UNIDAD 2 BIOFISICA

Clase 1 : Difusion

La difusin es un proceso fsico irreversible, en el que marticulas materiales se introducen en un

medio que inicialmente estaba ausente, aumentando la entropa o desorden molecular del
sistema conjunto formado por las partculas difundidas o soluto y el medio donde se difunden o
disuelven.

> =

Coeficiente de Difusin = Como difunden las partculas en un medio para determinar cual es el
flujo que tienen las partculas. En los solidos prcticamente no existe difusin.

Flujo

C1 es mejor que C2, por ende el flujo es hacia C1 y el flujo (J) no es ms que el numero de
partculas que atraviesan el plano (que dividen a C1 y C2) en una unidad de tiempo.

c = n / b -> Concentracin como numero de partculas (n) por el tamao del slap (C1 o C2).

El flujo de una sustancia depende de la distancia.

1 2 = ( )

Las leyes de fick sobre la difusin son leyes cuantitativas. La primera ley de Fick relaciona el flujo
difusivo con la concentracin bajo la asuncin de un estado estacionario. Esta ley postula que el
flujo va desde una regin de alta concentracin a las regiones de baja concentracin, con una
magnitud que es proporcional al gradiente de concentracin.
 1
= 2 2

Donde J es el flujo difusivo, mide la cantidad de sustancia que fluye a travs de una unidad de rea
durante un intervalo de una unidad de tiempo (mol/ m2 s)

D es el coeficiente de difusin. Su dimensin es el rea por unidad de tiempo (m2/s)

(para mezclas ideales) es la concentracin, en la cual la dimensin es de cantidad de sutancia

por unidad de volumen (mol/ m3)

x es la posicin, dado en dimensiones de longitud. Puede ser expresado en m.

Para dos o ms dimensiones espaciales, podemos hacer uso del operador lo cual generaliza
la primera derviada.

Para saber como varian las concentraciones en funcin del tiempo, colocaremos un slab l entre el
slab 1 y el slab 2.

El flujo de partculas del slab 1 sera:

y la que dejan la slab 2 alejandose de 1 son.

Dejando las direcciones del flujo de esta manera, podemos ver que las partoculas que llegan a la
slab l stan dados por la parte de derecha de la ecuaciones.
Segunda ley de Fick La solucin de ambas ecuaciones en condiciones peridicas es
matemticamente complicada. Esta ley predice la forma en la que la difusin causa que la
concentracin cambie con el tiempo. Se trata de una ecuacin diferencial parcial que en una
dimensin se escribe como en 5.9 Donde C es igual a .

Viscosidad

La viscosidad es la oposicin de un fluido a las deformaciones tangenciales. Un fluido que no tiene

viscosidad es un fluido ideal. En realidad todos los fluidos presentan algo de viscosidad, siendo el
modelo de viscosidad nula una aproximacin bastante buena para ciertas aplicaciones. La
viscosidad solo se manifiesta en lquidos en movimiento. Es contrario a la difusin.

Entre ms viscoso menos se deforma, es decir, no influye el estrs de corte.

Cuando un objeto est sometido a una deformacin tangencial , la deformacin que se produce
est relacionado con a travs de una constante .

= -> En este caso, el slido obedece la ley de Hooke.

Si eliminamos el estrs de corte si eliminamos lo que provoca la deformacin tangencial, el slido

retornara a su forma original. Pero si el slido ha sido deformado ms all de su lmite elstico, no
volvera a su forma original cuando se elimina el estrs de corte.
Una caracterstica que define a los lquidos es que no pueden resistirse a una deformacin
tangencial, comienzan inmediatamente a moverse (por lo tanto a deformarse). Podemos decir que
el lquido presenta un lmite elstico de cero.

La viscosidad en los lquido s con respecto al tiempo.

= =

= Fluidez

= Viscosidad dinmica, describe como evoluciona la deformacin con respecto a .

Viscosidad dinmica.

