Université Paris XI - Val de Marne ANNEE UNIVERSITAIRE 2005 - 2006 P.C.E.M.1 EPREUVE DE BIOCHIMIE DATE: Jeudi 8 juin DUREE: | heure FREE CETTE EPREUVE COMPREND : 37 Q.C.M. , dont: 26 questions 1 probléme comprenant 2 QCMs 1 probléme comprenant 3 QCMs 1 probléme comprenant 6 QCMs (4 pages) Répondre sur la grille de réponses au feutre noir CE CAHIER COMPREND 15 PAGES. SIL EST INCOMPLET, VEUILLEZ LE SIGNALER DES LE DEBUT DE L’EPREUVE AU SURVEILLANT. IL COMPREND LE CODE GENETIQUE EN PAGE 2. AUCUNE RECLAMATION NE SERA ADMISE PAR LA SUITE. Page 1/15Code Génétique 2" LETTRE uU c A G T TIT phe | TCTser | TATtyr | TGTcys | T | : | TTC phe | TCCser | TAC tyr | TGCeys | C | TTA leu | TCA ser | TAA Stop | TGA Stop | A | T1G leu | TCG ser | TAG Stop | TGGup | G Lere r CITieu | CCTpro| CAThis | CGTarg | T | 3éme | CTC leu | CCC pro | CAChis | CGCarg | C L t CTA leu | CCA pro | CAA gin | CGAarg | A L ;E] CTG leu | CCG pro} CAGgin | CGGarg | G | E | T ATTile | ACTthr | AATasn | AGTser | T | T T ATC ile | ACC thr | AACasn | AGCser | C | T R | ATA ile | ACAthr | AAAlys | AGA arg | A E ATG met | ACGthr | AAGlys | AGGarg| G | E GIT val | GCTala | GATasp | GGTgly | T GTC val | GCCala | GAC asp | GGCgly | C | 7 GTA val | GCAala | GAAglu | GGAgly | A | GTG val | GCGala | GAG gu | GGGgly | G Page 2/15QCM L.: Parmi ies composés suivants quel(s) est (sont) celui (ceux) qui peut (peuvent) étre substrat(s) d'une transaminase et d'une déshydrogénase ? 4 A) citrate B) pyruvate C) 1,3-diphosphoglycérate D) oxaloacétate E) fumarate, QCM 2: Quel(s) composé(s) posséde(nt) au moins une liaison riche en énergie ? A) 2-phospho-glycérate B) phospho-énol-pyruvate C) malonyl-CoA D) adénosine monophosphate (AMP) E) fructose 6-phosphate, QCM 3:: Panni les enzymes suivantes, quelle(s) est (sont) celle(s) qui peuve(nt) utiliser le pyruvate comme substrat ? A) pyruvate kinase B) lactate déshydrogénase C) phosphoglycérate mutase D) triose phosphate isomérase E) pyruvate déshydrogénase. QCM 4.: Quel(s) est (sont) le(s) coenzyme(s) commun(s) aux réactions catalysées par la pyruvate déshydrogénase et la B-hydroxybutyrate déshydrogénase ? A) thiamine pyrophosphate B) coenzyme A C) NAD* D) acide lipoique E) NADP*. QCM 5.; Quelle(s) est (sont) la (les) substrat(s) possible(s) de la voie de la néoglucogenése ? A) lactate B) acétyl-CoA C) glycérol D) glycogéne E) alanine Page 3/45QCM 6.: Quelle est l'enzyme dont le déficit est responsable de la galactosémie du nourrisson? A) galactokinase 4B) galactose-1-phosphate uridyl transférase C) UDP-galactose 4 épimérase D) galactose-1-phosphate pyrophosphorylase E) phosphoglucomutase. QCM 7.: Quel est le métabolite de la glycolyse qui permet, en une seule étape, la synthése de glycérol phosphate dans le tissu adipeux ? A) phospho-énol-pyruvate B) glyceraldéhyde 3-phosphate C) pyruvate D) dihydroxy-acétone-phosphate E) 3-phospho-glycérate, QCM 8.: Quelle(s) est (sont) fa (les) proposition(s) exacte(s) 7 A) les histones établissent des liaisons ioniques avec I'ADN B) la méthionine initiale peut-étre éliminée lors de la maturation protéique C) le précurseur 458 des ARN des ribosomes est synthétisé dans le nueléole D) les protéines qui se lient 4 ADN ont obligatoirement une structure en doigt de zine E) les modifications post-traductionnelles d'une protéine conduisent toujours 4 son inactivation, QCM 9.: Quelle(s) est (sont) la (les) proposition(s) exacte(s) ? A) il existe un codon spécifique permettant lincorporation de V'hydroxyprotine lors de la traduction B) Ia phosphorylation des protéines peut conduite & leur activation C) les protéines transmembranaires présentent des résidus hydrophiles sur la face cytoplasmique D) les collagenes présentent le plus souvent une structure globulaire E) Iinsuline est synthétisée sous forme d'un précurseur inactif, QCM 10.: Quelle(s) est (sont) la (les) proposition(s) exacte(s) ? A) Vaminoacyl-ARNt-synthétase de l'arginine reconnait aussi la lysine B) I'ARN polymérase II permet la transcription