Universidad Politcnica de Victoria

Maestra en Ingeniera Mecatrnica

PROTOCOLO DE TESIS DE POSGRADO

SISTEMA COMPUTACIONAL PARA LA

GENERACION DE CARIOTIPOS AUXILIAR
EN EL DIAGNOSTICO TEMPRANO DE
ENFERMEDADES GENETICAS

Alumno:
Ing. Eddie Nahm Armendriz Mireles

Asesor de Tesis:
Dr. Yahir Hernndez Mier

Co-Asesor de Tesis:
Dr. Marco Aurelio Nuo Maganda
Cd. Victoria, Tam. /Agosto 2010

p g. 1
 II. ANTECEDENTES:
La Gentica mdica es la rama de la medicina que se encarga del estudio de
las diferencias en la raza humana, diferencias tanto en la estructura gnica,
como en la expresin de dicha informacin de individuo en individuo, la cual ha
tenido un desarrollo muy importante en los ltimos aos a partir del
reconocimiento de su importancia a mediados del siglo pasado con sus
diferentes divisiones: Gentica clnica, Citogentica, Gentica molecular,
Gentica de poblaciones, etc.

La aplicacin fundamental de la Gentica mdica se da en el diagnstico de

enfermedades complejas y anteriormente consideradas poco comunes que
ocurren en la poblacin general; con la finalidad de instaurar el tratamiento y
seguimiento del paciente, lo cual repercutir en una reduccin de
complicaciones y un alargamiento en la vida productiva y econmicamente
activa del individuo, adems de la prevencin de ms casos dentro de la familia
diagnosticados a travs del asesoramiento gentico y en su defecto por el
diagnstico prenatal especifico.

En el cariotipo se pueden realizar diversas observaciones en los cromosomas,

el cariotipo es un esquema, foto o dibujo de los cromosomas de una clula
metafsica ordenados de acuerdo a su morfologa (metacntricos,
submetacntricos, teocntricos, subtelocntricos y acrocntricos) y tamao,
que estn caracterizados y representan a todos los individuos de una especie.
El cariotipo es caracterstico de cada especie, al igual que el nmero de
cromosomas; el ser humano tiene 46 cromosomas (23 pares porque somos
diploides o 2n) en el ncleo de cada clula,1 organizados en 22 pares
autonmicos y 1 par sexual (hombre XY y mujer XX).Cada brazo ha sido
dividido en zonas y cada zona, a su vez, en bandas e incluso las bandas en
subbandas, gracias a las tcnicas de marcado.

p g. 2
No obstante puede darse el caso, en humanos, de que existan otros patrones
en los cariotipos, a lo cual se le conoce como aberracin cromosmica.

Mediante el cariotipado se pueden analizar anomalas numricas y

estructurales, cosa que sera muy difcil de observar mediante gentica
mendeliana.

Los programas computacionales comerciales actualmente utilizados para

realizar cariotipos, no permiten la modificacin o adaptacin de sus funciones
de procesamiento y los usuarios deben limitarse a las funciones programadas
por la compaa

Algunos de los programas computacionales comerciales utilizados actualmente

para estudios de cariotipos son:

El programa VideoTesT-Karyo ha utilizado exitosamente en gentica humana,

animal y vegetal, para anlisis de cromosomas y cariotipos.

MCID Core es un software de procesamiento digital de imgenes. MCID Core

puede ser optimizado y configurado para aplicaciones individuales basados en
las necesidades especficas de los usuarios. Requiere de una Cmara de
apoyo que tiene que ser compatible como el CoolSNAP o rango Qimaging.

