Brbara C. P.

Figueiredo

SNTESE DE PROTENAS
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A traduo permite associar conjuntos de
nucleotdeos a aminocidos correspondentes

DIREO DA TRADUO

mRNA 5 3
Protena NH2 COOH
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A sntese de longas protenas requer uma
baixa frequncia de erros

PRECISO X RAPIDEZ

p = (1-)n
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A traduo permite associar conjuntos de
nucleotdeos a aminocidos correspondentes

G A V F Y W

L I P
A G Traduo K R H
S T C

C T M N Q D E

4 tipos de bases
20 tipos de aminocidos
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O cdigo gentico

3 nucleotdeos codificam
um aminocido

O cdigo
redundante
(ou degenerado)

Graa a essa redundncia os

efeitos deletrios das mutaes
so minimizados
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Determinao da janela de leitura

Janela de leitura = ORF Open reading frame

Numa sequncia aleatria, 1 a cada 20 cdons seria de terminao

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Um aminocido no pode, por si s,
reconhecer um cdon.
aa1 aa1

aa2 aa2
aa1
aa3
aa2 aa3

Molculas adaptadoras
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RNA mensageiro o molde para sntese das
protenas
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O RNA transportador

tRNA: molcula
adaptadora que se liga
especficamente a um
cdon, trazendo o
aminocido correspondente
para ser incorporado
cadeia polipeptdica.
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Estrutura Geral do tRNA
- Cada molcula uma cadeia nica,
contendo entre 73 e 93 ribonucleotdeos
(cerca de 25 kDa);

- Contm bases no usuais: derivados

metilados ou dimetilados de A, U, C e G;

- Cerca de 50% dos resduos so

pareados e formam hlices;

- Contm 5 regies no pareadas:

1) A regio terminal 3 CCA (ponta de
ligao ao aminocido)
2) A ala TC (ribotimidina-pseudo-
uridina-citosina)
3) O brao extra;
4) A ala DHU (di-hidrouracila);
5) A ala do anticodon
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Estrutura 3D do tRNA

(1974): Cristalografia e difrao de

raios X da fenilalanil-tRNA de fungo
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Estrutura 3D do tRNA - Estrutura em forma de L

- Existem dois segmentos de dupla

hlice;

-As alas DHU e TC formam a

quina do L.

- A maioria das bases nas regies

no helicoidais participa de
interaes incomuns de pontes de
hidrognio;

- O terminal 3 (CCA) que contm

o ponto de ligao ao aminocido
est em uma das pontas do L. Na
outra ponta, est a ala do
anticdon.
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Complexo aminoacil-tRNA
A formao da ligao peptdica entre dois aminocidos
termodinamicamente desfavorvel!

Ativao do aminoacil-tRNA

1) Aminocido + ATP Aminoaciladenilato (Aminoacil-AMP) + PPi

2) Aminoacil-AMP + tRNA Aminoacil-tRNA + AMP

Aminocido + ATP + tRNA Aminoacil-tRNA + AMP + PPi

2 ATP
aminoacil-tRNA sintetase
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Aminoacil-tRNA sintetases fazem a leitura do
cdigo gentico

A ligao de um determinado aminocido

a um determinado tRNA estabelece o
cdigo gentico

A ligao ao tRNA forma esteres de

aminocidos, que so ativados.

O grupo carboxlico de um aa ligado a

um grupo hidroxila (2 ou 3) da unidade
de ribose na poro 3 do tRNA
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Aminoacil-tRNA sintetases fazem a leitura do
cdigo gentico

Cada aminoacil-tRNA sintetase muito especfica para um

determinado aminocido;

Cada enzima apresenta mecanismos bastante especficos do

reconhecimento de determinado aminocido, evitando os demais.

