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INTRODUCCION……………………………………………………………………….….1
I. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA
II. AMINOÁCIDOS
III. PROTEÍNAS
OBJETIVOS:
Comprobar la actividad enzimática en los procesos bioquímicas.
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IV. METABOLISMO
V. GLUCÓLISIS
VI. OXIDACIÓN.
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VIII. GLUCONEOGÉNESIS.
OBJETIVO: Reconocer la fisiología de diversos órganos y tejidos del ser humano así
como el impacto de algunas enfermedades y padecimientos del cuerpo.
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INTRODUCION
Para entender la vida tal como la conocemos, primero debemos entender un poco de
química orgánica. Las moléculas orgánicas contienen carbono e hidrógeno. Mientras
que muchos químicos orgánicos también contienen otros elementos, es la unión del
carbono - hidrógeno lo que los define como orgánicos. La química orgánica define la
vida. Así como hay millones de diferentes tipos de organismos vivos en este planeta,
hay millones de moléculas orgánicas diferentes, cada una con propiedades químicas
y físicas diferentes. Hay químicos orgánicos que son parte del pelo, piel, uñas, etc.
La diversidad de químicos orgánicos tiene su origen en la versatilidad del átomo de
carbono. ¿Por qué el carbono es un elemento tan especial? Miremos su química en
más detalle.
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I. ESTRUCTURA DE LA CADENA HIDROCARBONADA
Las moléculas orgánicas son: las sustancias químicas basadas en cadenas de Carbono
e Hidrógeno. En muchos casos contienen Oxígeno, y también Nitrógeno, Azufre,
Fósforo, Boro y Halógenos. No son moléculas orgánicas los carburos, los carbonatos y
los óxidos de carbono.
Moléculas orgánicas naturales: Son las sintetizadas por los seres vivos y se
llaman biomoléculas, que son estudiadas por la bioquímica.
Moléculas orgánicas artificiales: Son sustancias que no existen en la naturaleza y
han sido fabricadas por el hombre como los plásticos. La mayoría de los
compuestos orgánicos puros se producen artificialmente.
La línea que divide las moléculas orgánicas de las inorgánicas ha originado polémicas e
históricamente ha sido arbitraria, pero generalmente, los compuestos orgánicos tienen
carbono con enlaces de hidrógeno, y los compuestos inorgánicos no. Así el ácido
carbónico es inorgánico, mientras que el ácido fórmico, el primer ácido graso, es
orgánico. El anhídrido carbónico y el monóxido de carbono, son compuestos
inorgánicos. Por lo tanto, todas las moléculas orgánicas contienen carbono, pero no
todas las moléculas que contienen carbono, son moléculas orgánicas.
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Para los químicos antiguos las sustancias orgánicas procederían de fuentes animales o
vegetales, mientras las sustancias inorgánicas serían las de procedencia mineral.
Aunque durante muchos años se creyó que entre química orgánica y química
inorgánica existía una barrera infranqueable, a principios del siglo XIX, tras conseguir el
químico alemán Wöhler sintetizar la urea, un producto orgánico, a partir de sustancias
inorgánicas, se comprobó que tal división era totalmente artificial, algo que es
completamente evidente en la química moderna.
Entre los principales elementos que forman el cuerpo de los seres vivos destacan
cuatro, éstos son: carbono (C), hidrógeno (H), oxígeno (O) y nitrógeno (N).Estos cuatro
elementos forman 97.4% del organismo de los seres vivos (carbono 9.5%, hidrógeno
63%, oxígeno 23.5% y nitrógeno 1.4%). El porcentaje restante (2.6%) lo integran los
demás elementos de la tabla periódica. Por su constitución, los compuestos pueden
agruparse en dos tipos: orgánicos e inorgánicos.
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Propiedades de los elementos biogenésicos
Se les llama elementos biogenésicos (formadores de vida, bios, que significa "vida" y,
génesis, "origen" o "formación") a aquellos que intervienen en la conformación de los
seres vivos. Los más importantes son el carbono, hidrógeno, oxígeno y nitrógeno. El
carbono tiene propiedades químicas que lo hacen muy importante para los seres vivos.
Por ejemplo, puede unir sus átomos para formar largas cadenas que, a su vez, son los
componentes básicos de las sustancias orgánicas, como el caso de las proteínas, las
grasas y los azúcares. El carbono es tan importante que hay una rama de la química
que se encarga de estudiar los compuestos de cadenas largas y cortas que forma este
elemento: la química orgánica. Todas las biomoléculas se basan en los átomos de
carbono para formar su estructura.
El hidrógeno es un gas incoloro, inodoro e insípido; es más ligero que el aire y es muy
activo químicamente, es decir, puede reaccionar con la mayoría de los elementos y
compuestos químicos. Forma parte de todos los compuestos orgánicos, junto con el
carbono. El oxígeno es un gas muy importante para la mayoría de los seres vivos, pues
resulta indispensable para la respiración. Se le encuentra en una proporción de 21% en
el aire. Las reacciones en las que el oxígeno se combina con otros elementos se
conocen como oxidaciones. Además, el oxígeno es un gas comburente, es decir, ayuda
a la combustión de las sustancias y forma parte de gran cantidad de compuestos
orgánicos.
Estos elementos también pueden encontrarse en las cosas; forman parte de las rocas,
el aire, el agua. En los compuestos orgánicos la combinación de carbono, hidrógeno,
oxígeno y nitrógeno es equilibrada y estable, pues se unen por medio de enlaces
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químicos difíciles de romper llamados covalentes, en los que los átomos comparten sus
electrones.
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magnesio. Estas sustancias se encuentran en pequeñas proporciones en los
organismos vivos, pero las funciones que desempeñan son de vital importancia, por
ejemplo, son necesarios para que se lleven a cabo los procesos de digestión,
respiración y nutrición. Como las sales son muy solubles en agua, se encuentran con
facilidad en casi todos los cuerpos de los seres vivos.
La fórmula química del agua es H2O tiene dos átomos de hidrógeno y un átomo de
oxígeno y una masa molar de 18 g/mol. Por medio de la electrólisis, el agua se
descompone en sus elementos constituyentes (hidrógeno y oxígeno).
El agua pura es insípida, incolora e inodora, y su temperatura de ebullición es de 100º C
y la de congelación de 0º C a nivel del mar.
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Plásticos
Los plásticos son compuestos orgánicos muy empleados, entre ellos están el nailon,
que se usa en la fabricación de ropa; el poliuretano o unicel, el polietileno, con el que se
hacen las bolsas, etc. Un inconveniente del plástico es que no es biodegradable, por lo
que su uso indiscriminado ocasiona problemas de contaminación. La principal
característica de los plásticos es su capacidad para moldearse de distintas formas, por
ejemplo, en láminas, esferas y rollos, y por medio de diferentes procesos químicos
adquieren cualidades como la rigidez, la suavidad, la transparencia, etcétera. El vocablo
plástico viene del griego plastikós que significa sustancia moldeable.
Medicamentos
Los medicamentos son todas aquellas sustancias que se usan en el tratamiento contra
las enfermedades; también se les conoce como fármacos o medicinas.
La mayor parte de los medicamentos son de origen orgánico, vegetal o animal, aunque
actualmente casi todos se preparan en forma sintética por métodos químicos, con el
propósito de lograr su producción en grandes cantidades.
Existen medicamentos para contrarrestar diversas enfermedades, algunos mitigan el
dolor y otros destruyen microorganismos. Aunque los medicamentos actúan de
diferentes formas de acuerdo con su composición química, en general, sus
componentes son absorbidos por la célula para restablecer sus funciones. Cuando las
enfermedades son infecciosas, los medicamentos trabajan conjuntamente con el
sistema inmunitario para facilitar la activación y funcionamiento de las defensas del
cuerpo contra los agentes patógenos (los agentes de la enfermedad).
I.2. Enlaces.
1 s2 2s2 2p2
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Siguiendo el principio de máxima multiplicidad de Hund podemos representar la
configuración como:
1s 2s 2p
1s Energía 1s
2s 2s
2p 2p
px py pz px py pz
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estado normal
Un carbono unido a cuatro átomos siempre tendrá hibridación sp3 y una estructura
tetraédrica. Así son los alcanos, haluros de alquilo, alcoholes, éteres y aminas, entre
otros. Todos estos compuestos tienen estabilidad suficiente (1) como para poder ser
almacenados sin problemas especiales. Un carbono unido a menos de cuatro átomos
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también puede tener hibridación sp3 pero la estructura variará dependiendo del número
de sustituyentes:
Estructura
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Un carbono unido a tres átomos, que mantiene un doble enlace con uno de ellos,
siempre tendrá hibridación sp2 y una geometría trigonal plana. Así son compuestos
estables (1) tales como olefinas, hidrocarburos aromáticos, aldehídos, cetonas y ácidos
carboxílcos y derivados, entre otros.
