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Departamento de Microbiologia

Instituto de Cincias Biolgicas


Universidade Federal de Minas Gerais
http://www.icb.ufmg.br/mic

Introduo Microbiologia Ambiental


Introduo
A microbiologia ambiental a interface entre as cincias ambientais e a ecologia microbiana. Estuda
os microrganismos e suas funes na conduo de processos nos sistemas naturais e prioriza os
efeitos provocados pela presena e atividade desses no meio ambiente. Com os avanos da biologia
molecular aumentou-se a habilidade de detectar e identificar microrganismos e suas atividades no
ambiente.
A diretriz principal da vida microbiana sua sobrevivncia, manuteno, gerao de ATP e crescimento. A grande diversidade de habitats fez com que os microrganismos estivessem sob diferentes
presses seletivas o que resultou na seleo de grande variedade metablica, fisiolgica e molecular. Considerando-se que microrganismos ambientais podem afetar vrios aspectos da vida, e so
facilmente transportados entre ambientes, as interfaces do campo de microbiologia ambiental tm
um nmero grande de diferentes sub-especialidades, incluindo solo, ambiente aqutico, qualidade
da gua, sade ocupacional e controle de infeces e microbiologia industrial.
Impacto dos microrganismos no ambiente
Os microrganismos so agentes primrios das mudanas geoqumicas. Algumas caractersticas que
possibilitam essa atuao ampla no ambiente so sua distribuio ubqua devido grande diversidade metablica e fisiolgica, pelo fato de serem pequenos e possurem grande rea superficial e as
altas taxas de atividade metablica e de crescimento.
Os microrganismos so elementos chave na ciclagem e liberao dos nutrientes e na manuteno
da composio qumica do solo, gua, sedimentos e atmosfera. Alm disso, so importantes na detoxificao de poluentes orgnicos e inorgnicos, sendo a base de muitas tecnologias emergentes
com aplicao ambiental e industrial.

Biogeografia
o estudo da distribuio da diversidade no tempo e no espao. Destina-se a revelar onde os organismos vivem, sua abundancia e o porque, ou seja, revela a diversidade e a atividade desses.

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Populao microbiana
Os ecossistemas so formados pelas comunidades biolgicas e pelos componentes abiticos. Cada
ecossistema apresenta uma diversidade de microrganismos distribudos em duas categorias:

1 Autctones ou indgenas, que so os microrganismos residentes e naturais daquele ambiente.

2- Alctones ou no indgenas, que so os microrganismos transitrios.
O ecossistema pode ser ocupado por microrganismos especializados metabolicamente e que so
restritos a um ambiente distinto.

Nicho Ecolgico
O nicho corresponde ao papel funcional do microrganismo na comunidade e suas caractersticas de
adaptao s condies ambientais. Cada espcie apresenta requerimentos nutricionais particulares, propriedades cinticas e potenciais bioqumicos. As caractersticas do microrganismo so determinantes da habilidade ou no de realizar uma funo particular no ambiente (Figura 1).

Figura 1. Representao de diferentes nichos ecolgicos determinados por requerimentos nutricionais

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Ecologia
o estudo da estrutura e da funo do ecossistema. A estrutura a composio da comunidade
biolgica, a quantidade e a distribuio dos componentes abiticos e a faixa gradiente das condies ambientais. J a funo envolve processos relacionados com o fluxo de energia, a ciclagem de
nutrientes e a regulao mtua dos organismos no ambiente.

Densidade Populacional
Corresponde ao nmero de indivduos por rea. Pode ser modificada por fatores abiticos, como
modificaes fsico-qumicas no meio, por fatores biticos, especialmente por relaes ecolgicas
como a competio, e pelas taxas de migrao, mortalidade e natalidade.
Biofilmes
uma forte associao de microrganismos atacados
com a produo de uma matriz extracelular polimrica (glicoclix). So sistemas microbianos organizados, que consistem em camadas de clulas microbianas que se desenvolvem sobre superfcies slidas.
A complexidade de um biofilme dependente dos
recursos energticos disponveis.

