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Enzimas
I. VISION DE CONJUNTO
Practicarnente todas las reacciones del organismo estan mediadas por enzimas, que son protelnas catalizadoras que aumentan
la velocidad de las reacciones sin experimentar cam bios en el
proceso. Entre las much as reacciones biol6gicas que son enerqeticamente posibles, las enzimas canalizan selectivamente los
reactantes (denominados sustratos) en vias utiles, Las enzimas,
por tanto, dirigen todos los acontecimientos metab6licos. En este
capitulo se examina la naturaleza de esas molecules cataifticas
y su mecanismo de acci6n.
CH3- CHI
Cada enzima tiene asignado dos nombres. EI primero es su nombre recomendado, corto, c6modo para el uso cotidiano. EI segundo es el nombre sistematico mas completo, que se utiliza
cuando debe identificarse una enzima sin ambigOedad.
A. Nombre recomendado
Los nombres utilizados con mas frecuencia para las enzimas
tienen el sufijo -asa unido al sustrato de la reacci6n (p. ej.,
glucosidasa, ureasa, sacarasa) 0 a una descripci6n de la acci6n que realizan (p. ej., lactato deshidrogenasa y adenilato
ciclasa). [Nota: algunas enzimas conservan sus nombres triviales originales, que no dan ninguna pista sobre la reacci6n
enzlrnatica asociada, p. ej., tripsina y pepsina.)
Lactato
deshidrogenasa
"
2H
Lactato
Piruvato
2. Transferasas
Catalizan la transferencia de
grupos que contienen
C-, N- 0 P-, como:
H20
NH3
NH3
transfel8sa
3. Hidrolasas
Glicina
Catalizan la escisi6n de enlaces
mediante la adici6n de agua,
como:
4. Liasas
CH3 - C +- COo-
--+
Piruvato
descarboxilasa
o"
Piruvato
Acetaldehido
5. Isomerasas
~
Catalizan la racemizaci6n
de los is6meros 6pticos
o geometricos, como:
?H3
-OOC} CH2-C-CoA
Metilmalonil-CoA
B. Nombre sistematico
6. Ligasas
COO- + NAD+
OH 2e-
Serina
II. NOMENCLATURA
Catalizan reacciones de
oxidorreducci6n, como:
1. Oxidorreductasas
~sfatos
CH3 C
~
MetilmalonllCoAmutasa
Piruvato
Succinil-CoA
COO- + CO2
l!
-OOC-CH2CH2-C-CoA
0"
PiruVBto
carboxllasa
I
~
ATP
ADP + Pi
I!
0
Oxalacetato
Figura 5-1
Ejemplos de las seis principales clases
de la clasificaci6n internacional de enzimas.
THF, tetrahidrofolato.
53
p
54
5. Enzimas
sustrato~
{-~
Nomenclatura de enzimas potencialmente confusa: sintetasa (requiere ATP), sintasa (no requiereATP); fosfatasa (utiliza agua para retirar un grupo fosforilo), fosforilasa (usa Pi para romper un enlace y generar un producto
fosforilado); deshidrogenasa (NAD+/FAD actua como
aceptor de electrones en una reacclon redox), oxidasa
(EI O2 es aceptor de electrones pero no se incorporan
atornos de oxrgeno en el sustrato), oxigenasa (se incorporan uno 0 ambos atornos de oxfgeno en el sustrato).
MITOCONDRIAS
Cicio de los ATC
Oxidaci6n de los acidos grasos
Oxidaci6n del piruvato
CITOSOL
Gluc6lisis
Via de las hexosas
Sintesis de
ADN yARN
LlSOSOMA
Degradaci6n de
macrornolecutas complejas
Figura 5-3
Localizaci6n intracelular de algunas
vias bioqulmicas importantes.
ATe, acidos tricarboxflicos.
Algunas enzimas necesitan molecules que no son proteinas para realizar su actividad enzimatica, EI terrnino holoenzima se refiere a la enzima
activa con su componente no proteico, mientras que la enzima sin su mitad no proteica se denomina apoenzima y es inactiva. Si la mitad no proteica es un ion metallco como el Zrr' 0 el Fe2+,se denomina cofactor. Si
se trata de una molecule orqanica pequeria, se conoce como coenzima.