Existen otras situaciones donde un átomo de carbono unido a tres átomos también
posee hibridación sp2:
Estructura
Carbocatión
Tipo de compuesto Radical
(ion carbenio)
Geometría Trigonal plana Trigonal plana
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Un carbono unido a dos átomos, que mantiene un triple enlace con uno de ellos,
siempre tendrá una hibridación sp y una estructura lineal.
Existen otras posibilidades:
Estructura
Los alenos son compuestos estables. Los acetiluros son especies reactivas
(intermedios de reacción).
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I.2.2. Estructura y características que estos enlaces le confieren a las moléculas
orgánicas.
La fortaleza de los enlaces C-C es muy elevada. El diamante es una red tetraédrica de
carbono (sp3) y es el mineral más duro que se conoce. El grafito es una red
bidimensional de carbono (sp2) y su poder lubricante para máquinas es excepcional
debido a la fortaleza de las capas de carbonos que pueden resbalar unas sobre otras.
I.3. Isomería
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La isomería puede ser de dos tipos:
Isomería constitucional
Isomería en el espacio o estereoisomería
Los isómeros son sustancias que tienen las mismas fórmulas pero se diferencian en
sus estructuras y propiedades. Por ejemplo, un isómero C 2H6O es el etanol, un líquido a
temperatura ambiente. Las bebidas alcohólicas habituales son disoluciones acuosas
diluidas de etanol (en presencia de otros componentes) Otro isómero del C 2H6O es el
dimetil éter, un compuesto gaseoso a la temperatura ambiente y bastante tóxico.
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así como de ciertos compuestos cíclicos.
Para que pueda darse en los compuestos con doble enlace, es preciso que los
sustituyentes sobre cada uno de los carbonos implicados en el doble enlace sean
distintos. Es decir, que ninguno de los carbonos implicados en el doble enlace tenga los
dos sustituyentes iguales.
Las distribuciones espaciales posibles para una sustancia que con un doble enlace son:
Forma cis; en ella los sustituyentes iguales de los dos átomos de carbono
afectados por el doble enlace se encuentran situados en una misma región del
espacio con respecto al plano que contiene al doble enlace carbono-carbono.
Forma trans; en ella los sustituyentes iguales de los dos átomos de carbono
afectados por el doble enlace se encuentran situados en distinta región del
espacio con respecto al plano que contiene al doble enlace carbono-carbono.
Por ejemplo:
De ordinario resulta más fácil transformar la forma cis en la trans que a la inversa,
debido a que en general la forma trans es la más estable.
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Se produce cuando hay dos carbonos unidos con doble enlace que tienen las otras
valencias con los mismos sustituyentes (2 pares) o con dos iguales y uno distinto.
a a a b
\ / \ /
C=C C=C
/ \ / \
b b b a
Forma CiS Forma Trans
a a a c
\ / \ /
C=C C=C
/ \ / \
b c b a
Forma CiS Forma Trans
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C=C C=C
/ \ / \
H H H COOH
Ácido maleico Ácido fumárico
(Forma CiS) (Forma Trans)
La libre rotación en torno a un enlace simple da lugar a que las moléculas puedan
adoptar un número infinito de distribuciones espaciales interconvertibles
recíprocamente sin ruptura de enlaces. Estas disposiciones espaciales, pasajeras, y
que se interconvierten con tanta facilidad que no pueden aislarse isómeros espaciales
reciben el nombre genérico de conformaciones.
De las infinitas conformaciones posibles por libre rotación en torno al enlace simple, no
todas son igualmente probables, dependiendo de las interacciones entre los átomos de
la misma molécula.
Alternada. Es la más estable (menor energía) pues sus átomos están los más
separados posible y por tanto la interacción es mínima.
Eclipsada. Es la menos estable (mayor energía).
Sesgada o desviada. Se llaman así a las infinitas conformaciones que existen
entre la alternada y la eclipsada. Su energía es mayor que la alternada y menor
que la eclipsada.
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En el etano, que es uno de los casos más sencillos de considerar, las conformaciones
más notables son la alternada y la eclipsada. La siguiente figura muestra ambas
conformaciones con distintos tipos de representaciones:
Conformación alternada
Conformación eclipsada
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enlaces convencionales
caballete de Newman
Las conformaciones más importantes que puede presentar el ciclohexano son la silla y
el bote. Estas conformaciones experimentan una interconversión continua. La forma de
silla es más estable que la de bote, por lo que la forma de silla es mayoritaria. Se
estima que, en un momento dado, más del 99% de las moléculas se encuentran en
forma de silla.
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En la conformación silla existen dos tipos de enlaces: axiales y ecuatoriales.
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Al estudiar la isomería geométrica, hay ocasiones en que una misma estructura
molecular puede adoptar disposiciones espaciales diferentes y estables que resultan
ser isómeros espaciales separables. Estas disposiciones espaciales diferentes y
permanentes reciben el nombre de configuraciones. Así las formas cis y trans de los
isómeros geométricos son distintas configuraciones de la misma estructura.
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Se denomina carbono asimétrico o estéreocentro aquel carbono que tiene los 4
sustituyentes distintos. Si una molécula tiene un único carbono asimétrico, sólo puede
existir una par de enantiómeros. Si tiene dos carbonos asimétricos da por resultado un
máximo de cuatro estereoisómeros (dos pares de enantiómeros).En general, una
molécula con n carbonos asimétricos hace posibles 2 n estereoisómeros ( 2n-1 pares de
enantiómeros ).
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Si en una proyección de Fischer se realiza un número par de permutaciones entre los
sustituyentes se obtiene la configuración original. Si se realiza un número impar de
permutaciones se obtiene la imagen especular de la configuración original.
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Las moléculas quirales se diferencian de las aquirales en que tienen actividad óptica,
desvían el plano en el que vibra la luz polarizada. Una de las formas lo desvía a la
derecha y la otra a la izquierda. Por lo demás, ambas formas corresponden al mismo
compuesto y tienen idénticas propiedades.
Las consecuencias de este hecho, cuya explicación constituye uno de los grandes
enigmas actuales de la Ciencia, se vuelven imprevisibles cuando un ser vivo debe
enfrentarse a una molécula que tiene la forma opuesta a la que existe en la Naturaleza,
lo cual ocurre siempre que el compuesto se produce de manera artificial, se forman a
partes iguales las dos versiones moleculares siendo extremadamente difícil separar
unas de otras. El método que usó el primer científico que hizo esta separación es buena
prueba de ello.
Enantiómeros
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Por ejemplo: el ácido láctico: 2-hidroxi-propiónico , CH 3 – CH OH- COOH
COOH COOH
CH3 OH HO CH3
H H
Para identificar cada estructura es necesario asignar la configuración del centro quiral.
Para ello se asignan prioridades a los sustituyentes aplicando las Reglas de Notación
de Cahn, Ingold y Prelog. Y se indica el orden que siguen los sustituyentes de mayor a
menor prioridad alrededor del centro quiral.
H
Reglas de Notación deHCahn, Ingold
S y Prelog: R
1. a cada grupo se le asigna un orden de prioridad por el número atómico del átomo
directamente unido al centro quiral (Cl > O > N > C > H) (entre isótopos se tiene
en cuenta el número másico T > D > H).
2. Si dos átomos iguales están unidos al centro quiral se aplica la regla 1 a dichos
átomos, avanzando en la cadena hasta llegar a una diferencia.
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Diastereómeros
También existen parejas de diastereómeros en los que la relación que mantienen entre
si es de no ser imagen especular uno del otro. Pero pueden presentar actividad óptica
debido a la existencia de dos centros quirales contiguos. Una molécula que tiene dos
centros quirales contiguos tiene un diastereómero en el que un centro mantiene la
configuración y el otro centro quiral cambia la configuración.
Cl Br Cl CH3
Inversión de Br
CH3 CH3 CH3
un centro
quiral H H
H H
2R 3S 2R 3R
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Cuando en una molécula existe un átomo de carbono con geometría electrónica
tetraédrica y todos los sustituyentes sobre ese átomo de carbono son diferentes entre sí
entonces se dice que ese átomo de carbono es asimétrico, y la molécula también es
asimétrica.
En este caso no se puede encontrar ningún eje o plano de simetría que contenga dicho
átomo. La asimetría molecular confiere a la materia la propiedad llamada actividad
óptica.
Los centros quirales forman compuestos que pueden ser prácticamente iguales química
y físicamente, con algunas pequeñas diferencias como que algunos de ellos hacen girar
en un sentido o en otro la luz polarizada.
