Abstract o

Abstracto
Algunas arqueas anaerbica viven sobre sustratos que no permiten la sntesis

de 1 mol de ATP por mol de sustrato. La conservacin de energa en estos casos
slo es posible por un mecanismo quimiosmtica que implica la generacin de
un gradiente inico electroqumico a travs de la membrana citoplasmtica,
que luego impulsa la sntesis de ATP a travs de un A 1 A O ATP sintasa. La
cantidad mnima de energa requerida depende tanto de la magnitud del
gradiente inico electroqumico, el potencial de fosforilacin, y la relacin de ion
/ ATP de la ATP sintasa. Los
metangenos, Thermococcus, Pyrococcus, y Ignicoccus han desarrollado
diferentes maneras de energizar sus membranas, tales como metiltransferasas,
H +, o NAD + reduccin de los sistemas de transporte de electrones alimentados
por ferredoxina reducida o H 2 dependiente de reduccin de azufre que todos
funcionan en el lmite termodinmico de vida. Se discute la estructura y la
funcin de las enzimas implicadas. A pesar de las diferencias en la activacin de
la membrana, que tienen en comn un 1 A O ATP sintasa A que muestra una
divergencia extraordinaria en la composicin de rotor y adaptaciones
estructurales a la vida en estas condiciones. En suma, la adaptacin de las
arqueas anaerbico para sustratos de energa limitada implica el acoplamiento
de energa quimiosmtica, a menudo con Na + como ion de acoplamiento y un
ATP sintasa estructural y funcionalmente muy adaptados.
Introduccin
Desde arqueas se han descubierto, su estilo de vida inusual, sus metablicas y
estructurales adaptaciones a ambientes extremos, y su uso como biocatalizador
en procesos industriales han atrado mucho la atencin (Schiraldi et al., 2002 ;
Stetter, 2006 ; Sharma et al., 2012 ). La mayora de las arqueas primera
descubrieron creci bajo condiciones extremas, tales como temperaturas de 80
a 121 C, altas concentraciones de sal, valores de pH cidos o alcalinos, y sus
combinaciones (Stetter et al,.1983 ; Fiala y Stetter, 1986 ; Zillig et al. , 1990 ;
Kurr et al,. 1991 ;. Blchl et al, 1997 ;. Andrei et al, 2012; Mesbah y
Wiegel, 2012 ;. Sharma et al, 2012 ). Por lo tanto, el nombre 'archaea' es a
menudo sinnimo de "extremfilos", aunque esto no es correcto, ya que una
serie de arqueas no son extremfilos en absoluto. Por ejemplo, los miembros de
la archaea metanognicas habitan en el tracto gastrointestinal de los seres
humanos o el rumen. Tambin habitan en zonas anxicas de lagos de agua
dulce o viven en otros ambientes no extremos (Miller y Wolin, 1982 ; Belay et
al., 1990 ; Kulik et al., 2001 ; Moissl et al., 2003 ; Lepp et al., 2004 ) , por no
mencionar el phylum recientemente descubierto de amoniacooxidante thaumarchaeota (Brochier-Armanet et al,. 2008 ; Schleper y
Nicol,2010 ).
Los metangenos pueden crecer en un nmero limitado de sustancias que se
convierte en metano (Zinder, 1993 ). El sustrato utilizado por la mayor parte es
H 2 + CO
2,
y el sustrato utilizado por algunas especies, pero con el mayor
impacto en la produccin de este gas de efecto invernadero en la naturaleza, es

el acetato. La va de la metanognesis se ha trabajado en las ltimas dcadas
(Thauer,1998 ; Deppenmeier y Mller, 2008 ). La pregunta, cmo se utiliza
esta va para sintetizar ATP, tambin se ha respondido en gran medida
(Mller et al., 1999 ; Schfer et al., 1999 ; Deppenmeier & Mller, 2008 ;
Thauer et al., 2008 ; Schlegel y Mller, 2013 ). El cambio de energa libre en la
metanognesis de diversos sustratos es baja y, a menudo no es suficiente para
la sntesis de 1 mol de ATP. Los metangenos slo pueden utilizar este tipo de
metabolismo mediante reacciones bioqumicas complejas y poco comunes y un
mecanismo quimiosmtica de conservacin de la energa. Las reacciones que
conducen a la generacin de un gradiente inico transmembrana son a menudo
cerca de la mnima cantidad de energa necesaria para trasladar un ion contra
un gradiente inico electroqumico a travs de la membrana. Los metangenos
son los "pioneros" en nuestros estudios para comprender los principales
mecanismos de cmo las clulas sintetizan ATP con limitacin de energa
extrema. Resultaron involucrar a los sistemas de transporte de electrones unido
a la membrana, utilizar Na + en lugar o adems de H +, y el uso de un ATP sintasa
inusual (Mller et al., 1999; Deppenmeier & Mller, 2008 ;. Thauer et al, 2008 ;
Schlegel y Mller, 2013 ). Ms tarde, se descubri que otras arqueas
anaerbica utilizar estrategias similares, principales para energizar su
membrana para la sntesis de ATP o el transporte de sustrato. Es el propsito de
esta revisin para introducir brevemente las limitaciones termodinmicas de la
vida (arqueas) con limitacin de energa extrema. A continuacin, vamos a
describir los mecanismos quimiosmticos de conservacin de la energa
utilizada en los miembros seleccionados de las arqueas anaerbico para
finalmente concluir con la estructura y la funcin de la enzima ms importante
en la bioenergtica celular, la ATP sintasa.
Los principios de conservacin de la energa o la cantidad de

energa se requiere para hacer un ATP
estructuras altamente ordenadas tales como clulas vivas requieren de energa
para mantener un "status" ordenada. La energa es suministrada por diferentes
maneras, ya sea por la luz o por reacciones qumicas (Harold, 1986 ). la sntesis
de ATP impulsada por la luz se observa no slo en las plantas en condiciones
aerbicas, pero tambin en microorganismos bajo condiciones anaerbicas. Por
ejemplo, Rhodospirillaceae, Chromatiaceae, y Chlorobiaceae son bien conocidos
por su fotosntesis anaerbica. Curiosamente, una familia prominente de
las arqueas, la Halobacteriaceae, es conocida por su bomba de protones luz
impulsada, bacteriorrodopsina, que se transloca protones desde el interior hacia
el exterior a travs de un interruptor de la retina impulsada por la luz
(Oesterhelt y Tittor,1989 ; Krebs y Khorana , 1993 ;. Mukohata et
al, 1999 ). Por el contrario, las arqueas discutido aqu son estrictamente
chemotrophic. Sin embargo, difieren con respecto a su metabolismo, y
organoheterotrophic as como se conocen especies lithoautotrophic. De todos

modos, la fuente primaria de energa, ya sea de luz o una reaccin qumica, se
convierte a una moneda de energa que puede ser utilizado por la clula
viva. La evolucin ha trado cerca de dos monedas diferentes de energa en las
clulas vivas: ATP y el ion transmembrana electroqumico (H +, Na +) gradiente a
travs de una membrana. Es esencial que ambas monedas son generalmente
libremente convertible. Esto se realiza mediante una enzima que estaba en el
principio de la bioenergtica llamados el "factor de acoplamiento ', hoy en da
conocido como ATP sintasa (Mitchell, 1966 ; Senior, 1988 ; Cruz y
Mller, 2004 ). Esta enzima est presente en todas las clulas vivas, a pesar de
las diferentes formas en que se sintetiza ATP o la membrana est
energizado. La ATP sintasa es, por lo tanto, la enzima ms importante y
universal en la bioenergtica celular. Como veremos ms adelante, las ATP
sintasas conocidas hasta la fecha surgi a partir de un ancestro comn, tienen
el mismo modo principal de operacin, pero evolucionado de manera diferente
en trminos de estructura y funcin en los tres dominios de la vida (Mller &
Gruber, 2003 ). La ATP sintasa cataliza la siguiente reaccin (Ec. 1 ):
El cambio de energa libre en la reaccin en condiciones estndar es -31,8 kJ

mol -1 (Thauer et al.,1977 ). Esto significa que cualquier reaccin que es ms
exergnica de -31,8 kJ mol -1 es suficiente para conducir la sntesis de ATP por
un mecanismo de acoplamiento directo. Evolucin evolucion slo unas pocas
reacciones de las ecuaciones ( 2 - 7 ) en las clulas vivas que son ms
exergnica y se utiliza para conducir la fosforilacin del ADP (Thauer et
al,. 1977 ; Teague y Dobson, 1999 ):
acetato quinasa:
fosfoglicerato quinasa:
piruvato quinasa:
Creatina quinasa:
arginina quinasa:
carbamato quinasa:
Azcar-organismos fermentadores utilizan sobre todo las reacciones 2, 3 y 4

para la sntesis de ATP.Por lo tanto, chemoorganotrophs anaerbicas que
fermentan azcares al acetato de ganar 4 mol de ATP cuando el azcar se

convierte en:
En comparacin con las bacterias aerbicas, esto es poco ATP por mol de
azcar, pero para un estilo de vida anaerbica, esto es lo ms que se obtiene de
una molcula de hexosa por fosforilacin a nivel de sustrato. Sin embargo, la
fermentacin de acuerdo con. Ecuacin 8 slo es posible si los equivalentes
reductores se 'arrastrados' como hidrgeno.
La produccin de hidrgeno (de ferredoxina) nos lleva a la segunda moneda de
energa, el potencial transmembrana de iones electroqumico (
,
). Como veremos ms adelante, la translocacin de protones por
reduccin de protones de hidrgeno gaseoso es una forma de dinamizar la
membrana citoplasmtica. archaea aerbico y anaerbico tiene una hermosa
diversidad de membrana integral que enzimas par reacciones exergnicos a la
translocacin de iones fuera de la clula. Translocacin de la de iones, protones
en la mayora de los casos, conduce a la translocacin de una carga positiva y
la translocacin de una sustancia. Por lo tanto, la reaccin exergnica impulsa
el establecimiento de un gradiente de protones electroqumico (ec. 9 ):
donde la fuerza PMF = protn-motriz;

elctrico; z = 2,3 x R x T / F;pH = pH en el
= temperatura; F = constante de Faraday.
= Membrana de potencial
interior
-pH
exterior;
= constante de gas R; T
Como veremos ms adelante, los organismos que viven con limitacin de

energa a menudo utilizan Na+ en lugar de H +. . A continuacin, la ecuacin 10 es:
donde SMF = fuerza de sodio-motriz.
Si reconciliamos que una reaccin exergnica impulsa la exportacin de un ion
en contra de su potencial electroqumico, ahora podemos pedir a la cantidad de
energa que se requiere para trasladar un ion. Esto est dado por la siguiente
ecuacin. 11 :
donde G = cambio de la energa libre de la reaccin; n = nmero de iones de
translocacin; F = constante de Faraday;
).
los
(
o
) Se ha medido solo en algunas bacterias y
arqueas y parece ser bastante constante a alrededor de -180 a -220 mV (por
simplicidad
ms bien que
se utiliza de aqu en adelante). .
Con la ecuacin 11 , este calcula a un cambio de energa libre de -17 a -21 kJ
mol -1 para la reaccin exergnica de trasladar un protn o ion sodio a travs de
la membrana (Schink, 1997 ;. Hoehler et al, 2001 ). Obviamente, la cantidad
mnima de energa necesaria para trasladar un ion depende de la magnitud
de
. Si G consigue menor que -17 kJ
mol-1,
la membrana puede todava
ser activa si
tambin se reduce.
mecanismos de acoplamiento indirecto para la sntesis de ATP implican una ATP
sintasa que es impulsado por
de acuerdo con la siguiente ecuacin:
donde G P = potencial de fosforilacin intracelular.

