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volutif.
Les bases : vont saccrocher au niveau du C1 du ribose, limination
dune molcule deau, accrochage par un azote (N), liaison
covalente trs solide.
2 bases pour crer 2 nuclotides diffrents dans lADN et lARN.
- Pyrimidine : (6 sommets, cest par le N1 que se fait la liaison au
sucre, a partir de ce noyau, de nombreux constituants vont se fixer
Il existe 3 types de base pyrimidique :
Luracile (U) 2,4 dioxo pyrimidine formation de double liaison O. (dioxo.)
La cytosine : 2, oxy, 4 amino, au 4 on a un NH2 donc fonction
amine.
La thymine (T) : la 2,4 dioxo 5 methyl pyrimidine. (=5mthyl uracile)
U et C sont les 2 que lon trouve dans lARN,
Dans lADN on trouve la C et T. au fur et a mesure de lvolution,
comme ARN a proprit dautocatalyse, il est plus fragile, luracile plus
fragile aux mutations que la thymine, donc la nature a invent un
driv de luracile qui est la thymine. ADN a un dsoxyribose moins
fragile que le ribose de lARN.
- Purine : noyau pyrimidine + cycle 5 sommets, cest par
lintermdiaire du N9 que va se faire la liaison osidique.
2 types de nuclotides :
Ladnine (A) : dcouvert dans le ganglion 6NH2 purine
Guanine (G): 2 amino 6 oxy purine.
On les retrouve dans tous les acides nuclique ADN et ARN, ADN sous
forme de succession de lettres; C A T G, et dans ARN T remplac par U. 3
milliard de lettres chez lhomme.
Quand on forme un nucloside (2 pices : sucre + base),
Luracile + le sucre = uridine
le Nt = UMP
Cytosine + sucre = cytidine
le Nt = CMP
Thymine + sucre = thymidine
le Nt = dTMP
Adnine + sucre = Adnosine
le Nt = AMP
Guanine + sucre = Guanosine
le Nt = GMP
Nuclotides vont se former par laccrochage donc de la fonction
ester en 5. Elimination dune molcule deau, la fonctoin acide de
lH3PO4 va saccrocher et on aura des charges -. Nt permet dautres
fonctoin cellulaires a ltat isol : Nuclotide qui contient de ladnine, on
peut lappeler lAMP. (adnosine monophosphate) si on rajoute Pate ADP
ATP.. pareil pour le u UMP.
Doubles liaisons au niveau de P instable, contenu en Energie libre lev,
pour quE libre diminue, il faut quelle shydrolyse. Quand on libre de
lacide phosphorique on recre stabilit complte de la molcule, et lE de
lacide phosphorique est basse donc libration dE.
AMP = acide adnylique.
Composition en base connu des les 50s mais pour la structure + difficile
car pour connaitre assemblage des molcules de base, la seule technique
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grand sillon et un petit sillon. 2 sillon selon la faon dont la double hlice
se tord sur son axe.
Inclinaison des paires des bases environ 90 (6 dcart)
Longueur de lADN humain 3 milliard de Nt, cela fait un mtre (0,34nm x
3 milliard.) 3 milliards de paires de bases. (muguet 78Gbases)
On a 2 gnomes, donc 2m car gnome maternel et paternel..
Mensurations dune molcule dADN retenir la structure de type A.
On en trouve de type A court et trapu (pas de lhlice 2,5 nm, diam de
2,5nm et le nombre de paire de base par tour est de 11, base incline par
rapport laxe de lhlice, Adn court et trapu.
Et structure de type Z tir et mince (site de recombinaison gntique
chromosome, rgion chromosomique) diamtre 1,8nm et le pas de lhlice
est de 4,6 nm, elle est plus tir, et le nombre de paire de base est de 12.