(R)-2-Bromobutano (S)-2-Bromobutano
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La rotación de una proyección de Fischer afecta a la configuración del estereocentro
representado:
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El giro de 180º conserva la configuración
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Aldosas de la serie D y L
La letra D indica la ubicación del OH en el carbono asimétrico más lejano del grupo –
CHO. Se dice que tienen configuración D porque el grupo OH del C5 está a la derecha
del grupo terminal –CH2OH, en forma análoga al D-Gliceraldehído que se considera
sustancia de referencia. La mayoría de los azúcares que se encuentran en la naturaleza
son de la serie D. Sustancia de referencia: es una triosa.
Los enlaces existentes entre el carbón tanto consigo mismo como con los demás
elementos se realizan a través de enlaces covalentes, teniendo algunas excepciones.
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Según la teoría de Lewis acerca del enlace químico, los átomos tiene una tendencia a
completar su último nivel energético alcanzando la similitud de un gas noble lo que les
confiere gran estabilidad pues completan el octeto. El H, por tener electrones sólo en el
orbital 1s, tiende a completar un par electrones.
Este tipo de enlace se conoce también como covalente puro u homopolar se forma
cuando dos átomos de un mismo elemento se unen para formar la molécula de una
sustancia sin carga eléctrica , simétrica, en donde la diferencia de electronegatividad
entre los elementos participantes es cero.
Se puede observar que en estos ejemplos el par electrónico de enlace está a la misma
distancia de cada átomo.
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El enlace covalente se representa con una línea recta que une a los 2 átomos, por
ejemplo:
O-H
El cloro tiene una alta afinidad electrónica y el sodio tiene una baja energía de
ionización. El cloro gana un electrón que pierde el sodio. De esta forma cada ión tiene
ocho electrones en su capa de valencia.
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Una vez que se forman los iones, cada ión interacciona con los demás iones de la red,
buscando la manera de estabilizarse de forma que el sistema tenga la menor energía
posible. De este modo se forma una red cristalina que se repite en la tres direcciones
del espacio (sólido iónico). No hay moléculas con un número limitado de iones, por lo
que las fórmulas de los compuestos iónicos son empíricas, es decir, sólo dan idea de
las proporción de átomos existentes en la red cristalina.
NaCl
Electronegatividad
Linus Pauling propuso una teoría para estimar la electronegatividad de los átomos.
Analizó una gran cantidad de información experimental y logró asignar un valor para
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cada uno de los elementos de la tabla periódica. Es importante que te familiarices con
la electronegatividad y con la manera en que varía a lo largo de la tabla periódica, ya
que esta cantidad resulta muy útil para explicar y predecir gran cantidad de reacciones
y de propiedades químicas.
Las moléculas que poseen dipolos permanentes, se atraen unas a otras con mucha
más fuerza que moléculas de estructura similar y tamaño semejante, sin dipolos
permanentes. Esto se refleja en mayores puntos de ebullición para las sustancias
polares, pues es necesario aplicar una mayor cantidad de energía para romper las
atracciones entre las moléculas.
En la figura se muestran algunas sustancias polares y no polares con sus temperaturas
de ebullición:
Sustancias no polares Sustancias polares
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Temperaturas de ebullición de algunas sustancias polares y no polares. Las flechas
indican la dirección del momento dipolar.
Polarización eléctrica
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Molécula apolar y molécula polar.
En estas condiciones, las moléculas de esta sustancia están distribuidas al azar, como
se representa en la figura A. Al acercar a este dieléctrico un cuerpo electrizado (por
ejemplo, con carga positiva), la carga de este último actuará sobre las moléculas del
aislante, haciendo que se orienten y alineen en la forma indicada en la figura B. Cuando
esto sucede, se dice que el dieléctrico está polarizado. La figura C muestra que el
efecto final de esta polarización consiste en hacer aparecer cargas negativas y positivas
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distribuidas tal como se ve en la ilustración. Obsérvese que aún cuando la carga total
del dieléctrico es nula, la polarización hace que se manifiesten cargas eléctricas de
signos opuestos de manera similar a lo que sucede cuando se carga un conductor por
inducción.
Fuerzas intermoleculares
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Las fuerzas de atracción explican la cohesión de las moléculas en los estados líquido y
sólido de la materia, y se llaman fuerzas de largo alcance o fuerzas de van der Waals
en honor al físico holandés Johannes Diderik van der Waals. Estas fuerzas son las
responsables de muchos fenómenos físicos y químicos como la adhesión, el
rozamiento, la difusión, la tensión superficial y la viscosidad.
Fuerza intermolecular atractiva, pero poco intensa, que se ejerce a distancia entre
moléculas. Son fuerzas de origen eléctrico que pueden tener lugar entre dipolos
instantáneos o inducidos y entre dipolos permanentes.
Las fuerzas entre dipolos permanentes se producen cuando las moléculas son polares,
como el dióxido de azufre (SO2) o el monóxido de carbono (CO), y existe atracción
entre el polo de una molécula y el polo opuesto de otra molécula contigua. Estas
fuerzas siguen siendo débiles pero son más intensas que las fuerzas de dispersión y,
aunque éstas siguen existiendo, predominan las de atracción dipolo-dipolo.
No pareciera que las moléculas no-polares tengan ninguna base física para tener
interacciones atractivas. Sin embargo, los gases de las moléculas no-polares pueden
licuarse, y esto indica que si la energía cinética se reduce, existe algún tipo de
interacciones atractivas que predominan.
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Fritz London (1930) sugiere que el movimiento de los electrones en un átomo o una
molécula no polar puede dar como resultado un dipolo transiente (transiente quiere
decir que tiene tiempos de vida muy cortos)
La intensidad de las fuerzas de London depende de la facilidad con que se polarizan los
electrones de una molécula, y eso depende del número de electrones en la molécula y
de la fuerza con que los sujeta la atracción nuclear. En general, cuantos más electrones
haya en una molécula más fácilmente podrá polarizarse. Así, las moléculas más
grandes con muchos electrones son relativamente polarizables. En contraste, las
moléculas más pequeñas son menos polarizables porque tienen menos electrones. Las
fuerzas de London varían entre aproximadamente 0.05 y 40 kJ/mol.
SÍMBOLOS USADOS
FUERZAS DE LONDON
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En las moléculas no polares puede producirse
transitoriamente un desplazamiento relativo de los
electrones originando un polo positivo y otro negativo
(dipolo transitorio) que determinan una atracción entre
dichas moléculas. (El polo positivo de una molécula
atrae al polo negativo de la otra, y viceversa).
Estas fuerzas de atracción son muy débiles y se
denominan fuerzas de London.
Atracciones dipolo-dipolo
En un líquido las moléculas están muy cercanas entre sí y se atraen por sus fuerzas
intermoleculares. Las moléculas deben tener suficiente energía para vencer esas
fuerzas de atracción, y hacer que el líquido pueda entrar en ebullición. Si se requiere
más energía para vencer las atracciones de las moléculas del líquido A que aquéllas
entre las moléculas del líquido B, el punto de ebullición de A es más alto que el de B.
Recíprocamente, menores atracciones intermoleculares dan pie a puntos de ebullición
más bajos.
FUERZAS DIPOLO-DIPOLO
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Cuando dos moléculas polares (dipolo) se
aproximan, se produce una atracción entre el
polo positivo de una de ellas y el negativo de la
otra.
Fuerza ión-dipolo.
Es la fuerza que existe entre un ión y una molécula polar neutra que posee un momento
dipolar permanente, las moléculas polares son dipolos tienen un extremo positivo y un
extremo negativo. Los iones positivos son atraídos al extremo negativo de un dipolo, en
tanto que los iones negativos son atraídos al extremo positivo.
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Puentes de Hidrógeno
Tensión superficial
puntos de fusión y ebullición
viscosidad
tensión superficial
capacidad de la misma para disolver muchas clases de sustancias.
Un átomo de hidrógeno en un enlace polar (por ejemplo H-F, H-O o H-N) puede
experimentar una fuerza atractiva hacia una molécula polar o un ion vecino que cuenta
con pares electrónicos sin compartir, usualmente átomos de F, O o N .
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Tomando en consideración que el átomo de H no tiene electrones de core, entonces el
lado del átomo que está hacia afuera del dipolo es virtualmente un núcleo desnudo la
carga parcial positiva se verá atraída a la carga parcial negativa de un átomo
electronegativo de una molécula cercana debido a que el átomo de hidrógeno en un
enlace polar tiene deficiencia de electrones (particularmente en un lado, es decir, el lado
opuesto al enlace covalente polar), entonces, puede acercarse mucho al átomo
electronegativo de la molécula vecina (el cual tiene carga parcial negativa) de manera
que puede interactuar fuertemente con él. Entre más cerca pueda estar mayor será la
atracción electrostática.