El potencial de fosforilacin intracelular describe la relacin de ATP sobre ADP y
P I como se describe en la siguiente ecuacin:
Sntesis de ATP es una reaccin muy endergnica, y el potencial de fosforilacin

es una funcin de las concentraciones celulares de ATP, ADP y P i que, de nuevo,
se ha determinado slo por unos organismos modelo (Slater et al., 1973 ;
Kashket , 1982 ). Estos datos revelaron un valor de alrededor de 60 mol kJ
Este valor se utiliza a travs de los libros de texto y se ve casi como un "valor
estndar" para el potencial de fosforilacin. Pero ha habido slo unos pocos
1.
organismos analizados y slo una archaea. En este ltimo, las estimaciones son
ms bajas, por ejemplo 45 kJ mol -1 (Jetten et al., 1991 ).La segunda variable,
muy importante es n, el nmero de iones translocados por la ATP
sintasa.Consideremos por el momento un valor de p G constante. Si
el
disminuye, la sntesis de ATP requiere un nmero mayor de n, el
nmero de protones translocados. Por lo tanto, incluso a baja
, La
sntesis de ATP es todava posible si n aumenta. Cunto 'n' vara entre las
especies o dentro de una especie se discute en detalle ms adelante. Vamos, de
nuevo, por el momento, la vuelta al argumento. Si una reaccin qumica ligada
a metabolismo transloca dos protones, a continuacin, la reaccin tiene que
proceder dos veces para exportar los cuatro protones requeridos para la sntesis
de ATP en condiciones estndar. Si slo uno de ion puede ser bombeado por la
reaccin qumica, slo el 0,25 mol de ATP puede ser formado. Cmo se podra
aumentar este nmero? Slo si G P es menor que en condiciones
normales! Por ejemplo, una reaccin qumica que conduce a la exportacin de
dos iones puede di un ATP, si G P no es 60, pero 30 kJ mol -1. Por lo tanto, la
magnitud del potencial de fosforilacin es otra variable importante que
determina la cantidad de energa que se requiere para mantener la vida.
En suma, los mecanismos de acoplamiento directo e indirecto difieren con
respecto a la cantidad de energa requerida para fosforilar ADP. En el primer
caso, la cantidad total es requerido por una reaccin qumica; Para estos
ltimos, la energa puede ser secuestrado para el nmero de iones
transportados a travs de la membrana. All, la cantidad mnima es el requerido
para trasladar uno de iones a travs de la membrana.
Despus de haber descrito los principios de la termodinmica, ahora vamos a
pasar a discutir las diferentes maneras en que las arqueas uso de energa
limitada para conducir la sntesis de ATP.Debido a la limitacin de energa

incluye siempre una manera quimiosmtica de la sntesis de ATP, vamos a
describir la belleza de la diversidad de la activacin de la membrana en arqueas
anaerbico seleccionado.
La conservacin de energa en arqueas metanognicas

Los metangenos son un grupo nutricionalmente nico, pero filogenticamente
diverso de organismos que todos pertenecen al
filo Euryarchaeota (Wolfe, 1992 ). Los metangenos han llamado mucho la
atencin debido a su metabolismo nico. Sustratos metanognicas son H 2 +
CO 2, grupos metilo como en metanol o trimetilamina, o acetato. La va de la
metanognesis, la bioqumica de las enzimas que participan con sus coenzimas
nicas, y la forma en que se sintetiza ATP han sido objeto de recientes,
excelentes crticas (Blaut et al., 1992 ; Gottschalk y Thauer, 2001 ;
Deppenmeier, 2002a , b ; Deppenmeier & Mller, 2008 ;. Thauer et
al, 2008 ). Por lo tanto, vamos a mantener este breve prrafo y se centran en
los principios de acoplamiento. La conversin de H2 + CO2 a CH4 requiere coenzimas
nicos con mecanismos de reaccin sin precedentes. Esta va lineal es funcional
incluso a altas temperaturas de hasta 113 C como se muestra
para Methanopyrus kandleri (Kurr et al., 1991 ).Metanognesis de H 2 +
CO 2 podra permitir la sntesis de alrededor de 2 moles de ATP bajo condiciones
estndar (Deppenmeier y Mller, 2008 ; Thauer et al,. 2008 ) de acuerdo con la
ec. 14 :
Teniendo en cuenta la baja presin parcial de hidrgeno en ambientes

naturales, la energtica permite la sntesis de slo alrededor de un tercio de un
ATP (Deppenmeier & Mller, 2008 ; Thauer et al,. 2008). Los metangenos
utilizan una forma quimiosmtica de conservacin de la energa y la pareja
metanognesis a la generacin de dos gradientes de iones primarios
(Deppenmeier, 2002a ). Uno de estos gradientes inicos es un gradiente
primaria, electroqumica de iones de sodio establecido por la metiltransferasa
methyltetrahydromethanopterin-coenzima M (Mtr;. Mller et al, 1988 ;
Gottschalk y Thauer, 2001 ), una enzima nica en la bioenergtica de
metangenos. Esto unido a la membrana, de mltiples subunidades enzima
transfiere complejos del grupo metilo de methyltetrahydromethanopterin a la
coenzima M; esta reaccin exergnica se utiliza para conducir la translocacin
de iones sodio a travs de la membrana citoplasmtica (Gottschalk y
Thauer, 2001 ; Fig. 1a ). Valor de la reaccin de la G 0 'es de -30 kJ mol-1 que es
suficiente para trasladar 2 Na + (Schnheit y Beimborn, 1985 ; Thaueret
al,. 2008 ). Metil-com se reduce con la coenzima B (COB, 7mercaptoheptanoylthreoninephosphate) a CH 4, y un heterodisulfide de COM y
de la mazorca, com-SS-mazorca, se forma. La reduccin de este heterodisulfide
es el ltimo paso en la va. El proceso, por el cual se redujo la heterodisulfide,
es diferente en los dos grupos de metangenos (Deppenmeier, 2002b ;
Thauer et al,. 2008 ). Los metangenos libre de citocromo

como Methanothermobacter thermautotrophicus yMethanocaldococcus
Jannaschii tienen un complejo soluble de reductasa heterodisulfide y el metil
hidrogenasa violgeno-reductor (MVH-HDR complejo) que utilizan el mecanismo
de reciente creacin de la bifurcacin de electrones (Buckel y Thauer, 2013 )
para utilizar la energa liberada durante la reduccin heterodisulfide exergnica
para conducir transferencia de electrones endergnica de hidrgeno (E 0 '= -420
mV) a la ferredoxina (E 0' = -500 mV) [el potencial redox de la ferredoxina se
establece en -500 mV, que es el potencial redox del CO 2 / par
formylmethanofuran (Thauer et al., 2008)] (Fig. 1a ). La ferredoxina reducida se
utiliza entonces como un donador de electrones "alto potencial" para conducir
la primera reaccin en la metanognesis, la reaccin deshidrogenasa
formylmethanofuran endergnica (Thauer et al., 2008 ). Estos organismos
tienen solamente un sitio de acoplamiento que es Na + motivo, y por lo tanto, la
ATP sintasa debe ser Na + selectiva. Esto se confirma por anlisis de la
secuencia (Mller & Gruber, 2003 ;. Mayer et al, 2012a ), as como, en un caso,
el apoyo de anlisis experimental (McMillan et al., 2011 ).
Descargar figura
Abrir en una nueva pestaa
Descargar PowerPoint
Figura 1
La conservacin de energa en los metangenos y sin (a) y con los citocromos
(b). Los metangenos par su metabolismo a la generacin de un gradiente de
Na + primaria que se establece por la metiltransferasa
methyltetrahydromethanopterin-coenzima M (Mtr), que transfiere el grupo
metilo de methyltetrahydromethanopterin a la coenzima M. En metangenos
libre de citocromo, se utiliza este gradiente de Na
por la a 1 a O ATP sintasa
para sintetizar ATP. La reduccin del aceptor de electrones, un heterodisulfide

de la coenzima M y la coenzima B, es catalizada por un complejo soluble de la
reductasa heterodisulfide y metil violgeno de reduccin de hidrogenasa
(complejo Mvh-HDR).Transferencia de electrones exergnica de hidrgeno a la
heterodisulfide impulsa la transferencia de electrones endergnica de hidrgeno
a la ferredoxina por bifurcacin de electrones (Kaster et al., 2011). La reduccin
de la heterodisulfide est en metangenos que contiene citocromo-alcanzados
por una cadena de transporte de electrones protn-motriz (Vho-Hdr complejo),
que contiene los citocromos y methanophenazine. Estos gradientes H
Na son entonces tambin utilizados por un promiscuo A 1A O ATP sintasa que

+
simultneamente se transloca Na
yH
+.
En metangenos que contiene
citocromo-, la transferencia de electrones endergnica de hidrgeno para

ferredoxina es impulsado por el
catalizada por la hidrogenasa Ech. Los
iones estequiometras representados se basan principalmente en clculos

termodinmicos y tienen algunas incertidumbres.
Metangenos que contiene citocromo-como acetivorans
Methanosarcina, Methanosarcina mazei, ybarkeri Methanosarcina son
evolutivamente ms avanzado y se han desarrollado, adems de Mtr una
cadena de transporte de electrones protn-motriz que incluye los citocromos y
la methanophenazine portador de electrones (Deppenmeier, 2002b ). Por lo
tanto, par metanognicas archaea metanognesis a la generacin de un
protn y un gradiente de in de sodio al mismo tiempo que contiene citocromo(Fig. 1b ; Schlegel y Mller, 2013 ). La cadena de transporte de electrones de
protones motivo implica una heterodisulfide reductasa unida a la membrana
(HDR) anclada a la membrana por un citocromo b, la methanophenazine
portador de electrones soluble, y los mdulos de entrada de electrones que
cambia con el sustrato de crecimiento. Durante la metanognesis a partir de
H 2 + CO 2, el hidrgeno es activado por una hidrogenasa unido a la membrana
F 420 no reductor (VHO) que tambin acta como un mdulo de entrada para la
cadena de transporte de electrones (complejo Vho-Hdr en la Fig. 1b ). En total,
cuatro protones, dos bombeado y dos escalares, son finalmente en el exterior
de la membrana (Deppenmeier, 2002b ). Durante el crecimiento en sustratos
que contienen grupos metilo, los grupos metilo se oxidan a CO 2 con el cofactor
deazaflavin F 420 como aceptor de electrones. Reduccin F 420 se vuelve a oxidar
por un F 420 H 2 deshidrogenasa unida a la membrana, es decir, sobre la base de
los datos bioqumicos y anlisis de secuencias, muy similar al complejo I de la
cadena de transporte de electrones bacterianas. En total, cuatro protones son
translocados (Deppenmeier, 2002b ). El, H 2 reduccin dependiente de
termodinmicamente desfavorable de ferredoxina no es catalizada por un
mecanismo de acoplamiento directo a travs de la bifurcacin de electrones,
sino por un mecanismo de acoplamiento secundario utilizando
como
fuerza motriz, catalizada por la hidrogenasa de conversin de la energa (Ech;.

