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Se acepta ahora generalmente que la 'dogma central genoma' (es decir, una cadena causal que va de ADN a ARN a las protenas y aguas abajo de las
funciones biolgicas) debe sustituirse por el 'dogma genoma fluido', es decir, complejo de alimentacin de alimentacin hacia adelante y ciclos -back ese
organismo de interconexin y el medio ambiente por la programacin epigenmico y la reprogramacin durante toda la vida y en todos los niveles, a veces
tambin de generacin en generacin. La programacin epigenmico es la suma neta de interacciones derivados de metabolismo propio y microbiota, as
como factores externos tales como la dieta, productos farmacuticos, compuestos ambientales, y as sucesivamente. Es un cuerpo creciente de resultados
que indican que muchos metablica crnica y trastornos degenerativos y enfermedades
llamado a menudo
'enfermedades de la civilizacin' se inician y / o influido sobre por programacin epigenmico no ptima, a menudo
que tiene lugar temprano en la vida. En este contexto, los primeros 1.000 das de vida desde la concepcin en la primera infancia a menudo se llama
el perodo ms importante de la vida. Las siguientes secciones presentan algunos mecanismos principales para la programacin epigenmico as
como algunos factores asumidos para ser de importancia. La necesidad de ms informacin sobre propio genoma y metagenoma, as como una
considerable falta de informacin adecuada sobre las bases de datos dietticos y ambientales tambin se comentan. Sin embargo, el mero hecho de
que podemos influir en la programacin de salud epigenmico abre el camino para intervenciones profilcticas y teraputicas. Los autores subrayan
la importancia de crear un 'microbiota intestinal humana y la Plataforma epigenmica' con el fin de facilitar la colaboracin interdisciplinaria entre los
cientficos y los mdicos que participan en la ecologa microbiana de acogida, la nutricin, la metagenmica, epigenomics y metabolmica, as como
en la epidemiologa de la enfermedad,
palabras clave: programacin epigenmico; microbiota intestinal; mitocondrias; metabolismo energtico; alimentos y bioactivos microbiana molculas; la conservacin de las heces
* Correspondencia a: Boris A. Shenderov, Mosc Instituto de Investigacin de Epidemiologa y Microbiologa despus GN Gabrichevsky,
Mosc, Rusia, e-mail: shenderof@yandex.ru
Recibido: 20 Febrero 2014; Revisado: 17 Marzo 2014; Aceptado: 1 Abril 2014; Publicado: 8 de Mayo 2014
yo publicado su artculo sobre la estructura del ADN (1), que era un axioma
generalmente
n las aceptado que la informacin
dcadas posteriores biolgicamente
a Watson y Crick importante slo
en 1953 tuvieron
poda fluir de ADN a travs del ARN a las protenas y prcticamente nada se
importante en la configuracin del genoma de fluido en eucariotas (3, 4). Hoy en
da, un ser humano se describe a menudo como un 'superorganismo', que
consiste en un consorcio de gran nmero de representantes de los virus, Eukarya,
podra aadir desde el exterior. Sin embargo, en los ltimos aos del siglo bacterias y Acaya. En trminos de nmero de clulas, los seres humanos adultos
pasado, un creciente cuerpo de resultados indica un 'intrincada diafona entre son ms procariota que eucariota con 90% de nuestras clulas que se estima ser
el organismo y su entorno en todos los niveles, con ciclos de alimentacin de microbiana, y slo el 10% de origen humano (5). Adicin de bacterifagos al
hacia adelante y de retroalimentacin en la epigentica y red metablica de nmero, las clulas humanas pueden ser responsables de menos del uno por mil.
