UNIVERSIDAD PRIVADA SAN JUAN BAUTISTA

FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD

ESCUELA PROFESIONAL DE MEDICINA HUMANA
CURSO: BIOLOGA MOLECULAR
CICLO I SEMESTRE: 2017-I

SEMINARIO # 1

ENLACES QUE GOBIERNAN LA MATERIA VIVA

Las actividades de las clulas se derivan directamente de la actividad de las molculas que
las constituyen. Es imposible entender las funciones de las clulas sin un conocimiento
adecuado de la estructura y las propiedades de los principales tipos de molculas que forman
parte de ellas.

Uno de los objetivos de este tema es suministrar la informacin esencial acerca de los
aspectos qumicos de la materia para poder comprender las bases de la vida. Una breve
exposicin de las bases atmicas y moleculares de los seres vivos resulta una necesidad para
poder comprender los siguientes niveles de organizacin de la materia viva.

Las bacterias, las levaduras, los hongos, los gatos, los perros, los monos, los elefantes, en
fin, todos los seres vivos tienen una gran similitud en su composicin elemental. Si se analizan
las membranas de todos ellos se encontrarn molculas muy semejantes y hasta idnticas
que son parte integrante de las mismas, por solo citar un ejemplo. A continuacin se iniciar
el estudio de los aspectos elementales esenciales de la qumica que permitan comprender los
mecanismos moleculares de organizacin de los seres vivos.

Entre los elementos ms abundantes presentes en los seres vivos estn los tomos de
carbono (C), hidrgeno (H), oxgeno (O) y nitrgeno (N), que llegan a representar ms del 99
% de la composicin del organismo humano. Con tan solo esos cuatro bioelementos, existen
biomolculas tales como monosacridos, polisacridos, cidos orgnicos y cidos grasos,
alcoholes, aminas, triglicridos, colesterol y steres del colesterol, adems de hormonas
esteroides, la mayora de los aminocidos (excepto los dos aminocidos azufrados), algunas
protenas que estn libres de aminocidos azufrados, y una infinidad de metabolitos
intracelulares y extracelulares.

La formacin de cidos nucleicos y sus precursores requiere de otro

bioelemento: el fsforo (P). El P forma parte de aproximadamente el 0,5% de los restantes
bioelementos destacados en la composicin de nuestro cuerpo.

De todo lo anterior se puede destacar que los componentes orgnicos mayoritarios de los
seres vivos requieren de los elementos C, H, O, N, S y P; para constituir los lpidos, los
glcidos o carbohidratos, las protenas y los cidos nucleicos, son necesarios estos seis
elementos qumicos. El resto de los elementos qumicos, aunque pueden estar formando parte
de algunas de esas molculas, presentan destacadas funciones como iones en las clulas. El
cloro (Cl), el potasio (K), el sodio (Na), el calcio (Ca), el magnesio (Mg), etc., son componentes
electrolticos de importancia capital para la regulacin del equilibrio hidro-mineral. No menos
importantes se presentan otros en tan nfimas cantidades que se les consideran
oligoelementos, ms adelante se encontrarn algunos ejemplos de su importancia para
nuestro organismo.

La inadecuada ingestin en la dieta de algunos de los oligoelementos puede tener serias

consecuencias sobre la salud humana. La anemia (condicin en la cual la sangre contiene
menor concentracin de hemoglobina que la normal) microctica es la ms comn de las

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anemias nutricionales y su causa es la falta de hierro (Fe). Tambin la falta de cobre (Cu)
puede provocar este tipo de anemia. La deficiencia de zinc (Zn) ocasiona severos trastornos
en la piel entre otros.

Pero tambin los excesos nutricionales en bioelementos son dainos a la salud. El flor (F),
un elemento tan renombrado para proteger las caries dentales y que se utiliza como aditivo a
las cremas dentales para prevenir las caries, es causante de una enfermedad dental que
motea los dientes de forma desagradable. La fluorosis dental es una condicin que es
provocada por el consumo excesivo de flor durante el periodo de desarrollo dentario, desde
el nacimiento hasta los 6-8 aos de edad.