Message gntique de la 2e chaine respecte les rgles dappariement. Les
messages sont donc complmentaires, mais par contre les 2 messages
gntiques sont diffrents. La proportion, quand on dose lAdnine on aura
autant de thymine, pareil pour la guanine et cytosine, par contre le
rapport A+T/ C+G, il est de lordre de 1,5, il y a donc plus de A et T.
Masse molculaire sexprime en dalton : nombre de molcule par mol :
masse dune mol (6,023) quand on lapplique a lhydrogne = 1 gramme.
Milliers de fois plus gros quun atome dH. ADN se mesure en Nt. Nt
environ 350Da.
3) Structure des ARN
Pas de structure rgulire en double hlice. Structure plus fragile.
ARN les plus abondant de la cellule sont ceux des ribosomes, trs
important aux fonctions du ribosome 80% (120Nt a 4700Nt)
15% pour les ARNt (100aine de Nt) rle dadaptateur pour amener les AA
sur les ribosomes.
Les ARNm qui transmettent linfo gntique la production de protine, ils
se dtruisent trs vite, dpend de taille des gnes de 1000 a 10 000Nt.
ARNsn
ARNnc : non codant: dont les plus imp. Sont les ARNmi (20 a 30Nt), rle de
transcription et traduction,
Pas de structure en double hlice, Les ARN peuvent former des appareils
de structure 2ndaire. On peut imaginer quil y a des zones apparies en
hlices mais le reste de la structure est globalement pas appari, on peut
avoir structure tige tige boucle, ou en forme dpine cheveux.
Structure non rgulire.
4) Mtabolisme des acides nucliques :
Cest lensemble des modifications chimiques qui permettent de
crer des acides nucliques et de les dtruire.
Chaque jour, sans le savoir on renouvelle 1kg de la masse corporelle, les
tissus les plus sujets a un renouvellement est la peau, lpithlium
intestinal surtout et les cellules souches prcurseurs des GR et GB de
notre sang.
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La mitose, une cellule mre va donner 2 cellules filles, donc doit crer une
autre mol dADN, nos cellules font des conomies car pour synthtiser un
nuclotide, le plus dnergie est pour synthtiser la base.
On transforme le glucose en ribose.
H3PO4 est dispo par lalimentation.
Le plus difficile ce sont les bases, par contre on peut rcuprer des bases
dans les voies de rcupration. Si cellule a pas assez de ce recyclage
des bases, il faudra fabriquer avec un rythme plus important, il va falloir
donc une voie de NOVO synthse a neuf des bases.
- Voie de rcup : sans le savoir on renouvelle 100 a 200g de
lpithlium intestinal, notre propre ADN va tre en morceau et on
va rcuprer cet ADN pour recrer de lADN neuf, bases peuvent
tre tir de lalimentation comme reprendre de lADN dans la viande
par ex qui va coup lADN grce a des nuclases. La voie de
rcupration consomme moins dnergie environ 5 6 moins
dnergie que la voie de NOVO.
Selon quil sagit de pyrimidine ou purine utilise 2 types denzymes,
pour les pyrimidines, il y a des nuclosides kinase, a partir de
lalimentation, on rcupre le nucloside et on accroche lacide
phosphorique. ATP sert de donneur de groupement Pate pour obtenir un
Nt a partir dun nucloside.
Pour les purines: au lieu dutiliser le sucre et la base demble, on
utilise que la base, on utilise les phospho rybosyl transfrase. On
utilise le Phospho rybosyl pyro Pate (PRPP) : ajoute le ribose et lacide
phosphorique obtention dAMP et GMP.
PRPP : activ : on a PR 1 pyro Pate: quand on libre 2 mol dacide
phosphorique, (pyro car quand libre 2 H3PO4 gnre du feu.) 2 pate
runis par groupement phospho anhydride. Imp est de voir que
demble pice rapproch grce a phosphorylase qui vont ajout sucre
phosphoryl sur la base, on fait partir le groupement pyro pate qui libre
de lE et on ajoute la base au niveau du 1 donneur de ribose.
APRM adnine phospho ribosyl transfrase et GPRT.
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