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Acidos
nucleicos
ESQUEMA
17.1 ONA
Estru ctura del ONA naturaleza de las mutaciones
Estructura del ONA del Jél rdín de Mende l a
Watso n y Cri ck
Estructura del ONA varia ciones sob re un tema
Su perenrollami ento del ONA
Cromoso mas y cromatin a
Estructura de l genoma
17.2 RNA
RNA de tra nsferencia
RNA ri bosoma l
RNA mensajero
RNA 110 cod ificado r
17.3 VIRUS
625
626 CAPíTULO DIECISIETE Ácidosnucleicos
Sinopsis
LA DETERMINACiÓN DE LA ESTRUCTURA DEL ÁCIDO DESOXIRRIBONUCLEICO POR
JAMES WATSON y FRANCIS CRICK EN LOS PRIMEROS AÑOS DE LA DÉCADA DE 1950 FUE
la culminación de una investigación que había comenzado casi un siglo antes.
Las consecuencias de su fundamental trabajo se están desplegando mientras la
información genética de diversos organismos, incluido el ser humano, se revela de
forma gradual. La estructura y el funcionamiento asombrosamente complejos del
DNA y de su compañero, el RNA, continúan fascinando a los investigadores y a los
estudi antes.
D
urante incontables siglos, los seres humanos han observado los patrones de he-
rencia sin entender los mecanismos que transmiten de los padres a la progenie
los rasgos físicos y los procesos del desarrollo. Muchas culturas humanas han
utilizado estas observaciones para mejorar sus condiciones económicas, como en la
crianza de los animales domésticos o en los cultivos . La investigación científica de
la herencia, que en la actualidad se denomina genética, no empezó hasta el siglo XIX.
Al comienzo del siglo XX, los científicos comenzaron a admitir de forma generaliza-
da que los rasgos físicos se heredan en unidades discretas (que después se denomina-
ron genes) y que los cromosomas del interior del núcleo son los depositarios de la in-
formación genética. Al final, se elucidó la composición química de los cromosomas
y (tras muchas décadas de investigación) se identificó el ácido desoxirribonucleico
(DNA) como el portador de la información genética. En los decenios que siguieron al
descubrimiento de la estructura del DNA por James Watson y Francis Crick en 1953
(Fig. 17.1), emergió una nueva ciencia. La biología molecular se dedica a la inves-
tigación de la estructura de los genes y al procesamiento de la información genética.
Utilizando las tecnologías desarrolladas por biólogos moleculares y bioquímicos, los
investigadores de las ciencias de la vida han estudiado los procesos por los cuales
FIGURA 17 . 1
El primer modelo estructural completo
del DNA
los seres vivos organizan y procesan la información genética. Este trabajo ha revela-
do los siguientes principios.
3.3 nm
o H
(33Á)
o
o e en la cadena de éster-fosfato
e y N en las bases
O p
i. - -i
' 2.4 nm .
(24Á)
(a) (b)
F IGURA 17 . 2
Dos modelos de la estructura del DNA
(a) La doble hélice del DNA se representa co mo una esca lera en espiral; ésta es la conformación propuesta originalmente
por Watso n y Crick y ahora co nocida co mo DNA B. (Las propiedades estructurales de las tres formas de DNA pueden
verse en el Cuadro 17.1 , más adelante.) Los lados de la escalera represe ntan los esqueletos azúcar- fosfato. Los peldaños
representan los pares de bases. (b) En el modelo espacial. los esq ueletos azúcar-fosfato están representados por esferas
coloreadas. Los pares de bases constan de disposiciones horizontales de esferas azul oscuro. Los surcos mayor y menor
se crean al enrollarse las dos cadenas una alrededor de la otra.
628 CAPíTULO DIECISIETE Ácidosnucleicos
Transcripción
Citoplasma
Rililonuc!eótidos
(a)
Traducción
(b)
FIGURA 17 .3
Panorama general del flujo de información genética
La información genética conten ida en el DNA es convertida en la secuencia lineal de aminoácidos de polipéptidos en un proceso en dos fases. Durante la
trallscripción (a) , se sintetizan moléculas de RNA a partir de una cadena de DNA mediante apareamiento de bases complementarias entre las bases del
DNA y las bases de moléculas de ribonucleósidos trifosfatados libres. Durante la segunda fase, llamada traducción (b) , las moléculas de rnRNA se unen
a ribosomas constituidos por rRNA y proteínas ribosomales. Comp lejos RNA de transferencia-aminoacilo colocan la carga de aminoácidos en el sitio
catalítico del interior del ribosoma, en un proceso que implica el apareamiento de bases complementarias entre los tripletes de bases de mRNA llamados
codones y tripletes de bases de tRNA llamados anticodones. Cuando los aminoácidos se colocan de manera correcta dentro del sitio catalítico, se forma
un enlace peptídico. Después de que la molécula de mRNA se mueve respecto al ribosoma, un nuevo codón ingresa en el sitio catalítico de éste y aparea
sus bases con las del anticodón apropiado en otro complejo aminoacilo-tRNA. Cuando un codón de terminación apropiado en el mRNA enU'a en el sitio
catalítico, el poÍipéptido recién formado se libera del ribosoma.
