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2016;14(3):24-33
Doi: 10.18004/Mem.iics/1812-9528/2016.014(03)24-033
Estandarizacin de la tcnica de PCR-RFLP de la regin
ITS1, para la caracterizacin molecular de Leishmania (L.)
infantum, en muestras caninas
Enmanuel Cspedes Chaves I, Nilda PortilloI, Vanette Thomaz-SoccolII, Andr Luiz Gonalves II, Nilsa
Gonzlez Brtez I
RESUMEN
La leishmaniasis es una enfermedad producida por protozoarios parsitos del gnero
Leishmania. Estos parsitos infectan a hospedadores mamferos, entre los cuales los perros
han sido implicados como reservorios del parsito. Este trabajo plante estandarizar la
tcnica de la PCR-RFLP luego de la amplificacin de la regin ITS1 de Leishmania spp, como
herramienta til para la deteccin y caracterizacin molecular. Se utilizaron promastigotes
de cultivo y muestras de biopsias procedentes de perros con leishmaniasis visceral
previamente diagnosticados en el Centro Antirrbico Nacional. La regin ITS1 del ADN
genmico nuclear de Leishmania spp. fue amplificada utilizando los cebadores LITSR y
L5,8S. La tcnica ITS1 PCR-RFLP aplicada, permiti la deteccin de Leishmania
(Leishmania) infantum en 10/10 aislados de parsitos mantenidos en medio NNN, en 10/18
muestras de bazo y 10/18 muestras de ganglio linftico poplteo. Las condiciones ptimas
de reaccin fueron 0,2 mM de dNTPs, 0,1 pmol de cada cebador y 1U de Taq polimerasa. La
sensibilidad de la PCR fue de 3 ng/L de ADN en aislados de cultivo NNN y 60 ng/L de ADN
en muestras de biopsias, mientras que la especificidad fue de 100% para la deteccin de
Leishmania sp. La enzima de restriccin Hae III, determin fragmentos de 184, 72 y 55 pb.,
que resultaron especficos para la especie Leishmania (L.) infantum. El marcador utilizado
result confiable para la deteccin y caracterizacin de Leishmania sp. en perros
procedentes de zonas endmicas, lo cual podra ser til para verificar las especies de
parsitos circulantes entre los perros.
Palabras claves: Leishmania infantum, perros, ITS -1 (Espaciador transcripto interno 1).
Leishmania (L.) infantum in 10/10 of the isolates from parasites maintained in NNN culture
medium, in 10/18 samples from spleen and 10/18 samples from popliteal lymph node.
Optimal reaction conditions were 0.2 mM dNTPs, 0.1 pmol of each primer and 1U of Taq
polymerase. The sensitivity of PCR was 3 ng/L DNA in isolates of parasites from NNN
culture medium and 60 ng/L DNA in biopsy samples while the specificity was 100% for the
detection of DNA of Leishmania sp. The restriction enzyme Hae III determined fragments of
184, 72 and 55 bp., which were specific to Leishmania (L.) infantum. The marker used is
reliable for the detection and characterization of Leishmania sp. in dogs from endemic
areas, which could be useful to verify the species of parasites circulating among animals.
Keywords: Leishmania infantum, dogs, ITS1 (Internal Transcribed Spacer 1).
INTRODUCCIN
La leishmaniasis se define como una histoparasitosis producida por protozoos parsitos
del gnero Leishmania, de localizacin intracelular (macrfagos), caracterizada por diversas
manifestaciones clnicas y transmitidas por la picadura de insectos del gnero Lutzomyia en
el nuevo mundo (1). Afecta a mamferos entre los que se incluye el hombre. Clnicamente
los cuadros pueden variar desde lesiones cutneas ulcerosas que cicatrizan; leishmaniasis
cutnea (LC), las no ulcerosas o difusas que no curan fcilmente; leishmaniasis cutneo
difusa (LCD), la forma mucosa llamada leishmaniasis mucocutnea (LMC) y la forma
sistmica fatal llamada leishmaniasis visceral (LV). Las manifestaciones clnicas dependen
tanto del estado inmunolgico del hospedador como de la especie causante de la infeccin,
con al menos 20 especies patgenas para el humano (2,3). La leishmaniasis es considerada
como un importante problema de salud pblica, debido al aumento en el nmero de casos.
El riesgo de infeccin parasitaria se asocia no slo con factores ambientales tales como
migraciones masivas, urbanizacin, deforestacin; sino tambin se encuentran factores
individuales como infeccin con VIH, desnutricin, gentica, entre otros (3). Los perros
domsticos han sido implicados como reservorios del parsito, pudiendo ser asintomticos o
sufrir la enfermedad, dependiendo de la respuesta inmunolgica del animal (4).
De esta forma, la leishmaniasis visceral canina (LVC) est ampliamente distribuida en
Amrica del Sur y es una de las enfermedades caninas ms importantes de la regin,
principalmente debido a su importancia zoontica (5). Varias especies de parsitos de
Leishmania sp. han sido aislados de perros en Amrica del Sur y caracterizados
molecularmente, entre estos se incluyen Leishmania braziliensis, L. peruviana, L.
colombiensis, L. mexicana, L. panamensis, L. guyanensis, L. amazonensis, L. pifanoi y L.
infantum (5,6). Diversos mtodos de caracterizacin se han aplicado para el estudio de
este gnero, tales como electroforesis de isoenzimas, anlisis del ADN del kinetoplasto
(ADNk), la tcnica de ADN polimrfico amplificado al azar (RAPD) y la tipificacin molecular
(7-11). En los ltimos aos, la reaccin en cadena de la polimerasa, seguida del anlisis de
la longitud de los fragmentos de restriccin del producto amplificado (PCR-RFLP), se ha
erigido en una importante herramienta, no solo para la identificacin, sino para la
caracterizacin de especies de este gnero, en distintas zonas geogrficas (12,13). Es as
que la identificacin y caracterizacin precisa de las especies de Leishmania sp. es
importante y necesaria para conocer sus caractersticas epidemiolgicas, as como para
documentar su distribucin, lograr nuevos esquemas de tratamiento y finalmente lograr el
diseo de medidas de control apropiadas a cada regin (14,15). Tomando en cuenta los
antecedentes mencionados, este trabajo tuvo como objetivo, optimizar las condiciones de la
PCR-RFLP/ITS1, utilizando ADN de aislados de parsitos en medio de cultivo bifsico NNN y
muestras de biopsias (bazo y ganglio linftico poplteo) obtenidas de perros con diagnstico
serolgico positivo para la leishmaniasis visceral.
MATERIALES Y MTODOS
se le extrajo una porcin del bazo, y del ganglio linftico poplteo. Una porcin de cada
muestra del bazo fue sometida a cultivo en medio bifsico NNN. Las cepas utilizadas como
controles positivos fueron mantenidas en el mismo medio de cultivo durante las pruebas
realizadas, para lo cual se utilizaron cepas de referencia internacional de tres especies del
gnero Leishmania, tales como Leishmania (Leishmania) infantum (MHOM/FR/78/LEM75),
Leishmania (Viannia) braziliensis (MHOM/BR/75/M2903), Leishmania (Leishmania)
amazonensis (MHOM/BR/73/M2269), las cuales fueron provedas por el Laboratorio de
Biologa Molecular del Programa de Post-graduacin en Ingeniera de Bioprocesos y
Biotecnologa de la Universidad Federal del Paran, Brasil.
Cultivo in vitro de Leishmania: Pequeas porciones del bazo (aproximadamente 2-3
mm2) fueron sometidas a lavado con buffer salino fosfato (PBS 1X) esterilizado, pH 7,2, con
el fin de aislar promastigotes en medio de cultivo bifsico NNN suplementado con medio
Schneider (Sigma, EEUU), gentamicina, estreptomicina 200 g/mL y suero fetal bovino al
10% inactivado por calor (16). Los cultivos fueron mantenidos en incubadoras a 26 C. El
crecimiento exponencial de los parsitos fue el parmetro obligado para la extraccin de
ADN y fueron descartados aquellos medios que demostraron algn tipo de modificacin
durante el procedimiento. En forma paralela, restos del rgano y ganglio linftico poplteo
fueron conservados a -20 C hasta su posterior extraccin de ADN.
Extraccin de ADN: La extraccin de ADN de los aislados se realiz por el mtodo
convencional (fenol-cloroformo) tomando como referencia la propuesta de Sambrook J, et al
(17) y de Meredith SEO, et al (18). Se procedi a la extraccin a partir de la fase lquida del
medio de cultivo que contena las formas promastigotes. Las muestras fueron sometidas
previamente a lisis celular y digestin de ARN mediante un buffer de lisis (10 mM de Tris,
10% SDS p/v a concentracin final de 0,5% y ARNasa a concentracin final de 100 g/mL)
a 37 C por 30 min., posteriormente la digestin de protenas se realiz con proteinasa K
mediante incubacin a 60 C por toda la noche. La eliminacin de protenas y los procesos
de precipitacin, lavado y resuspensin, se realiz segn el protocolo ya mencionado. Por
otra parte, las muestras de biopsia de los rganos mantenidos a -20 C, fueron
descongeladas y lavadas con buffer salino fosfato (PBS 1X) esterilizado, pH 7,2 y maceradas
para la extraccin de ADN mediante el Kit comercial Wizard Genomic DNA Purification kit
(PROMEGA, EEUU), siguiendo el protocolo recomendado por el fabricante.
Cuantificacin de ADN: La concentracin y pureza del ADN extrado se estim midiendo
la absorbancia a 260/280 nm. Este procedimiento se realiz en un cuantificador de
ADN/ARN/PROTENA (NanoVueTM Plus Spectrophotometer, RU). El grado de pureza se
calcul dividiendo la absorbancia a 260 nm entre la absorbancia a 280 nm. Valores ptimos
de pureza se encuentran entre 1,7-1,9 (19).
Reaccin en cadena de la polimerasa (PCR): Con el fin de obtener fragmentos
correspondientes al ADN de la regin ITS1 de Leishmania sp., se optimizaron las
condiciones de la reaccin en un volumen final de 25 L mediante la variacin de la
concentracin de determinados componentes. Se utilizaron los cebadores: LITSR:
5'-CTGGATCATTTTCCGATG-3' (directo) y L5,8S: 5'-TGATACCACTTATCGCACTT-3' (reverso),
ya reportados por Schnian et al (20) y Kuhls et al (21), que amplifican una regin de 300 a
350 pb. denominada ITS1 que se encuentra entre los genes SSU rRNA y 5,8S rRNA del
gnero Leishmania. La longitud del amplicn obtenido depende de la especie del gnero
Leishmania que haya sido aislado. La mezcla de reaccin para la amplificacin contena
Buffer 1X, 1,5 mM de MgCl2, 1 g/L de BSA (Sigma, EEUU), 0,2 mM de dNTPs (dATP,
dTTP, dCTP y dGTP), 0,1 pmol de cada cebador, 1 U de Taq polimerasa, y agua destilada
libre de ADNasa/ARNasa UltraPure (Invitrogen, EEUU). Para la amplificacin de muestras
de cultivos se requirieron 3 ng/L de ADN molde. La amplificacin a partir de muestras de
biopsia solo fue posible a partir de 60 ng/L del ADN molde. En todos los casos, se utiliz un
control negativo que contena todos los componentes de la mezcla de reaccin, excepto el
ADN molde, el cual fue sustituido por agua libre de ADNasa/ARNasa UltraPureTM (Invitrogen,
EEUU).
La amplificacin se realiz en un termociclador de ADN (Veriti Thermal Cycler, EEUU),
siguiendo las modificaciones propuestas por el Laboratorio de Biologa Molecular de la
Universidad Federal del Paran y tomando como referencia la propuesta de Schnian et al
(20) y Kuhls et al (21). Las condiciones de tiempo y temperatura utilizadas fueron
desnaturalizacin inicial a 94C por 2 min, seguida de 40 ciclos de procesos de
desnaturalizacin (94C por 30 s), hibridacin (53C por 30 s) y extensin (72C por 30 s).
Finalmente, un ltimo proceso de extensin se realiz a 72C por 10 min.
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Cspedes et al Estandarizacin de la tcnica de PCR-RFLP de la regin ITS1
RESULTADOS
ITS1-PCR a partir de ADN de parsitos en medio de cultivo bifsico NNN:
Para la amplificacin de la regin ITS1 de parsitos aislados en medio de cultivo, se
detect el blanco molecular con 5 L de ADN a concentracin de 3 ng/L, por lo que fue
suficiente para observar bandas ntidas. En estas reacciones adems fueron testadas
concentraciones de 8, 15, 31 y 51 ng/L del ADN, en las cuales de manera similar se
observaron bandas bien diferenciadas con los productos de 300-350 pb en los 10/10
aislados de parsitos que reunan las condiciones del criterio de inclusin del trabajo. La
amplificacin obtenida se visualiza en la Figura 1.
1650 pb
850 pb
650 pb
400 pb
300 pb
200 pb
Figura 1. Electroforesis en gel de agarosa al 1% con los productos obtenidos por la amplificacin de
la regin ITS1 con los cebadores LITSR y L5,8S. MM: Marcador de peso molecular de 1 kb (Invitrogen,
EEUU). Carriles 1 al 5, muestras de parsitos aislados en medio de cultivo NNN. CN: Control negativo.
CP: Control positivo Leishmania (L.) infantum (MHOM/FR/78/LEM75).
1650 pb
850 pb
500 pb
400 pb
300 pb
200 pb
100 pb
Figura 2. Electroforesis en gel de agarosa al 1% con los productos obtenidos por la amplificacin de
la regin ITS1 con los cebadores LITSR y L5,8S. MM: Marcador de peso molecular de 1 kb (Invitrogen,
EEUU). Carriles 1 y 3: muestra de parsitos aislados de biopsias (bazo). Carril 2: muestra de parsitos
aislados de biopsias (ganglio linftico poplteo). CN: Control negativo. CP1: Control positivo Leishmania
(L.) infantum (MHOM/FR/78/LEM75). CP2: Control positivo Leishmania (L.) amazonensis
(MHOM/BR/73/M2269). CP3: Control positivo Leishmania (V.) braziliensis (MHOM/BR/75/M2903).
350 pb
250 pb
200 pb
150 pb
100 pb
50 pb
350 pb
250 pb
200 pb
150 pb
100 pb
50 pb
DISCUSIN
Desde el punto de vista epidemiolgico, la caracterizacin de parsitos de Leishmania a
nivel de subgnero y especie es importante para establecer la precisa distribucin
geogrfica y el modo de transmisin de stos patgenos hacia los humanos, as como para
establecer el diagnstico clnico y la evaluacin de esquemas teraputicos adecuados para la
enfermedad (25). Est demostrado que la leishmaniasis visceral es producida por L.
infantum y es endmica en nuestro pas, especialmente en Asuncin, departamentos
Central y Cordillera, en donde se ha observado una elevada seroprevalencia en el reservorio
principal, el perro domstico (26). Con la utilizacin de diversas herramientas moleculares
han sido observados altos niveles de variacin inter e intra especies tanto en el Viejo como
en el Nuevo Mundo. En la actualidad se utilizan tcnicas moleculares tales como, la
secuenciacin, RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), IRT (Intergenic Ribosomal
Typing), entre otras (27). Diferentes blancos de amplificacin han sido utilizados, pero los
que presentan mayor sensibilidad son los que se encuentran en secuencias multicopias,
como el gen de la subunidad pequea ribosomal (SSU rRNA), secuencias repetitivas del
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ADN genmico o de los minicrculos del ADN del kinetoplasto (kDNA), el gen del locus gp63,
los cuales han sido utilizados no slo para la deteccin sino para la identificacin de los
parsitos (27). El uso de la Reaccin en Cadena de la Polimerasa, unido a la tcnica de
Polimorfismo en la longitud de los fragmentos de restriccin (PCR-RFLP) tambin se ha
utilizado con el propsito de identificacin y caracterizacin de Leishmania (28). El mtodo
de amplificacin de la regin ITS1 seguido del mtodo de RFLP proporciona alta sensibilidad
en el diagnstico e identificacin utilizando diferentes tipos de muestras, tal como se ha
verificado en este trabajo. Por otra parte, este mtodo puede constituir una herramienta til
para lograr la diferenciacin de especies mediante la digestin con endonucleasas de
restriccin. As la tcnica permite la diferenciacin entre las diversas especies (29).
En nuestro pas se han registrado estudios previos acerca de la caracterizacin molecular
de Leishmania, utilizando marcadores tales como kDNA, SLME, Hsp70, entre otros (30-33).
La amplificacin de la regin ITS1 lograda en nuestro estudio, permiti la identificacin de
bandas ntidas pertenecientes a Leishmania sp., principalmente cuando fueron amplificados
los fragmentos de ADN extrados de muestras derivadas de cultivos, que a pesar de generar
una buena cantidad de producto present diferencia en comparacin a la amplificacin
obtenida a partir del ADN derivado de las biopsias. Esto concuerda con lo observado por
algunos autores que reportaron diferencias en la carga parasitaria y cantidad de ADN, segn
la(s) especies de Leishmania que estaran parasitando al animal, as como se han observado
diferencias entre rganos de un mismo husped. Esto como consecuencia afecta la
sensibilidad de las tcnicas moleculares, por lo que pudiese tener menor nmero de copias
de alguna diana para determinadas especies y localizaciones del parsito dentro de su
husped (20), lo que nos lleva a pensar que una ptima concentracin de reactivos de PCR
podra ser determinante para la deteccin de algunas especies en particular. Nuestros
resultados permitieron observar cmo la concentracin de 0,2 mM de dNTPs, 1,5 mM de
MgCl2 y 0,1 pmol de cada cebador fue ptima para amplificar la regin en cuestin.
Por otra parte, los cortes en fragmentos de los productos amplificados que permiten
observar diferencias en la longitud de estos fragmentos de restriccin y por ende diferencias
entre especies a travs de la tcnica de la PCR-RFLP de la regin ITS1, en nuestro estudio
slo se logr detectar parte de los fragmentos que correspondera a la especie Leishmania
infantum, es decir, que la tcnica an no permiti detectar con claridad y nitidez los dos
fragmentos de menor tamao, por lo que ser necesario continuar las pruebas relacionadas
a la caracterizacin de especies de Leishmania. Sin embargo, a pesar de lo mencionado, se
observ mayor similitud de los cortes procedentes de las muestras caninas, comparadas con
los fragmentos de la cepa de referencia internacional MHOM/FR/78/LEM75 perteneciente a
Leishmania infantum, utilizada como control positivo.
Esta tcnica constituye una herramienta valiosa para el diagnstico molecular de la
leishmaniasis en sus diversas manifestaciones clnicas (LV, LC, LMC) (34) directamente en
muestras biolgicas o en aislados de medio de cultivo, como as tambin para el control de
la calidad (pureza) de cepas de referencia internacional mantenidas en laboratorios.
Similarmente, la PCR constituye una herramienta muy til para el diagnstico de la
leishmaniasis canina y la implicacin de los caninos como reservorios en las distintas zonas
endmicas para la LV, siendo de gran importancia para la deteccin de casos asintomticos.
A pesar de esta afirmacin, se debe enfatizar que no siempre la tcnica de PCR muestra
mejores ndices diagnsticos que las tcnicas convencionales (35), por lo que es
recomendable su uso en conjunto con otras tcnicas para lograr un diagnstico certero de
leishmaniasis y as, basados en esto, fortalecer los programas de control vigente en nuestro
pas (36).
El ensayo de PCR-RFLP es considerado una de las herramientas multipropsito para el
diagnstico directo de muestras clnicas, incluso sin aislamiento previo del parsito; por lo
que es recomendado para la caracterizacin de especies del gnero Leishmania en zonas
endmicas donde circulan varias especies, y por ende exigen una identificacin a bajo costo.
Este trabajo sugiere continuar con las pruebas realizando algunas modificaciones adecuadas
a las condiciones de laboratorio, considerando que, un principio fundamental para el uso de
la PCR contina siendo su optimizacin, con el fin de garantizar una amplificacin exitosa
(35). Finalmente, esta tcnica estandarizada ser muy valiosa en el diseo e
implementacin de sistemas de control y vigilancia de las leishmaniasis.
AGRADECIMIENTOS:
Al Dr. Jorge Miret, del PNCZ y CAN por el diagnstico clnico y la toma de muestras de los
caninos. A los estudiantes de veterinaria Gustavo Dvalos, Lidia Boy y Victor Agero por su
valiosa e incansable colaboracin en la colecta de muestras as como a los tcnicos del
PNCZ y CAN del Ministerio de Salud.
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