Biometra 2

2015
Anova de 1 factor: supuestos,
tabla de anova, comparaciones,
magnitud del efecto e IC.

TP 2. Diseos y ANOVA

Problema 4

Segregacin de aa

Anemia

La segregacin de ciertos aa produce anemia?

TP 2. Diseos y ANOVA
Variable respuesta:
Variable explicatoria o factor
u.e.:
Niveles:
Rplicas:

Cantidad de glbulos rojos en sangre, en millones/mm3

Material infundido en el conducto biliar
Rata
prolina, aa-prolina, aa+prolina, suero (4)
10

GRUPO I

GRUPO II

GRUPO III

GRUPO IV

20 mmol
prolina

mezcla aa
pro

mezcla aa +
pro

Suero fisio

6.47
5.42
6.09
5.83
6.27
5.95
6.04
6.35
5.60
5.80

6.09
5.94
5.75
5.51
6.34
5.65
6.42
6.04
5.51
5.44

5.61
5.40
5.26
4.99
5.44
5.13
5.21
5.52
4.79
4.92

7.35
7.11
6.99
6.72
7.16
6.85
6.94
7.25
6.51
6.65

TP 2. Diseos y ANOVA

Diseo utilizado: DCA

Modelo Lineal:

yij i ij
Yij = # de glbulos rojos de la rata j sometida
al tratamiento i
= # de glbulos rojos promedio de la poblacin
de ratas wistar

i = efecto del tratamiento i sobre el # de

glbulos rojos promedio
ij = error: variabilidad natural entre
ratas, errores de medicin, etc.

GRUPO I

GRUPO II

GRUPO III

GRUPO IV

20 mmol
prolina

mezcla aa
pro

mezcla aa +
pro

Suero fisio

6.47
5.42
6.09
5.83
6.27
5.95
6.04
6.35
5.60
5.80

6.09
5.94
5.75
5.51
6.34
5.65
6.42
6.04
5.51
5.44

5.61
5.40
5.26
4.99
5.44
5.13
5.21
5.52
4.79
4.92

7.35
7.11
6.99
6.72
7.16
6.85
6.94
7.25
6.51
6.65

subndices? i=

j=

TP 2. Diseos y ANOVA

La segregacin de ciertos aa produce anemia?

ANOVA DE 1 FACTOR
Hiptesis
Ho: I = II = III = IV =
Ha: Alguna i

Hiptesis
Ho: i = 0
Ha: Algn

i 0

TP 2. Diseos y ANOVA

Descripcin Grfica y analtica de los datos

Medidas resumen
grupo
G_I
G_II
G_III
G_IV

Variable
GR
GR
GR
GR

n
10
10
10
10

Media
5,98
5,87
5,23
6,95

D.E.
0,33
0,35
0,27
0,27

Var(n-1)
0,11
0,12
0,07
0,07

CV
5,55
5,99
5,18
3,92

Mn
5,42
5,44
4,79
6,51

Mx
6,47
6,42
5,61
7,35

7,48
7,13

Presencia
de datos
atpicos?

3,74

5,35

GR

GR

5,61

3,57

1,78

1,87

0,00

0,00
G_I

G_II

G_III

grupo

G_IV

G_I

G_II

G_III

grupo

G_IV

TP 2. Diseos y ANOVA

Supuestos para la validez del modelo

ij

independientes ~ N (0, )

u.e. Independientes

- Muestreo aleatorio
- Asignacin aleatoria de u.e.

Distribucin Normal de la v.a para cada subpoblacin

Homogeneidad de varianzas de las subpoblaciones.

TP 2. Diseos y ANOVA

ANOVA: SUPUESTOS

u.e. Independientes - Muestreo aleatorio

- Asignacin aleatoria de u.e.
Suponemos que las ratas fueron extradas
al azar y que la asignacin de las ratas a
cada tratamiento se hizo al azar.

TP 2. Diseos y ANOVA

ANOVA: SUPUESTOS
Para probar los supuestos necesitamos
calcular los
RESIDUOS (RDUO)

RESIDUOS ESTUDENTIZADOS (RE)

* Formula descrita en el manual de
InfoStat

RESIDUOS ABSOLUTOS (RABS)

VALORES PREDICHOS (PRED)

TP 2. Diseos y ANOVA

Residuos un ejemplo para repasar el clculo

Calcule el residuo para la 3ra. observacin del grupo II

yi.
n

GRUPO I
20 mmol
prolina
6.47
5.42
6.09
5.83
6.27
5.95
6.04
6.35
5.60
5.80
5.98
10

GRUPO II
GRUPO III
mezcla aa mezcla aa +
pro
pro
6.09
5.61
5.94
5.40
5.75
5.26
5.51
4.99
6.34
5.44
5.65
5.13
6.42
5.21
6.04
5.52
5.51
4.79
5.44
4.92
5.87
5.23
10
10

GRUPO IV
Suero fisio
7.35
7.11
6.99
6.72
7.16
6.85
6.94
7.25
6.51
6.65
6.95
10

e 23 = 5.75 5.87 = -0.12 milGR/mm3

y..
6.01

TP 2. Diseos y ANOVA

Distribucin Normal de la v.a. para cada subpoblacin

Es equivalente a decir que los errores aleatorios se distribuyen normalmente

Mtodo grfico

Cuantiles observados(GR)

7,50

n= 40 r= 0,988 (GR)

6,75

6,01

5,26

4,52
4,52

5,26

6,01

6,75

7,50

Cuantiles de una Normal(6,0077,0,47848)

TP 2. Diseos y ANOVA

Distribucin Normal de la v.a. para cada subpoblacin

Mtodo analtico: Prueba de Shapiro-Wilks
Ho: los errores del modelo ajustan a una distribucin normal
H1:los errores del modelo NO ajustan a una distribucin normal

Shapiro-Wilks (modificado)
Variable
n
RDUO_HEMATOCRITO
40

Media
0.00

D.E.
0.30

W*
0.95

p (una cola)
0.2193

NO RECHAZO Ho. No encontramos evidencias en contra de la normalidad

(corriendo el riesgo de cometer un error de Tipo II)

TP 2. Diseos y ANOVA

Homogeneidad de varianzas de las subpoblaciones.

Mtodo grfico

G_II

0,61

G_III

G_I

0,30

RDUO_GR

La dispersin
dentro de cada
grupo tiene que
ser similar

G_IV

-0,01

-0,31

-0,62
5,14

5,62

6,09

PRED_GR

6,56

7,04

TP 2. Diseos y ANOVA

Homogeneidad de varianzas de las subpoblaciones.

Mtodo Analtico
Ho: las varianzas de las 4 subpoblaciones son homogneas con respecto a la
cantidad de glbulos rojos. 2 i. = 2

Ha: las varianzas de las 4 subpoblaciones NO son homogneas con respecto a la

cantidad de globulos rojos. Alguna 2 i.

NO RECHAZO Ho. Podemos suponer que la variabilidad de las 4 subpoblaciones

no difiere (corriendo el riesgo de cometer un error de Tipo II)

TP 2. Diseos y ANOVA

Ahora si el ANOVA tiene validez

Anlisis de la varianza

Variable
GR

N
40

R
0,816

R Aj
0,801

CV
5,139

Cuadro de Anlisis de la Varianza (SC tipo III)

F.V.
SC
gl
CM
F
Modelo
15,230
3
5,077
53,269
grupo
15,230
3
5,077
53,269
Error
3,431
36
0,095
Total
18,661
39

p-valor
<0,0001
<0,0001

TP 2. Diseos y ANOVA

Cmo decidimos si nos quedamos con Ho con Ha?

Resolucin del ANOVA
Comparamos la variabilidad que observamos ENTRE
tratamientos con la observada DENTRO de los tratamientos

yi.
n

GRUPO I
20 mmol
prolina
6.47
5.42
6.09
5.83
6.27
5.95
6.04
6.35
5.60
5.80
5.98
10

GRUPO II
GRUPO III
mezcla aa mezcla aa +
pro
pro
6.09
5.61
5.94
5.40
5.75
5.26
5.51
4.99
6.34
5.44
5.65
5.13
6.42
5.21
6.04
5.52
5.51
4.79
5.44
4.92
5.87
5.23
10
10

GRUPO IV
Suero fisio
7.35
7.11
6.99
6.72
7.16
6.85
6.94
7.25
6.51
6.65
6.95
10

Variabilidad
DENTRO de los
tratamientos

y..
6.01

Variabilidad
ENTRE
tratamientos

Var. ENTRE = Var. DENTRO => No rechazo Ho

Var. ENTRE > Var. DENTRO => Rechazo Ho

TP 2. Diseos y ANOVA

Construccin de la Tabla de ANOVA.

Prctica de clculo de SC a mano
Fuente de
Variacin
Grupo

Suma de
Cuadrados

n ( y y) 2
2
(
y

y
)

( y y) 2
i

Error

Cuadrados
Medios
SC / GL

na

SC / GL

ij

Total

Grados de
libertad
a-1

p-valor

CMgrupos
CMerror

n-1

ji

10x[(5.98-6.01) 2 +(5.87-6.01) 2 +(5.23-6.01) 2 +(6.95-6.01) 2] =

10x[(-0.03) 2 +(-0.14) 2 +(-0.78) 2 +(0.94) 2] = 15.125

TP 2. Diseos y ANOVA

Conclusiones

Conclusin estadstica:
Rechazo Ho con una probabilidad de cometer error tipo I de 5%.
Algn i 0
Conclusin biolgica:
La concentracin media de glbulos rojos de ratas Wistar es afectada por
alguno de los tratamientos aplicados (nivel de significacin de 0,05).
7,48

GR

5,61

Todos los tratamientos difieren

entre si o solo algunos?

