Ing.

Química Facultad de Ingeniería de Procesos UNSA

RESUMEN

El advenimiento de la secuenciación rápida del genoma completo y la posibilidad

de capturar esta información en modelos metabólicos a escala del genoma,
proporcionan la posibilidad de modelar de manera exhaustiva las interacciones
microbianas de la comunidad. Por ejemplo, las especies de Rhodoferax y
Geobacter son reductores de Fe (III) oxidantes del acetato que compiten en
ambientes subsuperficiales anóxicos y esta competencia puede tener una
influencia en la biorremediación in situ del agua subterránea contaminada con
uranio. Por lo tanto, se usaron modelos a escala genómica de Geobacter
sulfurreducens y Rhodoferax ferrireducens para evaluar cómo Geobacter y
Rhodoferaxlas especies pueden competir bajo diversas condiciones encontradas
en un acuífero contaminado con uranio en Rifle, CO. El modelo predijo que a
las bajas tasas de flujo de acetato esperadas bajo condiciones naturales en el
sitio, Rhodoferax superará a Geobacter siempre que haya suficiente amonio
disponible. El modelo también predijo que cuando se agregan altas
concentraciones de acetato durante la biorremediación in situ , las especies de
Geobacter predominarían, de acuerdo con las observaciones a escala de campo.
Esto se puede atribuir a los mayores rendimientos de crecimiento esperados de
Rhodoferax y la capacidad de Geobacter para fijar nitrógeno. El modelado
predijo proporciones relativas de Geobacter yRhodoferax en zonas
geoquímicamente distintas del sitio Rifle que eran comparables a las que se
documentaron previamente con técnicas moleculares. El modelo también
predijo que bajo la fijación de nitrógeno, los mayores flujos de carbono y de
electrones se desviarían hacia la respiración en lugar de la formación de
biomasa en Geobacter , proporcionando una posible explicación para una mejor
reducción in situ de U (VI) en zonas de bajo amonio. Estos resultados muestran
que el modelado a escala del genoma puede ser una herramienta útil para
predecir las interacciones microbianas en entornos subsuperficiales y muestra
la promesa de diseñar estrategias de biorremediación.
Fuente: https://www.nature.com/articles/ismej2010117, 2010.

1
Ing. Química Facultad de Ingeniería de Procesos UNSA

Los pili eléctricamente conductivos de las especies de Geobacter

son una característica recientemente desarrollada para la
transferencia de electrones extracelulares
El pili eléctricamente conductor (e-pili) de Geobactersulfurreducenstienen
importancia ambiental y práctica porque pueden facilitar la transferencia de
electrones a los óxidos de Fe (III) insolubles; a otras especies microbianas; y a
través de biofilms eléctricamente conductivos. La conductividad de E-pili se ha
atribuido al monómero de PilA truncado, que permite un empaquetado apretado
de aminoácidos aromáticos para formar un camino conductor a lo largo de la
longitud de e-pili. Para comprender mejor la evolución y distribución de e-pili
en el mundo microbiano, se examinaron las proteínas tipo IVa PilA de diversas
bacterias Gram-negativas y Gram-positivas con un énfasis particular en las
bacterias que reinan en Fe (III). Los genes de E-pilina están restringidos
principalmente a un grupo filogenético estricto en el orden Desulfuromonadales.
El gen corriente abajo en todos menos uno de los Desulfuromonadales que
poseen un gen de e-pilina es un gen previamente anotado como 'pilA-C 'que
tiene características que sugieren que puede codificar una proteína de
membrana externa. Otros genes asociados con la función de la pilina se agrupan
con e-pilina y ' pilA-C'genes en el Desulfuromonadales. Por el contrario, en las
pocas bacterias fuera de los Desulfuromonadales que contienen genes e-pilina,
los otros genes necesarios para la función de la pilina pueden haber sido
adquiridos a través de la transferencia horizontal de genes. De los 95
microorganismos reductores conocidos de Fe (III) para los que hay genomas
disponibles, el 80% carecen de genes de e-pilina, lo que sugiere que los e-pili
son solo uno de los varios mecanismos implicados en el transporte de electrones
extracelulares. Estos estudios proporcionan información sobre dónde y cuándo
es probable que los e-pili contribuyan a los procesos de transporte de electrones
extracelulares que son biogeoquímicamente importantes e implicados en las
conversiones de bioenergía.
Fuente:
http://mgen.microbiologyresearch.org/content/journal/mgen/10.1099/mgen
.0.000072#tab1, 2016

2
Ing. Química Facultad de Ingeniería de Procesos UNSA

Enriquecimiento de las bacterias disimiladoras reductoras de Fe

(III) de las aguas subterráneas del sitio contaminado con BTEX de
Siklós (Hungría)
RESUMEN