AxioVision. Es un software de edicin digital de imgenes y procesamiento de

imgenes digital, requiere camara digital Zeiss y filtros compatibles.

p g. 3
 III.JUSTIFICACIN:

Este proyecto se realiza en colaboracin con personal del rea de Citogentica

del Hospital Infantil de Tamaulipas (HIT). Un cariotipo es un esquema o
imagen de los cromosomas de una clula metafsica ordenados de acuerdo a
su morfologa y tamao. Algunos ejemplos de anomalas cromosmicas que se
han detectado en el HIT son el Sndrome de Turner, de Klinefelter, de Betwith-
Wiedeman, de Down y de Prader Willi. Todos estos sndromes son altamente
discapacitantes y reducen la calidad y el tiempo de vida de las personas
afectadas. Los anlisis cromosmicos se realizan a partir de una muestra de
sangre o de tejido que es teida o fotografiada mediante una cmara adaptada
a un microscopio. A partir de la fotografa tomada, un experto puede separar y
organizar los cromosomas de acuerdo a su forma y tamao. Esta tarea
requiere de varios das para ser completada. Debido a la gran cantidad de
tiempo requerido para la realizacin de este estudio se han comercializado
herramientas computacionales que permiten reducir el tiempo de realizacin de
un cariotipo. El costo de estas herramientas es muy elevado ( alrededor de
250,000.00 pesos, solamente el software de procesamiento, segn una
cotizacin facilitada por el personal del HIT ) y estn desarrolladas bajo cdigo
cerrado, lo que no permite su adaptacin a las necesidades del usuario final.
Actualmente, el departamento de citogentica del HIT realiza estudios basados
en cariotipos, que son obtenidos en forma manual, lo que acarrea tiempos de
diagnostico prolongados y consecuentemente un nmero reducido de estudios
por mes.

Los mdicos de las reas de Gentica, Oncologa y Hematologa del HIT, en

reuniones con los profesores investigadores de la Universidad Politcnica de
Victoria ( UPV ) han expresado que la falta de un equipo que facilite el
procesamiento de imgenes automatizadas y de tcnicas que contribuyan a la
emisin de diagnsticos mas precisos, hace que los pacientes con
enfermedades genticas hemato-oncologoicas como las leucemias, tengan que
ser referidos a centros hospitalarios forneos que cuentan con equipo
especializado para el anlisis genticos, lo que implica un alto impacto
econmico en traslado y pago de servicios para los pacientes.

p g. 4
As mismo, expresaron que esta referencia de pacientes a laboratorios
externos especializados podra disminuir si el Laboratorio de Citogentica del
HIT contara con un sistema que generara cariotipos en forma automatizada,
adems de que se podra atender a un mayor nmero de pacientes por mes.

p g. 5
 IV. DESCRIPCION DEL PROBLEMA:

Mediante el cariotipado se pueden analizar anomalas numricas y

estructurales, cosa que sera muy difcil de observar mediante gentica
mendeliana. Las anomalas numricas, tambin conocidas como aneuploida,
hacen referencia a cambios en el nmero de cromosomas, que pueden dar
lugar a enfermedades genticas. Las anormalidades estructurales a menudo se
derivan de errores en la recombinacin homloga. Ambos tipos de anomalas
pueden ocurrir en los gametos y, por tanto, estarn presentes en todas las
clulas del cuerpo de una persona afectada, o puede ocurrir durante la mitosis
y dar lugar a mosaicos genticos individuales que tiene normal y anormal
algunas clulas.

Estos anlisis cromosmicos se realizan a partir de una muestra de sangre

(glbulos blancos), de biopsias prenatales o de alguna muestra de tejido. Para
poder observar los cromosomas con un microscopio, la muestra de sangre o
tejido debe ser teida y posteriormente fotografiada. A partir de esa fotografa,
un experto puede separar y organizar los cromosomas de acuerdo a ciertas de
sus caractersticas. Esta tarea es realizada en un lapso de tiempo
considerablemente grande (varios das). El experto puede determinar si existe
alguna enfermedad gentica mediante la sola observacin del cariotipo.

Debido a la gran cantidad de tiempo que implica la realizacin de este estudio,

se han desarrollado diferentes herramientas computacionales que permiten
reducir el tiempo de realizacin de un cariotipo. Sin embargo, el costo de estas
herramientas es muy elevado y estn desarrolladas bajo cdigo cerrado, lo que
no permite su adaptacin a las necesidades del usuario final.

