Curso de Biotecnología Ambiental-Epg 2016 - MRJ Parte I

BIOTECNOLOGA AMBIENTAL | Curso MRJ-Enero 2016
TEMA 01. BIOTECNOLOGIA Y GESTION AMBIENTAL. Perspectiva histrica.

Objetivos y aspectos generales de la biotecnologa. Aplicaciones actuales y
futuras de la biotecnologa ambiental.
OBJETIVOS:
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Conocer los aspectos generales e histricos ms importantes de la

biotecnologa en general.
Definir los trminos generales de la biotecnologa ambiental.
Conocer las aplicaciones y usos de la biotecnologa ambiental moderna.
INTRODUCCIN:
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Segn el Convenio sobre Diversidad Biolgica de 1992, la biotecnologa se define

como "toda aplicacin tecnolgica que utilice sistemas biolgicos y organismos
vivos o sus derivados para la creacin o modificacin de productos o procesos
para usos especficos".
La biotecnologa, base de la nueva revolucin industrial, abarca una serie de

procesos biolgicos, lo que implican el uso de organismos vivos (plantas, animales
o microorganismos), los verdaderos protagonistas de la biotecnologa, para
fabricar un producto que van desde combustibles a medicinas, pasando por
plsticos, alimentos, vacunas, recursos minerales, etc. Millones de aos de
evolucin les ha preparado para ello.
A la biotecnologa tambin la podemos definir como el conjunto de actividades
humanas que aplican principios cientficos y de ingeniera para la transformacin
de materiales por accin de agentes o sistemas biolgicos (microorganismos,
enzimas, clulas eucariotas) con el fin de proveer bienes y servicios a la sociedad.
Aunque no siempre es fcil encontrar el sistema biolgico adecuado para producir

un determinado producto, la biotecnologa moderna es capaz de crear ese sistema
ya que cuenta con una poderossima herramienta, la ingeniera gentica, y en
muchas ocasiones, la propia biotecnologa se confunde con ella. Ms all de los
productos, la biotecnologa provee metodologas (herramientas) para el desarrollo
socieconmico sostenible, sobre todo aquellas que respetan el medio ambiente y
permiten preservar los recursos naturales.
CURSO MRJ-ENERO 2016 1

Los productos biotecnolgicos son muy comunes en nuestra vida diaria. Los ms
conocidos y comercializados son los que se asocian a la salud: insulina, linfocinas,
interfern, hormona del crecimiento, eritropoyetina, factores de coagulacin
sangunea, mltiples vacunas, antibiticos, vitaminas, etc. Pero tambin hay
insecticidas, combustibles renovables, cultivos resistentes, plantas y animales
mejorados en su produccin, colorantes, alimentos para ganado, sistemas de
control de la contaminacin, etc.
La biotecnologa actual tiene sus races histricas en el nacimiento de la ciencia

moderna (siglo XVII) hasta sus aplicaciones industriales durante el siglo XX. Al
siglo XVII corresponden la generacin de nuevos conocimientos y el
descubrimiento de muchos principios matemticos y fsicos (p.e. el clculo
diferencial, el clculo de probabilidades y la ley de la gravitacin universal de
Newton), que fueron de la mano con la aparicin de los primeros microscopios
(con las primeras descripciones microbianas de Leeuwenhoek) y de otros inventos
(p.e. el barmetro de mercurio, el manmetro y las primeras calculadoras). En el
siglo XVIII se destaca la revolucin de la qumica, con la aparicin de las primeras
tablas de elementos y reacciones qumicas, la teora atmica de Robert Boyle, el
estudio de la combustin por G.E. Stahl, la qumica newtoniana y el desarrollo de
la teora atmica. En esta poca tambin se desarrollaron la matemtica y la fsica
ilustradas (electricidad y magnetismo) as como la taxonoma biolgica de Kar von
Linneo.
Figura 1: A. Leeuwenhoek y sus primeras descripciones bacterianas (izquierda)

En el siglo XIX Gay-Lussac descubre la Ley de dilatacin de los gases, J. Wilhelm

Ritter descubre la radiacin UV y Henri Becquerel descubre la radioactividad. En
biologa y microbiologa, este siglo es crucial, Luis Pasteur desarrolla la Teora
Microbiana de la Enfermedad y descubre los principios microbianos de la
fermentacin. En este siglo las ciencias biolgicas avanzaron rpidamente debido
a la convergencia de tres eventos: La Teora Celular que estableci que las
clulas son bloques con los que se construye la vida, la Teora del Gen que
clarific las leyes que gobiernan los rasgos que pasan de una generacin a otra
(Gregor Mendel elabora la Teora de la Herencia y August Weismann establece la
Teora Cromosmica de la Herencia) y la Teora Evolutiva Darwiniana que explic
el origen de las especies a travs de la seleccin natural (Charles Darwin publica
El origen de las especies y El origen del hombre y la seleccin natural).
En la primera mitad del siglo XX, Albert Einstein da a conocer su Teora General
de la Relatividad y su Teora General de la Gravitacin. En 1917, Karl Ereky acua
el trmino biotecnologa como parte de un plan extenso que condujera a una
sociedad atrasada hacia la edad de la agricultura industrial. La biotecnologa
surge como alternativa centrada en la vida frente a la industria qumica que estuvo
contaminando el aire y el agua. Rachel Carson publica Primavera silenciosa
donde plantea el control biolgico de plagas, como la solucin a los problemas
ambientales y de la salud causado por los pesticidas qumicos.
La biotecnologa contempornea, con la microbiologa como componente principal
de la industria biotecnolgica, se desarroll gracias a los avances en gentica y
biologa molecular que le dio grandes poderes sobre el mundo viviente.
Actividades claves como el aislamiento, identificacin, multiplicacin, almacenaje y
creacin de genes a travs de la Ingeniera Gentica dio lugar a los organismos
genticamente modificados (GMOs).
Biotecnologa
Figura 2. Diferentes avances en biologa dieron pie a la aparicin de la

biotecnologa moderna.

Los eventos ms importantes en biologa molecular que dieron impulso a la

biotecnologa fueron: en 1953 Watson & Crick plantean la estructura helicoidal y
doble cadena del ADN, en 1959, Severo Ochoa y Arthur Kornberg sintetizan
cidos nucleicos, luego F. Jacob y J. Monod determinan la funcin gentica del
ADN y el ARN. Para 1973 ya se haba desarrollado la Tecnologa del ADN
recombinante por Herbert Boyer y Stanley Cohen, permitiendo en 1982 la
produccin de insulina humana en bacterias genticamente modificadas. En 1984,
Kary Mullis perfeccion la reaccin en cadena de la polimerasa para amplificar un
pequeo fragmento de ADN en millones de copias; luego se logr determinar el
orden de los nucletidos mediante las tcnicas de secuenciacin y se crearon
nuevas herramientas como la hibridacin. La bioinformtica tambin tomo impulso
y permiti la creacin de banco de genes para el mapeo del ADN y protenas de
muchos organismos. Todo esto ha dado lugar a la Biologa Sinttica y la Ingeniera
Metablica de microorganismos, herramientas fundamentales en la biotecnologa
moderna actual.
Figura 3. Watson y Crick y la estructura helicoidal del ADN

OBJETIVOS DE LA BIOTECNOLOGA: en general, la literatura los agrupa de la
siguiente manera, considerando que el mayor desarrollo de esta tecnologa se da
en pases desarrollados.
Produccin de alimentos: granos transgnicos (maz y soya) resistentes a

pesticidas y herbicidas.
Salud ambiental (biotecnologa ambiental): tratamiento biolgico de
contaminantes y residuos, y tcnicas de biorremediacin para ecosistemas
contaminados.
Produccin de materiales: algodn transgnico
Salud humana: medicamentos transgnicos (insulina, hormona del
crecimiento)
Seguridad y defensa nacional: armas biolgicas (ntrax)

BIOTECNOLOGA AMBIENTAL:
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La International Society for Environmental Biotechnology (ISEB) define a la
Biotecnologa Ambiental (BA) como la "Integracin de la ciencia y la ingeniera
para el desarrollo, el uso y la regulacin de los sistemas biolgicos para el
tratamiento y restauracin de los ambientes contaminados (suelo, aire y agua) y
para el desarrollo de procesos amigables ambientalmente (tecnologas verdes y
desarrollo sostenible)".
La BA abarca al conjunto de actividades biotecnolgicas que permiten comprender
y gestionar los sistemas biolgicos del medio (ambiente) a fin de proveer
productos y servicios a la sociedad. En el mundo actual, fundamentalmente, la BA
debe garantizar la sostenibilidad de dos recursos: el agua y la energa.
Si bien varios sistemas biolgicos pueden ser utilizados en la BA, la utilizacin de
microorganismos es la ms extendida, ya que se pueden gestionar para dar
diferentes servicios a la sociedad. Estos servicios van desde la eliminacin de la
toxicidad de los contaminantes presentes en el agua, el suelo, los sedimentos y
los lodos hasta la recuperacin de recursos a partir de residuos. Al mismo tiempo,
tambin se pueden utilizar para convertir en valor energtico diferentes tipos de
biomasa desde su forma difusa, y en algunos casos peligrosa como son los
residuos slidos, en formas de energa utilizables directamente por la sociedad
como el biogs (metano y dixido de carbono) y el hidrgeno.
Los microorganismos son capaces de desarrollarse adaptndose a prcticamente
cualquier medio. As, hay microorganismos que pueden soportar altas dosis de
radiactividad como la que hay en las centrales nucleares donde se almacena el
combustible nuclear gastado u otros que viven en ambientes con una
concentracin elevada de arsnico. Para su crecimiento necesitan una fuente de
alimentacin, que como cualquier ser vivo est basada en el carbono y una fuente
de energa. La obtencin de energa se realiza a nivel celular mediante un
intercambio de electrones en el que se requiere una especie capaz de ceder a los
electrones una especie capaz de aceptarlos. Este proceso tan sencillo, y a la vez
tan complicado, se aprovecha en la BA para poner los microorganismos al servicio
de la lucha contra la contaminacin con el objetivo de transformar sustancias
peligrosas (contaminantes) en sustancias inocuas o menos peligrosas ya que los
contaminantes servirn como fuente de carbono, donador de electrones o
aceptador de electrones.
Entre los contaminantes donadores de electrones estn los hidrocarburos del
petrleo, la materia orgnica biodegradable y el amonio que los microorganismos
aerobios podrn convertirse en dixido de carbono y nitrato. Por otra parte, si los

