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Las Proteínas

Estructura tridimensional
de las proteínas
Niveles de organización
en la
estructura proteica

Las proteínas son


macromoléculas de alta
masa molecular, donde la
estructura tridimensional
está directamente
relacionada con la función
que cumplen.
Los niveles de estructura
encontrados en las
proteínas son los siguientes

• Primaria
• Secundaria
• Terciaria
• Cuaternaria (* no en todas)
Estructura primaria

Representa la secuencia lineal de aminoácidos


específicos que se encuentran en una cadena. Las
secuencias proteicas se construye a partir de la información
de los 20 aminoácidos codificados en el código genético.
Secuencia de aminoácidos, estructura y función de las
proteínas

Secuencia proteica cadena alfa


Efectos en la alteración de la secuencia aminoacídica:
ANEMIA FALCIFORME La anemia falciforme o
anemia drepanocítica es
una enfermedad genética
recesiva
Se produce por la
sustitución en el gen de la
cadena beta de la
hemoglobina, donde se
cambia Adenina por
Timina
Como consecuencia en la
cadena polipeptídica se
incorpora valina en el
lugar de ácido glutámico
en la posición 6 de la
cadena.
Esta alteración hace que
la hemoglobina forme
agregados a bajas
presiones de oxígeno,
originando la forma de
hoz.
El albinismo
Los melanocitos son células
especializadas de la piel
localizadas en la capa basal
de la epidermis, producen y
secretan melanina, el
pigmento que da color a la
piel, ojos y cabello .
La melanina, es producida a
partir del aminoácido tirosina
por la enzima tirosinasa
El albinismo es una
enfermedad congénita de
carácter recesivo (hay
también otras formas de
herencia), que se produce
por mutación en esta
enzima, por lo tanto no se
puede sintetizar el pigmento
Alteraciones de las vías metabólicas por
deficiencias enzimáticas con bases genéticas
Errores congénitos del
metabolismo:
Distintas vías del
metabolismo pueden verse
afectadas cuando por
alteraciones genéticas se
produce la ausencia o
alteración de una enzima
que regula un paso
específico de una
determinada vía.
Ejemplos de estas
enfermedades
relacionadas al
metabolismo de
fenilalanina y tirosina son:
-fenilcetonuria
-tirosinemias
-alcaptonuria
BASES GENÉTICAS DE LA FENILCETONUARIA

El cambio de G en el lugar de A en el gen de PAH muta el codón de inicio, por lo tanto la


síntesis de esta enzima no puede realizarse, porque no existe codón de inicio
Mutaciones que alteran la actividad enzimática de una proteína

La mutante R408W de la
enzima PAH (fenilalanina
hidroxilasa ), se produce
cuando el codón 408,
codificante para arginina
(R), es mutado ya que se
introduce T en el lugar de
C.
Esto hace que el codón
cambie y codifique para
triptófano (W).
El cambio en este
aminoácido hace que la
enzima resultante no
tenga actividad PAH
Determinación de la secuencia proteica
Frederick Sanger y sus
colaboradores, son los primeros
en secuenciar una proteína a
principios de 1950.
La proteína estudiada fue insulina
de ternera, la que está formada
por 2 cadenas de polípéptidos de
21 y 30 aminoácidos.
El aporte de Sanger marca un hito
en la biología molecular
permitiendo revelar la
especificidad en la estructura
proteica dada por la secuencia de
aminoácidos que estas poseen.
Obtuvo dos veces el premio Nobel
de Química
Los primeros ordenadores
Estructura secundaria de las proteínas
La estructura secundaria de
una proteína revela la
conformación (arreglo
tridimensional, organización
espacial) de fragmentos de la
proteína, de aminoácidos
próximos en la cadena.
Los estudios originales
realizados por Pauling y
Corey, postularon que los
polipéptidos presentan
conformaciones
características en las que se
produce el máximo número
posible de interacciones por
puentes de hidrógeno.
Se propuso 2 tipos de
conformaciones:
- hélice alfa
-lámina beta plegada
Conformaciones de estructura secundaria
posible