CONCEPTO DE BIOMOLCULAS

Las biomolculas son las molculas orgnicas que forman parte de los seres vivos, con
diversos grados de complejidad, desde muy simples hasta muy complejas. Una caracterstica
esencial de las biomolculas orgnicas es su gran diversidad, a pesar de tener en su
composicin un nmero relativamente pequeo de elementos qumicos (ms frecuentes C, H,
O, N, y otros dos en menor proporcin, el P y el S). Estos elementos qumicos integran la
mayora de los compuestos orgnicos al unirse entre s mediante uniones que se estudiarn
a continuacin.

LA COMBINACIN DE TOMOS Y LAS FUENTES DE ESTABILIDAD

A) EL ENLACE COVALENTE

Los tomos que constituyen una molcula se mantienen unidos por enlaces covalentes. Este
tipo de enlace se genera cuando los pares de tomos que se
unen comparten pares de electrones. Las biomolculas deben su estabilidad a los enlaces
covalentes que mantienen los tomos adyacentes unidos. Pero adems, muchos de los
procesos biolgicos que ocurren en la clula viva se producen por ruptura o formacin de
algunos de estos enlaces covalentes.

Los tomos de cada elemento qumico tienen un nmero de protones en el ncleo, lo cual se
corresponde con su nmero atmico, y un nmero equivalente de electrones en la envoltura.
Estos electrones ocupan los orbitales, que se caracterizan por un estado energtico permitido,
que se seala con un nmero, el nmero cuntico principal, y con una letra (s, p, d) que
corresponde al orbital. En cada orbital pueden estar slo 2 electrones de spin opuesto. En el
caso de! tomo de carbono, que tiene nmero atmico 6, existen 6 electrones que deberan
ocupar esos orbitales con una distribucin 1s2 2s2p2.

Pero en el caso particular del C no ocurre as y se originan 4 orbitales hbridos entre el 2s y

los 2p, denominados sp3, que se dirigen hacia los vrtices de un tetraedro. Cada uno de estos
orbitales sp3 contiene ahora un electrn que puede ser compartido, por ejemplo, con un orbital
1s de un tomo de hidrgeno, y formar el metano CH4, mediante enlaces covalentes sencillos
o simples. Asimismo, en el caso del C se pueden hibridizar los orbitales 2s con slo dos de
los 2p y dar lugar a un orbital hbrido sp2.

El enlace covalente es un enlace fuerte, estable en medio acuoso. Un enlace C-C simple,
donde se comparten 2 electrones, uno por cada tomo de carbono, tiene una energa de
enlace de 85 kcal/mol (356 kJ/mol), lo que significa que una alta cantidad de energa debe ser
suministrada para romper esa unin.

Un enlace covalente doble, por ejemplo C=O, tiene una energa de 175 kcal/ mol (732 kJ/mol).
Entre los enlaces covalentes que se pueden presentar se destacan los siguientes:
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 EnIace Energa (kJ/mol)

H-H 436
C-H 414
C-C 343
C-O 351
C-N 292
O-H 460
N-H 393
C=O 686

La orientacin precisa de los enlaces covalentes es la base de la geometra tridimensional de

las molculas orgnicas. Finalmente, debemos destacar que como resultado de la formacin
de enlaces covalentes entre los tomos surgen los grupos funcionales que caracterizan a
familias de sustancias. En la seccin final se estudiarn las agrupaciones atmicas ms
frecuentes encontradas en las biomolculas y que se denominan grupos funcionales.

Polaridad del enlace covalente. En las molculas formadas por tomos iguales unidos a
grupos similares los electrones se comparten de manera simtrica, pero en molculas como
el H2O, con tomos que poseen diferente electronegatividad, o en molculas con tomos
iguales pero unidos a grupos diferentes, el compartimiento del par electrnico es desigual y
un tomo, el ms electronegativo, atrae ms fuertemente el par electrnico que el otro tomo,
adquiriendo el primero una fraccin de carga negativa y el segundo positiva. Un enlace de
este tipo es polar, para distinguirlo del enlace, por ejemplo la molcula de H2, que es apolar.