Las coenzimas que solo se asocian transitoriamente con la enzima se
denominan cosustratos. Los cosustratos se disocian de la enzima en un
estado alterado (p. ej., NAD+, v. paq. 101). Si la coenzima esta asociada
permanentemente con la enzima y vuelve a su forma original, se denomina grupo prostettco (p. ej., FAD, v. pag. 110). Las coenzimas normalmente proceden de las vitaminas. Por ejemplo, el NAD+ contiene niacina,
y el FAD contiene riboflavina (v. cap. 28).
pst
55
E. Regulaci6n
La actividad enzirnatica puede ser regulada, es decir, incrementarse 0
reducirse, de modo que la velocidad de la forrnacion del producto responde a las necesidades de la celula.
F. Localizaci6n
dentro de la celula
T*
Energra libre
de activacion
(no catalizada)
Estado final
(productos)
Progreso de la reacci6n --~
Figura 5-4
Efecto de una enzima sobre la energfa
de activaci6n de una reacci6n.
F
56
5. Enzimas
energfa libre de los reactantes ni de los productos y, por consiguiente, no cambia el equilibrio de la reaccion (v. pag. 71). Sin embargo, acelera la velocidad con la cual se alcanza el equilibrio.
T*
1\.
Progreso de
la reacci6n
---+
ai
IBI
~
Progreso de ---+
la reacci6n
T*
A
iii.
-----r:::::====~p
Progreso de
la reacci6n
---+
3. Visualizaci6n del estado de transici6n: la conversion catalizada enzimaticarnente de un sustrato en un producto puede visualizarse
como algo similar a quitarle un jersey a un lactante que no coopera
(fig. 5-5). EI proceso tiene una energfa de activacion elevada porque
la unica estrategia razonable para quitar la prenda (practicamente
arrancandosela) requiere que la sacudida aleatoria dellactante haga
que los dos brazos queden completamente extendidos por encima
de la cabeza (una postura improbable). Sin embargo, podemos imaginar a uno de los padres actuando como una enzima, primero poniendose en contacto con ellactante (formando el ES), luego guiando los brazos dellactante a la posicion vertical extend ida, analoqa al
estado de translclon ES. Esta postura (conformacion) dellactante facilita la retirada del jersey, dando lugar al nino desnudo, que aquf representa el producto. [Nota: el sustrato unido a la enzima (ES) tiene
una energfa ligeramente menor que el sustrato no unido (S) y explica la pequefia depresion en la curva en ES.]
Figura 5-5
Esquema de los cam bios de energia
que se asocian a la formaci6n de
un complejo enzima-sustrato y la
subsecuente formaci6n de un estado
de transici6n.
pi
57
del sustrato
1. Velocidad maxima: la tasa 0 velocidad de una reaccion (v) es el numere de molecules de sustrato que se convierte en producto por unidad de tiempo; la velocidad suele expresarse como urnol de producto
formado por minuto. La tasa de una reaccion catalizada enzimaticamente aumenta con la concentracion del sustrato hasta alcanzar una
velocidad maxima (Vmax) (fig. 5-6). La nlvelacion de la velocidad de la
reaccion a concentraciones elevadas de sustrato refleja la saturacion
con sustrato de todos los sitios de union disponibles en las molecules
de enzima presentes.
2. Forma hiperb61ica de la curva de la cinetica enzimatice: la mayorfa de
las enzimas muestran una clnetica de Michaelis-Menten (v. pag. 58),
en la cual, la representacion de la velocidad de reaccton inicial (vo)frente a la concentraclon de sustrato ([8]) es hiperbolica (de forma similar
ala curva de dlsoclacton de oxfgeno de la mioglobina, v. pag. 29). Por
el contrario, las enzimas alostericas no siguen la cinetica de MichaelisMenten y muestran frecuentemente una curva sigmoidea (v. paq. 62)
cuya forma es similar a la de la curva de disociacion de oxfgeno de la
hemoglobina (v. paq, 29).
Las enzimas
alostericas muestran
una curva sigmoidea.
[Sustratoj
Figura 5-6
Efecto de la concentraci6n del sustrato
sobre la velocidad de la reacci6n.
