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CONCLUSION
INTRODUCTION
Lors de la semaine banalise du 21 au 24 Mars 2016, jai effectu un stage dobservation
LHpital Universitaire de Ble, Universittsspital Basel (USB) . Pour ce faire, jai auparavant
demand au PD Dr. Michel BIHL de bien accepter dtre mon tuteur de stage, ce quil accepter, et
dont je len remercie fortement. Monsieur BIHL exerce le mtier de Biologiste Molculaire au service
Pathologie de l Unispital . Il ma fait dcouvrir son mtier, ainsi que celui de certains de ses
collgues, que je citerais par la suite.

Le Bureau du PD Dr. BIHL

sultaion clinique gntique PD Dr. I Filges

PRSENTATION GNRALE DE LENTREPRISE

Nombre de Salaris
170 personnes travaillent au dpartement de Pathologie. Parmi ces 170 salaris, il y a 75
Laborantins, qui se chargent des prparations de matriel (Humain ou outils), et qui aident les 39
Chercheurs dans leur travail. Il y a bien sur des Mdecins : 25. Ils se partagent en deux catgories : Les
Mdecins traitant, et les Mdecins-Chef. Pour les seconder, il y a 8 Mdecin assistants. En plus, au
sous-sol de lhpital se trouve une morgue, ou travail 2 personnes. Et enfin, le reste des salaris se
composent de Secrtaires.

Organigramme

Neuro- / O

Cytog

Activit
La particularit de linstitut de pathologie de Ble, est, quil abrite conjointement lactivit de
pathologie et de gntique humaine. Ces deux spcialits recherches des mutations et des anomalies
chromosomiques dans les tumeurs, mais se distingue par lorigine mme de la tumeur. Tandis que la
pathologie ne recherche que des altrations gntiques dtes somatiques , cest--dire acquise au
cours de la vie, la gntique humaine est spcialise dans ltude des mutations hrditaires
Ethiquement, la recherche de mutations hrditaires est svrement encadre et dpend du
consentement des patients. Le travail effectu par le personnel de linstitut de pathologie commence par
la rception de plusieurs matriels humains (organes, parties dorgane, sang priphrique, moelle
osseuse.) et la prparation de ce matriel pour son analyse des fins de diagnostiques. Ces
analyses peuvent se faire au niveau de lHistologie (tude des structures des tissus), par une recherche
de caractrisation des cellules en prsence (prsence de marqueurs au niveau des cellules)
immunohistochimie, ou par des marqueurs de biologie molculaire par la recherche de mutations et de
translocations. Dans le personnel du travail, beaucoup de personnes sont l pour prparer le matriel
(tiquetages, prparation des blocs de paraffine, prparation des coupes), et du personnel analytique
faire des rapports et rpondre aux questions des oncologues.
La pathologie est un des maillons dune chane qui est propre au diagnostic et la thrapie des
patients, mais dont le rle est croissant grce aux nouvelles technologies. Il est en interaction avec les
diffrentes spcialits, et influence extrieur, que je dcris dans le schma ci-dessous.
Patient

Oncologue
Pathologue

Hmatologie

Histologie

Cytologie

Morphologie/Immuno coloration

Molculaire

Gntique

Diagnostic

Cible thrapeutique

Utilisation de mdicaments spciaux

Industrie pharmaceutiques
(Nouveaux traitements)
Science Assurance Maladie
8
(Tarmed
Tarif)
(Nouveaux objectifs)