Es usual normalizar la viscosidad en trminos de la densidad, para producir lo que se conoce como
viscosidad cinematica.

=

Si una sustancia es sometida a una deformacin elstica o y se mantiene ese nivel de

deformacin, dicho nivel llegar a o y despus se relajara, lo cual significa que el rgimen de
Hooke es gradualmente remplazado por el rgimen de newton.

=

Como podemos calcular la constante de tiempo t en la cual un sistema que soporta la

deformacin se convienrte en un sistema que absorbe la deformacin. El estrs de corte poco a
poco deja de influir en la deformacin para pasar a una deformacin newtoniana.

Sabemos que

= La deformacin tangencial de hooke en un slido se va a ir perdiendo con el tiempo

para dar paso a una deformacin tangencial de newton (lquido). Por ende, el estrs de corte no
deforma a un hookeniano.

= 0 / , = n / u, n viscosidad dinmica, u = cte.

El estrs de corte depende del inicial multiplicado por un exponencial que disminuye en el tiempo
que disminuye en el tiempo en la cual un fluido se convierte.

Entre ms pequeo el tiempo, ms cuesta disminuir la deformacin inicial, entre ms viscoso ms

se demora y menos cambios pueden haber.

= =


= Tau, depende de la viscosidad dinmica y de la constante

Ms viscoso, menos absorbe la deformacin

- La membrana plasmtica se comporta como Hooke, debido a su apariencia ms ordenada

similar a un solido, muy organizado por interaccin de los fosfolpidos y agua, restringe el
movimiento.

Membranas biolgicas

- Membrana como simil de nuestra piel, pues ambas son un medio de contencin, permite
el intercambio con el medio.
Funcin = Transporte de iones, comunicacin con otras clulas, conversin de
energa (ATPsintasa, ATPasa).

- Lipidos, Proteinas -> Conforman la membrana

Las membranas tienen 10 vecesel peso de lpidos en peso de protenas.

- Se componen de fosfolpidos, la colina es la contraparte positiva, tiene carcter polar

neutro.
- Los acidos grasos pueden ser saturados (simple enlace) o insaturados (doble o triple
enlace).
- Si los lpidos son insaturados hay ms espacios donde pueden entrar las protenas para
evitar que cambien su conformacin por cambios de temperatura.
 Como se disponen?

- Los acidos grados cambian dependiendo del

rgano donde se encuentre el fosfolpido. Regulan la
protena de membrana.
- Glicolipidos : Lipido unido a un carbohidrato,
forman glicocalix, superficie que permite el
intercambio entre membrana.
- Los fosfolpidos son molculas anfipaticas.
A pesar de que la membrana es hidrofbica, molculas
de H2O pueden atravesar membranas, los iones no
Se comprime hasta los pueden cruzar debido a que se forman esferas de
45 A sulfatacin que son muy grandes por ende son muy
grandes por eso existen canales por donde pasan los iones por la membrana plasmtica.

- La presencia de fosfolpidos y colesterol le dan la fluidez a la membrana -> mosaico fluido

- El coeficiente de actividad de un hidrocarburo en el agua es 1 ya que solo interactan
entre si, membranas y micelas.
- RTln -> 0

. = , + , + ,

Estandar + Fraccin molar + coeficiente de actividad.

Hidrocarburos= Interactuan entre ellos, no con el medio, f = 1, ln(1) = 0

- La energa va a aumentar a mayor cantidad de carbonos, si existe mayor cantidad de H20

desfavorece la interaccin.

pH superficie en la membrana: = + 2,3

qe = Carga del fosfolpido

o = Potencial de la membrana en milivolts.
pH bulk : pH normal
 Para la membrana tambin se aplica la ley de Fick, lo ms lento corresponde al paso por la
bicapa, flujo : velocidad / Area.

,
Coeficiente de particin: . , = ln .
El coeficiente de particin favorable tiene que pasar tanto por un medio acuoso,
solubilizarse, difundir en la membrana y pasar al otro lado. Por ende, el foecificente de
particin debe ser parecido tanto en H2O como en hidrocarburos.