Welte et al, 2010b ), como veremos ms adelante.
El acetato es el peor substrato para la metanognesis con un cambio de energa
libre estndar de solamente -36 kJ mol-1 y slo utilizado por los metangenos que
contiene citocromo. Se convierte de acuerdo a:
Para conservar tanto como sea posible de la poca energa disponible, los
metangenos acetotrophic han desarrollado mecanismos sofisticados. Acetato
se escinde a un grupo metilo y CO. El grupo metilo se transfiere a
tetrahidrometanopterina, y la reduccin posterior de nuevo implica el sodio
motivo Mtr.CO se oxida a CO 2 con posterior reduccin de
ferredoxina. Ferredoxina reducida es el donador de electrones para la reduccin
heterodisulfide, pero los mdulos de entrada de electrones difieren en
metangenos. M. mazei tiene una hidrogenasa de tipo Ech, un sitio de
acoplamiento notable y nico en metangenos (Welte et al., 2010a , b ). Esta
enzima contiene integrante de la membrana centros hierro-azufre como
transportadores de electrones y transfiere electrones desde ferredoxina
reducida a los protones, produciendo con ello H2. Se trata de una pequea
cadena de transporte electrnico que utiliza protones como aceptor terminal de
electrones y parejas la transferencia de electrones desde exergnica
ferredoxina reducida (E 0 ' -500 mV) a los protones (E 0' = -414 mV) a la
exportacin de los protones de la citoplasma al medio, estableciendo as
una
travs de la membrana (Hedderich, 2004 ; Fig. 2a ). La reaccin
es reversible, y utiliza la enzima

endergnica de ferredoxina con H
2,
para conducir la reduccin

requerida en la primera etapa de la
metanognesis a partir de H 2 + CO 2 en M. Mazei Go1 (Fig. 1a ). Esta notable,

hidrogenasa de conversin de la energa puede ser considerado como el
prototipo de hidrogenasas de conversin de la energa que se encuentran en
otras arqueas de energa limitada se discute a continuacin. El hidrgeno
producido por Ech se alimenta a continuacin en la cadena de transporte de
electrones protn-motriz (Vho-Hdr complejo) por la hidrogenasa unido a la
membrana F 420 no reductor (VHO) descrita anteriormente (Fig.2a ;
Deppenmeier et al,. 1991 ; Welte et al ., 2010a , b ).
Descargar figura
Figura 2
La conservacin de energa en Methanosarcina mazei y Methanosarcina
acetivorans por la metanognesis aceticlastic. En M. mazei (a), el complejo Ech
se utiliza para reducir los protones a H 2gas con los electrones derivados de la
ferredoxina reducida en un proceso, que est acoplado a la generacin de un
gradiente de protones electroqumico transmembrana. M. acetivorans (b) no
tiene Hydrogenases, sino un complejo de Na
-translocating RNA. La
transferencia de electrones desde la ferredoxina para methanophenazine est

acoplado a vectorial de transporte
de
Na
+.
La reaccin heterodisulfide reductasa
posterior es motriz de protones. Los iones estequiometras representados se

basan principalmente en clculos termodinmicos y tienen algunas
incertidumbres.
Acetivorans Methanosarcina no tiene una hidrogenasa, y por lo tanto, el
hidrgeno no es un intermediario en la transferencia de electrones desde
ferredoxina reducida a la reductasa heterodisulfide (HDR). Una vez ms, la
diversidad en este pequeo grupo de organismos es
increble.M. acetivorans emplea una ferredoxina: oxidorreductasa
methanophenazine codificadas por los genesRNA (Li et al., 2006 ; Rohlin y
Gunsalus, 2010 ). Este complejo de protena de transferencia de electrones
contiene varias subunidades con flavins, hierro-azufre grupo, y un
citocromo c como un transportador de electrones. El homlogo bacteriano (sin
citocromo c) se ha demostrado que es un vectorial bomba de Na + (Biegel y
Mller, 2010 ; Biegel et al,. 2011 ). En M. acetivorans, la transferencia de
electrones exergnica de ferredoxina reducida (E 0 ' -500 mV) a
methanophenazine (E 0' = -165 mV) est acoplado a vectorial transporte
Na + fuera de la clula (Fig. 2b ;. Schlegel et al, 2012a ).Methanophenazine
reduce entonces dona los electrones a la reductasa heterodisulfide, y esta
reaccin conduce translocacin de protones fuera de la clula (Schlegel et
al., 2012a ). En conjunto, esta secuencia de reaccin bastante simple que
conduce de etilo para metano y dixido de carbono implica tres sitios de
acoplamiento. Lo ms interesante, no slo Mtr, sino tambin RNF transloca
Na +. Esto plantea la cuestin acerca de la especificidad de iones de la ATP
sintasa que se discute a continuacin.
En suma, los metangenos se han desarrollado sofisticados sitios de
acoplamiento temprano en la historia de la vida (Schlegel y
Mller, 2013 ). Primero fue el motivo de sodio-Mtr que, hasta ahora, slo se ha
encontrado en arqueas metanognicas. Esta reaccin utiliza -30 kJ mol -1 para
conducir
generacin ( 2 Na + transloca). En segundo lugar, con el
advenimiento de los citocromos, fue la evolucin de las cadenas de
transferencia de electrones que estn acopladas a protn translocacin. A
destacar tambin son RNF y Ech. RNF est muy extendida en las bacterias. En
anaerobios, que utiliza NAD + como aceptor de electrones, mientras que
aerobios pueden utilizar para conducir la reaccin endergnica de ferredoxina
con NADH a expensas de
. RNF es el antepasado del sodio-motriz
compleja nqr se encuentra en algunas bacterias (Tokuda y Unemoto, 1984;
Jurez y Barquera, 2012 ). Ech se encuentra en arqueas anaerbica y algunas

bacterias, as, sino que tambin era el antepasado del complejo I de la cadena
respiratoria (Biegel et al., 2011 ).
La conservacin de energa por oxidacin en

formato Thermococcus onnurineus
Thermococcus onnurineus es una archaea hipertermoflico anaerbica aislado
de una fuente hidrotermal de aguas profundas dentro del campo Pacmanus
cerca de la cuenca de Manus en el Ocano Pacfico. Crece de manera ptima a
pH 8,5 y 80 C y requiere sustratos complejos tales como extracto de levadura,
peptona, casena, o almidn (Bae et al., 2006 ). La caracterstica sobresaliente
deT. onnurineus es su crecimiento en formiato como fuente de carbono y
energa (Kim et al., 2010 ).Debido a la pequea variacin de energa en la
reaccin,
que haba sido excluido tericamente que los microorganismos pueden crecer
mediante la conversin de formato de dixido de carbono y de hidrgeno. Hasta
el momento, el crecimiento en condiciones anaerbicas por oxidacin de
formiato de acuerdo con la ec. 16 slo se ha observado por bacterias syntrophic
en cultivos mixtos. En estos consorcios, un organismo socio oxida hidrgeno y,
por lo tanto, disminuye la presin parcial de hidrgeno en el medio ambiente y
hace que el crecimiento por oxidacin formiato termodinmicamente posible
(Dolfing et al,. 2008 ; Stams y
Plugge, 2009 ).Sorprendentemente, T. onnurineus puede hacer el mismo tipo
de metabolismo en cultivo puro! A 80 C, la G 0 se vuelve ligeramente
negativa (-2,6 kJ mol-1). Este es un buen ejemplo de un tipo de metabolismo que no
es posible bajo ambiente, pero slo a temperaturas ms altas. Mediante el
anlisis de las concentraciones de los eductos y productos, la G de la reaccin
se calcula durante el crecimiento en formiato. Estos elegantes estudios
revelaron que T. onnurineus qu crece -20--8 kJ
las concentraciones medidas de formiato,
(como se calcula a partir de
mol-1
YH
2),
el valor ms bajo
jams registrado por un organismo (Kim et al., 2010 ). Este hallazgo desafa el
concepto actual del valor mnimo de energa que sostiene la vida.
Cmo es la oxidacin formiato acoplado a la conservacin de energa? De
acuerdo con los estudios moleculares y genticos, se postula que el formiato
est ocupada por un transportador de formiato y se oxida a dixido de carbono
y el hidrgeno por un formiato deshidrogenasa soluble (FDH) acoplado a una
hidrogenasa de protones reductor (Kim et al., 2010 ; Fig . 3 ). La organizacin
gentica de esta hidrogenasa es similar a la hidrogenasa unida a la membrana
(Mbh) a partir de Pyrococcus furiosus(Schut et al., 2012 ). Ambos son ms
complejas que la hidrogenasa Ech, pero todas son variaciones de un tema: la
reduccin de protones a hidrgeno gas acoplado a la exportacin de protones
de la clula, estableciendo as una
. En analoga con el sistema de liasa
de hidrgeno formiato deEscherichia coli, se sugiere que el electrn es

transferido directamente desde la FDH a la hidrogenasa a travs de una
subunidad de electrones de transferencia. Aunque ni el transporte de iones ni la
dependencia de iones de estos Hydrogenases mltiples subunidades se han
demostrado experimentalmente, se argumenta que son bombas de
protones. Dado que los valores G debajo de -17 kJ mol -1 estn bien por debajo
de la mnima cantidad de energa requerida para energizar la membrana a
una
de -180 mV, puede ser posible que la
menor que -180 mV.
establecida es
Descargar figura
figura 3
Modelo de conservacin de la energa mediante la oxidacin formiato
en Thermococcus onnurineus.Formiato se oxida por el Fdh. Los electrones son
transportados directamente a la hidrogenasa unida a la membrana (HFM,
similar a Mbh del mismo organismo y Pyrococcus furiosus), que impulsa H
electrognico
translocacin. El gradiente de H
gradiente de Na
por un Na
/H
pueden ser cambiados a un
antiporter (MRP), y la A 1 A O ATP sintasa
utiliza entonces esta gradiente de Na
para la sntesis de ATP (Kim et
al., 2010 ). La figura muestra la naturaleza de los iones bombeados, pero no las
estequiometras de las reacciones, que hasta el momento no se conocen.
Separados por dos genes que codifican una protena de funcin desconocida y
un potencial transportador de formiato son genes que codifican para
subunidades con similitudes con mltiples subunidades Na + / H + antiporter
(MRP). Tal sistema de MRP-como fue descubierto por primera vez en los
alcalfilas halodurans Bacillus y es necesaria para la homeostasis del pH en
condiciones alcalinas en el hbitat (Hamamoto et al., 1994 ). Por lo tanto, se
postula que el potencial de protones primaria se convierte en un gradiente de
iones secundarios de sodio por estos antiporters (Kim et al., 2010 ). Este
argumento se ve reforzado por el hallazgo de una unin a Na + conservada
motivos de la subunidad cde la ATP sintasa. Sin embargo, estos postulados
tienen que ser vistos con precaucin debido ATP sintasas methanoarchaeal
tambin tienen el motivo de unin a Na + (Mller et al., 1999 ), pero, hasta
ahora, no se ha obtenido evidencia clara para el transporte de Na +, y en uno
caso (M. acetivorans), la enzima se demostr que trasladar Na + y
H + simultneamente (Schlegel et al., 2012b ). En segundo lugar, los mdulos
de Na + / H + antiporter-como tambin estn presentes en el complejo I de la
cadena respiratoria de las bacterias, y hay una clara evidencia de que el
complejo I transloca protones (Efremov et al,. 2010 ; Hunte et al,. 2010 ;
Brandt, 2011 ;. dRose et al, 2011 ). Claramente, la bioenergtica fascinantes
de T. onnurineus merece mucha ms atencin en futuros estudios.
La conservacin de energa en Pyrococcus Furiosus

Pyrococcus furiosus, una hyperthermophilic archaeon estrictamente anaerbico
que pertenece a la phylum Euryarchaeota, conserva la energa para el
crecimiento de la fermentacin de hidratos de carbono y pptidos a CO 2, H 2, y
cidos orgnicos (por ejemplo acetato) en ausencia de azufre elemental. En
presencia de azufre, P. furiosus ms bien reduce azufre elemental a H 2 S que la
produccin de H 2 (Fiala y Stetter, 1986 ). Por lo tanto, no vive bajo limitaciones
extremas de energa, pero sin embargo se incluye en esta revisin, ya que es el
paradigma de un anaerobio mediante un novedoso de protones de
translocacin, la cadena de transporte de electrones protones reductor. Los
azcares son oxidados por una ruta de Embden-Meyerhof-Parnas modificado. La
modificacin importante es una reaccin deshidrogenasa gliceraldehdo-3fosfato dependiente de ferredoxina acoplado a la ferredoxina reduccin (GAP:
ferredoxina oxidorreductasa, GAPOR). El organismo tambin no emplea una
piruvato deshidrogenasa que reducira NAD +, pero una piruvato: ferredoxina
oxidorreductasa lugar (Sapra et al,. 2003 ). Porque es esto importante? El
potencial redox de la ferredoxina (E 0 ' -500 mV) es suficientemente bajo como
para transferir electrones directamente a los protones (E 0' = -414 mV),
produciendo de ese modo gas de hidrgeno. Por lo tanto, los equivalentes de
reduccin son, literalmente, 'arrastrados' como el hidrgeno. Esto permite la
oxidacin de la glucosa a dos acetatos con la produccin de 2 moles de ATP por
la fosforilacin a nivel de sustrato (Fig. 4 ). A primera vista, la invencin de la
GAPOR se parece a una prdida de energa debido a 'la fosforilacin a nivel de
substrato' un ATP se pierde. Pero '' que arranca electrones como hidrgeno
elimina la necesidad de producir productos finales reducidas tales como el

