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ESTRUCTURA MOLECULAR
El agua es una molécula formada por dos átomos de Hidrógeno y uno de Oxígeno.
La unión de esos elementos con diferente electronegatividad proporciona unas
características poco frecuentes. Estas características son:
· La molécula de agua, aun siendo neutra, forma un dipolo, aparece una zona con
un diferencial de carga positivo en la región de los Hidrógenos, y una zona con
diferencial de carga negativo, en la región del Oxígeno.
LA DENSIDAD DEL AGUA: en estado líquido, el agua es más densa que en estado
sólido. Por ello, el hielo flota en el agua. Esto es debido a que los puentes de
Hidrógeno formados a temperaturas bajo cero unen a las moléculas de agua
ocupando mayor volumen.
Las propiedades del agua permiten aprovechar esta molécula para algunas
funciones para los seres vivos. Estas funciones son las siguientes:
· Disolvente polar universal: el agua, debido a su elevada constante dieléctrica,
es el mejor disolvente para todas aquellas moléculas polares. Sin embargo,
moléculas apolares no se disuelven en el agua. Esta propiedad, tal vez la más
importante para la vida, se debe a su capacidad para formar puentes de
hidrógeno con otras sustancias que pueden presentar grupos polares o con
carga iónica (alcoholes, azúcares con grupos R-OH, aminoácidos y proteínas
con grupos que presentan cargas + y - , lo que da lugar a disoluciones
moleculares También las moléculas de agua pueden disolver a sustancias
salinas que se disocian formando disoluciones iónicas.
· Lugar donde se realizan reacciones químicas: debido a ser un buen disolvente,
por su elevada constante dieléctrica, y debido a su bajo grado de ionización.
· Función estructural: por su elevada cohesión molecular, el agua confiere
estructura, volumen y resistencia.
· Función de transporte: por ser un buen disolvente, debido a su elevada constante
dieléctrica, y por poder ascender por las paredes de un capilar, gracias a la
elevada cohesión entre sus moléculas, los seres vivos utilizan el agua como
medio de transporte por su interior.
· Función amortiguadora: debido a su elevada cohesión molecular, el agua sirve
como lubricante entre estructuras que friccionan y evita el rozamiento.
· Función termorreguladora: al tener un alto calor específico y un alto calor de
vaporización el agua es un material idóneo para mantener constante la
temperatura, absorbiendo el exceso de calor o cediendo energía si es necesario.
PROPIEDADES BIOQUÍMICAS DEL AGUA:
Como ya se dijo anteriormente los procesos de la vida requieren que una gran
variedad de iones y moléculas se muevan en proximidad, es decir, que sean
solubles en un medio común. El agua funciona como disolvente universal en los
medios intracelular y extracelular gracias a su destacada capacidad como
disolvente.
¿Qué es el pH?
Cuando, por ejemplo, decimos que el agua está a 91° Celsius expresamos
exactamente lo caliente que está. No es lo mismo decir “el agua está caliente” a
decir “el agua está a 91 grados Celsius”.
De igual modo, no es lo mismo decir que el jugo de limón es ácido, a saber que su
pH es 2,3, lo cual nos indica el grado exacto de acidez. Necesitamos ser específicos.
Escala de pH
Los ácidos y las bases tienen una característica que permite medirlos: es la
concentración de los iones de hidrógeno (H+). Los ácidos fuertes tienen altas
concentraciones de iones de hidrógeno y los ácidos débiles tienen concentraciones
bajas. El pH, entonces, es un valor numérico que expresa la concentración de
iones de hidrógeno.
Hay centenares de ácidos. Ácidos fuertes, como el ácido sulfúrico, que puede
disolver los clavos de acero, y ácidos débiles, como el ácido bórico, que es bastante
seguro de utilizar como lavado de ojos. Hay también muchas soluciones alcalinas,
llamadas "bases", que pueden ser soluciones alcalinas suaves, como la Leche de
Magnesia, que calman los trastornos del estómago, y las soluciones alcalinas
fuertes, como la soda cáustica o hidróxido de sodio, que puede disolver el cabello
humano.
Las enzimas actúan modificando las moléculas del sustrato para que sean más
reactivas, para que se unan a otros átomos, etc. Por ejemplo, la enzima anhidrasa
carbónica cataliza muy rápidamente la conversión de dióxido de carbono en
bicarbonato y en hidrogeniones.
En resumen, las enzimas son proteínas que tienen por función activar, controlar y
finalizar todas las reacciones metabólicas que suceden en el organismo, regulando
su velocidad de acción.
