Localizacin y degradacin de

protenas
Biologa molecular II - 2016

MSc. Milagros Quintana Cceda

Localizacin de protenas sintetizadas

En el citoplasma
En algn orgnulo celular
Ancladas a la membrana plasmtica
Secretadas al exterior de la clula
Las localizaciones determinadas por pptidos
seal que forman la secuencia de la protena.
Proceso de clasificacin basado en la unin
de una o ms protenas (algunas localizadas
en superficie de organela) al pptido seal.
La migracin puede ocurrir:
Cuando protena ha sido completamente
sintetizada , el destino es en:
Ausencia de seales: Citosol
Presencia de seales: Mitocondria,
Cloroplastos, Peroxisomas, Ncleo
De forma simultnea al proceso de sntesis
de la protena.
Ruta de secrecin de protenas: Retculo
endoplasmtico, Aparato de Golgi,
Lisosomas, Membrana plasmtica,
Exterior de la clula

1.

2.
3.
4.
5.
6.

La protena se sintetiza en el citosol, donde se mantiene desnaturalizada

mediante su unin a Chaperones
El pptido seal es reconocido por receptores en la membrana externa
mitocondrial
Los receptores se asocian a un canal de la membrana por el que se
introduce el pptido desnaturalizado
En el interior se asocian al pptido otros chaperones que mantienen a la
protena desnaturalizada hasta su entrada completa
Una vez ha entrado, con consumo de ATP se liberan los chaperones y la
protena adquiere su estructura
Eliminacin del pptido seal

Secuencias seal

Degradacin de protenas

Puede ser por digestin enzimtica o protelisis

intracelular en tejidos
Produce aminocidos que:
a) formarn a las nuevas protenas que se estn
sintetizando en la clula
b) formarn a molculas seal(hormonas,
neurotransmisores) o
c) se degradarn separando su grupo amino de la
cadena carbonada.

Se pueden sintetizar aas de novo

Los aas se reutilizan y slo cuando hay exceso
se degradan.

Digestin de protenas de la dieta y

absorcin de aminocidos

Comienza en el estmago, la ingesta de

protenas estimula la sntesis de la
hormona gastrina que a su vez estimula la
liberacin de pepsingeno, forma inactiva
de la ppsina, una endopeptidasa que
produce fragmentos peptdicos (activacin
pH 2)
Continua en el intestino delgado por accin
de las peptidasas pancreticas:
quimotripsina y tripsina y otras
enteropeptidasas, que son secretadas como
zimgenos. stos se activan por protelisis
en el tracto digestivo.
Los aa se absorben en los enterocitos de la
mucosa intestinal y se distribuyen por la
sangre hacia los rganos y tejidos

Degradacin de protenas por protelisis

intracelular: ubiquitina y proteasoma

Desempea importantes funciones en las clulas como punto de control de diversos

procesos biolgicos, ejm la progresin del ciclo celular.
En eucariotas dos vas:
a) La ruta vacuolar donde participan los lisosomas, los endosomas y el retculo.
b) La ruta citoplsmica que est mediada por el sistema ubiquitina-proteasoma. sta va
es fundamental en la regulacin de las protenas de vida media corta (10 a 120 min)
Ubiquitina:
Protena pequea, presente en todas las clulas eucariotas.
Altamente conservada (3 aa diferentes entre especies). Ser humano y
levadura comparten un 96 % de la secuencia
Sirve como seal para la degradacin de protenas. Realiza sus funciones
gracias a la conjugacin con una gran gama de protenas diana
Regula la funcin, la localizacin y las interacciones protena-protena
C-term Gly y 7 Lys

MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPP
DQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGG

La protena a degradar debe de estar ubiquitinizada para ser reconocida por el proteasoma.

Proteasoma o proteosoma
Complejo multiprotico con forma de barril con tres
subunidades con actividad proteasa
Localizado en ncleo y citoplasma de eucariotas. Tambin
en Archaea y algunas bacterias
Degrada aprox. el 90% de las protenas celulares,
principalmente las sintetizadas en el interior de la clula, las
no necesarias o daadas
Contiene un "ncleo" compuesto de 4 anillos apilados
alrededor de un poro central. Cada anillo est compuesto por
7 protenas individuales.
Los 2 anillos internos contienen subunidades proteicas ,
conformando los sitios activos de las proteasas (ubicados en Actividad proteasa:
1 : quimiotripsina con preferencia
caras internas para que protena a ser degradada tenga que
por restos Tyr (Y) o Phe (F).
entrar a travs del poro antes de ser procesada)
2 : tripsina con preferencia por
Los 2 anillos exteriores contienen subunidades , cuya
restos Arg (R) o Lys (K).
funcin es mantener una "puerta" por la cual las protenas
5 con actividad post-glutmico con
puedan entrar al barril.
preferencia por restos Glu (E) u otros
Las subunidades son controladas por regiones reguladoras,
residuos cidos.
a veces llamadas "pestaas", que reconocen los compuestos
poliubiquitnicos en los sustratos de las protenas e inician el Las Archaea tienen todas las subunidades
proteosmicas y idnticas
proceso de degradacin

Proteosoma 26S

La forma ms comn con pm de 2 kDa aprox.