Actualmente, el departamento de citogentica del Hospital Infantil de

Tamaulipas realiza estudios genticos basados en cariotipos efectuados en
forma manual, lo que implica tiempos de diagnstico muy elevados y
consecuentemente, un nmero de estudios por mes reducido.

p g. 6
Con este desarrollo de tesis se propone desarrollar un sistema computacional
con una interfaz de usuario amigable, que genere cariotipos sin intervencin
humana a partir de imgenes obtenidas en microscopia convencional y auxilie
en el diagnstico temprano de enfermedades genticas.

Este sistema sera completamente adaptable a las necesidades particulares del

hospital donde se utilice. Una herramienta de este tipo permitir atender una
mayor cantidad de pacientes con posibles anomalas genticas en un tiempo
notoriamente menor al que le tomara realizarlo a un experto en forma manual.

p g. 7
 V. FUNDAMENTACION TEORICA:

El inters por los mtodos de tratamiento digital de imgenes deriva de dos

reas principales de aplicacin: la mejora de la informacin pictrica para la
interpretacin humana y el procesamiento de datos de la escena para la
percepcin autmata por una maquina, de estas dos reas tomamos el
tratamiento de imgenes y manejo de datos para utilizarlo en una aplicacin de
tipo software capas de filtrar y restaurar imgenes de una calidad ntida y
definida.

Con respecto a las tcnicas de procesamiento y anlisis de imgenes que

sern exploradas para el desarrollo del proyecto, se consultaran referencias
bibliogrficas comunes que contienen informacin de operadores y algoritmos
para procesar y analizar imgenes. Por ejemplo, en [3], se tratan fundamentos
y tcnicas relacionadas con el anlisis y procesamiento de imgenes desde
una perspectiva general. En relacin al anlisis y procesamiento de imgenes
aplicadas a imgenes de microscopia, en [4] se reportan un conjunto de
tcnicas generales que han dado muy buenos resultados para esa clase
particular de imgenes. Con respecto al anlisis de imgenes de cromosomas
y obtencin de cariotipo, se han reportado soluciones desde enfoques muy
variados. Uno de los enfoques ms importantes es el enfoque basado en
clasificacin [5], [6], en donde se intenta segmentar los cromosomas utilizando
herramientas de aprendizaje automtico. Un enfoque comnmente utilizado
est basado en redes neuronales artificiales [7],[8], en donde se aplica un
conjunto de operadores de procesamiento de imagen y la clasificacin de los
cromosomas se realiza mediante una red neuronal. El mejoramiento de la
imagen es una etapa de procesamiento digital en donde se aplican un conjunto
de operadores que permiten eliminar el ruido de la imagen derivado del
proceso de adquisicin, as como la realizar ciertas correcciones a la
iluminacin [9].

p g. 8
La segmentacin es tambin una fase importante del procesamiento que debe
ser aplicado a las imgenes, en donde la finalidad es la separacin de regiones
de inters, cromosomas en nuestro caso, del resto de la imagen [10], [11], [12],
[13], [14], [15]. Se han puesto tambin tcnicas de segmentacin basadas en la
transformada Wavelet [16], [17].

La restauracin consiste en corregir la degradacin sufrida por una imagen, La

degradacin de una imagen se puede modelar mediante una funcin de
transformacin lineal y un ruido, El algoritmo de restauracin permite obtener
una estimacin de la imagen original.

La segmentacin de imgenes sub-divide una imagen en sus partes

constituyentes u objetos. Los algoritmos de segmentacin de imgenes
monocromticas se basan en una propiedad de los valores de nivel de gris:
discontinuidad y similaridad, la primera consiste en cambios bruscos de nivel
de gris, los principales reas de inters de esta categora son la deteccin de
puntos aislados y la deteccin de lneas y bordes de una imagen.

La segunda categora est basada en la umbralizacin, crecimiento de regin,

y divisin y fusin de regiones.

Los cromosomas se clasifican de acuerdo a su morfologa, tamao, forma,

distribucin de bandas, posicin del centrmero, conteo.

Para la clasificacin se aplicaran tcnicas de histogramas para ver tamao y

bandas, para ver la forma se aplicara tcnicas de puntos y bordes, la tcnica de
segmentacin mediante un vector horizontal permitir obtener el punto ms
reducido para llegar a la , posicin del centrmero.

