1.

Lokasi dan Urutan Sekuens

(sekuens nukleotida dan asam amino)
FASTA

Tergolong : mRNA

Locus : nm_012509

Panjang sekuens: 3105 bp

Kode gen : ATPase

GI : 281306810

Accession : NM_012509
XM_001076500
XM_341834

Tahun pemetaan: ROD 04-SEP-

2014

Sumber :
http://www.ncbi.nlm.nih.
gov

GARFIK NCBI
NCBI genbank digunakan untuk identifikasi lokasi dan urutan gens pada suatu kromosom tertentu.

FASTA merupakan data sekuens DNA atau RNA yang berupa urutan basa nitrogen yang mengkode
suatu proteun tertentu.Grafik dari kode yang terdapat pada FASTA berupa suatu garis lurus dengan
penanda nomer mencapai 3105 bp.Data sekuens mRNA ini diunduh dari
http://www.ncbi.nlm.nih.gov yang merupakan perusahaan yang bergerak di bidang ilmu
pengetahuan yang mempunyai projek untuk memetakan Genom manusia.Perusahaan ini berpusat di
amerika dan sekarang telah selesai dalam memetakan seluruh genom manusia.

Ini adalah sekuens linear mRNA dari ATPase, dengan panjang basa nitrogen 3105 bp .Sekuens ini
terletak pada locus NM_012509 . Sekuens ini mengkode enzim ATPase ,yang terdiri atas alpha
polypeptide (Atp4a),mRNA.Data sekuens mRNA pengkode enzim ATPase ini di unduh pada NCBI
genbank dan di upload pada 04 september 2014.Sekuens mRNA ini memiliki versi NM_012509.1
dan kode GI: 281306810.

Identifikasi gens ATPase:

LOCUS :NM_012509 3105 bp mRNA linear ROD 04-SEP-2014

DEFINITION :Rattus norvegicus ATPase, H+/K+ exchanging, alpha polypeptide(Atp4a), mRNA.
ACCESSION :NM_012509 XM_001076500 XM_341834
VERSION :NM_012509.1 GI:281306810
2.Identifikasi Gen(S) Pada gDNA Manusia
GENSCAN

GENSCAN merupakan situs peta genetik manusia yang digunakan untuk identifikasi dan prediksi
gen(s) dengan determinasi genom DNA yang menggunakan NCBI genbank .Web ini bisa digunakan
untuk membandingkan sequens DNA/RNA yang ada pada NCBI genbank dan genscan.

Kode pada genscan tersebut berbeda dengan basa nitogen yang biasanya mengkode mRNA ,kode
pada genscan itu memiliki arti yang sama dengan basa nitrogen pada mRNA.
3.Mengidentifikasi Tingkat Kesamaaan Sekuens
Antar Spesies
Grafik Distribusi Sekuens

Deskripsi Grafik

NCBI genbank dapat digunakan untuk mengidentifikasi kesamaan sekuens yang tinggi antara tikus
dan manusia pada sekuens yang mengkode ATPase . Dengan adanya Gensbank ini ,maka kita dapat
menggunakannya dalam berbagai kepentingan hidup manusia misalnya penelitian arkeologi kasus
pembunuhan dan berbagai kegiatan genomik lain yang memerlukan informasi DNA sebagai
pembanding.

Keberadaan genbank ini juga dapat digunakan untuk rekayasa genetika untuk menghasilkan
berbagai produk sintetik yang dapat mengobati berbagai macam penyakit.Pada deskrifsi di atas
ditunjukan bahwa sekuens pengkode ATPase pada tikus dan manusia memiliki kesamaan 99%.
5.Prediksi Fungsi Protein
Grafik

Referensi

Pada alamat web ini kita dapat mencari referensi untuk genom yang kita cari.Terdapat banyak artikel
dan referensi yang terpercaya yang berisi ulasan tentang genom yang sedang kita cari.Grafik di atas
menunjukan contoh segmen pada sekuensd DNA yang sedang kita amati.