B. Temperatura
1. Aumento de la velocidad con la temperatura: la velocidad de la
reaccion aumenta con la temperatura hasta que se alcanza una velocidad maxima (fig. 5-7). Este aumento es consecuencia del mayor
nurnero de rnoleculas que tienen energia suficiente como para atravesar la barrera enerqetica y formar los productos de la reaccion.
Inactivaci6n de la
enzima por calor
c:
'0
'(3
U
III
e
.!!!
Q)
2. Disminuci6n de la velocidad con temperaturas mas elevadas: un aumento ulterior de la temperatura provoca una disminucton de la velocidad de la reacclon como consecuencia de la desnaturalizacion de
la enzima inducida por la temperatura (v. fig. 5-7).
"tI
"tI
III
"tI
'(3
~
80
La temperatura optima para la mayoria de las enzimas humanas esta comprendida entre 35C Y
40 C. Las enzimas humanas empiezan a desnaturalizarse a temperaturas por encima de 40C, pero
bacterias terrnofilas encontradas en las aguas termales tienen temperaturas optimas de 70C.
C. pH
1. Efecto del pH sobre la ionizaci6n del sitio activo: la concentracion de
H+ afecta a la velocidad de reaccion de varias formas. En primer lugar, el proceso catalitico suele precisar que la enzima y el sustrato
tengan grupos quimicos especificos en un estado ionizado 0 desionizado para interaccionar. Por ejemplo, la actividad catalitica puede
precisar que un grupo amino de la enzima este en la forma protonada (-NH3+)' A pH alcalino, este grupo se desprotona y la velocidad de
la reaccion, por tanto, disminuye.
2. Efecto del pH sobre la desnaturalizaci6n de la enzima: los valores extremos de pH tarnbien pueden inducir desnaturatizacion de la enzima,
porque la estructura de la rnolecula proteica cataliticamente activa depende del caracter ionico de las cadenas laterales de los amlnoacidos.
Temperatura (Oe)
Figura 5-7
Efecto de la temperatura sobre una
reacci6n catalizada enzirnaticamente.
5. Enzimas
58
3. EI pH optlmo varia para las diferentes enzimas: el pH al cual se atcanza la actividad enzimatlca maxima es diferente para las diferentes enzimas, y a menudo refleja la [W] a la cual funciona la enzima
en el organismo. Por ejemplo, la actividad maxima de la pepsina, una
enzima digestiva del est6mago, se encuentra a pH 2, mientras que un
ambiente tan acldo desnaturaliza otras enzimas, disefiadas para trabajar a pH neutro (fig. 5-8).
11
pH
Figura 5-8
Efecto del pH sobre las reacciones
catalizadas enzimaticarnente.
A. Modelo de reacci6n
Leonor Michaelis y Maude Menten propusieron un modelo simple que
explica la mayorfa de las caracterfsticas de las reacciones catalizadas
por enzimas. En este modelo, la enzima se combina irreversiblemente
con su sustrato para formar un complejo ES, que posteriormente rinde el producto y permite la regeneraci6n de la enzima libre. EI modelo,
en el que interviene una rnolecula de sustrato, se representa a continuaci6n:
kl
E
k2
+ S .;::=:t ES ~
+ P
k.l
donde
S es el sustrato
E es la enzima
ES es el complejo enzima-sustrato
P es el producto
k1' k., Y k2 son las constantes de velocidad
B. Ecuaci6n de Michaelis-Menten
Vmax
----------------------
Enzima 1
_ Vmax [S]
Km + [S]
Vo -
donde
La gran Km de la
enzima 2 refleja una
baja afinidad de la
enzima p~r el sustrato.
La pequeiia Km de la
enzima 1 refleja una
gran afinidad de la
enzima p~r el sustrato.
Figura 5-9
Efecto de la concentraci6n de sustrato
en las velocidades de la reacci6n
catalizada por dos enzimas: enzima 1
con una Km pequefia y la enzima 2 con
una Km alta.
p
VI. Ecuaci6n de Michaelis-Menten
59
3. Velocidad inicial: en el anal isis de las reacciones enzirnaticas se utilizan las velocidades de reacci6n iniciales (vo)' Esto significa que la
velocidad de la reacci6n se mide en cuanto se mezclan la enzima y
el sustrato. En este momento, la concentraci6n de producto es muy
pequefia y, por consiguiente, la velocidad de retrorreacci6n de P a 8
puede ignorarse.