etanol y permite la produccin de acetato por el ADP de formacin de acetil-CoA
sintetasa (ACD) que tambin produce ATP (Brasen et al., 2008 ). Por lo tanto, no
hay prdida de ATP sintetizado por fosforilacin a nivel de sustrato. An mejor,
si la produccin de hidrgeno a partir de ferredoxina reducida est acoplado
a
generacin, ms ATP se puede sintetizar. Aqu es donde la mltiples
subunidades, Mbh entra en juego.
Descargar figura
Figura 4
Modelo de conservacin de la energa en Pyrococcus Furiosus. Enzimas
implicadas en la conservacin de energa son una Mbh, un MRP-como Na
H
detoxificador mdulo, y Na
dependiente A 1 A OATP
sintasa. P. furiosus fermenta diferentes hidratos de carbono y pptidos y

produce cidos orgnicos, por ejemplo, acetato, CO 2 y H
2.
Todas las etapas
oxidativas de esta ruta de Embden-Meyerhof Parnas-modificado, las reacciones

catalizadas por la gliceraldehdo-3-fosfato: ferredoxina oxidorreductasa (GAPOR)
y la piruvato: ferredoxina oxidorreductasa (POR), utilizan ferredoxina como
aceptor de electrones. El gas de hidrgeno es producido por la Mbh, junto a la
oxidacin de ferredoxina reducida y la generacin de un gradiente de
protones. Este gradiente puede ser cambiado a un gradiente de Na
MRP-como Na
/H
por el
antiporter mdulo de los Mbh. Este gradiente de Na
utiliza entonces por el dependiente de A 1 A O ATP sintasa Na
se
para sintetizar
ATP. La figura muestra la naturaleza de los iones de bombeo, pero las

estequiometras de las reacciones son desconocidos.GAP, gliceraldehdo-3fosfato; 3-PG, 3-fosfoglicerato; ACD, ADP de formacin de acetil-CoA sintetasa.
El hidrgeno se desarroll por hidrogenasas, y el genoma de P. furiosus codifica
tres hidrogenasas diferentes. Dos de ellos (SH-I y SH-II) son solubles, que consta
de cuatro subunidades de cada uno, y son extremadamente termoestable
(Bryant y Adams, 1989 ;. Ma et al, 2000 ; Robb et al., 2001 ). Por ejemplo, SH-I
purificado slo pierde 50% de la actividad despus de 12 h de incubacin a 80
C (Ma y Adams, 2001 ; Jenney y Adams, 2008 ). La tercera hidrogenasa,
codificado en el genoma de P.Furiosus, es unida a la membrana (Mbh). El
opern Mbh contiene 14 genes (MBHA - mbhN), sino un complejo Mbh
purificado tena slo dos subunidades (MbhK y MbhL), en la que la subunidad
MbhL tiene la actividad cataltica (Jenney y Adams, 2008 ; Schut et
al,. 2012 ). Se cree que este Mbh utiliza ferredoxina reducida, generada durante
la gluclisis en el GAPOR (Mukund y Adams, 1995 ;. Van der Oost et al, 1998 ) y
las reacciones POR (Blamey y Adams, 1993 ), como un donante de electrones y
transferencias electrones a protones, produciendo de ese modo gas de
hidrgeno. Esta reaccin exergnica se utiliza para bombear iones fuera de la
clula, y el gradiente inico electroqumico establecido a continuacin, se utiliza
para conducir la sntesis de ATP (Fig. 4 ). En principio, la reaccin es similar a la
reaccin catalizada por Ech. Las mediciones de la sntesis de ATP y la
produccin de hidrgeno en vesculas de membrana invertidas
de P. furiosus mostr claramente que la produccin de hidrgeno est acoplado
a la sntesis de ATP (Sapra et al., 2003 ). Aunque el ion de acoplamiento no se
abord en este estudio, es la hiptesis de que los protones se translocan. Sin
embargo, con el hallazgo de que la ATP sintasa de P. Furiosus utiliza

Na + (Pisa et al., 2007 ), la pregunta sobre el ion trasladadas por el Mbh
surgi. El opern Mbh (14 genes en total) codifica ocho protenas (MBHA-MbhH)
que son similares a las subunidades MRPB-MrpG del tipo Mrp Na + /
H + antiporter (Schut et al.,2012 ). Por lo tanto, podra ser posible que el Mbh
de P. furiosus, como el de T. onnurineus, consta de dos mdulos: uno es para la
actividad de hidrogenasa para producir un gradiente de protones, y el otro
mdulo, el tipo Mrp Na + / H + mdulo antiporter, cambia el gradiente de
protones a un gradiente de Na+ (Schut et al,. 2012 ). El gradiente de Na
continuacin, puede ser utilizado por el dependiente de A1 A O ATP sintasa

Na + de P. furiosus (Pisa et al., 2007 ) para sintetizar ATP a altas
temperaturas.Tambin hay una identidad de secuencia sorprendente de Mbh de
complejo I de la cadena respiratoria.Su dominio soluble, que consiste en
mdulos N y Q, cataliza la oxidacin electrones NADH y transfiere a travs de
una cadena de centro de hierro-azufre a la membrana. El dominio soluble es de
hecho similar a hidrogenasas solubles. El dominio de membrana integrado, que
se llama P-mdulo o mdulo de la bomba, contiene dos mdulos
principales, P P y P D, con una fila de cuatro subunidades Na--antiporter
similares + / H +, que estn conectados por una larga helicoidal 'elemento de
transmisin' (Efremov et al,. 2010 ;. Hunte et al, 2010 ; Brandt, 2011 ;.
dRose et al, 2011 ). Estos mdulos de Na + / H + antiporter-como son los sitios
predichos de H + translocacin. En el complejo I de E. coli yRhodothermus
marinus, se observ no slo una exportacin de H +, pero tambin se observ un
transporte de Na + en la otra direccin. Uno puede trabajar como una bomba de
H + y el otro como Na +/ H + detoxificador. Pero esto Na + / H + antiporte actividad
no parece ser una propiedad general del complejo I porque para Paracoccus
denitrificans, slo se observ H + translocacin. No hay transportede Na + en la
direccin opuesta se pudo demostrar (Batista et al., 2010 ; Batista y
Pereira, 2011 ).
Es este sistema de conservacin de la energa, compuesto por Mbh, de tipo MRP
Na + / H +detoxificador mdulo, y A 1 A O ATP sintasa tambin presente en otros
hyperthermophiles? S, tal sistema de MRP-Mbh tambin est codificada
genticamente en los
gneros Thermococcus,Desulfurococcus, Thermosphaera, Ignisphaera, y Staphy
lothermus (Schut et al., 2012 ), todas las arqueas hyperthermophilic. Podra ser
posible que un sistema de conservacin de la energa de este tipo es una
adaptacin de arqueas hipertermoflico a ambientes con altas temperaturas.
La conservacin de energa en hospitalis

Ignicoccus y Nanoarchaeum
Ignicoccus hospitalis es un crenarchaeon hipertermoflico, estrictamente
anaerobias aisladas de un sistema submarino hidrotermal en Kolbeinsey
Ridge. Crece de manera ptima a 90 C y tiene un metabolismo
quimiolittrofos (Papel et al., 2007 ). Junto con nanoarchaeum clulas, que son
pequeos cocos con solamente 400 nm de dimetro, I. hospitalis forma una
'asociacin ntima', la asociacin estable slo se conoce entre dos arqueas

(Huber et al., 2002 ; Jahn et al., 2008 ). Las especies del gnero Ignicoccus son
hasta ahora los nicos miembros de arqueas se describe que tienen una
arquitectura celular inusual, as como un mecanismo de conservacin de la
energa original (Fig. 5 ).Son el nico arqueas que tienen una membrana interna
y una membrana celular externa.Estos dos membranas encierran un
compartimento intermembrana con una anchura de hasta 500 nm (Huber et
al ,. 2000 , 2012 ; Rachel et al ., 2002 ). Primeros conocimientos sobre los
mecanismos de conservacin de energa inusuales en Ignicoccus clulas
provenan de microscopa electrnica de inmuno de cortes ultrafinos de I.
Hospitalis clulas. Con el uso de anticuerpos contra el A 1 A O ATP sintasa de I.
hospitalis , la enzima se detect exclusivamente en la membrana celular
exterior (Kper et al ., 2010 ). Este fue un avance importante hacia una nueva
era de la bioenergtica, ya que hasta entonces, slo las membranas
citoplasmticas se han descrito como albergar ATP sintasas (Lewalter y
Mller, 2006 ), y se crea que las membranas exteriores son generalmente
'conservacin no energticos' (Nicholls y Ferguson, 1992 ). Sin embargo, no
slo una A 1 A O ATP sintasa es esencial para conducir la sntesis de ATP, pero
tambin es necesario un gradiente de iones a travs de la membrana. Este
gradiente de ion es producido por el H2: reaccin oxidorreductasa de azufre, en
el que el azufre se reduce con H 2 a H 2 S (Dirmeier et al ,. 1998 ). La reduccin
de azufre con hidrgeno no es una caracterstica exclusiva de Ignicoccus , pero
se ha observado antes en bacterias y arqueas (Hedderich et al ., 1999 ). El
cambio de energa libre de la reaccin
Descargar figura
Figura 5
Modelo de conservacin de la energa en Ignicoccus hospitalis . Este archaeon
tiene dos membranas, una membrana celular externa y una membrana
interna. Complejos de protenas para la conservacin de la energa se localizan
en la membrana celular exterior, hasta el momento exclusivamente.Para
ahorrar energa, el H2: oxidorreductasa de azufre reduce el azufre con H
H
S. Esta reaccin se acopla a la generacin de un ion electroqumica (lo ms
probable protn) potencial por un mecanismo desconocido. Puede tratarse de

un ciclo Q o equivalente protn-motriz.Entonces, el gradiente de protones es
utilizado por el A
ATP sintasa para sintetizar ATP. Este se utiliza ATP, por
ejemplo, por el AMP de formacin de acetil-CoA sintetasa (ACS) para la

activacin de etilo y la conversin de acetato en acetil-CoA, la molcula
aceptora principal de CO
fijacin en I. hospitalis . La figura muestra la
naturaleza de los iones de bombeo, pero no la estequiometra de la

reaccin.Adaptado de Huber et al .( 2012 ).
es lo suficientemente grande para permitir la translocacin de protones
(Thauer et al ,. 1977 ; Amend y de choque, 2001 ). Sin embargo, el mecanismo
de activacin de la membrana es oscura. Si la hidrogenasa y azufre cara
reductasa para el exterior, que debe implicar un transporte activo de protones
desde el interior hacia el exterior, porque no hay generacin de carga neta en la
reaccin redox. El c subunidad de la A 1 A O ATP sintasa de I. hospitalis no tiene
Na conservada + motivo de unin a. Esto es coherente con la sntesis de ATP de
protones impulsada y la presencia de un gradiente de protones a travs de la
membrana primaria. Consistente con el hallazgo de que la membrana ms
externa es el lugar de conservacin de la energa (Kper et al ., 2010 ), se
encontr una enzima clave que consume ATP de estilo de vida auttrofa en el
compartimiento intermembrana. El AMP de formacin de acetil-CoA sintetasa
utiliza la ATP por la A 1 A O ATP sintasa para la activacin de etilo y la conversin
de acetato en acetil-CoA, la molcula aceptora principal de CO
en I. hospitalis(Mayer et al ., 2012b ).
fijacin
Nanoarchaeum , el pequeo compaero de paseos I. hospitalis tiene al parecer,

segn se deduce de su secuencia del genoma, sin capacidad gentica para la
conservacin de la energa (Giannone et al .,2011 ). Por lo tanto, la hiptesis de
trabajo es que gana ATP de su anfitrin. Incluso si esto es correcto, todas las
clulas vivas requiere una membrana con energa. En principio, esto se puede
lograr por una ATP sintasa de protones translocacin / ATPasa a expensas de
ATP. De hecho, este no es infrecuente y se observa en muchas bacterias
estrictamente fermentacin. Sin embargo, el genoma de N. Equitanspuertos
slo un subconjunto de genes que normalmente son necesarios para codificar
una sintasa funcional ATP / ATPasa (Lewalter y Mller, 2006 ; Giannone et
al ., 2011 ). Ya sea N. Equitans tiene el ms rudimentario y simple ATPasa
conocido hasta la fecha se discute a continuacin.
ATP sintasas: enzimas clave en la bioenergtica celular

