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BIODEGRADACIN DE COMPUESTOS
NATURALES I
Degradacin de la celulosa:
Una parte importante del ciclo del carbono, realizada por
microorganismos, es la degradacin de los polmeros
de las plantas.
Es un proceso crtico ya que la principal entrada de
carbono orgnico en los suelos es a travs de las
plantas y los microorganismos son los que
transforman sus polmeros estructurales.
Como consecuencia de esta actividad microbiana se
forman compuestos hmicos que se convierten en
compuestos orgnicos ms sencillos y accesibles para
otras poblaciones.
La hemicelulosa
La quitina
La lignina
CELULOSA
USOS DE LA CELULOSA
Se han llevado a cabo muchos esfuerzos para utilizar este polisacrido como materia
prima en la obtencin de glucosa, mediante hidrlisis, que es utilizada en la industria
de las fermentaciones, permitira obtener una gran gama de productos como el etanol
de uso como combustible.
Los procesos desarrollados hasta la fecha para aprovechar este compuesto natural
no tienen la rentabilidad necesaria para explotarlos comercialmente.
Sin embargo, las enzimas producidas por hongos y bacterias para degradar la
celulosa (celulasas) s han encontrado utilidad en la industria de detergentes,
papelera, textil y alimenticia.
Microorganismos celulolticos
Hongos
Bacterias
Diferencias en la estrategia de
degradacin de celulosa
Actividades enzimticas
Actan en las porciones
amorfas de las fibras de
celulosa y rompen los
enlaces -1 ,4
glucosdicos generando
oligosacridos de
distintas longitudes.
a)Endoglucanasas
b) Exoglucanasas
c) B-glucosidasas
Actividades enzimticas
Los hongos celulolticos tienen la capacidad de penetrar en los residuos celulsicos y excretan las
celulasas en sitios internos de las partculas celulsicas, en estos sistemas las enzimas no forman
complejos y son denominados sitios no agregativos.
Por el contrario las bacterias anaerbicas carecen de la capacidad de penetrar en este material y
presentan sistemas agregativos.
Sistemas
a) No agregativos: Estos sistemas estn compuestos por tres tipos de enzimas:
1) -1 ,4 -endoglucanasas
2) celobiohidrolasas y
3) -glucosidasas.
Rumen
Los microorganismos que viven en el tracto digestivo de los animales herbvoros
(rumen) desempean un papel fundamental en Ia degradacin de polmeros
vegetales (celulosa, hemicelulosa), que transforman en compuestos asimilables por
el animal.
RUMEN
La degradacin de la celulosa la inician
los microorganismos celulolticos
que representan entre el 1 y el 5% de
la flora ruminal. La mayora de los
microorganismos de esta flora no son
celulolticos, aunque en conjunto
pueden degradar un gran nmero de
polmeros de alto peso molecular.
Degradacin de Iignina
Degradacin de Iignina
Lignina peroxidasas
Manganeso
peroxidasas
Lacasas bencenodiol
oxidoreductasa
Glioxal-oxidasa
Arilalcohol oxidasa
Enzimas implicadas en la
degradacin de la lignina
Enzimas implicadas en la
degradacin de la lignina
Las lignina peroxidasas (LiP) y las manganeso peroxidasas
(MnP) son glcoprotenas que requieren perxido de hidrgeno
como oxidante.
Enzimas implicadas en la
degradacin de la lignina
La lacasa, una oxidasa que contiene cobre, utiliza oxgeno molecular como oxidante y
oxida compuestos fenlicos hasta radicales fenoxi. Tambin se ha descrito que oxida
compuestos no fenlicos bajo determinadas condiciones.
CIANURO
El cianuro tiene un origen natural. Se conoce su
presencia en algunas plantas, como la yuca; las
almendras o las pepitas de limn, aunque
tambin lo producen algunas bacterias, algas y
hongos (Tabla 12.2).
Las plantas son la mayor fuente de produccin de
cianuro (cianognesis) en la naturaleza, que en
la mayora de los casos est implicada en
procesos defensivos u ofensivos.
