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La palabra protena proviene del griego protop (lo primero, lo principal, lo ms importante). La
protenas son las responsables de la formacin y reparacin de los tejidos, interviniendo en el
desarrollo corporal e intelectual.
Las protenas son biopolmeros (macromolculas orgnicas), de elevado peso molecular,
constituidas bsicamente por carbono (C), hidrgeno (H), oxgeno (O) y nitrgeno (N); aunque
pueden contener tambin azufre (S) y fsforo (P) y, en menor proporcin, hierro (Fe), cobre (Cu),
magnesio (Mg), yodo (Y), entre otros elementos.
Estos elementos qumicos se agrupan para formar unidades estructurales (monmeros)
llamados aminocidos ( aa ), a los cuales se consideran como los "ladrillos de los edificios
moleculares proteicos". Estos edificios macromoleculares se construyen y desmoronan con gran
facilidad dentro de las clulas, y a ello debe precisamente la materia viva su capacidad de
crecimiento, reparacin y regulacin.
La unin de un bajo nmero de aminocidos da lugar a un pptido ; si el nmero de aa que forma
la molcula no es mayor de 10, se denomina oligopptido ; si es superior a 10, se
llamapolipptido y si el nmero es superior a 50 aa , se habla ya de protena .
La estructura primaria
es la secuencia de
aminocidos de la
protena. Nos indica
qu aminocidos
componen la cadena
polipeptdica y el orden
en que dichos
aminocidos se
encuentran. La funcin
de una protena
depende de su
secuencia y de la
forma que sta adopte.
Estructura secundaria
La estructura secundaria es la disposicin de la secuencia de aminocidos en el espacio. Los
aminocidos, a medida que van siendo enlazados durante la sntesis de protenas y gracias a la
capacidad de giro de sus enlaces, adquieren una disposicin espacial estable, la estructura
secundaria .
Existen dos tipos de estructura secundaria:
1.- La a(alfa)-hlice
Esta estructura se forma al enrollarse helicoidalmente sobre s
misma la estructura primaria.
Se debe a la formacin de enlaces de hidrgeno entre el -C=O
de un aminocido y el -NH- del cuarto aminocido que le sigue.
Estructura terciaria
La estructura terciaria informa sobre la disposicin de la estructura secundaria de un polipptido al
plegarse sobre s misma originando una conformacin globular.
En definitiva, es la estructura primaria la que determina cul ser la secundaria y por tanto la
terciaria.
Esta conformacin globular facilita la solubilidad en agua y as realizar funciones de transporte,
enzimticas, hormonales , etc.
Esta conformacin
globular se mantiene
estable gracias a la
existencia de enlaces
entre los radicales
R de los aminocidos.
Aparecen varios tipos
de enlaces:
1.- el puente
disulfuro entre los
radicales de
aminocidos que
tienen azufre.
2.- los puentes de
hidrgeno.
3.- los puentes
elctricos.
Las protenas determinan la forma y la estructura de las clulas y dirigen casi todos los procesos
vitales. Las funciones de las protenas son especficas de cada una de ellas y permiten a las
clulas mantener su integridad, defenderse de agentes externos, reparar daos, controlar y regular
funciones, etc...
Todas las protenas realizan su funcin de la misma manera: por unin selectiva a molculas. Las
protenas estructurales se agregan a otras molculas de la misma protena para originar una
estructura mayor. Sin embargo, otras protenas se unen a molculas distintas: los anticuerpos, a los
antgenos especficos; la hemoglobina, al oxgeno; las enzimas, a sus sustratos; los reguladores de
la expresin gentica, al ADN ; las hormonas, a sus receptores especficos; etc...
Funcin reguladora
Funcin homeosttica
Algunas mantienen el equilibrio osmtico y actan junto con otros sistemas
amortiguadores para mantener constante el pH del medio interno.
Funcin defensiva
Las
inmunoglobulinas
actan
anticuerpos frente a posibles antgenos.
como
La lactoalbmina de la leche.
Home
Diferencias Entre
Diferencias entre ADN y ARN
ARN de transferencia
Como sabemos, para que la sntesis proteica se lleve a cabo es necesario que est
presente una molcula de mRNA que proviene del ncleo, que lleva la
informacin necesaria para decidir qu protena se va a sintetizar. Este mRNA
deber asociarse a un ribosoma que le brindar el ambiente necesario para la
traduccin y finalmente ser necesario que aparezca el primer aminocido
codificado por el primer codn del mRNA. Lo cierto es que el aminocido no
puede unirse solo sino que necesita una molcula adaptadora que lo porte. Esta
molcula es el tRNA que posee en un extremo el aminocido correcto y en otro
extremo tiene un triplete de bases llamado ANTICODON que se aparea por
complementariedad de bases con el codn presente en el mRNA.
Como cualquier RNA, est formado por una secuencia de bases (75 a 85 aprox.),
que se representa en la clsica forma de hoja de trbol debido al apareamiento de
bases que ocurre en cortas secuencias de su cadena (Estructura secundaria).
Cada ARNt est codificado en el ADN y hay uno para cada tipo de aminocido, y
la aminoacil sinteteza lo reconoce por esta estructura tridimensional en forma de
L. O sea que hay ARNt de leucinas , de argininas, de serinas etc. La estructura
tridimensional tambin le sirve para para poder asociarse a los ribosomas en el
proceso de la traduccin de protenas.
En este proceso entonces participan tres tipos de ARN, el de transferencia, el
ribosomal que se asocia a protenas formando los ribosomas y el ARNm que ser
ledo para sintetizar un polipptido.
La estructura de los ARN mensajeros ya ha sido descrita y sabemos que la
traduccin comienza en un triplete de bases (AUG) llamado el codn de inicio.
Este codn determinar entonces como se leer el ARNm, o sea de a tripletes o
codones que le siguen al AUG, por eso se dice que determina el marco de lectura
del ARNm.
