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Junio de 2003

Biochips
Rodrigo Yez, Ingrid Gonzlez
Departamento de Electrnica, Universidad Tcnica Federico Santa Mara,, Valparaso, Chile
renfield@elo.utfsm.cl, ingjazz@elo.utfsm.cl

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Resumen
Los biochips representan una de las herramientas recientes con las que cuentan los investigadores para hacer frente a la resolucin de
los problemas biolgicos basados en nuevos enfoques que se orientan a la obtencin masiva de informacin. El desarrollo de estos
enfoques integrados para el anlisis ha venido de la mano de la capacidad de gestionar y almacenar grandes cantidades de informacin, por tanto no es de extraar que la llegada de estos dispositivos haya coincidido con la madurez de la bioinformtica en la cual
se sustentan la realizacin de los experimentos en general y el anlisis de los datos que se obtienen de los biochips en particular.
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1.

INTRODUCCIN
3.

El hombre siempre ha ido de la mano con la necesidad de


controlar lo que le rodea, por lo cual es primordial el manejo
y manipulacin de la informacin.
Es as como toman su importancia los sensores de todo
tipo, ya que monitorean el estado de un proceso en todo momento, pudiendo as almacenar y utilizar la informacin en
un ordenador.
Los biosensores, nacen de la necesidad biolgica de obtener
informacin tanto del comportamiento como de la estructura
de los seres vivos, con el fin ltimo de generar vas de desarrollo aplicadas a las tecnologas de la informacin, a la resolucin de problemas de orden biolgico trabajando en la
investigacin y desarrollo de herramientas tiles para llegar a
comprender el flujo de la informacin biolgica que se origina en los genes, estructuras moleculares, la funcin bioqumica, la conducta biolgica y por ltimo la influencia en
las enfermedades y la salud, el medio ambiente y los alimentos.
Un ejemplo de biosensores es el biochip, dispositivos de
pequeo tamao (chip) que contienen material biolgico (bio)
y que se emplean para la obtencin de informacin gentica.
2.

ANTECEDENTES

El desarrollo de los primeros ensayos de afinidad con


muestras inmovilizadas sobre soportes slidos se remonta a
los primeros ensayos inmunolgicos que se desarrollaron en
los aos 60s y en los que se inmovilizaban sobre una superficie antgenos o anticuerpos para su deteccin. El siguiente
paso en la evolucin hacia estos dispositivos se dio en los
aos 70s cuando Edwin Southern, comenz a emplear filtros
de nitrocelulosa para que actuasen como soporte slido para
la adhesin de molculas de ADN. El ADN as inmovilizado
no interacciona con las otras molculas inmovilizadas pero
mantiene su capacidad de hibridar con molculas complementarias en disolucin. La deteccin de estas hibridaciones
se realizaba mediante la deteccin de un marcador radiactivo
en un revelado por autorradiografa.
El siguiente paso en el camino hacia la aparicin de los
biochips consisti en la construccin de matrices de material
biolgico, inmovilizado por este mecanismo empleando para
ello superficies porosas como son las membranas de nitrocelulosa o nylon. El proceso de miniaturizacin crea la necesidad de utilizar superficies con poros ms diminutos, trabajando, posteriormente, con vidrio y silicio.

DEFINICIONES

Un biosensor biochip, es un dispositivo al que se le incorpora una sustancia biolgica (una enzima, un anticuerpo, una
protena, ADN, etc.) para poder medir de manera selectiva
determinadas sustancias en cierto medio. Por ejemplo, plomo
o bacterias en el agua, toxinas en los alimentos. El dispositivo
traduce el cambio qumico producido en presencia del compuesto de origen biolgico en una seal elctrica procesable.
Todo esto en unos pocos minutos.
La utilidad de los biochips radica en la posibilidad de estudiar y obtener informacin de muchos genes a la vez con un
nico experimento
4.

FUNCIONAMIENTO

En estos equipos miniaturizados, los biochips, se integran


decenas de miles de sondas de material gentico con una secuencia conocida. Cuando se ponen en contacto con una
muestra de un paciente o de un experimento, slo aquellas
cadenas complementarias a las del chip se hibridan y originan
un patrn de luz caracterstico, que se lee con un escner y se
interpreta con un ordenador. De este modo se pueden conocer
las mutaciones que el paciente tiene en sus genes o aquellos
genes que se estn expresando en una situacin determinada.
La enorme cantidad de informacin que puede resultar de
estos ensayos debe ser analizada de nuevo por sistemas bioinformticos.
Una ventaja de los biosensores es que copian los sistemas
biolgicos, no miden la sustancia A, sino que miden toda
sustancia que pueda producir el efecto X. El concepto es el
monitoreo del efecto y no de la sustancia qumica
5.

COMPOSICIN

Estos dispositivos estn constituidos formando una matriz


con el material biolgico que se inmoviliza sobre ellos de
forma que se sabe en cada punto de la matriz que es lo que se
ha depositado permitiendo el posterior anlisis. El nmero de
posiciones en estas matrices puede llegar a alcanzar las decenas de miles.