Este arreglo de las moléculas tiene un volumen mayor (es decir, es menos denso) que
el agua líquida, de manera que el agua se expande al congelarse. El arreglo de
moléculas de agua en el hielo normal tiene geometría hexagonal (es decir que está
compuesto de anillos con seis moléculas de agua), lo cual es la base estructural de la
forma hexagonal de los copos de nieve.
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Cada molécula de agua puede participar en cuatro enlaces de H, es decir, uno con cada
par de no enlace del oxígeno y uno con cada átomo de hidrógeno.
Resonancia
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posiciones de los electrones. Las propiedades de ese compuesto o ión no serán las
expresadas por una formula en particular sino por una estructura híbrida de todas ellas.
1.- Nunca deben moverse los átomos, solamente se redistribuyen los electrones. Las
estructuras resonantes son interconvertibles mediante unos o varios otros
desplazamientos de electrones.
2.- todas las estructuras canónicas deben tener el mismo número de electrones
desapareados.
3.- Todas las formas canónicas no contribuyen igualmente al híbrido. Cuanto mayor es
la estabilidad, mayor es su contribución al híbrido.
-Cuanto mayor sea el número de enlaces covalentes mayor será la contribución. (las
estructuras isovalentes contribuyen mas que las heterovalentes).
-Cuanto mas separadas estén las cargas de una estructura polar, mayor será la
estabilidad y mayor ira la contribución de un híbrido.
4.- Las estructuras heterovalentes son importantes cuando acumula densidad de carga
negativa en un átomo electronegativo.
6.- Los elementos del segundo periodo de la tabla periódica (C, N, O, F) no pueden
expandir su capa de valencia. El numero máximo de electrones en el ultimo nivel será
de 8; para el hidrogeno será de dos electrones.
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8.- La deslocalización de electrones en un sistema insaturado es máximo cuando el
esqueleto sigma es completamente planar.
10.- Cuando átomos electrónicamente diferentes están unidos por dobles o triples
enlace, uno de los enlace se desplazara havia el elemento mas electronegativo,
habiendo resonancia.
11.- en un sistema conjugado, con enlace sencillo: un elemento electronegativo (Cl, Br,
u O) unido al carbono, el doble enlace se polariza en la dirección mas lejana del átomo
con el par de electrones libres y este tiende siempre a formar doble enlace con el
carbono al cual esta unido.
Benceno y aromaticidad
El benceno es una molécula plana que presenta formas resonantes las cuales le
confieren una gran estabilidad.
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El benceno y sus derivados constituyen la que se denomina serie aromática. La
característica de dicha serie se denomina aromaticidad. Los radicales procedentes de la
serie aromática se denominan radicales arilo.
Propiedades físicas
Reacciones
Propiedades físicas.
Reacciones
Las reacciones más comunes del benceno son las reacciones de sustitución. Los
sustituyentes producen diversos efectos sobre la reactividad y orientación de una nueva
sustitución. Considerando estos efectos los sustituyentes se clasifican en:
Reactividad
o Activadores. Aumentan la reactividad.
o Inhibidores. Disminuyen la reactividad.
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Orientación
o Ortoparadirigentes. El nuevo sustituyente se sitúa en posición orto o para
respecto a él (pero no meta).
o Metadirigentes. En nuevo sustituyente se sitúa en posición meta respecto
a él.
Tautomeria
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II.4. Efectos estéricos.
La refractividad molar (MR) está directamente relacionada al volumen molar (PM/d) por
la ecuación de Lorentz-Lorenz
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Grupo oxhidrilo
Se utiliza el término grupo hidroxilo cuando el grupo funcional -OH se cuenta como un
sustituto de un compuesto orgánico. Las moléculas orgánicas que contienen el grupo
hidroxilo son conocidas como alcoholes.
El hidróxido es uno de los iones poliatómicos más simples y más importantes. Hidróxido
es un término general para cualquier sal que contenga cantidades estequiométricas de
este ión poliatómico. Estas sales son generalmente álcalis o bases, es decir, presentan
pH superior a 7 en agua.
Alcohol
Los alcoholes pueden ser primarios, secundarios, o terciarios, en función del número de
átomos de hidrógeno sustituidos en el átomo de carbono al que se encuentran enlazado
el grupo hidroxilo.xupa el pico propanotriol, glicerol o glicerina:
CH2-OH
|
CH-OH
|
CH2-OH
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Ejemplos
Alcoholes
Derivado de
Primarios Secundarios Terciarios
metano metanol
H4C H3C-OH
etano etanol
H3C-CH3 H3C-CH2-OH
prop-1-en-1-ol
H3C-CH=CH-OH prop-1-en-2-ol
propeno
prop-2-en-1-ol H3C-C(OH)=CH2
H2C=CH-H2C-OH
metilpropano metilpropan-1-ol metilpropan-2-ol
(H3C)2=CH-H3C (H3C)2=CH-H2C-OH (H3C)3≡C-OH
Nomenclatura
Común (no sistemática): anteponiendo la palabra alcohol y sustituyendo el sufijo
-ano del correspondiente alcano por -ílico. Así por ejemplo tendríamos alcohol
metílico, alcohol etílico, alcohol propílico, etc.
IUPAC: sustituyendo el sufijo -ano por -ol en el nombre del alcano progenitor, e
identificando la posición del átomo del carbono al que se encuentra enlazado el
grupo hidroxilo.
Formulación
54
Propiedades generales
Fuentes
Muchos alcoholes pueden ser creados por fermentación de frutas o granos con
levadura, pero solamente el etanol es producido comercialmente de esta manera,
principalmente como combustible y como bebida. Otros alcoholes son generalmente
producidos como derivados sintéticos del gas natural o del petróleo.
Usos
Los alcoholes tienen una gran gama de usos en la industria y en la ciencia como
solventes y combustibles. El etanol y el metanol pueden hacerse combustir de una
manera más limpia que la gasolina o el gasoil. Por su baja toxicidad y disponibilidad
para disolver sustancias no polares, el etanol es utilizado frecuentemente como
solvente en fármacos, perfumes y en esencias vitales como la vainilla. Los alcoholes
sirven frecuentemente como versátiles intermediarios en la síntesis orgánica.xupa el
pico
55
ingerido producen la sensación de acidez y dolor. Si el ataque a la mucosa se
hace constantemente se puede originar una gastritis.
3. En el intestino delgado se absorbe entre el 70% a 80% del alcohol consumido.
Ingresa al torrente sanguíneo y es llevado al hígado por la vena porta.
4. En el hígado las células hepáticas metabolizan el alcohol, transformándolo en
sustancia útil para el organismo. alcohol(tóxico)----->acetaldehído----->Acetato
(Rico en calorías usado como fuente de energía)
5. El exceso de alcohol ocasiona el desgaste de las reservas de glucógeno en el
hígado y los músculos. La falta de glicógeno disminuye los azúcares en la sangre
y provoca una sensación de debilidad y agotamiento físico.
6. Al ser insuficiente el trabajo realizado por el hígado el etanol invade el torrente
sanguíneo y se esparce por todos los tejidos del cuerpo. Entre 30 y 90 minutos
de la ingesta se registra el máximo nivel de alcohol en la sangre.
7. En los riñones el alcohol inhibe la función de la hormona vasopresina, lo que
ocasiona que se elimine más agua de la que se ingiere. El agua que el
organismo necesita es obtenida de órganos como el cerebro.
56
- Grupo aldehído, donde el grupo C=O está al final de una molécula orgánica.
Un átomo de hidrógeno se ubica también sobre el mismo átomo de carbono.
- Grupo cetona, donde el grupo C=O se ubica dentro de una molécula orgánica.
Todas las azúcares tienen o engrapo cetona o un grupo aldehído..
Aldehídos
Los aldehídos son compuestos orgánicos caracterizados por poseer el grupo funcional
-CHO:
Propiedades físicas
La doble unión del grupo carbonilo son en parte covalentes y en parte iónicas
dado que el grupo carbonilo está polarizado debido al fenómeno de resonancia.
Los aldehídos con hidrógeno sobre un carbono sp³ en posición alfa al grupo
carbonilo presentan isomería tautomérica.
57
Propiedades químicas
Se comportan como reductor, por oxidación el aldehído da ácidos con igual
número de átomos de carbono.
Nomenclatura
Se nombran sustituyendo la terminación -o del nombre del hidrocarburo por -al. Los
aldehídos más simples (metanal y etanal) tienen otros nombres que no siguen el
estándar de la IUPAC pero son más utilizados (formaldehído y acetaldehído,
respectivamente).
Reacciones
Con aminas primarias dan las iminas correspondiente en una reacción exotérmica que
a menudo es espontánea:
58
recuperan en medio ácido y presencia de agua esta reacción se utiliza para la
protección del grupo funcional.