Este tipo de estructura terciaria le brinda a la molcula la posibilidad de, por un
lado, poder aparear su anticodn con el codn del mRNA de una forma poco
habitual, es decir que permite que se apareen G con U por ejemplo, adems del
clsico A-U y C-G; y esta configuracin en forma de L le permite tener lo ms
alejado posible al anticodn del extremo aceptor, esto es necesario porque el
anticodn se asocia con el codn sobre la subunidad pequea del ribosoma y el
aminocido que est en el extremo aceptor se une con otro aminocido sobre la
subunidad grande del ribosoma.
El enlace entre un determinado aminocido y su correspondiente tRNA es
catalizado por la Aminoacil sintetaza, que es especfica para cada
aminocido, y por lo tanto para todos los tRNA que lo puedan portar. A los tRNA
diferentes que puedan portar el mismo aminocido, se los llama iso-aceptores.
La enzima produce la reaccin de carga del tRNA con su correspondiente
aminocido en dos pasos:
*
Los Ribosomas
Los ribosomas son partculas ribo-nucleo-proteicas compuestas por dos
subunidades. Cada subunidad esta formada por varias protenas asociadas a
molculas de rRNA.
En el caso de los procariotas el ribosoma es de 70 S de coeficiente de
sedimentacin y las subunidades son de 30 S y 50 S. La subunidad pequea 30 S
est compuesta por el rRNA 16 S asociado a 21 protenas (S de small: S1 a S21)
en cambio la subunidad grande (50 S) est formada por los rRNA 5S y 23 S,
ambos asociados a 34 protenas denominadas L de large (L1 a L34).
En cambio en el caso de los eucariotas el ribosoma es 80 S y las subunidades son
de 40 S y 60 S. La subunidad pequea (40 S) est constituida por el rRNA 18 S y
33 protenas, y la 60 S integrada por los rRNA 5 S/5,8 S/28 S y 49 protenas.
Cuadro con los aminoacidos y sus abreviaturas de tres letras y una letra.
Fase de Iniciacin
Cada mRNA tiene una secuencia de bases precedente al codn de inicio que es
complementaria a una secuencia de consenso que se encuentra en el rRNA 16 S,
la cul se denomina secuencia de Shine Dalgarno y que permite el apareamiento
entre los dos RNA (mRNA y rRNA) por complementariedad de bases, formando
el complejo de iniciacin.
Este complejo est integrado tambin por protenas indispensables para el inicio
y que son llamadas Factores de iniciacin, que intervienen en la disociacin de
los ribosomas, la unin al mRNA, la unin al tRNA iniciador y alguna otra
funcin desconocida an. En procariotas se conocen 3 de estos factores, y en
eucariotas 11 factores.
El Factor de Iniciacin 3 (IF-3) en procariotas, se une a la subunidad pequea del
ribosoma, y los dos se unen al mRNA, por lo tanto ste participa de la separacin
de las subunidades del ribosoma, luego el IF-2 es el encargado de traer al tRNA
iniciador (tRNA-f Met). Al unirse el IF-2 con su tRNA, ambos se asocian con el
complejo que se haba formado entre la subunidad pequea, el IF-3 y el mRNA,
y forman entonces en conjunto el Complejo de Iniciacin. Ms tarde se
une al complejo la subunidad grande del ribosoma, quedando liberados al medio
los factores de iniciacin.
En el caso de los eucariotas hay muchos ms factores que intervienen en la
iniciacin, adems de existir algunas diferencias con respecto al tRNA iniciador
que porta metionina normal, la subunidad pequea es 40 S y primero sta debe
reconocer el extremo 5 del mRNA y desde all se desplaza sobre el mismo hasta
encontrar el codn de inicio (Teora de scanning). Estas diferencias las realiza
gracias a la gran cantidad de factores asociados al ribosoma.
No se conoce an con exactitud como el IF-2 reconoce al tRNA-fMet en los
procariotas, pero se supone que sera por tener el grupo amino bloqueado. En los
eucariotas en cambio el tRNA lleva metionina normal lo que no lo hara diferente
de un tRNA-Met comn, pero est comprobado que en su extremo aceptor hay
una de las bases que no est unida por puente de H a su complementaria y este
cambio de configuracin sera lo que lo distingue.
Es importante aclarar que tanto el tRNA iniciador de procariotas como el de
eucariotas tienen propiedades especiales que los distinguen de otros tRNA no
iniciadores.
El ARNt iniciador viene cargado con Met formando parte del complejo con el
ribosoma y por lo tanto la traduccin comenzar con Met, a menudo luego
removida por una proteasa. El ARNt inciador trado por el factor eIF2, se
introduce en el sitio P de la subunidad pequea del ribosoma y se hidroliza GTP
en esa unin. Esto provoca junto con la liberacin de algunos factores en la
asociacin de la subunidad grande (60S). As el ribosoma una vez completo est
listo para inciar la elongacin y translocacin hasta encontrar el codn de stop.
Inciacin cap independiente.
Fase de elongacin
El sitio A ser ocupado entonces por un tRNA determinado por el siguiente
codn del mRNA y se le unir el aminocido que est en el sitio P (Metionina)
por un enlace covalente que realiza la peptidil transferasa, producindose de esta
forma un enlace entre el grupo amino del aminocido que ingresa y el grupo
carboxilo del aminocido anterior (o la cadena en crecimiento). De esta forma
queda el tRNA iniciador sin aminocido o sea desacilado y el sitio P libre.
As cada vez que ingresa un tRNA cargado al sitio A y se produce la unin entre
el grupo COOH del aminocido de la cadena en crecimiento y el grupo NH2 del
aminocido del sitio A, se cumple la fase de elongacin.
Este proceso tambin esta regido por protenas llamadas factores de elongacin,
que colaboran con la unin de los aminoacil-tRNA. Se descubri en procariotas
que este Factor de elongacin tiene dos componentes, el EF-Tu y EF-Ts (Uno
termolbil y otro termoestable).