USOS:
El cianuro tambin tiene un origen antropognico
ya que este compuesto se utiliza en numerosos
procesos industriales. Las actividades mineras y
metalrgicas y otras, como son las de joyera y
bisutera, son una fuente importante de residuos
con grandes cantidades de cianuro
Normativa
De acuerdo con la normativa vigente, los residuos que contienen este
compuesto son calificados como txicos y peligrosos y, por tanto, queda
regulada su gestin de manera especial.
Los residuos que lo contienen no pueden ser vertidos al medio sin que se
sometan a tratamientos destinados a reducir su contenido por debajo del
lmite permitido (0,1 mg/l en agua potable).
Por este motivo, para la eliminacin de cianuro se pueden emplear desde lodos activados hasta
enzimas puras, dependiendo de la complejidad y variabilidad del efluente a tratar. Las
caractersticas qumicas del cianuro hacen que sea una mala fuente de carbono para organismos
hetertrofos, pero una excelente fuente de nitrgeno en potencia, siempre y cuando la bacteria
lo pueda tolerar y asimilar.
Todos
ellos
pueden
resultar
igualmente eficientes in vivo, pero in
vitro
resulta
especialmente
interesante la cianidasa, ya que no
necesita cofactores y produce
directamente amoniaco y cido
frmico, utilizando cianuro y agua
como nicos sustratos.
La utilizacin de microorganismos
alcalfilos y cianotrofos, o de las
enzimas procedentes de ellos,
permitir trabajar a un pH que
minimizar el peligroso escape del
cianuro a la atmsfera.
CIANATO
El cianato puede aparecer de forma natural en algunos tejidos animales como
resultado de la descomposicin no enzimtica del carbamil-fosfato y en el
medio ambiente como resultado de la disociacin de la rea y la
fotooxidacin del cianuro.
MICROORGANISMOS TOLERANTES AL
CIANATO
Se han descrito microorganismos capaces de tolerar cianato y de usarlo como fuente de nitrgeno debido
a la capacidad de inducir la enzima cianasa. La cianasa (cianato hidratasa) cataliza la reaccin
entre el cianato y bicarbonato para producir amonio y dixido de carbono. Esta actividad enzimtica
inducible la presentan diferentes especies de bacterias, cianobacterias y plantas.
Escherichia coli
Pseudomonas spp
CIANOBACTERIAS Y ALGAS
BACTERIAS CARBOXIDOTRFICAS
Existen bacterias carboxidotrficas que crecen autotrficamente utilizando las reacciones del ciclo de
Calvin para fijar el CO2 generado por la oxidacin del CO. Bacterias como P. carboxidoava y
P.carboxydohydrogena pueden utilizar el CO como fuente de carbono y de energa aunque el crecimiento
es lento.
La enzima implicada en el proceso es la monxido de carbono xido reductasa que cataliza la reaccin.
BACTERIAS CARBOXIDOTRFICAS
En presencia de oxgeno, el H2 producido se oxida a H2O produciendo energa para la fijacin del C02. Las
carboxidobacterias utilizan preferentemente gas hidrgeno por lo que, si ste est presente, lo utilizan
antes que el CO.
Algunos metangenos pueden reducir anaerbicamente el CO hasta CH4 mediante H2.
Tambin se han descrito gneros de hongos y algas verdes que oxidan CO hasta CO2.
OXIDACIN DE METILAMINAS
Los compuestos de este tipo, desde el punto de vista
bioqumico, comparten una caracterstica clave y es que
no contienen enlaces carbono-carbono. Los
organismos que utilizan compuestos de un tomo de
carbono se denominan metilotrofos.
A) Tetrametilaminas
Los
microorganismos
degradan
el
cloruro
de
tetrametilamonio a travs de la formacin de trimetilaminas.
La reaccin inicial est catalizada por una monoxigenasa que
no posee grupo hemo y es dependiente de NADH. En esta
reaccin se forman oxidotrimetilamina y formaldehdo.
B) Trimetilaminas
C) DIMETILAMIDAS
(CH3)2N + O2 + NAD(P)H + H+
> CH3NH2 + HCHO + NAD(P)+ +
H2O
D) METILAMINAS
En el gnero Pseudomonas se ha
descrito Ia existencia de una
amina deshidrogenasa que
cataliza
la
oxidacin
de
metilamina
para
producir
formaldehdo y amonio.