Ecologa microbiana en Salud y Enfermedad 2014. # 2014 Boris A. Shenderov y ToreMidtvedt. Este es un artculo de acceso abierto distribuido bajo los trminos de la licencia de Atribucin-No comercial 3.0 Unported 1
(http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/), permitiendo todo uso no comercial, distribucin y reproduccin en cualquier medio, siempre que la obra original est debidamente citados.
epigenomics y metaepigenomics, que describe cmo ciertos genes en porque ayuda a explicar la relacin entre el individuo gentico fondo, el
clulas eucariotas y procariotas se enciende o se apaga sin envejecimiento, el estilo de vida y el medio ambiente, y porque cualquier
alteraciones en la secuencia de nucletidos de ADN;
perturbacin en la epigenotipo pueden dar lugar a trastornos de salud.
procesos epigenmicos regulan cundo y cmo ciertos genes se enciende
transcriptmica, que mide los niveles de ARNm de transcripcin;
o se apaga sin alteraciones en la secuencia de nucletidos de ADN. La
2 ( no el nmero de pgina para el propsito de la citacin) Cita: Ecologa Microbiana en Salud y Enfermedad de 2014, 25: 24145 - http://dx.doi.org/10.3402/mehd.v25.24145
programacin epigenmico
ha presentado en algunos papeles y las revisiones recientes (8, 19, T capaces 1. Principales participantes y potenciales inductores de alteraciones epigenmicos
anfitrin
21, 28 35).
ADN epigenmica y remodelacin de la cromatina estn estrechamente
Los donantes de la diana afectan a los grupos o sustancias
relacionados con los procesos de produccin de energa y con los niveles de la
S- adenosil metionina grupo metilo
ingesta calrica total en clulas eucariotas y procariotas en un superorganismo.
Acetil-CoA grupo acetilo
Las mitocondrias, adems de la produccin de energa y el aumento de las
Nicotinamida adenina dinucletida grupo ribosil ADP
especies de oxgeno, tener varios mecanismos bioqumicos por los que
(NAD )
participan en la modificacin epigentica del genoma nuclear, la alteracin de la
La adenosina trifosfato (ATP) grupo fosfato
metilacin del ADN, remodelacin de la cromatina, la formacin y expresin de
coenzima Q ubiquinona
microARN (32, 36 38). Es bien sabido que las clulas procariotas y eucariotas
biotina biotina
comparten vas comunes para la produccin de energa, especialmente en el
Los nucletidos, doble o de cadena sencilla microARN
ciclo de Krebs (39, 40). Esto significa que en organismos de mamferos,
ARN
mitocondrias y microbiota humana debe considerar para ser tanto una
Algunas enzimas que intervienen en mquinas epigenmicos
metablicamente activo 'rgano' interna colectiva que afecta el metabolismo
De ADN y ARN y las histonas methyltransferases; desmetilasas; acetiltransferasas,
energtico del husped (39
desacetilasas; ribosyltransferases, hidrolasas; fosfotransferasas, quinasas; Bir una
menaquinona-K2), nonvitamins (NAD, NADH, NADP , NADPH), trifosfato de programacin epigenmico de genoma de la clula y la modificacin
adenosina (ATF), la citidina trifosfato (CTP), S- postraduccionales de los productos gnicos son mecanismos esenciales en el
desarrollo y la vida postnatal de organismos eucariotas superiores (regulacin de la
adenosil metionina (SAM), 3? fosfoadenosina-5? fosfosulfato (PAPS), el expresin gnica, el silenciamiento elementos de ADN repetitivo, la proliferacin
glutatin (GSH), Coenzima celular, eventos de estrs celular, el envejecimiento y la reparacin del ADN,
B, coenzima M, Cofactor F-430, la coenzima Q10, hemo, cido alfa derivas circadianos de toda la vida, equilibrio entre la mitosis y la apoptosis,
lipoico, metanofurano, molybdopterin / cofactor de molibdeno, modificacin de la deteccin de qurum bacteriano y clula husped, husped /
pirroloquinolina quinona (PQQ), tetrahidrobiopterina (THB / BH4), bacteria crosstalk) (8, 54). programacin similar tambin tiene lugar en procariotas
(THMPT / H4MPT), minerales (Ca, Cu, Fe , Fe , del ADN, la reparacin del ADN, la variacin de fase) (18).
