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En Amrica, la Inquisicin fue impuesta por Felipe II, en 1570, y tuvo tres centros
jurisdiccionales: Mxico, Lima y Cartagena. Los casos que se juzgaron fueron
bastantes, aunque se exclua a los indgenas de los castigos impuestos, debido a
que, al ser nuevos en la fe, no tenan la madurez teolgica para evitar errar.
Contraria a la opinin de la mayora de historiadores, los acusados en s fueron
pocos, y todava mucho menor el nmero de condenados a muerte o a castigos
corporales. En la Nueva Granada, la Inquisicin se encarg, adems, de reprimir
la propagacin de las tradiciones paganas de los negros y de reprobar las obras
literarias que atentaban contra los dogmas de la Iglesia Catlica.
Durante el proceso de independencia iniciados a principios del siglo XIX, varios
clrigos criollos simpatizaron con la causa patriota y participaron activamente
como agitadores, capellanes y an soldados. Algunos de ellos llegaron a ingresar
a la masonera cuyas logias se establecieron por esos aos con gran aceptacin
de parte de las lites locales. Luego de un proceso dubitativo, el Vaticano
reconoci en 1835 al nuevo estado independiente y estableci relaciones formales
con este, iniciando adems un proceso de romanizacin eclesistica. Al tiempo,
las lites liberales en el poder presionaron por el establecimiento de un estado
cada vez ms libre el influjo eclesistico, lo que provoc choques de poder con la
institucin clerical que no estaba dispuesta a ceder su espacio en la sociedad.
Vale la pena aclarar que este hecho se presentaba en el contexto de la lucha entre
federalistas y centralistas, aquellos de escuela liberal influenciados en algunos
aspectos por la Revolucin francesa, estos de corte conservador, que buscaban
mantener la herencia espaola y la alianza con la Iglesia. Este conflicto influy en
la gnesis de ms de siete guerras civiles generales (1839-41; 1853, 1859-61,
1876-77, 1885, 1895, 1899-1903) y varias regionales, en los cuales el elemento
religioso fue protagonista. En este conflicto se destacan episodios como la
declaracin de separacin Iglesia y Estado, generada por la Constitucin de 1853,
la expropiacin de bienes eclesisticos, llevada a cabo por Toms Cipriano de
Mosquera en 1861-63, la declaratoria de tuicin de cultos (1861) extraamientos
de obispos, supresin de comunidades religiosas (1861) o la expulsin de los
Jesuitas (en dos oportunidades: 1851 y 1861). Finalmente, los intentos del
gobierno radical por establecer un sistema educativo "neutro" en materia religiosa
degener en una guerra civil (1877) donde participaron activamente varios obispos
y clrigos. A partir de 1886 las relaciones entre ambas potestades se regularizaron
de nuevo con el establecimiento de una nueva constitucin centralista, que
reconoca a la Iglesia Catlica como fundamento de unidad nacional.
En 1887 se firm un concordato con la Santa Sede, en el cual se le otorgaba a la
institucin eclesistica el control del sistema educativo colombiano, privilegio que
mantuvo hasta la reforma concordataria de 1973, a la vez que le restitua las
tierras y bienes que le fueron substrados durante la desamortizacin impulsada
por los radicales. La constitucin conceda apenas "tolerancia" a las dems
religiones establecidas en el pas, y que por entonces no llegaban al 1%,
aproximadamente. Durante las dcadas siguientes un nuevo orden social,
regentado por una alianza entre Iglesia Catlica y Estado, marc la vida de la