En el caso ms simple, una molcula formada por 2 tomos de diferente electronegatividad y

un enlace polar, esa molcula constituye un dipolo elctrico, con un momento dipolo u (u = q
X 4 donde q es la carga y d la distancia entre los centros de carga opuesta). A consecuencia
del momento dipolo las molculas tienden a orientarse en un campo elctrico y a interactuar
favorablemente unas con otras si ambas son polares. Por el contrario estas molculas no
interactan bien con las apolares; esa es la razn por ejemplo de que el etanol, que es una
sustancia formada por molculas polares se disuelve bien en agua que tambin es
polar, mientras que las grasas (triacilglicridos) que es una sustancia apolar no. Una regla
muy simple es que lo polar tiene afinidad por lo polar y lo apolar por lo apolar.

b) El enlace inico. Las fuerzas de atraccin que mantienen juntos a los tomos en los
compuestos son visibles en los enlaces de tipo inico, siendo el resultado de la transferencia
neta de uno o ms electrones de un tomo o grupo de tomos a otro.

Es necesario que para que pueda darse un enlace inico uno de los tomos pueda ceder
electrones y por el contrario el otro pueda ganar electrones, es decir, se produce la unin entre
tomos que pasan a ser cationes y aniones. Este tipo de enlace generalmente se produce
entre un elemento metlico (electropositivo) y elemento no metlico (electronegativo). En
ausencia de agua, las fuerzas inicas son muy fuertes.

La existencia de enlaces inicos dar formacin a compuestos inicos. Los iones al poseer
cargas elctricas pueden:

tener ms electrones que protones, estar cargados negativamente: son los aniones.

tener menos electrones que protones, estar cargados positivamente: son los cationes.

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 Tabla. Iones monoatmicos y poliatmicos.

IONES MONOATMICOS IONES POLIATMICOS

CATIONES ANIONES ANIONES
Zn2+ Br- NO2-
Mg2+ O2- SO42-
K + N3- MnO4-
Ca2+ S2- HPO42-

B) LAS INTERACCIONES DBILES

Entre las biomolculas se pueden establecer interacciones dbiles o fuerzas no covalentes

que desempean un papel muy importante en numerosos e importantes fenmenos que
ocurren en las distintas formas de materia viva. Ejemplo de esto se pueden encontrar en los
procesos de reconocimiento molecular, en la morfo-estructuracin de las macromolculas, en
los proceso de flujo de la informacin gentica, en la transmisin de seales entre las clulas
y otras:

a) Las interacciones electrostticas. Esta interaccin se establece

entre tomos o grupos de tomos con carga elctrica neta (enlaces inicos ya descritos) como
entre grupos parcialmente cargados de molculas polares. Si son de la misma carga se
repelen y si son de carga contraria se atraen. En el medio acuoso de la clula muchas
biomolculas poseen agrupaciones atmicas que pueden ionizarse y adquirir carga positiva
o negativa, y es posible as que se establezcan interacciones electrostticas entre partes de
la misma biomolcula o entre biomolculas diferentes. La fuerza (F) o intensidad de este tipo
de interaccin en una disolucin est dada por la ley de Coulomb.

F= q1q2

r2

Donde, F es la fuerza, q1 y q2 son las cargas sobre los dos tomos, r la

distancia entre esos tomos, la constante dielctrica del medio. Para una disolucin acuosa,
la constante dielctrica del H2O es muy elevada, tiene un valor de 80, por lo tanto la fuerza
(energa) de la interaccin electrosttica de dos tomos que estn por ejemplo a una distancia
de 0.3 nm (3 ngstrom) es, aplicando esta frmula, solamente de 1.4 kcal/mol (5.9 kJ/mol).
Por lo tanto, en medios acuosos las interacciones electrostticas son dbiles.

