Sus padres fueron Don Miguel de Gemes Montero y Doa
Mara Magdalena Goyechea y la Corte.
Estudi en Buenos Aires en el Real Colegio de San Carlos y a los catorce aos ingres a la carrera militar. Particip de las invasiones inglesas de 1806 como edecn de Santiago de Liniers. Tras la Revolucin de Mayo de 1810 se incorpor al ejrcito patriota destinado al Alto Per y form parte de las tropas victoriosas de Suipacha. Luego, regres a Buenos Aires y colabor con el sitio de Montevideo. En 1815 volvi a Salta para ponerse al frente de la resistencia a los realistas, organizando el pueblo y militarizando la provincia. El 15 de mayo fue electo Gobernador. En 1817, ante la inminencia de una invasin realista Gemes organiz un verdadero ejrcito popular con el que logr recuperar Humahuaca y defendi la ciudad de Salta. En 1821 el General se enfrentaba a los espaoles, en el norte; y, por el sur, al gobernador de Tucumn aliado a algunos terratenientes salteos.