Mg, Mn, Mo, Ni, Se, Zn), aminocidos (arginina, lisina, metionina,
cistena, segundo- alanina, serina, treonina, histidina, triptfano, cido
asprtico), cidos orgnicos ciclo de Krebs y algunos nucletidos plasticidad del desarrollo epigentico permite que un organismo se adapte a
(pirimidina), miRNA (26, las seales ambientales, especialmente durante la vida temprana; aumentando
36, 39, 42, 43). as su propia 'aptitud'. Sin embargo, tambin puede aumentar el riesgo de
investigaciones moleculares de procesos-epigenmicos asociado han crnica, especialmente metablico, enfermedades. alteraciones epigenticas de
demostrado (8, 18, 30, 42, 44 46) que la mayora de los participantes principales en la cromatina y las histonas feto podran ser heredados y afectan a la salud de
la maquinaria epigenmico (Tabla 1) se forman durante el metabolismo de la las generaciones futuras. Hay varias combinaciones de ADN diseaselinked,
energa en las mitocondrias de clulas eucariotas y en las membranas de las microARN y la cromatina y modificaciones de las histonas que difieren segn el
mi programacin pigenomic y son ms pronunciados en el embarazo y primeros aos de vida (8, 18, 28 30,
organismos en desarrollo parecen ser particularmente susceptibles a cambios 48, 49). Los productos alimenticios, adems de agua, contienen gran cantidad de
epigenticos. Durante la embriognesis temprana, themammalian genoma se diversos andmicronutrients macro. En diferentes compartimentos GI, estos
'limpia' ofmost marcas epigenticas, y luego un proceso de 'programacin componentes pueden ser accionados por host- y factores microbiota derivados
epigentica' (y reprogramacin) comienza la construccin de fenotipos (por ejemplo, enzimas, lectinas). Dependiendo de las condiciones fsicas (pH,
individuales (27, 47). Estos procesos estn influenciados por muchos tipos de potencial redox,
la tensin de oxgeno) y la microbiota presentado en los diversos compartimentos, T capaz 2. Algunos componentes bioactivos de los alimentos y / o microbiano que afecta a
procesos epigenticos
se pueden formar una larga serie de nuevos compuestos (55). Adems, se
establecen muy rpida dieta microbiota transversales conversaciones (56).
Pectinas, oligosacridos, segundo- glucanos B1, B2, B6, B12, C, E, D-3, biotina, flico,
Ambos compuestos primarios y secundarios o bien pueden ser absorbidos o
pantotnico, nicotnico,
excretados en las heces. Cuando se absorbe, muchos de ellos pueden interferir
cidos ortico, colina, betana selenio, magnesio, potasio, zinc, yodo, cobalto,
con la programacin epigenmico, as como tener un valor nutricional ms
hierro,
directa. Una demanda dependiente de la edad de muchos micronutrientes es bien
yodo, calcio, manganeso, cobre piruvato, citrato, lactato, un- cetoglutarato, succinato,
conocida; Del mismo modo, parece que hay una 'ventana' dependiente de la edad
butirato,
para la programacin epigenmico (57).
propionato de arginina, lisina, metionina, cistena, segundo- alanina, serina,
dividir en varios grupos: precursores metablicos o cofactores, compuestos global. En la Tabla 3, los datos con respecto a los minerales y tambin escasez
bioactivos, molculas de sealizacin puros, productos metablicos y molculas similares que se encuentran con respecto a muchos otros compuestos se presenta (14,
que poseen simultneamente metablico y la actividad de sealizacin. Sus 58, 68, 69).