171 DNA 629
17.1 DNA
El DNA está formado por dos cadenas polinuc\eotídicas enrolladas una alrededor de
la otra para formar una uoble hélice uextrógira (Fig. 17.2). La estructura del DNA es
tan característica que con frecuencia a esta molécula se le denomina la doble hélice.
Como se ha descrito (en las Secciones 1.3 y 14.3), cada monómero nucleotídico del
DNA está formado por una base nitrogenada (púrica o pirimídica), un azúcar desoxi-
rribosa y fosfato. Los mononuc\eótidos están unidos mediante enlaces 3' ,5' -fosfo-
diéster. Estos enlaces unen el grupo hidroxilo 5' de la desoxirribosa de un nuc\eótido
con el grupo hidroxilo 3' del azúcar de otro nucleótido mediante un grupo fosfato
630 CA P íTU LO DIE C I SIETE Ácidos nucleicos
H H
"-/
N
_ H- {Nt i A
I~
'
0=¡-OCH 2 O
N N
O
H
0- H,C~N/H T
O H)lN~O O
o=t-o~
c, HJN~N/H O G
0- \
N
~R~
N N
/ H
I
O H
I H H
0 = P- OCH 2i O "'-/
H~
Enlace I
FIGURA 17 .4 fosfodiéster 0-
Jl-l
Estructura de una cadena de DNA
Q
sí medi ante enlaces 3' ,5 ' -fosfodi éster. La
0=¡-OC 2 O
secuencia de la secci ón de la cadena que se
representa en esta fig ura es S'-ATGC- 3' . 0-
3'
OH
~O
extremo 3'
C
"",",,",,' "-P-O
0- .,,'.' G "'" / \--=-
O~/ O O ~ O O
O
_
6~ IIIIIIIIIIII
11111111111/
G O
O~ I C 0\
o»
IIIIIIIIIIII
/ -0 O P=O
"nnnn,,~
l
FIGURA 17 . 5
1111111111111 O
/ \ _
O O
Estructura del DNA
O O O T A Azú car
~~
0p IIIIIIIIIIIII~
-_-:'
En este seg mento corto de DNA se muestran
O~/ ~IIIIII///III ~
las bases e n color naranj a y los azúcares en G O
co lor azu l. Cada par de bases se mantiene - O _ - _ Enlace
O P O fosfodiéster
unido por dos o tres enlaces de hidrógeno.
111////////// C \
Las dos cadenas de polinucleótidos son
anti paralelas . El orden de las bases de una O I
cadena determ ina el orden de las bases de la Enlace de
otra debido al apareamiento de bases. extremo 5' extremo 3 '
hidrógeno
17.1 DNA 631
FIGURA 1 7. 6
Estructura del DNA: dimensiones de los
pares de bases AT y GC
¡ - - - -- - - - - 1 . 0 8 n m - - - - - - - - - 1
1--------1.08nm - - - - - - - - - 1
Nitrógeno Carbono
H
H /
NH H-N N
/ \ ~" / ~CH
HC-C ~ C-C I
/j '\ /j '\ N
HC N N C-
\
N-C
/ \C=j A la d~soxirribosa
/ '\ H
A la desoxirribosa O
Citosina
!
Adenina (amino)
H H
NH •••••• .• •. N N
/ '\ /~CH
HC-C C-C I
/j '\ / '\ N
HC N········· HN C- \
N-C
\ / \ C=N/ A la desoxirribosa
/ '\ H
A la desoxirribosa O
Citosina Adenina (imino)
FIGURA 17 . 7
La desviación tautomérica produce una mutación por transición
Al experimentar la adenina una desviación tautomérica, su forma imino
puede aparearse con la citosina. La transición se presenta en la segunda
generación de la replicac ión de l DNA cuando la ·c itosi na se aparea con
la guanin a. De esta forma se sustituye un par de bases A-T por un par
de bases G-c.
o O
?g~rH HOH'C'CrH
~N/ O N O
H I I
H H
Timina glicol 5-Hidroximetiluracilo 8-Hidroxiguanina
"
Las timinas adyacentes forman dímeros con 1 11
/N-HC"
gran eficacia tras la absorción de luz Uv.
O=C N I
C¿jC_C ~~;:~'O
O=C ;C-C/
CH 3 1
H
H
1
N-C
t O
11
"N
butano
3' 5'
1. Análogos de las bases. Debido a que sus estructuras son semejantes a las de
las bases nucleotídicas normales, los análogos de las bases pueden incorpo-
rarse al DNA. Por ejemplo, la cafeína es un análogo de la base timina. Debido
a que puede aparearse con la guanina, la incorporación de cafeína puede pro-
ducir una mutación por transición .