Las bacterias reductoras de hierro disimiladoras se encuentran comúnmente en

comunidades microbianas de ambientes subterráneos contaminados con
hidrocarburos aromáticos donde a menudo juegan un papel clave en la
degradación de los contaminantes. El área contaminada con benceno, tolueno,
etilbenceno y xileno (BTEX) de Siklós es uno de los sitios de Hungría mejor
contaminados por hidrocarburos derivados del petróleo. El monitoreo continuo
de la comunidad microbiana en el centro del penacho contaminante indicó la
presencia de una población emergente de Geobacter y un filotipo de Rhodoferax
altamente asociado con los ambientes subsuperficiales contaminados con
hidrocarburos aromáticos. El objetivo del presente estudio fue hacer un esfuerzo
inicial para enriquecer Rhodoferaxrelacionadas y otras bacterias disimiladoras
reductoras de hierro de este entorno. En consecuencia, se utilizaron cuatro
medios de agua dulce ligeramente diferentes para enriquecer los reductores de
Fe (III), que difieren únicamente en la forma de fuente de nitrógeno (nitrógeno
orgánico, nitrógeno inorgánico o nitrógeno del espacio de cabeza gaseoso).

Aunque no se consiguió el enriquecimiento del filotipo de Rhodoferax deseado ,

las bacterias relacionadas con Geobacter se enriquecieron fácilmente. Además,
las diferentes fuentes de nitrógeno causaron el enriquecimiento de diferentes
especies de Geobacter . La investigación de la diversidad del gen de la
benzilsuccinato sintasa tanto en los enriquecimientos como en la muestra
inicial de aguas subterráneas indicó que el Geobacter la población en el centro
de la pluma contaminante puede no jugar un papel significativo en la
degradación anaeróbica del tolueno.

Fuente: https://link.springer.com/article/10.1007/s12223-016-0473-8, 2017

3
Ing. Química Facultad de Ingeniería de Procesos UNSA

Las partículas conductoras permiten la oxidación del acetato

sintrófico entre Geobacter y Methanosarcina de los sedimentos
costeros
RESUMEN

Los sedimentos costeros son ricos en partículas conductoras, posiblemente

afectando los procesos microbianos para los cuales el acetato es un
intermediario central. En la zona metanogénica, el acetato es consumido por
metanógenos y / o consorcios de acetato sintrófico oxidante (SAO). Los
consorcios SAO viven bajo una presión termodinámica extrema y su
supervivencia depende de una asociación exitosa. Aquí, demostramos que las
partículas conductoras permiten la asociación entre las bacterias SAO (es decir,
Geobacter spp.) Y los metanógenos ( Methanosarcina).spp.) de los sedimentos
costeros de la Bahía de Botnia del Mar Báltico. Los sedimentos metanogénicos
bálticos eran ricos en minerales conductivos, tenían un aparente
fraccionamiento isotópico característico de la metanogénesis reductora de CO 2
, y estaban habitados por Geobacter y Methanosarcina . Mientras se
suministraron partículas conductoras, persistieron Geobacter y
Methanosarcina , mientras que la exclusión de partículas conductoras condujo
a la extinción de Geobacter . Baltic Geobacter no estableció un contacto eléctrico
directo con Methanosarcina , necesitando partículas conductoras como
conductos eléctricos. Dentro de los consorcios de SAO,Geobacter fue un
eficiente utilizador de [ 13 C] acetato, representando el 82% de la asimilación y
el 27% de la degradación del acetato. Geobacter se beneficia de la asociación
con el metanogeno, porque en ausencia de un aceptor de electrones puede usar
Methanosarcina como un sumidero terminal de electrones. En consecuencia, la
inhibición de la metanogénesis también limitó la actividad de SAO de Geobacter
. Un beneficio potencial para la asociación de Methanosarcina con Geobacter es
que juntos excluyen competitivamente metanógenos acetoclásticos como
Methanothrixde un ambiente rico en partículas conductoras. El SAO conductivo
mediado por partículas podría explicar la abundancia de oxidantes de acetato
como Geobacter en la zona metanogénica de los sedimentos donde no están
disponibles otros receptores de electrones además del CO 2 .

IMPORTANCIA bacterias de etilo-oxidantes son conocidos para prosperar en

consorcios mutualistas en la que H 2 o formiato se transportó a un productoras
de metano Archaea pareja. Aquí, descubrimos que tales bacterias podrían

4
Ing. Química Facultad de Ingeniería de Procesos UNSA

transferir electrones a través de minerales conductivos. La SAO mineral

(oxidación del acetato sintrófico) podría ser una vía vital para el CO
2Metanogénesis reductora en el ambiente, especialmente en sedimentos ricos
en minerales conductivos. El SAO facilitado por minerales es por lo tanto de
importancia potencial para los ciclos de hierro y metano en los sedimentos y
suelos. Además, nuestras observaciones implican que la escorrentía agrícola o
las enmiendas con chalecos conductores podrían provocar un aumento
significativo en las emisiones de metano.
Fuente: http://mbio.asm.org/content/9/3/e00226-18.short, 2018.