des ARNs prémessagers C) un méme messager peut donner naissance a des protéines différentes dans des tissus différents D) la traduction nécessite de I'énergie sous forme de GTP E) la polyadénylation des ARN prémessagers se fait dans le cytoplasme. Page 4/15Probléme (2 questions) : Soit le schéma métabolique suivant: COOH Oxaloacétate { if c=0 1 Lactate coon CH | tT? EI coon 2 Phospho-énol-pyruvate ae oN cH CH; i CH-NB, ¢=0 Alanine COOH S-Coa Acétyl-Cod QCM 11: Quel est le nom du composé X 2 A) citrate B) pyruvate C) aspartate D) malate E) 2-phosphoglycérate. QCM 12.: Quelle(s) est (sont) la (les) proposition(s) exacte(s) ? A) enzyme El utilise de 'ATP B) enzyme E2 n'existe pas chez Homme C) lenzyme E3 est mitochondriale D) l'enzyme E4 est une transaminase E) lenzyme ES est importante pour le métabolisme anaérobie QCM 13.: Quelle(s) est (sont) Ia (les) proposition(s) exacte(s) ? A) Ia dégradation de l'acide palmitique en CO) et HO donne plus d'énergie que la dégradation de 3 molécutes de glucose en CO? et HO B) Jes agents découplants augmentent la consommation doxygene des mitochondries C) Ia phosphorylation de ADP en ATP se fait au niveau du complexe V D) le NADH+H" alimente la chaine respiratoire au niveau du complexe | E) |'ATP/ADP translocase est membranaire. Page 5/15QCM 14.: Quelle(s) est (sont) la (les) proposition(s) exacte(s) ? A) la maturation des ARN prémessagers se fait dans le eytoplasme B) 1a maturation des ARN prémessagers comporte I'épissage des introns C) les ARN messagers matures contiennent une ou plusieurs séquentces non codantes D) la séquence polyA des ARNs messagers matures est complémentaire d'une séquence polyT de 'ADN. E) le nucléotide CAP est placé en 5! des ARN prémessagers en cours de maturation, QCM 15.: Dans quelle(s) voie(s) métabolique(s) intervient le dihydroxy-acétone-phosphate (DHAP)? A) Ia glycolyse hyaloplasmique B) Ia voie de synthése des triglycérides C) la glycogénolyse D) la néoglucogentse a partir du lactate E) la glycolyse anaérobie QCM 16.: Quelle(s) proposition(s) s'applique(nt) a l'acétyl-CoA? A) il contient une liaison riche en énergie B) il peut-etre transformé en une étape en oxaloacétate chez !homme C) il est le substrat initial de la voie de synthése des acides gras D) illest un substrat de la néoglucogentse dans le foie E) il peut étre produit dans le cytoplasme. QCM 17.: Quelie(s) est (sont) la (les) proposition(s) exacte(s) ? A) la chaine respiratoire mitochondriale peut fonctionner méme si le cycle de Krebs est interrompu B) la chaine respiratoire mitochondriale réalise un gradient de protons entre la matrice intra-mitochondriale et l'espace intermembtanaire C) le produit final de la chatne respiratoire est eau D) le transfert des électrons de la chaine respiratoire suit un gradient de potentiels @oxydo-réduction £) Je couple ubiquinone/ubiquinol (UQ/UQHL) permet le transfert d'équivalent réducteur dans la chaine respiratoire mitochondriale, QCM 18.; Parmi les propriétés suivantes, indiquez celle(s) qui s'applique(nt) a Linhibition non compétitive dune enzyme michaélienne A) la Vmax de la réaction est inchangée B) la Km n'est pas modifiée C) il peut se former des complexes El, ES, et EST D) Pinhibiteur se fixe au niveau du site actif de lenzyme E) Taugmentation de la concentration du substrat léve linhibition. Page 6/15QCM 19.: Parmi les propositions suivantes concemant la séquence peptidique suivante: 7 + S gly-gly-val-cys-val-val-pro-his-val-gly-arg-ala-pro-cys-thr-val-thr-glu-ely Cocher celle(s) qui est (sont) exacte(s): A) la séquence des acides aminés suggére une forte probabilité d’hélice a B) elle est basique C) elle peut contenir un pont disulfure intrachaine D) elle présente un pic d'absorption a 280 nm E) elle contient des séquences répétitives caractéristiques du collagene. QCM 20.: Quelle(s) propositions(s) est(sont) exacte(s): A) un géne peut coder plusieurs formes d’une méme protéine B) sur un chromosome les deux brins de 'ADN sont porteurs de génes