Presencia
Ejemplos de aldehídos
Metanal (Formaldehído)
Etanal (Acetaldehído)
Propanal
Butanal
Pentanal
Hexanal
Glucosa
Cetona
59
Una cetona es un compuesto que contiene el grupo cetona (-ona). Las cetonas se
nombran agregando el sufijo -ona al hidrocarburo del cual provienen (hexano,
hexanona; heptano, heptanona; etc). También se puede nombrar anteponiendo cetona
a los radicales a los cuales está unido.
El grupo funcional cetona es un grupo carbonilo (un átomo de carbono unido con un
doble enlace a un átomo de oxígeno) unido a otros dos átomos de carbono.
El tener dos átomos de carbono unidos al grupo carbonilo, es lo que lo diferencia de los
ácidos carboxílicos, aldehídos, ésteres. El doble enlace con el oxígeno, es lo que lo
diferencia de los alcoholes y éteres. Las cetonas suelen ser menos reactivas que los
aldehídos dado que los grupos alquílicos actúan como dadores de electrones por efecto
inductivo.
Cetonas alifáticas
Isomería
o Las cetonas son isómeros de los aldehídos de igual número de carbono.
o Las cetonas de más de cuatro carbonos presentan isomería de posición.
(En Casos específicos)
o Las cetonas presentan tautomeria ceto-enólica.
60
Cetonas alicíclicas
Cetonas aromáticas
Hidrocarburo alifático
Los hidrocarburos alifáticos son aquellos hidrocarburos en los que los átomos de
carbono se unen en cadenas abiertas, pudiendo ser lineales o ramificadas. Pueden ser:
Alcanos
Alquenos
Alquinos
CH3-(CH2)n-CH3
Usos
61
embargo, este método de análisis puede aplicarse a compuestos de la misma familia
como por ejemplo n-pentano, n-decano, etc.
Hidrocarburo aromático
Los hidrocarburos aromáticos son polienos cíclicos conjugados que cumplen la Regla
de Hückel, es decir, que tienen un total de 4n+2 electrones pi en el anillo. Para que se
dé la aromaticidad, deben cumplirse ciertas premisas, por ejemplo que los dobles
enlaces resonantes de la molécula estén conjugados y que se den al menos dos formas
resonantes equivalentes.
62
El máximo exponente de la familia de los hidrocarburos aromáticos es el benceno
(C6H6), pero existen otros ejemplos, como la familia de anulenos, hidrocarburos
monocíclicos totalmente conjugados de fórmula general (CH) n.
Estructura
Resonancia del Benceno. Cada carbono tiene tres electrones enlazados y el cuarto
localizado en gira alrededor del anillo.
Todos los derivados del benceno, siempre que se mantenga intacto el anillo, se
consideran aromáticos. La aromaticidad puede incluso extenderse a sistemas
policíclicos, como el naftaleno, antranceno, fenantreno y otros más complejos, incluso
ciertos cationes y aniones, como el pentadienilo, que poseen el número adecuado de
electrones pi y que además son capaces de crear formas resonantes válidas para la
aromaticidad.
Estructuralmente, dentro del anillo los átomos de carbono están unidos por un enlace
sp2 entre ellos y con los de hidrógeno, quedando un orbital pi perpendicular al plano del
63
anillo y que forma con el resto de orbitales de los otros átomos un orbital pi por encima
y por debajo del anillo.
Reacciones
Químicamente, los hidrocarburos aromáticos son por regla general bastante inertes a la
sustitución electrófila y a la hidrogenación, reacciones que deben llevarse a cabo con
ayuda de catalizadores. Esta estabilidad es debida a la presencia de orbítales
degenerados (comparando estas moléculas con sus análogos alifáticos) que conllevan
una disminución general de la energía total de la molécula.
Sustitución electrofílica (la letra griega Φ se usa para designar el anillo fenil):
Aplicación
Entre los hidrocarburos aromáticos más importantes se encuentran todas las hormonas
y vitaminas, excepto la vitamina C; prácticamente todos los condimentos, perfumes y
tintes orgánicos, tanto sintéticos como naturales; los alcaloides que no son alicíclicos
(ciertas bases alifáticas como la putrescina a veces se clasifican incorrectamente como
alcaloides), y sustancias como el trinitrotolueno (TNT) y los gases lacrimógenos. Por
otra parte los hidrocarburos aromáticos suelen ser nocivos para la salud, como los
llamados BTEX, benceno, tolueno, etilbenceno y xileno por estar implicados en
numerosos tipos de cáncer o el alfa-benzopireno que se encuentra en el humo del
tabaco, extremadamente carcinógenico igualmente, ya que puede producir cáncer de
pulmón.
64
III.1.1. Carbono anomérico en aldohexosas.
HOCH2-CHOH-CHOH-CHOH-CHOH-CHO
Aldohexosas
Hay 16 aldohexosas.
8 pertenecientes a la serie D-
8 pertenecientes a la serie L-
65
66
III.1.2. Formación de enlaces hemiacetálicos intramoleculares. (Formas furanosa y
piranosa). Enlaces acetálicos intermoleculares. Oligosacáridos, polisacáridos,
heterósidos y sus características. Esteres. Estructura e importancia de estos
grupos en diversas funciones celulares.
El estudio de la ciclación fue realizado por Haworth, por ello lo conocemos como
proyección de Haworth. En las proyecciones de Fisher la geometría queda muy
distorsionada. Una visión más cercana a la realidad la proporcionan las fórmulas de
Haworth, en ellas los anillos o formas cíclicas se representan como pentágonos (forma
furanosa) o hexágonos regulares (forma piranosa), en los que la parte inferior del papel
corresponde a la región más cercana al espectador, y los sustituyentes de los carbonos
se sitúan perpendiculares al anillo.
67
Oligosacárido
Inulina y oligofructosa están formados por cadenas de fructosa que pueden terminar en
glucosa o fructosa. Están presentes en muchos vegetales: achicoria, cebolla, puerro,
ajo, plátano, alcachofa, etc..
Polisacárido
Los polisacáridos son polímeros cuyos monómeros son los monosacáridos, que se
unen repetitivamente mediante enlaces glucosídicos. Estos compuestos llegan a tener
un peso molecular muy elevado, que depende del número de residuos o unidades de
monosacáridos que participen en su estructura. Pueden descomponerse en
polisacáridos más pequeños, así como en disacáridos o monosacáridos, mediante
hidrólisis, que en la materia viva es catalizada por enzimas llamadas glucosidasas.
68
-[Cx(H2O)y)]n- donde y es generalmente igual a x - 1.
Según la composición
69
heteropolisacáridos participan junto a polipéptidos (cadenas de aminoácidos) de
diversos polímeros mixtos llamados peptidoglucanos, mucopolisacáridos o
proteoglucanos. Se trata esencialmente de componentes estructurales de los
tejidos, relacionados con paredes celulares y matrices extracelulares.
Heterósidos
70
La formación e hidrólisis de un O-heterósido como la salicina o salicósido puede ser
representada así:
Conviene advertir que estas reacciones son reversibles y, en las plantas con
heterósidos, se sintetizan o se hidrolizan bajo la influencia respectiva de enzimas más o
menos específicas. Mientras que los heterósidos no reducen el reactivo de Fehling por
71
sí mismos, los azúcares sencillos que ellos originan por hidrólisis, lo reducen, dando
lugar a un precipitado de óxido cuproso rojo.
Como los azúcares existen en las formas isómeras a y b, son posibles, teóricamente,
ambos tipos. Practicamente, todos los heterósidos naturales son sin embargo del tipo b,
aunque las uniones a se encuentran en la naturaleza en algunos glúcidos como
sacarosa, glucógeno y almidón. En el k-estrofantósido, heterósido constituido por la
genina estrofantidina y la estrofantotriosa (cimarosa + glucosa + glucosa), la molécula
de glucosa final está unida en á- y la intermedia en P-. Pueden obtenerse por síntesis
heterósidos isómeros; de la glucosa y él alcohol metiílico, por ejemplo, se obtienen
tanto a- como (b-metilglucósidos, introduciendo el grupo metilo en los OH señalados
con trazo grueso en las siguientes fórmulas de la glucosa:
72
molécula, otros a la genina; mientras que otros indican algunas propiedades bien
definidas físicas o farmacológicas. Así, un glucósido es un heterósido que posee
glucosa como único componente azucarado; un pentósido da una pentosa como, por
ejemplo, la arabinosa; los ramnósidos liberan la metil-pentosa, ramnosa; y los
ramnoglucósidos dan ramnosa y glucosa. Los vocablos empleados para las geninas se
explican generalmente por sí mismos (por ejemplo, fenol-antraquinona y
esterolglucódidos). Los nombres saponina (semejante a jabón), cianogenético
(productor de ácido cianhídrico) y cardiaco (que posee acción sobre el corazón),
aunque se aplicaron a estas sustancias cuando se sabía poco sobre ellas, son términos
usuales que, de hecho, se han incorporado a los heterósidos de estructura similar.