ANABOLISMO
Son los procesos donde las células descomponen o “degradan” las macromoléculas
de carbohidratos, grasas y proteínas y las transforman en sustancias más simples.
De esa forma se libera la energía almacenada en ellas y puede utilizarse como
combustible para realizar las distintas funciones orgánicas como, por ejemplo,
mantener la temperatura normal del cuerpo, respirar o caminar. Las sustancias
simples producidas por el catabolismo (dióxido de carbono, urea, amoníaco, etc.)
son eliminadas del organismo por los riñones, los intestinos, los pulmones y la piel.
La energía obtenida se almacena como ATP. El catabolismo, o metabolismo
destructivo, cumple entonces con dos propósitos:
1.- Liberar energía útil para las reacciones de síntesis de nuevas moléculas
(anabolismo).
METABOLISMO BASAL
Si hay dos personas de la misma talla, peso y hábitos alimenticios y una de ellas
utiliza menos calorías durante el sueño tendrá un menor metabolismo basal, con
tendencia a ganar peso. En los animales de sangre caliente, el metabolismo basal
es inversamente proporcional al tamaño corporal. Un ratón posee un metabolismo
basal mucho más elevado que un elefante.
Los vegetales verdes transforman la energía solar en energía química a partir del
dióxido de carbono atmosférico, del agua absorbida por las raíces (savia bruta) y de
la clorofila, pigmento verde característico presente en los cloroplastos de las hojas.
Mediante este proceso, denominado fotosíntesis, las plantas elaboran glucosa
como fuente de energía para sus reacciones metabólicas. Además, es importante
señalar que los procesos fotosintéticos producen oxígeno que es devuelto a la
atmósfera donde es utilizado para la respiración de animales y de los propios
vegetales. La fotosíntesis es la base de la vida en la actualidad, ya que permite la
alimentación de todos los organismos vivos del planeta, como los herbívoros en
forma directa y los carnívoros y carroñeros en forma indirecta.
Los animales no pueden fotosintetizar, con lo cual deben incorporar los alimentos
por ingestión de vegetales y animales. De esa forma incorporan los hidratos de
carbono, como la glucosa y demás nutrientes como fuente de energía para realizar
su metabolismo. Los alimentos comienzan a degradarse en la boca con la
masticación. Cuando llegan al estómago y al intestino delgado, los azúcares, grasas
y proteínas son degradados por las enzimas digestivas a sustancias más pequeñas
como monosacáridos (glucosa), ácidos grasos y aminoácidos. De esa forma son
absorbidos hacia la circulación sanguínea y llegan a los tejidos de todo el
organismo. Cuando ingresan al interior de las células, algunos nutrientes son
utilizados para construir nuevas moléculas. El resto es atacado por otro tipo de
enzimas que regulan o aceleran (catalizan) las reacciones bioquímicas para que
sean metabolizados. Es así como se libera la energía contenida en los nutrientes y
es utilizada para los procesos vitales del individuo. Parte de esa energía se pierde
como calor, y otra parte se guarda en las moléculas de ATP (adenosín trifosfato). El
ATP almacena la energía en el hígado, en los músculos y en el tejido graso hasta
que las células la necesiten. La finalidad de todo este proceso es producir la materia
prima y la energía que un ser vivo necesita para crecer, reproducirse, generar calor
y realizar todas las funciones vitales.
ALIMENTOS Y ENERGÍA
Cada gramo de hidratos de carbono contiene 4,1 Cal, mientras que un gramo de
proteínas produce 4,2 Cal y un gramo de grasas 9,3 Cal. Muchos animales
necesitan de las grasas en su alimento por su alto valor energético, sobre todo
aquellos que habitan en ecosistemas de bajas temperaturas como el oso polar y el
zorro del ártico.
METABOLISMO DE LOS ALIMENTOS
Hidratos de carbono
Lípidos
El producto de la digestión de los lípidos es el glicerol y los ácidos grasos, que más
tarde se convierten en triglicéridos, fosfolípidos y colesterol. Las grasas son
importantes en la constitución de las membranas celulares, como fuente energética
y en la absorción de las vitaminas liposolubles como la A, D, E y K. Se almacenan
en células especiales, los adipocitos, que forman parte del tejido adiposo. El
catabolismo de los lípidos produce compuestos de carbono que al degradarse
forman dióxido de carbono y agua, igual que los carbohidratos.