2. Agentes alquilantes. La alquilación es un proceso en el que las sustancias
electrófilas ("ávidas de electrones") atacan a las moléculas que poseen un par
de electrones sin compartir. Cuando los electrófilos reaccionan con estas mo-
léculas, por lo general añaden grupos alquilo que contienen carbono. La ade-
ni na y la guanina son muy susceptibles a la alquilación, aunque la timina y la
citosina también pueden ser afectadas. Las bases alquiladas con frecuencia se
aparean de forma incorrecta (p. ej., la metilguanina se aparea con la timina en
lugar de con la citosina) lo que conduce a posibles mutaciones por transición
en las siguientes rondas de replicación. En el caso de la metilguanina, el par
GC se transforma en el par AT. Las mutaciones por transversión también pue-
den tener lugar cuando el grupo alquilante es voluminoso. (En una mutación
por transversión, otra clase de mutación puntual, una pirimidina se sustituye
por una purina o viceversa.) Las alquilaciones también pueden promover la
formación de un laulómero, que puede dar lugar a mutaciones de transición.
Entre los agentes alquilantes se encuentran el dimetilsulfato y la dimetilnitro-
samina. La mitomicina C es un agente alquilante con doble función . Puede
impedir la síntesis de DNA entrecruzando las bases de guanina. Los mecanis-
mos de reparación del DNA (Sección 18.1) por lo general eliminan el anillo
de la base anormal antes de la replicación, lo que reduce la frecuencia de las
mutaciones.
17.1 DNA 635
Anaranjado de acridina
(a)
Acridina
FIGURA 17 .9
Agente intercalador
Considérese cada uno de los compuestos siguientes. ¿A qué clase de xenobióticos per-
judiciales para el DNA pertenecen?
H'Cl~)
O N N
I
CH 3
Cafeína Benzo[a]pireno Cloruro etílico
La acumulación de daño oxidativo en el DNA parece ser la causa principal del en-
vejecimiento de los mamíferos. Los animales que tienen tasas metabólicas elevadas
(Le., que emplean grandes cantidades de oxígeno) o que eliminan grandes cantidades de
bases modificadas en la orina, en general tienen vidas más cortas. La eliminación
de cantidades relativamente grandes de bases oxidadas indica una reducción de la
capacidad de impedir el daño oxidativo. A pesar de las pruebas sustanciales de que
los radicales de oxígeno dañan al DNA, aún no es claro cuáles son los radicales
que producen el daño. Además del radical hidroxilo, sugiéranse otros posibles cul-
pables. Algunos tejidos soportan un mayor daño oxidativo que otros. Por ejemplo, se
piensa que el cerebro humano sufre un mayor daño oxidativo que el resto de los teji-
dos durante un lapso promedio de vida. Sugiéranse dos razones para este fenómeno.
que les interesan. Los investigadores de esta clase con más talento suelen ayudar a
crear nuevas tecnologías.
La revolución científica que finalmente condujo al modelo del DNA comenzó en
la tranquilidad del jardín de la abadía de un oscuro monje austriaco que se llamaba
Gregor Mendel. Él descubrió las reglas básicas de la herencia cultivando guisantes.
En 1865, Mendel publicó los resultados de sus experimentos de reproducción en el
Journal 01 the Brunn Natural History Society. Aunque envió copias de esta publica-
ción a biólogos eminentes de toda Europa, su trabajo fue ignorado hasta 1900. En
ese año, varios botánicos de forma independiente redescubrieron la publicación de
Mendel y se dieron cuenta de su importancia. Este largo retraso se debió en parte a la
naturaleza descriptiva de la biología del siglo XIX; pocos biólogos estaban familiari-
zados con las matemáticas que Mendel utilizó para analizar sus datos. En 1900, mu-
chos biólogos no sólo tenían conocimientos de matemáticas, sino también un marco
de referencia proporcionado por los principios de Mendel, debido a que muchos de
los detalles de la meiosis, de la mitosis y de la fertilización ya eran de conocimiento
público.
Asombrosamente, se estaba investigando casi al mismo tiempo la sustancia que
constituía las unidades de la herencia a las que Mendel se refería en su trabajo. El
descubrimiento de la "nucleína", que posteriormente se denominó ácido nucleico, lo
realizó Friedrich Miescher, un patólogo suizo, en 1869. Trabajando con los núcleos
de las células purulentas, Miescher extrajo la nucleína y descubrió que era ácida y
que contenía una gran cantidad de fosfato. (Aunque Joseph Lister publicó en 1867
sus descubrimientos sobre la cirugía antiséptica, los hospitales continuaron siendo
una fuente abundante de secreciones purulentas durante los años siguientes.) De
modo interesante, Miescher creyó (erróneamente) que la nucleína era un compuesto
de almacenamiento de fosfato.