contaminantes son aceptores de electrones (como el cromado, el arseniato o el

uranil) pueden ser transformados, en medio anaerobio, en especies qumicas con
menor movilidad en el medio ambiente, y si los contaminados son sustancias
txicas (como los disolventes organoclorados) pueden ser convertidos en especies
menos txicas.
Estos procesos se han aplicado desde hace tiempo a la depuracin de aguas
residuales tanto urbanas como industriales con el objetivo principal de disminuir la
concentracin de materia orgnica, eliminar compuestos orgnicos recalcitrantes,
eliminar metales pesados o txicos y reducir o eliminar nutrientes y organismos
patgenos. Otro campo de aplicacin ha sido la depuracin de gases
contaminados con compuestos orgnicos voltiles o compuestos inorgnicos de
azufre y amonio, responsables, la mayora de ellos, de los olores asociados, por
ejemplo, depuradoras de aguas y vertederos.
Otro campo de actuacin importante es la aplicacin de la BA en suelos

contaminados y aguas subterrneas para tratar diferentes contaminantes como
hidrocarburos del petrleo, hidrocarburos aromticos policclicos, disolventes
organoclorados, metales y nitratos. Estas actuaciones se pueden llevar a cabo in
situ, es decir, sin remover ni extraer el suelo contaminado el agua subterrnea, o
ex situ, haciendo el tratamiento en instalaciones especficas. Las barreras pasivas
reactivas estimulacin de los microorganismos con fuentes externas de carbono
son ejemplos de tratamientos in situ, mientras que la tecnologa de las biopilas,
que consiste en favorecer los procesos biolgicos en pilas de suelo contaminado,
es un ejemplo de tratamiento ex situ.
Para alcanzar estos objetivos y mejorar las aplicaciones y el uso de la BA, la
incorporacin de nuevas herramientas es de vital importancia. En primer lugar,
cabe destacar la biologa molecular que permite conocer los microorganismos
involucrados, los procesos y la relacin entre los microorganismos y el medio. As,
tcnicas como la PCR deben permitir avanzar en el conocimiento microbiolgico
aplicado. En segundo lugar, la modelizacin matemtica de los procesos
biolgicos debe ser utilizada para el diseo de nuevas tecnologas y nuevas
aplicaciones para la industria. Finalmente, el anlisis del ciclo de vida debe servir
para cuantificar la mejora ambiental de los nuevos procesos biotecnolgicos desde
el punto de vista de utilizacin de recursos y de impacto en el medio.
En definitiva, la BA es una disciplina que requiere un equipo multidisciplinar que

debe caminar con el fin de mejorar los procesos industriales para reducir los
recursos utilizados de materia y energa y minimizar la generacin de residuos no
aprovechables evitando al mximo la impacto del hombre en el medio. Todo ello, a
partir de sistemas biolgicos al servicio de la sociedad.

OBJETIVOS DE LA BA: son principalmente:
Mitigacin de la polucin y eliminacin de residuos

Monitoreo de la salud ambiental (contaminacin ambiental)
Produccin de energa y materiales ambientalmente amigables.
AMBITOS DE ACCIN Y ENFOQUES DE LA BA: los mbitos son
fundamentalmente dos:
Gestin del ambiente: gestin de los recursos microbianos (conocimiento

de los principios para un mejor manejo de los genes y funciones biolgicas).
Aprovechamiento adecuado de los recursos naturales.
La gestin ambiental implica acciones para prevenir, mitigar o eliminar

compuestos contaminantes del ambiente, empleando herramientas o tratamientos
biolgicos (con bajo costo y menor alteracin del medio) cuyo principio bsico
comn es la degradacin de compuestos orgnicos en compuestos inorgnicos
mediante la actividad metablica de los (micro) organismos presentes en los
ecosistemas naturales.
A su vez, la biodegradacin microbiana, tiene dos enfoques: el primero, basado en

el conocimiento y manejo de la microbiologa clsica, implica el aislamiento,
identificacin y puesta a prueba de cultivos microbianos puros (cepas), con
importantes desventajas; y el segundo enfoque fortalecido por la aparicin y los
avances de la ecologa microbiana y la metagenmica que han dado lugar al uso
de consorcios microbianos cada vez ms complejos y verstiles.
Al mismo tiempo, las experiencias derivadas de la biotecnologa ambiental facilitan

el estudio de los ecosistemas en la ecologa microbiana, para seguir aportando
nuevos avances conceptuales y nuevas metodologas y tcnicas que la
biotecnologa ambiental podr considerar de nuevo para sus aplicaciones y que le
permiten avanzar conceptualmente y desarrollar nuevas metodologas.
REFERENCIAS:
__________________________________________________________________
Gerben J Zylstra and Jerome J Kukor. What is environmental biotechnology? Current Opinion in
Biotechnology 2005, 16:243245.
Anicet R. Blanch. Biotecnologa ambiental. Aplicaciones biotecnolgicas en la mejora del medio

ambiente. Nota deconomia 97-98. 3.er cuatrimestre 2010.
Briggie, A. Biotechnology. Encyclopedia of Applied Ethics (Second Edition). 2012: 300-308.

TEMA 02. CARACTERSTICAS GENERALES DE MICROORGANISMOS.

Diversidad microbiana. Nichos microbianos. Microrganismos en su ambiente natural.
Sistemas biolgicos.
OBJETIVOS:
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Conocer las caractersticas generales ms importantes de los
microorganismos y de inters en la biotecnologa.
Conocer los diferentes tipos microbianos segn las caractersticas que
definen la diversidad microbiana y los nichos microbianos.
INTRODUCCIN:
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Hace trescientos aos Antonie van Leeuwenhoek observ por primera vez en un
microscopio primitivo unos pequeos animculos que ahora se conocen como
microorganismos. Los microorganismos son los seres ms primitivos y numerosos
que existen en la Tierra, colonizan todo ambiente: suelo, agua y aire, participan de
forma vital en todos los ecosistemas y estn en interaccin continua con las
plantas, los animales y el hombre. Los microorganismos son clave para el
funcionamiento de los sistemas biolgicos y el mantenimiento de la vida sobre el
planeta, pues participan en procesos metablicos, ecolgicos y biotecnolgicos de
los cuales dependemos para sobrevivir y enfrentar los retos del futuro. Estos retos
son gigantescos para la continuidad de la vida, en particular, para satisfacer la
demanda de alimentos y medicamentos y resolver problemas ecolgicos y de
contaminacin ambiental. En otras palabras, parte de la actividad biolgica
esencial que permite la vida depende de los microorganismos.
Los microorganismos participan en muchos procesos bioqumicos asociados al
funcionamiento de los ecosistemas. Son los principales responsables de la
descomposicin de la materia orgnica y del ciclaje de los nutrientes (carbono,
nitrgeno, fsforo, azufre, etc.). Por ejemplo, en el ciclo del nitrgeno intervienen
bacterias simbiticas de los gneros Rhizobium y Frankia, y bacterias de vida libre
como Azotobacter, Azospirillum, Burkholderia, Thiobacillus, incluso cianobacterias
como Anabaena y Nostoc.
A pesar de su importancia y de los servicios ambientales que podran ofrecerse a
travs de la biotecnologa, los microorganismos son poco conocidos en los pases
megadiversos como el nuestro, ya que la investigacin microbiolgica es an
incipiente comparada con la que realizan pases desarrollados. En esos pases la
diversidad microbiana (escaza) es fuente de nuevos productos y de altas
ganancias provenientes de los diversos tipos de aplicaciones biotecnolgicas que
han generado con la investigacin y gestin microbiolgica.