A altas concentraciones de
sustrato ([5] Km) la
velocidad de reacci6n es del
orden de 0, es decir, es
constante e independiente
de la concentraci6n de sustrato.
1Vmax
C
'0
'0
o
~ Vmax
co -a;
2
'tl
'tl
co
'0
'tl
A bajas concentraciones
de sustrato ([5] Km) la
velocidad de reacci6n es
de primer orden, es decir,
es proporcional a la
concentraci6n de sustrato.
Figura 5-10
Efecto de la concentraci6n del sustrato
sobre la velocidad de la reacci6n para
una reacci6n catalizada por una enzima.
D. Representacion de Lineweaver-Burk
Cuando se representa la Vocon respecto a [8], no siempre es posible determinar cuando se ha alcanzado la Vmax' debido a la pendiente ascendente gradual de la curva hiperb61ica a concentraciones de sustrato elevadas. 8in embargo, si se representa vv; con respecto a 1/[8], se
obtiene una Ifnea recta (fig. 5-11). Esta qraflca, la representaci6n de Lineweaver-Burk (tam bien denominada como representaci6n doble recfproca) puede utilizarse para calcular la Km Y la Vmax' as! como para determinar el mecanismo de acci6n de los inhibidores enzimaticos.
1. La ecuaci6n que describe la representaci6n de Lineweaver-Burk es:
Km
= ---''-'--
V max [S]
+ ---
Vmax
donde la intersecci6n en el eje de las x es igual a -1 /Km Y la intersecci6n en el eje de las yes igual a 1Nmax'
Figura 5-11
Representaci6n de Lineweaver-Burk.
r
5. Enzimas
60
Y2Vmax
3. Efecto sobre la representacion de Lineweaver-Burk: la inhibici6n
competitiva muestra una representaci6n de Lineweaver-Burk caracterfstica en la cual las graficas de las relaciones inhibida y no inhibida cortan transversalmente en el eje yen 1Nmax (no se modifica la
V max)' Las reacciones inhibida y no inhibida muestran diferentes puntos de intersecci6n con el eje de las x, 10 que indica que la Km aparente aumenta en presencia del inhibidor competitive porque -1/Km se
ace rca a cero desde un valor negativo (v. fig. 5-12).
A
oVmsx
e,
c
---------------------------------------------------
'0
'uo
to
~
.!!!
Con inhibidor
competitivo
Q)
"0
"0
to
"0
'0
t
Km
Km
[S]
La constante de Michaelis, Km, aumenta
aparentemente en presencia de un inhibidor
competitivo.
Figura 5-12
A. Representaci6n del efecto de un inhibidor competitivo sobre la velocidad de la reacci6n 010) frente al sustrato ([S]). B. Representaci6n de Lineweaver-Burk de la inhibici6n competitiva de una enzima.
61
HMG-CoA reductasa
B. Inhibici6n no competitiva
HO
"
c-oOH
HO
HaC
Y""C-O-L_cs-co
8
HMG-CoA
(sustrato)
HO
Pravastatina
(inhibidor competitivo)
Figura 5-13
B
La velocidad maxima, Vm~x,
disminuye aparentemente en
presencia de un inhibidor no
competitivo.
() Vmb
Z.
Inhibidor no
r:::
'0
'()
0
(Q
~
.!l!
CI)
'C
'C
(Q
'C
'()
0
Vmb
Con inhibidor
no competitivo
VmAx
2
0
0
[8]
Km
Figura 5-14
A. Representaci6n del efecto de un inhibidor no competitivo sobre la velocidad de la reacci6n (vo)frente al sustrato ([S)). B. Representaci6n de Lineweaver-Burk de la inhibici6n no competitiva de una enzima.
62
5. Enzimas
Enzima (E)
Complejo ES
/",Inhibidor
c.
Complejo EI
(inactivo)
Complejo ESI
(inactivo)
Figura 5-15
Un inhibidor no competitivo se une
tanto a la enzima libre como al
complejo enzima-sustrato (ES).
enzimaticos
----------------------~~~.