La composición química del DNA la determinaron en gran medida Albrecht Kos-
sel, entre 1882 y 1897, Y P.A. Levene, en la década de 1920 cuando se descubrieron
las técnicas analíticas adecuadas. Por desgracia, Levene creyó erróneamente que el
DNA era una molécula pequeña y sencilla en términos relativos. Su concepto, que se
denominó hipótesis del tetranucleótido, retrasó de manera significativa más investi-
gaciones del DNA. En su lugar, las proteínas (los otros componentes principales de
los núcleos) se consideraban como los posibles transportadores de la información
genética. (A finales del siglo XIX se aceptaba en general que el núcleo contenía la
información genética.)
Mientras que los genetistas se centraban en la investigación de los mecanismos
de la herencia y los químicos elucidaban las estructuras de los componentes de
los ácidos nucleicos, los microbiólogos ponían a punto métodos para estudiar los
cultivos bacterianos. En 1928, mientras investigaba una epidemia mortal de neu-
monía en Gran Bretaña, Fred Griffith realizó una serie notable de experimentos
con dos cepas de neumococos (Fig. 17.10). Una cepa bacteriana, que se denomi-
naba la forma lisa (o de tipo S) debido a que estaba recubierta con una cápsula de
polisacáridos, es patógena. La forma rugosa (o de tipo R) carece de la cápsula y
no es patógena. Griffith observó que los ratones inoculados con una mezcla de las
bacterias R vivas y las S destruidas por el calor, morían. Quedó asombrado cuando
ais ló las bacterias S vivas de los ratones muertos. Aunque esta transformación de
las bacterias R en bacterias S se confirmó en otros laboratorios, el descubrimiento
de Griffith se recibió con un escepticismo considerable. (El concepto de transmi-
sión de la información genética entre las células bacterianas no se aceptó hasta la
década de 1950.)
En 1944, Oswald Avery y sus colegas Colin MacLeod y Maclyn McCarty comu-
nicaron su cuidadoso aislamiento y la identificación del DNA como el agente trans-
formador de los experimentos de Griffith. No todo el mundo aceptó esta conclusión
uebido a que su muestra ue DNA tenía trazas de impurezas proteínicas. Avery y
McCarty demostraron después que la digestión del DNA por parte de la desoxirribo-
nucleasa (DNasa) inactivaba al agente transformador. (Al final, se determinó que el
DNA que transforma los neumococos R en la forma S codifica una enzima necesaria
para sintetizar la cápsula gelatinosa de polisacárido. Esta cápsula protege a las bac-
terias del sistema inmunitario del animal y aumenta la adherencia y colonización de
los tejidos del hospedador.)
638 CAPíTULO DIECISIETE Ácidosnucleicos
+ +
Tipo S
(atenuado por calor)
+
FIGURA 17 . 10
Experimento de Fred Griffith
En el experimento de Griffith , una mezcla de neumococos R no virulentos y neumococos S virulentos
atenuados por calor causó la muerte de los ratones. De éstos se recuperaron neumococos S virulentos.
te E. coli no marcada
Trituradora.
• Lisis
32p
FI GURA 17 . 11
Experimento de Hershey y Chase
(a) Se preparó un fago radiomareado inoculando el virus en cultivos bacterianos que contenían los radioisótopos. (b) Cuando el fago marcado infectó
bacterias no marcadas, sólo el DNA del fago marcado se detectó en las bacterias. Parte de la etiqueta 32p se localiza en la progenie vírica. (e) Imagen del
bacteriófago T4 en el momento de lisar una célula de E. coli.
FIGURA 17 . 12
Estudio de difracción de rayos X de DNA
hecho por Rosalind Franklin y R. Gosling
F I GURA 17 . 13
DNA A,DNA By DNA Z
Como el DNA es una molécula flexible, puede adoptar diferentes configuraciones, dependiendo de
su sec uencia de pares de bases y/o de las condiciones en que se realice su aislamiento. Cada forma
molecular de la figura posee el mismo número de pares de bases. En el Cuadro 17.1 se exponen las
dimensiones de estas tres estructuras de DNA .
C- T
I \
A C
\ /
G- C
C- G
T-A
A-T
T- A
-------ATATCGACTCCGATAT------- A- T
----~) ~
1 1 1 1 1 11 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
-------TATAGCTGAGGCTATA------- --~\ ,---
T-A
A- T
T- A
A-T
G-C
C- G
I \
T G
'G_ A)
El empaquetamiento de las grandes moléculas de DNA para colocarlas dentro de
las células requiere un superenrollamiento. Para que éste se produzca, una sola ca-
dena del dúplex de DNA debe mellarse y luego sobregirarse o relajarse antes de que
el hueco se vuelva a tapar. (Una "mella" es un cOlte en una sola cadena del DNA de
doble hélice.) Los cambios pequeños de la forma del DNA dependen de la secuencia.
Por ejemplo, cuatro pares AT secuenciales producen una curvatura en la molécula.
Sin embargo, el doblamiento o el enrollamiento significativo alrededor de proteínas
asociadas requiere un superenrollamiento.