Presenta un ncleo 20S y 2 subunidades
reguladores 19S
El ncleo que es hueco, presenta una cavidad
cerrada donde las protenas son degradadas.
Las aberturas en los extremos del ncleo sirven de
entrada a las protenas.
Las 19S situadas en los extremos del barril
presentan mltiples sitios con actividad ATPasa y
sitios de unin a ubiquitina, conformando as la
estructura encargada de reconocer a las protenas
poliubiquitinadas y transferirlas al ncleo cataltico.
Existe una sub. reguladora 11S alternativa, que
bsicamente acta igual que las 19S. Se supone que
las 11S juegan un papel fundamental en la
degradacin de pptidos exgenos producidos
despus de haber sufrido una infeccin viral.

El proceso de ubiquitinacin ms el
proceso de degradacin
proteosmica recibe el nombre de
sistema ubiquitino-proteosmico.

Sistema Ubiquitino-proteosmico:
Ubiquitinacin de protenas
Implica a tres tipos de enzimas:
E1: Enzima activadora de ubiquitina
Reconoce a la Ubiquitina.
Dependiente de ATP. El paso inicial implica
la produccin de un producto intermedio
adenilil-ubiquitina
Activa el grupo Carb del residuo C-term
(Gly 76) formndose un enlace tioster
entre la Gly 76 y un resto de Cys de enzima
E2: Enzima conjugadora de ubiquitina
Transporte de Ubiquitina Activa
Acepta la ubiquitina unida a la enzima E1
formndose un enlace tioester entre la Gly
76 y un resto de Cys de la enzima
E3: Enzima ligadora de ubiquitina
Reconoce a la protena sustrato
Transfiere la ubiquitina de enzima E2 al
grupo NH3 (amino epsilon) de una Lys de
la protena a degradar, se crea un enlace
isopeptdico
Forma protenas ubiquitinizadas.

E1 puede unirse
con docenas de
enzimas E2, que
pueden a su vez
unirse con unos
cientos de enzimas
E3 de un modo
jerrquico

Poliubiquitinacin
La cadenas poliubiquitinizadas unidas a K48 marcan

Una vez que una ubiquitina se ha unido a una

protenas para su destruccin. Las cadenas unidas a la
protena a eliminar se empiezan a incorporar
K63 dirigen la localizacin de las protenas.
nuevas ubiquitinas que se unen por sus
residuos de K formndose una cadena
poliubiquitnica que le permite al proteasoma
identificar y degradar la protena
Existe diversidad estructural en la formacin
de estas cadenas de poliubiquitina. La
variedad en el nmero de ubiquitinas y su
topologa determina el destino del sustrato.
Adems, algunos sustratos son modificados
con la adicin de ubiquitinas a los mltiples
residuos de lisina de la protena diana,
La ubiquitina tiene 7 K que pueden servir como puntos de
proceso llamado multiubiquitinizacin.
poliubiquitinizacin: K48, K63, K6, K11, K27, K29 y K33
Estos ptos de unin pueden definir seales nicas que
La monoubiquitinizacin de las protenas
son reconocidas por protenas de unin ubiquitina, que
tambin marca su localizacin (protenas
tienen motivos de interaccin con ubiquitina (UIM) y se
transmembrana, ejm,los receptores)

La unin K63, est implicada en el reconocimiento del ADN

daado en zonas de rotura de la doble hlice

unen a la propia protena. El reconocimiento de las

uniones se da por la topologa intrnseca del enlace

Ubiquitinacin y N-terminal

Reconocimiento de seales de degradacin:

PEST (Ricas en ProP, GluE, SerS, ThrT)
Una mala estructuracin de la protena induce
su degradacin rpida

Algunas secuencias en el extremo N-terminal

favorecen la degradacin rpida (< 3min): Ricas en
Arg, Lys, Phe, Leu, Trp
Algunas secuencias en el N-terminal permiten una
degradacin lenta (> 30 h): Ricas en Cys, Ala, Ser,
Thr, Gly, Val, Met.

El sistema de ubiquitinizacin
En una gran variedad de procesos celulares:
Procesacin de antgenos
Apoptosis
Biognesis de las organelas
Ciclo celular y divisin
Transcripcin y reparacin del ADN
Diferenciacin y desarrollo
Respuesta inmunolgica e inflamacin
Degeneracin muscular y neuronal
Morfognesis de las redes neuronales
Modulacin de los receptores de la superficie celular, canales
inicos y vas de secrecin
Respuesta al estrs y a moduladores extracelulares
Biognesis ribosmica
Infeccin viral

Sistema ubiquitina-proteosoma
Ubiquitina-Gly-C-NH-Lys-Protena.
La protena modificada con ubiquitina va al proteosoma
y en el interior est la subunidad cataltica que degrada
la protena a pptidos y aminocidos.

La degradacin
proteosmica es un
mecanismo esencial
en varios procesos
celulares, como:
el ciclo celular, la
regulacin de
la expresin gnica y
las respuestas
al estrs oxidativo.
Aarn Ciechanover, Avram Hershko y Irwin
Rose recibieron el Premio Nobel de
Qumica en 2004 por la importancia de la
degradacin proteica dentro de las clulas
y el rol de la ubiquitina en dicho proceso

Revisar:
Gil Hernndez, Angel & Snchez de
Medina, F.2004. Sntesis, degradacin y
recambio de las protenas.