____ V_",!a~.
KO,5
[Sustrato]
Ko,5 Ko,5
KO,6
[Sustrato]
Figura 5-16
1. Efectores homotropos: cuando el propio sustrato actua como efector, se dice que el efecto es homotropo. Es mucho mas frecuente que
un sustrato alosterico funcione como efector positive. En tal caso, la
presencia de una molecule de sustrato en un lugar de la enzima intensifica las propiedades cataifticas de los otros lugares de uni6n del
sustrato, es decir, sus sitios de uni6n muestran cooperatividad. Estas
enzimas exhiben una curva sigmoidea cuando se representa la velocidad de reacci6n (vo) frente a la concentraci6n del sustrato ([S]),
fig. 5-16). Esto contrasta con la curva hiperb61icacaracterfstica de las
enzimas que siguen la cinetica de Michaelis-Menten, como se coment6 previamente. [Nota: el concepto de cooperatividad de uni6n del
sustrato es analoqo al de uni6n del oxfgeno a la hemoglobina.] Los
efectores positives y negativos de las enzimas alostericas pueden
afectar 0 bien a la Vmax 0 bien a la KO5, 0 a ambas (v. fig. 5-16).
63
",,,,--,
/
A~Bot(.
oI
''
D~E~F~G
Figura 5-17
Muchas enzimas pueden ser reguladas mediante modificaci6n covalente, 10mas frecuente, mediante la adici6n 0 la extracci6n de grupos fosfato de residuos de serina, treonina 0 tirosina especfficos de la enzima.
La fosforilaci6n de la protefna se reconoce como una de las vias principales por medio de las cuales se regulan los procesos celulares.
ATP~ADP
Enzima
Enzima
OH
I~I
OPO~2-
HP04
Fosioproteinfosfatasa'
H20
Figura 5-18
Modificaci6n covalente mediante la
adici6n y retirada de grupos fosfato.
r
64
5. Enzimas
ACONTECIMIENTO REGULADOR
EFECTOR HABITUAL
RESULTADOS
Sustrato
Inmediato
Producto
Cambio en la Vmax 0 la Km
Inmediato
Control alosterico
Producto final
Inmediato
Modificaci6n covalente
Otra enzima
Cambio en la Vmax 0 la Km
De inmediato a minutos
Sfntesis 0 degradaci6n
de laenzima
Hormona 0
metabolito
Cambio en la cantidad
de enzima
De horas a dias
Figura 5-19
Mecanismos de regulaci6n de la actividad enzlmatica. [Nota: La inhibici6n por producto final de la vfa tambien se conoce como
retroinhibici6n.]
cemia elevada provocan un aumento de la sfntesis de las enzimas fundamentales que intervienen en el metabolismo de la glucosa (v.paq, 105).
Por el contrario, las enzimas en uso constante no suelen estar reguladas
por alteracion de su velocidad de sfntesis. Las alteraciones de los niveles
enzimatlcos como consecuencia de lnduccion 0 represion de la sfntesis
proteica son lentas (de horas a dlas), en cornparacion con los cambios de
la actividad enzimatica regulados de manera alosterica 0 covalente, que
ocurren en cuestion de segundos a minutos. En la figura 5-19 se resumen
las vlas comunes de requlacion de la actividad enzimatlca.
fa
Figura 5-20
Liberaci6n de enzimas de celulas normales y enfermas
65
EI plasma es la parte liquida, no celular, de la sangre. En los anal isis de laboratorio de determinaci6n
de la actividad enzimatloa se utiliza mas a menudo
el suero, que se obtiene mediante centrifugaci6n de
la sangre completa despues de dejar que coagule.
EI plasma es un liquldo fisiol6gico, mientras que el
suero se prepara en el laboratorio.
de enzimas
Isoenzimas
y enfermedades
cArODO (-)
Direccion de la miqracion
diaqnosticas
c.
ANODO(+)
CK1
CK2
1. Estructura cuaternaria de las isoenzimas: muchas isoenzimas contienen diferentes subunidades en diversas combinaciones. Por ejemplo, la creatina cinasa (CK) aparece como tres isoenzimas. Cada
isoenzima consiste en un dfmero compuesto por dos polipeptidos
(denominados subunidades By M) asociados en una de tres cornbinaciones: CK1 = BB, CK2 = MB Y CK3 = MM. Cada isoenzima rnuestra una movilidad electroforetlca caracterfstica (v.fig. 5-21). [Nota: virtualmente toda la CK en el encefalo es la isoforma BB, mientras que
0
Origen
cardfacas
CK3
Infarto de
miocardio
Normal
Figura 5-21
Estructura de subunidades, movilidad
electroforetica y actividad enzimatica
de las isoenzimas de la creatina cinasa
(CK).