Biotecnologas correctoras de la
contaminacin:
Biosensores y biorreactores
BIOSENSORES
Un biosensor es una herramienta o sistema analtico
compuesto por un material biolgico inmovilizado (una
enzima, anticuerpo, clula entera/ orgnulo o
combinaciones de los mismos, m.o o DNA), en ntimo
contacto con un sistema transductor (electroqumico,
ptico, elctrico) adecuado que convierte la seal
bioqumica en una seal elctrica cuantificable.
b) Intervencin en el proceso
(bio)qumico.
e) Funcionamiento: reversible o
irreversible (desechable).
g) Modos de operacin:
discontinuo o continuo.
c) Forma de inmovilizacin y
especie inmovilizada: transitoria
(muestra, producto de la reaccin) o
permanente (reactivo, catalizador).
USOS
De manera habitual se pueden encontrar biosensores en los laboratorios
de bioqumica clnica para determinar glucosa, cido lctico, etc. Un
ejemplo, el control de, glucosa sangunea en los diabticos.
La tasa de glucosa en sangre de un diabticoinsulino-dependiente tiene
que determinarse dos o tres veces al da (precisin).
Biosensores en la biorremediacin
Tiene un inters especial en el
tratamiento biolgico de zonas
contaminadas.
Mtodo:
inmovilizacin
de
un
catalizador biolgico, en este caso la
cianasa,
en
vidrio
de
poro
controlado por el que pasa un flujo
con la mezcla a determinar.
BIOSENSORES
Se han diseado biosensores para la deteccin de
naftaleno en suelos contaminados. La protena
reguladora denominada NahR es capaz de reconocer
a un intermediario de la ruta de degradacin y
activar al promotor Pnah para la transcripcin de
Ios genes que codifican las enzimas implicadas en la
ruta metablica.
El biosensor diseado acopla el promotor Pnah a
unos genes denominados lux (de Ia bacteria
bioluminiscente Vibrio sheri) cuyo producto (la
luciferasa) provoca la emisin de luz visible.
Mediante la utilizacin de esta bacteria como sistema
sensor, la presencia de naftaleno en el medio se
traduce en una emisin de luz.
Biorreactores
Tratar contaminantes "trasladando" la zona contaminada a otro lugar.
Biorreactores.
Polmeros
biodegradables
a) Polmeros
naturales: celulosa,
almidn y protenas.
b) Polmeros naturales
modificados: acetato de
celulosa o los
polialcanoatos.
d) Polmeros sintticos:
polisteres, poliesteramidas y
poliuretanos (derivados del
petrleo).
Derivados de
azcares
Con respecto a la
constitucin
qumica, los
materiales
biodegradables de
mayor uso pueden
clasificarse en tres
categoras:
Alcohol
polivinlico
Polisteres
DERIVADOS DE AZCARES
Es un material termoplstico de
carcter fuertemente hidroflico
de bajo coste y de alta
disponibilidad,
que
puede
utilizarse
como
aditivo
biodegradable o material de
sustitucin
en
plsticos
tradicionales.
b) Derivados de la celulosa
La celulosa es el polmero natural ms abundante por lo que este polisacrido y sus
derivados se han investigado intensamente como material biodegradable potencial.
Como ejemplo cabe destacar el acetato de celulosa, que se caracteriza por una
elevada resistencia a la tensin: y la celulosa oxidada.
POLISTERES
Los polisteres constituyen el grupo
de polmeros ms extensamente
estudiados en cuanto a la degradacin
enzimtica.
TIPOS
La
ruta
de
sntesis
polihidroxibutrico (PHB) de
bacteria Ralstonia eutropha se
clonado en otras bacterias y
plantas.
de
la
ha
en
cido poligliclico (PGA).- Es el polister aliftico lineal ms simple. Fue utilizado para
desarrollar la primera sutura sinttica y se comercializ como DEXON. Mediante un
proceso de dimerizacin del cido gliclico se sintetiza el monmero, el cual produce un
material de alto peso molecular.