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BIOCHEMISTRY

Bios:(Late Greek)= life, living systems


Khemia:(Late Greek)= cradle of civilization,
studying what life was all about
Oxford Dictionary:the study of the process and
products involved in LIFE PHENOMENON of animals and
plants.

Gruppi funzionali e legami chimici


in biochimica

Gruppi funzionali e legami chimici


in biochimica

Biochemistry
: of the fundamental properties of life
:chemical composition of living cells
:reactions processes involved with LIFE PHENOMENON

Biomolecules

macromulecules composed of monomeric subunits


-proteinsamino acids
-DNA deoxynucleotides
-RNA ribonucleotides
-carbohydrates monosaccharides
-lipids fatty acids and an alcohol

Organization of Life

elementi
simple organic compounds (monomers)
macromolecules (polymers)
supramolecular structures
organelles
cells
tissues
organisms

Range of the
sizes of objects
studies by
Biochemist and
Biologist

1 angstrom = 0.1 nm

Elements of Life

Most abundant, essential for all organisms: C, N, O, P, S, H


Less abundant, essential for all organisms : Na, Mg, K, Ca, Cl
Trace levels, essential for all organism: Mn, Fe, Co, Cu, Zn
Trace levels, essential for some organisms: V, Cr, Mo, B, Al, Ga, Sn, Si,
As, Se, I,

Important compounds, functional groups

Common theme:
Monomers form
polymers through
condensations
Polymers are broken
down through
hydrolysis.

I polimeri biologici

Many Important Biomolecules are Polymers

monomer

lipids

proteins

carbo

f a t t y a c id

a m in o a c id

g lu c o s e

n u c le o tid e

p r o t e in s u b u n it

c e llu lo s e

D N A

p r o t e in c o m p le x

c e ll w a ll

c h ro m o s o m e

polymer p h o s p h o l i p i d
supramolecular
structure

m e m b ra n e

nucleic acids

Conoscenza delle caratteristiche chimiche e stereochimiche delle principali classi


di composti come :

CARBOIDRATI

ACIDI GRASSI
AMINOACIDI
NUCLEOTIDI

Lipids
monomer

f a t t y a c id

polymer p h o s p h o l i p i d

supramolecular
structure

m e m b ra n e

Proteins

monomer

amino acid

polymer protein subunit

supramolecular
structure Enzyme complex

Carbohydrates

monomer g l u c o s e
polymer c e l l u l o s e
supramolecular
structure c e l l w a l l

Nucleic Acids
monomer

n u c le o tid e

polymer

D N A

supramolecular
structure

c h r o m a t in

-4500 milioni
Origine della
terra

-3750 milioni
VITA?

10

12

11

16

17

18

19

13

14

20

21

-1950 milioni -1800 milioni


respirazione molti batteri

22

23

24

25

29
-1500 milioni
Primi
mammiferi
dinosauri

30
Primi uccelli
Prime piante con fiore
Estinzione dei dinosauri
Primi ominidi
Homo sapiens: 23h 55
La storia scritta: 23h 5954

-1350 milioni
primi eucarioti

26

-750 milioni
primi organismi
multicellulari

7
-3450 milioni
i pi antichi
fossili di
procarioti

-2700 milioni
fotosintesi

-3000 milioni
chemioautotrofi

15

65

27

28

-450 milioni
evoluzione
esplosiva di
piante e
animali

-300 milioni
le piante
colonizzano
la terra
primi vertebrati

CALENDARIO DELLA STORIA


DELLA TERRA

Le dimensioni in biologia

A dimensioni diverse corrispondono modalit


diverse di visualizzazione e discipline diverse:
anatomia e fisiologia, istologia, biologia
cellulare, embriologia, genetica,
microbiologia, virologia, biochimica e
biologia molecolare, chimica, fisica.

Il mondo del
nanometro

Il mondo del nanometro: il virus dellHIV ha un diametro


di circa 100 nm (0,1 m, ossia 10-4 mm)

LE DIMENSIONI DELLE CELLULE EUCARIOTICHE (VEGETALI E


ANIMALI) E DELLE CELLULE PROCARIOTICHE

Confronto tra il potere di risoluzione del microscopio


ottico e del microscopio elettronico

Spessore della sezione:


1,5 m

0,03 m

Immagini ottenute con il microscopio elettronico a scansione

I LIVELLI DI ORGANIZZAZIONE

ATOMI MOLECOLE MACCHINE MOLECOLARI ORGANULI

CELLULA

La teoria cellulare

La cellula la pi piccola unit del vivente


Tutti gli organismi viventi sono costituiti da
cellule
Ogni cellula deriva da una cellula pre-esistente
In base a caratteristiche, quali la presenza di un
nucleo e di strutture intracellulari (organuli),
classifichiamo le cellule in due categorie:
procariotiche ed eucariotiche

Prokaryote Cell

Cellular Organization
of an E. coli Cell

200 300 mg protein / mL cytoplasm

Eukaryote Cell

La cellula eucariotica differisce per molti aspetti


da quella procariotica

In un organismo pluricellulare le cellule sono specializzate


per svolgere funzioni diverse e la loro morfologia dipende
dalla funzione che svolgono. Gli organuli primari sono tuttavia
presenti in tutte le cellule.
SPECIALIZZAZIONE CELLULARE = DIFFERENZIAMENTO

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