Fase de translocacin
Ahora el ribosoma se desplaza un codn o tres bases, de modo que por un lado
libera al tRNA que estaba en sitio P e introduce en el mismo al que estaba en el A
(que es un peptidil tRNA ya que porta dos aminocidos) y de esta forma queda
nuevamente el sitio A libre para aceptar un nuevo Aminoacil tRNA. Este
movimiento se realiza en direccin 5-3 de la cadena de mRNA.
El proceso contina hasta que en el sitio A queda expuesto un codn de
terminacin, que no codifica para ningn aminocido y que ser reconocido por
un factor de liberacin.
Fase de terminacin
En las bacterias el inicio o sea la regin que se reconoce por el complejo de inicio
de la traduccin se denomina secuencia de Shine Dalgarno y es donde se unen
el mensajero y la subunidad pequea del ribosoma.
ARN ribosmico
Esto ayuda al ARNm y el ARN de transferencia a unirse para formar la cadena
polipeptdica.
ARNs reguladores
Estos RNAs sirven para regular el proceso de la expresin gnica. MicroRNAs (miRNA;
21-22 nt) por ejemplo son encontrados en eucariotas y actuar a travs de ARN de
interferencia (ARNi). Estos miRNA y enzimas pueden descomponer ARNm que es
complementario a la miRNA. Esto puede bloquear el ARNm de ser traducido, o aceleran
su degradacin.
Por otro lado pequeos RNAs de interferencia (siRNA; 20-25 nt) a menudo son
producidos por la degradacin del ARN viral, tambin hay fuentes endgenas de ARNsi.
Actan similares a miRNA. Un ARNm puede contener elementos reguladores, como
riboswitches, en la 5' UTR o 3' UTR; Estos elementos cis reguladores regulan la
actividad de ese mRNA.
ARN bicatenario
Estos son llamados dsARN donde el ARN tiene dos hebras complementarias, similares
al ADN encontrado en todas las clulas. dsARN constituye el material gentico de
algunos virus (virus de ARN bicatenario).
Introduccin
Como es lgico la rapidez con que se suceden las innovaciones de toda ndole tanto
cientficas como humansticas resulta difcil adaptarse a los avances alcanzados, en
los momentos actuales, que se dan a nivel mundial, que coloca esta ciencia entre las
primeras con ms descubrimientos y logros..
AL hacer este estudio, se ha tenido en cuenta los progresos de la Biologa y de
la Genticacon un tema tan interesante como lo es la estructura del ADN y ARN.
Esperamos que este estudio no sea un tema complicado ms sin embargo que nos
sea fcil de entender y discutir con gran facilidad.
Sntesis Proteica
Una de las tareas ms importantes de la clula es la sntesis
de protenas, molculas que intervienen en la mayora de las funciones
celulares.
El material hereditario conocido como cido desoxirribonucleico (ADN), que
se encuentra en el ncleo de la clula, contiene la informacin necesaria para
dirigir la fabricacin de protenas.
El ADN incorpora las instrucciones de produccin de protenas. Una protena es un
compuesto formado por molculas pequeas llamadas aminocidos, que
determinan su estructura y funcin.
La secuencia de aminocidos est a su
vez determinada por la secuencia de
bases de los
nucletidos del
ADN.
Cada secuencia de
una palabra
especifica un aminocido determinado.
Por tanto, una protena formada por 100 aminocidos queda codificada por un
segmento de 300 nucletidos de ADN.
De las dos cadenas de polinucletidos que forman una molcula de ADN, slo una,
llamada paralela, contiene la informacin necesaria para la produccin de una
secuencia de aminocidos determinada. La otra, llamada antiparalela, ayuda a la
replicacin.
La sntesis proteica comienza con la separacin de la molcula
de ADN en sus dos hebras. En un proceso llamado
transcripcin, una parte de la hebra paralela acta como
plantilla para formar una nueva cadena que se llama ARN mensajero o ARNm.
El ARNm sale del ncleo celular y se acopla a los ribosomas, unas estructuras
celulares especializadas que actan como centro de sntesis de protenas. Los
aminocidos son transportados hasta los ribosomas por otro tipo de ARN
llamado de transferencia (ARNt). Se inicia un fenmeno llamado traduccin que
consiste en el enlace de los aminocidos en una secuencia determinada por el
ARNm para formar una molcula de
protena.
Un gen es una secuencia de nucletidos
de ADN que especifica el orden de
aminocidos de una protena por medio de una molcula intermediaria de ARNm.
La sustitucin de un nucletido de ADN por otro que contiene una base distinta
hace que todas las clulas o virus descendientes contengan esa misma secuencia de
bases alterada.
Como resultado de
la sustitucin, tambin puede cambiar
la secuencia de
aminocidos de la protena resultante.
Esta alteracin de
una molcula de ADN se llama
mutacin. Casi todas
las mutaciones son resultado de errores
durante el proceso de replicacin. La exposicin de una clula o un virus a las
radiaciones o a determinados compuestos qumicos aumenta la probabilidad de
sufrir mutaciones.
Replicacin
reaction). Esta tcnica utiliza una enzima denominada ADN polimerasa que copia
cadenas de ADN en un proceso que simula la forma en la que el ADN se replica de
modo natural en la clula.
Este proceso, que ha revolucionado todos los campos de la biologa, permite a los
cientficos obtener gran nmero de copias a partir de un segmento determinado de
ADN. La tecnologa denominada huella de ADN (DNA fingerprinting) permite
comparar muestras de ADN de diversos orgenes, de manera anloga a la
comparacin de huellas dactilares.
En esta tcnica los investigadores utilizan tambin las enzimas de restriccin para
romper una molcula de ADN en pequeos fragmentos que separan en un gel al
que someten a una corriente elctrica (electroforesis); de esta manera, los
fragmentos se ordenan en funcin de su tamao, ya que los ms pequeos migran
ms rpidamente que los de mayor tamao.
Se puede obtener as un patrn de bandas o huella
caracterstica de cada organismo. Se utiliza una sonda
(fragmento de ADN marcado) que hibride (se una
especficamente) con algunos de los fragmentos obtenidos
y, tras una exposicin a una pelcula de rayos X, se obtiene una huella de ADN, es
decir, un patrn de bandas negras caracterstico para cada tipo de ADN.
