Cahier des charges

Formation
"SIG et analyse spatiale dans l'environnement
R"
1.Objet :
1-1 Contexte de la demande
LINRA PACA souhaite mettre en place une formation portant sur les SIG,
principalement lattention des doctorants et postdoctorants de lunit de
recherche de Biostatistique et Processus Spatiaux BioSP.
L'unit de BioSP du Centre de Recherche INRA PACA d'Avignon conduit des
recherches en statistiques et en modlisation spatiales et spatio-temporelles,
la fois thoriques et appliques, avec un intrt particulier pour les
applications relevant de l'environnement, de l'cologie, de l'pidmiologie et
de la biologie des populations.
Dans le contexte de recherche de lunit, l'environnement R est largement
utilis par les futurs stagiaires. L'aspect spatial et gographique est de plus en
plus ncessaire dans certains projets de recherche soit pour faire des
simulations (utilisant l'aspect spatial) et/ou pour rcuprer des donnes
stockes dans des bases existantes.
Cette formation sadresse donc des participants qui auront utiliser des SIG
en lien avec des traitements de donnes pour faire de l'analyse statistique
sous R.
1-2 Objectif de la formation
Objectif dimpact :
Permettre aux participants de sapproprier les concepts sous-tendus par les
SIG, ainsi que leurs modalits dapplication via lexemple du logiciel QGIS,
afin quils puissent dterminer la pertinence de leur utilisation dans certains
projets de recherche de modlisation statistique, sous lenvironnement R.
Objectifs gnral pour les agents
tre capable de :
Comprendre les concepts associs aux SIG,
Savoir les mettre en application avec QGIS (Quantum GIS) et PostGIS,
Comprendre les formats internes des donnes

spatialises/gorfrences
Savoir raliser des interfaages divers environnements (outils,
langages), et tout particulirement avec l'environnement R pour les
traitements statistiques.
Savoir stocker et interroger des bases de donnes gorfrences au
travers de SIG.

1-3 Public
Personnels scientifiques, ingnieurs, doctorants et postdoctorants devant utiliser des
logiciels de SIG en liaison avec des traitements statistiques.
La formation est principalement destine des agents de lunit BioSP mais elle sera
galement ouverte des agents dautres units de recherche ayant des besoins
similaires.
Le nombre de participants prvu est compris entre 8 et 10.

1-4 Elments de contenu

Axe n1 : Systmes dinformations gographiques et concepts
- Modles de donnes dans les SIG : modle raster, modle vecteur.
- Relations topologiques entre objets.
- Systmes de rfrence, projections.
- Description dtaille des formats de donnes vectorielles pour diffrents outils :
QGIS [format shp ], PostgreSQL et PostGIS, GRASS ; implmentation des relations
topologiques.
Axe 2: QGIS , prise en main

- Prsentation de QGIS et de son mcanisme de plugin.

- Chargement de donnes existantes : fichiers shp, fichier csv, tables
PostgreSQL.
- Fonctions cartographiques de base : affichage, symbologie quantitative,
symbologie qualitative, tiquetage, impression, lgende et export image.
- Fonctionnalits de base des SIG : slection dobjets, projection,
reprojection, accs aux donnes smantiques en lecture/criture,
- Fonctionnalits de gotraitement : croisement de couches, zone tampon,
- Fonctions de cration/dition de couche dinformation (point, ligne,
polygone).
Axe 3 : Donnes gographiques vs donnes spatiales : analyse et
manipulation avec R

- Apport de la rfrence gographique (localisation) aux donnes spatiales.

- Pourquoi et comment utiliser (reprsentation, visualisation ) les donnes
spatiales dans R.
- Panorama (non exhaustif) des packages de R traitant des donnes
spatiales (sp, spatial, rgdal, gstat, geoR, geoRglm, SpatialTools, ).

Caractristiques de ces packages.

- Interfaage et principaux packages lis aux SIG courants :
ArcGIS, QGIS, PostGIS, GRASS GIS.
Partie applicative :
Une mise en pratique des diffrents aspects thoriques (exemples, exercices
et TP) est prvoir tout au long de la formation.
Dans ce cadre un cas d'application relle doit tre traite :
Importation de donnes, visualisation, slection dun sous ensemble,
exportation vers R, traitement des donnes dans R (statistiques de base),
rimportation des donnes et visualisation dans QGIS.
1-5 Organisation mettre en uvre :
Salle de formation : 2 possibilits sont envisages
La salle de formation informatique quipe de 8 postes fixes peut tre utilise.
Lautre solution consiste ce que les participants utilisent leur ordinateur
portable dans une salle de formation classique.
Le choix sera fait, en collaboration, par le formateur et les participants, tenant
compte des logiciels installer.
Phases pralable la formation:
Une runion de prparation pralable la formation, en prsentiel ou en
visioconfrence avec le formateur et les personnes ressource INRA, est
prvoir. Cette runion permettra dadapter la formation notre
demande.
Le formateur prvoira linstallation des outils sur les ordinateurs utiliss
par les participants.
Supports de formation:
- Fourniture dun support de formation papier et lectronique.
1-6 Dure et priode
La dure estime est de 3 ou 4 jours. Si besoin, le prestataire pourra proposer
une dure diffrente en argumentant sa proposition.
La formation est raliser entre le 20 mai et le 20 juin 2014.

2. Type de procdure : march procdure adapt

3. Centre : INRA PACA
4. Unit administrative : 0402 Formation Permanente
5. Domaine dachat : Gnral

6. Rfrentiel inter EPST : 27 Gestion des Ressources Humaines

7. Caractristique du besoin :

voir la description dtaille

paragraphe 1

8. Remise des offres

Les offres doivent parvenir au plus tard le 26 avril 2014 16 h 00 par courriel
et par courrier.
mireille.mounition@paca.inra.fr et estelle.ferrari@paca.inra.fr
Estelle FERRARI
SDAR/Formation INRA
Domaine Saint Paul Site Agroparc CS 40509
84914 AVIGNON Cedex 9

9- Critres de slection des offres :

-

Contenu,
Fourniture et structuration de litinraire pdagogique,
Mthodes pdagogiques,
Supports de formation,
Dure,
Rfrences et expriences du formateur,
Proposition financire (Prix. H.T./jour + frais de dplacements ventuels).

10 Contacts
Contact adminsitratif
Estelle Ferrari, Responsable formation adjointe PACA
Tel : 04-32-72-20 44
Courriel : estelle.ferrari@paca.inra.fr
ou
Mireille MOUNITION
Tel : 04-32-72-20 20
Courriel : mailto: mireille.mounition@paca.inra.fr
INRA Centre PACA - Equipe Formation
Domaine St Paul Site Agroparc CS 40509
84914 AVIGNON Cedex 9
Contact technique :
Haddad Abdelmalek INRA
Centre PACA - Unit de recherche BIOSP
Domaine St Paul Site Agroparc CS 40509
84914 AVIGNON Cedex 9
Courriel : Abdelmalek.Haddad@avignon.inra.fr
Tl : 04 32 72 21 58