chez les eucaryotes C) Ia méthylation du promoteur d'un gene de !ADN influence le niveau de transcription de ce gine. D) des éléments influengant la transcription d'un gene peuvent se trouver A distance de celui-ci E) chez les eucaryotes organisation des génes est monocistronique. QCM 21.: Soit le peptide : asp — phe — asp ~ gly Indiquer quelle(s) proposition(s) est (sont) exacte(s) A) il est scindé en un tripeptide et un acide aminé apres action de la chymotrypsine B) il présente un pic 'absorption 280 nm ©) il aboutit a la libération de phénylalanine aprés action courte d'une carboxypeptidase D) ilest chargé négativement a pH=12 E) il contient un acide aminé capable de former des ponts disulfure. QCM 22.: Parmi les techniques suivantes, quelle(s) est (sont) celle(s) permettant la séparation des protéines en fonction de leur poids moléculaire ? A) Vélectrophorese en présence de SDS (SDS-PAGE) B) la PCR (Polymerase Chain Reaction) ©) Pultracentrifugation D) la chromatographic d°exclusion ou par perméation de gel E) la chromatographie d’échange d'ions. Page 7/15QCM 23.: Quelle(s) est (sont) la (les) proposition(s) exacte(s) ? A) Visoélectrofocalisation permet de séparer deux. protéines selon leurs points isoélectriques B) Pélectrophorése bidimensionnelle permet de séparer les protéines selon deux critéres physico-chimiques C) dans un systéme de chromatographie d’échange d’ions, I’élution peut étre réalisée en faisant varier les conditions de pH D) certaines techniques de séparation des protéines peuvent étre couples a une révélation utilisant un anticorps spécifique E) la mesure de la densité optique (DO) peut permettre de déterminer la concentration protéique, QCM 24.: Quelle(s) proposition(s) s'applique(nt) au galactose? A) cest un hexose B) clest un oligosaccharide C) cest un constituant du glycogene D) il est absorbé au niveau de la bordure en brosse par diffusion facilitée E) c'est un substrat de la galactokinase. QCM 25.: Quelle(s) proposition(s) s'applique(at) & 'oxaloacétate? A) clest un lipide B) c'est un intermédiaire de la synthése du glucose a partir du lactate C) c'est un intermédiaire de la synthése du glucose & partir du glycérol D) cest un intermédiaire de Ia glycolyse anaérobie E) il peut traverser la membrane mitochondriale. QCM 26.: Quelie(s) propositions(s) est(sont) exacte(s): A) I'hybridation de 2 brins d'ADN est assurée par des liaisons hydrogéne B) Ladénine est complémentaire de la thymine C) Jes bases pyrimidiques sont complémentaires entre elles D) les caractéristiques de la dénaturation thermique d'un double brin d'ADN dépendent de sa séquence en bases E) Ieffet hyperchrome n'existe pas en cas de présence de séquences de I'ADN répétitives. QCM 27.: Quelle(s) propositions(s) est(sont) exacte(s): A) les ADN polymérases nécessitent la présence d'une amorce B) 'ADN polymérase III est aussi appelée primase C) les ARN polymérases nécessitent la présence d'une amorce D) les ARN polymérases assurent un réle majeur dans la réparation de !ADN, 5) ARN polymérase synthétisant les ARNr synthétise aussi les ARNm primaires. Page 8/15Probléme (3 questions): Soient différentes courbes d 's enzymatiques dont certaines sont obtenues avec une enzyme de la glycolyse anaérobie dans différentes conditions réactionnelles : un des produits de cette réaction est un composé non phosphorylé et portant une fonction eétone <——- 1 380 ~ 300 250 2) 3 150 V (U/mg) 100 as 50 3.4 5 6 mM [Substrat] QCM 28.: Quelle(s) est (sont) la (les) proposition(s) exacte(s) concernant la réaction catalysée décrite ci-dessus : A) Venzyme de cette réaction est la triose phosphate isomérase B) un substrat de cette réaction est le 2-phospho-glycérate C) Fenzyme de cette réaction permet de récupérer de énergie sous forme de phosphate d’énol D) ADP est un cosubstrat de la réaction E) la réaction catalysée est iméversible. QCM 29.: Considérant que la courbe n°4 est la courbe de base de cette enzyme, indiquer quelle(s) est (sont) la (les) proposition(s) exacte(s): A) la courbe de base (n°4) est typique d’une enzyme allostérique B) Ia courbe n®1 correspond a une réaction dans laquelle une concentration 2 fois plus grande d’enzyme a été utilisée comparativement la courbe de base C) la courbe n°3 correspond a une prédominance de la forme « T » comparativement a la courbe de base D) la courbe n°2 présente une cinétique michaélienne \_ E) lacourbe n°5 peut correspondre & une expérience faite en présence durée 8 M. Page 9/15QCM 30.: Quelle(s) est (sont) la (les) proposition(s) exacte(s) concemant le produit de la réaction en cause ? A) il est directement exporté par les cellules ne possédant pes de métabolisme aérobie B) il peut étre le substrat d’une réaction permettant d’obtenir un coenzyme réduit C) sa conversion en oxaloacétate met en jeu une réaction qui utilise un cosubstrat, porteur d’un noyau purique D) il peut étre le substrat d’une décarboxylation oxydative E) il peut étre le produit d°une réaction réversible. QCM 31: Le schéma ci-dessous décrit les courbes de saturation en oxygéne de deux protéines, P’hémoglobine et la myoglobine, en fonction de la pression partielle en oxygéne. Saturation on 02 (%) 40 60 e100 Pression partolio on axygine pO, (tor) A) la courbe I correspond a celle de fz myoglobine et Ia courbe 2 correspond a celle de Phémoglobine B) en présence de 2,3 DPG, seule la courbe I est observée C) pour une pression partielle en oxygéne de 26 torrs, l’affinité de 'hémoglobine pour Foxygéne est plus forte que celle de la myoglobine D) au point noté « a » sur la courbe 2, la forme T de la protéine est majoritaire E) [a structure quaternaire de 'hémoglobine explique 'aspect de sa courbe de fixation de Toxygéne. Page 10/16Probléme (6 questions): Par ses actions concertées sur les vaisseaux, le rein et le coeur, le systéme rénine-angiotensine est !’un des systimes régulateurs de la pression artériclle Jes plus importants de lorganisme. Son effecteur principal est un octapeptide, Vangiotensine II, qui posséde des effets hypertenseurs par des propriétés vasoconstrictives propres d'une part et par la stimulation de la production d’aldostérone surrénalienne d’autre part. Angiotensinogéne naa Angiotensine | (1-10) (AGTI) “fh Ne Angiotensinell (1-8) (AGTID) Angiotensine 1-9 Aminopeptidases ‘AcE Angiotensine Wi (2-8)(AGTIT) Dans ce systtme, la rénine clive Pangiotensinogene (485 acides aminés) dans sa partie N- terminale et produit un décapeptide inactif, l’angiotensine I (AGTI). ATI peut étre son tour clivé par enzyme de conversion de l’angiotensine (ACE) en un octapeptide, l'angiotensine I] (AGT). AGTI: Asp-Arg-Val-Tyr-Ile-His-Pro-Phe-His-Leu -He-His-Pro-Phe AGTIL Asp-Arg-Val- QCM 32.: Quelle(s) est(sont) la(les) proposition(s) exacte(s) ? A) les protéolyses successives en cascade constituent un mode d’activation protéique B) larénine est une endoprotéase C) Ia perte de histidine et de la leucine modifie les propriétés électriques de AGTII par rapport a AGTI D) Phistidine et la leucine C terminales sont des résidus indispensables & l’activité hypertensive de I’angiotensine E) AGTI et AGTII sont clivables par la chymotrypsine. Page 11/15De plus, AGTH est degradé en AGTIII par des aminopeptidases (angiotensinases). AGTH posséde 40% de l’activité de ’ AGTII sur la pression artérielle et 100% de son activité sur la production d’aldostérone. AGT: Arg-Val-Tyr-He-His-Pro-Phe QCM 33.: Quelle(s) est(sont) la(les) propositions(s) exacte(s) ? A) la perte de Vaspartate en position N terminale modifie les propriétés hypertensives de la molécule B) la perte de Paspartate baisse le pHi de Pangiotensine III par rapport a celui de Vangiotensine II C) Fangiotensine III est un peptide phosphorylable D) Laspariate en position N terminale joue un rdle majeur sur la production daldostérone E) Tangiotensine [II peut étre clivée par la chymotrypsine. Page 12/15L'effet hypertenseur d’AGTII comme celui d’AGTILI est médié par un récepteur, le récepteur de langiotensine II (AGTRI), possédant sept domaines transmembranaires et couplé aux protéines G. Le géne codant pour ce récepteur est localisé en 3q21 et posséde plusieurs exons répartis sur 55 kilobases. Sa transcription peut produire quatre variants d’épissage AGTRIA D, le variant A étant Ie plus court, les variants B, C et D étant de plus en plus longs. La protéine traduite & partir de la forme B posséde une affinité plus faible pour l'angiotensine IT que la forme A. AUG 4080 pb UGA AGTRIA [Et —_ os Sid an pe AUG AUG 4122 pb UGA AGTRIB Leif ieeeebee: | mt AUG sommn _UGA AGTRIC ([LEt JE2 aS £4 — t5po ae AUG 1122 pb. UGA AGTRID [Et JE2IE3| Se Be La zone grisée correspond & la partie traduite QCM 34.: Quelle(s) est(sont) la(les) propositions(s) exacte(s) ? A) exon 4 de la forme A code pour lintégralité de la protéine mature AGTRIA B) exon 3 posséde un site initiateur de traduction qui explique pourquoi le transcrit B est plus long que le transerit A C) on peut déduire de la figure ci-dessus que si AGTRIB posséde une affinité plus faible pour AGTII que AGTRIA, alors AGTRID aura une affinité plus faible pour AGTII que AGTRIC D) on peut expliquer la différence d'expression tissulaire entre les différents variants par Ja variabilité importante qu’ils présentent & leur extrémité 3° non codante F) Ie signal de polyadgnylation est retrouvé dans "exon 4. Page 13/15Un polymorphisme en position 1166 (c.1166A>C, substitution simple de A par C) est retrouvé ayec une fréquence d'hétérozygotic anormalement ¢levée dans la population caucasienne. Ce polymorphisme est associé a Ja survenue d'une hypertension artérielle essentielle. QCM 35.: Quelle(s) proposition(s) est(sont) exacte(s) ? A) ce polymorphisme est présent dans la région 5” non codante du géne B) ce polymorphisme peut étre visualisé aprés RT-PCR par séquengage C) ce polymorphisme modifie un site donneur d’épissage et produit une forme tronquée du récepteur qui présente une affinité modifiée pour Pangiotensine IT D) le produit du gene portant le polymorphisme peut étre différencié de la forme normale par Western-Blot E) utilisation d’enzymes de restriction spécifiques peut permettre de visualiser ce polymorphisme sur ADN. Une autre mutation responsable d’hypertension artérielle et de prééclampsie (hypertension lors de la grossesse) a été mise en évidence sur le gene codant pour I’angiotensinogéne. Cette mutation touche le nucléotide signalé par un caractére gras dans les séquences suivantes. Angiotensinogéne mature sauvage : GAC CGG GIG TAC ATA CAC CCC TTC CAC CTC GTC ATC CAC AAT GAG AGT ACC TGT Angiotensinogéne mature muté : GAC CGG GTG TAC ATA CAC CCC TTC CAC TTC GTC ATC CAC AAT GAG AGT ACC TGT QCM 36.: Quelle(s) proposition(s) est(sont) exacte(s) ? A) la mutation produit un décalage du cade de lecture B) la mutation est silencieuse C) 1a mutation est faux sens 1D) Ja mutation est non sens E) Ja mutation transforme une leucine en phénylalanine Page 14/15Cette mutation a une conséquence importante puisqu'elle touche le site de clivage de Ja rénine dont les propriétés catalytiques vis-a-vis de ce substrat muté sont modifiées (dans les représentations de Lineweaver-Burk, ci-dessous, les expériences ont été réalisées avec des concentrations identiques de rénine), ord ont wed AGT normal AGT muté Surla figure B est figurée en pointillé la droite de la figure A Substrate nF (x) Kage (SY Kege/Ky (4 St) act normal «3-—=s«18,025.0 —-10,042.0 0.5620.05 AGT mut 6 3 -4e7H0,4 480.20. 2340.02 QCM 37.: Quelle(s) affirmation(s) est(sont) exacte(s) A) Vangiotensinogéne muté présente une affinité plus forte pour la rénine que la forme normale B) la mutation affcte la valeur de Km sans modifier la Vmax C) la mutation affecte la Vmax sans modifier le Km de enzyme pour son substrat 1D) ala fois Vmax et Km sont modifiés par la mutation E) [a rénine hydrolyse plus rapidement l’angiotensinogéne muté que I angiotensinogéne normal, é concentration saturante de substrat. 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