CARACTERSTICAS GENERALES DE LOS GRUPOS MICROBIANOS

Los microorganismos se agrupan en dos categoras: procariotas y eucariotas. En
la primera estn las archaeas y las bacterias (eubacterias), mientras que en la
segunda se encuentran hongos, algas y protozoos. Adems, de manera
convencional los virus y priones tambin pueden ser considerados microbios.
CLASIFICACION DE LOS MICROORGANISMOS
A) Microorganismos con organizacin celular Procariotas Archaeas
Eubacterias
- Poseen membrana celular
- Tienen como cidos nucleicos tanto Cianobacterias
ADN como ARN. Eucariotas Hongos microscpicos
Algas microscpicas
Protozoos
B) Microorganismos sin organizacin celular Virus
Viroides
- No poseen membranas
- Nunca estn presentes los dos cidos nucleicos juntos (ADN o ARN). Priones
- Son parsitos estrictos de los que tienen organizacin celular, pues carecen
de metabolismo.
PROTOZOOS
La palabra protozoo significa " animal pequeo y representa a un amplio conjunto
de microorganismos unicelulares, que segn algunos zologos forman el Phylum
Protozoa considerados como la forma ms antigua de vida animal. Son
organismos que al estar formados por una sola clula, poseen la estructura tpica
de una clula eucaritica animal, aunque en ocasiones presentan una mayor
complejidad en su organizacin. Tienen una membrana plasmtica que los rodea y
delimita, algunos forman un caparazn duro, calizo o silceo, o bien una fina
envoltura de quitina. Constituyen un grupo heterogneo de unos 25.000
organismos de estructura celular tpica, con diferencias notables en dimensiones y
formas. Muchas especies se comportan de manera semejante a animales
minsculos con capacidades metablicas (se alimentan de bacterias, algas y otros
protozoos) y de reproduccin.
Son de dimensiones microscpicas variables entre las 10 micras y varios
milmetros. Su interior celular est diferenciado por el ncleo, donde se aloja el
material gentico y el citoplasma. El cuerpo de estos organismos puede estar
formado por una sola clula o por una colonia de clulas iguales entre s, es decir,
aunque sean unicelulares se reconocen como organismos completos en cuyas
estructuras se llevan a cabo todas las funciones propias de animales
multicelulares. Se suelen reproducir por segmentacin (biparticin simple) donde
cada clula da lugar a dos clulas hijas, que a veces pueden intercambiar material
gentico; aunque algunos tienen otras modalidades e incluso se conocen
procesos de reproduccin sexual.

Los protozoos son primariamente acuticos y viven en el agua dulce o salada, en

pequeas lagunas o en los ocanos. Estn presentes como depredadores de las
bacterias en los lodos activados para el tratamiento de aguas residuales,
principalmente los de los grupos ciliados (Ciliophora), flagelados (Mastigophora) y
rizpodos (Sarcodina). La actividad de los protozoos contribuye significativamente
a la reduccin de la DBO. Algunos viven en el suelo hmedo arrastrndose en la
capa de agua que rodea a cada partcula del suelo. Algunos son parsitos que
viven en lquidos orgnicos como la sangre (Apicomplexa) o tisulares vegetales.
Algunos absorben el alimento a travs de sus membranas celulares. Otros, como
las amibas, rodean el alimento y lo engullen. Otros tienen aberturas llamadas
poros bucales, con los cuales barren el alimento. Todos los protozoarios digieren
su alimento dentro de compartimientos similares a estmagos llamados vacuolas.
Algunos pueden capturar y deglutir organismos mayores en tamao.
Se pueden clasificar segn su capacidad de movimiento; algunos se impulsan
agitando estructuras llamados flagelos (pelos largos). Otros, como el protozoario
Loxodes, nadan batiendo proyecciones similares a pelos cortos llamados cilios en
un patrn rtmico similar al que produciran muchos minsculos remos. Otros
tienen locomocin mediante seudpodos y otros son ssiles (sin desplazamiento
propio, independiente).
Figura 4. Principales grupos (Phylum) de protozoos.

LOS PROTOZOOS EN LA DEPURACIN DE AGUAS RESIDUALES

Los protozoos son considerados como bioindicadores del estado de
funcionamiento de las depuradoras de aguas residuales, destacando en la
deteccin y prevencin de variaciones en la continuidad de los procesos. Son los
principales consumidores de las poblaciones bacterianas en los sistemas
acuticos e intervienen en la formacin de cogulos sedimentables, siendo
fundamentales en los sistemas de depuracin biolgica de las aguas residuales.
El metabolismo de los protozoos es la base de su actuacin en la depuracin de
las aguas; primero por el consumo directo de materia orgnica disuelta en el agua
y de las poblaciones bacterianas que se desarrollan en el medio, lo cual provocar
posteriormente la formacin de flculos: acumulaciones de materia, a travs de la
excrecin de materiales mucilaginosos.
En los medios acuticos, los protozoos, junto con organismos fotosintticos,
juegan un importante papel como productores primarios de las redes alimentarias.
Este proceso se desarrolla en dos fases; mineralizacin del medio, caracterizada
por una disminucin de la materia orgnica y, la segunda, de saneamiento, en la
que disminuye la concentracin de bacterias y de sales. Durante la mineralizacin,
aumenta la concentracin de bacterias y de protozoos que van a descomponer la
materia orgnica, a la vez que excretan sales minerales que remineralizarn el
agua. Posteriormente se desarrollan otro tipo de protozoos que se alimentan de
bacterias, como son los ciliados, adems de metazoos del tipo rotferos y
nematodos, que van a hacer disminuir la poblacin bacteriana, reducen la cantidad
de sales minerales del medio y sirven de soporte a otras poblaciones superiores.
Para su desarrollo ingieren la materia orgnica disuelta en el agua y las colonias
de bacterias, formando en su interior vacuolas digestivas, repletas de enzimas
encargadas de la degradacin del alimento en el caso de los organismos
hetertrofos, o a travs de citoplasma cromatforo, orgnulos con funcin
fotosinttica, en el caso de los auttrofos.
Figura 5. Estructura bsica de un protozoo. (esquema en un Paramecium spp)

Los productos de excrecin, que salen del cuerpo de diversa manera, formarn los
flculos, que son agregaciones de partculas minerales, materia orgnica,
bacterias y protozoos en el seno de la matriz mucilaginosa, la cual presenta la
particularidad de ser pegajosa. Estos flculos sern fcilmente decantables en
procesos de depuracin de aguas residuales convencionales.
Si las condiciones del medio son ptimas, o sea, con presencia de materia
orgnica disuelta y de bacterias fecales, se favorecern los procesos de
crecimiento celular de los protozoos, lo cual equivale a un aumento de la biomasa
poblacional ms que en un aumento de la biomasa del propio individuo,
principalmente mediante procesos de escisin binaria, donde cada individuo se
divide en dos exactamente iguales.
La mayora de los protozoos son de distribucin cosmopolita, o sea, en colonias o
comunidades poblaciones agrupadas dependientes siempre de las condiciones del
medio. La presencia de un determinado tipo de protozoos, su concentracin y
proliferacin dependen directamente de parmetros como la concentracin de
nutrientes, la cantidad y calidad de materia orgnica, temperatura, oxgeno, pH,
poblaciones bacterianas, etc, por ello, se considera a los protozoos como
elementos bioindicadores de las condiciones del medio donde habitan, o lo que es
lo mismo, son una informacin directa sobre el estado real de los procesos de
depuracin de aguas residuales.
Figura 6. Diversidad de especies de protozoos en ambientes acuticos diversos.

ALGAS MICROSCPICAS UNICELULARES (MICROALGAS)

Cuando se habla de algas, casi siempre nos referimos a un conjunto grande y
variado de organismos eucariotas que contienen clorofila (todas tipo a) y realizan
la fotosntesis utilizando O2 y liberando H2O como donador de electrones. Adems,
algunas algas pueden utilizar H2 para la fotosntesis sin la liberacin de O2.
Muchas algas son fottrofas y por lo tanto requieren de luz para su crecimiento.
Las algas se clasifican en dos grupos (macroalgas y microalgas) o segn su
pigmentacin en tres grupos (verde, rojo y marrn), en ellas se observa la
presencia de diferentes tipos de polmeros de carbono como producto de reserva,
as como diferencias en la estructura de la pared celular y en el tipo de movilidad.
De igual forma, las algas ocupan el primer eslabn en la cadena alimenticia en el
ambiente acutico, son productores primarios capaces de elaborar sustancias
orgnicas a partir de sustancias inorgnicas, transformando la energa luminosa
que proviene del sol en energa qumica.
Las algas presentan una considerable diversidad en la estructura y composicin
qumica de sus paredes celulares. stas estn constituidas por una multicapa de
celulosa microcristalina, generalmente intercalada con material amorfo. Una capa
de material relativamente inerte, est presente en la mayora de sus clulas,
compuestas de hidratos de carbono homogneos o heterogneos. Estas capas
pueden estar impregnadas con sustancias inorgnicas tales como carbonato de
slice, calcio o magnesio. En algunas algas, la pared se ve reforzada por la
deposicin de CaCO3, y son llamadas algas coralinas calcreas.
La pared celular puede ser modificada por la presencia de otros polisacridos
como la pectina (cido poligalacturnico), xilanos, mananos, cido algnico y cido
fuccnico. La pared celular es generalmente considerada como un complejo de
intercambio inico, similar a las resinas de intercambio inico. La capacidad de
intercambio inico se relaciona con la presencia de grupos funcionales y la
estructura espacial de la pared celular. Muchas algas, por ejemplo, presentan
clulas en capas que tienen una importante capacidad de absorcin de metales
debido a la presencia de cidos urnicos.
Las microalgas estn presentes en todos los ecosistemas de la tierra, no slo
acuticos y terrestres, lo que representa una gran variedad de especies que viven
en diferentes condiciones ambientales. Se estima ms de 50 000 especies de
microalgas, de las cuales, slo un nmero limitado, de alrededor de 30 000 se han
estudiado. Estas constituyen, en realidad, un grupo diverso de microorganismos
fotosintticos procariotas y eucariotas que crecen rpidamente debido a su
estructura simple y estn presentes en diversos ambientes: agua marina, dulce o
terrestre. Muchas de las algas eucariotas son taxonmicamente cercanas a las
plantas superiores.