La clasificacin estndar hoy da se toma en base a una tabla comparativa de

cromosomas y esta misma se utilizara cuando se tengan separadas y filtradas
contadas y listas para el experto medico.

p g. 9
Finalmente, existen algunas herramientas de desarrollo de cdigo libre que
incluyen un marco de trabajo que representa una alternativa importante con
respecto al software comercial. Con estas herramientas es posible desarrollar
proyectos de investigacin interesantes sin que esto represente un desembolso
significativo para las instituciones participantes. Una alternativa de
herramientas de cdigo libre es el OpenCV ( Open Computer Vision), la cual es
una biblioteca multiplataforma libre que contiene una gran cantidad de
operadores de procesamiento digital de imgenes. Con respecto a esta
herramienta, [18],[19],[22] es una herramienta bibliogrfica muy importante
dado que la documenta ampliamente el uso de los componentes de la
biblioteca.

p g. 10
a) b) c)

fig. a) Tcnica donde se segmenta por medio de un vector horizontal y con su

punto mnimo en la regin central que est marcado con un crculo. b) Tcnica
donde se tiene la longitud y densidad media, por medio de la Distribucin
Pxeles. c) Tcnica donde se tiene el grosor, posicin y cantidad de las bandas
del cromosoma, por medio de la Distribucin Pxeles a lo largo del cuerpo
(oscuro/blanco/oscuro/etc).

d) e)

fig. d) Tcnica donde se tiene la longitud de un contorno, se cuentan los

pixeles a lo largo y ancho del cuerpo y se reduce en promedio para obtener
una lnea de aproximacin al original. e) Tcnica para obtener la Regio del
cuerpo, por medio de una Distancia de la curva al punto de cruce (arriba) y la
curvatura del borde de una superposicin.

p g. 11
fig. f) Tcnica donde se tiene la longitud y densidad media y su contorno para
cuando tenemos cromosomas encimados, por medio de dos coincidencias
simples y una superposicin.

fig. g) Tcnica en degradacin de una imagen se puede modelar mediante una

funcin de transformacin lineal y un ruido.

fig. h) Tcnica consiste en estimar la funcin de transformacin lineal H en el

modelo y posteriormente calcular la estimacin de la imagen original mediante
el Filtrado Inverso.

VI. HIPTESIS Y OBJETIVOS:

p g. 12
HIPTESIS:
Un sistema para la realizacin automtica de cariotipos, a partir de imgenes
de cromosomas adquiridas en la prctica clnica y basado en tcnicas de PDI,
puede arrojar resultados comparables a los obtenidos por un experto y en un
tiempo menor.

OBJETIVO GENERAL:

Desarrollar un sistema computacional flexible, amigable para el usuario, que

sea capaz de generar cariotipos automticamente aplicando algoritmos de
procesamiento digital en imgenes obtenidas en procedimientos
citogenticas estndar, cuyos resultados de clasificacin sean similares a
los obtenidos por un experto, y que sea auxiliar en el diagnstico temprano
de enfermedades genticas.

OBJETIVOS PARTICULARES:

i. Investigar tcnicas de mejoramiento (filtrado y compensacin de la

iluminacin) de imgenes de cromosomas adquiridas en gentica,
para desarrollar un software utilizable en el ambiente hospitalario.

ii. Investigar los mtodos de segmentacin y clasificacin de

estructuras en imgenes para lograr producir un software que realice
el cariotipo automtico de los cromosomas segmentados.

iii. Construir un sistema automatizado para la realizacin de cariotipos

iv. Evaluar el desempeo de este sistema mediante pruebas que arrojen

resultados cuantificables.

v. Los resultados de estas actividades sern inscritas en foros de

divulgacin cientfica, ya sea en congresos de talla internacional o
revistas cientficas.

