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ACTIVIDAD N° 02

ECOLOGIA MICROBIANA –BACTERIAS PATOGENAS QUE ATACAN LAS PLANTAS

ECOLOGIA MICROBIANA
La 'ecología microbiana' es la rama de la ecología que estudia a los microorganismos en
su ambiente natural, los cuales mantienen una actividad continua imprescindible para
la vida en la Tierra. Los mecanismos que mantienen la diversidad microbiana de la
biosfera son la base de la dinámica de los ecosistemas terrestres, acuáticos y aéreos. Es
decir, la base de la existencia de las selvas y de los sistemas agrícolas, entre otros. Por
otra parte, la diversidad microbiana del suelo es la causa de la fertilidad del mismo.
LA GEOMICROBIOLOGIA
Es la ciencia que estudia cómo las bacterias interactúan con los procesos
geológicos y
geoquímicos. En 1980, diversos estudios explicaron cómo una bacteria, el
Bacillus subtilis, era hábil en interactuar con un rango de metales tóxicos como
el cobre, hierro, magnesio, oro y plomo. Esta habilidad fue atribuida a la
diferencia entre la carga ne

Agrobacterium

Agrobacterium
Clasificación científica
Dominio: Bacteria
Filo: Proteobacteria
Clase: Proteobacterias alfa
Orden: Rhizobiales
Familia: Rhizobiaceae
Género: Rhizobium
Principales especies
Agrobacterium tumefaciens
Agrobacterium rhizogenes
Véase la nota taxonómica
[editar datos en Wikidata]

Agrobacterium es un género de bacterias que causan tumores en las plantas. Esta


capacidad tumorigénica viene dada por su capacidad natural para transferir ADN a las
células vegetales, hecho que los científicos rápidamente aprovecharon para convertirla en
una herramienta para la creación de plantas transgénicas mediante ingeniería genética.

Nota taxonómica: Estudios recientes han reclasificado todas las especies del género
Agrobacterium, la mayoría en Rhizobium y otras en Ruegeria, Pseudorhodobacter y
Stappia (géneros nuevos).

Antiguo nombre Nuevo nombre


Agrobacterium larrymoorei Rhizobium larrymoorei
Agrobacterium tumefaciens (= A. radiobacter) Rhizobium radiobacter
Agrobacterium rhizogenes Rhizobium rhizogenes
Agrobacterium rubi Rhizobium rubi
Agrobacterium vitis Rhizobium vitis

Agrobacterium como patógeno de las plantas

Los abultamientos en estas raíces son agallas producidas por la Agrobacterium


tumefaciens.

Rhizobium radiobacter (= Agrobacterium tumefaciens) es la especie más comúnmente


estudiada de este grupo. En plantas causa la enfermedad de las agallas del cuello,
denominada así porque produce agallas o tumores, a menudo en la zona donde se une la
raíz al tallo (cuello, o también llamado corona). Los tumores son producidos por la
transferencia de un segmento de ADN (ADN-T) del plásmido bacteriano Ti (abreviatura
de tumor-inductor). La especie próximamente relacionada, R. rhizogenes (= A.
rhizogenes), induce tumores en la raíz, y presenta un plásmido distinto Ri (abreviatura de
raíz-inductor). La especie R. vitis (= A. vitis), restringida generalmente a la vid, puede
presentar un plásmido Ti.

Cepas de otras especies bacterianas distintas de Agrobacterium, alisladas en muestras


ambientales, han presentado también plásmidos Ti. Además, muchas cepas ambientales
de Agrobacterium no poseen plásmidos Ti ni Ri, por lo que no son virulentas.

El plásmido ADN-T se integra semi-aleatoriamente en el genoma de la célula huésped,1


y los genes de virulencia del ADN-T se expresan causando la formación de una agalla. El
ADN-T lleva genes de enzimas biosintéticas para la producción de aminoácidos
inusuales, típicamente octopina o nopalina. También lleva genes para la biosíntesis de
hormonas de las plantas, auxinas y citoquininas. Estos alteran el equilibrio hormonal en
la célula, de forma que la planta no puede controlar la división de esas células, formándose
tumores. El cociente de auxina a citoquinina determina la morfología del tumor.

