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Mdulo 1
Biologa Molecular
11 de octubre de 2013
AGENTES ALQUILANTES: Aaden grupos alquilo (etilo o metilo) a las bases nitrogenadas y
alteran su patrn de apareamiento bloqueando la replicacin.
AGENTES INTERCALANTES: Son compuestos que se intercalan entre los nucletidos del ADN
y producen adiciones de un solo par de nucletidos. Entre los agentes intercalantes se encuentran la
proflavina, la acridina y el etidio.
ANLOGOS DE LAS BASES: Son compuestos qumicos con estructura similar a la de las bases
nitrogenadas normales que se pueden incorporar al ADN en lugar de stas. El 5- bromouracilo es un
anlogo de la timina
ENERGA IONIZANTE: La exposicin del ADN a la luz UV produce dmeros de pirimidinas. La
luz UV produce que se formen enlaces covalentes ente 2 pirimidinas contiguas, lo que interfiere con
la unin normal de las bases nitrogenadas con la cadena complementaria.
La radiacin ionizante produce dao directo en las bases nitrogenadas del ADN e induce la
generacin de especies reactivas de oxgeno, adems produce roturas de los enlaces N-glucosdicos
que conducen a la formacin de sitios apurnicos.
Transcripcin:
El primer paso en la expresin gnica es la transcripcin, que es el paso previo
y necesario para la generacin de protenas funcionales que definen el
metabolismo y la identidad de las clulas. La secuencia del ADN que se copian
se denominan genes que son una secuencia lineal de nucletidos en la
molcula de ADN que contienen la informacin necesaria para la sntesis de un
ARN funcional. Estos genes se sitan a lo largo de cada cromosoma en una
posicin que se denomina locus.
Gerstein describe a un gen como un conjunto de secuencias que codifican para
potenciales productos funcionales que se sobreponen entre si y que pueden
estar localizados en ms de un locus en el ADN.
Factores transcripcionales
Son protenas que se unen al ADN en el promotor, potenciador o silenciador
para el control de la expresin de los genes. Estos se unen al ADN
reconociendo una secuencia especfica, aunque una misma secuencia puede
ser reconocida por ms de un factor que puede ser activador o represor. Los TF
se han clasificado de acuerdo a su funcin:
Proceso de Transcripcin:
La transcripcin tiene lugar en el ncleo, en el sitio de inicio de este proceso, la
molcula de ADN se separa de forma transitoria en 2 cadenas sencillas y una
se utiliza como molde para la sntesis de ARND, formando una burbuja (Burbuja
de transcripcin).Esta reaccin se divide en 3 etapas:
Regulacin de la transcripcin
El desarrollo y el fenotipo de un organismo pueden regularse por el producto
gnico que interacta con otros genes o con el ambiente en tiempo y espacio.
TRADUCCIN
Se conoce como traduccin a la sntesis de una protena de acuerdo con la
informacin gentica y se emplea como molde una molcula de ARNm.
Se llama traduccin porque interpreta la informacin contenida en el gen
utilizando un cdigo gentico a travs del cual desarrolla una lectura de la
secuencia de nucletidos contenidos en el ARNm.
La cadena molde que la traduccin requiere para su inicio es el ARNm, que se
codifica por el cdigo gentico con una secuencia de 64 codones diferentes.
A la primera reaccin de la traduccin se le conoce como polimerizacin, que
es la adicion secuencian de aminocidos uno tras otro mediante la formacin
de enlaces peptdicos.
Cdigo Gentico
Un gen contiene la informacin necesaria para transcribirse en un ARNm, que a
su vez puede expresarse como una protena.
El ADN est formado por 4 bases nitrogenadas. La forma en la que se codifica
la informacin es en grupos de 3 nucletidos, lo que conforma un triplete o
codn, que representara un aminocido o seal especfica que la clula
interpreta durante el proceso de traduccin.
Este sistema de cdigos se denomina cdigo gentico, este cdigo gentico es
utilizado por la clula para sintetizar protenas a travs del proceso de
traduccin, donde la secuencia de nucletidos del ARNm se lee en grupos de 3
de modo secuencial y sin interrupciones, para convertirse en una secuencia de
aminocidos.
El sitio E es el lugar por donde saldr del complejo ribosomal el ARNt sin
aminocido.
Fenmeno de bamboleo
La interaccin codn/anticodn ocurre bsicamente con la teora de
complementariedad de bases establecida por Watson y Crick por lo que
debera de existir igual nmero de codones que de anticodones, es decir 61,
sin embargo, se sabe que existen menos de 61 ARNt.
El reconocimiento se da entre la complementariedad de las bases 1, 2 y 3 del
codn con las bases 3, 2 y 1 del anticodon. Para explicar este fenmeno se
estableci la hiptesis de bamboleo que expresa 2 reglas:
1. Las bases tercera y segunda del anticodn forman puentes de H con las
bases primera y segunda del codn.
2. La primera base del anticodn puede orientarse de formas ligeramente
distintas para interaccionar con distintas bases en la posicin tercera del
codn.
Trfico o destino de las protenas
Tambin es llamado topognesis y se refiere a la ruta que siguen las protenas
en la clula hasta alcanzar la localizacin donde ejercern su funcin. Esta
topognesis se realiza en el citosol, en donde participan varios organelos como
el retculo endoplasmatico y el complejo de Golgi.
La clave del proceso por el que las protenas se dirigen a su sitio son las
seales de clasificacin, conocidas como secuencias seal, pptido seal o
etiqueta seal, entre las que se encuentran las protenas de membranas,
lisosomales y de secrecin, mientras que las protenas que no presentan
secuencias seal permanecen en el citosol.
Pptido seal o etiqueta seal
Los pptidos seal cuentan con una secuencia corta de aminocidos situados
con frecuencia cerca del extremo amino de la cadena que marcan a la protena
recin sintetizada. Esta se divide en 3 secciones, la primera cuenta con uno o
ms aminocidos bsicos en el extremo N-terminal; la segunda se encuentra
en la parte central y consta de 6 o 7 aminocidos hidrfobos y la tercera se
encuentra en la parte C-terminal, es hidrfila y contiene la zona reconocida y
cortada por la peptidasa lder.
Mecanismo de accin: La secuencia seal sobresale del ribosoma y se une
inmediatamente a la partcula de reconocimiento de la seal (SRP) que se
encuentra en el retculo endoplsmico y se interrumpe momentneamente
durante la sntesis proteica. La SRP se disocia del ribosoma y la sntesis se
reinicia.
La protena TRAM se une a la secuencia de seal y, junto con una familia de
molculas llamadas protenas Sec forman el complejo de translocacin, que
dirige la protena naciente hacia el interior del retculo endoplsmico. Una vez
completa la sntesis, el ribosoma se disocia de la membrada del retculo
endoplsmico y puede volver a comenzar un nuevo ciclo.
Modificaciones Postraduccionales
La mayora de los procesos biolgicos son regulados por modificaciones
postraduccionales de las protenas, y las condiciones que interrumpen la
regulacin de tales acontecimientos pueden conducir al desarrollo de una
enfermedad.
Las modificaciones postraduccionales son importantes para determinar la
funcin y la actividad de la protena. De las casi 200 modificaciones distintas
que se conocen, la fosforilacin es una de las ms importantes y abundantes.
Tales modificaciones tienen un papel importante en la estabilidad, plegamiento
y reconocimiento.
Los principales mecanismos de modificaciones postraduccionales son los
producidos en la etiqueta seal, en algunos residuos de aminocidos y la
protelisis.
Las modificaciones postraduccionales ms importantes son: