DISEO MOLECULAR DE LA VIDA

Objetivos:
- Conocer la organizacin de la materia viva.

- Reconocer los bioelementos que forman las estructuras

biomoleculares.

- Reconocer el grado de interaccin de las molculas debido a

sus propiedades qumicas.

- Conocer las propiedades del agua y su importancia en el

concierto celular.
Organizacin de la materia viva a diferentes niveles.

Nivel 4: Nivel 3: Nivel 2: Nivel 1:

Clula y organelos Complejos supramoleculares Macromoleculares Unidades monomricas
TODAS LAS MACROMOLCULAS ESTN CONSTRUDAS
A PARTIR DE ELEMENTOS SIMPLES
TODOS LOS CONSTITUYENTES DE LOS SISTEMAS VIVOS
SE COMPONEN DE TOMOS DE CARBONO
COVALENTEMENTE UNIDOS CON OTROS TOMOS DE
CARBONO Y CON HIDRGENO, OXGENO,
NITRGENO, FSFORO O AZUFRE.
 Los bioelementos, que constituyen la materia orgnica elemental,
se unen para conformar las molculas orgnicas. Estas molculas
se asocian para originar macromolculas, con estructuras y
funciones definidas.

El conjunto de macromolculas asociadas forman estructuras

supramoleculares, conocidas como organelos, con formaciones
especializadas, organizadas y complejas.

La asociacin y el trabajo conjunto de estas superestructuras forma la

clula: unidad fundamental de la vida.

Dependiendo del tipo de clula, organizacin nuclear y el nmero de

ellas, los organismos vivos pueden clasificarse en eucariotas o
procariotas.

Los organismos simples, monocelulares, sin ncleo verdadero, abarcan la

mayora de los microorganismos y constituyen los procariotas.
CLULAS PROCARIOTAS

BACTERIAS

VIRUS
 CLULAS EUCARIOTAS

Clula animal

Levaduras

Clula vegetal
Biomolculas polifuncionales en base a carbono
 INTERACCIONES NO COVALENTES

Puentes de hidrgeno
Entre grupos neutros

Entre enlaces peptdicos

Interacciones inicas
Atraccin
Repulsin

Interacciones hidrofbicas

Interacciones de Van der Entre tomos en

Waals estrecha proximidad
 Las interacciones no covalentes son ms dbiles que las covalentes, si
se consideran de manera individual.

En una macromolcula, como una protena o un cido nucleico, el conjunto

de interacciones no covalentes que pueden establecerse aumentan
considerablemente la estabilidad de la estructura.

La estructura nativa (ms estable) de una macromolcula es aquella donde

existe la mayor posibilidad de establecerse interacciones no covalentes,
determinando el plegamiento de una cadena polipeptdica o polinucleotdica.

A nivel molecular, las interacciones dbiles entre grupos polares, cargados o

hidrofbicos refleja la complementaridad que debe existir entre una enzima y
su sustrato, o una hormona o neurotransmisor con su receptor celular.
Tanto la enzima como el sustrato presentan molculas ordenadas en sus
alrededores. Al unirse el sustrato a la enzima, se liberan algunas aguas lo
que resulta en un favorecimiento para la formacin del complejo enzima
sustrato.
LAS BIOMOLCULAS Y SU ENTORNO
 PROPIEDADES DEL AGUA

Constituye cerca del 70% en peso de los seres vivos.

Cubre todas las partes de una clula y es el medio donde se

desarrollan el transporte de nutrientes y desechos, las reacciones
bioqumicas catalizadas por enzimas y la transferencia de energa
qumica.

Las fuerzas inmensamente atractivas entre las molculas de agua

dan cuenta de sus propiedades de solvente universal.

Su capacidad de ionizarse tiene importancia en la estructura y

propiedades de las biomolculas.
 ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL DEL AGUA

La estructura tridimensional de la molcula de agua es un tetraedro

irregular (sp3). Los enlaces con el hidrgeno se dirigen hacia dos
esquinas del tetraedro, en tanto que los dos pares de electrones sin
compartir lo hacen hacia las otras dos esquinas.
 El ncleo de O es ms electronegativo que los H por lo tanto
ATRAE CON MAYOR FUERZA A LOS ELECTRONES del enlace
covalente O H :

La molcula de agua adquiere un CARCTER DIPOLAR

ENLACES o PUENTES DE HIDRGENO: interaccin no covalente
que se genera entre un grupo dador y otro aceptor de hidrgenos.
Tipos comunes de puentes de hidrgeno:
Diferentes tipos de puentes de hidrgeno que se
encuentran en biomolculas:
 LA COHESIVIDAD DEL AGUA