A pesar de todas las diferencias en las formas se genera el gradiente inico
electroqumico, la caracterstica comn de las arqueas (y otras formas de vida)
es una enzima que sintetiza ATP, de acuerdo con la ec. 1 , a expensas de la
gradiente inico elctrico transmembrana: el ATP sintasa (Mller et al ., 1999 ;
Mller & Gruber, 2003 ). Todos los presentes ATP sintasas / ATPasas rotativos
surgieron de un ancestro comn y se desarrollaron en las tres clases conocidas
hasta la fecha: el F 1 FO ATP sintasa presente en las bacterias, mitocondrias y
cloroplastos; la V 1 V O ATPasa presente en eucariotas; y la A 1 A O ATP sintasa
presente en arqueas (Fig. 6 ; Cruz y Taiz, 1990 ; Nelson, 1992 ; Mller &
Gruber, 2003 ; Cruz y Mller, 2004 ). Su caracterstica comn es una estructura

formada por dos motores rotativos, la A 1 / F 1 / V 1 y la A O / F S / V S motores,
conectadas por un tallo central y de uno a tres tallos perifricos. A 1 A O ATP
sintasas, F 1 F O ATP sintasas, y V 1 V S ATPasas catalizan una reaccin que in
vitro es totalmente reversible. En el modo de la hidrlisis de ATP, ATP
hidrolizado por el motor soluble, localizada en el citoplasma de las bacterias y
arqueas, impulsa la rotacin del tallo central que est conectado fsicamente al
motor membrana embebido, ion-translocacin. La rotacin de este motor est
acoplado obligatoriamente a la translocacin de iones, en el modo de hidrlisis
desde el interior hacia el exterior. En el modo de sntesis, el potencial
electroqumico de iones conduce el flujo de iones en el motor, obligndolo a
girar. Los iones se translocan desde el exterior hacia el interior, y el tallo central
comienza a girar. Energa de rotacin se transmite entonces al motor soluble,
donde se utiliza para sintetizar ATP (Mller & Gruber, 2003 ). Una diferencia
importante de funcionamiento es que la funcin fisiolgica predominante de
A 1 A S y F 1 F O ATP sintasas es sintetizar ATP a expensas de un gradiente inico
electroqumico, mientras que las V 1 V S ATPasas son diseadas por la
naturaleza para conducir el transporte de iones a costa de la hidrlisis de ATP
en orgnulos de eucariotas. La sntesis de ATP en las clulas eucariotas es por
F 1 F O ATP sintasas que residen en mitocondrias y cloroplastos. Curiosamente, a
pesar de su gran diferencia en la funcin, la A 1 A O ATP sintasa es
evolutivamente ms relacionado con V 1 V S ATPasas que a F 1 F O ATP
sintasas. Esto es consistente con el rbol filogentico de la vida que muestra
una divergencia ms bien tarde de arqueas y eucariotas de un ancestro
comn. Cabe sealar a este respecto que el "rbol de la vida" en realidad se ha
convertido en un "arbusto de la vida '. Los genes son transferidos entre los
dominios de la vida por la transferencia horizontal de genes. Esto tambin es
vlido para las bacterias y arqueas (Averhoff, 2009). En realidad, una serie de
bacterias han 'robado' los A 1 A O genes ATP sintasa de arqueas. Esto es cierto
para Thermus thermophilus y Enterococcus hirae y puede ser tambin cierto
para otras bacterias, como es evidente a partir de las secuencias del
genoma. ATPasa genes de bacterias anotados como V1 V O genes ATPasa son en
realidad un 1 Una O genes ATP sintasa! Mientras estas anotaciones errneas no
son tomadas de bases de datos, continuarn debido a la utilizacin de los
programas de anotacin.
Descargar figura
Figura 6
La comparacin de las tres clases de ATP sintasas / ATPasas.El arqueas
A
ATP sintasa consta de nueve subunidades, mientras que el F bacteriana
bien estudiado
levadura V
ATPasa tiene 14 subunidades diferentes. Subunidades iguales o
similares de un
ATP sintasa tiene slo ocho subunidades diferentes. La
Una
ATP sintasas, F
ilustran con el mismo color. La levadura V
O
1
ATP sintasas, y V
V
ATPasas se
ATPasa tiene tres
diferentes c subunidades ( c , c ', y c "), codificadas por genes diferentes, que

construyen el rotor. Subunidad una de la levadura V
ATPasa tiene dos
isoformas Vph1p (complejo de orientacin a la vacuola) y Stv1p (complejo de

orientacin al aparato de Golgi), que no se mencionan en la figura. X
V
oF
yX
=A
oF
oV
=A
Cmo se utiliza la energa de rotacin para la sntesis de ATP en la A
F 1 dominio? El A 1 dominio se compone de tres subunidades alterna A y B y de

la F 1 dominio de tres alternantes y subunidades beta (Tabla 1 ). Todas las
subunidades contienen los motivos Walker A y B, que se encuentra en la
superficie lmite de cada subunidad. Estos motivos Walker han conservado
aminocidos para la unin de nucletidos (Boyer, 1997 ). Los tres centros
catalticos para la sntesis de ATP y la hidrlisis de ATP se construyen
predominantemente por aminocidos de la subunidad A en A 1 A O ATP sintasas
y por los aminocidos de la subunidad en F 1 F O ATP sintasas (Weber et
al ,. 1995 ; Weber & senior, 1996 ; Kumar et al ., 2010 ). El Walker Un motivo,
tambin llamado P-bucle (Walker et al ., 1982 ), tiene una estructura de
horquilla con la secuencia de consenso (GXXXXGKT), que est directamente
implicado en la coordinacin del grupo -fosforilo del nucletido (Hanson &
Whiteheart , 2005 ). Similar al modelo B subunidades de V 1 V S ATPasas, las
subunidades B de un 1 Una O ATP sintasas (funcionalmente equivalentes a las
subunidades alfa de F 1 F O ATP sintasas) no contienen un motivo P-loop
conservada (Olendzenski et al . , 1998 ), pero que son capaces de unirse
selectivamente ADP y ATP (Weber et al ,.1995 ; Weber & senior, 1996 ;
Kumar et al ., 2008 ). El motivo Walker B est implicado en la coordinacin de
los nucletidos y contiene un glutamato, que activa una molcula de agua, que
es esencial para la escisin del enlace fosfoanhdrido durante la hidrlisis de
ATP (Abrahams et al ., 1994). ATP se sintetiza en la superficie lmite de las
subunidades A y B ( y en F 1 F O sintasas ATP) en una "unin change'mecanismo usando la energa de rotacin desde el motor a la membrana
incorporado y el tallo central. En el 'estado abierto', la superficie lmite entre las
subunidades A y B ( y en la F 1 F O ATP sintasas) est abierto para la unin
de ADP y P i . Despus de la unin de ADP y P i, el tallo central gira en 120 , y
se sintetiza ATP a partir de ADP y P i , que se llama el "estado apretado '. Una
rotacin adicional de la tallo central de 120 conduce a la 'estado suelto' en la
que el ATP se libera de la superficie lmite. Despus de una rotacin del tallo
central de otro 120 , la superficie lmite est de nuevo en el "estado
abierto". Con este mecanismo, tres ATPs pueden ser sintetizados por una
rotacin del motor membrana incorporado (Boyer, 1989 ; Yoshida et al ., 2001 ;
Nakanishi-Matsui et al ,.2010 ).
Ampliar la mesa
tabla 1
La comparacin de la composicin de subunidades de un
V
ATPasas, y F 1F
ATP sintasas
Una
ATP sintasas,
A 1 A O ATP sintasa (nueve

subunidades)
V 1 V O ATPasa (14
subunidades)
F 1 F O ATP sintasa (ocho

subunidades)
MARIDO
GRAMO
un
un
un
A 1 A O ATP sintasa (nueve

subunidades)
V 1 V O ATPasa (14
subunidades)
F 1 F O ATP sintasa (ocho

subunidades)
do
c, c ', c "
do
mi
mi
do
re
UN
UN
segundo
segundo
re
re
do
MARIDO
segundo
mi
subunidades homlogas estn en la misma fila.
composicin de la subunidad de la A
ATP sintasa de Pyrococcus
Furiosus .
composicin de la subunidad de la V
ATPasa de la levadura.
composicin de la subunidad de la F
ATP sintasa de Escherichia coli .
La sntesis de ATP es reversible in vitro , pero es importante tener en cuenta

que esto es diferente in vivo . Por ejemplo, una modificacin tiol como se
observa en las plantas se apaga el "modo de hidrlisis 'por la noche (Hisabori et
al ., 2002 ). Por otra parte, la conservacin de energa en las clulas eucariotas
se encuentra en las mitocondrias o cloroplastos y catalizada por F 1 F O ATP
sintasas. Por el contrario, la activacin de las membranas de los
compartimentos eukaryal tales como la vacuola o el retculo endoplsmico es
por la generacin de un gradiente de iones a travs de las membranas de
orgnulos por la accin de hidrolasas ATP giratorios (la
V 1 V O ATPasas). Naturaleza evolucion esas enzimas a descansar en el "modo
de hidrlisis 'cambiando el nmero de sitios de unin de iones en la membrana
rotor embebido.
El nmero de sitios de unin de iones en el rotor se determina por la estructura
primaria de la csubunidad y el nmero de c subunidades en el anillo (Fig. 7 ). En
su forma ms simple, el c subunidad contiene dos hlices transmembrana
conectados por un pequeo bucle, citoplasmtica. Cada csubunidad tiene un
sitio de unin de iones, y un carboxilato como en un residuo de glutamato o
aspartato es esencial para atar y trasladar H + . La H + se une entre el oxgeno
carboxilo de un carboxilato conservada y el carbonilo columna vertebral de otro
aminocido, por ejemplo fenilalanina (Pogoryelov et al ., 2009 ). Muy
pocos c subunidades, en particular de bacterias y arqueas anaerobias, se unen
Na
en lugar de H
(Dimroth, 1992 ; Mller et al ., 2001 ). La determinada
experimentalmente Na
unin a sitio de Ilyobacter tartaricus contiene el
carboxilato antes mencionados (Glu65) y cuatro residuos de aminocidos ms

que la coordenada de Na + (Murata et al ,. , 2005b ; Meier et al ., 2009 ), en
particular, Gln32, Val63, Ser66 y Thr67 (ms de una molcula de agua
estructural enterrada). Tyr70 est formando un enlace de hidrgeno con Glu65 y
estabiliza la geometra de la capa de coordinacin de iones, pero no participa
directamente en Na + coordinacin. Digno de mencin, slo se Gln32, Glu65, y
Ser66 estn suficientemente conservados en la evolucin y encontraron en
todos los metangenos, Pyrococci, y thermococci. (Sin embargo, hay que
sealar que Gln32 se puede cambiar a Glu, Glu65 a Asp, y Ser66 a menudo
para Thr.) Por lo tanto, el cambio de un ion de sodio ( P. furiosus ) a una (sitio de
unin de protones Spirulina platensis ) es simplemente por un cambio en tres
residuos dentro de la gran complejo de un total de 6.657 residuos (como se
calcula para el a
ATP sintasa de P. furiosus )!
Descargar figura
Figura 7
Subunidades del rotor y la composicin del rotor en arqueas A
sintasas. A
que F
ATP sintasas o V
ATP
ATP sintasas tienen una mayor diversidad en c subunidades