Proteínas
Los aminoácidos son los productos de la digestión de las proteínas por acción de
las enzimas digestivas. Los aminoácidos son muy importantes para el anabolismo
de las células, ya que se transforman en proteínas que cumplen diversas funciones.
Además de formar una parte importante desde el punto de vista estructural, las
proteínas se comportan como hormonas, enzimas y anticuerpos. El catabolismo de
los aminoácidos que no son utilizados por el organismo sigue dos rutas. Una de
ellas tiene por objetivo desprenderse del nitrógeno que forma parte de sus
moléculas, para unirse al dióxido de carbono y al agua y formar urea, amonio y ácido
úrico que serán excretados vía renal. Luego de este proceso, llamado
desaminación, el resto de los aminoácidos son nuevamente catabolizados dando
dióxido de carbono y agua como sustancias de deseho.H6.
TERMODINAMICA
Ampliar
1.
INTRODUCCIÓN
2.
3.
La primera ley de la termodinámica da una definición precisa del calor, otro concepto
de uso corriente.
Cuando un sistema se pone en contacto con otro más frío que él, tiene lugar un
proceso de igualación de las temperaturas de ambos. Para explicar este fenómeno,
los científicos del siglo XVIII conjeturaron que una sustancia que estaba presente
en mayor cantidad en el cuerpo de mayor temperatura fluía hacia el cuerpo de
menor temperatura. Según se creía, esta sustancia hipotética llamada “calórico” era
un fluido capaz de atravesar los medios materiales. Por el contrario, el primer
principio de la termodinámica identifica el calórico, o calor, como una forma de
energía. Se puede convertir en trabajo mecánico y almacenarse, pero no es una
sustancia material. Experimentalmente se demostró que el calor, que originalmente
se medía en unidades llamadas calorías, y el trabajo o energía, medidos en julios,
eran completamente equivalentes. Una caloría equivale a 4,186 julios.
En cualquier máquina, hace falta cierta cantidad de energía para producir trabajo;
es imposible que una máquina realice trabajo sin necesidad de energía. Una
máquina hipotética de estas características se denomina móvil perpetuo de primera
especie. La ley de conservación de la energía descarta que se pueda inventar nunca
una máquina así. A veces, el primer principio se enuncia como la imposibilidad de
la existencia de un móvil perpetuo de primera especie.
4.
SEGUNDO PRINCIPIO DE LA TERMODINÁMICA
5.
CICLOS TERMODINÁMICOS
Ciclo de Carnot
Ciclo de Carnot
El ciclo ideal de Carnot fue propuesto por el físico francés Sadi Carnot, que vivió a
principios del siglo XIX. Una máquina de Carnot es perfecta, es decir, convierte la
máxima energía térmica posible en trabajo mecánico. Carnot demostró que la
eficiencia máxima de cualquier máquina depende de la diferencia entre las
temperaturas máxima y mínima alcanzadas durante un ciclo. Cuanto mayor es esa
diferencia, más eficiente es la máquina. Por ejemplo, un motor de automóvil sería
más eficiente si el combustible se quemara a mayor temperatura o los gases de
escape salieran a menor temperatura.
Enciclopedia Encarta
6.
7.
Por ello se diseñaron métodos estadísticos para obtener los valores medios de las
variables mecánicas de las moléculas de un sistema y deducir de ellos las
características generales del sistema. Estas características generales resultan ser
precisamente las variables termodinámicas macroscópicas. El tratamiento
estadístico de la mecánica molecular se denomina mecánica estadística, y
proporciona a la termodinámica una base mecánica.
Sin embargo, las reacciones pueden clasificarse también en función de su variación de energía
libre, DG, parámetro fundamental para determinar si una reacción química es o no
espontánea (como puedes ver explicado con mayor profundidad aquí). Y esta clasificación
también tiene su propio nombre, aunque mucho menos utilizados que los de exotérmica y
endotérmica. En función de la energía libre, las reacciones químicas se clasifican como
“endergónicas” y “exergónicas”. En este caso se tiene en cuenta el balance entre la entalpía
y la entropía, es decir, el cálculo de la energía libre de Gibbs se realiza como:
ΔG = ΔH – TΔS
Y así:
– Reacción endergónica: es aquella reacción química en la cual la variación de energía
libre de Gibbs es positiva. Por tanto, se tratará de una reacción desfavorable o no
espontánea. Si consideramos condiciones estándar de presión y temperatura, tenemos:
ΔGo > 0
– Reacción exergónica: es aquella reacción química en la cual la variación de energía libre
de Gibbs es negativa. Se trata, así, de una reacción espontánea (aunque recordemos que
la espontaneidad no nos dice nada acerca de la velocidad a la cual se producirá la reacción
química, es decir, de la cinética química). En condiciones estándar de presión y temperatura,
por tanto, tendremos:
ΔGo < 0
Esperamos que este apunte os sirva para recordar que “reacción endergónica” y “reacción
exergónica” son también conceptos válidos y adecuados para una explicación precisa en
termoquímica.