PRSENTATION GNRALE DU MTIER OBSERV

Le dossier dun patient que reoit Mr BIHL

Le Mtier que jai observ durant cette semaine, est celui de

Biologiste molculaire, dont lactivit principale est de faire un diagnostic
gntique des patients cancreux. On peut noter que ce type dactivit
en France est rserv titre professionnel un possesseur du titre de
mdecin (diplme de mdecine). Cependant, les connaissances
molculaires et les techniques de nouvelles gnrations demandent une
formation spcifique, et il nest dans la plus part des cas pas possible au
mdecin dacqurir la connaissance ncessaire pour pouvoir faire en
bonne connaissance de cause un diagnostic gntique
Pour faire ce mtier, le PD. Dr. BIHL a achev ses tudes en France avec un DEA de Pharmacologie
lUniversit dIllkirch-Graffenstaden (Strasbourg), puis est venu en Suisse faire une Thse de Biologie
Cellulaire au dpartement de recherche de la Pneumologie. Il sest intress au rle des cytokines dans
le cancer du poumon.
La plus importante des qualits requises, est, de savoir remettre en question les mthodes
utilises, et leurs analyses respectives ralises. Cette lise jour permanente doit tre faite dans le
cadre technique des mthodes, dans le cadre des connaissances scientifiques et mdicales. Si une
analyse est mal interprte, elle peut conduire la prescription dun mauvais mdicament, qui nauras
non seulement pas deffet sur la tumeur, mais des effets secondaires non-dsirs. Bien dautres qualits
sont requise au dtenteur de ce poste, mais une retiens mon attention, la crativit. En effet, il en faut
beaucoup, pour pouvoir interprter diffrentes analyses.
Jai galement observ une partie du mtier de Neuropathologue. Lhomme qui ma fait
dcouvrir cela ma montr la facette la plus importante de son mtier, la connaissance parfaite de
lencphale. Pour cela il ma montr une autopsie crbrale de trois personnes, afin de dceler la
prsence ventuelle de mtastases. Jai trouv cette observation trs intressante. De plus, le Dr
HENCH (le Neuropathologue) ma parl des tudes quil a faites, savoir, mdecine, avec
spcialisation en Neurologie.

LAutopsie
Crbrale

OBSERVATIONS ET DROULEMENT
Observations lors du stage
L Universittsspital de Ble est quip avec des machines nouvelles gnrations.
Notamment la NGS (Next Generation Sequencing). Ces machines analysent des CHIP , qui
regroupent plusieurs millions de squences nuclotidiques sur leurs petites plaquettes
Cette technique reprend le principe de la PCR, mais celle-ci se droule non pas dans un tube
de laboratoire, mais de manire alatoire et simultane dans des
millions de bulles formes par mulsion. Les informations obtenues
sont donc considrables, et doivent tre traites par informatique.
Mais la PCR, quest-ce que cest ?
Cest la technique qui tait la plus utilise avant la NGS. Ici, le principe
de duplication de lADN est contrl In Vitro, cest--dire dans un tube
avec un milieu artificiel. Lamplification va devenir de moins en moins
efficace partir dune vingtaine de cycle. La PCR permet
lamplification trs rapide de lADN, contrairement la NGS, qui traite
les informations nuclotides par nuclotides.
En gntique molculaire, ensemble de fragments d'ADN clons dpend des rsultats
souhaits. Ils ne peuvent tre reprsents que par une petite quantit dexon, par lensemble des
squences codantes (transcriptome tude des parties transcrite en ADN), ou par le gnome en entier.
Aujourdhui, les investigations sur le gnome en entier ne se font quau niveau de la recherche. Le
diagnostic mdical ne sintresse quau gne dont les mutations sont connues dont le cancer, et pour
lesquelles une option thrapeutique existe