5. Enzimas
66
x.
Figura 5-22
Aparicion de la creatina cinasa (CK)
y de troponina cardlaca en el plasma
despues del infarto de miocardio.
67
Enzimas
Oatallsis
son
se estudia utilizando
Modelos de reacci6n
Concentraci6n de enzima
Temperatura
Coenzimas, cofactores
porejemplo
que contienen
E + S - ES - E + P
Uno 0 varios
sitios activos
que son una hendidura
o grieta en la superficie
de la enzima
complementarios
a la estructura
del sustrato.
que induce
t
Ecuaciones ctneticas
porejemplo
Ecuaci6n de
Michaelis-Menten
Vmax [S]
vo=..,,.:.:..:.::.:.:....:;~
Km + [5]
I .
que pertniten
t
La union del sustrato
que induce
pH
Concentraci6n de sustrato
Modificaci6n covalente
Inhibidores
c/asificados como
Competitivo
que predice
Como los cambios en la [5]
afectan a la vo
por ejemplo, para Michaelis-Menten:
cuando
que induce
que se denomina
[ Mayores tasas de S - P ~
Enzimas alostericas
I
amenudo
5in cambio en el
equilibrio de la
reaccion
10que induce
que se denomina
que induce
Figura 5-23
Mapa de conceptos fundamentales sobre las enzimas. E, enzima; Km, constante de Michaelis; Ko.s, concentraci6n de sustrato que
da la mitad de la velocidad maxima; P, producto; S, sustrato, [S), concentraci6n de sustrato; Vmax, velocidad maxima; Yo. velocidad
inicial.
68
5. Enzimas
Preguntas de estudio
MM
MM
A. apoenzima.
B.
C.
D.
E.
coenzima-cosustrato.
coenzima-grupo prostetico.
cofactor.
efector heter6tropo.
5.3 Un hombre de 70 afios fue ingresado en urgencias con antecedentes de 24 h de dolor toracico. Se mtdio la actividad
serica de la creatina cinasa (CK) en el ingreso (dia 1) Y una
vez al dia (fig. 5-24). EI dia 2 despues de su ingreso experiment6 arritmia cardlaca, que consigui6 controlarse mediante tres ciclos de cardioconversi6n electrica, los dos ultimos a la energia maxima. [Nota: la cardloconverslon se
realiza colocando dos paletas, de 12 cm de diarnetro, en
contacto firme con la pared toracica y aplicando un corto
voltaje electrlco.] Se restableci6 el ritmo cardiaco normal.
En los siguientes dias no hubo recurrencia de la arritmia. EI
dolor toraolco remiti6 y fue dado de alta el dia 10. 6Que
afirmaci6n de las siguientes es mas compatible con los datos presentados?
A. EI paciente tuvo un infarto de miocardio 48 h a 64 h antes del ingreso.
B. EI paciente tuvo un infarto de miocardio el dia 2.
C. EI paciente tuvo una angina antes del ingreso.
D. EI paciente tuvo lesion en el rnusculo esqueletico el
dia 2.
E. Los datos no permiten sacar conclusi6n alguna relativa
a un infarto de miocardio ni antes ni despues de su ingreso en el hospital.
Paciente
Normal
En el momento
del ingreso
(dia 1)
Normal
12 h despues de la
cardioconversi6n
(dia 2)
Figura 5-24
Niveles sericos de creatina cinasa.
Respuesta correcta = B. Las coenzimascosustratos son rnoleculas orqanicas pequefias que se asocian transitoriamente con una
enzima y dejan la enzima modificada. Las
coenzimas-grupos prostetlcos son moleculas
orqanicas pequefias que se asoeian permanentemente con una enzima y que la enzima
devuelve a su estado original. Los cofactores
son iones rnetahcos. Los efectores heterotropos no son sustratos.