DIATOMEAS (Crisofitas)
Un grupo importante de algas eucariotas, dado su empleo como indicadores
biolgicos de la calidad de aguas, son las diatomeas (bentnicas), las cuales
presentan una biologa muy particular, en especial por dos aspectos:
1) su distribucin en el espacio y
2) su elevada capacidad de colonizar aguas con un grado de perturbacin
extremo.
Las diatomeas son algas unicelulares, que pueden a lo sumo formar pequeas
colonias y pueden llegar a cualquier hbitat acutico arrastradas por el agua. Por
tanto, pueden colonizar potencialmente cualquier nicho acutico. Esta estrategia
hace que, a pesar de la heterogeneidad del ambiente, las comunidades de
diatomeas que se desarrollan en ambientes de ecologa semejantes, sean tambin
muy similares. Tambin hay diatomeas que viven en ambientes extremos (aguas
limpias o aguas muy contaminadas, etc.), a diferencia de los macrfitos y otras
microalgas, que en ambientes extremos, con una fuerte perturbacin,
desaparecen.
Las Diatomeas, que viven tanto en el mar como en el agua dulce, poseen un
caparazn de slice (frstula) constituido por 2 piezas que encajan como una caja
y su tapadera. Contienen un pigmento pardo-amarillento que le da su color pardo
caracterstico.
Figura 7. Diversos especmenes de diatomeas bentnicas.

CLOROFITAS
Son las conocidas como algas verdes, con cloroplastos de este color muy bien
definidos, con formas y localizaciones celulares diferentes. Es el grupo ms
complejo de algas con ms de 8 000 especies conocidas, es el grupo ms
importante en ambientes continentales, tanto en los ecosistemas acuticos como
forestales, ya que crecen en ambientes subareos y forman parte del 92 % de las
especies de lquenes. Ocupan el 3er. lugar en la flora del macrofitobentos marino.
Gneros importantes y de potencial biotecnolgico son Chlorella, Scenedesmus y
Chlamydomonas, esta ltima se mueve mediante flagelos.
EUGLENOFITA
Este es un grupo bastante pequeo de algas unicelulares que se mueven
mediante flagelos y viven en aguas naturales. Las euglenas como Euglena viridis,
generalmente predominan en estanques de estabilizacin. Presentan una
estructura llamada estigma, que actuara como fotorreceptor para que pueda
acercarse a la superficie en busca de la luz solar.
Principales hbitats que ocupan las algas
Hbitats marinos
Pelgico Ms pobre, ms estructurado en tiempo y espacio

Plancton
Nertico Ms rico, ms variable
Epilticas Substrato rocoso
Bentos Epfitas Sobre hierbas marinas o sobre otras algas

Plataforma continental,
0-55 m de profundidad Epizoicas Sobre animales
Epiplicas Sobre sedimentos
PIRROFITAS (Dinofitas)
Sus principales miembros son los dinoflagelados, que tienen una pared dura de
celulosa que parece un escudo o casco. Presentan dos flagelos entre surcos para
su movimiento.

Hbitats continentales
Plancton En hbitats continentales plancton y bentos estn menos

diferenciados
Acuticas Bentos
Perifiton Comunidades adheridas a objetos sumergidos
Pueden vivir a varios mm de profundidad y sobrevivir como

Edficas
formas de resistencia a mayor profundidad
Epilticas
Subareas Saxcolas
Endolticas
Corticcolas
Aerovagantes
Simbiontes Ficobiontes liqunicos
Las algas son organismos esencialmente acuticos y poiquilohdricos, por tanto

ocupan principalmente hbitats acuticos (marinos o continentales). No obstante,
muchas son capaces de vivir en ambientes subareos: corteza, rocas, suelos
desnudos, sobre animales o incluso suspendidas en el aire. Las microalgas
presentes en los ecosistemas marinos tienen un importante papel, ya que su
actividad metablica contribuye a la transformacin y enriquecimiento de las aguas
madres y los fangos salinos.
Las microalgas siendo individuos unicelulares o pluricelulares (colonias), sus
clulas funcionan independientemente, realizando todas las funciones vitales.
Para clasificarlas se emplea un sistema de caracteres taxonmicos que contempla
ciertas caractersticas como:
La estructura y composicin de la pared celular
La dotacin flagelar: nmero, tipo y posicin de los flagelos.
Los pigmentos fotosintticos
La ultraestructura de los plastos
La reproduccin puede ser sexual o asexual, de manera similar a las bacterias y
hongos. Su crecimiento es bastante rpido en condiciones favorables y los
tiempos de generacin son bastante cortos, como de algunas horas.

Caracteres Euglenofitas Criptofitas Dinofitas

diferenciales
Pigmentos Clorofilas a y b Clorofilas a y c Clorofilas a y c
betacaroteno Ficobilinas Xantofilas
Polisacrido de Paramilo Almidn Almidn

reserva
Flagelos Subapicales Subapicales Laterales o subapicales
PC Periplasto proteico Periplasto Placas celulsicas
en bandas proteico en endgenas (hay formas
helicoidales placas desnudas y acorazadas)
Invaginaciones Reservorio Citofaringe Dos surcos:
subapical subapical Sulco y cngulo
(cripta)
Ncleo Cromosomas Normal Cromosomas condensados
condensados eucaritico permanentemente,
permanentemente, acntricos; bajo contenido
acntricos en ADN
Reproduccin No se conoce Hay rep. sexual Hay rep. sexual con iso- o
sexual con isogamia anisogamia
CIANOFITAS (Microalgas Procariotas, Cianobacterias)

Conocidas vulgarmente como algas verde azuladas. Al igual que las bacterias, son
organismos procariotas, cuyas clulas no presentan sistemas de membranas
internas que aslen los organelos del citoplasma. Son oxignicas, con gran
variedad de tamaos, incluyendo largos filamentos. Dentro de los gneros ms
importantes estn: Anabaena, Nostoc y Oscillatoria. Una importante propiedad de
este grupo es la capacidad entre muchos de sus miembros de usar gas N 2 de la
atmsfera (fijadores) para producir protena celular y acidos nucleicos. Por ello, a
diferencia de las algas eucariotas, pueden crecer incluso en aguas deficientes de
nitrgeno, aunque lentamente.
Algunas caractersticas importantes, adems, son:
Ncleo carece de membrana (diferencia con algas eucariotas)
Plastidios tampoco tienen membranas
No tienen mitocondrias
Pigmentos: clorofila A, betacaroteno y ficobilinas
Ficocianina: azul-verde
Ficoeritrina: verde-amarillo (tien rojas)
Morfologa variada: unicelulares, colonias esfricas u ovoides, con formas
fijas o mviles.
Multiplicacin: por divisin celular, por esporas.

HONGOS
Los hongos son organismos eucariotas, sin clorofilas y hetertrofos que se
reproducen sexual y asexualmente y cuyas estructuras somticas estn rodeadas
por una pared celular compuesta de quitina, glucano, manano y otros
polisacridos, y que forman un nico reino, el Fungi.
A diferencia de las bacterias, la estructura celular de los hongos es ms compleja.
Como microorganismos eucariotas, poseen un ncleo bien definido, mitocondrias,
aparato de Golgi y retculo endoplsmico. Los hongos pueden existir en una
forma unicelular (levadura) capaz de replicarse de manera asexual, o en una
forma filamentosa (moho), capaz de replicarse de forma tanto asexual como
sexual. La mayor parte de los hongos existen en forma de levadura o bien en
forma de moho, sin embargo, algunos pueden adoptar ambas morfologas (hongos
dimrficos), como los gneros Histoplasma, Blastomyces y Coccidioides.
Los hongos representan un grupo ubicuo y diverso de microorganismos que se
dedica principalmente a la degradacin de materia orgnica. Los hongos llevan
una vida heterotrfica como saprofitos (microorganismos que subsisten en materia
muerta o en descomposicin), simbiontes (microorganismos que conjuntamente
con otros, viven y obtienen ventajas de su asociacin), comensales (aquellos que
se desarrollan en estrecha relacin, en la que uno de los participantes obtiene
beneficios mientras que el otro ni se beneficia ni resulta perjudicado) o parsitos
(microorganismos que se establecen sobre o en el interior de un anfitrin del que
obtienen beneficios sin corresponder con ninguna ventaja; en el caso de los
patgenos, la relacin es perjudicial para el anfitrin).
La clasificacin ms sencilla, basada en aspectos morfolgicos, agrupa a los
hongos en levaduras y formas miceliales. Desde el punto de vista morfolgico, una
levadura se define como una clula que se reproduce mediante gemacin o fisin,
de modo que la clula progenitora o madre se desprende de una porcin de s
misma para producir una clula descendiente o hija. Las clulas hijas pueden
alargarse para formar seudohifas.
Por lo general, las levaduras son unicelulares y producen colonias redondeadas,
plidas o mucoides en las placas de agar. Por su parte, las formas miceliales son
microorganismos pluricelulares formados por unas estructuras tubulares
semejantes a hebras conocidas como hifas cuyos extremos se alargan mediante
un proceso denominado extensin apical. Las hifas pueden ser cenocticas
(huecas y multinucleadas) o septadas (divididas por tabiques). El conjunto de hifas
conforma una estructura semejante a un tapete llamada micelio. A menudo, las
colonias formadas por las formas miceliales se describen como filamentosas,
vellosas o algodonosas. Cuando crecen en agar o sobre la superficie de otros
medios slidos, las formas miceliales producen unas hifas, denominadas hifas
vegetativas, que crecen por encima o por debajo de la superficie del medio de