Un procedimiento denominado secuenciacin de ADN permite determinar
el orden preciso de bases nucletidas (secuencia) de un fragmento de
ADN. La mayora de los tipos de secuenciacin de ADN se basan en una
tcnica denominada extensin de oligonucletido (primer extension) desarrollada
por el bilogo molecular britnico Frederick Sanger.
En esta tcnica se lleva a cabo una replicacin de
fragmentos especficos de ADN, de tal modo que el extremo
del fragmento presenta una forma fluorescente de una de
las cuatro bases nucletidas.
Los modernos secuenciadores de ADN parten de la idea del bilogo molecular
estadounidense Leroy Hood, incorporando ordenadores y lser en el proceso. Los
cientficos ya han completado la secuenciacin del material gentico de varios
microorganismos, incluyendo la bacteria Escherichia coli.
Aplicaciones
La investigacin sobre el ADN tiene un impacto significativo, especialmente en el
mbito de la medicina. A travs de la tecnologa del ADN recombinante los
cientficos pueden modificar microorganismos que llegan a convertir en autnticas
fbricas para producir grandes cantidades de sustancias tiles. Por ejemplo, esta
tcnica se ha empleado para producir insulina (necesaria para los enfermos de
diabetes) o interfern (muy til en el tratamiento del
cncer).
Los estudios sobre el ADN humano tambin revelan la
existencia de genes asociados con enfermedades
especficas como la fibrosis qustica y determinados tipos
de cncer. Esta informacin puede ser valiosa para el
diagnstico preventivo de varios tipos de enfermedades.
La medicina forense utiliza tcnicas desarrolladas en el curso de
la investigacin sobre el ADN para identificar delincuentes. Las
muestras de ADN tomadas de semen, piel o sangre en el escenario
del crimen se comparan con el ADN del sospechoso; el resultado
es una prueba que puede utilizarse ante los tribunales.
El estudio del ADN tambin ayuda a los taxnomos a establecer las relaciones
evolutivas entre animales, plantas y otras formas de vida, ya que las especies ms
Conclusin
Hoy en da el ADN ha tomado una importancia que aos
atrs no lo tenia y se ha vuelto un tema de frecuente
discusin. La investigacin sobre el ADN tiene un impacto significativo,
especialmente en el mbito de la medicina, la agricultura y ganadera.
Como conclusin general podemos afirmar que este trabajo nos sirvi para ampliar
nuestros conocimientos, informar y complementar nuestros objetivos en pos de
una mayor divulgacin cientfica.
Hola:
En efecto, la pregunta y las respuestas estn mal formuladas:
A. Cambio de nmero de cromosomas: S se expresa una caracterstica fenotpica.
B. Hubo formacin de clulas haploides: No se relaciona con la pregunta.
C. No ocurri sntesis de protenas: Puede ser, en efecto, por una mutacin, y como resultado se
Desde nuestros inicios se han llevado a cabo un sin fin de investigaciones, experimentos, hiptesis
y dems estudios acerca del ADN, muchos cientficos dedicaron su vida a la investigacin de esta
biomolcula, dejando a las generaciones siguientes dudas y ganas de seguir aclarando este
fascinante tema, hay que aclarar que muchas personas estuvieron involucradas en este proceso,
en el cual tuvieron que pasar muchos aos para esclarecer este tema. Sin embargo hoy en da
agradecemos cada hallazgo, respuesta y definicin de lo que conocemos como ADN.
Hoy en da vemos que el ADN se a vuelto una herramienta clave para identificar a una persona, su
parentesco; tambin puede ser muy til en el derecho para reconocer a una persona que haya
cometido un crimen (en especial en casos de libertad sexual o en los que se haya ejercido
violencia). Podemos conocer que posibles enfermedades hereditarias pueden manifestarse en
siguientes generaciones de una familia.
Es de mucha importancia seguir aprendiendo acerca de nosotros mismo y lo que nos compone
tanto emocional y biolgicamente.
Sntesis de protenas: en este proceso los aminocidos son transportados por ARN
mensajero donde se unen en la posicin adecuada para formar las nuevas protenas.
Las protenas son sintetizadas en los ribosomas a partir de la informacin codificada en el
ARN mensajero. Suplida la necesidad, el ARN mensajero es destruido. La grfica que
mejor ilustra este proceso es la letra "A" ya que de puede ver un descenso en la linea del
ARN
mensajero (ARNm) este sale del ncleo y es ledo, en grupos de tres nucletidos para atraer
complementarios de ARN de transferencia (ARNt), a los cuales se unen aminocidos (aa)
particulares, con la ayuda de los ribosomas.
ADN
ADN
1.
La herencia de algunos caracteres parece incumplir las leyes de mendel
porque las proporciones genotpicas o fenotpicas resultantes no son las
esperadas.
Los alelos mltiples: en los caracteres mendelianos tpicos existen solo dos
alelos posibles. Pero para algunos caracteres, aunque, cada individuo solo posee
dos genes, los alelos o alternativas posibles son ms de dos.
Leyes de Mendel
En su trabajo publicado en el ao 1865, Gregor Mendel habl de un conjunto de reglas bsicas,
para entender como se da la transmisin por herencia de las caractersticas de padres a sus hijos.
Son tres leyes, las cuales buscan predecir como sern los caracteres fenotipicos de el nuevo
individuo.
1 Ley de Mendel: Ley de la uniformidad de los hbridos de la primera generacin filial:
Explica que al cruzar dos razas puras ( una con un genotipo dominante y otra con un genotipo
recisivo) para un determinado carcter; todos los descendientes de la primera generacin sern
iguales entre si genotpica y fenotpicamente.