efectos pueden ser expresadas en diferentes niveles de acogida: molecular, en el alteraciones epigenticas associatedwith desequilibrio de la dieta y la
interior de la clula, matriz intercelular, rganos y sistemas fisiolgicos. Ellos son microbiota intestinal simbitica podran ser heredados y afectan a la salud de las
capaces de activar / desactivar genes a travs de la interaccin directa con ADN generaciones futuras. Ahora es evidente que los nutrientes de los alimentos y
especfico, ARN, o los receptores de la cromatina o el uso de diversas quinasas u compuestos bioactivos de origen microbiota anfitrin desempean los papeles
otras vas-epigenmicos asociado correspondiente. crticos en la vida de una persona durante una estrecha ventana de tiempo, es
decir, los 1000 das comenzando en la concepcin y continuando hasta el segundo
ao de vida (18, 30 , 70 74). Durante este perodo, un desequilibrio en la
El siguiente ejemplo puede reflejar la complejidad: alimentos o alimentacin y / o microbiota puede dar lugar a sombras 'desarrollo' ms tarde en
microbiano derivado de cido flico, colina, betana y / o vitamina B 12 contribuir la vida, como se indica en algunos de los siguientes ejemplos. Resultados
a la generacin de 6-metiltetrahidrofolato que proporciona el grupo metilo recientes indican que
para la sntesis de
4 ( no el nmero de pgina para el propsito de la citacin) Cita: Ecologa Microbiana en Salud y Enfermedad de 2014, 25: 24145 - http://dx.doi.org/10.3402/mehd.v25.24145
programacin epigenmico
La cantidad necesaria de Nmero de personas (mil millones) con cantidad microelementos (mg / kg) en
subalimentacin o comer en exceso en las mujeres embarazadas y nios (30), el tiempo es obvia, as como la necesidad de que los datos de las
su larga la alimentacin con alimentos ricos en grasa enriquecida (22, 23, 30, cohortes que viven en otras fuentes de hidratos de carbono (82, 83); ms
75), la alimentacin de lactantes y nios con dieta dficit de protenas (23, 30, informacin tambin es necesaria sobre la microbiota intestinal en varios
76), as como una dieta con ciertas deficiencias de nutrientes (22, 30) o el compartimentos. Adems, la aceptacin de los de toda la vida cruzadas
consumo de alcohol crnico (22) tienen un impacto negativo en el programa conversaciones que tienen lugar entre un host y su microbiota y la
epigenmico de desarrollo que resulta en trastornos epigenmicos especficos adaptabilidad de la microflora a la comida local o regional, hay que
generales o locales, lo que influye en la expresin gnica y el desequilibrio empezar a pensar en la sostenibilidad de la microbiota intestinal en
metablico riesgode ms tarde en la vida. cohortes de personas que no viven en un 'occidentalizada dieta', y se
debe intentar investigar o al menos salvar las heces de los grupos de
personas que viven en tales alimentos. Como el primer intento, las obras
Por el contrario, los alimentos para bebs y madres que contienen
deben comenzar a recopilar y almacenar heces de cohortes de personas
compuestos suficientes para una adecuada programacin epigenmico se supone
que no viven en una dieta 'occidentalizada'. Un lugar adecuado para el
que son de importancia para la salud ms adelante en la vida (18, 27, 77 81). Sin
almacenamiento podra ser la ONU Global SeedVault en Svalbard,
embargo, como se destaca por Park et al. (77), en este campo, 'hay mucho por
Noruega, o, si eso resulta ser difcil, novela, organizado especialmente
hacer que tiene un gran potencial para producir resultados con una importante
libre de Cryobank Internacional de humanMicrobiocenoses naturales debe
implicacin de salud pblica'.
ser establecido. En el futuro, estas muestras pueden darnos instrucciones
valiosas si queremos volver a la lnea de base de nuevo.
de producto qumico, mientras que la poblacin humana, incluidas las mujeres impresionados por nuestra relativamente poco inters en este importante campo.
embarazadas y lactantes, estn expuestos a una multiplicidad de productos Si no estamos aumentando nuestros esfuerzos, vamos a ser visto como si
qumicos y el efecto (s) aditivo son mucho menos investigado. El acetaminofeno estamos siguiendo un enfoque desde la Francia prerrevolucionaria:
(paracetamol la mayor parte
R eFERENCIAS
1) La identificacin de epigenticamente regin 'sensible' en el genoma
humano. 1. Watson JD, Crick FH. Estructura molecular de los cidos nucleicos; una estructura para los
epigentica relacionada con el compuesto puede tener lugar. 3. Bry L, Falk PG, Midtvedt T, Gordon JI. Un modelo de las interacciones microbianas
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F metas y problemas UTURO
ecosistema gastrointestinal: lo que sabemos y necesitamos saber de Gnotobiology.