cultivo, as como hifas que se proyectan por encima de la superficie y se conocen

como hifas areas. Las hifas areas pueden producir unas estructuras
especializadas, las conidias (elementos de reproduccin asexual). Las conidias se
transmiten fcilmente por el aire y se encargan de la diseminacin del hongo. La
morfologa, el tamao y ciertas caractersticas del desarrollo de las conidias
permiten asignar un hongo a un gnero y una especie concreta.
Casi todos los hongos son aerobios, aunque algunos son anaerobios
(fermentadores) facultativos y otros son anaerobios estrictos. En cuanto a su
metabolismo, los hongos son hetertrofos y verstiles desde el punto de vista
bioqumico; producen metabolitos primarios (como cido ctrico, etanol, glicerol) y
secundarios (p. ej., antibiticos [penicilina], aflatoxinas). En comparacin con las
bacterias, los hongos son seres de crecimiento lento cuyos tiempos de duplicacin
celular alcanzan horas en lugar de minutos; adems no tienen el amplio rango de
caractersticas metablicas de las bacterias.
Son esencialmente organolitotrofos y ninguno fototrofo. Son importantes en la
descomposicin de residuos lignocelulsicos que se acumulan en el suelo.
FISIOLOGA Y REPRODUCCIN
La mayora de los hongos crecen entre 0 y 30 C, con una temperatura ptima de
crecimiento de 20-30 C. Algunos pueden vivir en condiciones termoflicas, con
temperaturas tan altas como de 60 C. Son organismos aerobios y, al carecer de
clorofila, deben tomar del exterior los elementos necesarios para su nutricin. No
requieren la luz para crecer, pero muchas especies la necesitan para que sus
estructuras reproductoras esporulen. En condiciones favorables, las hifas pueden
mantener un crecimiento indefinido por su extremo apical, presentando la colonia
una tendencia a crecer uniformemente en todas direcciones.
Los hongos se reproducen mediante la formacin de esporas, las cuales pueden
ser sexuales (lo que implica un proceso de meiosis precedido por la fusin del
protoplasma y los ncleos de dos cepas compatibles) o asexuales (lo que
nicamente implica procesos de mitosis). La mayora de los hongos presentan las
dos formas. La forma asexual es ms importante para la propagacin de la
especie, pues se realiza varias veces al ao, mientras que la fase sexual se
produce exclusivamente con una periodicidad anual. Los hongos imperfectos slo
se reproducen asexualmente mientras que los hongos perfectos tienen capacidad
sexual y asexual de reproduccin.
Las formas ms comunes de reproduccin asexual son las siguientes:
Fragmentacin del micelio: cada fragmento se transforma en un nuevo
individuo. As, las hifas pueden fragmentarse en las clulas que las
componen; a las clulas escindidas se las denomina artrosporas.

Fisin o escisin: la clula madre se divide en dos clulas hijas, por

constriccin y formacin de la pared celular.
Gemacin: en la clula madre se forma una pequea yema y el ncleo se
divide, migrando uno de ellos hacia la yema. Posteriormente la yema
aumenta de tamao y se separa de la clula progenitora, formando un
nuevo individuo. Este tipo de reproduccin es el que presenta la mayora
de las levaduras.
Produccin de esporas: es el mtodo ms comn. Cuando la espora
germina, emite un tubo germinal que crece hasta formar el micelio.
Las esporas asexuales se componen de dos tipos generales: esporangiosporas y
conidias. Las esporangiosporas son unas esporas asexuales producidas y
contenidas en una estructura llamada esporangio que caracterizan a algunos
gneros pertenecientes a la clase cigomicetos, como Rhizopus y Mucor spp. Las
conidias son esporas asexuales que se encuentran en estructuras especializadas,
como sucede en los gneros Aspergillus y Penicillium, y en los dermatofitos.
Figura 8. Estructura de Aspergillus y de Penicillium
La reproduccin sexual se lleva a cabo mediante la unin de dos ncleos

compatibles y presenta tres fases sucesivas: plasmogamia (unin de ambos
protoplasmas), cariogamia (unin de los ncleos) y meiosis (divisin de los
ncleos diploides en ncleos haploides). Algunas especies de hongos producen
rganos sexuales masculinos y femeninos sobre el mismo talo, es decir, son
hermafroditas (hifas monoicas), mientras que en otras especies, los rganos
sexuales femeninos y masculinos se hallan en diferentes talos (hifas dioicas).
Las estructuras reproductoras, ya sean sexuales o asexuales, presentan una gran
variedad morfolgica, lo cual tiene gran utilidad en la identificacin de las distintas
especies de hongos, puesto que las estructuras vegetativas son muy similares en
la mayora de los hongos.

HONGOS EN AGUAS
En la mayora de aguas hay hongos adems de bacterias y cianofitas. Numerosas
especies en charcos, lagos y ros conforman los hongos acuticos caractersticos
que no se desarrollan en otros medios, aunque tambin hay hongos de la tierra
que crecen en aguas, y los hay de aguas que crecen en suelo hmedo.
Como los hongos son carbono-hetertrofos, o son saprfitos de materia orgnica
muerta o son parsitos de plantas y animales, aunque tambin hay hongos
facultativos que pueden hacer lo uno o lo otro. La mayora de especies acuticas
necesitan nitrgeno libre, siendo capaces de desintegrar compuestos orgnicos
muy complejos como pectina, celulosa, lignina y quitina.
Los hongos acuticos tienen comportamientos diversos en cuanto al pH y la
temperatura del agua que habitan. Pueden desarrollarse en aguas cidas y
alcalinas (pH 3,2 9,6) como por ej. Achlya racemosa y Saprolegnia monoica;
otros slo en aguas cidas (pH 1,9 2,9) de los volcanes. En cuanto a la T, la
mayora son mesfilos, aunque algunos pueden desarrollarse entre 1 y 33 C.
En aguas se encuentran los siguientes grupos de hongos:
Los Mixomicetos que apenas se presentan en medios acuosos y son de
escasa importancia.
Los hongos superiores. Slo las levaduras (especies primitivas de
Ascomicetos) y especies levaduriformes de Deuteromicetos (hongos
imperfectos) se desarrollan libremente en el agua. Todos los dems hongos
superiores, incluyendo los Basidiomicetos de papel secundario en las
aguas, o colonizan o parasitan sustratos fijos como plantas acuticas vivas
o muertas, madera, sedimentos, conchas de moluscos y rocas.
Los hongos inferiores o Ficomicetos son los acuticos propiamente dichos,
cuya reproduccin es a travs de zoosporas libres y mviles por flagelos,
pero tambin hay especies que colonizan seres vivos de los sedimentos o
del material orgnico muerto.
En los ros abundan los ficomicetos parsitos de algas planctnicas y de pequeos
animales, siendo importantes los Chytridiales que produce numerosas zoosporas.
En los sedimentos de aguas continentales son frecuentes hongos del gnero
Aryhrobotrys (frecuentes en tierra y cazadores de nematodos). Otros hongos
frecuentes de tierra hallados transitoriamente son especies de Penicilium y
Aspergillus, cuyas esporas estn presentes en casi todas las aguas y pueden
germinar sobre restos de plantas.
Los hongos normalmente no estn presentes en aguas residuales, slo en
condiciones ambientales muy especiales (bajo pH, deficiencia de nitrgeno,
presencia de productos txicos) pueden aparecer ciertos hongos de los gneros
Penicillium y Cephalosporium, entre otros.

BACTERIAS
Las bacterias son microorganismos con estructura celular procariota (del griego:
protos: primitivo, y karion: ncleo), es decir estn dotados de individualidad con
estructura y organizacin celulares elementales y simples.
MORFOLOGA Y ESTRUCTURA
Las bacterias son las clulas vivas conocidas ms pequeas; incluso, algunas de
ellas son microorganismos de menor tamao posible con capacidad
independiente. El tamao de las distintas especies bacterianas oscila entre 0,1 y
10 um. Los elementos de la estructura bacteriana se dividen en: elementos
obligados, indispensables para la vida celular, que comprenden el material
nuclear, el citoplasma, los ribosomas, la membrana citoplasmtica y la pared
bacteriana, y elementos facultativos, que incluyen la cpsula, el glicoclix, flagelos,
fimbrias y esporas.
Figura 9. Estructura bsica de una clula bacteriana.
Regin nuclear: las bacterias no poseen un verdadero ncleo, sino un nucleoide,

desprovisto de membrana limitante y cuya dotacin gentica se limita a un solo
cromosoma, constituido por una molcula circular de ADN replegada sobre s
misma. Se halla asociado a la membrana citoplasmtica a travs de una
invaginacin central de sta o mesosoma septal.
Citoplasma y membrana citoplasmtica: el citoplasma bacteriano es un sistema
coloidal formado por agua (85%), principios inmediatos, minerales y fermentos.
Adems de las estructuras mesosmicas (invaginaciones de la membrana
citoplasmtica) y el cromosoma bacteriano, contiene los ribosomas, que muestran
caractersticas diferentes a los de las clulas eucariotas, y las inclusiones,