Figura 2. Etapas da formao do biofilme: Colonizao inicial por um nico tipo bacteriano (1) Desenvolvimento de camadas de diferentes microrganismos (2 e 3)

Os biofilmes possibilitam a criao de microambientes e nichos na ausncia de um ambiente fsico


estruturado e propiciam melhor condio de sobrevivncia nos ambientes naturais. Protegem contra flutuaes de pH, radiao ultravioleta, concentrao de sais, desidratao, predadores, fagocitose, biocidas e antimicrobianos. Aumentam a possibilidade de trocas de material gentico entre
seus componentes e facilitam o estabelecimento de microconsrcios, possibilitando a utilizao de
substratos de difcil degradao. Tambm aumentam a quantidade de nutrientes disponveis, atravs da deposio e concentrao desses na matriz polimrica.
Biofilmes tm sido extensivamente estudados pelo seu papel no ciclo de nutrientes e controle de
poluentes em ambientes aquticos, alm dos efeitos benficos ou prejudiciais sade humana.
A formao dos biofilmes (Figura 2) acontece da seguinte forma:

1- Formao de filme condicionado adsoro de substancias orgnicas a uma superfcie
slida e colonizao inicial por um nico tipo bacteriano.

2- Associao transiente do microrganismo com a superfcie ou com outros microrganismos.
Produo de EPS (protenas, carboidratos e polissacardeos) e biosurfactantes. Apndices externos,
como adesinas e pilus tipo III, facilitam a associao.

3- Associao estvel adeso firme dos microrganismos superfcie. Reduo da motilidade desses atravs da inibio do gene da flagelina. Sntese de exopolissacardeos e desenvolvimento
de camadas compostas por diferentes microrganismos.

4- Maturao formao e estruturao de microcolnias. Formao de poros intersticiais
e canais. Sntese de mais exopolissacardeos. Ocorrem interaes metablicas e genticas entre os
microrganismos.
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Os biofilmes podem ter as seguintes formas de disperso:



Expansiva ocorre a liberao de clulas do interior das colnias aps a morte celular, a degradao da matriz por liases ou a restaurao da motilidade dos microrganismos.

Fragmentao por foras mecnicas.

Migrao superficial.
A formao do biofilme afetada pelas caractersticas da superfcie, pela cobertura polimrica da
gua, pela presena de materiais particulados, pela qualidade e concentrao de nutrientes do meio
circundante e pelas caractersticas da bactria e do fluido, se houver.

Lei do mnimo de Liebig


A biomassa total de um organismo determinada pelo nutriente presente no meio em menor concentrao em relao a seus requerimentos. Em um dado ecossistema sempre haver algum fator
nutricional limitante.

Lei da tolerncia de Shelford


A ocorrncia e abundncia de um microrganismo em um ambiente depende no somente dos nutrientes disponveis, mas tambm dos fatores qumicos e fsicos. O microrganismo apresenta um
conjunto complexo de condies, dentro de uma faixa de tolerncia. Se qualquer condio exceder
os limites mnimo ou mximo, o organismo falha e morre. Para todo fator abitico existe uma faixa
de crescimento, com valores cardeais mnimo, timo e mximo.
Determinantes ambientais

1- Qumicos nutrientes, minerais, composio atmosfrica, pH, fatores de crescimento,
fontes de carbono e energia, potencial de eletro-reduo.

2- Fsicos radiao, presso, salinidade, temperatura, atividade de gua, superfcie.

3- Biolgicos relaes espaciais, gentica do microrganismo e relaes ecolgicas.
Microrganismos extremfilos
Prosperam ou requerem condies extremas que excedem as condies timas para o crescimento
e reproduo da maioria dos microrganismos. Sobrevivem em um leque de ambientes diferentes e
utilizam uma gama de diferentes fontes de carbono e energia. Possuem estratgias para reter gua
e manter suas membranas, protenas e cidos nuclicos funcionais.
Temperatura

Afeta a taxa de crescimento por alterar a taxa das reaes qumicas. A elevao da temperatura, at certos limites, leva ao aumento do crescimento e das atividades metablicas at um ponto,
a partir do qual as reaes de inativao comeam a atuar.
Os microrganismos so classificados de acordo com a faixa de temperatura em que sobrevivem e
crescem em (Grfico 1):

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Grfico 1. Faixa de temperatura de crescimento de microrganismos psicrfilos, psicrotolerantes, mesfilos, termfilos


e hipertermfilos.