Cromosomas y cromatina
El DNA, que contiene los genes (las unidades de la herencia) , está empaquetado
en estructuras que se denominan cromosomas. Al principio el término cromosoma
sólo se refería a las estructuras densas que se teñían de tono oscuro, observables en
17.1 DNA 643
FIGURA 17 . 14
IXl~~~~ -
del DNA
(b)
FIGURA 17 . 1 5
Superenrollamientos
(a) (b)
el interior de las células eucariotas durante la meiosis o la mitosis. Sin embargo, este
término se utiliza también en la actualidad para describir a las moléculas de DNA de
las células procariotas. La estructura física y la organización genética de los cromo-
somas procariotas y eucariota'i son muy diferentes .
644 [:;APíTULO DIE[:;ISIETE Ácidosnucleicos
Girasa
+
ATP
(a) DNA relajado (b) DNA superenrollado laxo (e) DNA tensionado laxo
FIGURA 17 . 16
Efecto de la tensión sobre una molécula circular de DNA
Cuando una molécula de ONA con superenrollamiento negativo es forzada a yacer en un plano , se reintroduce la tensión aliviada por la formación
del superenrollamie nto negativo. La rotura y la nueva formación de los enlaces fo sfodi éster permiten la conversión de una forma circular rel ajada
(a) en la form a superenrollada negativamente (b). El alivio de la ten sión que produce el proceso de superenrollamiento se reintroduce cuando la
molécul a laxa se fuerza a descan sar en un plano (e) .
+ + +
H3N-CH2-CH2-CH2-CH2-NH2-CH2-CH2-CH2-NH3
Espermidina
+ + + +
H3N-CH2-CH2-CH2-NH2-CH2-CH2-CH2-CH2-NH2-CH2-CH2-CH2-NH3
Espermina
Cuando las poliaminas con carga positiva se unen al esqueleto del DNA cargado ne-
gativamente evitan la repulsión de cargas entre las espirales adyacentes de DNA.
17.1 DNA 645
FIGURA 17 . 17
Cromosoma de E. coli
•
EUCARIOTAS En comparación con las prckariotas, las eucariotas poseen geno-
mas que son extraordinariamente grandes. Dependiendo de las especies, los cromo-
somas de las eucariotas varían en longitud y en número. Por ejemplo, el ser humano
tiene 23 pares de cromosomas con un total de cerca de 3000 millones de bp. La
mosca de la fruta Drosophila melanogaster tiene cuatro pares de cromosomas con
180 millones de bp, y el maíz (Zea mays) tiene 10 pares de cromosomas con un total
..• ti..,e
de 6600 millones de bp. e.... 8
Cada cromosoma eucariótico consta de una sola molécula lineal de DNA que for-
ma un complejo con histonas para originar las nucleohistonas. Se emplea el término
cromatina para describir el complejo formado por DNA e histonas. También se unen
FIGURA 17. 18
a la cromatina varios tipos de proteínas que no son histonas. Algunos ejemplos son
las enzimas que participan en la replicación y en la reparación del DNA, y una gran Micrografía electrónica de cromatina
cantidad de factores de transcripción de diferentes tipos. Una muestra de cromatina extendida para la
Las histonas son un grupo de proteínas básicas pequeñas que se encuentran en micrografía electrónica. Nótese la estructura
todos los organismos eucariotas. La unión de las histonas al DNA da lugar a la for- de "cuentas en un collar" de este material que
mación de nucleosomas, que son las unidades estructurales de los cromosomas eu- contiene DNA.
cariotas. Las histonas, que son de cinco clases principales (Hl, H2A, H2B , H3 Y
H4), tienen estructuras primarias semejantes entre las especies eucariotas. En las
micrografías electrónicas, la cromatina tiene aspecto de cuentas. Cada una de estas
"cuentas" es un nucleosoma, que está formado por un segmento de DNA superen-
rollado que forma un rizado toroidal alrededor de un núcleo de ocho histonas (dos
copias de cada una de las histonas H2A, H2B , H3 Y H4.
Cada una de las histonas centrales altamente conservadas (Fig. 17.9a) contiene
una característica estructural en común llamada pliegue de histona: tres hélices a
separadas por dos segmentos cortos no estructurados. Las colas terminales N de las
histonas centrales constan de unos 25 a 40 residuos de aminoácidos que sobresalen
de los nucleosomas. Varios tipos de modificaciones covalentes de los residuos de la
cola (p. ej ., acetilación y metilación) cambian las propiedades estructurales y fun- COMPAN10N
cionales de las histonas, que a su vez modifican la accesibilidad del DNA a factores
de transcripción. Tales cambios reciben el nombre de modificaciones epigenéticas. 9N. Visítese el sitio de Internet
de apoyo en www.ouo.comlus/mckee.
El núcleo de histona se forma cuando dos conjuntos de H2A y H2B constituyen dos
para consultar el recuadro Bioquímica
heterodímeros de cabeza a cola y las histonas H3 y las H4 forman dos juegos de he- en perspectiva titulado Epigenética y
terodímeros de cabeza a cola. A continuación los heterodímeros H3·H4 se unen para epigenoma: herencia genética más allá de
formar un tetrámero H3 2o H4 2 (Fig. 17.19b). El ensamblaje del nucleosoma comienza las secuencias de bases de DNA.
