Tema: Resumen sobre la Sntesis y maduracin del ADN Libro: Biologa de Hausman
El nivel primario de regulacin en la expresin gnica sobre clulas
procariotas y eucariotas es la transcripcin de ADN a ARN. Existen varios tipos de ARN, y cada uno se encarga de una funcin especfica, detallada ms adelante. TRANSCRIPCIN EN PROCARIOTAS
Los experimentos en E. coli aclararon los mecanismos implicados en
las transcripcin. Al igual que la ADN polimerasa, la ARN polimerasa cataliza el crecimiento de la cadena de ARN en direccin 5-3, pero en este proceso no es necesaria la intervencin de un cebador; en lugar de ello, la transcripcin empieza en secuencias especificas al inicio de los genes. La secuencia de ADN a la que se une la ARN polimerasa para iniciar la transcripcin de un gen se llama promotor, que usualmente comprenden de 6 nucletidos. A medida que avanza, la polimerasa desenrolla el molde de ADN que tiene por delante y vuelve a enrollar el ADN que queda por detrs. La sntesis de ARN continua hasta que la polimerasa encuentra una seal de terminacin, despus de lo que la transcripcin se detiene. El proceso de transcripcin se encuentra regulado por represores y activadores. TRANSCRIPCIN EN EUCARIOTAS
ARN polimerasa en eucariotas
Las clulas eucariotas contienen tres tipos de ARN polimerasa, que
transcriben distintos tipos de genes. As, la ARN polimerasa II se encarga de la sntesis de ARNm, la ARN polimerasa I acta sobre los ARNr y la ARN polimerasa III interviene en los ARNt.
Factores de transcripcin generales
La transcripcin en sistemas eucariotas necesita de ciertos factores
de iniciacin para que se desarrolle el proceso, que pueden ser generales o aquellos que regulan la expresin gnica. La regin del promotor contiene casi siempre una secuencia similar a TATAA a unos 25-30 nucletidos corriente arriba; as como una secuencia Inr, donde se inicia la transcripcin.
En clulas eucariotas es necesaria la intervencin de 5 factores de
transcripcin como mnimo para llevar a cabo el proceso, aunque generalmente actan ms.
Regulacin de la transcripcin en eucariotas
La transcripcin en clulas eucariotas est controlada por protenas
que se unen a secuencias reguladoras especficas y modulan la actividad de la ARN polimerasa, aunque las modificaciones de la cromatina tambin poseen un rol en ste proceso. Las secuencias reguladoras usualmente se localizan a gran distancia del sitio de inicio de la transcripcin, por lo que su actividad no depende de la distancia ni de la orientacin con respecto al inicio de la transcripcin y reciben el nombre de estimuladores. La explicacin del proceso a distancia de las regiones reguladoras se explica por la capacidad del ADN de formar bucles, lo que permite que un factor de transcripcin unido a un intensificador lejano interacte con la ARN polimerasa en el promotor. La actividad de cualquier estimulador dado, es especfica para un promotor. Este hecho se mantiene gracias a ciertos elementos llamados aisladores, que dividen a los cromosomas en dominios independientes y permiten la especificidad.
Estructura y funcin de los activadores de la transcripcin
En general, estos factores constan de dos dominios, una regin que
se une especficamente al ADN y otra que activa la transcripcin interactuando con otras protenas. El primer dominio difiere a nivel estructural y all se encuentra su especificidad. El segundo dominio acta de dos formas, que puede ser por medio de interacciones con el mediador y los factores de transcripcin generales o a travs de la modificacin de la estructura de la cromatina.
Represores eucariotas
Estos se unen a secuencias especficas de ADN e inhiben la
transcripcin. Lo pueden realizar por medio de la interaccin con protenas activadoras especficas, con protenas del mediador, y con corepresores que actan modificando la estructura de la cromatina.
Relacin entre la estructura cromotnica y la transcripcin
Las regiones del genoma que estn implicadas activamente en la
sntesis de ARN corresponden a regiones cromosmicas descondensadas. Los mecanismos para regular la estructura cromotnica pueden ser a travs de la acetilacin, fosforilacion y metilacin de las histonas, donde mediante modificaciones especificas es posible regular la expresin gnica y tambin existen los factores remodeladores del nucleosoma, que son complejos proteicos, que alteran la organizacin
del nucleosoma mediante el deslizamiento de octameros de histonas
sobre la molcula de ADN, reposicionando as a los nucleosomas. Regulacin de la transcripcin por ARN no codificantes
Este tipo de ARN puede reprimir la transcripcin induciendo
modificaciones histnicas, que desencadenan la condensacin cromatnica y la formacin de heterocromatia. Esta regulacin se ha evidenciado en muchas especies animales y vegetales, por lo que se sabe que es un fenmeno ampliamente distribuido en la naturaleza.
Metilacin del ADN
Este mecanismo funciona a travs del reemplazo de residuos de
citosina en el ADN por grupos metilo en la posicin del carbono-5. Se ha evidenciado que la metilacin posee un papel determinante en la supresin del movimiento de transposones a lo largo del genoma. En este tipo de mecanismo, se hace alusin a los genes impresos, cuya expresin depende de si se heredan del padre o de la madre. MADURACIN Y RENOVACIN DEL ARN
ARN ribosmico y de transferencia
El procesamiento o maduracin de este tipo de ADN es similar en
eucariotas y procariotas, y proceden del corte de un pre-ARN. En los ARNr se aaden grupos metilo y en los ARNt se modifican varias bases.
Maduracin del ARN en eucariotas
El procesamiento del pre-ARNm incluye la modificacin de ambos
extremos de la molcula, as como la eliminacin de intrones de su interior mediante corte y empalme. En el extremo 5 ocurre la adicin de casquetes o cap de 7-metilguanosina y en extremo 3 se aade colas de poli-A.
Mecanismos de corte y empalme
Este proceso se lleva a cabo en complejos llamados espliceosomas,
formados por protenas y pequeos ARN nucleares (ARNsn). Los ARNsn son los que reconocen los puntos de corte en la secuencia y la escinden. Esto es posible debido a que los pre-ARNm poseen secuencias consenso o de reconocimiento para los ARNsn. Ciertos ARN mitocondriales, cloroplsticos y bacterianos pueden autoempalmarse, debido a que el proceso se cataliza por secuencias de intrones.
Corte y empalme alternativo
Debido a la presencia de muchos intrones, en algunos casos es
posible generar varios tipos de ARNm, a partir del mismo gen. Esto constituye otro mecanismo de regulacin de la expresin gnica, al
generar una diversidad de los ARNm obtenidos y en consecuencia de
las protenas resultantes. Correccin del ARN
En ciertos tipos de ARNm, a parte de los mecanismo de corte y
empalme alternativo se efectan otros procesos que alteran el funcionamiento de ste componente. Estos mecanismos implican cambios de bases nicos y entre estos se encuentran las reacciones de desanimacin de citosina a uridina y de adenosina a inosina.