Treonil-tRNA - possui um ionte zinco, de modo que a treonina

coordena-se com o zinco por seu grupo amina e a hidroxila da
cadeia lateral forma ligao de hidrognio com outro resduo de
aminocido da enzima. Assim, a poro cido fica disponvel
para ligao peptdica.
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Estrutura e mecanismo da treonil-tRNA sintetase

Treonina Valina Serina

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Estrutura e mecanismo da treonil-tRNA sintetase

Se ocorrer a ligao do aminocido

errado, a enzima pode edit-lo

Chance de erro: 1 em 10.000

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Estrutura e mecanismo da treonil-tRNA sintetase
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Alguns tRNAs podem transportar seus aminocidos
especficos para qualquer um de vrios cdons

Oscilao em alguns casos, o primeiro nucleotdeo de um

anticdon (extremidade 5) pode se parear com seu nucleotdeo
complementar normal na terceira posio do cdon ou com um
nucleotdeo diferente.
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As aminoacil-tRNAs sintetases podem ser
divididas em duas classes

Acilam a hidroxila 2 da adenosina terminal Acilam a hidroxila 3 da adenosina terminal

Monmeras Dmeras
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O RNA ribossmico

Estrutura Ribossomos Alta resoluo (cristalografia: 100.000 tomos)

RNAs constituem 2/3 da massa dos ribossomos (5S, 16S e 23S)

RNAs ribossmicos so enovelados em estruturas definidas, com

muitas regies dplices curtas
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O RNA ribossmico

30S 50S 70S

21 protenas + 1 RNA (16S) 34 protenas + 2 RNAs (23S e 5S)
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O RNA ribossmico
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A sntese de protenas envolve cinco etapas

1) Ativao de aminocidos
tRNA aminoacilado
2) Iniciao da traduo
mRNA e tRNA aminoacilado se ligam ao ribossomo
3) Elongamento
Ciclos de ligao de tRNA aminoacetilado se ligam para a
formao da ligao peptdicaat um STOP codon
4) Terminao e reciclagem do ribossomo
mRNA e protena se dissociam, o ribossomo reciclado
5) Dobramento e processamento ps-traducional
Catalisados por uma grande variedade de enzimas
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O sinal de comeo da traduo precedido
de regies iniciadoras
Sequncia de Shine e Dalgarno

Pareamento de bases do mRNA com a ponta 3 do rRNA 16 S

Pareamento do cdon de incio do mRNA com o anticdon de um tRNA

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A sntese de protenas em
bactrias iniciada pelo
Formilmetionil-tRNA

Formilao do metionil-tRNA:
Incio da sntese em E. coli
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Os ribossomos tm trs pontos de ligao com tRNA

Exit Peptidil Aminoacil

sada
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Os ribossomos tm
trs pontos de
ligao com tRNA
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Locais de ligao do tRNA nos ribossomos

Stio A (aminoacil) possui um

aminoacil-tRNA cujo anticdon
corresponde ao cdon no stio A

Stio P (peptidil) possui um

tRNA ligado cadeia
polipeptdica crescente

Stio E (sada) possui um tRNA

desacilado que est pronto para
ser liberado do ribossomo
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Alongamento em procariotos

fMet-tRNA ocupa o
local P.

O local A est vazio

Fator de Alongamento Tu se liga ao

aminoacil-tRNA formando um
complexo EF-Tu-aminoacil-tRNA e
o ribossomo
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Alongamento em procariotos
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Alongamento em procariotos

Com P e A ocupados uma

ligao peptdica formada

A enzima translocase (fator de

alongamento EF-G) fora a entrada de um
GTP no local A, obrigando ao tRNA e o
mRNA se moverem pelo ribossomo .
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Alongamento em procariotos

O tRNA desacilado
locado em E

Ficando livre para se

dissociar do ciclo

O peptidil tRNA est no

local P
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Alongamento em procariotos

Em eucariotos o
alongamento semelhante
Fatores de transcrio anlogos
No possui stio E
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Trmino da traduo

Os cdons de fim (UAA,

UAG e UGA) no so
reconhecidos por tRNAs,
mas sim por fatores de
liberao (RF)
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Trmino da traduo

realizado pelo fator de

liberao RF1

Uma molcula de gua entra no

centro peptiltransferase,
causando a liberao do
polipeptdeo do tRNA no stio P
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https://www.youtube.com/watch?v=7UcgXvjXJDs
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Enovelamento
- Pode ocorrer naturalmente assim que a cadeia polipeptdica
traduzida

- Ou exigir ajuda de chaperonas

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Antibiticos e toxinas inibem a sntese de
protenas
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RICINA
A ricina uma lectina presente nas sementes
da mamona (Ricinus communis), considerada uma das
mais potentes toxinas de origem vegetal conhecida.

Protena composta por duas subunidades:

1. um stio receptor especfico para um acar (galactose)
2. um stio inativador de ribossomo (inibe sntese proteica)
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RICINA
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POR HOJE S

H S T C
M K A