1
ATPasas. La mayora de las arqueas,
como Methanosarcina mazei , tienen un c subunidad con una horquilla y un sitio

de unin de iones (E, residuos de glutamato). Methanothermobacter
thermautotrophicus tiene una csubunidad que consta de dos horquillas con dos
sitios de unin a iones. El c subunidad deMethanocaldococcus Jannaschii tiene

una horquilla triplicado con dos sitios de unin a iones, y la csubunidad
de Methanopyrus Kandleri consta de 13 horquillas con 13 sitios de unin a
iones. Sobre la base de un hipottico c anillo compuesta por 24 hlices
transmembrana, el nmero de monmeros disminuye con la temperatura de 12
a 1 en las diferentes especies. El / ATP estequiometra de iones se calcul
utilizando la hipottica c composicin anillo.
Los individuales c subunidades se renen para un anillo que gira contra el
estator subunidad una . No slo el sitio de unin de iones con su carboxilato
conservada, pero tambin una arginina conservada de la parte de membrana
embebido de la subunidad una es esencial para la translocacin de iones
(Fig. ). Se sugiere que el carboxilato desprotonado de la c subunidad est
formando un puente salino con la arginina cargada positivamente de la
subunidad a y mantiene el carboxilato de metilo en el llamado 'conformacin
desbloqueado' (estado 2). Un ion (H + o Na + ), transportado por el primer canal
de iones de la subunidad a del periplasma al hidrfilo a / c interfaz competir
con este par de iones, lo que permitir a la protonacin del (o unin de Na + a)
el carboxilato (estado 3). Un c subunidad con un protonada (Na + carboxilato
-bound) puede entrar en la interfaz de lpidos en este 'conformacin de ionlocked' (estado 0). Despus de la rotacin de la c anillo y volver a entrar en el
hidrfila un / c interfaz desde el otro lado, el carboxilato en la "conformacin
ion-bloqueado 'gira hacia el exterior y libera el ion, con la ayuda de la influencia
electrosttica de la arginina, sobre el segundo canal de iones de la
subunidad una en el citoplasma (estado 1). Despus, el carboxilato se
encuentra en la 'conformacin desbloqueado' (estado 2) de nuevo y abierto a la
re-entrada de la prxima iones (Pogoryelov et al .,2009 ). El movimiento de
rotacin de la c anillo est acoplado a la rotacin del tallo central, que transmite
esta energa de rotacin en el dominio soluble (Fig. ).
Descargar figura
Figura 8
mecanismo propuesto de la translocacin de iones en la membrana de dominio
incrustado de la ATP sintasa.Individuales c subunidades se renen para un anillo
que gira contra el estator subunidad una .Se sugiere que el carboxilato
desprotonado de la c subunidad est formando un puente salino con la arginina
cargada positivamente de la subunidad a y mantiene el carboxilato en la
"conformacin desbloqueado '(estado 2). Un ion (H
o Na
) transportado por
el primer canal inico de la subunidadun competir con este par de iones y

permite la protonacin de (o unin de Na
a) el carboxilato (estado
3). Un c subunidad con un protonada (Na
carboxilato unido) puede entrar en
la interfaz de lpidos en la "conformacin de ion-locked '(estado 0). Despus de

la rotacin de la c anillo y volver a entrar en el hidrfila un / c interfaz desde el
otro lado, el carboxilato en la "conformacin ion-bloqueado 'gira hacia el
exterior y libera el ion sobre el segundo canal de iones de la subunidad una en

el citoplasma (estado 1). Despus, el carboxilato se encuentra en la
'conformacin desbloqueado' (estado 2) de nuevo y abierto a la re-entrada de la
prxima iones (Pogoryelov et al ., 2009 ).
Como se mencion anteriormente, el nmero de sitios de unin de iones en el
rotor se determina por la estructura primaria de la c subunidad y el nmero
de c subunidades en el anillo (Mller, 2004 ). Por ejemplo, si el c anillo tiene 12
monmeros, con dos hlices transmembrana cada uno, el c anillo tiene 12 sitios
de unin de iones. Debido a que el motor soluble tiene centros / ATP de sntesis
de tres ATP hidrolizante, la relacin de iones-a-ATP es de cuatro. Una manera de
cambiar esta relacin es para cambiar el nmero de sitios de unin de iones en
la c anillo ya sea cambiando la estequiometra de los monmeros en el anillo o
cambiando la estructura primaria de los monmeros. En realidad, el csubunidad
de V 1 V S ATPasas surgi por la duplicacin de genes de un ancestral 8kDa c gen de la subunidad seguido por la fusin de los productos. A c subunidad
doble de grande no tiene consecuencias para la eficiencia de la enzima (Jones &
Fillingame, 1998 ). Sin embargo, un sitio de unin de iones se perdi durante el
evento de duplicacin. Por lo tanto, si se compara el mismo nmero de hlices
transmembrana, el rotor de V 1 V S ATPasas tiene slo la mitad del nmero de
sitios de unin a iones. Esta es una forma muy inteligente de la naturaleza para
bloquear la enzima en el "modo de hidrlisis ' in vivo . La sntesis de ATP es
termodinmicamente imposible, pero la enzima es una bomba de iones muy
bueno: porque se transloca menos iones, que es capaz de generar gradientes
ms pronunciadas (Nelson, 1992 ; cf ec. ).
Hasta el descubrimiento de los A 1 A O ATP sintasas, haba una clara diferencia
en la estructura y funcin del ATP sintasas / ATPasas. La evolucin de un
duplicado c subunidad con slo la mitad del nmero de sitios de unin de iones
fue visto como el punto de partida para la evolucin de ATPasas encerrados en
el modo de hidrlisis (V 1 V O ATPasas). Ms tarde, subunidades adicionales
fueron evolucionado para reflejar la necesidad de la interaccin de la enzima
con una red de regulacin complejo en la clula eucariota (Wieczorek et
al ,. 2000 ; Kane & Smardon, 2003 ; Forg, 2007 ). Con la mejora en la
tecnologa de secuenciacin de ADN, las secuencias del genoma de archaea
llegaron a estar disponibles. Estos datos revelaron que los A 1 A O ATP sintasas
forman un grupo filogenticamente distinto de las enzimas. Por otra parte,
estos datos mostraron que una 1 A O ATP sintasas tienen una extraordinaria
variedad en el tamao de c subunidades, as como el nmero de sitios de unin
de iones por monmero (Mller, 2004 ), cuestionando la evolucin sugerido de
ATP sintasas / ATPasas.
Estructura de la A 1 A O ATP sintasa
Los primeros conocimientos sobre la estructura de los A
ATP sintasas
vinieron de anlisis de micrografas electrnicas de las enzimas aisladas de

hyperthermophiles. Las estructuras globales de los A 1 A O ATP sintasas
de M. jannaschii y P. Furiosus a una resolucin de 1,8 y 2,3 nm,

respectivamente, caractersticas similares a F mostr 1 F O ATP sintasas, pero
tambin algunas caractersticas inesperadas (Coskun et al ,. 2004 ; Vonck et
al ., 2009 ), lo que podra ser una adaptacin a las altas temperaturas de sus
entornos. En general, la A 1 A O ATP sintasa tiene una estructura bipartita, que
consiste en una A 1 de dominio y un O de dominio, que forman un par de
motores rotativos acoplados conectados con una central y dos tallos perifricos
(Fig. ). Los anlisis de la masa molecular de la A 1 A O ATP sintasa
de P. furiosus por lquido de bolitas de desorcin inducida por lser de iones de
espectrometra de masas (LILBID-MS) revel una masa molecular de 730 10
kDa y una estequiometra del complejo enzimtico de
A 3 B 3 CDE 2 FH 2 ac 10 . La soluble A 1 dominio tiene la actividad cataltica, y la
A-membrana hidrfoba incrustado O dominio es responsable de la translocacin
de iones a travs de la membrana. La A 1 dominio, descrito a menudo como jefe
de dominio cataltico, muestra la simetra pseudo-3 veces y clara asimetra
debido a la presencia del tallo central (Vonck et al ., 2009 ) y tiene un gran
parecido con el aislado A 1 dominio de M. mazei OG1 (Coskun et al ., 2004 ). El
dominio de cabeza tiene una cavidad central, que est rodeado por tres
subunidades alterna A y B, donde A es la subunidad cataltica comparable a la
subunidad en F 1 F Osintasas ATP (Fig. ). La subunidad A se puede identificar
claramente en la reconstruccin 3D por sus estructuras en espiga, y la
generacin de ATPA contiene un 270 pb de longitud intein, lo que hace ATPAde
arqueas ms tiempo que sus homlogos (Bowman et al ,. 1988 ; Zimniak y
col ., 1988 ; Hirata et al ,.1990 ; Puopolo et al ., 1991 ; Vonck et al ., 2009 ). El
dominio de cabeza asimtrica est conectado al tallo central, que se compone
de subunidades C, D, y F. subunidad C tiene una estructura en forma de
embudo, compuesta de tres dominios, y se coloca directamente en la parte
superior de la membrana embebido c anillo (Bernal y Stock, 2004 ; Iwata et
al ., 2004 ; Murata et al ., 2005a ; Vonck et al ., 2009). Adems, una estructura
de mando similar sobre la subunidad C es visible en la reconstruccin 3D.Esta
es la subunidad F, que tiene un dominio N-terminal globular y una parte
alargada C-terminal, que se extiende profundamente en la A 1 dominio de
cabeza e interacta all con la subunidad B (Gayen et al ,. 2007 ; Vonck et
al ,. 2009 ). La tercera subunidad del tallo central es D, que tiene un alto
contenido de -helicoidal y puede ser reticulado en el interior de la subunidad B
(Xu et al ,. 1999 ; Arata et al ,.2002 ). Desafortunadamente, la subunidad D no
se pudo detectar en la reconstruccin en 3D de la A 1A O ATP sintasa
de P. furiosus , debido a la baja resolucin de 2,3 nm del mapa de densidad
(Vonck et al ., 2009 ).
Descargar figura
Figura 9
Reconstruccin en 3D de la A
ATP sintasa de Pyrococcus
furiosus . representacin de la superficie de la ATP sintasa en la vista superior,

vista desde abajo, y una vista lateral de orientacin.La estructura global se
obtuvo mediante la sola partcula anlisis y reconstruccin en 3D de la
A
ATP sintasa deP. Furiosus . Las caractersticas principales de esta nueva
clase de A
ATP sintasas son una estructura en forma de collar (subunidad
a) y dos tallos perifricos (cada uno compuesto por un complejo de EH). La

barra de escala representa 100 (Vonck et al ., 2009 ).
Descargar figura
Figura 10
Estructura global de la A
ATP sintasa de Pyrococcus Furiosus . Montaje de
estructuras de rayos X conocidas en el mapa de densidad electrnica de la

A
ATP sintasa de P. Furiosus . (A-f) Cortar vistas abiertas del mapa. (A-d)
vertical de puntos del mapa, cortados en los niveles indicados en (e).(a) de
montaje de A
, la subunidad A (azul) de Pyrococcus horikoshii (PDB: 1VDZ)
y la subunidad B (verde) de Methanosarcina mazei (PDB: 2C61). (b) de montaje

de la subunidad F (prpura) de P.Furiosus (PDB: 2QAI). (c) de montaje de la
subunidad C (turquesa) a partir de Thermus thermophilus(PDB: 1R5Z). (d) de
montaje del tipo A-20 de la horquilla c anillo (oro) de Enterococcus hirae (PDB:
2BL2). (E, f) Dos vistas perpendiculares a lo largo del plano de la membrana.El
dominio CE (rosa) de P.horikoshii se ajust a los mandos (PDB: 2DM9). (G) Todas
las subunidades empotrados en la misma orientacin que (f).(h) Modelo para el
estator con la una subunidad en dmeros de color amarillo y la EH en rosa
(Vonck et al ., 2009 ).
Las nuevas caractersticas estructurales son una estructura en forma de collar
situado perpendicular a la c anillo y dos tallos perifricos (Fig. ). En contraste,
los F 1 F O ATP sintasas de bacterias, mitocondrias, cloroplastos y tienen un solo
tallo perifrico y sin cuello. Cada uno de los dos tallos perifrica de
un 1 Una O ATP sintasas consiste en un dmero de subunidades E y H (Vonck et
al ., 2009). Como se muestra para el A 1 A O ATP sintasa de T. thermophilus, el
heterodmero EH est formada por dos dominios distintos, un dominio cabeza
globular y un 140-A-Long bobina diestro en espiral, un pliegue de protenas, lo
cual es bastante inusual en la naturaleza (Lee et al ., 2010 ). Este dmero EH
est conectado a la A 1 dominio. Espectroscopia de correlacin de fluorescencia
mostr que la subunidad E del dmero EH es vinculante ms fuerte para la
subunidad B de la subunidad cataltica A (Hunke et al ., 2011 ). Los tallos se
montan en el cuello, que se encuentra perpendicular a la c anillo que tiene dos
largos alfa-hlices cruzadas con cuatro -motivos. Podra ser posible que
estos cuatro motivos son los sitios de unin para los tallos perifricos a la
subunidad a y por lo tanto a la A Odominio. Subunidad una tiene tambin una
parte de membrana integrado, que se compone de 7-8 transmembrana alfahlices (Vonck et al ., 2009 ). Estas alfa-hlices estn en estrecho contacto con
elc anillo, y que presumiblemente forman dos "canales inicos 'para cargar
la c anillo con iones de acoplamiento sobre el primer canal y para eliminar el ion
de nuevo desde el c anillo sobre el canal segundo ion ( Lau y
Rubinstein, 2012 ).
La composicin del rotor y de acoplamiento eficiencias en