Introducción
Una célula puede considerarse como una pequeña ciudad bulliciosa. Proteínas portadoras
mueven sustancias hacia el interior y el exterior de la célula, proteínas motoras transportan
cargas a lo largo de pistas formadas por microtúbulos y las enzimas metabólicas afanosamente
degradan y construyen macromoléculas.
Incluso si no son energéticamente favorables (que liberan energía, o que son exergónicos) de
forma aislada, estos procesos continuarán alegremente si hay energía disponible para
impulsarlos (así como un negocio que continuará realizándose en una ciudad mientras fluya
dinero). Sin embargo, si la energía se agota, las reacciones se detienen y la célula comienza a
morir.
El adenosín trifosfato, o ATP, es una molécula pequeña relativamente simple. Esta puede ser
considerada como la principal moneda energética de las células, así como el dinero es la
principal moneda económica de las sociedades humanas. La energía liberada por la hidrólisis
(degradación) del ATP se utiliza para impulsar muchas reacciones celulares que requieren
energía.
Estructura del ATP. En el centro de la molécula se encuentra un azúcar (ribosa), unida a la base
adenina de un lado y a una cadena de tres fosfatos al otro. El grupo fosfato más cercano a la
ribosa se denomina grupo fosfato alfa, el que está a la mita de la cadena es el grupo fosfato
beta y el del final es el grupo fosfato gama.
Estructuralmente , el ATP es un nucleótido de ARN que lleva una cadena de tres fosfatos. En
el centro de la molécula se encuentra un azúcar de cinco carbonos, una ribosa, que se une a la
base nitrogenada adenina y a la cadena de tres fosfatos.
Los tres grupos fosfato se denominan —en orden del más cercano al más alejado del azúcar
ribosa— alfa, beta y gamma. El ATP es inestable debido a las tres cargas negativas adyacentes
en su cola fosfato, la cuales no se "quieren" e intentan alejarse entre ellas. Los enlaces entre
los grupos fosfato se llaman enlaces fosfoanhídridos y puedes encontrar que se llamen
enlaces de "alta energía".
¿Por qué se considera que los enlaces fosfoanhídridos son de alta energía? Todo lo que esto
realmente significa es que se libera una cantidad apreciable de energía cuando uno de estos
enlaces se rompe en una reacción de hidrólisis (ruptura mediada por agua). El ATP se hidroliza
a ADP en la siguiente reacción:
\text {ATP} + \text {H} _2 \text {O} \leftrightarrow \text {ADP} + \text P_i + \text {energía}ATP+H2
O↔ADP+Pi+energıa
́
Nota: \text {P}_iPiP, start subscript, i, end subscript simplemente representa a un grupo de
fosfato inorgánico \text{(PO}_4^{3-}\text)(PO43−)left parenthesis, P, O, start subscript, 4, end
subscript, start superscript, 3, minus, end superscript, right parenthesis.
\text {Energía} + \text {ADP} + \text P_i \leftrightarrow \text {ATP} + \text {H} _2 \text
́ +ADP+Pi↔ATP+H2O
{O}Energıa
Hemos mencionado que se libera un montón de energía libre durante la hidrólisis de ATP, pero
¿exactamente de cuánto estamos hablando? La ∆G para la hidrólisis de un mol de ATP en ADP
y \text P_iPiP, start subscript, i, end subscript es −7.3 \text{kcal/mol}kcal/molk, c, a, l, slash, m,
o, l (−30.5\text{kJ/mol}kJ/molk, J, slash, m, o, l) en condiciones estándar
(concentración 111 \text MMM de todas las moléculas, 252525°C, and \text{pH} = 7.0pH=7.0p,
H, equals, 7, point, 0). No est mal, pero las cosas se ponen más impresionantes bajo condiciones
no estándar: La ∆G para la hidrólisis de un mol de ATP en una célula viva es casi el doble del
valor observado en condiciones normales, cerca de -14−14minus, 14 \text{kcal/mol}kcal/molk,
c, a, l, slash, m, o, l (−57 \text{kJ/mol}kJ/molk, J, slash, m, o, l).