2 Ley de Mendel: Ley de la segregacin de los caracteres en la segunda generacin filial:
El carcter hereditario que se transmite como una unidad que se combina, se diluye o se pierde al
pasar de una generacin a otra, solo se segrega o se separa. Los dos genes que rigen cada
carcter no se mezclan ni se fusionan, sino que se segregan a la hora de formarse los gametos,
teniendo cada gameto uno y solo uno de los alelos diferentes.
3 Ley de Mendel: Ley de la independencia de los caracteres hereditarios:
Se hace referencia al caso de que se contemplen dos caracteres distintos. Cada uno de ellos se
transmite siguiendo manera independiente las leyes anteriores, como si no existiera presencia del
otro carcter.
Las herramientas bsicas que usa la biotecnologa para manipular el ADN son las
siguientes:
1.
Para cortar. Las enzimas de restriccin. Son capaces de cortar el ADN en
secuencias especficas, son como unas <<tijeras>> moleculares.
2.
Para pegar. La ADN ligasa. Permite unir fragmentos de ADN que han sido
cortados por otras enzimas.
3.
Para copiar. Los plsmidos. Son pequeas molculas circulares de ADN
(con capacidad de autorreplicarse) que <<viven>> en el interior de las bacterias.
Los plsmidos se usan como vehculos o vectores en ingeniera gentica.
Soy Ingeniero en Biotecnologa y no estoy seguro si te refieres a las herramientas como tales o a
las tcnicas empleadas en biotecnologia...
Las tcnicas que ms se usan en biotec. son la electroforesis en general y la reaccin en cadena
de la polimerasa PCR, adems de algunas tcnicas inmunolgicas en especial la
inmunoprecipitacin y ELISA, no debes descuidar que la biotecnologia es una ciencia demasiado
amplia y las tcnicas tradicionales de fermentaciones, preparaciones de alimentos y otras prcticas
tambien constituyen parte de la biotecnologa
Galo A hace 9 aos
Escrito por David Saceda Corralo, Mdico Interno Residente, especialista en Dermatologa
Medicoquirrgica y Veneorologa
Compartido:
56
Qu es la PCR
Resultados de la PCR
Gel de agarosa teido con bromuro de etidio que muestra varios productos de PCR obtenidos mediante
el uso de distintos cebadores, los cuales presentan un bajo nivel de especificidad.
La reaccin en cadena de la polimerasa, conocida como PCR por sus siglas en ingls
(polymerase chain reaction), es una tcnica de biologa molecular desarrollada
en 1986 por Kary Mullis.1 Su objetivo es obtener un gran nmero de copias de un fragmento
de ADN particular, partiendo de un mnimo; en teora basta partir de una nica copia de ese
fragmento original, o molde.
Esta tcnica sirve para amplificar un fragmento de ADN; su utilidad es que tras la amplificacin
resulta mucho ms fcil identificar con una muy alta probabilidad, virus o bacterias causantes
de una enfermedad, identificar personas (cadveres) o hacer investigacin cientfica sobre el
ADN amplificado. Estos usos derivados de la amplificacin han hecho que se convierta en una
tcnica muy extendida, sobre todo en el mbito de la investigacin forense, con el
consiguiente abaratamiento del equipo necesario para llevar a cabo dicha tcnica.
ndice
[ocultar]
1Fundamento e importancia
2Reactivos
3Conceptos de la PCR
4Ciclo de amplificacin
o
4.1Inicio
4.2Desnaturalizacin
4.5Elongacin final
4.6Conservacin
5Optimizacin de la PCR
6Tipos de PCR
6.1PCR anidada
6.3PCR in situ
6.4PCR mltiple
7Aplicaciones
o
7.1Investigacin
7.2Medicina
7.4Agronoma y diversidad
8Historia
o
8.1Guerras de patentes
9Vase tambin
10Referencias
11Bibliografa
12Enlaces externos
Fundamento e importancia[editar]
Esta tcnica se fundamenta en la propiedad natural de los ADN polimerasas para replicar
hebras de ADN, para lo cual se emplean ciclos de altas y bajas temperaturas alternadas para
separar las hebras de ADN recin formadas entre s tras cada fase de replicacin y, a
continuacin, dejar que las hebras de ADN vuelvan a unirse para poder duplicarlas
nuevamente. La reaccin en cadena de la polimerasa fue perfeccionada por Kary
Mullis perteneciente a la Cetus Corporation en California, en la dcada de 1980. Inicialmente
la tcnica era lenta, ya que las polimerasas se desnaturalizaban al realizar los cambios de
temperatura y era necesario agregar nuevas polimerasas en cada ciclo. Puesto que las
temperaturas del ciclo (95 C en las fases de desnaturalizacin del ADN) suponen la inmediata
desnaturalizacin de toda protena, se emplean ADN polimerasas termoestables, extradas
de microorganismos adaptados a vivir a esas temperaturas, restrictivas para la mayora de los
seres vivos. Dichos microorganismos, generalmente arqueas, son: Thermus
Reactivos[editar]
Dos cebadores o iniciadores (en ingls, primers), oligonucletidos que son, cada uno,
complementarios a una de las dos hebras del ADN. Son secuencias cortas, de entre seis y
cuarenta nucletidos, normalmente de dieciocho a veintids, que permiten que la
polimerasa inicie la reaccin. Deben estar enfrentados y no a mucha distancia. Delimitan
la zona de ADN a amplificar, es decir, corresponden a los nucletidos que definen los
extremos de la secuencia que se desea replicar.
Iones divalentes. Se suele usar magnesio (Mg2+), agregado comnmente como cloruro
de magnesio (MgCl2), o algn otro catin divalente. Tambin se puede
emplear manganeso (Mn2+), para mutagnesis de ADN mediante PCR, ya que altas
concentraciones de Mn2+ incrementan la tasa de error durante la sntesis de ADN. Actan
como cofactores de la polimerasa.
Conceptos de la PCR[editar]
otros casos no es tan importante. Una buena fidelidad permite evitar falsos positivos y/o
negativos.