= (1 2)

B = C membrana / C H20 -> Como difunde en la membrana
Muy hidrofbico > 1 , Muy hidrofilico < 1
D= Coeficiente de difusin, l = ancho de la membrana.

De menor a mayor concentracin se coloca D

De mayor a menor concentracin se coloca D

El flujo debe ser electro-quimico por lo tanto las ecuaciones cambian

V1 -> Vmax

( ( 1))
1 2 = 1
1

La cargas negativas se ven favorecidas.

Entalpia de fusin: Entalpia a la cual una membrana cambia al estado (+) liquido,
determinado por cambios de temperatura; cambios de energa interna que se produzcan
por cambios de temperatura en la temperatura basal.

1 2
= (
) = ()2
({ } { }2 ) =

- La membrana ejerce acciones sobre las protenas con presin (lateral)

- Un frmaco puede cambiar la conformacin de una protena que influye en la membrana.
--Zr-- ---- Zt ------ Zt > Zr
-

Presion = Fuerza / Area , Area = Longitud x Area

= = , =

()
= () =
()

= Presin lateral , presin en termino de variacin de la presin laterial con respecto al

ancho.

El potencial quimico para el estado s a una presin p ser:

= + , + [] +

Vs = Volumen molar parcial del solido en el estado z

Cambio del trabajo mecanico dw asociado con un cambio en la seccin transversal dA(z)
esta dado por:

= ()()
El signo negativo proviene porque el trabajo es hecho por la protena y no por el medio y
si sumamos todo el trabajo de todas las protenas a lo largo de los varios estados z de la
membrana tendramos. Si hablamos de trabajo en la membrana el signo negativo
desaparece

= + [] + () ()

Nav : Numero de avogradro

En el equilibrio, los potenciales qumicos de los dos estados r y t tienen que ser iguales,
entonces podemos eliminar en las ecuaciones 8.12 y 8.14 los potenciales qumicos
estndar ( ) y igualamos esos dos potenciales a dos presiones p(z) p0(z). Entonces
tenemos:
 [] []
[]
= []
-> [] estados iniciales, como dependen los cambios dependiendo de los
estados iniciales

1
= ()

La presin Ft de protena que estn en el estado t los podemos escribir como:

[] [] []
= = =
[] + [] (1 + )
[]

( )
= =
, 0 (1 + )

De este anlisis podemos deducir finalmente que el nico modo en que una protena no se viera
afectada por cambios en la presin de la membrana es que fuera independiente de Z, lo cual es
muy improbable dada la disposicin de alfa hlices de las protenas ms comunes en el sistema
nervios. La expansin o contraccin de una protena va a depender de la profundidad a la que
ocurren estos movimientos en la membrana. El signo de depende del modo que varie con Z
(del smbolo de la integral)

Este fenmeno es de gran inters dado que puede llevar una protena de un estado activo a uno
inactivo o viceversa. Este efecto puede ser mucho mayor que el efecto que produce un ligando
especifico al hacer docking en una protena. Si un anestsico, por ejemplo, es capaz de modificar
toda en presin de la membrana puede modificar por este fenmeno estudiado, las aproximacin
de una vescula a una membrana.

ENERGIA BIOLOGICA

1 Caloria = 1000 calorias = 1 Kcal

1 cal = 4.168 J

Dieta diaria = 2400 Kcal -> 200 veces la energa total almacenada en nuestro cuerpo es en forma
de enlace, esto permite tener prendida dos ampolletas de 60 Watts por 24 horas.

