1.

En que consiste el mtodo de sntesis de oligonucletidos

basado en la qumica de fosforamiditos?
2. para que se utilizan los oligonucletidos cebadores en la PCR?
Son oligonucletidos sintticos que hibridan con la regin, complementaria
al ADN molde, que se desea amplificar y propician el inicio de la reaccin de
elongacin por la Taq ADN polimerasa.
3. Qu es la taq polimerasa y cules son sus caractersticas para
ser usada en la PCR?
Taq DNA polimera es una enzima termoestable que cataliza la
polimerizacin de nucletidos en la direccin 5-a-3 a 70-74 C y exhibe
una vida media de 30-45 minutos a 95 C. Esta enzima posee actividad
polimerasa y exonucleasa en la direccin 5-3' pero carece de actividad
exonucleasa en la direccin 3'-5' (prueba de lectura). La enzima es capaz de
amplificar productos de hasta 5 kb de longitud, con una adenosina en su
extremo 3 lo que facilita el clonado en sistemas del tipo TA.
4. Cmo puedo calcular la cantidad de molculas generadas en la
PCR a partir de una molecula de DNA de doble cadena?
2No ciclo + 1
5. Cules son los tipos y aplicaciones de la PCR y RT- PCR?

PCR anidada
Tcnica muy sensible de PCR en la que el producto de una amplificacin es
utilizado como molde para realizar una segunda amplificacin con cebadores
que se ubican dentro de la primera secuencia amplificada. Este tipo de PCR es
muy especfica.

17.2. PCR Multiplex

Es un tipo de PCR en el cual se amplifica ms de una secuencia en una misma
reaccin, en este tipo de PCR se utilizan mltiples pares de primers (hasta 8) lo
que da una serie de productos, los amplificados pueden verse como mltiples
bandas en un gel, este tipo de PCR es frecuentemente usada en diagnstico
mdico.
17.3. PCR in situ
Es una PCR realizada sobre preparaciones fijas sobre un portaobjetos, consiste
en una reaccin de PCR en secciones histolgicas o clulas, donde los
productos generados pueden visualizarse en el sitio de amplificacin. En la
tcnica de in PCR-in situ se realiza primero amplificacin de ADN blanco y luego
deteccin mediante hibridacin in situ convencional con sondas ADN/ARN. De
esta manera pueden detectarse cantidades pequesimas de genoma.
17.4. RT-PCR
Donde el molde inicial es ARN y se requiere de una enzima denominada
transcriptasa inversa, para realizar la conversin del ARN a un tipo de ADN
llamado ADNc (ADN complementario). Es especialmente til cuando solo se
dispone de pequeas cantidades de ARN, esta tcnica se utiliza para amplificar
genes especficos
En esta PCR se requiere de dos tipos de cebadores: un cebador denominado
Antisentido que inicia la reaccin de RT-PCR y el cebador denominado Sentido
(sense) que realiza el duplex de ADNc, adems requiere una ADN polimerasa
dependiente de ARN, la RT-PCR puede ser usada para construir bibliotecas de
ADNc.
17.5. PCR tiempo real
Permite cuantificar, la cantidad de ADN o ARN amplificado en cada momento.
Para la deteccin de la cantidad de ADN especfico se emplea una sonda unida
a dos fluorocromos que hibrida en la zona intermedia entre el cebador directo
(forward) y el inverso (reverse), cuando la sonda est intacta, presentan una
transferencia energtica de fluorescencia por resonancia (FRET). Dicha FRET no
se produce cuando la sonda est daada y los dos fluorocromos estn
distantes, producto de la actividad 5'-3' exonucleasa de la ADN polimerasa.
Esto permite monitorear el cambio del patrn de fluorescencia y deducir el

nivel de amplificacin del gen. (The Board of Trustees of the University of South
Carolina)