5
Ing. Química Facultad de Ingeniería de Procesos UNSA

Potencial de Methanosarcina para contribuir a la reducción de

uranio durante la biorremediación de agua subterránea promovida
por acetato
RESUMEN

Estudios previos de biorremediación in situ de aguas subterráneas

contaminadas con uranio con inyecciones de acetato se han centrado en el papel
de las especies de Geobacter en la reducción de U (VI) debido a la falta de otros
abundantes microorganismos de reducción de U (VI) conocidos. La
monitorización de los niveles de la subunidad A de la metil CoM reductasa
(mcrA) durante un experimento de campo de inyección de acetato demostró que
los metanógenos acetoclásticos del género Methanosarcina se enriquecieron
después de 40 días de la enmienda del acetato. La mayor abundancia de
Methanosarcina correspondió con una acumulación de metano en el agua
subterránea. Una cultura de enriquecimiento dominada por una especie de
Methanosarcina con la misma secuencia de Methanosarcina mcrA que
predominaba en el experimento de campo podría convertir efectivamente el
acetato en metano. Con el fin de determinar si las especies de Methanosarcina
podrían participar en la reducción de U (VI) en el subsuelo, las suspensiones
celulares de M. barkeri se incubaron en presencia de U (VI) con acetato
proporcionado como donador de electrones. U (VI) se redujo por células de M.
barkeri metabólicamente activas, sin embargo, no se observó reducción de U
(VI) en controles inactivos. Estos resultados demuestran que las especies de
Methanosarcina podrían desempeñar un papel importante en la
biorremediación a largo plazo de acuíferos contaminados con uranio después
de que el agotamiento de óxidos de Fe (III) limita el crecimiento de las especies
de Geobacter. Los resultados también sugieren que Methanosarcina tiene el
potencial de influir en la geoquímica del uranio en una diversidad de ambientes
sedimentarios anaeróbicos. barkeri se incubaron en presencia de U (VI) con
acetato proporcionado como donador de electrones. U (VI) se redujo por células
de M. barkeri metabólicamente activas, sin embargo, no se observó reducción
de U (VI) en controles inactivos. Estos resultados demuestran que las especies
de Methanosarcina podrían desempeñar un papel importante en la
biorremediación a largo plazo de acuíferos contaminados con uranio después
de que el agotamiento de óxidos de Fe (III) limita el crecimiento de las especies
de Geobacter. Los resultados también sugieren que Methanosarcina tiene el
potencial de influir en la geoquímica del uranio en una diversidad de ambientes
sedimentarios anaeróbicos. barkeri se incubaron en presencia de U (VI) con
acetato proporcionado como donador de electrones. U (VI) se redujo por células
de M. barkeri metabólicamente activas, sin embargo, no se observó reducción
de U (VI) en controles inactivos. Estos resultados demuestran que las especies

6
Ing. Química Facultad de Ingeniería de Procesos UNSA

de Methanosarcina podrían desempeñar un papel importante en la

biorremediación a largo plazo de acuíferos contaminados con uranio después
de que el agotamiento de óxidos de Fe (III) limita el crecimiento de las especies
de Geobacter. Los resultados también sugieren que Methanosarcina tiene el
potencial de influir en la geoquímica del uranio en una diversidad de ambientes
sedimentarios anaeróbicos. Estos resultados demuestran que las especies de
Methanosarcina podrían desempeñar un papel importante en la
biorremediación a largo plazo de acuíferos contaminados con uranio después
de que el agotamiento de óxidos de Fe (III) limita el crecimiento de las especies
de Geobacter. Los resultados también sugieren que Methanosarcina tiene el
potencial de influir en la geoquímica del uranio en una diversidad de ambientes
sedimentarios anaeróbicos. Estos resultados demuestran que las especies de
Methanosarcina podrían desempeñar un papel importante en la
biorremediación a largo plazo de acuíferos contaminados con uranio después
de que el agotamiento de óxidos de Fe (III) limita el crecimiento de las especies
de Geobacter. Los resultados también sugieren que Methanosarcina tiene el
potencial de influir en la geoquímica del uranio en una diversidad de ambientes
sedimentarios anaeróbicos.
Fuente: https://www.biorxiv.org/content/early/2017/10/12/202242,2017