- La mayora de las cadenas troficas comienzan con las plantas, ellas son organismos
auttrofos que producen azucares a partir de :
 - La luz es producida por longitudes de onda que se ubican en la regin infraroja del
espectro electromagntico, las longitudes de onda cortas generan ruptura de enlaces, lo
que puede producir un cambio en el color de nuestra piel, lo que conocemos como
bronceado. Pero ese proceso no produce energa til al servicio del metabolismo. Cuando
la luz de los fotones tiene una longitud de onda lo suficentemente corta (lo que implica
una suficiente alta energia) y estos ocurren sobre la clorofila produce ionizacin.

- La maquinaria fotosinttica es relativamente complicada para evitar que se produzca la

reaccin contraria, para evitar que el electron que se desprende se reuna con el ion
positivo debido a que ese electron es tomado por la cadena transportadora de electrones
que esperan dicho electron y lo toman para hacer nuevas molculas como por ejemplo
glucosa. Estas molculas subyacentes son fuentes de energa que despus requiere la
planta o el animal que se la come.

- Este proceso produce 36 ATPs

- 62 + 62 + . 6126 + 62

El porcentaje de eficiencia es de un 40%

A traves de la energa aerobica se obtiene energa ATP.

6126 + 62 + 62 + 620 +

Este proceso se llama glicolisis.

La fotosntesis ocurre en las granas que son grupos de tilacoides y especficamente el proceso
ocurre en la membrana. Este proceso ocurre gracias a la endosimbiosis de una bacteria
fotosinttica por asimilacin de las plantas.

En el humano existe el retinal que con luz tiene un cambio conformacional donde se transforma a
retinol, sin embargo esto no pasa en la clorofila que se encuentra en un estado basal con luz que
se ioniza donde debido a que el siguiente nivel es muy alto no cambia de conformacin.
Existen distintos tipos de clorofila:

Plantas superiores: Clorofila A y B

Algas cafes: Clorofila C

Algas Rojas: Clorofila D

435-480 MM -> Si la luz blanca que llega a la retina tiene esta longitud de onda, nosotros vemos
azul y si es 650 -675 nm naranja y roja

Las plantas reflejan el verde puesto que el

naranja/rojo y azul son absorbidos por los
altos picks que tienen. La clorofila al impactar
la luz libera un e- de un doble enlace
conjugado que permite que salgan e-

La absorcin de un foton se va a producir si

hay niveles basales de energa, con la
magnitud apropiada para absorber un foton

La clorofila tiene un anillo porfinirico con a=

CH3 y b= CHO, la longitud de onda es 10 veces
el tamao de la clorofila, lo que hace que se
sacuda (por los doble enlaces conjugados
existen e- disociados que permiten moverlos
entre los enlaces.

Los fotosistemas son dimeros en donce

cada dimero tiene muchas subunidades
20 proteinas diferentes conjugadas
para formar los fotosistemas, cada una
genera 35 clorofilas x 2.

ATPSintasa

Es una protena muy compleja, que utiliza el gradiente de protones producido por el citocromo
para generar ATP. Esta compuesto por 2 subunidades: Fo -> Transmembranal, que funciona como
rotor y F1 que es citoplasmtica donde se sintetiza el ATP, el gradiente produce la rotacin de
gamma que produce el giro del disco, por cada giro se crean 3 moleculas de ATP. Los cambios
conformacionales producen la unin de ADP+Pi.
En F1 existen subunidades alfa y beta, las alfas son iguales y las diferentes unidades se encargan
de acoplar el ADP y Pi y liberar el ATP.

BL-> ADP+Pi , se cambia la conformacin de BL a BT para acoplar y generar ATP.

BT-> Se genera ATP

Bo -> Se libera el ATP

Este cambio conformacional ocurre cada 120 a un giro (360) se geberab 3 moleculas de ATP.

- Gamma rota 100 revoluciones por segundo, osea que en 1 segundo se generan 300 ATPs.
- Alfa conecta F0 con F1.

Cada fosfato esta unido al resto de la molecula por una energa mucho mayor que la barrera
energtica que previene su ruptura espontanea, este fenmeno se denomina como
metaestabilidad.