646 CAPÍTULO DIECISIETE Ácidos nucleicos
H2B N ==========~L :~ C
(a)
(b)
(e)
FIGURA 17 . 19
Histonas centrales
Cada nucleosoma contiene ocho histonas: dos de cada una de H2A , H2B , H3 Y H4. Cada una de estas
moléculas contiene un dominio globular llamado pliegue de histona y un largo dominio terminal N
no estructurado. (a) Estos dominios se ilustran como moléculas lineales con cilindros que representan
hélices 0. . (b) La formación del núcleo de histonas comienza con la unión de H2A y de H2B , para crear
un dímero, y dos moléculas de H3 y dos de H4 se combinan para formar un tetrámero. El tetrámero
H3 2·H4 2 se une entonces al DNA. La estructura del nucleosoma se completa (c) cuando dos dímeros
H2A·H2B se unen al tetrámero,
17.1 DNA 647
cuando el tetrámero H3 2 ·H42 se une al DNA. Cuando los dos dímeros H2A·H2B se
unen al tetrámero, el ensamblaje del nucleosoma está completo (Fig. 17.19c). Una
molécula de histona Hl se une al nucleosoma en el punto en que el DNA entra y sale,
y actúa como una pinza que impide el desenroUamiento del nucleosoma (Fig. 17.20).
Alrededor de 145 bp están en contacto con cada octámero de histonas. Un tramo
adicional de 60 bp de DNA de enlace conecta nucleosomas adyacentes.
H1 unida
F I GURA 17 . 20
Histona HI
cromosoma
Fibra condensada
(30 nm de diámetro)
DNAde
enlace
I
Nucleosoma (11 nm de diámetro)
L
~Ii~ig~.
CONCEPTOS CLAVE
Compárense las características estructurales que diferencian al DNA B del DNA A
• Cada cromosoma procariota consta de una y del DNA Z. ¿Qué se sabe sobre las propiedades funcionales de estas variantes del
molécula circular de DNA superenrolla- DNA B, la estructura de Watson-Crick?
do que forma un complejo con un núcleo
proteínico .
• Cada cromosoma eucariota consta de una
so la molécula de DNA lineal que forma
complejos con las histonas para formar una
nucleohistona. ¿Cuáles son los componentes proteínicos más importantes de los cromosomas de las
células procariotas y de las eucariotas? ¿Cuáles son sus funciones?
Descríbanse las pruebas que utilizaron James Watson y Francis Crick para construir
su modelo de la estructura del DNA.
171 DNA 649
pm~ ~UBID
l l ¡¡;m i i
[J~~ A"I, !JI
i 11
~ g~ ~D i ~ Dl !fJ!)Q 1 ~ I f!;» i
i
O 10 20 30 40 50
O 10 20 30 40 50 FIGURA 17. 23
30
I'I "'!., · I~'
40
i ;~!liM¡
50
Comparación de segmentos de 50 kb de los
genomas de algunos organismos eucariotas
con el genoma del procaI"iota E. coli
FIGURA 17 . 24
Única Genoma humano
o'",~
_~,ú~ ,~,e"
Otras
La mayoría de las secuencias de DNA del
geno ma humano no codifican productos
~·~e
'" ... regiones DNA génicos. Cerca del 62% de estas secuencias
15% ... intergénicas: intergénico: 62% son DNA intergénico, que a su vez puede
dividirse en repeticiones entremezcladas
(96%) ampliamente en el genoma, microsatélites y
Secuencias
relacionadas
0:.,30%7 / otras regiones intergénicas. En el ser humano,
38% de las secuenc ias son genes y otras
, ' secuenc ias re lacionadas, de las cuales só lo 4%
, "
(Fragmentos génicos \, / codifican productos génicos. Las secuenc ias
y seudogenes) re lac ionadas con genes representan el resto.
Genes y
secuencias Repeticiones en
relacionadas: todo el genoma
38%
MÉTODOS BIOQuíMICOS
Métodos de investigación
de los ácidos nucleicos
as técnicas que se utilizan para el aislamiento, la purificación de cromatografía (p. ej ., intercambio iónico, filtración en geles y
1.44
1.40
. \" ;', ~ ~ E
e
1.36
• ~ ~ ~.illJL.
O 1.32
q,/., <D
~ ..