p g. 13
 Vll. METODOLIGA:
Primera Etapa: En esta etapa se realiza una investigacin en la literatura y en
los documentos disponibles en la secretaria de salud del estado de Tamaulipas
para recabar informacin sobre la situacin actual de las enfermedades de
origen gentico que son detectables por medio de un anlisis del cariotipo.
Tambin se buscara informacin relacionada con las tcnicas de generacin de
cariotipos utilizadas comnmente en la practica clnica y se har un cuadro
comparativo de caractersticas de sistemas comerciales para la generacin
automatizada o semi automatizada de cariotipos por medio del procesamiento
digital de imgenes. Adems, se revisar en la literatura disponible el estado
del actual de las tcnicas de generacin automtica de cariotipos por medio de
procesamiento digital de imgenes.

Para la adquisicin de imgenes de cromosomas, se propone integrar tres

componentes bsicos: un microscopio de alta definicin, una cmara de alta
resolucin y una unidad de procesamiento digital (computadora personal), Con
la informacin obtenida durante la investigacin bibliogrfica, se dispondr la
plataforma de adquisicin de imgenes de cromosomas, la interfaz de
comunicacin entre los componentes materiales y la unidad central de
procesamiento digital, incluyendo los protocolos, medios e interfaces
necesarios para esa comunicacin. Der ser necesario, se construirn las
interfaces electrnicas utilizando los medios y recursos disponibles en la
universidad. Una vez que se tienen los componentes y los medios necesarios
para su interaccin con la unidad de procesamiento se deber realizar su
montaje y configuracin. Se debern realizar pruebas que permitan comprobar
el correcto funcionamiento y la comunicacin entre todos los componentes de
la plataforma de adquisicin de imgenes.

En esta etapa se investigara tambin las tcnicas de eliminacin de ruido y de

compensacin de la iluminacin que potencialmente permitan mejorar la
calidad visual de las imgenes, as como enfatizar la informacin que sirva
como base para realizar la segmentacin y clasificacin de los cromosomas en
un cariotipo.

p g. 14
Con esta informacin se desarrollara un modulo de software en la unidad
central que realizara el procesamiento de las imgenes adquiridas por la
plataforma.
La implementacin del algoritmo se realizara en Matlab (Mathworks) en una
primera instancia y enseguida se programara en un lenguaje de ms bajo nivel,
utilizando una biblioteca de procesamiento de imgenes optimizada, como
OpenCV, [19], [22].

Segunda Etapa: En esta etapa se investigara el estado del arte concerniente

a las tcnicas de segmentacin de imgenes que puedan ser aplicadas a la
separacin de cada cromosoma de las imgenes. Se debern investigar
tambin tcnicas para identificar y separar los cromosomas en los casos en los
que dos o ms cromosomas se encuentran superpuestos. Para efectuar esta
tarea, posiblemente se tendr que considerar propiedades geomtricas de los
objetos segmentados.

Esta informacin servir como base para programar un modulo software que
sea capaz de realizar el aislamiento de cada cromosoma, no importando si se
encontraba superpuesto. La programacin del algoritmo de segmentacin se
realizar en una computadora personal, utilizando primeramente el software
Matlab (Mathworks), para facilitar la generacin de un programa prototipo y
cuando se haya depurado completamente, se proceder a programarlo
utilizando un lenguaje de programacin de ms bajo nivel para optimizar su
funcionamiento. Este modulo tomara como imgenes de entrada las imgenes
arrojadas por el modulo de procesamiento desarrollado en la primera etapa.

Para probar la robustez y exactitud del algoritmo de segmentacin, se deber

disear un banco de pruebas que contenga casos generados sintticamente y
que permitan probar los lmites del modulo de segmentacin de cromosomas
programando.

p g. 15
Tercera Etapa: En este proyecto ya se dispondr de imgenes donde los
cromosomas han sido aislados del resto de la imagen, por lo que ahora se
deber realizar una investigacin en la literatura sobre las tcnicas de
clasificacin automtica que permitan construir un cariotipo bsico.

Adems, se experimentara con software de investigacin en clasificacin

automtica, para seleccionar mediante un banco de pruebas, los algoritmos
ms adecuados para resolver el problema de la clasificacin. Una vez que se
defini el algoritmo de clasificacin. se proceder a programar un modulo
software en una computadora personal utilizando Matlab para la fase de
experimentacin y en un lenguaje de nivel bajo para su versin final.