Alfa hélice Hoja β


Naturaleza del enlace peptídico
HÉLICE ALFA
Las hélice alfa se
caracterizan por:
- Ser hélices dextrógiras
- En el interior de la hélice
se encuentra el esqueleto
- Hacia el exterior se
encuentran las cadenas
laterales
- La estructura helicoidal
es estabilizada por la
formación de puentes de
hidrógeno
- En cada vuelta completa
en un fragmento de la
hélice hay 3.6 residuos
de aminoácidos
Alfa hélice
En la hélice alfa se produce un
acercamiento entre el grupo
carbonilo de un enlace peptídico
con el grupo –NH de otro enlace,
lo que permite formar puentes
de hidrógeno.
Los puentes de hidrógeno se
orientan casi paralelos al eje y
otorgan estabilidad a la hélice
las superficies opuestas de las
hélices pueden tener
propiedades opuestas:
- una región puede tener
residuos polares que
interaccionan con el solvente,
externa
-otra región, con carácter no
polar o hidrofóbico, hacia el
interior
Alfa hélice

• El esqueleto está formado por la cadena polipeptídica unida a través de los


peptídicos, enrollada compactamente en torno a un eje imaginario, donde las
cadenas laterales sobresalen hacia el exterior. La unidad repetitiva es el giro
de la hélice, con 3.6 residuos (5.5 Aº). El giro de la hélice es dextrógiro
Alfa hélice

La estabilidad de la estructura alfa hélice depende de:


1. Repulsión a atracción electroestática entre residuos de aminoácidos
2. El volumen de los grupos R adyacentes
3. Las interacciones entre cadenas laterales de aminoácidos sep. 3-4 res
4. Residuos de Prolina y glicina
5. Interacción entre residuos de los extremos de la hélice y el dipolo
eléctrico
HOJA BETA PLEGADA

• Las hojas beta plegadas están formadas por segmentos de la cadena


con orientación paralela entre sí, en la que el esqueleto tiene una
conformación con pliegues o dobleces.
• La estabilidad también se logra también por la formación de puentes de
hidrógeno, pero que son perpendiculares al eje de la hoja.
• Los grupos R se proyectan hacia arriba y hacia debajo del esqueleto
Hojas Beta paralelas y anatiparalelas

La disposición de las cadenas en las hojas beta puede ser de forma


paralela (presentan la misma orientación amimo-carboxilo terminal)
o antiparalela (orientaciones opuestas)
Representación de la estructura secundaria

• Las regiones de alfa hélice se muestran como espirales, las regiones de


hoja beta plegada como listones aplanados con flechas que marcan el
sentido N-C terminal
Estructura Terciaria
de las Proteínas
La estructura terciaria de una
proteína describe la conformación
espacial total de una proteína, el
aspecto íntegro de la distribución
espacial de todos los átomos de
esta proteína.
De acuerdo a esta conformación las
proteínas se clasifican en:
• Proteínas fibrosas ( forma
alargada)
• Proteínas globulares (forma
compacta)
Proteínas fibrosas
Las proteínas fibrosas son
características de los
materiales estructurales fuera
de la célula.
Las proteínas fibrosas constan
de largas hebras u hojas
aplanadas que resisten las
fuerzas de tensión a las que
están expuestas.

Ejemplos de proteínas fibrosas


son:
-colágeno (tejido conectivo)
-elastina
-queratina (cabello, piel, uñas)
- fibroína de la seda
El colágeno
El colágeno
El colágeno es una proteína
característica del tejido
conectivo, uno de los
principales componentes
de la piel, hueso, cartílago,
tendones, etc.
Consta de fibras que actúan
como cables que permiten
resistir las fuerzas de
tensión entre los espacios
que rodean a las células.
Las fibras de colágeno son
polímeros formados a partir
de monómeros compuestos
de tres cadenas
polipetídicas helicoidales
(cadenas α), las que se
enrollan sobre sí mismas
para formar una triple
hélice.
El colágeno