Agrobacterium en biotecnología

La capacidad de Agrobacterium para transferir genes a las plantas se ha explotado en


ingeniería genética para la creación de plantas trangénicas. Pueden utilizarse plásmidos
Ti o Ri modificados. El plásmido se desarma eliminando los genes que inducen el tumor.
Las únicas partes esenciales del ADN-T son dos pequeñas repeticiones (25 pares de bases)
en los extremos, por lo menos una de las cuales es necesaria para la transformación de la
planta. Marc Van Montagu y Jozef Schell en la universidad de Gante (Bélgica)
descubrieron el mecanismo de transferencia de genes entre Agrobacterium y las plantas,
que permiten el uso de esta bacteria en ingeniería genética. Un equipo de investigadores
dirigido por Maria-Dell Chilton demostró que podían eliminarse los genes de virulencia
sin afectar a la capacidad de la bacteria para insertar su propio ADN en el genoma de la
planta (1983).

Los genes que se desea introducir en la planta son clonados en la región ADN-T del
plásmido desarmado, junto con un marcador seleccionable (tal como la resistencia
antibiótica) que será usado para seleccionar a las plantas que han sido modificadas con
éxito. Después de la modificación, se hace crecer a las plantas en un medio que contiene
el antibiótico, de forma que las que no tienen el ADN-T integrado en su genoma morirán.
Un método alternativo es la agroinfiltración.

La modificación genética mediante Agrobacterium se puede realizar de dos formas. Una


consiste en la incubación de protoplastos u otros tejidos de la planta con la bacteria y la
posterior regeneración de las plantas completas. Otra forma (común para modificación de
Arabidopsis se denomina"floral dipping": las flores se sumergen en un cultivo de
Agrobacterium, y la bacteria transforma las células de la línea germinal que producen los
gametos femeninos. Agrobacterium no infecta a todas las especies de plantas, pero se han
desarrollado otras técnicas eficaces para la modificación genética de la plantas tales como
la biobalística.

Pseudomonas es un género de bacilos rectos o ligeramente curvados, Gram negativos,


oxidasa positivos, aeróbicos estrictos aunque en algunos casos pueden utilizar el nitrato
como aceptor de electrones. El catabolismo de los glúcidos se realiza por la ruta de Etner-
Doudoroff y el ciclo de los ácidos tricarboxílicos. Algunos miembros del género son
psicrófilos, mientras que otros sintetizan sideróforos fluorescentes de color amarillo-
verdoso con gran valor taxonómico. Es común la presencia de plásmidos y no forman
esporas.

Con el reciente análisis de secuencias del RNAr 16S se han definido la taxonomía de
muchas especies bacterianas1 y como resultado, el género Pseudomonas incluyen algunas
cepas clasificadas anteriormente dentro de las Chryseomonas y Flavimonas.2 Otras cepas
clasificadas previamente en el género Pseudomonas, ahora son agrupadas en los géneros
Burkholderia y Ralstonia.

Índice
Erwinia es un género de enterobacterias bacterias que contienen principalmente
patógenos de plantas especies que fue nombrado por el famoso patólogo de plantas ,
Erwin Frink Smith . Contiene gram-negativas bacterias relacionadas con Escherichia coli
, Shigella , Salmonella y Yersinia . Son bacterias principalmente en forma de varilla.

Muchos infectan plantas leñosas. Un conocido miembro de este género es la especie E.