Aunque los heterósidos constituyen un grupo natural, en el sentido de que todos ellos
contienen una unidad glucídica, las geninas son de tan variada naturaleza y
complejidad que los heterósidos varían, a su vez, mucho en sus propiedades físicas y
químicas, así como en su acción farmacológica.
Ésteres
En química, los ésteres son compuestos orgánicos en los cuales un grupo orgánico
(simbolizado por R' en este artículo) reemplaza a un átomo de hidrógeno (o más de
73
uno) en un ácido oxigenado. Un ácido oxigenado es un ácido cuyas moléculas poseen
un grupo -OH desde el cual el hidrógeno (H) puede disociarse como un ion H+.
Los ésteres más comunes son los ésteres carboxilados, donde el ácido en cuestión es
un ácido carboxílico. Por ejemplo, si el ácido es el ácido acético, el éster es
denominado como acetato. Los ésteres pueden también ser formados por ácidos
inorgánicos; por ejemplo, el dimetil sulfato, es un éster, a veces también llamado "ácido
sulfúrico, dimetil éster".
En bioquímica son el producto de la reacción entre los ácidos grasos y los alcoholes.
En la formación de ésteres, cada radical OH (grupo hidroxilo) del radical del alcohol se
sustituye por la cadena -COO del ácido graso. El H sobrante del grupo carboxilo, se
combina con el OH sustituido formando agua.
Los ésteres más comúnmente encontrados en la naturaleza son las grasas, que son
ésteres de glicerina y ácidos grasos, oleico, etcétera.
74
Denominación de los ésteres
O
||
C - CH3
/
CH3 - CH2-O
El caso de los ésteres consiste en dos cadenas separadas por un oxígeno. Cada
una de estas cadenas debe nombrarse por separado y el nombre de los ésteres
siempre consiste en dos palabras separadas del tipo alcanoato de alquilo. La
parte del alcanoato se da a la cadena que tiene el grupo carbonilo. La parte
alquílica del nombre se da a la cadena que no contiene el grupo carbonilo. Este
procedimiento se utiliza sin importar el tamaño de la cadena. La posición del
grupo carbonilo es la que determina cual es la cadena del alcanoato.
Propiedades físicas
Los ésteres pueden participar en los enlaces hidrogenados como aceptadores de los
enlaces de hidrógeno, pero no pueden participar como dadores de enlaces de
hidrógeno, a diferencia de los alcoholes de los que derivan. Esta capacidad de
participar en los enlaces de hidrógeno les convierte en en más hidro-solubles que los
hidrocarbonos de los que derivan. Pero las limitaciones de sus enlaces de hidrógeno los
hace más hidrofóbicos que los alcoholes o ácidos de los que derivan. Esta falta de
capacidad de ceder su enlace de hidrógeno ocasiona el que no puede formar enlaces
de hidrógeno entre moléculas de ésteres, lo que los hace más volátiles que un ácido o
éster de similar peso molecular.
Muchos ésteres tienen un olor característico, lo que hace que se utilicen ampliamente
como sabores y fragancias artificiales. Por ejemplo:
75
metil butanoato: olor a piña
metil salicilato (aceite de siempreverde): olor de las pomadas Germolene y
Ralgex (Reino Unido)
etil metanoato: olor a frambuesa
pentil etanoato: olor a plátano
pentil pentanoato: olor a manzana
pentil butanoato: olor a pera o a albaricoque
octil etanoato: olor a naranja.
Grupo amino
Grupo carboxilo
76
Estructura de un ácido carboxílico, donde R es un hidrógeno o un grupo orgánico).
Las moléculas que contienen este grupo funcional se llaman ácidos carboxílicos o
ácidos orgánicos.
Amina
77
Amoniaco Amina primaria Amina secundaria Amina terciaria
Las aminas son simples cuando los grupos alquilo son iguales y mixtas si estos son
diferentes.
Las aminas son compuestos muy polares. Las aminas primarias y secundarias pueden
formar puentes de hidrógeno. Las aminas terciarias puras no pueden formar puentes de
hidrógeno, sin embargo pueden aceptar puentes de hidrógeno con moléculas que
tengan enlaces O-H o N-H. Como el nitrógeno es menos electronegativo que el
oxígeno, el enlace N-H es menos polar que el enlace O-H. Por lo tanto, las aminas
forman puentes de hidrógeno más débiles que los alcoholes de pesos moleculares
semejantes.
Las aminas primarias y secundarias tienen puntos de ebullición menores que los de los
alcoholes, pero mayores que los de los éteres de peso molecular semejante. Las
aminas terciarias, sin puentes de hidrógeno, tienen puntos de ebullición más bajos que
las aminas primarias y secundarias de pesos moleculares semejantes.
Estructura molecular
Las aminas, como el NH3, tienen una estructura piramidal con 3 enlaces sp³ y un par de
electrones no compartidos. Por tanto, los orbitales presentan hibridación sp³ y están
dirigidos hacia los vértices de un tetraedro.
78
Nomenclatura
Cuando se usan los prefijos di, tri, se indica si es una amina secundaria y terciaria,
respectivamente, con grupos o radicales iguales. Cuando se trata de grupos diferentes
a estos se nombran empezando por los más pequeños y terminando con el mayor al
que se le agrega la terminación amina. Algunas veces se indica el prefijo amino
indicando la posición, más el nombre del hidrocarburo.
Ejemplos:
Compuesto Nombre
CH3
|
N-CH3
CH3 Trimetilamina ó dimetilaminometano
CH3
|
N-CH2-CH2-CH3
|
CH2-CH3 Metil-etil-propilamina ó metil-etil-aminopropano
79
Ácidos carboxílicos
Como dice el nombre, tienen propiedades ácidas; los dos átomos de oxígeno son
electronegativos y tienden a atraer a los electrones del átomo de hidrógeno del grupo
hidroxilo, por lo que de esta forma se debilita el enlace y es más fácil que se ceda el
correspondiente protón, H+, quedando el anión del ácido, RCOO -. Además, en este
anión, la carga negativa se distribuye (se deslocaliza) simétricamente entre los dos
átomos de oxígeno, de forma que los enlaces carbono-oxígeno adquieren un carácter
de enlace parcialmente doble.
No son unos ácidos muy fuertes, pero sí más que otros en los que no se produce esa
deslocalización electrónica, como por ejemplo los alcoholes. El ión resultante, RCOO-,
se nombra con el sufijo "-ato". Por ejemplo, el anión procedente de la desprotonación
del ácido acético se llama ión acetato. Al grupo COO- se le denomina carboxilato.
Generalmente los ácidos carboxílicos son ácidos débiles, con sólo un 1% de sus
moléculas disociadas para dar los correspondientes iones, a temperatura ambiente y en
disolución acuosa.
Los ácidos carboxílicos reaccionan con bases para formar sales. En estas sales el
hidrógeno del grupo OH se reemplaza con el ión de un metal, por ejemplo Na +. De esta
forma, el ácido acético reacciona con bicarbonato de sodio para dar acetato de sodio,
dióxido de carbono y agua
Los grupos carboxilos reaccionan con los grupos amino para formar amidas. En el caso
de aminoácidos que reaccionan con otros aminoácidos para dar proteínas, al enlace de
tipo amida que se forma se denomina enlace peptídico. Igualmente, los ácidos
carboxílicos pueden reaccionar con alcoholes para dar ésteres, o bien con halogenuros
para dar halogenuros de ácido, o entre sí para dar anhídridos. Los ésteres, anhídridos,
halogenuros de ácido y amidas se llaman derivados de ácido.
80
Ejemplos de ácidos carboxílicos
HCOOH ácido fórmico (se encuentra en insectos, fórmico se refiere a las
hormigas)
CH3COOH ácido acético o etanoico (se encuentra en el vinagre)
CH3CH2COOH ácido propanoico
C6H5COOH ácido benzoico (el benzoato de sodio, la sal de sodio del ácido
benzoico se emplea como conservante)
Ácido láctico
Todos los aminoácidos contienen un grupo carboxilo y un grupo amino. Cuando
reacciona el grupo carboxilo de un aminoácido con el grupo amino de otro se
forma un enlace amida llamado enlace peptídico. Las proteínas son polímeros de
aminoácidos y tienen en un extremo un grupo carboxilo terminal.
Todos los ácidos grasos son ácidos carboxílicos. Por ejemplo, el ácido palmítico,
esteárico, oleico, linoleico, etcétera. Estos ácidos con la glicerina forman ésteres
llamados triglicéridos.
Nomenclatura
Al nombre del hidrocarburo que tiene el mismo número de átomos de carbono se
le añade la terminación -ico o -oico y se emplea la palabra ácido para referirse
a él.