elementos sin estructura uniforme, que sirven como mecanismo de regulacin o

almacenamiento de sustancias de reserva. Las bacterias carecen de aparato de
Golgi y mitocondrias. En el citoplasma bacteriano pueden hallarse molculas de
DNA bicatenario circular extracromosmicas, de menor tamao y autorreplicantes,
denominadas plsmidos no imprescindibles para la vida celular. Son transmisibles
no slo a la descendencia (ya que en principio se duplican sincrnicamente como
el cromosoma bacteriano), sino tambin de una bacteria a otra, por fenmenos de
transferencia gentica, pudiendo aportar a la bacteria que los posee propiedades
adicionales. As, la resistencia a los antimicrobianos o, incluso, determinados
factores de patogenicidad, como la sntesis de exotoxinas, pueden hallarse
determinados por la presencia extracromosmica de plsmidos en la clula
bacteriana.
La membrana citoplasmtica de las bacterias, a pesar de ser similar a la de la
clula eucariota, carece de esteroles y se halla rodeada de una pared celular
rgida caracterstica y nica de la clula procariota.
Pared celular: la pared celular es la envoltura ms externa, y su papel primordial
en la vida de las bacterias, consiste fundamentalmente en proteger a stas frente
a los agentes externos. Es una estructura extraordinariamente resistente, lo que
le permite mantener presiones osmticas intracitoplasmticas muy elevadas (10-
20 atm). Pero, adems, es rgida, siendo por tanto, responsable de la morfologa
bacteriana. La rigidez y la resistencia fsica de la pared celular se deben a la
presencia de una sustancia compleja, presente slo en la clula procariota,
denominada peptidoglicano o murena, polmero compuesto de dos azcares
(glucosamina y cido murmico) y aminocidos.
De acuerdo con la estructura de la pared celular, las bacterias se pueden clasificar
en dos grandes grupos: grampositivas y gramnegativas. Una de las principales
diferencias entre estos dos tipos de estructura radica en la composicin en
peptidoglicano. Mientras que en las bacterias grampositivas el peptidoglicano
representa el 50-90% de la pared celular, en las gramnegativas slo constituye
una pequea proporcin de sta, en la que predominan fosfolpidos, protenas y
polisacridos. As, la pared celular de las bacterias grampositivas es
especialmente vulnerable a la accin de los antimicrobianos que actan inhibiendo
la sntesis de peptidoglucano.
La pared celular de las bacterias gramnegativas es una estructura trilaminar
compleja, en la que el peptidoglucano constituye la capa interna. En la capa ms
externa de la pared celular o membrana externa, constituida por fosfolpidos,
protenas y lipopolisacridos, destaca la fraccin interna o lpido A del
lipopolisacrido, que se identifica con la endotoxina, cuya actividad txica,
observada en las infecciones por bacterias gramnegativas, al ser un componente
estructural, slo se pone de manifiesto tras la lisis bacteriana.

Aunque existen bacterias que carecen de pared celular, esta estructura es muy
importante para la morfologa bacteriana, este carcter permite adems clasificar a
la mayora de bacterias segn la morfologa que presentan.
Figura 10. Morfologa bacteriana y clasificacin

Esporas
Algunas bacterias grampositivas, pero no las gramnegativas, pertenecientes a
gneros como Bacillus (p. ej., Bacillus anthracis) y Clostridium (p. ej., Clostridium
botulinum) son capaces de formar esporas. En condiciones ambientales adversas,
como en la falta de un nutriente, estas bacterias pueden pasar de un estado
vegetativo a un estado de latencia o de espora. La localizacin de la espora en el
interior de la clula constituye una caracterstica de cada bacteria que puede
facilitar su identificacin.
La espora es una estructura deshidratada formada por mltiples capas que
protege a la bacteria y le permite vivir en un estado de latencia. La espora
contiene una copia completa del cromosoma bacteriano, concentraciones
mnimas imprescindibles de ribosomas y protenas esenciales, y una elevada
concentracin de calcio unido a cido dipicolnico. Asimismo, la espora posee una
membrana interna, dos capas de peptidoglucano y una capa proteica semejante a
la queratina externa. En el examen al microscopio ptico, la espora aparece como
una estructura refringente (brillante). La estructura de la espora protege el ADN
del genoma bacteriano del calor intenso, la irradiacin y la accin de la mayora de
enzimas y sustancias qumicas. De hecho, las esporas bacterianas son tan
resistentes a los factores ambientales que pueden mantener su viabilidad durante
siglos. Asimismo, las esporas resistentes a los desinfectantes convencionales.
FISIOLOGA Y REPRODUCCIN
El metabolismo bacteriano es muy complejo. La clula bacteriana sintetiza por s
misma y genera suficiente energa para la biosntesis, la replicacin del
cromosoma, el transporte activo, la movilidad (en algunas especies) y otras
actividades, diferencindose del metabolismo de las clulas eucariotas en que

est programado para un rpido crecimiento y acta de 10 a 100 veces ms de

prisa que en las clulas del organismo humano, en su mayor versatilidad para
utilizar distintos compuestos como fuentes de energa y en su habilidad para
emplear agentes oxidantes distintos del oxgeno molecular en el metabolismo de
los diferentes nutrientes.
Las bacterias se dividen mediante un fenmeno de fisin binaria transversal, de
forma que una clula madre se divide en dos clulas hijas y pueden progresar en
los medios de cultivo, con frecuencia, con extraordinaria rapidez. As, muchas
bacterias pueden presentar, en condiciones ideales, un tiempo de duplicacin de
20 min; por consiguiente, en temperaturas ptimas de crecimiento, un nico
microorganismo puede originar una poblacin de 109 individuos al cabo de slo 8
h. Sin embargo, esta tasa de crecimiento rara vez es alcanzada en el interior del
organismo humano.
Figura 11. Proceso de fisin binaria bacteriana (reproduccin)

Accin patgena
En general, se designa como patgeno a cualquier microorganismo que posee la
capacidad de producir enfermedad. Sin embargo, no todos los agentes patgenos
poseen la misma capacidad de lesin. La virulencia proporciona una expresin
cuantitativa del poder patgeno o de la posibilidad de causar enfermedad. Los
factores de virulencia no se refieren slo a la capacidad de lesin, sino a todos los
factores que facilitan las diferentes etapas del proceso infeccioso, es decir,
colonizacin, penetracin, multiplicacin, invasin y lesin. El poder patgeno no
depende exclusivamente del microorganismo, sino tambin del hospedero.

En este sentido, es probable que prcticamente todos los microorganismos con

capacidad para multiplicarse en el hombre puedan provocar enfermedad en
individuos que presentan alteraciones en sus mecanismos de defensa. El trmino
oportunista es apropiado para esta categora de agentes patgenos. Para poder
manifestar su accin patgena, las bacterias deben ser capaces de colonizar una
puerta de entrada, efecto que se basa en la utilizacin de estructuras adherentes,
o adhesinas, que intervienen en la fijacin a receptores especficos de la clula
epitelial y que, por tanto, condicionarn en gran manera el tropismo por una
determinada puerta de entrada o mucosa. Adems, una vez fijas, deben competir
con la flora normal, adaptarse al medio nutriente y resistir los mecanismos de
defensa del hospedero a travs de diversos mecanismos, entre los cuales los ms
conocidos incluyen la presencia de cpsula antifagoctica y la elaboracin de
toxinas y enzimas como bacteriocinas o proteasas de IgA.
Tras la colonizacin de la puerta de entrada, se puede considerar la existencia de
diferentes modelos de infeccin y diversas variantes en la accin patgena, segn
la importancia relativa de los distintos factores de virulencia determinantes de la
capacidad de penetracin del epitelio cutneo-mucoso, multiplicacin, invasin
(contigidad, hemtica, linftica, nerviosa) y lesin (sntesis de exotoxinas,
presencia de endotoxinas o induccin de fenmenos de hipersensibilidad).
BACTERIAS DE LAS AGUAS

La flora bacteriana de las aguas no es uniforme, sino que ofrece una
extraordinaria variedad tal como sucede en los ambientes terrestres. Las aguas
contienen bacterias autctonas que slo se pueden desarrollar ptimamente en
ellas, pero tambin contienen a otras que provienen de otros biotopos, como por
ejemplo bacterias del suelo de las proximidades de los ros, o aquellas que
provienen del aire y que son arrastradas con la lluvia, o las que llegan a travs de
fuentes de contaminacin vegetal, animal o del hombre.
La composicin de la flora bacteriana es muy variable segn la clase de agua, y
depende de la cantidad de sustancias orgnicas, sales, pH, turbidez y
temperatura. Estos factores pueden variar segn las estaciones anuales, o segn
las fuentes de contaminacin; as, las bacterias marinas son distintas de las
presentes en agua dulce.
La mayora de las bacterias de aguas son carbono-hetertrofas, es decir, que se
alimentan de sustancias orgnicas; casi todas son saprfitas sobre material
muerto de origen animal o vegetal, y por regla general las parsitas son escasas.
En el agua pueden hallarse, adems, bacterias fotoauttrofas y quimioauttrofas,
que slo necesitan sustancias inorgnicas, y que como las plantas estn
capacitadas para la fotosntesis, o que reducen el cido carbnico.