C\J
~ 1.28
al
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""'
I I~I I ,' I ' \ ~II " ;, ro
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~ 1.20
al
)\~J J '0
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al
1.16
.o 1.12
O
CIl
.o 1.08
«
1.04
25 31 37 43 49 55 61 67 73 79 85 91
ONA renaturalizado Temperatura (oC)
FIGURA 178
Desnaturalización del DNA
FIGURA 17C
Patrón de la secuencia de DNA del genoma del ratón
FIGURA 170
~ -- Molécula de DNA
Hibridación de Southern
_____ Fragmentos
\ \ \ \\ \ \ \ separados
por tamaño
\\ \ \
, , ,\
'b=====_=~
Filtro de Bandas de DNA Gel que
nitrocelulosa contiene las
/ \ / bandas de DNA
Gel ----\..---'~-
::::::::-:::.:::::::::=:-:'=:::::::::::::::::-::::::::::-::::::, Filtro de
nitrocelulosa
'----------------'~ Material
Flujo del absorbente
amortiguador
Filtro de
• • • • Transferencia de
los fragmentos al filtro
\
nitrocelulosa - -
con los fragmentos \\ ,
en las mismas
posiciones que en , \\ \ \
el gel
" " \ "\ • • • •
Hibridación con sondas
radiactivas de DNA,
lavado yautorradiografía
\
, , - - - - - Autorradiografía que muestra los
\ fragmentos híbridos de DNA
656 CAPíTULO DIECISIETE Ácidosnucleicos
5'
3'
•
GAATTC
111111111111111 1 11 1 11111111111
CTTAAG
•
GAATTC
CTTAAG
3'
5'
entre ellas. Las velocidades de reasociación han pro-
porcionado información valiosa sobre la estructura del
genoma. Por ejemplo, los organismos varían en el nú-
mero y en los tipos de secuencias únicas que contiene
t
Corte
t
Corte
su genoma. (Una secuencia singular sólo sucede una
vez por genoma haploide.) El número relativo de se-
cuencias únicas y repetidas puede determinarse cons-
truyendo una curva Cot, que proporciona una medida
de renaturalización (donde Ca es la concentración de
ssDNA en moles/litro y t es el tiempo transcurrido en
segundos). Los científicos han determinado a partir de
5' - - - - G AATTC G AATTC - - - - 3' curvas Cal que la velocidad de reasociación desciende
111 al hacerse los genomas mayores y más complejos. En
1111111I 1 1 1 1 11111111 I II I f 11 1 1111111
G - - - - CTTAA
la Figura 17C se presenta la frecuencia de secuencias
3' - - - - CTTAA G - - - - 5'
de DNA únicas y repetidas, que se determina al medir
las velocidades de reasociación del genoma del ratón.
La hibridación también puede utilizarse para situar
FIGURA 17E y/o identificar genes específicos u otras secuencias
Enzimas de restricción de DNA. Por ejemplo, se puede estudiar el ssDNA de
Las endonucleasas de restricción son enzimas aisladas de bacterias que cortan el dos procedencias diferentes (p. ej., células tumorales
DNA en secuencias específicas. En este ejemplo, la enzima EcoRI (que se obtiene y células normales) para comprobar diferencias de se-
de E. coli) hace cortes escalonados que dan lugar a la formación de "extremos cuencia. Si se biotinila un conjunto de ssDNA, después
adherentes". Un "extremo adherente" es un extremo de cadena individual de un los híbridos de doble cadena se unen a una columna
fragmento de DNA bicatenario. Los extremos adherentes facilitan la formación de de avidina. Si hay alguna secuencia sin hibridar, ésta
DNA recombinante porque un segmento monocatenario de un fragmento de DNA
puede hibridarse con un extremo adherente complementario de otro fragmento de
DNA. Algunas enzimas de restricción hacen lo que se denomina "cortes romos".
Véase una exposición del DNA recombinante en el recuadro Métodos bioquímicos
del Capítulo 18 titulado Genómica, págs. 700 a 707.) --'-'~_--'-". Cebador
Polimerasa de DNA I I marcado
+ 4 dNTPs +
geno entre los pares GC y AT Y las interacciones de apilamiento
de las bases afectan la estabilidad del DNA. (Véase la pág. 632.)
1
ddATP
I
ddTTP
I
ddCTP
I
ddGTP
Por lo tanto, para "fundir" las moléculas de DNA con un conteni- ~ ~ ~ ~
do elevado de G y C se requiere más energía.] Si las cadenas de
T
DNA separadas se mantienen a una temperatura aproximadamen- T
te 25°C por debajo de la T rn durante un tiempo prolongado, la re- A
naturalización es posible. La renaturalización, o reasociación, no G
ocurre de manera instantánea debido a que las cadenas exploran A
C
varias configuraciones hasta que alcanzan la más estable (i.e., en
C
la que se aparean las regiones complementarias). C
La fusión del DNA es muy útil en la hibridación de los ácidos G
nucleicos. Las moléculas de DNA de cadena individual de dife- A
Gel de T
rentes procedencias se asocian ("hibridan") si hay una homología acrilamida A
significativa de secuencia (i.e., semejanzas estructurales). Si una A
muestra de DNA se fracciona en trozos pequeños uniformes, la G
C
C
C
FIGURA 17F
G
Método de terminación de cadena de Sanger C
A
Se elige un cebador específico de forma que la síntesis de DNA
comience en el punto de interés. La síntesi s de DNA continúa hasta que
Secuencia
/
se incorpora un didesox inucl eótido radiactivo y se termina la cadena. A de DNA de la
continuac ión se separan mediante electroforesis en gel los productos de cadena original
las reacciones y se analizan a través de autorradiografía. Los fragmentos
migran según el tamaño. La secuencia se determina ·'Ieyendo" el gel.