Ciclo de amplificacin[editar]
Grado de amplificacin segn el nmero de ciclos empleados. A: gel de agarosa (1: ladder, 2: producto
especfico, 3: producto inespecfico); B concentracin de ADN respecto del tiempo; C logaritmo de la
concentracin de ADN respecto del tiempo.
Inicio[editar]
Este paso consiste en llevar la reaccin hasta una temperatura de 94-96 C ( 98 C si se est
usando una polimerasa termoestable extrema), que se mantiene durante 1-9 minutos. Esto
slo es necesario para ADN polimerasas que requieran activacin por calor.
Desnaturalizacin[editar]
En primer lugar, se desnaturaliza el ADN (se separan las dos cadenas de las cuales est
constituido). Este paso puede realizarse de diferentes modos, siendo el calentamiento (9495 C) de la muestra la forma ms habitual. La temperatura a la cual se decide realizar la
desnaturalizacin depende, por ejemplo, de la proporcin de G+C que tenga la cadena, como
tambin del largo de la misma. Otros mtodos, raramente empleados en la tcnica de la PCR,
seran la adicin de sales o agentes qumicos capaces de realizar la desnaturalizacin.
Elongacin final[editar]
Etapa nica que se lleva a cabo a una temperatura de 70-74 C durante 5-15 minutos tras el
ltimo ciclo de PCR. Con ella se asegura que cualquier ADN de cadena simple restante sea
totalmente ampliado.
Conservacin[editar]
Este es un paso que se lleva a cabo a 4-15 C durante un tiempo indefinido para conservar la
reaccin a corto plazo.
La PCR normalmente se realiza con un volumen de reaccin de 15-100 L, en pequeos
tubos de 0.2-0.5 mL que se colocan en el termociclador.
Para verificar que la PCR ha generado el fragmento de ADN previsto, se emplean tcnicas
de electroforesis, que separan los fragmentos de ADN generados de acuerdo a su carga, esto
es, longitud, y, en menor medida y dependiendo de la matriz empleada, a su tamao:
tpicamente se emplean la electroforesis en gel de agarosa, para fragmentos grandes;
en acrilamida, para los ms pequeos; y, de forma ms rpida y aplicable a la PCR asociada a
marcaje fluorescente, la electroforesis capilar.3 El/los tamao/s de los productos de la PCR
vienen determinados por un marcador de peso molecular de ADN, el cual contiene fragmentos
de ADN de tamao conocido, y que se corre en el gel junto con los productos de PCR.
Optimizacin de la PCR[editar]
En la prctica, la PCR puede fallar por varias razones, entre ellas:
La PCR es una tcnica de gran sensibilidad, es decir, necesita una mnima cantidad de
ADN para obtener un gran nmero de copias. Adems, puede ser muy propensa a errores
si se lleva a cabo en condiciones inadecuadas de esterilidad, que conduzcan a la
amplificacin de ADN no correspondiente a la muestra a analizar (y por tanto a
conclusiones inciertas). Se han de tomar una serie de precauciones para evitar
la contaminacin con ADN extrao. Ejemplos en los que es especialmente importante
evitar la amplificacin son la deteccin de enfermedades (para no diagnosticar
errneamente a los pacientes) o el diagnstico de identidad y parentesco.
Posibles precaucionesson:
La proporcin entre bases pricas y pirimidnicas de los dos oligos sea 1:1 (4060% a lo sumo), y que empiecen y terminen con 1 2 bases pricas.
Artefactos: pueden darse situaciones como las bandas "stutter" o "shadow", que
consisten en que la polimerasa amplifica una repeticin de ms de un microsatlite o
repeticin en tndem.
Alelo fuera de patrn: un alelo amplificado puede no coincidir con el patrn de picos
de la referencia. Esto es seal de que algo ha ido mal durante la PCR.
Mezclas: es posible que dos muestran se mezclen de alguna forma y el resultado sea
una combinacin del patrn de picos que cabe esperar tras la amplificacin de cada una
de ellas por separado. Esto y el caso anterior dificulta la interpretacin de los resultados.
Tipos de PCR[editar]
PCR anidada[editar]
Tcnica muy sensible de PCR en la que el producto de una amplificacin es utilizado como
molde para realizar una segunda amplificacin con cebadores que se ubican dentro de la
primera secuencia amplificada, es decir, cuando tenemos el primer, como su amplificacion se
pueden unir los cebadores y se hace de nuevo una amplificacin dentro del amplicn inicial.
Este tipo de PCR tiene la ventaja de brindar alta sensibilidad y especificidad. La especificidad
aumenta porque como es amplificacin de un amplicn obtenido previamente, los cebadores
slo van a hibridar en un sitio dentro de la molcula y el resultado ser una nica banda. As,
evitamos posibles hibridaciones inespecficas de los cebadores. La desventaja de esta
tcnica es que no nos permite cuantificar la muestra.
PCR in situ[editar]
La PCR in situ consiste en una reaccin de PCR en secciones histolgicas o clulas, donde
los productos generados pueden visualizarse en el sitio de amplificacin. Es realizada sobre
preparaciones fijas en un portaobjetos. En la tcnica de PCR in situ se realiza una primera
amplificacin de ADN blanco y luego deteccin mediante hibridacin in situ convencional
con sondas de ADN/ARN. De esta manera pueden detectarse cantidades pequesimas
de genoma. Esta tecnologa es de gran alcance en la capacidad de amplificar especficamente
una poblacin de secuencias de menor representacin.
PCR mltiple[editar]
PCR en la cual se amplifica simultneamente ms de una secuencia. Para ello, se combinan
dos o ms pares de cebadores en un mismo tubo, junto con el resto de los reactivos de
la reaccin en cantidades suficientes, para amplificar simultneamente varios segmentos de
ADN. Ventajas: informacin sobre varios locus en una sola reaccin, menor cantidad de
molde para el anlisis, menor cantidad de reactivos, rpida construccin de bases de
datos. Desventajas: para llevarla a cabo adecuadamente y sin errores, se requiere de una
cuidadosa optimizacin del proceso.