81
CH3CH2CH2COOH tiene cuatro átomos de carbono, procede formalmente del
hidrocarburo butano, CH3CH2CH2CH3, por lo que empleando la terminación el
ácido se llama ácido butanoico.
Cuando hay más de un grupo carboxilo o está unido a un ciclo se suele emplear
otra nomenclatura. Consiste también en usar el nombre del hidrocarburo del que
formalmente procede, pero descontando el número de carbonos del grupo o
grupos carboxilo. A este nombre se le añade la terminación carboxílico.
82
Estructura de la morfina
Los alcaloides son compuestos complejos que se encuentran en las plantas y contienen
grupos amina. Algunos ejemplos son la morfina, la nicotina, etc.
Enlace peptídico
El enlace peptídico tiene lugar mediante la pérdida de una molécula de agua entre el
grupo amino de un aminoácido y el carboxilo de otro:
83
El resultado es un enlace covalente CO-NH. Es, en realidad, un enlace amida
sustituido. Podemos seguir añadiendo aminoácidos al péptido, porque siempre hay un
extremo NH2 terminal y un COOH terminal.
Para nombrar el péptido se empieza por el NH2 terminal por acuerdo. Si el primer
aminoácido de nuestro péptido fuera alanina y el segundo serina tendríamos el péptido
Alanil-serina.
Podríamos pensar que una proteína puede adoptar miles de conformaciones debidas al
giro libre en torno a los enlaces sencillos. Sin embargo, en su estado natural sólo
adoptan una única conformación tridimensional que llamamos conformación nativa; que
es directamente responsable de la actividad de la proteína.
Esto hizo pensar que no podía haber giro libre en todos los enlaces; y efectivamente,
mediante difracción de rayos X se vio que el enlace peptídico era más corto que un
enlace sencillo normal, porque tiene un cierto carácter (60%) de enlace doble, ya que
se estabiliza por resonancia.
Por esa razón no hay giro libre en torno a este enlace. Esta estabilización obliga a que
los 4 átomos que forman en enlace peptídico más los dos carbonos que se encuentran
84
en posición a (marcado con a en la ilustración) con respecto a dicho enlace, se
encuentren en un plano:
85
La distancia de enlace determinada por
Pauling y Corey para el enlace peptídico
fue de 1.32 Å, intermedia entre los 1.49Å
de un enlace simple C-N y los 1.27Å de un
enlace doble C=N.
Configuración trans.
86
Péptidos.
Los péptidos son cadenas lineales de aminoácidos enlazados por enlaces químicos de
tipo amídico a los que se denomina Enlace Peptídico. Así pues, para formar péptidos
los aminoácidos se van enlazando entre sí formando cadenas de longitud y secuencia
variable. Para denominar a estas cadenas se utilizan prefijos convencionales como:
Dipéptidos.- si el nº de aminoácidos es 2.
Tripéptidos.- si el nº de aminoácidos es 3.
Tetrapéptidos.- si el nº de aminoácidos es 4.
etc...
87
El enlace peptídico es un enlace covalente y se establece entre el grupo carboxilo (-
COOH) de un aminoácido y el grupo amino (-NH 2) del aminoácido contiguo inmediato,
con el consiguiente desprendimiento de una molécula de agua.
Por otra parte, el carácter parcial de doble enlace del enlace peptídico (-C-N-)
determina la disposición espacial de éste en un mismo plano, con distancias y ángulos
fijos. Como consecuencia, el enlace peptídico presenta cierta rigidez e inmoviliza en el
plano a los átomos que lo forman.
En las proteínas, los aminoácidos están unidos uno seguido de otro, sin ramificaciones,
por medio del enlace peptídico, que es un enlace amido entre el grupo a-carboxilo de
un aminoácido y el grupo a-amino del siguiente. Este enlace se forma por la
deshidratación de los aminoácidos en cuestión. Esta reacción es también una reacción
de condensación, que es muy común en los sistemas vivientes:
III.3. Lípidos. Ocurrencia y características. Grupos funcionales que los conforman.
88
Los lípidos pueden encontrarse unidos covalentemente con otras biomoléculas como en
el caso de los glicolípidos (presentes en las membranas biológicas), las proteínas
aciladas (unidas a algún ácido graso) o las proteínas preniladas (unidas a lípidos de tipo
isoprenoide).
También son numerosas las asociaciones no covalentes de los lípidos con otras
biomoléculas, como en el caso de las lipoproteínas y de las estructuras de membrana.
Una característica básica de los lípidos, y de la que derivan sus principales propiedades
biológicas es la hidrofobicidad. La baja solubilidad de los lipídos se debe a que su
estructura química es fundamentalmente hidrocarbonada (alifática, alicíclica o
aromática), con gran cantidad de enlaces C-H y C-C. La naturaleza de estos enlaces es
100% covalente y su momento dipolar es mínimo.
El agua, al ser una molécula muy polar, con gran facilidad para formar puentes de
hidrógeno, no es capaz de interaccionar con estas moléculas. En presencia de
moléculas lipídicas, el agua adopta en torno a ellas una estructura muy ordenada que
maximiza las interacciones entre las propias moléculas de agua, forzando a la molécula
hidrofóbica al interior de una estructura en forma de jaula, que también reduce la
movilidad del lípido. Todo ello supone una configuración de baja entropía, que resulta
energéticamente desfavorable. Esta disminución de entropía es mínima si las moléculas
lipídicas se agregan entre sí, e interaccionan mediante fuerzas de corto alcance, como
las fuerzas de Van der Waals. Este fenómeno recibe el nombre de efecto hidrofóbico.
89
BASE
BASEN.
N.
FOSFATO
FOSFATO
PENTOSA
PENTOSA
Los AN son polímeros lineales en los que la unidad repetitiva es el nucleótido.Cada
nucleótido está formado por:
90
Diferencias estructurales entre el DNA y el RNA
* pentosa bases nitrogenadas estructura
DNA
RNA
BIBLIOGRAFÍA
91
BABOR-IZBARZ “QUÍMICA GENERAL MODERNA” Edit. Marín S.A Barcelona
España 1979
LINKOGRAFIA
http://www.monografias.com/trabajos14/compuestos-carbono/compuestos-
carbono.shtml#pro
http://www.uam.es/departamentos/ciencias/qorg/docencia_red/qo/l1/const.html
http://www.telecable.es/personales/albatros1/quimica/isomeria/isomeria.htm
http://www.uam.es/departamentos/ciencias/qorg/docencia_red/qo/l4/fischer.html
http://html.rincondelvago.com/enlaces-quimicos-organicos.html
http://www.te.ipn.mx/polilibros/Quimica/cap4/a010.html
http://www.cneq.unam.mx/adela/archivos/Enlace%20Qu%EDmico.htm
http://www.qfb.umich.mx/Curquim/enlaces-quim.htm
http://www.monografias.com/trabajos17/calorimetria/calorimetria.shtml
http://www.textoscientificos.com/quimica/inorganica/fuerzas-intermoleculares
http://html.rincondelvago.com/fuerzas-intermoleculares_1.html
92
93
GUIA DE ESTUDIO
1. Son constituyentes de los seres vivos formadas por sólo cuatro elementos que
son el hidrógeno, oxígeno, carbono, y nitrógeno, representando el 97,6 % de los
átomos de los seres vivos:
a) Biomoléculas.
b) Macromoléculas
c) Compuesto químico
a) Sangre
b) Citosol
c) savia
94
5. las moléculas sencillas se unen para obtener otras mayores
a) Fotosíntesis
b) Hidrólisis
c) Condensación
a) Modificados y particulares
b) Codificables y universales
c) Proteicos y no proteicos
a) Alanina, Tirosina
b) Fenol, guanidino
c) Fenilamina, carboxilo
a) Neutros
b) Aromáticos
c) Iminoácidos
a) Neutros, dibásicos
b) Apolares, polares sin carga, cationicos, anionicos
c) Tioaminoacidos, hidroxiaminoacidos, aromáticos
a) Y
b) T
c) W
95
2. Las abreviaturas de tres y de una letra para elaminoácido triptófano son:
3. Entre las modificaciones que pueden sufrir los aminoácidos una vez incorporados
a las proteínas podemos citar:
10. La actividad enzimática puede ser disminuida o eliminada por la acción de ciertas
sustancias a las cuales se les conoce con el nombre de:
96
III.- Señala lo que se te pide en la Estructura primaria, secundaria, terciaria y
cuaternaria en una proteína modelo .
97
IV.- Defina los siguientes conceptos:
CONCEPTO DEFINICION
98
ISOMERIA
ESTEREOISOMERÍA
ISOMERÍA DE
CONFORMACIÓN
ESTEREOISOMERÍA
GEOMÉTRICA.