b) El enlace de hidrgeno. Los puentes de hidrgeno se producen cuando un tomo de

H unido covalentemente a un tomo electronegativo ( generalmente O o N) se halla prximo
y se enlaza a otro tomo electronegativo. Aunque tambin es una interaccin dbil, el puente
de hidrgeno es crucial en el mantenimiento de la estructura espacial de macromolculas
como las protenas y el ADN. Esta interaccin adems es responsable de muchas de las
propiedades del H2O (como solvente por ejemplo). En realidad el puente de hidrgeno tambin
se establece por una interaccin electrosttica. En un enlace covalente entre un tomo de H
y otro muy electronegativo, como el O o el N, los electrones no se comparten equitativamente
y son ms atrados hacia el tomo electronegativo. Se crea as una pequea carga negativa
sobre el O o el N, y una pequea carga positiva sobre el H. Esta carga positiva pequea puede
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a su vez interactuar con otro tomo electronegativo de otra molcula o de la misma molcula
y as formarse el puente de H.

De igual forma, esta interaccin es mucho ms dbil que un enlace covalente. La energa de
esta interaccin es de slo 1.3 kcal/mol (4.13 kJ/mol), comparada con unas 100 kcal/mol
aproximadamente del enlace covalente. Los puentes de hidrgeno ms fuertes se establecen
cuando los 3 tomos se encuentran en una lnea recta. Tngase en cuenta que en una
macromolcula como el ADN se establecen miles de estas interacciones, de ah su
importancia como fuerza estabilizadora en sta y otras biomolculas.

c) Las interacciones de Van der Waals. Denominadas as en honor del cientfico que las
descubri, las interacciones de Van der Waals se originan porque la distribucin electrnica
alrededor de los tomos vara con el tiempo. En cada instante la distribucin electrnica
alrededor de un tomo no es simtricamente perfecta y, como los electrones tienen una
pequea carga negativa, se puede originar alrededor del tomo un pequeo dipolo elctrico y
esta asimetra elctrica puede inducir en tomos vecinos una asimetra complementaria, de
tal manera entonces que los tomos se atraen. La atraccin entre los dos tomos aumenta a
medida que estos se acercan, hasta una cierta distancia llamada distancia o radio de Van
der Waals, si se acercan ms se genera entonces una fuerte repulsin entre esos tomos
porque los orbitales electrnicos se solapan. La energa asociada con esta interaccin es muy
pequea, entre 0.5 a 1.0 kcal/mol por par de tomos. Si las superficies de contacto entre dos
biomolculas son extensas la fuerza neta de este tipo de interaccin puede ser significativa.

d) Las fuerzas hidrofbicas. Estas interacciones se producen cuando molculas apolares

se encuentran disueltas en un medio acuoso, es decir, rodeadas de molculas polares como
el H2O. En esas condiciones las molculas apolares tienden a agruparse entre s,
separndose del H2O, cumplindose as la segunda ley de la termodinmica, que establece
que la entropa total de un sistema ms su entorno siempre tiende a aumentar en los procesos
espontneos. Al agregarse las molculas apolares y separarse de las molculas de agua,
estas ltimas adquieren una mayor libertad de movimiento y un mayor desorden o entropa.

LOS PRINCIPALES GRUPOS FUNCIONALES:

Las biomolculas se caracterizan por presentar agrupaciones atmicas o grupos funcionales,

de los cuales dependen muchas de sus propiedades fisicoqumicas. Entre estos grupos
funcionales se pueden distinguir los que se muestran en la tabla.

Principales grupos funcionales presentes en las biomolculas

Grupo
Representacin Principales propiedades
funcional

Grupo funcional caracterstico de los alcoholes. En forma

Hidroxilo -OH abreviada R-OH. Puede aparecer en otras biomolculas
diferentes de los alcoholes.

Si la funcin carbonilo se encuentra

en un carbono primario es el compuesto es un aldehdo
Carbonilo C=O (R-CHO); si se encuentra en un carbono secundario
(carbono unido a otros 2 carbonos) es una cetona
. (R-CO-R).