Reaccin de PCR cuya principal caracterstica es que permite cuantificar la cantidad de ADN o
ARN presente en la muestra original, o para identificar con una muy alta probabilidad,
muestras de ADN especficas a partir de su temperatura de fusin (tambin denominado
valor Tm, del ingls melting temperature).
Se puede dividir en las tcnicas basadas en fluorocromos no especficos y en las tcnicas
basadas en sondas especficas.
En las tcnicas basadas en fluorocromos el ADN, que ve multiplicada su cantidad con cada
ciclo, se une al fluorocromo (generalmente SYBR Green) produciendo fluorescencia que es
medida por el termociclador apto para PCR en tiempo real. Permite cuantificar slo una
secuencia por reaccin pero tiene la ventaja de utilizar cebadores normales para su
realizacin. Es mucho ms econmica que la que usa sondas especficas.
Las tcnicas basadas en sondas especficas utilizan una sonda unida a dos fluorocromos que
hibrida en la zona intermedia entre el cebador directo (forward) y el inverso (reverse); cuando
la sonda est intacta, presenta una transferencia energtica de fluorescencia por resonancia
(FRET). Dicha FRET no se produce cuando la sonda est daada y los dos fluorocromos
estn distantes, producto de la actividad 5'-3' exonucleasa de la ADN polimerasa. Esto permite
monitorizar el cambio del patrn de fluorescencia y deducir el nivel de amplificacin del gen.
La mayora de estos inconvenientes se han solucionado con la introduccin de la PCR
realizada en tiempo real (Q-PCR), que elimina cualquier proceso post-PCR puesto que
monitoriza la progresin de la amplificacin en el momento en que ocurre. A diferencia de la
PCR convencional (en punto final), que mide la acumulacin del ADN al final de un nmero
predeterminado de ciclos, con Q-PCR esto se hace durante el proceso de amplificacin
usando fluorescencia, de forma que su aumento es proporcional a la cantidad de ADN
formada. El proceso se puede automatizar fcilmente usando un sistema que realice la
amplificacin (termociclador) y que a su vez sea capaz de leer fluorescencia. Existe una
amplia oferta de aparatos en el mercado. La mayora pueden trabajar con las diversas
opciones de marcado fluorescente y son "abiertos", es decir, permiten programar las
condiciones de amplificacin y lectura de forma que su uso no queda limitado a unos reactivos
determinados.
PCR asimtrica: usada para amplificar preferentemente una cadena del ADN original
con respecto a la otra.
PCR de colonia: mediante esta tcnica, colonias de bacterias Escherichia coli pueden
ser rpidamente examinadas para construcciones viables de vectores de ADN.
PCR hot-start: esta tcnica reduce la amplificacin inespecfica durante las etapas
iniciales de la PCR: mientras que la mquina alcanza la temperatura de la primera etapa
(unos 95 ) puede que ocurra la unin de los cebadores y se produzca amplificacin, ya
que en el camino para alcanzar estos 95 se pasa por la temperatura de anillamiento
(que es ms baja).
Para evitar esto, la PCR hot-start se basa en que la reaccin comience cuando la
mquina ya est a 95, debido a que antes no se encuentran presentes la polimerasa
o el cloruro de magnesio, lo que podemos conseguir mediante varias tcnicas:
- Aadir la polimerasa o el cloruro de magnesio tras el periodo de calentamiento
- Separar por una capa de cera los distintos componentes de la reaccin. La cera se
funde al alcanzar los 95 y es entonces cuando los componentes entran en contacto
- Anticuerpos anti-polimerasa que estn bloqueando a la polimerasa. Al alcanzar los
95 estos anticuerpos se inactivan debido a que se desnaturalizan y la polimerasa
puede actuar
PCR inversa: es un mtodo usado para poder realizar la PCR cuando slo es
conocida una secuencia interna. Muy til en la identificacin de secuencias que
flanquean insertos genmicos.
PCR mediada por ligacin: este mtodo usa pequeos linkers de ADN ligados al ADN
de inters y mltiples cebadores hibridando estos linkers.
PCR especfica de metilacin (MSP): se usa para detectar metilaciones en islas CpG
de ADN genmico.
PAN-AC: este mtodo usa condiciones isotermas para la amplificacin, y puede ser
usado en clulas vivas.
Ciclo trmico rpido para PCR:4 La amplificacin del DNA puede llevarse a cabo
rpidamente, como completar 30 ciclos en menos de 30 minutos: ciclo trmico rpido.
Normalmente se ha considerado que las etapas de cada ciclo son tres reacciones que
ocurren en tres periodos separados y a tres temperaturas diferentes. Este paradigma
del equilibrio secuencial no tiene en cuenta que la temperatura de la muestra no
cambia instantneamente, de hecho, durante una PCR la muestra est la mayora del
tiempo en temperaturas de transicin. El ciclo trmico rpido aprovecha la ventaja de
la instantnea desnaturalizacin e hibridacin, cuyas temperaturas necesitan
alcanzarse, pero no mantenerse. Adems, para productos cortos, la extensin puede
llevarse a cabo durante la transicin a la temperatura de extensin, y por lo tanto,
tampoco es necesario mantenerla. Un ciclo rpido podra entonces describirse como
94 C, 0 s; 55 C, 0 s y 72 C, 0 s. Como vemos, este modelo no ayuda, porque nos
lleva solo a temperaturas extremas y no nos da informacin sobre lo que pasa entre
ellas. En cambio, en el paradigma cintico para PCR de ciclo rpido se describe
completamente el historial de temperaturas de la muestra. Se considera que
desnaturalizacin, hibridacin y elongacin ocurren en un rango de temperaturas y
adems pueden solapar temporalmente. Hay termocicladores que permiten que un
ciclo se complete en 20-60 segundos, por lo que 30 ciclos tardan de 10 a 30 minutos.
Aplicaciones[editar]
La tcnica de la PCR tiene multitud de aplicaciones: ya en ciencia bsica, como
herramienta de deteccin y/o generacin de acervos de fragmentos de ADN de inters; ya
en ciencia aplicada, como elemento resolutivo en s mismo, por ejemplo en diagnstico
clnico.