amylovora , lo que provoca el tizón de fuego en manzanas, peras y otras Rosaceae
cultivos; E. tracheiphila por otra parte provoca la marchitez bacteriana de las
cucurbitáceas . Otras especies conocidas, tales como E. carotovora (otra de las principales
causas de enfermedades de las plantas), están más alejadas de la plaga bacteria fuego, y
ha trasladado a los géneros Brenneria , Dickeya y Pectobacterium . [1] electroforesis en
gel de poliacrilamida bidimensional de las proteínas secretadas de Erwinia carotovora
subsp. atroseptica reveló una proteína de baja abundancia que se identificó por
espectrometría de masas como un homólogo de una proteína de avirulencia Xanthomonas
campestris con función desconocida. La proteína Svx predicho tiene una secuencia N-
terminal de la señal y de zinc-región de unión de firma, y la proteína madura después de
la traducción es modificada. A diferencia de la electroforesis en gel 2D (DIGE) mostró
que la proteína es secretada por el aparato de secreción de tipo II (out), que también es
responsable de la secreción de los principales factores de virulencia conocidos, Pelc y
CELV. La transcripción del gen svx está bajo control de quórum homoserina-lactona
detección mediada Nacyl-. El gen svx se inactivó mediante inserción del transposón. El
mutante mostró una disminución en la virulencia en ensayos de plantas de patata, lo que
demuestra un papel para Svx en la patogenicidad de E. carotovora subsp. atroseptica.
Estos resultados muestran que Svx es un determinante de virulencia previamente no
identificado que es secretada por la maquinaria a cabo y está regulada por la detección de
quórum, dos sistemas empleados por varios otros factores de virulencia. Por lo tanto, la
máquina de secreción de tipo II es un conducto para los factores de virulencia, excepto
los principales pectinnases y celulasa en E. carotovora subsp. atroseptica. [2]

Corynebacterium es un género de bacterias, bacilos y gram positivos, inmóviles,


anaerobio facultativos, pertenecientes al filo actinobacteria. Es uno de los géneros más
numerosos de actinobacterias con más de 50 especies, la mayoría no causa enfermedades,
sino que son parte de la flora saprófita de la piel humana.1

Taxonomía

El género Corynebacterium fue creado por Lehmann y Neumann (1896) para ubicar
taxonómicamente a los bacilos de la difteria. El género fue definido basándose en
características morfológicas: Corynebacteria proviene del griego corönë (bastón nudoso)
y bacterion (bastoncillo). A partir de estudios de RNAr 16S se ha agrupado a las
corinebacterias en la subdivisión de eubacterias Gram-positivas de alto contenido en G:C,
en estrecha relación filogenética con Arthrobacter, Mycobacterium, Nocardia e incluso
Streptomyces.3

axonomía

El género Xanthomonas ha sido objeto de numerosos estudios taxonómicos y


filogenéticos y fue descrito por primera vez como Bacteria vesicatorium como patógeno
de pimiento y tomate en 1921. [1] Dowson [2] posteriormente reclasificado como la
bacteria Xanthomonas campestris y propuso el género Xanthomonas. [ 3] Xanthomonas
fue descrito por primera vez como un género monotípico y una mayor investigación dio
lugar a la división en dos grupos, A y B. [4] [5] El trabajo posterior utilizando ADN: la
hibridación de ADN ha servido de marco para la clasificación general especies
Xanthomonas. [6] [7] Otras herramientas, incluyendo el análisis de secuencias multilocus
y polimorfismo de longitud de fragmento amplificado, se han utilizado para la
clasificación dentro de clados. [8] [9] Así, mientras que la investigación anterior ha
ilustrado la complejidad del género Xanthomonas, aparece investigaciones recientes
haber dado lugar a una imagen más clara. Más recientemente, el análisis de todo el
genoma de varias cepas de Xanthomonas mayoría apoya las filogenias anteriores. [10]

Morfología y crecimiento

Características de las células individuales incluyen:

 Tipo de la célula - varillas rectas


 Tamaño - 0,4 a 1,0 micras de ancho por 1,2 a 3,0 micras de largo
 Motilidad - móviles por un solo flagelo polar

Características de crecimiento de colonias incluyen:

 Mucoide, convexas y colonias amarillas en medio YDC [11]


 Pigmento amarillo de xanthomonadin, que contiene bromo
 Mayoría producen grandes cantidades de polisacáridos extracelulares
 Rango de temperatura - 4-37 ° C

Resultados de las pruebas bioquímicas y fisiológicas son:

 Tinción de Gram - negativo


 La catalasa positivo [11]
 Oxidasa negativo [11]

Para aislar las bacterias:

 Tejido de la planta infectada debe ser desinfestada superficie utilizando una


solución de hipoclorito de sodio diluido (10%) y se enjuagan a fondo.
 Si no está seguro de la presencia de bacterias, examinar el tejido sintomático
cortando a lo largo de la zona infectada, la colocación de tejido cortado en un
portaobjetos de vidrio y cubrir con un cubreobjetos y examinar para la transmisión
bacteriana a gran aumento. En una ampliación de 200X, Streaming bacteriana se
puede observar como una masa supuración de la zona de corte.
 Una vez que se confirma el streaming bacteriana, coloque el tejido de la superficie
desinfestadas en unas pocas gotas de agua estéril y permiten que las bacterias de
flujo hacia fuera en la gota de agua. Después de que las bacterias han colonizado
la gota de agua (30-60 segundos), use un asa estéril a raya las bacterias en un
medio de agar sólido.
 Permita que las bacterias crezcan durante al menos 48 horas a temperatura
ambiente y examinar periódicamente para el crecimiento de colonias.