La mayora de las bacterias acuticas tienen las mismas formas fundamentales

que las terrestres. Es decir, pueden ser esfricas, bacilares o en forma de coma o
espiral. Hay adems formas anulares, filamentosas, acintadas y pedunculadas.
Tambin podemos observar agrupaciones en forma de estafiloccicas y de otros
tipos. Adems, las bacterias de medios acuosos a menudo son de tamao muy
grandes, notable diferencia con las de otros biotopos. En la mayora de aguas
predominan las bacterias gramnegativas, rasgo taxonmico relacionado con la
pared celular y con otros caracteres estructurales de las bacterias.
La mayor parte de estas bacterias son mviles por flagelos, aunque algunas
parecen reptar sobre sustratos slidos. Tambin se observan fimbrias que les
permiten agruparse sobre materiales detrticos o sobre el moco de algas, aunque
muchas tambin pueden vivir libremente en el agua y participan en la gran
comunidad biolgica del plancton.
En las aguas podemos encontrar representantes de casi todos los rdenes
bacterianos, estrictas o facultativas, aunque la taxonoma al respecto sigue
teniendo muchos problemas. Por ejemplo, por algunas semejanzas entre las
sulfobacterias del gnero Beggiatoa con cianofceas del gnero Oscillatoria, a
ambas se les consideraba como algas verdeazules.
BACTERIAS EN AGUAS RESIDUALES

Las bacterias constituyen el principal componente de los lodos activados en el
tratamiento de aguas residuales. Los gneros principales son Zooglea,
Pseudomonas, Flavobacterium, Alcaligenes, Bacillus, Achromobacter,
Corynebacterium y Acinetobacter; tambin hay formas filamentosas como
Beggiatoa. Estas bacterias oxidan la materia orgnica y producen polisacridos y
otros polmeros extracelulares que facilitan la floculacin. Los microorganismos
aerobios representan una fraccin importante cuyo nmero vara inversamente al
tamao del flculo puesto que la difusin de O2 al interior se va viendo ms
dificultada. En los flculos de gran tamao el interior es anaerobio y permite el
crecimiento de anaerobios estrictos (tales como metangenos) que han
sobrevivido fases de mayor aerobiosis en pequeas bolsas anaerobias internas en
flculos de menor tamao.
Su nmero en los lodos activados llega a 108 ufc ml-1 y entre ellas el grupo ms
importante numricamente es el de Pseudomonas. En los lodos activados tambin
hay bacterias auttrofas tales como las oxidantes de amonio: Nitrosococcus y
Nitrosomonas, as como oxidantes de nitritos: Nitrospira y Nitrobacter, e incluso
algunas bacterias fotosintticas.

ARCHAEA
Un grupo procariota, de gran inters en biotecnologa ambiental, que se diferencia
estructuralmente de las bacterias son las Archeas o arqueobacterias, sobre todo
en su pared celular, membranas y RNA. Por ejemplo, sus paredes no contienen
murena o peptidoglucano que se encuentra entre las eubacterias, sino pseudo-
peptidoglicanos qumicamente diferente. Otra diferencia importante son los lpidos
de la membrana, que en el caso de las archaeas estn unidos por medio de
teres.
Las archeaes extremfilas pueden ser tiles en el tratamiento biolgico de aguas
residuales industriales que contienen temperaturas y contenidos en salinidad
extremos, pero han sido poco explotadas en sus beneficios potenciales.
Son arqueobacerias importantes aquellas productoras de metano a partir de H2 y
acetato (metangenos): Methanobacterium, Methanospirillum, Methanogenium,
Methanosarcina y Methanococcus; posiblemente tambin los extremadamente
halfilos Halobacterium y Halococcus, los que viven en condiciones extremas de
cido y/o temperatura como Sulfolobus, y Thermoplasma.
Figura 12. rbol Filogentico de los organismos vivos, un ancestro universal

comn.

VIRUS
Al comienzo los virus fueron descritos como agentes filtrables. Su pequeo
tamao les permite pasar por los filtros diseados para retener a las bacterias. A
diferencia de lo que ocurre con la mayor parte de las bacterias, hongos y
parsitos, los virus son unos parsitos intracelulares obligados y para replicarse
dependen de la maquinaria bioqumica de la clula husped. Asimismo, la
replicacin de los virus ocurre por ensamblaje de sus componentes individuales
dentro de la clula que parasitan.
El virus ms simple est formado por un genoma de cido desoxirribonucleico
(ADN) o cido ribonucleico (ARN), monocatenario o bicatenario, empaquetado
dentro de un cascarn protector de protenas y, en algunos virus, una membrana.
Los virus carecen de la capacidad de producir energa o sustratos, no pueden
fabricar sus propias protenas ni tampoco son capaces de replicar su genoma
independientemente de la clula anfitriona. Para utilizar la maquinaria bioqumica
de la clula, el virus debe adaptarse a las reglas bioqumicas que la gobiernan.
Las unidades utilizadas en la medicin del tamao del virin son los nanmetros
(nm). El tamao de los virus ms importantes oscila entre 18 nm (parvovirus) y
380 nm (poxvirus). Estos ltimos son casi visibles mediante el microscopio ptico,
y su tamao es aproximadamente una cuarta parte del de una clula de
Staphylococcus. Los viriones de gran tamao pueden tener un genoma mayor
capaz de codificar ms protenas; asimismo, por regla general, su estructura es
ms compleja.
Figura 13. Tamao relativo de los virus (de importancia humana)

El virin (la partcula vrica) contiene un genoma de cido nucleico envuelto en una
capa de protenas (cpside) o adems en una membrana (envoltura). Asimismo,
el virin puede contener ciertas enzimas accesorias o esenciales junto a otras
protenas. La cpside o las protenas de fijacin del cido nucleico pueden
asociarse al genoma y formar una nucleocpside, que puede ser la misma del
virin o bien estar rodeada de la envoltura.
VIRUS ACUATICOS
En muchas aguas hay virus. Se trata de partculas intracelulares obligadas, pues
necesitan clulas vivas vegetales, incluidas las algas unicelulares, o animales para
reproducirse y sin ellas no pueden multiplicarse en nmero. Poseen un solo tipo
de acido nucleico (ADN o ARN) que viene a ser su material gentico rodeado por
una cubierta proteica llamada cpside (fig. A), y esta a su vez rodeada por una
envoltura (fig. B).
Figura 14. Esquema de la estructura bsica de los virus
Las bacterias y las cianobacterias, organismos unicelulares, tambin pueden ser

invadidas por tipos especficos de virus denominados bacterifagos (fig. C), que
adems estn muy difundidos en las aguas. Los bacterifagos son virus ADN y
probablemente exista un tipo para cada bacteria de las aguas. Existen reportes
cientficos de hasta 10 000 partculas libres en aguas costeras limpias por lo que
supone que hay cantidades anlogas en todas las aguas eutrficas.
Los virus se encuentran tanto en aguas continentales como en casi todas las
zonas del mar, en organismos acuticos, siendo algunos de los ms conocidos los
que producen enfermedades en peces y cangrejos con las consecuentes prdidas
econmicas. Pero tambin son muy importantes los virus patgenos del hombre,
sobre todo aquellos que producen cuadros entricos y que son resistentes a
sistemas de desinfeccin y control. Adems el aislamiento e identificacin viral es
muy difcil y costosa.

Como se ha indicado ms arriba, la deteccin de los virus es ms difcil que la de

las bacterias. En este caso, se suele realizar por concentracin de los virus en un
pequeo volumen a fin de poder detectarlos en ese ambiente de alta densidad.
Para conseguir esa concentracin se pueden utilizar varios mtodos, entre ellos la
ultrafiltracin y la ultracentrifugacin. Una vez realizada la concentracin, deber
realizarse la deteccin y el recuento mediante mtodos directos basados o no en
la infectividad o mediante mtodos indirectos (indicadores de contaminacin fecal
o indicadores qumicos).
Figura 15. Esquema del ciclo de replicacin viral bsico
REFERENCIAS:
__________________________________________________________________
Madigan, M; Martinko, J.; Parker, J. 2004. Brock. Biologa de los
Microorganismos. 10 ed. Pearson Education, S.A. Espaa.
Pelczar, M.; Reid, R.; Chan, E. 1982. Microbiologa. 2 ed. MacGraw Hill.
Mxico.