La cohesividad (unin) del agua se debe a los puentes de hidrgenos

De la cohesividad depende otras propiedades del agua de gran
importancia para los seres vivos.
Capilaridad
Es un lquido prcticamente incompresible
Elevada tensin superficial del agua
Elevados puntos de fusin (0oC a 1 atm) y ebullicin del agua (100oC a 1
atm)
Elevado calor especfico y calor de vaporizacin
Densidad a 0oC (0'97g/cm3) es menor que a 4oC (1g/cm3)
 HIELO

Cada molcula de agua forma 4 puentes de hidrgeno promedio

 EL AGUA COMO SOLVENTE
Solubilidad de las biomolculas
Son solubles (Hidroflico):
Los iones inorgnicos y orgnicos (grupos
cidos y aminos)
Las molculas polares (alcoholes, tioles,
etc)

Son insolubles (Hidrofbico):

Las molculas apolares (molculas con
muchos C o H)
SOLUBILIDAD DE LOS IONES

Iones positivos o cationes

El agua es un buen disolvente de

los compuestos inicos por ser una
molcula polar.

Iones negativos o aniones

 HIDRATACIN DE SALES

El agua solvata a las sales interaccionando a travs de sus cargas

parciales con los cationes y aniones de la sal.
Comportamiento de las molculas segn su polaridad
 SOLUBILIDAD DE LAS
MOLCULAS POLARES

Glcidos o Carbohidratos Alcoholes

(Glucosa) (Etanol)
 SOLUBILIDAD DE LAS
MOLCULAS APOLARES

cido graso insaturado

Triglicridos
 SUSTANCIAS ANFIPTICAS

Molculas que presentan una parte soluble en agua

(hidroflica) y otra parte insoluble en agua (hidrofbica),

Ejemplo: Lpidos

Fosfoglicridos
Dispersin de lpidos en el agua:
Cada molcula de lpido individual obliga a las
molculas de agua que las rodean a ordenarse
alrededor de ellas.

Agrupacin de las molculas de lpidos:

Slo las porciones de lpidos ubicados en los
bordes de estas agrupaciones fuerzan a unas
pocas molculas de agua a ordenarse,
contribuyendo a un aumento de la entropa del
sistema.

Micelas:
Todos los grupos hidrofbicos son alejados del
agua, la capa ordenada de agua se minimiza,
favoreciendo an ms un aumento en la entropa
del sistema.
 SUSTANCIAS ANFIPTICAS EN
MEDIO ACUOSO

En soluciones acuosas pueden formar:

LAS MEMBRANAS CELULARES SON
BICAPAS LIPDICAS
SOLUBILIDAD DE GASES
 EL AGUA COMO SUSTANCIA REACCIONANTE

Participa en las reacciones de hidrlisis: ruptura de algunos

enlaces covalentes de macromolculas (enlace peptdico,
glicosdico, ster, etc)
Adicin en los dobles enlaces con la formacin de un grupo
funcional alcohol (-OH)
Fotosntesis: repone los electrones que se utilizan en la sntesis
de sustancias orgnicas.
Cadena respiratoria: se forma a partir del O2 como aceptor de
electrones
 IONIZACIN

1 X 10-7 moles (1 mol = 6,023x1023 molculas) de agua

se encuentran disociados en

H2O H+ + OH-
H+ + H2O H30+
 EL pH
El pH se define como el logaritmo con signo negativo de la
concentracin de iones hidrgeno (H+)

pH = - log H+
El pH del agua pura (1 x 10-7 M)ser por lo tanto:

pH = - log 1x 10-7
pH = 7
Los cidos disminuyen el pH debido a que entregan iones
H+ y por lo tanto iones hidronio al medio:

HA + H2O H30+ + A-
Las bases aumentan el pH debido a que captan iones H+ y
por lo tanto disminuyen los iones hidronio del medio:

HOB + H3O+ 2H2O + B+

Si el pH < 7 la disolucin es cida
Si el pH = 7 la disolucin es neutra
Si el pH > 7 la disolucin es bsica
Disociacin de cidos
 pH Y CAPACIDAD TAMPONANTE
DEL ORGANISMO

El pH afecta la estructura y actividad

biolgica de macromolculas. La medicin
de pH de orina (6,5) o sangre (7,4) se usa
en clnica para diagnstico.
 Mxima capacidad amortiguadora
de un sistema tampn

Un tampn o
buffer es una
sistema acuoso
que resiste
pequeos cambios
en su pH cuando
iones H+ o iones
OH- le son
agregados. Est
formado por un
cido dbil y su
base conjugada.
Ejemplo:
cido actico/acetato
Sistemas amortiguadores o tamponantes del pH
fisiolgico:

Sistema bicarbonato: en la sangre: HCO3- / H2CO3

Protenas plasmticas: contribuyen con sus grupos

ionizables.

Hemoglobina: contribuye con sus grupos ionizables.

Sistema fosfato: en el citoplasma: HPO4-2 / H2PO4-1

Protenas plasmticas: albmina, hemoglobina
Sistema bicarbonato en sangre
pH ptimo de algunas enzimas