En esta etapa se deber efectuar la integracin de los mdulos software de

intercomunicacin entre los elementos hardware, de procesamiento,
segmentacin y clasificacin. Para esto, se deber disear y programar una
interfaz usuario que facilite la utilizacin del sistema de adquisicin de
imgenes de cromosomas y de los mdulos de procesamiento digital. Adems,
esta interfaz deber mostrar el cariotipo generado en una forma fcilmente
accesible.

El indicador que permitir evaluar esta etapa es un sistema funcional donde se

integren los elementos hardware y los mdulos de adquisicin, segmentacin y
clasificacin de las imgenes de cromosomas, as como una interfaz de usuario
del sistema.

Cuarta Etapa: En esta ltima etapa, en conjunto con los mdicos expertos en
el rea de Citogentica, se definir un protocolo que contemple pruebas
tcnicas y clnicas que permitan evaluar el funcionamiento del sistema
propuesto y que posibiliten la comparacin del cariotipo generado por los
mdulos de procesamiento digital de imgenes con el cariotipo generado por
un experto del HIT.

p g. 16
Estas pruebas comprendern pruebas electrnicas, donde se verificar el
funcionamiento de los circuitos de interfaz y de las conexiones; de fatiga, donde
se someter el sistema a un uso continuo durante un periodo de tiempo
prolongado; de ergonoma, donde un bilogo o medico fungirn como usuarios
finales y reportaran los problemas que encuentren durante una simulacin de
utilizacin cotidiana; y de exactitud del cariotipo producido por el sistema,
donde se comparar el cariotipo por el sistema a partir de una imagen tomada
sobre una muestra de laboratorio con el generado por un experto y se definir
un ndice de exactitud.

En esta etapa se realizaran las estrategias y actividades tendientes a la

transferencia tecnolgica al centro hospitalario que fungir como usuario final.
El sistema con los componentes finales que se utilizar en la prctica clnica
ser instalado y probado en el HIT durante esta etapa. Para facilitar la
transferencia, se redactara en una primera instancia un manual de usuario del
sistema y se definirn otras formas de transferencia de tecnologa, como
sesiones de capacitacin en el manejo del sistema. Adems, se dar servicio
tcnico sobre los mdulos y circuitos desarrollados para este proyecto.

El indicador de avance de esta etapa ser el concentrado de resultados de las

pruebas aplicadas al sistema.

p g. 17
 VII. RESULTADOS ESPERADOS, POSIBLES
APLICACIONES Y USO DEL PROYECTO:

Un sistema computacional que por medio de algoritmos de procesamiento

digital de imgenes, genere cariotipos a partir de imgenes obtenidas en
procedimientos citogenticas estndar. Los cariotipos generados por este
sistema debern ser similares a los generados por un experto en al menos un
80%.

Primera etapa:
i. Un reporte que presente el estado actual de las enfermedades genticas
cuya deteccin sea posible mediante el anlisis de cariotipo.
ii. Un reporte que describa las caractersticas de los sistemas de extraccin
de cariotipos actuales.
iii. Un reporte en donde se definan los componentes hardware adecuados
para la adquisicin de imgenes de cromosomas.
iv. Un sistema funcional de adquisicin de imgenes compuesto por los
siguientes productos.
a) Una interfaz de comunicacin entre los componentes hardware de
la plataforma propuesta.
b) Un mdulo software para la adquisicin de imgenes.
c) Un mdulo software para el pre-procesamiento de las imgenes.
d) Un mdulo software para el almacenamiento de las imgenes
procesadas.
v. Un reporte conteniendo las tcnicas para el mejoramiento de la calidad
visual aplicadas al procesamiento de imgenes de cromosomas.