A 1 A O ATP sintasas
Una caracterstica sobresaliente de un
Una
ATP sintasas es su diferencia de
tamao de csubunidades y el nmero de residuos de iones translocadoras

(Mller, 2004 ). La mayora arqueas tienen el tpico 8-kDa c subunidad, como
ATP sintasas de tipo F (Inatomi et al ,. 1989 ; Wilms et al .,1996 ; Ihara et
al ,. 1997 ; Steinert et al ., 1997 ), pero algunas arqueas tienen muy
inusuales csubunidades. Especies de los gneros Pyrococcus (probado
experimentalmente) y Thermococcus(deducida a partir de datos de ADN) tienen
un 16-kDa c subunidad con cuatro hlices transmembrana, pero slo un sitio de
unin a iones (Mayer et al ., 2012a ). En contraste, los 16-kDa c subunidades
de los metangenos M. thermautotrophicus (experimentalmente; Ruppert et

al ,. 2001 ) y Methanosphaera stadtmanae (deducido) tienen dos sitios de unin
a iones por monmero (Mller, 2004 ; Fricke et al .,2006 ). M. jannaschii tiene
una triplicado c subunidad (experimentalmente) con una masa molecular de
alrededor de 21 kDa y dos sitios de unin a iones; la tercera se perdi durante
la evolucin (Ruppert et al ., 1999 ). Tambin M. kandleri es muy especial,
porque es la nica archaeon que tiene una c anillo consiste en un
solo c subunidad con 13 horquillas y, por tanto, 13 sitios de unin a iones
(Slesarev et al,. 2002 ; Mller, 2004 ), como se deduce de la DNA
secuencia. Cules son las consecuencias fisiolgicas de los diferentes nmeros
de sitios de unin a iones por c anillo? Obviamente, los cambios de relacin de
in-a-ATP y este es un aspecto importante, si no el ms importante, el
parmetro para adaptar la sntesis de ATP a entornos de bajo consumo. De
acuerdo con la ec., Un potencial de fosforilacin ( G p ) de ~ 50-70 kJ mol
1 sera sostenida por el uso de n = 2,9 a 4,0 iones / ATP a un potencial
fisiolgico ion electroqumica de -180 mV (

;Schfer et al ., 1999 ). Tres
subunidades de la ATP-sintetizan en A 1 subunidades y 12 de iones de
translocacin en el c calcular anillo en realidad a cuatro iones por ATP. En este
ejemplo, la prdida de un sitio de unin de iones en cada segunda horquilla del
rotor reducira el nmero de iones por medio. El valor resultante de ' n ' de dos
no es suficiente para sintetizar ATP a un potencial de fosforilacin de ~ 50-70 kJ
mol -1 en un dado
de -180 a -200 mV, y por lo tanto, la enzima ya no es
capaz para bombear iones contra este potencial y por lo tanto incapaces de
sintetizar ATP.
Al parecer, la ATP sintasa de P. furiosus es una ATP sintasa que opera en el
modo de sntesis, aunque tiene una c subunidad con sitio nico ion de unin en
cuatro hlices transmembrana (Mayer et al .,2012a ) que impida la enzima de
trabajar como ATP sintasa. Por otra parte, la funcin como ATP sintasa es de
importancia fisiolgica porque el H ferredoxina impulsada + translocacin por el
Mbh permite la activacin de la membrana adicional (ver Fig. 4 ) que debe ser y
se utiliza para la sntesis de ATP (Sapra et al ., 2003 ). Pero, cmo se puede
resolver esta aparente contradiccin? La respuesta es bastante simple:
mediante la adicin de ms c subunidades y por lo tanto ms sitios de unin a
iones a la c anillo. De hecho, el c anillo de P. furiosus contiene
10 c subunidades, cada sitio un ion de unin que tiene en cuatro hlices
transmembrana (Vonck et al ., 2009 ). Esto da una relacin de ion / ATP de
3,3. La relacin no es inusual y, por ejemplo, tambin predijo para la levadura
ATP sintasa (Petersen et al ., 2012 ) o de la Na
de acetobacterium woodii (Fritz et al ., 2008 ).
ATP sintasa
La deduccin del nmero de sitios de unin de iones no es inequvoco para las

otras especies. Por ejemplo, M. jannaschii tiene una c subunidad contiene tres
horquillas, pero slo dos sitios de unin a iones. Si tomamos cuatro subunidades
para hacer el c anillo, contamos con 12 hlices transmembrana con ocho sitios
de unin de iones; si tomamos 5, tendremos 15 hlices transmembrana y 10

sitios de unin de iones; seis da 18; y siete da 21 con 12 o 14 sitios de unin a
iones. Estos valores estn todos dentro del rango fisiolgico. Claramente, la
variacin en c subunidades de archaeal A 1 A O ATP sintasas tiene que ser de
ventaja evolutiva y puede reflejar una adaptacin al entorno estas arqueas
viven.
Las adaptaciones de
extremas
ATP sintasas a la vida en condiciones
Cmo las protenas se adaptan a alta temperatura ha sido objeto de muchos

excelentes crticas (Somero, 1995 ; Macario et al ., 1999 ; Robb y Clark, 1999 ;
Stetter, 1999 ; Sterner y Liebl, 2001 ). Sin embargo, hay que tener en cuenta
que la mayor parte de los estudios se han llevado a cabo con enzimas solubles
y no con protenas de membrana, que estn ms expuestas a la "calor" que las
protenas solubles que pueden estar protegidos, por ejemplo, solutos (Martins y
Santos, 1995 ; Martinset al ., 1997 ). Entre los complejos de protenas de
membrana, las ATP sintasas son especiales, ya que trabajan por un mecanismo
de rotacin. Debido a que un nmero de arqueas viven en el lmite
termodinmico de la vida, el mecanismo de acoplamiento tiene que ser muy
apretada, y cualquier fuga del ion de acoplamiento a travs del motor tiene que
ser evitado. Hasta la fecha, las diferentes caractersticas pueden clasificar como
adaptaciones de A 1 A O ATP sintasas a altas temperaturas.Algunas de estas
caractersticas aparentemente evolucionaron muy temprano en la evolucin,
pero luego se mantuvo tambin por mesfilos.
El estator de un 1 Una O ATP sintasas es construido por subunidad de una sobre
la que se montan dos tallos perifricos que guardan la A 3 B 3 subconjunto en su
lugar. Ion unidades de transporte rotacin del tallo central dentro de la esttica
A 3 B 3 subconjunto. Estructuras de rayos X de la subunidad E dePyrococcus
horikoshii mostraron que la -hlice 112-a-long N-terminal est en forma de S
como la columna vertebral de un ser humano y facilitara el almacenamiento de
energa elstica (Balakrishna et al ., 2012 ). El A 1 dominio se coloca de forma
asimtrica en el tallo central, lo que provoca una oscilacin de la cabeza de
dominio durante la rotacin del tallo central. Tanto los tallos perifricos, que
consisten en dmeros EH, se estn estabilizando la "cabeza bamboleo 'y por lo
tanto son esenciales para contrarrestar el par generado por el tallo central
durante la hidrlisis de ATP y la sntesis de ATP (Stewart et al ., 2012 ).
La diferencia ms importante a otras sintasas de ATP es la longitud de
los c subunidades. La mayora arqueas mesfilas tiene un 8-kDa c subunidad
con dos hlices transmembrana, y el nmero de copias en el anillo no se
conoce, pero en F 1 F O ATP sintasas, esto vara de 8 a 15 (Mitome et al ,. 2004 ;
Meier et al ,. 2005 ; Pogoryelov et al ., 2009 ; Vollmar et al ., 2009 ; Preiss et
al ,. 2010 ; Watt et al .,2010 ). Supongamos que el rotor de las ATP sintasas
consta de 8-15 no covalentemente unidos csubunidades que forman un anillo
que gira en contra de la una subunidad que se acopla a iones translocacin, un
ion por dos hlices transmembrana. Es fcilmente concebible que las
fluctuaciones trmicas resultarn en interacciones menos estables

de c subunidades en el anillo. Una forma de soslayar el problema es unir
covalentemente individuales c subunidades en el anillo, y cuanto ms los
enlaces covalentes, mayor es su estabilidad (Fig. 7 ). De hecho, mientras la
mayora de mesfilos tienen un c subunidad con dos hlices
transmembrana, Methanothermobacter y Methanosphaera , as
como Pyrococcus y Thermococcus especies tienen una c subunidad con cuatro
hlices transmembrana, y Methanocaldococcus especies tienen
una c subunidad con seis hlices transmembrana. En M. Kandleri , el c anillo es
ms probable hecha por una sola c subunidad que tiene 26 hlices
transmembrana predicho (Mller, 2004 ).
No slo el tamao de las c subunidades, sino tambin la de iones de
acoplamiento utilizado puede ser visto como una adaptacin a las altas
temperaturas y para entornos de baja energa. Los metangenos, por ejemplo,
viven en el lmite termodinmico de la vida (Deppenmeier & Mller, 2008 ).En
los metangenos libre de citocromo, Mtr es el nico sitio de acoplamiento, y la
totalidad de los rendimientos de la va slo dos iones (Na + ) trasladadas por el
metano moles formada, equivalente a 0,5 moles de ATP por CH
moles 4 (Thauer et al ., 2008 ) . Cualquier prdida de iones de nuevo en la
clula por la fuga sera perjudicial. Las membranas biolgicas son ms escapes
para los protones que para los iones de sodio, y este efecto es an ms grande
a altas temperaturas (van de Vossenberg et al ., 1995 ). Por lo tanto, un
bioenergtica de sodio es ventajoso y es visto como el principal evento en la
evolucin de la bioenergtica (Mulkidjanian et al ,. 2008 ; Poehlein et
al ,. 2012 ). De hecho, los metangenos libre de citocromo se basan en la
bioenergtica de sodio (Thauer et al ., 2008 ). Mtr es el nico sitio de
acoplamiento en el metabolismo de los metangenos, y es un Na + de la
bomba. Por lo tanto, la ATP sintasa debe ser altamente Na + especfico. Esto es
obviamente el caso (McMillan et al ,.2011 ; Mayer et al ,. 2012a ). Los
metangenos que contiene citocromo-H tienen una mixta + y Na +potencial, y
como una adaptacin a estos dos iones de gradientes, la ATP sintasa est
simultneamente impulsados por Na
al ., 2012b ).
yH
gradientes (Schlegel et
La ATP sintasa de P. furiosus requiere Na + para la hidrlisis de ATP (Pisa et