La estructura del colágeno es especial, ya que sus cadenas son hélices levógiras
Los monómeros de colágeno se organizan de forma escaliforme para formar
microfibrillas, y estas a su vez dan origen a fibras de mayor calibre con un patrón de
bandas característico al microcopio electrónico
Estructura tridimensional del
colágeno
El colágeno
La composición de
aminoácidos en la cadena
polipetídica también es
poco común.
Cada cadena está formada
por aproximadamente 1000
aminoácidos, donde glicina
constituye casi un tercio.
Normalmente se tiene la
relación:
35 % glicina
11 % de de alanina
21 % de prolina y de 4-
hidroxiprolina.
La secuencia suele ser la
repetición del tripéptido:
Gly-X-Y (donde X es a
menudo prolina, e Y es a
menudo 4-Hyp.
Los residuos de glicina
pueden acomodarse a las
uniones estrechas
Los residuos de glicina
pueden acomodarse a las
uniones estrechas
Los residuos de prolina
permiten el marcado
enrollamiento
Las cadenas alfa del colágeno y
las moléculas de fibrilla se
entrecruzan por enlaces
covalentes no habituales en los
que participan residuos de
lisina, hidroxilisina o histidina
presentes en algunas de las
posiciones x o y
Biosíntesis de Colágeno
El colágeno es una proteína
que experimenta importantes
modificaciones en su
estructura:
1. La cadenas son sintetizadas
2. Residuos de prolina y lisina
son hidroxilados,
3. se añaden residuos
glicosídicos (procolágeno)
4. Tres moléculas de
procolágeno se enrollan y
forman una triple hélice, se
pliegan los dominios
globulares
5. Secreción al exterior
6. Se remueven las regiones N y
C terminal
7. Desaminación de residuos de
lisina para formar aldehídos y
Fibroína de la seda
Queratinas
Proteínas Globulares

La hemoglobina es una proteína encargada de fijar oxígeno y


facilitar su difusión en el músculo, esta formada por una sola
cadena polipetídica que consta de 153 aminoácidos. Está
formado por 8 fragmentos de alfa hélice, conectados por giros
Estructura de las proteínas
globulares: patrones de
plegado
• Las proteínas globulares
presentan un exterior y un interior
definido
• Las láminas beta están
generalmente enrolladas o
envueltas en patrones cilíndricos.
• La cadena polipeptídica puede
doblas las esquinas de diversos
modos. Una clase de giro
compacto se denomina giro beta
• No todas las partes de las
proteínas globulares pueden
clasificarse como hélice, lámina
beta o giro
Disposición de los residuos hidrofílicos e hidrofóbicos

Representación tridimensional de la proteína Citocromo C. En la


secuencia aminoacídica, los residuos hidrofóbicos están marcados
con rojo, y en verde los hidrofílicos.
Giros Beta
Estructuras características de las proteínas globulares
DOMINIOS Y MOTIVOS DE UNA
PROTEÍNA

Los dominios
representan regiones
individuales que están
unidos entre sí
mediante porciones
flexibles, y que suelen
actuar de forma
independiente.
Los motivos
representan
subestructuras, por
ejemplo, la espiral
enrollada o barril α/β
La Mioglobina
La mioglobina es
una proteína que
funciona en el
tejido muscular
para almacenar
oxígeno
La molécula de
oxígeno se une al
grupo HEMO
Presenta ocho
fragmentos de alfa
hélice
La Mioglobina

La hemoglobina es una proteína encargada de fijar oxígeno y


facilitar su difusión en el músculo, esta formada por una sola
cadena polipetídica que consta de 153 aminoácidos. Está
formado por 8 fragmentos de alfa hélice, conectados por giros
El grupo Hemo
Estructura cuaternaria de las proteínas
La estructura
cuaternaria de una
Proteína representa a
aquellas proteínas que
están formadas por mas
de una subunidad
Secuencia proteica cadena alfa
Función de Las
Proteínas