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 Grupo que caracteriza a los cidos orgnicos. Este grupo
-COOH
Carboxilo le confiere carcter cido a las biomolculas que lo poseen
.
al disociarse:
R-COOH < - > R-COO- + H+

Se comporta este grupo corno una base, aceptando con

Amino -NH2
facilidad H+ del medio:

R-NH2 + H+< - > R-NH3+

Amida -CONH2
El grupo hidroxilo de los cidos carboxlicos es desplazado
por un amino.

Se conoce tambin como tiol.

Sulfhidrilo
-SH
Dos grupos sulfhidrilo pueden reaccionar entre s para
formar un enlace disulfuro, frecuente en las protenas.

Agrupaciones atmicas derivadas. Los grupos funcionales son capaces de reaccionar entre
s y originar nuevas agrupaciones atmicas, las cuales tienen mayor complejidad. Algunas
biomolculas presentan estos tipos de agrupaciones:

- Hemiacetales. En la formacin de este enlace se produce una reorganizacin de los tomos.

A los hemiacetales (o hemicetales si el carbonilo era de una cetona) pertenecen por ejemplo
las formas cclicas de los monosacridos.

- Acetales. Se forman al reaccionar el hidroxilo de los hemiacetales (o hemicetales) y otro

OH, con formacin de una molcula de agua. Tambin el hidroxilo de un hemiacetal puede
reaccionar con un amino (o imino) y formar un enlace N-acetal, como es por ejemplo el enlace
N-glicosdico que une a las bases nitrogenadas con el azcar en el caso de los nucletidos y
nuclesidos.

- steres. Los steres se forman al reaccionar un cido con un alcohol, con prdida de una
molcula de agua. Se analizarn los tipos de steres por su importancia en la constitucin
de algunas biomolculas.

. ster carboxlico. Formado entre un grupo COOH y un OH.

. ster fosfrico. Se forma al reaccionar un cido fosfrico con un alcohol.

Es posible que un ster fosfrico ya formado reaccione con otro grupo OH para formar un
enlace fosfodister, como es por ejemplo el que une a los nucletidos para formar las
molculas de los cidos nucleicos.

. Tioster. Un tioster se forma cuando reacciona un grupo carboxilo con un grupo sulfhidrilo
SH. Algunas biomolculas con enlace tioster son compuestos muy importantes en el
metabolismo celular. Este enlace es tambin importante porque al hidrolizarse libera gran
cantidad de energa til para muchos procesos.

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- Amidas. Se forman al reaccionar un grupo carboxilo (COOH) con un amino
(NH2). Este tipo de enlace qumico para formar esta agrupacin atmica es el que permite la
unin de los aminocidos para formar los pptidos y las protenas

- Anhdrido de cido. Un anhdrido de cido se forma cuando reaccionan cidos que pueden
ser iguales o diferentes, con prdida de una molcula de agua Los anhdridos del
cido fosfrico desempean un papel extraordinario en la conservacin y liberacin de la
energa qumica en la clula.

La multifuncionalidad. Resulta un hecho notable que en una misma biomolcula se pueden

encontrar varios grupos funcionales, en ocasiones el mismo tipo de grupo funcional y otras
veces grupos funcionales distintos. Ms adelante se ver cmo los monosacridos, los
nucletidos, los aminocidos y los cidos grasos presentan este fenmeno de la
multifuncionalidad. Esta propiedad de la mayora de las biomolculas hace mucho ms
diversa la existencia de la materia orgnica, as como la forma en que muchas partes de ellas
pueden interactuar por medio de atracciones o repulsiones. As por ejemplo un alcohol
importante en el metabolismo de los lpidos (un polialcohol) como es el glicerol o glicerina
(propanotriol) presenta tres grupos hidroxilos.

La molcula del aminocido, como por ejemplo la glicina, presenta dos grupos funcionales
diferentes, en la que puede observarse la presencia de un grupo amino y otro carboxilo.

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