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Introduccin
Ingeniera metablica es un campo
emergente de la biotecnologa que
ofrece un enorme potencial para la
produccin
de
metabolitos
deseado. El enfoque experimental
se basa en la manipulacin de
genes endgenos o la introduccin
de
genes
extraos
en
un
organismo de inters con el fin de
redistribuir las vas metablicas
para la produccin de compuestos
especficos
(Stephanopoulos,
1999). El xito en el desarrollo de
un proceso de ingeniera depende
de un profundo conocimiento del
funcionamiento de los genes y de
sus metabolitos en cuestin y la
disponibilidad
de
un
slido
conjunto de herramientas para
analizar los cambios fisiolgicos en
el organismo husped. La levadura
Saccharomyces
cerevisiae
ha
servido
como
un
organismo
producir
lpidos.
nuevos
productos
de
Materiales y mtodos
Las condiciones de cultivo y de
cepas de levadura Saccharomyces
cerevisiae cepas MMYO11 (MAT
ade 2-1 su3-11,15 leu2-3.112 Trp11
ura3-1
puede1-100+
Ole),
MMPX5 (MAT pex5::SU32::Ppgk
ade-GFPAKL-URA3 su3-11,15 leu23.112 Trp1-1 ura3-1 puede1-100+
Ole) o sus derivados (vase ms
adelante), fueron utilizadas en
estos estudios. Las clulas de
levadura
se
mantuvieron
inalteradas en YPD media (1% de
extracto de levadura, peptona,
2%, 2%) dextrosa agar solidificado
con 2%. Celdas que contengan
plsmidos fueron mantenidos en
placas SD (2% de dextrosa, 0,67%
de levadura sin base de nitrgeno
aminocidos, 2% de agar) con
suplementos
de
aminocidos
adecuados. Solo las colonias
fueron inoculados en medios
lquidos SD y crecido durante la
noche a 30C y 300 rpm. Las
celdas se diluyeron en una
variedad
de
medios
de
comunicacin (vase infra) y ha
crecido a 20C y 300 rpm en una
forma modelo cientfico 4580
refrigerados/agitador incubador de
la consola. El cultivo a 20C fue
escogido
desde
una
ptima
actividad
de
la
Brassica
napus cidos grasos 3 desaturase
(FAD3) expresa la enzima en la
levadura
fue
observado
anteriormente a esta temperatura
(Dyer et al. 2001). Las celdas se
diluyeron a 0,1 OD600 en soporte
SD
y
cultivados
durante
aproximadamente 20 h, diluida a
0.25 OD600 en SGal medios (2%
galactosa, 0,67% de levadura base
de nitrgeno) y cultivados durante
aproximadamente 40 h, o diluido
Construccin de vectores
cepas de levadura
315 con XbaI XhoI/ generar pEX11313 (CEN6 ARSH4, SU3) y pEX11315
(CEN6
ARSH4,
LEU2),
respectivamente. Por ltimo, la
cinta fue transferida al pRS-423 y
pRS-425 utilizando XhoI/SacI para
generar pEX11-423 (2, SU3) y
pEX11-425
(2,
LEU2),
respectivamente.
Vectores
de
expresin
que
contienen levadura PEX11-driven
desaturases
cidos
grasos
vegetales
(DCP)
fueron
construidos utilizando myc-eptopo
tagged Arabidopsis thaliana FAD2
y
hemagluttinin (HA)-tagged
Brassica napus FAD3,
que
anteriormente se utilizaban para
caracterizar
desaturase
localizacin subcelular (Dyer y
Mullen, 2001) y la regulacin posttranscripcional (Dyer et al. 2001).
El micnico-tagged FAD2 ORF se
ligaban entre la levadura PEX11
promotor
y
terminador
por
transferencia
de
un fragmento
EcoRI/PstI de pKS-mycFAD2 (Dyer
y Mullen 2001) similarmente
digerido pEX11-424. La final fue
llamado
plsmido
pEX11-424mycFAD2 (2, Trp1). La ha-tagged
FAD3 ORF fue clonado entre el
PEX11 promotor y terminador por
transferencia de un fragmento
EcoRI/PstI del plsmido pKS-HAB1
(Dyer
et
al.