Reacciones acopladas
¿Cómo se utiliza la energía liberada por la hidrólisis de ATP para impulsar otras reacciones en
una célula? En la mayoría de los casos, las células utilizan una estrategia
denominada acoplamiento de reacciones, en la que una reacción energéticamente favorable
(como la hidrólisis de ATP) se vincula directamente con una reacción energéticamente
desfavorable (endergónica). La vinculación suele ocurrirmediante un intermedio compartido,
es decir, que el producto de una reacción es "recogido" y utilizado como reactivo en la segunda
reacción.
Cuando dos reacciones se acoplan, estas pueden añadirse para dar una reacción general y la
ΔG de esta reacción será la suma de los valores de ΔG de las reacciones individuales. Mientras
el ΔG global sea negativo, ambas reacciones pueden ocurrir. Incluso puede ocurrir una reacción
muy endergónica si se acopla a una muy exergónica (como la hidrólisis de ATP). Por ejemplo,
podemos sumar un par de reacciones genéricas acopladas por un intermedio común, B, de la
siguiente manera^22start superscript, 2, end superscript:
A↔BΔG=X
+B↔C+DΔG=Y−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−
A↔C+DΔG=X+Y
Cuando participa ATP en el acoplamiento de reacciones, el intermedio compartido suele ser una
molécula fosforilada (una molécula a la que se ha añadido un grupo fosfato del ATP). Como
ejemplo de cómo funciona esto, veamos la formación de sacarosa, o azúcar de mesa, a partir
de glucosa y fructuosa^{3,4}3,4start superscript, 3, comma, 4, end superscript.
+ATP+H2O↔ADP+PiΔG=−30kJ/mol−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−
−−−−−−−−−−−−−−−−
glucosa+fructosa+ATP↔sacarosa+ADP+PiΔG=−3kJ/mol
En la primera reacción, se transfiere un grupo fosfato del ATP a la glucosa para formar
un intermediario fosforilado de la glucosa (glucosa-P). Esta es una reacción
energéticamente favorable (que libera energía) porque el ATP es muy inestable, es
decir, realmente "quiere" perder su grupo fosfato.
Cuando esta reacción es acoplada con la hidrólisis del ATP, se lleva a cabo en dos pasos
energéticamente favorables. En el primer paso, se transfiere un grupo fosfato del ATP a la
glucosa, creando la molécula intermediaria glucosa-P. La glucosa-P es reactiva (inestable) y
puede reaccionar con la fructosa para generar sacarosa, liberando un fosfato inorgánico en el
proceso.
Este ejemplo muestra cómo una reacción acoplada que involucra ATP puede funcionar por
medio de fosforilación, dividiendo una reacción en dos pasos energéticamente favorables
conectados por un intermediario fosforilado (que lleva un fosfato). Esta estrategia es utilizada
en muchas rutas metabólicas en la célula, proporcionando una manera para llevar a cabo otras
reacciones por medio de la conversión de ATP en ADP.
Mover sodio (\text {Na}^+Na+N, a, start superscript, plus, end superscript) al exterior o potasio
(\text K^+K+K, start superscript, plus, end superscript) al interior de una célula típica es
energéticamente desfavorable porque este movimiento es en contra de sus gradientes de
concentración. El ATP proporciona la energía para el transporte de sodio y potasio a través de
una proteína embebida a la membrana llamada bomba de sodio-potasio (bomba de Na+/K+).
1. Tres iones de sodio se unen a la bomba de sodio-potasio, que está abierta hacia el
interior de la célula.
Imagen modificada de "La bomba de intercambio de sodio potasio", por personal de Blausen
(CC BY 3.0).
En este proceso, el ATP transfiere uno sus grupos fosfato a la proteína bomba, y se forma ADP
y una forma fosforilada "intermediaria" de la bomba. La bomba fosforilada es inestable en su
conformación original (que abre hacia el interior de la célula) y se estabiliza al cambiar de forma,
abriéndose hacia el exterior de la célula, donde libera iones de sodio. Cuando se unen iones de
potasio extracelulares a la bomba fosforilada, estos activan la eliminación del grupo fosfato, con
lo que la proteína se vuelve inestable en su forma que abre hacia el exterior. La proteína se
vuelve más estable regresando a su forma original, con lo que libera los iones potasio dentro de
la célula.