DIVERSIDAD MICROBIANA Y NICHOS MICROBIANOS

__________________________________________________________________
En principio, la diversidad microbiana es evidente en trminos de variedad
morfolgica, estructural y funcional de los microorganismos, as como en el
tamao celular, en la divisin celular, y en la capacidad metablica y de
adaptacin.
Esta diversidad, en ecologa, es la suma de los distintos seres vivos que
constituyen un ecosistema, por lo que se suele usar el trmino biodiversidad, de
forma restringida, para aludir al nmero y variedad de organismos (especies) que
viven en el planeta; sin embargo, es ms aceptado el criterio de aplicarlo a todos
los posibles niveles de organizacin que existen en la naturaleza. Segn esto, se
reconocen explcitamente tres niveles. El primero la diversidad gentica alude
a la variedad de genes contenidos en individuos, poblaciones, especies, etc. El
segundo diversidad de especies alude al nmero y variedad de especies que
se pueden encontrar, por ejemplo, en un rea determinada. El tercero diversidad
de ecosistemas designa el nmero y abundancia relativa de hbitats,
comunidades biticas y procesos ecolgicos.
El material gentico (ADN y ARN) revela adems la existencia de miles de
millones de especies microbianas, que incluso habitan el planeta desde mucho
antes que cualquier otro ser vivo. Se ha estimado que slo el 3% de los
microorganismos son conocidos y de estos, pocos han sido estudiados con
profundidad. Asimismo, se reconoce que los microorganismos son ms diversos y
verstiles que los macroorganismos debido a su historia evolutiva y a su rpida
capacidad para adaptarse a los cambios ambientales. Por ejemplo, hace poco
ms de 3 300 millones de aos las bacterias fueron las primeras formas de vida en
colonizar la Tierra, ya que tienen capacidad para usar distintas fuentes de energa.
Desde entonces y hasta la actualidad las bacterias y otros microorganismos
pueden crecer en los ambientes ms diversos. Su capacidad y eficiencia
metablica permitieron que ellos colonizaran la superficie terrestre, el aire, los
lagos salados y prcticamente todas las regiones geogrficas del planeta. Los
encontramos desde los polos en ambientes debajo del punto de congelacin,
hasta ambientes secos como los desiertos, o los muy hmedos como las selvas
lluviosas.
Otra de las ventajas evolutivas bacterianas es que pueden vivir aisladas o en
asociacin con otros seres vivos. Por ejemplo, hongos y bacterias pueden hacer
simbiosis con plantas (viven en ellas sin causarles dao), tal como los hongos
micorrcicos en las races del 97% de las plantas, o la bacteria Rhizobium, un
simbionte de las leguminosas como el frjol. En el intestino humano tambin
existen bacterias en elevada densidad, como es el caso de Escherichia coli. De

esta forma, la diversidad microbiana en un sentido amplio se define como la

variedad de microorganismos y de sus diversos mecanismos de adaptacin.
Figura 16. Diagrama que muestra el tiempo de la evolucin en que aparecen las
bacterias
La literatura refiere poco ms de 30 800 especies de protozoos, 70 000 de hongos

y 45 000 de bacterias, la mayora asociado a enfermedades en macroorganismos.
Sin embargo, el estudio de la presencia de microorganismos por tcnicas
moleculares sugiere que el nmero de especies no descritas puede ser de no
menos de 10 millones en el caso de bacterias, o 150 000 hongos.
Existen an numerosos ambientes naturales que se encuentran poco o nada
estudiados, en los que se desarrollan microorganismos con capacidades
metablicas nuevas y potencialmente interesantes para el hombre. Es el caso de
ambientes marinos como los sedimentos de las profundidades ocenicas, as
como de las comunidades microbianas criptoendolticas (viven dentro de las
piedras), o de las asociaciones en forma de micorrizas (hongos y plantas).
Tambin se estn descubriendo microorganismos completamente nuevos en
lugares tan conocidos como los fangos que se generan en el fondo de las
depuradoras de aguas residuales, denominados lodos activos por la gran cantidad
de organismos que contienen y que son muy activos para eliminar los
contaminantes.

No obstante, en hbitats como el suelo existen una amplia diversidad de

protozoos, cianobacterias, bacterias y hongos. Se estima que en el suelo existen
miles de especies en poblaciones de 100 a 2 000 millones de individuos por gramo
de suelo, con hasta 35 000 especies de bacterias y 1 500 000 de hongos, aunque
slo se han identificado entre un 8% y un 1%, respectivamente.
La diversidad microbiana constituye tal vez la fuente potencial de recursos ms
importante para el desarrollo biotecnolgico. El potencial biolgico industrialmente
y ambientalmente explotable es enorme debido a la gran diversidad de especies
de microorganismos existente en la biosfera, la mayora de los cuales son an
desconocidos. Este potencial se ve incrementado por las tcnicas de Ingeniera
Gentica que permiten aumentar la diversidad de productos que se puede obtener
a partir de los organismos nativos o de sus genes iniciales.
Figura 17. Clasificacin de los microorganismos, nutricin y usos potenciales.

TEMA 03. FISIOLOGA Y GENTICA MICROBIANA. Metabolismo y cintica

microbiana bsica. Herramientas moleculares en biotecnologa y sus aplicaciones.
OBJETIVOS:
__________________________________________________________________
Conocer las caractersticas ms importantes del metabolismo y la cintica
de los microorganismos.
Conocer las herramientas moleculares actuales de uso en la biotecnologa
ambiental moderna.
INTRODUCCIN:
__________________________________________________________________
SISTEMA BIOLGICO
Un sistema biolgico es un sistema material capaz de realizar por s mismo tres
funciones denominadas funciones vitales: nutricin, relacin y reproduccin. La
unidad estructural y funcional de un sistema biolgico es la clula, cuyos
componentes son:
BIOELEMENTOS: son los elementos qumicos que mayoritariamente forman a los
sistemas biolgicos. Los bioelementos primarios constituyen el 95% de la materia
viva y son C, H, O, N, P, S.
Los bioelementos se asocian y dan lugar a las BIOMOLCULAS o PRINCIPIOS
INMEDIATOS:
Agua: componente mayoritario e
imprescindible de la materia
viva.
Sales minerales
Hidratos de carbono:
proporcionan energa inmediata
Lpidos: proporcionan energa a
largo plazo
Protenas: molculas con
informacin; responsables de los
caracteres
cidos nucleicos, ADN y ARN,
portadores de la informacin
gentica
Figura 18. Constitucin molecular de una clula bacteriana

METABOLISMO MICROBIANO:
__________________________________________________________________
Los microorganismos se encuentran en casi todos los ambientes e intervienen en
diversos procesos biolgicos. El crecimiento microbiano requiere la produccin de
macromolculas como protenas, cidos nucleicos, polisacridos y lpidos a partir
de elementos preformados en el medio de crecimiento o ser sintetizados por la
propia clula; y adems requiere de energa. Todo este proceso se designa con el
nombre de metabolismo, que no son sino las transformaciones qumicas de las
molculas nutritivas, dentro de la clula microbiana, a elementos que sern
utilizados para la sntesis de sus componentes estructurales.
Es evidente que los nutrientes son transformados cuando entran en un organismo,
ya que en ningn caso el alimento (sustrato) contiene todas las molculas que una
clula requiere. Esto se hace evidente, por ejemplo, al observar el crecimiento
normal de levaduras en un medio de cultivo que slo contiene glucosa como nica
fuente de energa. Hoy se conoce que las transformaciones que sufre la glucosa
no ocurren en un solo paso, sino que, por el contrario, se forman varios productos
intermedios que en muchas ocasiones no tienen una funcin especfica a no ser la
de formar parte de lo que se conoce como va metablica. La transformacin de
los nutrientes en compuestos tiles para la subsistencia de un organismo se lleva
a cabo por medio de las reacciones qumicas que realizan unas protenas
conocidas como enzimas.
Figura 19. Generacin y consumo de energa en el metabolismo microbiano.

Otra parte importante del metabolismo es la de transformar y conservar la energa
que est contenida en una reaccin qumica para ser empleada en los procesos
que requieran de energa, como puede ser el trabajo o el movimiento. La energa
liberada en las reacciones catablicas se usa para fosforilar ADP, generando ATP.

La energa almacenada en el ATP se utiliza en la mayora de los trabajos

celulares. Por lo tanto, el ATP acopla los procesos productores de energa de la
clula a los consumidores de energa. El metabolismo tiene lugar a travs de
secuencias de reacciones catalizadas enzimticamente, y se divide en anabolismo
y catabolismo. El proceso por el cual la clula bacteriana sintetiza sus propios
componentes se conoce como anabolismo, y como resulta en la produccin de
nuevo material celular, tambin se denomina biosntesis. La biosntesis es un
proceso que requiere energa, por lo tanto las bacterias deben ser capaces de
obtenerla de su entorno para crecer y, eventualmente, multiplicarse. El conjunto de
reacciones degradativas de los nutrientes para obtener energa o para convertirlos
en unidades se denomina catabolismo.
En resumen, el trmino metabolismo se refiere al conjunto de reacciones qumicas
que tiene lugar en la clula, y tiene tres funciones:
- Obtener energa qumica del entorno, almacenarla, para utilizarla luego en
diferentes funciones celulares,
- Convertir los nutrientes exgenos en unidades precursoras de los componentes
macromoleculares de la clula bacteriana,
- Formar y degradar molculas necesarias para funciones celulares especficas,
como por ejemplo, movilidad y captacin de nutrientes.
Figura 20. Clasificacin de los diferentes tipos nutricionales microbianos (a)

Figura 21. Clasificacin de los diferentes tipos nutricionales microbianos (b)
Figura 22. Clasificacin de los diferentes tipos nutricionales microbianos (c)

Curso de Biotecnología Ambiental-Epg 2016 - MRJ Parte I

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Figura 6. Diversidad de especies de protozoos en ambientes acuticos diversos.

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Figura 7. Diversos especmenes de diatomeas bentnicas.

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Principales hbitats que ocupan las algas

Pelgico Ms pobre, ms estructurado en tiempo y espacio

Epilticas Substrato rocoso

Bentos Epfitas Sobre hierbas marinas o sobre otras algas

Epiplicas Sobre sedimentos

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Plancton En hbitats continentales plancton y bentos estn menos

Perifiton Comunidades adheridas a objetos sumergidos

Pueden vivir a varios mm de profundidad y sobrevivir como

Simbiontes Ficobiontes liqunicos

Las algas son organismos esencialmente acuticos y poiquilohdricos, por tanto

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Caracteres Euglenofitas Criptofitas Dinofitas

Polisacrido de Paramilo Almidn Almidn

CIANOFITAS (Microalgas Procariotas, Cianobacterias)

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