Génétique

Science de la genèse des êtres vivants

Etude des relations génotype/phénotpe

•Génétique du développement

•Génétique de l’évolution

•Génétique médicale
 Une brève histoire de la génétique

•1866 découverte des lois de Mendel

•1900-1910 théorie chromosomique de l’hérédité

•1944 identification de l’ADN comme vecteur d’hérédité

•1953 la double hélice

•1970 le clonage de l’ADN

•2002 séquence du génome humain

•2006 répertoire de plusieurs millions de variants

dans le génome humain
1.Unité, diversité du monde vivant

2.Organisation des génomes

3.Organisation des gènes eucaryotes

Unité, diversité du monde vivant
 Unité du monde vivant
Ascendance commune (Darwin)

Grandes similarités de constitution et d’organisation:

•Les acides nucléiques véhiculent des informations

•Une même lecture de l’information: code génétique

 • in vivo ADN
Transcription

ARN
Traduction

protéine
L’ADN permet l’autorenouvellement
du vivant dans un contexte cellulaire

La cellule est un système complexe intégré

capable de se reproduire et d’évoluer
 Diversité des organismes vivants
• Une grande variété de « formes »
• Des millions d’organismes vivants (espèces)
Apparition de la nouveauté: Reproduction
« presque » à l’identique

•Mutation ponctuelle
•Duplication, délétion
•Recombinaison
 Le principe de l’évolution

Mécanismes de renouvellement et de transmission du matériel génétique

Mutation: apparition de la nouveauté

Elimination maintien, expansion

cohérence interne, environnement

Polymorphisme des individus au sein des espèces

Polymorphisme des Phénotypes

AGTCGGTAGCAGTAGATAATG
environnement

Polymorphisme des Génotypes

AGTCGGTAGCGGTAGATAATG
•Polymorphisme des individus

•Différences génotypiques et phénotypiques

•Valeur adaptative, dérive génétique,

isolement reproductif

Evolution des espèces, spéciation

 Grandes lignes d’une classification du vivant

• Procaryotes/eucaryotes,
unicellulaires/multicellulaires
=regroupement par similitude
• Phylogénie = regroupement par ascendance
commune
eubactéries archéobactéries

VIRUS
mitochondries
eucaryotes
Organisation des génomes
 Organisation des génomes

Espèces nucléotides gènes % ADN

codant
E. coli ~ 4,2 x 106 ~ 4000 ~ 90

Levure 1,3 x 107 ~ 7000 ~ 70

drosophile 1,8 x 108 ~ 20 000 ~ 33

H. sapiens 3,0 x 109 ~ 30 000 ~ 10

Xenope 2,0 x 1010 ~ 25 000 ~ 1,5

 ORGANISATION DU GENOME HUMAIN

GENOME HUMAIN
3200 MB

ADN intergénique:
Gènes: 1200 Mb 2000 MB

Séquences
Autres: 600 MB
répétées: 1400 MB
 ADN répété « non codant »
Type de Taille du Nombre de localisation
répétition motif copies
En tandem

•DNA satellite α 171 8x105 Centromères

•Minisatellites 6 104 Télomères

télomériques
Tous les
•microsatellites 1-5 5x105 chromosomes

Dispersées
Line 6000 106
Tous les
106 chromosomes
Alu 300
•Minisatellites télomériques: (TTAGGG)n

•Microsatellites: (GT)n ou (ATT)n

•Grand polymorphisme de ces séquences (n variable)

AGCCCATGAGTGTGTGTGTGTGTGTATTTGGA

AGCCCATGAGTGTGTGTGTATTTGGA
 ADN répété codant

• Familles de gènes: ex globines, histones

• (quelques gènes à quelques centaines de
gènes)
• ADN codant pour les ARNs ribosomiques
• (10 000-50 000 gènes)
• ADN codant pour les ARNs de transfert
Gains et perte de gènes, évolution par duplication
Familles de gènes

duplication

Mutations
Mécanismes de duplication des séquences

•Transposition
•Recombinaison inégale
•Duplication de l’ensemble du génome
 rétrotransposition
Locus A
Locus B

ARN

ADN

Locus A Locus B
 POL POLYA

LINE 6000 nt

POLYA

ALU

Un petit nombre de séquences LINE et ALU sont « actives »

La rétrotransposition peut entraîner des anomalies génétiques

 Recombination illégitime
une conséquence de la présence de séquences répétées

Prak & Kazazian. (2000) NRG. 1: 134-144

Organisation des gènes
eucaryotes
promoteur ADN
EXON 1 EXON 2 EXON3 EXON 4
TRANSCRIPTION

ARN transcrit primaire

EPISSAGE

ARNm
AUG UGA

TRADUCTION
protéine

Organisation modulaire des gènes

Notions de taille des gènes eucaryotes

• Exons: 150-200 nucléotides en moyenne

• Introns: très variable selon les espèces et selon
les gènes
• Nombre d’exons par gène: de 1 à plusieurs
centaines (souvent autour de 10-20)
Structure modulaire et combinatoire des protéines
 Epissage alternatif:
1 gène, plusieurs protéines

EXON 1 EXON 2A EXON 2B EXON 3

TRANSCRIPTION

ARN

EPISSAGE

ARNm
EX 1 EX 2A EX 3 EX 1 EX 2B EX 3

Diversité fonctionnelle des isoformes protéiques

 Promoteurs et épissage alternatifs :

P1 P2

EXON 1A EXON 1B EXON 2 EXON 3

transcription
EXON 1A EXON 1B EXON 2 EXON 3
EXON 1B EXON 2 EXON 3

épissage

EX 1A EX 2 EX 3 EX 1B EX 2 EX 3
 Recombinaison non allélique du génome:
Diversité combinatoire facilitée au cours de l’évolution

Gène A E1 E2

Gène B
E’1 E’2 E’3

Gène C E1 E’2 E’3

Nouvelle combinaison des exons

 Rôles des introns?
1- Pour l’expression des gènes

• Source d’ARNs non codant

• Source d’éléments de régulation
• Générateurs de diversité par épissage alternatif

2- Au cours de l’évolution?

• Permettent le partage de domaines entre différents

gènes par recombinaison au cours de l’évolution