ESTEREOISOMERÍA
ÓPTICA.
QUIRALIDAD DE LAS
MOLÉCULAS.
GLUCOLISIS
FERMENTACION
LIPIDOS
99
1. Catabolismo de estas moléculas para obtener la energía que necesitan las células
para realizar diferentes tipos de trabajo biológico. ….………………………….….( )
2. Están formados por la unión de muchos monosacáridos….……….………….…..( )
3. Todas las formas de vida están basadas en prácticamente las mismas reacciones
bioquímicas. Cada uno de los compuestos que se generan en este conjunto de
reacciones se le denominan compuestos endógenos y al conjunto de todas las
reacciones que suceden en una célula se le denomina:
………………………………………………………………………….........( )
4. Describe la transferencia y utilización de la energía en los sistemas biológicos: ( )
5. Son ésteres de ácidos grasos con glicerol (propanotriol)…………………….…...( )
6. Es la secuencia metabólica en la que se oxida la glucosa:………………………..( )
7. Son glúcidos sencillos, constituidos sólo por una cadena:………………………...( )
8. Es un conjunto muy heterogéneo de biomoléculas cuya característica distintiva aunque
no exclusiva ni general es la insolubilidad en agua, siendo por el contrario, solubles en
disolventes orgánicos:…………………………………………………...( )
9. Son monocarboxílicos de cadena larga:………………………………………….….( )
RESPUESTAS:
A) ACILGLICEROLES F) OLISACARIDOS
B) MONOSACÁRIDOS G) METABOLISMO
D) BIOENERGETICA I) LIPIDOS
100
LIPIDOS
AGUA
TEJIDO
ADIPOSO
PROTEINAS
POLISACARIDOS
101
b) Construye la Estructura básica de un aminoácido
102
c) Construya un cuadro sinóptico con la clasificación de las Proteínas:
103
a) Desde el punto de vista bioquímico, ¿Cuáles son las propiedades de las
proteínas?
104
h) Explica el término estructura Secundaria de las proteínas.
i) ¿Que es el Colágeno?
105
Diferencias estructurales entre el DNA y el RNA
pentosa bases nitrogenadas estructura
DNA
RNA
106
IX.- Complete correctamente el siguiente recuadro:
B1
B2
B3
B12
ACIDO FOLICO
107
X.- Especifique correctamente el nombre de las siguientes imágenes del tejido
adiposo:
108
PRESENTACION
109
La asignatura de Bioquímica II con clave 3725 se ubica en el sexto semestre de la
Licenciatura en Biología área Manejo de Recursos Naturales, tiene como finalidad que
el alumno sea capaz de comprender la importancia de los elementos que intervienen en
las funciones biológicas de los seres vivos.
Así como la importancia de las biomoléculas para nuestro organismo y de que forma
son asimiladas.
TEMA V: Glucólisis
DESNATURALIZACION DE PROTEINAS
110
Introducción: Las proteínas son una clase de biopolímeros que desempeñan una
enorme variedad de funciones: unas transportan, otras almacenan moléculas
pequeñas, otras más constituyen gran parte de la organización estructural de las
células y los tejidos. Quizás las más importantes de todas las proteínas sean las
enzimas que son los catalizadores que promueven la enorme variedad de reacciones
que forman el metabolismo. Cada tipo de célula en todos los organismos posee varios
miles de clases de proteínas para cumplir la gran variedad de funciones.
Material:
Huevo crudo
Fertilizante de sulfato de amonio
Leche fresca
Agua
Frascos pequeños de vidrio
Limón
Taza de peltre
Vinagre Blanco
Papel filtro para cafetera
Vasos desechables
111
Copas tequileras
Color vegetal
Acetona
Goteros
Cuchara desechable
Colador
Agitador
Procedimiento:
1.-Cambio de solvente
- Romper con cuidado por la mitad un huevo fresco
- Escurrir la clara a un frasco
- Poner un poco de clara de huevo en una copa tequilera y agregar agua
- Mezclar suavemente
- Dejar gotear acetona hasta notar un cambio
- Anotar que es lo que se observa
3.- Cambio de pH
- En dos vasos desechables transparentes colocar hasta la mitad leche fresca
- Marcar cada uno de los vasos con los números 1 y 2
- Agregar unas gotas de color vegetal a ambos vasos y agitar
112
- Al vaso 1, agregar poco a poco con ayuda de un gotero la misma cantidad de vinagre
blanco y mezclar suavemente
- Al vaso 2, agregar la misma cantidad de jugo de limón y mezclar
- Observar que acontece en los vasos y dejar reposar unos 20 minutos
- Filtrar con la ayuda de un colador y papel filtro por separado cada uno de los vasos
- Recibir el líquido en frascos de vidrio
- Observar los papeles filtro y el líquido que se filtró
- Anotar en donde se quedó el color
Variantes
Utilizar sal de mesa en lugar del fertilizante, enfriar en lugar de calentar, hervir un
huevo, freír un huevo, emplear alcohol en lugar de la acetona.
Discusión y conclusiones
113
células es un proceso muy eficiente y da como resultado una estructura nativa con una
función específica. Los factores que mantienen estable una estructura proteica son: la
temperatura, el pH, la concentración de sales y el solvente; si se quiere estudiar una
proteína es requisito que mantenga su conformación y para ello es necesario conservar
dichos factores como si se estuviera en forma natural dentro de la célula, ya que al
cambiar alguno de ellos las proteínas sufren un proceso conocido como
desnaturalización. La desnaturalización de una proteína hace que se pierda la
conformación y por ende la actividad. La mayoría de las proteínas desnaturalizadas
precipitan en solución haciendo evidente su presencia en algún medio biológico.
Algunas proteínas desnaturalizadas se pueden renaturalizar, es decir que regresen a su
estado nativo, el proceso es lento y se hace en el laboratorio más no así en los seres
vivos. Al efectuar un cambio brusco de los factores antes mencionados dentro de una
célula o un organismo se provoca la desnaturalización de una o varias proteínas
ocasionando en algunos casos serios padecimientos, un ejemplo sería la formación de
cataratas en los soldadores por la exposición constante a altas temperaturas.
ENZIMAS
114
Introducción: Cuando el peroxido de hidrogeno H2O2, comúnmente llamado agua
oxigenada, entra en contacto con una herida, se forman burbujas, esto se debe a que
las células de la piel o las células vivas contienen una enzima llamada peroxidasa que
provoca la rápida descomposición de dicha sustancia, convirtiéndola en agua y oxigeno
el cual es bactericida.
Las papas crudas contienen también esta enzima, por lo que se puede observar la
descomposición de este compuesto utilizando papas crudas.
Material Sustancias
a) Un tubo de ensayo 5 ml de agua oxigenada
b) Un palillo de dientes Una papa cruda
c) Un mechero de Bunsen
Procedimiento
115
Conclusión
Al introducir el palillo encendido en el tubo de ensayo se comprueba la presencia del
oxigeno ya que se produce una pequeña explosión.
SAPONIFICACION
Cuando las grasas no tienen impurezas son incoloras, inodoras e insípidas y en estado
sólido o liquido, según los diversos esteres que las forman producen en le papel una
mancha que no se quita al calentar. Son insolubles en el agua pero se disuelven en
alcohol, éter y bencina; por eso estos líquidos se usan para quitar manchas de grasa.
Al calentar las grasas se descomponen formándose diversos gases y vapores
combustibles.
Materiales y sustancias:
a) Vaso de precipitado
b) Mechero de Bunsen
c) Termómetro
d) Solución de hidróxido de sodio al 50%
116
e) Aceite de coco
Procedimiento:
Conclusión:
Las grasas (manteca, mantequilla, aceite) son magníficos alimentos por su poder
calorífico pero son de gran importancia en la industria.
ALCOHOLES
Materiales
117
a) Frasco de boca ancha
b) Tela manta de cielo
c) Matraz de destilación
d) Soporte
e) Mechero
f) Refrigerante
g) Termómetro
h) Vidrio de reloj
i) Cerillos
j) Cáscara de piña, manzana,
k) Piloncillo
l) Levadura
Procedimiento:
Conclusión:
El líquido incoloro que se obtiene presenta el color característico del alcohol y al colocar
un poco de este en un vidrio de reloj y ponerle una flama, entra en combustión.
118
CUESTIONARIO
119
Instrucciones: Conteste a las siguientes preguntas tomando en cuenta su antología.
120
29. ¿De que se encarga la bioenergética?
30. Define la glucólisis.
31. ¿En donde se producen los cuerpos cetónicos?
32. Que es la fosforilación oxidativa?
33. Define gluconeogénesis.
34. ¿En que consiste el ayuno?
35. ¿Cuál es la diferenta entre ayuno e inanición?
121