2001)
a
la EcoRI/PstI sitios de pKS-27poli.
El
plsmido
resultante
se
denomina pKS-27HAB1. La casete
gnico fue trasladado desde este
plsmido
como SalI/SacI al
fragmento SalI/SacI sitios de pRS425 para generar el plsmido
pEX11-425-HAFAD3 (2, LEU2).
Los plsmidos Se transfectaron
separadamente o en combinacin
en MMYO11 o MMPX5 en clulas
de levadura usando el mtodo de
acetato de litio Gietz y Woods
(1994). Cepas de levaduras fueron
depositados en la Coleccin de
Cultivos
del
Servicio
de
Investigacin
Agrcola
(Centro
Nacional para la Investigacin de
Utilizacin
Agrcola,
1815
N.
Universidad St., Peoria, IL 61604,
EE.UU.) y estn disponibles bajo
peticin.
La
cepa
nombres,
descripciones
y
nmeros
de
adhesin
son:
MM-424,
S.
cerevisiae cepa MMYO11 albergar
vector control pRS-424 (2, Trp1),
NRRL
Y-27443;
MM-F2,
MMYO11 albergando el plsmido
pEX11-424- mycFAD2, NRRL Y27444;
MM-F3,
MMYO11 albergando el plsmido
pEX11-425-HAFAD3,
NRRL
Y27445;
MM-F2/F3,
MMYO11 albergar
plsmidos
pEX11-424-mycFAD2 y pEX11-425HAFAD3, NRRL Y-27446; MMPX5424, S. cerevisiae cepa MMPX5
control de albergar el plsmido
pRS-424, NRRL Y-27447; MMPX5F2/F3,
MMPX5
albergan
plsmidos pEX11- 424-mycFAD2 y
pEX11-425-HAFAD3,
NRRL
Y27448.
Preparacin
de
extractos
proteicos, SDS-PAGE y Western
blotting
Los extractos de protenas totales
fueron obtenidos a partir de
levaduras usando el mtodo
de Veenhuis y Goodman (1990),
con
ligeras
modificaciones.
Brevemente, las clulas fueron
incubadas en un 5% de cido
tricloroactico antes de glass bead
interrupciones. No fueron lisados
hervidas,
sin
embargo,
para
mejorar la recuperacin de la
planta de cidos grasos protenas
desaturase (observacin personal).
Se determin la concentracin de
protenas en muestras triplicadas
utilizando el ensayo con protena
de BioRad BSA como estndar. 15
Resultados
La captacin de cidos grasos
por S. cerevisiae
S.
cerevisiae
clulas
fueron
cultivadas en la presencia de
mltiples fuentes de carbono, los
cidos grasos o solos, para
determinar los efectos de los
medios sobre la absorcin y la
asimilacin de composicin de
cidos grasos de los medios de
crecimiento.
Las
clulas
de
levaduras
cultivadas
en
la
galactosa contenan cantidades
bajas del total de los lpidos
celulares, que se distribuyen
principalmente en fosfolpidos y
neutrales fracciones lipdicas (Fig.
2). Adicin de cido oleico a la
galactosa media condujo a un
pequeo aumento en el total de
lpidos celulares y un aumento de
triacilglicerol y contenido de
cidos grasos libres se observ. El
incremento en el contenido de
cidos grasos celulares fue ms
expresin
de
enzimas
de
modificacin de lpidos, cidos
grasos vegetales desaturases 2 y
3 (FAD2, FAD3) fueron expresados
en clulas de levadura con el cido
graso-inducible PEX11 promotor
del gen de la levadura. El PEX11
gen codifica una protena (Pex11P)
que
est
implicado
en
la
proliferacin de peroxisomes en
respuesta
a
ciertas
seales
ambientales
(Erdmann
y Blobel 1995; Marshall et al.