Droulement du stage
Le premier jour, le 21 Mars, jai pu observer le plus grande partie du Travail de mon tuteur, qui
est de vrifier/contrler les analyses de leur plus performante machine, le NGS, ou Next Generation
Sequencing. Cette machine permet le squenage extrmement rapide de lADN. Mais jai dj
expliqu son fonctionnement plus tt.
Le lendemain, 22 Mars, mon arriv, jai pu visiter le btiment au complet, du 3 me tage, au 1er
sous-sol. Aux 3 premiers tages ainsi quau rez-de-chausse, se trouvent les laboratoires. Puis au
sous-sol, se trouve la salle des autopsies, o jai pu assister une autopsie crbrale de 3 personnes.
Ces trois personnes sont dcdes de cause dun cancer, et le Docteur HENCH Juergen est charg de
contrler lencphale, la recherche dune ou plusieurs Mtastases.
Plus tt dans la journe, le mme mdecin est venu me chercher pour me montrer, ce qui, en
Suisse et en Allemagne, est appel Schnellschitt . En franais, cela se traduirait par examen
extemporan . Il sagit dun examen qui intervient au cours dune intervention chirurgical pour une
tumeur. Cette tumeur peut-tre maligne ou bnigne. Pour dterminer cela, les chirurgiens font parvenir
cette tumeur pralablement retire, et la font parvenir dautre mdecin, qui font une analyse, pour
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savoir si le chirurgien doit ou non ajuster son acte chirurgical. Ici, lanalyse sest fate pour une tumeur
crbrale, qui sest rvle tre inoprable, en raison de sen emplacement (Dans le Thalamus).
Le jour suivant, 23 Mars, mon Tuteur ma propos de, nouveau regarder son travail et sa
faon de travailler. Puis, dans laprs-midi, il ma encourag commencer mon rapport de stage. Il ma
beaucoup aid crire les diffrentes parties de ce rapport en me conseillant dy mettre diffrentes
explications.
Le dernier jour, 24 Mars, Mr. BIHL ma donn des informations en plus concernant ses
diagnostics. Il ma galement aid dans lcriture de mon rapport de stage

A gauche, le laboratoire des examens extemporans avec son plan de travail et les instruments pour dissquer. A
droite, un cryostat qui permet de congeler rapidement les chantillons (pour conserver lhistologie des tissus) en vue de les

couper en fine lame pour lanalyse anatomopathologique.

Lors de cette analyse des morceaux de tumeurs sont fixs dans des blocs de paraffines pour tre analyss
ultrieurement par coloration, par immunohistochimie ou pour des examens de biologie molculaire.

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CONCLUSION
Ce stage ma apport une meilleure connaissance du monde professionnel, ainsi quune
dcouverte de plusieurs mtiers. Certains sont mconnus, mais nen sont pas moins importants et
intressants. Le PD Dr. BIHL, na, par exemple, que quelques homologues dans le Pays. Ce nest donc
pas un mtier trs rpandu.
Quant au Dr. HENCH, lui, pratique la neuropathologie. A ne pas confondre avec la neurologie.
Ce nest pas non plus trs rpandu, car ce nest quune partie dun mtier : Pathologue. Le Dr. Juergen
HENCH na pas le FMH de Pathologie (diplme), il na fait que la spcialit Neuropathologie.
Ces deux personnes mont tous deux donn le mme conseil, que je vais tenter de suivre.
Comme tude Post-Bac, je comptais faire une Licence puis un Master en Biologie Molculaire et
Cellulaire. Le Dr HENCH ma expliqu, quavant de se lanc en Mdecine, son choix tait le mme que
le mien, mais, il sest rendu compte que les dcouches de cette filire ne sont pas grandes, en dehors
de la recherche. Il a donc fait Mdecine, et il sest spcialis par la suite en Biologie Molculaire.
Cest donc cette voie que je vais tenter de suivre.

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REMERCIEMENTS
En premier lieu, il me faut remercier le Dr BIHL, pour mavoir accept en stage chez lui, malgr
les difficults de comprhension que je pouvais avoir concernant les activits de lentreprise.
Puis par la suite jaimerais remercier le Dr HENCH pour mavoir, lui aussi montr les diffrentes
facettes de son mtier, savoir, comme le Dr BIHL, analyser des cellules tumorales, mais aussi raliser
des autopsies crbrales sur les patients de lhpital dcds pour causes de cancer.
Et enfin, il me faut remercier tout le service de Pathologie pour mavoir accueilli
chaleureusement cette courte semaine.

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