En la actualidad, la salud para todos durante toda la vida no es ms que un sueo. Sin
Microbiol Mol Biol Rev 1998; 62: 1157 70.
embargo, aceptar el axioma genoma fluido y el postulado de que muchos desastres y
enfermedades de la civilizacin son 'hombre de influencia', se nos ha dado la oportunidad de 5. historia Lederberg J. infecciosa. Ciencia 2000; 288: 287 93.
interactuar. Trabajando en paralelo en las tareas descritas anteriormente, el desarrollo de 6. Tuohy KM, Gougoulias C, Shen D, Walton G, Fava F, Ramnani P. El estudio de la
alimentos funcionales representa metas alcanzables. Sin duda, 'no hay comida para todos'. Por microbiota intestinal humana en el transomics era-enfoque en metagenmica y
lo tanto, los alimentos funcionales basados microbiota-epigentica-nutria-epigentica y metabonmica. Curr Pharm Des 2009; 15: 1415 27.
especializados tienen que ser desarrollados (18, 63, 78, 79, 91). La intencin es tener alimentos
7. Nicholson JK, Holmes E, Kinross J, Burcelin R, Gibson G, Jia W, et al. Anfitrin microbiota
funcionales especializadas edad y relacionados de cohortes que afectan positivamente a grupos
intestinal interacciones metablicas. Ciencia 2012; 336: 1262 7.
especficos de hosts que resulta en una disminucin o eliminacin de las consecuencias
negativas causadas por los factores descritos anteriormente. Atencin debe centrarse en los 8. Shenderov BA. '' OMIC '' - tecnologas y su importancia en la medicina profilctica y
alimentos a las mujeres embarazadas y lactantes, y en estos campos, Se han prestado mucha regenerativa actual. Regenerativa Med J 2012; 3: 70 8. (en ruso).
atencin al concepto de probiticos. En animales de laboratorio, est bien establecido que los
9. Collins CD, Purohit S, Podolsky RH, Zhao SA, Schatz D, Eckenrode SE, et al. La
probiticos pueden realizar la programacin epigenmico y algunos resultados indican que este
aplicacin de las tecnologas de genmica y protemica en la medicina predictiva,
es el caso tambin en los seres humanos (92). Sin embargo, las reglas para tales estudios no
preventiva y personalizada. Vascul Pharmacol 2006; 45: 258 67.
se describen en las guas recientes (93). El mero hecho de que la mayora de los desastres de
la civilizacin y las enfermedades aumentan la incidencia subrayan la importancia de la 10. O'Flaherty S, Klaenhammer TR. El impacto de las tecnologas micas en el estudio de
coordinacin de los efectos en el establecimiento de una plataforma internacional 'microbiota los microbios de los alimentos. Annu Rev Food Sci Technol 2011; 2: 353 71.
descendientes sern est bien establecido que los probiticos pueden realizar la programacin 12. Yeoman CJ, Thomas SM, Berg Miller ME, Ulanov AV, Torralba M, Lucas S, et al. Un
epigenmico y algunos resultados indican que este es el caso tambin en los seres humanos enfoque basado en sistemas multi-micas revela marcadores metablicos de la
(92). Sin embargo, las reglas para tales estudios no se describen en las guas recientes (93). El vaginosis bacteriana y una visin de la enfermedad. PLoS One 2013; 8: e56111. doi:
mero hecho de que la mayora de los desastres de la civilizacin y las enfermedades aumentan
10.1371 / journal.pone.oo56111.
la incidencia subrayan la importancia de la coordinacin de los efectos en el establecimiento de
13. Zempleni J, Wijeratne SS, Hassan YI. Biotina. Biofactores 2009; 35: 36 46.
una plataforma internacional 'microbiota intestinal humana y Epigenmica' que facilita la
colaboracin interdisciplinaria entre los cientficos y los mdicos que participan en la ecologa 14. Shenderov BA. Los alimentos funcionales en la profilaxis del sndrome metablico.
microbiana de acogida, la nutricin, la metagenmica, epigenomics , e investigaciones metabolmica, as como enMosc: DeLi de impresin;
la epidemiologa 2008, 319 p.la(en
de las enfermedades, ruso). y el tratamiento. No es razonable pensar que nuestros de
prevencin
6 ( no el nmero de pgina para el propsito de la citacin) Cita: Ecologa Microbiana en Salud y Enfermedad de 2014, 25: 24145 - http://dx.doi.org/10.3402/mehd.v25.24145
programacin epigenmico
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8 ( no el nmero de pgina para el propsito de la citacin) Cita: Ecologa Microbiana en Salud y Enfermedad de 2014, 25: 24145 - http://dx.doi.org/10.3402/mehd.v25.24145