Segunda Etapa:
i. Reporte del estado del arte de los algoritmos de segmentacin de
imgenes de cromosomas.
ii. Un modulo software para la segmentacin de imgenes de cromosomas.

p g. 18
Tercera Etapa:
i. Un reporte del estado del arte de los algoritmos de anlisis de imgenes
aplicados a anlisis de imgenes de cromosomas.
ii. Un mdulo software para el anlisis de las imgenes de cromosomas.
iii. Un reporte del estado del arte de las tcnicas de clasificacin automtica
aplicadas a imgenes de cromosomas.
iv. Un mdulo software para la clasificacin automtica de los
cromosomas.
v. Un mdulo software para la integracin del cariotipo en funcin de los
cromosomas obtenidos por el modulo de clasificacin y la informacin
obtenida.

Cuarta Etapa:
i. Un reporte conteniendo los resultados de las pruebas efectuadas al
sistema y de las comparaciones de cariotipos.
ii. Un manual de usuario del sistema.
iii. Tres sesiones de capacitacin para el uso del sistema.

p g. 19
 VIII. REFERENCIAS BIBLIOGRAFICAS:

[1] Bertina Zubieta-Ruiz, Pedro Snchez-Mrquez, and Roci Castillo-Cruz.

Enfermedades Genticas y Defectos al Nacimiento. Impacto en la Morbilidad y
Mortalidad Peditrica. Acta Peditrica Mexicana, 30(4):220-225,julio-agosto
2009

[2] Consejo Nacional de Poblacin (CONAPO). Veinticinco Aos

Epidemiolgica en Mxico. la Situacin Demogrfica en Mxico, pg. 11-14,
Mxico, 1990. ISBN 970-628-397-8.

[3] Rafael C. Gonzalez and Richard E. Woods. Digital Image Proccessing (3rd.
Edition). Prentice-Hall, Inc., Upper Saddle River, NJ, USA, 2006.
ISBN 013168728X.

[4] Qiang Wu, Fatima Merchant, and Kenneth Castleman. Microscope Inage
Processing. Academic Press, 2008. ISBN 987-0123725783.

[5] Ahmed M. Badawi, Kahlen G. Hasan, Emam-Elhak A. Aly, and Rimon A.

Messiha. Chrosmosomes Classification based on Neural Networks, Fuzzy Rule
based and Templete Matching Classifiers. PROCEEDINGS OF THE IEEE
MIDWEST SYMPOSIUM ON CIRCUITS AND SYSTEMS, 1:383-387,2003.

[6] Boaz Lerner, Hugo Guterman, and Its'hak Dinstein. A Classification-Driven

Partially Occluded Object Segmentation (CPOOS) Method with Application to
Chromosome Analysis. IEEE Transactions on Signial Processing, 46:2841-
2847, 1998.

[7]Ibrahiem M. M. El Emary. On the Application of Artifiicaial Neural Networks in

Analyzing and Classifying the Human Chromosomes. Juornal of Computer
Science, 2(1):72-75,2006.

[8] Boaz Lerner. Toward A Completely Automatic Neural Network Based Human
Chromosome Analysis. IEEE transactions on Systems, Man, and Cybernetics,
28:554-552, 1998.

[9] Yimji Piao, ll-hong Shin, and HyunWook Park. Image Resolution
Enhancement using Inter-Subband Correlation in Wavelet Domain. ICIP 2007,
1:445-448, 2007.

[10] Gunter Ritter and Le Gao. Automatic segmentation of metaphase cells

based on global context and variant analysis. Pattern Recognition, pages 38-
55,2008.

[11] Wacharapong Srisang, Krisanadej Jaroensutasinee, and Mullica

Jaroensutasinee. Segmentation of Overlapping Chormosome Images Using
Computational Geometry. Walailak J Sci and Tech, 3:181-194, 2006.

p g. 20
[12] Hyun Soek Hong, Dong Hyun Yoo, and Myung Jim Chung. Real-time Face
Tracker using Ellipse Fitting and Color Look-up Table in Irregular Illumination.
International Journal of HWRS, 3:29-33, December 2002.

[13] K. Kanjanawanishkul and B. Uyyanonvara. Fast Adaptive Algorithm for

Time-Critical Color Quantization Application. Proc. Vllth Digital Image
Computing: Techniques and Applications, pages 781-785, December 2003.

