONTROL METABLICO

No hay una enzima que sea la
responsable de regular el flujo de la va
El flujo de una va est controlado por
varias enzimas de las reacciones
que integran la va

Las enzimas limitantes o reguladoras Cada una tiene una contribucin que
depende de la concentracin de
se han propuesto con base en
intermediarios
mediciones in vitro, muy alejadas de
las condiciones fisiolgicas como
[intermediarios], efectores alostricos, Se basa en la medicin exptl. de una va
etc.
perturbando una enzima especfica y
viendo como se comporta el flujo de la va
(concentraciones de los otros metabolitos)
todos estos datos se tratan matemticamente y por eso es cuantitativa