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Identificacin de DNA
1) Hidrlisis cida:
Se utiliza para romper los puentes de hidrogeno que unen a la doble hlice, mediante la
desnaturalizacin de la cadena. Para esto se utiliza cido clorhdrico (HCl), que es el componente
reactivo mas critico del mtodo, controlando la concentracin del cido, temperatura y tiempo,
que depende del tipo de tejido (compactacin de cromatina) y fijador empleado.
Durante la hidrlisis cida suave la mayor parte del RNA se divide en sustancias solubles y se pierde
del tejido, sin ser removidos los grupos ribosil debido a la presencia de un grupo hidroxilo en la
posicin 2' de la ribosa, por lo que, este material no reaccin posteriormente con el reactivo de
Schiff. Mientras tanto el DNA es parcialmente hidrolizado siendo removidas y liberadas las bases
pricas (A y G) de los residuos de deoxiribosa (depurinizacin) formando cido apurnico y
generando grupos aldehdo (CHO) en el C1 de la pentosa, donde se encontraba unida la base
nitrogenada.
Este es un paso crtico por lo que hay que tener en cuenta las variables de tiempo de exposicin a
la hidrlisis acida, pH ([ H+]) al que se lleve a cabo la reaccin, temperatura, el fijador utilizado en
el tejido y el grado de compactacin de la cromatina que depende de la naturaleza del tejido.
2) Tincin con Reactivo de Schiff:
Los grupos aldehdos liberados por la hidrlisis de Feulgen son teidos con reactivo de Schiff.
Cualquier grupo aldehdo libre endgeno y preexistente producido por el fijador (ej.
glutaraldehdo), tejido elstico inmaduro o algunos lpidos son removidos tratando el tejido con
boro hidrato de sodio antes de ser teido.
Los resultados son DNA (cromatina nuclear, cromosomas) teido color fucsia y fondo incoloro, en
el caso de que de que se utilice una coloracin de contraste como el Fast Green FCF el fondo sera
verde.
Para realizar una extraccin qumica de los cidos nucleicos se aplica un tratamiento para remover,
RNA pero no DNA, con una solucin de cido perclrico (HCIO4) al 10% a 4C por toda la noche. La
selectividad de este proceso, de extraccin qumica, se basa en la catlisis por cidos de la
hidrlisis de las uniones entre pentosas y bases, y entre pentosas y cido fosforito. En el caso del
RNA las uniones fosfato-ester son mas lbiles a la hidrlisis que en el DNA, por lo que, se extraen
mas fcilmente y de forma selectiva, mientras simultneamente remueve bases pricas y
pirimidicas del DNA permitiendo ser teidos sus cidos nucleicos posteriormente con reactivo de
Schiff.
Bibliografa: Histological and Histochemical Methods, Theory and Practice, J.A. Kiernan, Third
Edition, 1999.