1- Psicrfilos crescem em temperaturas baixas, na faixa de 0oC a 200C, com temperatura
tima em torno de 15oC. No toleram o calor e so encontrados em ambientes constantemente
frios, tais como as regies polares.

2- Psicrotolerantes capazes de crescer a 0 oC, mas com crescimento timo na faixa de 20
oC a 40 oC. So um problema na conservao de alimentos, sendo comumente encontrados em
alimentos estragados.

3- Mesfilos com temperaturas medianas como timas de crescimento (25 oC a 40 oC).
So encontradas em animais de sangue quente e em ambientes terrestre e aquticos de latitudes
tropicais.

4- Termfilos com crescimento timo em temperaturas superiores a 45oC. So encontrados em ambientes quentes. Geralmente produzem esporos resistentes ao calor que sobrevivem
inclusive aos tratamentos trmicos a que so submetidos os alimentos enlatados. Importantes tambm em acmulos de compostos orgnicos cuja temperatura pode ser bastante alta.

5- Hipertermfilos - crescimento timo em temperaturas superiores a 80oC. encontrados em
fontes termais, giseres e fendas hidrotermais.
Estresse em baixas temperaturas:

- Desestabilizao da bicamada lipdica da membrana.

- Despolimerizao do citoesqueleto.

- Citoplasma viscoso devido ao aumento da concentrao de soluto, o que interfere na difuso.

- Mudana de pH, muitas vezes levando desnaturao de protenas.

- Desidratao em decorrncia da sada de gua das clulas devido a formao de cristais de
gelo no meio extracelular.

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Presso hidrosttica
Os microrganismos so classificados de acordo com a faixa de presso hidrosttica em que crescem.
E so classificados em:

1- Sensveis crescem bem a 1 atm.

2- Barotolerantes resistem a presses bastante altas.

3- Baroflicos Precisam de grande presso para crescer bem. Morrem a 1 atm.
Presso osmtica
Fora com a qual a gua se move atravs da membrana plasmtica, de uma soluo hipotnica para
uma soluo hipertnica. Pode causar desidratao, lise ou plasmlise.
Salinidade
a soma da concentrao de todos os constituintes inicos dissolvidos na gua. A alta concentrao
de sal afeta a presso osmtica, desnatura protenas e desidrata a clula. De acordo com a salinidade os microrganismos podem ser classificados em (Grfico 2):

1- No haloflicos no necessitam de sal para crescer e no toleram sua presena no meio.

2- Halotolerantes no necessitam de sal para crescer, mas suportam certa quantidade no
meio. O crescimento timo ocorre na ausncia do sal.

3- Halfilos- requerem certa quantidade de sal para crescer. Podem ser discretos ou moderados, necessitando de baixa concentrao de sal no meio, ou extremo, necessitando de altssima
concentrao de sal para crescer.
O sistema de transporte de membrana dependente de sdio em bactrias marinhas um exemplo
de adaptao salinidade.

Grfico 2: Faixa de salinidade de crescimento de microrganismos no haloflicos, halotolerantes, halfilos moderados


e halfilos extremos.

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Disponibilidade de gua
A gua essencial para a atividade e crescimento dos microrganismos. Processos fisiolgicos requerem gua para movimentao, trocas gasosas, trocas de soluto, excreo de resduos, obteno de
nutrientes e outras funes.
A atividade de gua (Aa ou aw) o parmetro que mede a disponibilidade de gua para o microrganismo. Os valores de aw podem variar de 0 a 1. Representa a gua que est livre para agir como
solvente ou participar de reaes qumicas. a gua no ligada a macromolculas por foras fsicas.
A atividade de gua corresponde presso de vapor da soluo dividida pela presso de vapor da
gua pura. A atividade de gua reduzida aumenta a fase lag do crescimento, inibe a produo de
toxinas por alguns microrganismos e altera a permeabilidade da membrana celular, levando perda
de molculas essenciais.
Fatores que interferem nos efeitos da atividade de gua:

- Temperatura quanto mais prximo temperatura tima de crescimento, maior a faixa de
atividade de gua em que o crescimento microbiano possvel.