al ., 2007 ), Na + interacta con el c subunidad (Mayer et al ., 2012a ), y un
motivo de unin de iones de sodio se conserva en la subunidad c . Esto sera
argumentar que el mdulo detoxificador Mbh genera un Na + gradiente. El
mismo escenario bioenergtico puede estar presente en la estrecha
relacin T. onnurineus .
A 1 A O ATP sintasas han sufrido mltiples variaciones como la adaptacin a su
entorno, pero el cambio ms grande pueden ser encontrado
en N. Equitans . Una bsqueda de la secuencia del genoma revel slo los
genes que codifican las subunidades A, B, D, una , y c . Al parecer, las
subunidades C, F, E, y H no estn codificados (Waters et al ., 2003 ). A pesar de
esto tiene que ser interpretados con precaucin, esto tambin puede ser visto
como una adaptacin al metabolismo energtico de N. Equitans . Carece de las
enzimas respiratorias que energizan sus membranas, y al parecer, el
A 1 A O ATPasa / ATP sintasa es la nica bomba de iones presentes. La falta de
subunidades puede ser el resultado de una transicin de una sintasa de ATP a
una bomba de iones impulsado por ATP. Desafortunadamente, las clulas son
difciles de cultivar, y la purificacin y el anlisis bioqumico de la enzima no han
sido posible todava debido a la falta de la biomasa.
Observaciones finales
Al parecer, la vida anaerbica arqueas bajo limitaciones extremas de energa ha
desarrollado mecanismos sofisticados para conservar la energa, incluso
incrementos muy pequeos. La termodinmica no permite un acoplamiento
directo a travs de la fosforilacin a nivel de sustrato, pero permite reacciones
de excitacin de la membrana. Estos incluyen enzimas tales como
metiltransferasas que utilizan un exergnica ( G 0 ' = -30 kJ mol -1 ) reaccin
de transferencia de metilo para generar una
.Sin embargo, este tipo
de reaccin se limita a archaea metanognicas. Una reaccin ms generalizada
es la conversin reversible de hidrgeno de acuerdo con la ec. 18 : F
Flujo de electrones exergnica de ferredoxina reducida a H
se utiliza para generar un
(E
0'
= -414 mV)
(Buckel y Thauer, 2013 ). Este tipo de
reaccin es catalizada por la hidrogenasa Ech y los MBHS mucho ms complejas

de Pyrococcus o Thermococcus . La hidrogenasa Ech es una bomba de
protones, y la complejidad de la Mbh puede surgir de la fusin del mdulo de
hidrogenasa a un Na +/ H + antiporter mdulo.
Un tipo similar de reaccin es catalizada por el complejo de RNA que se
encuentra en algunas arqueas, pero muy extendida en bacterias (Biegel et
al ., 2011 ). All, el receptor de electrones del transporte de electrones
ferredoxina de combustible es NAD + (bacterias; Biegel y Mller, 2010 ) o
methanophenazine ( Methanosarcina sp .; Schlegel et al ,. 2012a ). As, el
principio comn es el uso de una cadena de transporte de electrones
ferredoxina-alimentado inherente a uno o ms complejos de protenas. Son
receptores de electrones NAD + (bacterias), methanophenazine o protones.
Un segundo principio observado en arqueas que viven bajo limitaciones
extremas de energa es el uso de Na + en lugar de H + como ion de
acoplamiento. Se esperaba una bioenergtica a base de iones de sodio para
estar presentes en los organismos que viven a altas concentraciones de NaCl,
pero sorprendentemente, ninguna de las bacterias y arqueas halfilas o
moderadamente halfilos conocido tiene una bioenergtica primarios basados
en iones de sodio. Todos ellos tienen una secundaria de Na+ potencial
construido por Na + / H + detoxificador utilizado para diversos fines, tales como
la regulacin del pH o la rotacin flagelar.
La nica excepcin son algunas bacterias marinas que han evolucionado a un

Na + NADH -pumping: ubiquinona oxidorreductasa (NQR; Tokuda y
Unemoto, 1984 ), pero que tambin tienen protn-motriz complejos III y IV de
sus cadenas respiratorias. Rotacin flagelar (Imae y Atsumi, 1989 ), pero no la
sntesis de ATP es impulsado por
.Esto fue discutido siempre como
una adaptacin al medio marino, pero adems estos entornos son algo de
energa limitada debido a que el pH en estos ecosistemas es muy superior a 8.
Estas bacterias y otros alcalfilos tienen una baja
debido a un inversa
pH, y el secundario potencial de iones de sodio ayuda a mover y absorber los
nutrientes (Krulwich et al ., 1996 ). Cmo se sintetiza ATP por esta
baja
es todava un misterio (Meieret al ,. 2007 ; Matthies et al ., 2009 ;
Hicks et al ,. 2010 ).
Al parecer, la nica bioenergtica de sodio primario se encuentra en
anaerobios, bacterias y arqueas, este ltimo se han descrito aqu. Por qu es
esto?Para responder a esta pregunta, tenemos que echar un vistazo a el
ecosistema: ambientes anaerbicos a menudo tienen altas concentraciones de
cidos orgnicos tales como acetato, propionato, butirato o. Estos actan como
protonforos que entran en la clula en la forma protonada por difusin y se
disocian en el interior de las clulas, debido a un pH ms alto en el
citoplasma. Por lo tanto, los cidos orgnicos actan como 'protones
transbordadores. El ion bombeada cuela de nuevo por la puerta de atrs y no se
puede utilizar para la sntesis de ATP. Si usted vive en una dieta, es mejor que
tenga cuidado de que los alimentos no se difunde a distancia. Los cidos
orgnicos no pueden actuar como Na + ferries ', y es por eso, algunos
anaerobios tienen un bioenergtica a base de iones de sodio.
Sin embargo, puede empeorar. Las membranas son, en general, ms escapes a
los protones que de iones de sodio (Lane & Martin, 2012 ). Esta diferencia
aumenta a alta temperatura. Por lo tanto,Thermococcus que vive en -8--20 kJ
mol -1 (Kim et al ., 2010 ) tiene que evitar de nuevo la fuga de iones en el
citoplasma, y los iones sodio son claramente superiores sobre H
sentido.
en este
El tercer principio es que las ATP sintasas estn adaptados a la vida con
limitacin de energa extrema.Si el gradiente principal es un gradiente de iones
de sodio, a continuacin, la ATP sintasa debe ser impulsada por
. Que
se observa de hecho. Slo se necesitan unos pocos cambios (tres) sutiles en
aminocidos para cambiar la especificidad de iones. Aparte de la utilizacin de
Na +, el A 1 A OATP sintasa muestra notables adaptaciones estructurales: una
excitante variedad de subunidades c que muy probablemente a rotores con
diferentes eficacias de acoplamiento. La tendencia general es que el / ATP
estequiometra de iones se reduce. Por qu y cmo puede ser esto de
importancia fisiolgica?Teniendo en cuenta la vida a tan solo -17 kJ mol
-1,
slo
un ion puede ser translocado travs de la membrana, y se requieren varias
rondas de metabolismo para bombear hacia fuera el nmero de iones

necesarios para hacer un ATP. Cuanto menor sea el / estequiometra ATP de
iones, menos es el nmero de sustratos convertidos para hacer una ATP. Por
supuesto, esta comparacin es odiosa porque la sntesis de ATP slo funciona si
el potencial de fosforilacin es muy por debajo de 60 kJ mol-1.
Esto nos llevar al cuarto principio. Tal vez el potencial de fosforilacin en estas
arqueas es de hecho considerablemente ms baja que 60 kJ mol-1. Los datos no
estn disponibles, pero en un caso (Jetten et al., 1991 ), se puede calcular, en
base a la medicin de los nucletidos, un G P de alrededor de 40 mol kJ -1. Al
describir la base de la vida en equilibrio termodinmico es un reto para estudios
posteriores. Ya se trate de Thermococcus u oxidantes de metano anaerobias
que viven tanto en torno al equilibrio (Kim et al., 2010 ;. Holler et al, 2011 ), la
termodinmica y, de manera ms importante, mecanicista de la conservacin
de la energa en estas criaturas no se comprenden. En las ltimas dcadas, la
base de la conservacin de energa en las cadenas de transporte de electrones
mitocondriales y bacterianos se ha descifrado hasta el nivel atomista. Los
principios se entienden bien.Ahora, es el momento de descubrir la belleza de la
diversidad en la bioenergtica microbianas en los organismos inusuales, tales
como las arqueas. Se puede aprender mucho, tambin sobre el origen de la
bioenergtica.

Abstract o

Uploaded by

Document Information

Copyright

Available Formats

Share this document

Share or Embed Document

Sharing Options

Did you find this document useful?

Is this content inappropriate?

Copyright:

Available Formats

Abstract o

Uploaded by

Copyright:

Available Formats

Abstracto

Algunas arqueas anaerbica viven sobre sustratos que no permiten la sntesis

y el sustrato utilizado por algunas especies, pero con el mayor

impacto en la produccin de este gas de efecto invernadero en la naturaleza, es

Los principios de conservacin de la energa o la cantidad de

organoheterotrophic as como se conocen especies lithoautotrophic. De todos

El cambio de energa libre en la reaccin en condiciones estndar es -31,8 kJ

Azcar-organismos fermentadores utilizan sobre todo las reacciones 2, 3 y 4

fermentan azcares al acetato de ganar 4 mol de ATP cuando el azcar se

donde la fuerza PMF = protn-motriz;

Como veremos ms adelante, los organismos que viven con limitacin de

. Si G consigue menor que -17 kJ

la membrana puede todava

de acuerdo con la siguiente ecuacin:

donde G P = potencial de fosforilacin intracelular.

Sntesis de ATP es una reaccin muy endergnica, y el potencial de fosforilacin

disminuye, la sntesis de ATP requiere un nmero mayor de n, el

nmero de protones translocados. Por lo tanto, incluso a baja

limitada para conducir la sntesis de ATP.Debido a la limitacin de energa

La conservacin de energa en arqueas metanognicas

Teniendo en cuenta la baja presin parcial de hidrgeno en ambientes

Thauer et al,. 2008 ). Los metangenos libre de citocromo

Abrir en una nueva pestaa

libre de citocromo, se utiliza este gradiente de Na

por la a 1 a O ATP sintasa

para sintetizar ATP. La reduccin del aceptor de electrones, un heterodisulfide

Na son entonces tambin utilizados por un promiscuo A 1A O ATP sintasa que

En metangenos que contiene

citocromo-, la transferencia de electrones endergnica de hidrgeno para

catalizada por la hidrogenasa Ech. Los

iones estequiometras representados se basan principalmente en clculos

sino por un mecanismo de acoplamiento secundario utilizando

fuerza motriz, catalizada por la hidrogenasa de conversin de la energa (Ech;.

travs de la membrana (Hedderich, 2004 ; Fig. 2a ). La reaccin

es reversible, y utiliza la enzima

para conducir la reduccin

metanognesis a partir de H 2 + CO 2 en M. Mazei Go1 (Fig. 1a ). Esta notable,

Abrir en una nueva pestaa

transferencia de electrones desde la ferredoxina para methanophenazine est

La reaccin heterodisulfide reductasa

posterior es motriz de protones. Los iones estequiometras representados se

Jurez y Barquera, 2012 ). Ech se encuentra en arqueas anaerbica y algunas

La conservacin de energa por oxidacin en

(como se calcula a partir de

. En analoga con el sistema de liasa

de hidrgeno formiato deEscherichia coli, se sugiere que el electrn es

Abrir en una nueva pestaa

pueden ser cambiados a un

antiporter (MRP), y la A 1 A O ATP sintasa

utiliza entonces esta gradiente de Na

para la sntesis de ATP (Kim et

La conservacin de energa en Pyrococcus Furiosus

elimina la necesidad de producir productos finales reducidas tales como el

Abrir en una nueva pestaa

sintasa. P. furiosus fermenta diferentes hidratos de carbono y pptidos y

Todas las etapas

oxidativas de esta ruta de Embden-Meyerhof Parnas-modificado, las reacciones

antiporter mdulo de los Mbh. Este gradiente de Na

utiliza entonces por el dependiente de A 1 A O ATP sintasa Na

ATP. La figura muestra la naturaleza de los iones de bombeo, pero las

embargo, con el hallazgo de que la ATP sintasa de P. Furiosus utiliza

continuacin, puede ser utilizado por el dependiente de A1 A O ATP sintasa

La conservacin de energa en hospitalis

'asociacin ntima', la asociacin estable slo se conoce entre dos arqueas