Patógenos de plantas Xanthomonas


Especies Xanthomonas pueden causar manchas bacterianas y plagas de las hojas, tallos y
frutas en una amplia variedad de especies de plantas: [12] especies patógenas muestran
altos grados de especificidad y algunos se dividen en múltiples patovares, una
designación de especie basándose en la especificidad del hospedador.

Cancro de los cítricos , causada por Xanthomonas citri subsp. citri es una enfermedad
económicamente importante de muchas especies de cítricos (limón, naranja, limón,
Pamelo, etc.) [10]

La mancha foliar bacteriana ha causado importantes pérdidas de cosechas en los últimos


años. Las causas de esta enfermedad incluyen Xanthomonas euvesicatoria y
Xanthomonas perforans = [Xanthomonas axonopodis (syn. Campestris) pv. Vesicatoria],
Xanthomonas vesicatoria, y Xanthomonas gardneri. En algunas áreas donde la infección
se inicia poco después del transplante, la cosecha total se puede perder como
consecuencia de esta enfermedad. [13]

Tizón bacteriano del arroz, causada por Xanthomonas oryzae pv. oryzae, es una
enfermedad que se encuentra en todo el mundo y particularmente destructiva en las
regiones productoras de arroz de Asia. [14]

Patogénesis Planta y control de la enfermedad

Especies Xanthomonas pueden propagarse fácilmente en agua, movimiento de material


infectado, como las plantas de semillas o de propagación, y por medios mecánicos tales
como las herramientas de poda infectadas. Al entrar en contacto con un huésped
susceptible, las bacterias entran a través de heridas o aberturas naturales de plantas como
medio para infectar. [13] Se inyectan una serie de proteínas efectoras, incluyendo efectores
TAL , en la planta por sus sistemas de secreción (es decir, del sistema de secreción tipo
III ).

Para prevenir las infecciones, lo que limita la introducción de las bacterias es la clave.
Algunos cultivares resistentes de ciertas especies de plantas están disponibles ya que esto
puede ser el medio más económico para el control de esta enfermedad. Para el control
químico, aplicaciones preventivas son la mejor manera de reducir el potencial para el
desarrollo de bacterias. Productos que contienen cobre ofrecen cierta protección junto con
los antibióticos campo de grado tales como oxitetraciclina, que está etiquetado para su
uso en algunos cultivos de alimentos en los Estados Unidos. Aplicaciones curativas de
pesticidas químicos pueden frenar o reducir la propagación de la bacteria, pero no curan
las plantas ya enfermas. [15] Es importante consultar las etiquetas de pesticidas químicos
cuando se trata de luchar contra las enfermedades bacterianas, como las diferentes
especies de Xanthomonas pueden tener diferentes respuestas a estas aplicaciones. La
excesiva dependencia de los métodos de control químico también puede dar lugar a la
selección de cepas resistentes, por lo que estas aplicaciones deberían considerarse como
un último recurso.

Uso industrial

Especies Xanthomonas producen un extrapolysaccharide llamado goma xantana que tiene


una amplia gama de usos industriales, incluyendo alimentos, productos derivados del
petróleo, y los cosméticos.
Recursos Xanthomonas

Los aislados de la mayoría de especies de Xanthomonas están disponibles en la Colección


Nacional de Plantas Las bacterias patógenas en el Reino Unido y otras colecciones de
cultivos internacionales como ICMP en Nueva Zelanda, CFBP en Francia, y MRV en
Rusia. También puede ser sacada de la MTCC India.

Múltiples genomas de Xanthomonas se han secuenciado y conjuntos de datos adicionales


/ herramientas están disponibles en El Recurso Xanthomonas

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