[14] Qiong Liu Ying Wu and Thomas S. Huang. An Adaptive Self-Organizing

Color Segmentation Algorithm with Application to Robust Real-time Human
Hand Localization. Proc. Asian Conf. on Computer Vision, 2000.

[15] Dorin Cominiciu and Peter Meer. Mean Shift: A Robust Approach Toward
Feature Space Analysis. IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine
Intelligence, 24:603-619, May 2002.

[16] Quynh Trang Le Baa Tarik Al-ani and Eric Monacelli. On-line Automatic
Detection of Human Activity in Home Using Wavelet and Hidden Markov Models
Scilab Toolkits. IEEE Internatioonal Conference on Control Applications, pages
485-490, October 2007.

[17] Victor Gajendran and Jeffrey J. Rodriguez, Chromosome counting Via

Digital Image Analysis. Proc. 2004 IEEE Intl. Conf on Image Processing,
5:2929-2932,2004.

[18] Gary Bradski and Adrrian Kaehler. Learning OpenCV. O'Reilly Media Inc.
2008. ISBN 978-059616130.

[19] Ian H. Witten and Eibe Frank. Data Mining: Practical Machine Learning
Tools and Techniques. Elsevier, 2nd.

[20] Digital Image Processing 3nd ed.

Rafael C. Gonzalez , Richard E. Woods

[21] Digital Image Processing Using MATLAB, 2nd ed.

Rafael C. Gonzalez , Richard E. Woods

[22] Learning OpenCV: Computer Vision with the OpenCV Library

Gary Bradski, Adrian Kaehler

[23] Practical Algorithms for Image Analysis

Lawrence O'Gorman

[24] Digital Signal Processing (4th Edition)

John G. Proakis (Author),Dimitris K Manolakis (Author)

[25] The Image Processing Handbook, Sixth Edition (Hardcover)

John C. Russ (Author)

p g. 21
[26] S. Umbaugh, Computer Imaging: Digital Image Analysis and Processing,
CRC Press Book, 2005.

[27] Automatic segmentation of metaphase cells based on global context and

variant analysis, Pattern Recognition, Volume 41, Issue 1, January 2008, Pages
38-55

[28] Comparison of different karyotyping methods in filamentous ascomycetes :

a case study of Nectria haematococca Author TAGA M. (1) ; MURATA M. (2) ;
SAITO H. (3) ; Journal Title Mycological research ISSN 0953-7562 , Source
1998, vol. 102 (11), pp. 1355-1364 (41 ref.) Publisher Elsevier,
Oxford,ROYAUME-UNI (1989)(Revue), (http://cat.inist.fr/?
aModele=afficheN&cpsidt=1592255)

[29] Automatic segmentation of metaphase cells based on global context and

variant analysis, Gunter Ritter, Le GaoFakultt fr Mathematik und Informatik,
Universitt Passau,D-94 030 Passau, Germany
Received 1 August 2006; received in revised form 6 February 2007; accepted
18 May 2007, 0031-3203/$30.00 2007 Pattern Recognition Society. Published
by Elsevier Ltd. All rights reserved.
doi:10.1016/j.patcog.2007.05.013

[30] Automated classification of metaphase chromosomes: Optimization

of an adaptive computerized scheme, Xingwei Wang a, Bin Zheng b, Shibo Li c,
John J. Mulvihill c, Marc C. Wooda, Hong Liu, journal homepage:
www.elsevier.com/locate/yjbin

[31] Yunis JJ. High resolution of human chromosomes. Science 1976;191:

1468-71

[32] Rowley JD. The role of chromosome translocations in leukemogenesis.

[33] Pinkel D, Straume T, Gray JW: Cytogenetic analysis using quantitative,

high- sensitivity, fluorescence hybridization. Proc Natl Acad Sci USA
1986;83:2934-8.
[34] Bentz M, Dohner H, Cabot G, Lichter P. Fluorescence in situ hybridization
in leukemias: 'the FISH are spawning!'. Leukemia 1993;8:1447-52.

p g. 22