- Nutrientes a disponibilidade amplia a faixa de atividade de gua onde o crescimento microbiano possvel.
Microrganismos que crescem em baixas atividades de gua bombeiam ons inorgnicos para o interior da clula ou sintetizam solutos orgnicos (chamados de solutos compatveis). A quantidade
mxima de solutos compatveis acumulados corresponde a uma caracterstica geneticamente determinada.
Adaptaes aos perodos de dessecao:

- Formao de esporos.

- Formao de polissacardeos extracelulares (cpsula, camada mucosa com trehalose).

- Sntese de acares que formam uma fase de cristal no cristalino que se liga a protenas,
impedindo sua desnaturao.

- A trealose forma ligaes de hidrognio com lipdeos, substituindo a molcula de gua e
mantendo o estado fluido da membrana.
Adaptaes grande quantidade de gua:

- Parede celular rgida para evitar a lise em bactrias.

- Vacolos contrteis em protozorios para bombear o excesso de gua para fora da clula.

- Excreo de gua atravs de aquaporinas em algumas bactrias.
pH
Assim como na temperatura, cada organismo possui uma faixa de pH onde seu crescimento possvel, exibindo no entanto um pH timo definido. Esse pH timo corresponde ao pH do meio externo,
sendo que o pH intracelular deve permanecer prximo a neutralidade, o que possvel devido a
impermeabilidade da membrana plasmtica aos ons. Alguns procariotos que vivem em pH extremo
parecem manter a neutralidade interna bombeando prtons para fora da clula.
A maioria dos ambientes tem o pH entre 5 e 9 e os organismos mais comuns so os que crescem
nessa faixa, conhecidos como neutrfilos. Os organismos acidfilos crescem em pH menor que 5.
Os fungos tendem a ser mais tolerantes acidez, mas algumas bactrias tambm so acidfilas. Os
microrganismos alcaliflicos crescem em valores elevados de pH.

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Valores de pH fora da faixa de crescimento tolerada pelos microrganismos pode levar desnaturao de protenas, alteraes na fluidez da membrana plasmtica, a dissociao e solubilizao de
molculas e solubilidade de gs carbnico. Tambm afeta a fora prton motora e a mobilidade de
metais pesados.
Potencial de oxi-reduo
Mede a tendncia de um composto doar ou receber eltrons. uma escala til para medida de anaerobiose. O oxignio molecular um poderoso agente oxidante. Ambientes com potenciais de oxi-reduo positivos favorecem a oxidao e permitem o crescimento de microrganismos aerbios. Em
contrapartida, ambientes com potenciais de oxi-reduo negativos favorecem a reduo e permitem
o crescimento de microrganismos anaerbios. Os microrganismos aerbios facultativos sobrevivem
a uma ampla faixa de potencial de oxi-reduo. medida que o oxignio vai sendo reduzido vo
sendo formadas molculas altamente reativas como o nion superxido (O2-) e o perxido de hidrognio (H2O2). Os microrganismos que crescem na presena de oxignio sintetizam enzimas que
transformam as molculas reativas em molculas inertes como a gua e o oxignio (O2).
Enzimas que destroem espcies txicas de oxignio:

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Literatura sugerida
MADIGAN, Michael T.; MARTNKO, John M.; PARKER, Jack. Microbiologia de Brock. 12 ed. Editora:
Artmed. So Paulo. 2010.
PELCZAR, Michael Joseph; CHAN, E.C.S; KRIEG, Noel R. Microbiologia: conceitos e aplicaes. 2.ed.
So Paulo: Makron Books.
MAIER, Raina M.; PEPPER Ian L.; GERBA Charles P. Environmental Microbiology. 2 ed. Editora: Academic Press. 2009

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