3,74

1,87

COMPARACIONES
0,00
G_I

G_II

G_III

grupo

G_IV

TP 2. Diseos y ANOVA

Comparaciones

A priori conocimientos previos del investigador. Pueden

detectar diferencias que el ANOVA no detecte.
Contrastes ortogonales

Bonferroni
A posteriori slo si el ANOVA dio significativo:
Tukey
Dunnet

TP 2. Diseos y ANOVA

Contrastes ortogonales Tabla ANOVA propia

Bonferroni
Tukey
Dunnet

Se calcula una DMS que se compara con

el valor obtenido del contraste

TP 2. Diseos y ANOVA

Bonferroni

Tukey

DMS QGLerror ,

CMerror
ni

TP 2. Diseos y ANOVA

Mtodos a priori
Contrastes Ortogonales (un ejemplo)
Los tratamientos con prolina difieren del resto?

El tratamiento con prolina sla, difiere del de aa+prolina?

Ho1: GI + GIII = GII + GIV
Ho2: GI = GIII

f1

=1GI + 1GIII- 1GII -1GIV=0

f 2 =1GI - 1GIII=0

TP 2. Diseos y ANOVA

Contrastes Ortogonales

TP 2. Diseos y ANOVA

Contrastes Ortogonales
Conclusiones

Los tratamientos con prolina difieren de la mezcla de aa

sin prolina y el suero (Contraste 1)
Los tratamientos con prolina y mezcla aa + prolina
difieren entre si (Contraste 2)

=> La prolina sola no sera la responsable de la anemia

observada

TP 2. Diseos y ANOVA

Mtodos a posteriori
Mtodo de Tukey
Se comparan todos los pares de medias posibles

En este caso:
Ho1: GI = GII
Ho2: GI = GIII
Ho3: GI = GIV

Ho4: GII = GIII

Ho5: GII = GIV
Ho6: GIII = GIV

f1 GI GII 0
f 2 GI GIII 0
f 3 GI GIV 0
f 4 GII GIII 0
f 5 GII GIV 0
f GIII GIV 0
6

TP 2. Diseos y ANOVA

Mtodos a posteriori
Mtodo de Tukey

B
B

Conclusin: la mezcla de aa ms la
prolina
produce
una
disminucin
significativa de la cantidad de GR en
sangre de ratas Wistar (p<0.05). Los
tratamientos I y II produjeron una
disminucin significativa de GR en sangre
respecto al suero (p<0.05).

C
C

7,14
B

B
A

5,36

GR

Test:Tukey Alfa=0,05 DMS=0,37

Error: 0,0953 gl: 36
grupo
Medias
n
E.E.
G_III
5,23
10
0,10
A
G_II
5,87
10
0,10
G_I
5,98
10
0,10
G_IV
6,95
10
0,10
Letras distintas indican diferencias significativas(p<= 0,05)

3,57

1,79

0,00
G_III

G_II

G_I

grupo

G_IV

TP 2. Diseos y ANOVA

Estimacin de la varianza residual

Se estima a partir del

CMerror

Recordar que CM error: Variacin natural o no

controlada, estima 2
Coeficiente de variacin (CV)
CMerror
y ..

0.09

6,01

TP 2. Diseos y ANOVA

Estimacin de la magnitud del efecto: Estimacin puntual

Estimacin del efecto del tratamiento III

y GIII y GIV
5,23 6,953
*100
*100 24,78
6,953
y GIV

El tratamiento de mezcla de aa + pro disminuye la cantidad

de glbulos rojos en sangre de ratas Wistar respecto al suero
fisiolgico en promedio 24,78 %.
y GIII y GIV 5,227 6,953 1,726

El tratamiento de mezcla de aa + pro disminuye la cantidad

de glbulos rojos en sangre de ratas Wistar respecto al suero
fisiolgico en promedio en 1,726 millonesGR/mm3 sangre.

TP 2. Diseos y ANOVA

Cmo construimos un IC para la diferencia de medias?

x1 x2 VC * EE
En el caso de nuestro problema .

TP 2. Diseos y ANOVA

IC para la magnitud del mximo efecto (Tratamiento III)

1.726 QGLerror , alfa * CMerror / ni

IC95% 2.79;1.37

DMS= 0,353

La adicin de aa+pro en suero de ratas Wistar produce

una disminucin promedio entre 1,37 y 2,79 millones de
GR/mm3 respecto al suero fisiolgico con una confianza
del 95%.

TP 2. Diseos y ANOVA

Redaccin de Materiales y Mtodos

estadsticos
Los datos fueron analizados mediante un ANOVA de una va,
con el tipo de suero administrado como nico factor con 4 niveles
(grupos I a IV descritos anteriormente). Se realizaron
comparaciones a posteriores utilizando el mtodo de tukey, con una
tasa de error global del 5%. Todos los anlisis fueron realizados
con el programa InfoStat (citar).