Investigacin[editar]
La PCR convencional, se emplea como base para multitud de tcnicas en el laboratorio
debido a su robustez y rapidez. De este modo, la PCR de punto final permite controlar y
detectar los fragmentos de ADN de inters.
Clonacin de un segmento de ADN mediante amplificacin con cebadores que contienen una
secuencia apta para la recombinacin dirigida con un plsmido.
Medicina[editar]
En medicina, la PCR se emplea fundamentalmente como herramienta
de diagnosis (Coleman y Tsongalis, 2006):
La PCR tambin se puede usar en revisiones mdicas rutinarias, como en los servicios
de donantes de sangre, para test de rutina. A travs de esta tcnica se pueden
detectar infecciones en el donante (como VIH o Hepatitis B) mientras an estn en el
periodo de incubacin. Dada la sensibilidad de los test de PCR se pueden tomar
muestras colectivas o "pools" (por ejemplo, 96 pruebas individuales). Si una de estas
muestras colectivas da positivo, se toman a partir de ella muestras progresivamente
menores hasta que se encuentre el causante.
Tambin se puede usar la PCR como parte de las pruebas realizadas cuando se hace
un trasplante de tejidos. En 2008 se propuso usar esta tcnica para reemplazar las
pruebas tradicionales con anticuerpos.7
En las ciencias forenses se emplea para establecer la filiacin de una persona o para
obtener pruebas a partir de muestras mnimas dejadas por el autor de
un crimen como saliva, semen u otros restos de tejidos (Butler, 2005).
Agronoma y diversidad[editar]
Tal y como la PCR multiplex permite producir huellas genticas de individuos concretos,
dentro del marco de la gentica forense, existen mtodos basados en la PCR que
permiten discernir entre grupos infraespecficos de cultivos de inters agronmico; por
ejemplo, de cultivares.10 Para ello, se emplean oligonucletidos de un tamao lo
suficientemente pequeo como para que ceben de forma relativamente inespecfica,
aunque siempre de tal forma que produzcan un patrn de bandas discreto e interpretable.
De este modo, la pauta obtenida tras la electroforesis de los fragmentos tiende a agrupar
a los individuos de mayor semejanza, que poseen un comportamiento similar, de los que
divergen.
Historia[editar]
En 1971, un artculo publicado por Kleppe et al. en Journal of Molecular Biology describi
por primera vez un mtodo que usaba enzimas para replicar una secuencia pequea de
ADN con cebadores in vitro.11 Sin embargo, este temprano ejemplo del principio bsico de
la PCR no recibi mucha atencin, y la invencin de la reaccin en cadena de la
polimerasa en 1983 es generalmente atribuida a Kary Mullis.12 13 Mullis gan el Premio
Nobel por su trabajo en PCR.
Algo muy a tener en cuenta en la PCR es que la ADN polimerasa que se use sea capaz
de soportar las altas temperaturas de >90 C necesarias para la separacin de las dos
hebras de ADN de la doble hlice tras cada ciclo de replicacin. Las ADN polimerasas que
se utilizaron originariamente para los experimentos in vitro previos a la PCR no eran
capaces de soportar estas altas temperaturas, por lo que los primeros procedimientos
para replicar el ADN eran muy ineficientes, largos y requeran grandes cantidades de ADN
polimerasa.
El descubrimiento en 1968 de la polimerasa Taq, una polimerasa de ADN extrada de
la bacteria termfila Thermus aquaticus que habita medios de muy alta temperatura (5080 C), elimin los grandes inconvenientes del mtodo de la PCR. Este ADN polimerasa
es estable a altas temperaturas, permaneciendo activa hasta despus de la
desnaturalizacin del ADN, eliminando la necesidad de aadir a la reaccin nueva
polimerasa tras cada ciclo. Este descubrimiento permiti automatizar el proceso, antes tan
tedioso, acoplndolo al uso del termociclador.
Al mismo tiempo que desarrollaba la PCR en 1983, Mullis trabajaba en
Emeryville, California (EE UU), para una de las primeras empresas biotecnolgicas, Cetus
Corporation, donde era responsable de sintetizar cadenas cortas de ADN. Mullis afirma
que concibi la idea para la PCR una noche mientras cruzaba la Autopista de la
Costa Pacfica (EE UU) en su coche.12 Estaba imaginando una nueva forma de analizar
mutaciones en el ADN cuando se percat de que, en lugar de eso, haba inventado un
mtodo para amplificar regiones especficas de ADN mediante ciclos de duplicacin
repetidos usando ADN polimerasas. Mullis atribuye la invencin de esta tcnica a los
efectos de la droga psicodlica y alucingena LSD.14
En la revista Scientific American, Mullis resumi el procedimiento: "Comenzando con una
nica molcula del material gentico ADN, la PCR puede generar 100 billones de
molculas iguales en una tarde. La reaccin es fcil de hacer, no requiere ms que un
tubo de pruebas, unos pocos reactivos simples y una fuente de calor". 15 Fue premiado con
el Premio Nobel de Qumica en 1993 por su invencin, y siete aos despus, l y sus
colegas del Cetus llevaron a la prctica su propuesta. Sin embargo, han aparecido
controversias y diferentes versiones sobre las contribuciones intelectuales y prcticas de
otros cientficos al trabajo de Mullis, y sobre si l fue el inventor nico del principio de la
PCR.
Guerras de patentes[editar]
La tcnica de la PCR fue patentada por Cetus Corporation, donde Mullis trabajaba cuando
invent la tcnica en 1983. La enzima polimerasa Taq fue tambin cubierta de patentes.
Tuvieron lugar varios pleitos relacionados con la tcnica, incluyendo un pleito fracasado
generado por DuPont. La compaa farmacutica Hoffmann-La Roche adquiri los
derechos de las patentes en 1992 y actualmente mantiene las que an estn
protegidas.16 17