Figura 1: Matriz de ADN


6.

MTODOS DE FABRICACIN

Los primeros chips de ADN se fabricaron en los mismos


centros donde fabrican los chips para ordenadores y usando la
misma tecnologa (fotolitografa).
Principalmente, son dos los mtodos de fabricacin:

Presntesis y deposicin (oligonucleotidos, ADNc)

Sntesis directa sobre el chip (oligonucleotidos)


7.

7.3 Aplicaciones en control de alimentos


En el nivel internacional el foco de atencin est puesto en
detectar alimentos contaminados o modificados, y que pueden afectar la salud. Los biosensores se usan para controlar
los procesos informatizados de elaboracin de los alimentos.
Al alertar al sistema sobre una anormalidad, sta puede ser
revertida automticamente. En Alemania ya existen en los
supermercados gndolas con productos que incluyen chips
que avisan si se ha cortado la cadena de fro.
Actualmente se estn fabricando biosensores para reconocer microtoxinas o Salmonella, por ejemplo. Se planea crear
sensores para aplicar en los casos de la vaca loca. Particularmente estn interesados en el Reino Unido en el trabajo con
productos derivados de plantas transgnicas, para identificarlos, y tambin a las plantas modificadas genticamente.
As se llegaran a evaluar sus efectos sobre la salud.
7.4Aplicaciones en computacin
Uno de los grandes adelantos, corresponde a los biochips en
base a ADN y silicio. La gran demanda de informacin hace
que da a da se piense en elementos que permitan la mayor
cantidad de almacenamiento. Una respuesta a esto, es el
ADN, ya que puede almacenar ms informacin que cualquier chip convencional:

APLICACIONES

Las principales aplicaciones de estos dispositivos se han


encontrado hasta el momento en el campo del anlisis gentico pero como se ha dicho anteriormente se pueden aplicar
para otros usos.
Aplicaiones potenciales:

Expresin diferencial de tumores (Cncer-Tumores)

Deteccin de mutaciones o polimorfismos (Genotipificacin)

Deteccin de microorganismos (Diagnstico)

Elaboracin de frmacos (Farmacogenmica)


7.1 Aplicaciones en salud
Las aplicaciones en medicina son variadas, se puede mencionar los anlisis clnicos, teraputicos, veterinaria, entre
otros.
Una aplicacin importante en materia de salud, consiste en
descubrir rpidamente enfermedades nuevas o raras en grupos poblacionales. Tambin se puede incorporar ADN en los
sensores, y ver cmo elementos extraos (metales, sustancias
orgnicas, sintticas) producidos por la industrializacin, y
que estn en el ambiente, afectan el material gentico y causan enfermedades en organismos vivos. Al detectar mutaciones de las cadenas del ADN de un individuo, se podra aplicar medicina preventiva en muchos casos o establecer diagnsticos precoces.
7.2 Aplicaciones en el medio ambiente
La medicin porttil y en campo, es decir, sin necesidad de
mandar una muestra al laboratorio, que permite la nueva tecnologa, es muy til para medir muchsimas sustancias contaminantes del ambiente.
El ejemplo ms claro que ya se est implementando es la
medicin de la demanda bioqumica de oxgeno (un parmetro que sirve para registrar el nmero de bacterias que hay en
el agua). Es el ensayo ms importante que se le hace a un lquido contaminado. Con la tecnologa convencional esta
prueba demanda alrededor de cinco das; con la nueva, los resultados se obtienen en 20 minutos. Adems, mediante un
sistema de alarma, los biosensores pueden alertar inmediatamente si una fbrica est excediendo el lmite de emisin de
contaminantes ambientales.

1 [gr] de ADN = 1 billn de CDs


En una reaccin bioqumica que tenga lugar en una superficie diminuta varios trillones de molculas de ADN pueden
operar en concierto creando un sistema de procesamiento en
paralelo, que imita la capacidad de las ms poderosas supercomputadoras.
8.

CONCLUSIONES

El fundamento de los biochips se encuentra en el desarrollo


y miniaturizacin de las tcnicas de afinidad que se conocen
y han venido empleando desde hace aos como una herramienta comn en biologa molecular.
Aunque an se estn usando principalmente en entornos de
investigacin, se prev que en los prximos aos asistiremos
a la aprobacin para uso clnico de algunos de estos sistemas.
Potencialmente podran ocasionar una revolucin en la medicina, trasladando el laboratorio gentico al hospital, e incluso
a la consulta de atencin primaria, del mismo modo que los
chips de los microprocesadores, debido a su miniaturizacin,
provocaron la salida de los ordenadores de los grandes centros de proceso de datos y su instalacin en la consulta o el
despacho de los profesionales.
Las potenciales aplicaciones de esta nueva tecnologa en las
reas de la salud, los alimentos y el medio ambiente pondrn,
en los prximos treinta aos, a la ciencia del lado de las demandas sociales actuales, muchas de las cuales, paradjicamente, son producto del impacto que los avances tecnolgicos y cientficos tienen sobre la vida cotidiana de las personas.

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