La metaestabilidad descubre un estado de delicado equilibrio. Un sistema metaestable esta en

equilibrio pero es susceptible de caer a un estado de energa mas bajo con una pequea
interaccin.

El rompimiento por hidrolisis del enlace covalente entre el ultimo y el penltimo fosfato,
produce una energa de 0.06 J, el factor gatillante de este rompimiento es la repulsin
electrosttica que hay en una molecula de ATP entre los O-.
1 1 2
() = 4
Ley de Coulomb, calculo del potencial de repulsin

El resultado es 7.2, la () del agua es 80 por lo tanto no ocurre a nivel del citoplasma pero si
esta ocurre al interior de una membrana embebida por protenas donde la () de esta est
entre 2 ~ 8

Cuando no hay colesterol la protena se mueve mas rpido, al agregar colesterol disminuye y si
se lava se recupera algo la membrana.

MOVIMIENTO DE LOS ORGANISMOS

El movimiento de las bacterias es estocstico.

La probabilidad de que una bacteria cambie de sentido tiende a cero cuando se muevan para
acercarse o repeler cierta sustancia.

El movimiento y velocidad de los organismos depender de la viscosidad en el medio donde se

muevan

= , l = largo, v= velocidad p = viscosidad

 6
= Fuerza que se opone al movimiento, a= rea= radio

1J = m2 kg/ s2

Watt = m2 kg / s3 = J/s
ESTRUCTURA

CILIO = Permiten el movimiento a

organismos eucariontes, protistas. El
movimiento es gracias a una membrana
que lo rodea, produce entrada de Ca y
salida de K, lo que hace el movimiento.
El centro del cilio se denomina axonema
este se encuentra rodeado por una
membrana donde se disponen 9 micro
tbulos alrededor de otros dos micro
tbulos. El movimiento se genera por
hiperpolarizacin y despolarizacin.

Despolarizacin > Retrocede, influjo de Ca+

Hiperpolarizacin > Avanza, Salida de K+ al exterior

FLAGELO= Directo contacto con el medio, movimiento por QUIMIOTAXIS, tiene un

tamao de 140~160 Amstrong, 10 veces ms pequeos que un cilio. El movimiento
generado es muy parecido al de la ATPsintasa puesto que tambin funciona como
rotor.

Quimiotaxis: Moleculas receptoras por una cascada metabolica (fosforilacin y

metilacin de proteinas) cuando percibe un quimiatractor o quimiorepelente.

Al sentido del reloj -> Mueve quimiorepelente.

Al sentido contrario -> Muece quimiorreceptor.

EL MOVIMIENTO DE LAS BACTERIAS ES ESTOCASTICO PERO SI PERCIBEN UN

QUIMIOATRACTOR COMO NUTRIENTES, CORRIGEN SU ANGULO Y VAN
DIRECTAMENTE HACIA EL O CONTRARIO A EL SI ES REPULSIVO.
Ejemplo Fibras musculares, descarga de AcetilCoA

El musculo esta compuesto por fibrillas, que forman un sarcomero (unidad funcional)
este se contrae entre la lnea Z para unirse y elimina la lnea A.

Esta compuestos por estas bandas, estas se estrechan para generar la contraccin, la
fibrilla tiene troponina y tropomiosina que dejan expuesto el sitio activo y as la
miosina se pueda unir con la actina, el movimiento se genera cada vez que se pega una
actina y se libera ATP.

Dependencia de Ca= Para exponer los sitios activos.

Dependencia de ATP= Movimiento de la actina sobre la miosina.

Calculos para la eficiencia del proceso.

El paso clave para que ocurra este proceso es la hidrolisis de ATP por lo tanto de ello
depende que la velocidad del movimiento de la miosina sobre la actina.
1
Numero minimo =

Tasa de eficiencia = + = = =

1 1
= , =


= , dx = desplazamiento real, x desplazamiento total

Cada 6 cabezas de miosina se produce una unin.

( + ) ( + )2
Fuerza = = =
2 2

= , = . ,