1995). El PEX11 gen es expresado
a bajos niveles basales de glucosa
y inducido aproximadamente 100
veces cuando las clulas se
desplazan a los medios que
contengan cidos grasos como
nica fuente de carbono (Marshall
et al. 1995). La planta FAD2
enzima convierte el cido oleico
(18:1) para el cido linoleico
(18:2), y FAD3 convierte el cido
linoleico (18:2) a cido linolnico
(18:3) (Covello y Reed 1996; Reed
et al. 2000). Ambas enzimas son
protenas
de
membrana
dependiente ubicado en
carbono
producido
sustancial
incorporacin de cido oleico en
levadura de lpidos, representando
el 98% del total de cidos grasos
celulares (Tabla 1). Co-expresin
de la FAD2 y FAD3 llev a la
conversin de una parte del cido
oleico en linoleico y linolnico ,
que representan el 12% y el 0,3%
del total de cidos grasos,
respectivamente (tabla 1). La FAD2
y
FAD3 Adnc se
expresaron
tambin en S. cerevisiae celdas
que contengan una alteracin del
gen PEX5 (cepa MMPX5). Estas
clulas
mutantes,
perturbado
en biognesis peroxisomal, son
incapaces de crecer en cidos
grasos como nica fuente de
carbono, pero son capaces de
crecer en fuentes de carbono
fermentables como la dextrosa
(Subramani et
al.
2000).
La composicin en cidos grasos
de la cepa de control MMPX5424, cultivada en dextrosa, fue
similar a la composicin de la cepa
de control tipo salvaje, MM-424,
con
cido
oleico
representa
aproximadamente el 55% del total
de la composicin en cidos
grasos (Tabla 1). Co-expresin de
planta FAD2 y FAD3 en MM
desaturasesPX5 celdas llev a la
conversin de una parte del cido
oleico
en lino
leic y linolnico ,
representando aproximadamente
el 22% y el 1,3% del total de
cidos grasos, respectivamente
(tabla 1).
Discusin
Aqu presentamos una estrategia
de ingeniera en el metabolismo
de los lpidos en S. cerevisiae que
parejas los procesos de absorcin
de cidos grasos de los medios de
crecimiento con la expresin de
enzimas de modificacin de cidos
remodelar la composicin de
cidos grasos, coherente con la
introduccin de una nueva va
metablica que conduce de cido
oleico (18:1) a cido linolnico
(18:3)
(Tabla
1).
Tambin
expresamos la planta desaturases
cidos grasos en una cepa de S.
cerevisiae perturbado en el PEX5
gen. El PEX5 gen codifica el
receptor para la mayora de las
protenas destinadas a la matriz
peroxisomal y celdas que carecen
de este gen son incapaces de
crecer en cidos grasos como
nica fuente de carbono debido a
su incapacidad para degradar los
cidos grasos (Subramani et al.
2000). La justificacin para la
realizacin
de
nuestros
experimentos
en
un
PEX5perturbado cepas de levadura fue
que, en ciertas estrategias de
ingeniera en el metabolismo de
los lpidos, puede preverse que el
cido graso deseado productos
finales podra ser selectivamente
hidrolizado de membranas y
dirigidos por la degradacin dentro
de
Eccleston y Ohlrogge
peroxisomes ( 1998; Millar et al.
2000). En tales casos, la ingeniera
de lpidos podra realizarse en
cepas de levadura alterada en su
capacidad para degradar los
cidos grasos por completo. Los
resultados presentados en el
cuadro
1
indican
que
el
metabolismo de los lpidos se
pueden realizar experimentos de
ingeniera en PEX5-perturbado S.
cerevisiae clulas que se cultivan
en dextrosa como una fuente de
carbono, con productos cidos
grasos
acumular
a
niveles
comparables a los observados en
las
clulas
de
tipo
salvaje
expresando las enzimas de las
plantas.
Sin
embargo,
la
incapacidad
de
los
PEX5-
cultivo
descrito
aqu,
y
la
expresin de los genes por tanto la
incorporacin de cidos grasos y
su modificacin, podr permitir la
utilizacin a escala industrial de S.
cerevisiae de bioconversin de
bajo costo de las materias primas
en productos de valor agregado de
lpidos.