El flujo de energa ingresa a los sistemas a travs de los productores y
los abandona a distintos niveles trficos en forma de calor. En los sistemas comunitarios la materia sigue las mismas vas por las cuales fluye la energa; sin embargo, a diferencia de esta, la materia o los compuestos inorgnicos que componen la materia viva, fluyen en forma cclica en el ecosistema. Entre las sustancias inorgnicas que forman parte de los organismos vivos, las ms significativas son: agua. Carbono, nitrgeno, fsforo, potasio, sulfuro, calcio, magnesio, sodio, cloro y algunos minerales, como fierro, cobalto, molibdeno y zinc. En general, el flujo de estas sustancias en el ecosistema se mueve en los distintos niveles trficos, pero adems fluyen a travs de los sistemas geofsicos: la atmsfera, la corteza terrestre y las fuentes de agua. As, debido a que este movimiento atraviesa tanto el componente bitico como el abitico del ecosistema, los ciclos que describen estas sustancias son conocidos como ciclos biogeoqumicos.