6. Qu es la expresin gentica?
La expresin gnica es el proceso por medio del cual todos los
microorganismos procariotas y clulas eucariotas transforman la
informacin codificada por los cidos nucleicos en las protenas necesarias
para su desarrollo y funcionamiento.
7. Cules son los mtodos para evaluar la expresin gentica?
Gen del Reportero
El borrar Septentrional
El borrar Occidental
Hibridacin in situ Fluorescente (FISH)
Reaccin en cadena Reversa de polimerasa de la transcripcin (RTPCR)
Anlisis Serial de la Expresin Gnica (SABIO)
Microrray de DNA
8. Qu son los microarreglos?
Un conjunto ordenado de genes en una pequea superficie (10,000 muestras
por cm2). Los microarreglos de DNA son una nueva herramienta de la biologa
molecular y las ciencias genmicas. Posiblemente es una de las aplicaciones
ms importantes para la informacin obtenida de la secuenciacin sistemtica
de los genomas completos.
9. Qu son las protenas?
Son constituyentes qumicos fundamentales e imprescindibles en la materia
viva porque:
a)son los "instrumentos moleculares" mediante los cuales se expresa la
informacin gentica; es decir, las proteinas ejecutan las rdenes dictadas por
los cidos nuclicos.
b)son sustancias "plsticas" para los seres vivos, es decir, materiales de
construccin y reparacin de sus propias estructuras celulares. Slo
excepcionalmente sirven como fuente de energa.
c)muchas tienen "actividad biolgica" (transporte, regulacin, defensa, reserva,
etc...). Esta caracterstica diferencia a las proteinas de otros principios
inmediatos como glcidos y lpidos que se encuentran en las clulas como
simples sustancias inertes.

10.

Qu mtodos se emplean para el anlisis de proteonoma?

Electroforesis de alta resolucin en dos dimensiones y la caracterizacin de

protenas. Desnaturalizacin de la electroforesis del gel de poliacrilamida
(PAGINACIN) o de la electroforesis del gel de poliacrilamida del sulfato
dodecyl de sodio (SDS-PAGE), de la electroforesis bidimensional del gel, y de la
cromatografa lquida de alto rendimiento (HPLC).
11.
en que consisten los mtodos de cuantificacin de
protenas?
El principio bsico consiste en determinar el contenido de protenas que
presentan las muestras (Hemingway, 1986). La determinacin y cuantificacin
de protenas contenidas en tejidos y fluidos puede ser usada como referencia
para cuantificar diversos componentes en el sistema biolgico.

12.
Cules son las aplicaciones de la computacin en la
biologa molecular?
Bases de datos
Software para visualizacin
Programas para control de reactivos, geles y otros materiales
Generacin y ensamblaje de secuencias
Programas para anlisis de secuencias
Programas para prediccin de estructura de protenas
Paquetes de integracin y ensamblaje de mapas genticos
Software para clasificacin y comparacin
Tcnicas de Inteligencia Artificial
Gestin de datos
Bases de datos locales o accesibles mediante redes de comunicaciones.
Literatura mdica y cientfica unida a las secuencias.
Distribucin de datos
Redes de comunicaciones
Aplicaciones
Gestin de datos en el laboratorio
Automatizacin de experimentos
Ensamblaje de secuencias contiguas

Prediccin de dominios funcionales en secuencias gnicas

Alineacin de secuencias
Bsquedas en las bases de datos de estructuras
Prediccin de genes
Prediccin de la estructura de protenas
Evolucin molecular. rboles filogenticos
Informacin Cientfica
Documentos de difusin y apoyo a la Bioinformtica
13.
Cules son las aplicaciones de la biologa molecular en el
campo profesional del QFB?
Gentica y ecologa de poblaciones
Evolucin de sistemas reproductivos
Mapeo gentico de caracteres de inters agronmico
Procesos de hibridacin e introgresin
Determinacin de patrones biogeogrficos
Resolucin e identificacin de relaciones taxonmicas
Reconstruccin de filogenias
Estructura poblacional
Biologa de la conservacin.
Busqueda de genes de inters
http://www.ugr.es/~quiored/espec/rmn.htm