17.1 DNA 657
GCG ACA T CAC T CCA GC TTG AA GCA GTT C TT C TCGT C TT C TGTTTTGT C T AAC TTGT C TT CC TT C TT C T C TT CC TGTTT AA G AA GAG AA
500 510 520 530 540 550 560 570 580
FIGURA 17G
Secuenciación automática del DNA
Utilizando marcadores fluorescentes en los didesoxinucleótidos , un detector puede explorar un gel con rapidez y determinar la secuencia a partir del
orden de los colores de las bandas .
•
658 CAPíTU LO DI EC I SIETE Ácidos nuc[eicos
BIOQuíMICA EN PERSPECTIVA
Investigaciones forenses
¿Cómo se utiliza el análisis de DNA en la in-
vestigación de crímenes violentos? El DNA per- reciente que analiza
siste durante muchos años en muestras biológicas deshidratadas repeticiones cortas en
(p. ej. , sangre, saliva, pelo y semen) y en los huesos. Por consi- tándem (STR) (secuencias
guiente, el DNA puede utilizarse como prueba en cualquier tipo de DNA con repeticiones de
de investigación forense en la que se disponga de esas muestras. entre 2 y 4 bp, que se denominan
Las técnicas de análisis de DNA que se utilizan de forma habitual microsatélites, véase la pág. 652) tiene un poder de discrimina-
para verificar la identidad de las víctimas y/o de los autores de ción mucho mayor que los RFLP y es rápida en términos relativos
crímenes violentos se denominan tipificación de DNA , o perfil (varias horas).
de DNA. La tipificación de DNA requiere el análisis de varias se- Además, las secuencias STR son lo suficientemente robustas
cuencias muy variables que se denominan marcadores. Utilizan- para que esta técnica pueda utilizarse con éxito a fin de analizar
do conjuntos de secuencias variables, los investigadores pueden muestras degradadas. Después de que se ha extraído el DNA de
proporcionar perfiles genéticos identificativos únicos para cada una muestra, varias secuencias STR diana se amplifican por me-
ser humano. dio de la PCR y se unen a moléculas de colorante fluorescente .
Desde la década de 1990, en numerosos casos judiciales la En Estados Unidos se emplean 13 marcadores de DNA poli-
tipificación de DNA ha proporcionado información decisiva mórficos (muy diversos) centrales para generar perfiles genéticos
acerca de la presencia o ausencia de un acusado en el lugar de un y lograr distinguir individuos. El perfil de DNA, que se produce
crimen. Las técnicas de las que se dispone varían en su capacidad cuando se separan los productos de la PCR en un gel electroforé-
para diferenciar personas y en la velocidad con la que pueden tico, es el patrón y el número de repeticiones de cada secuencia
obtenerse los resultados. La identificación genética, que intro- diana sobre el gel. La detección por fluorescencia incrementa la
dujo en 1985 el genetista británico Alec Jeffreys, es una variante sensibilidad de la técnica. A diferencia de los RFLP, las técnicas
de la hibridación de Southern. En esta técnica, se comparan las de tipificación de DNA que se basan en las STR pueden auto-
características de las bandas de los minisatélites de DNA (véase matizarse con facilidad . Si se comparan los perfiles de DNA de
la pág. 652) de diferentes personas; por ejemplo, muestras de ejemplares individuales y se determina que son idénticos, se dice
DNA del lugar del delito con las de los sospechosos (Fig. 17H). que las muestras son compatibles . Si los perfiles de DNA que
Cuando la cantidad de DNA que se extrae de la muestra del lugar
del delito es demasiado pequeña para poder analizarla, se ampli-
fica por medio de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR),
una técnica usada para amplificar el número de copias de DNA
de una muestra diminuta. Es posible obtener hasta 109 copias.
(Véase la pág. 703.) Por consiguiente, el DNA de una sola célula
es suficiente para realizar un análisis de identificación genética.
Se aísla el genoma completo de cada muestra y se trata con una
enzima de restricción. (Las enzimas de restricción son un gru-
po de enzimas producidas por bacterias que cortan moléculas de
DNA en sitios específicos de la secuencia de bases. En células
bacterianas , impiden o " restringen" la replicación de DNA exter-
no, por lo común vírico.)
Debido a las variaciones genéticas . las secuencias minisatéli-
te de DNA se fragmentan de forma diferente. (Estas diferencias
genéticas se denominan polimorfismos de la longitud de los
fragmentos de restricción, o RFLP.) Tras separar los fragmen-
tos de restricción según su tamaño, por medio de electroforesis
en gel de agarosa, y transferirlos a papel filtrante de nitroce lu-
losa, se exponen a so ndas marcadas radiactivamente. Debido a
que los tamaños de los fragmentos que se unen a estas sondas se
diferencian de una perso na a otra, se han utilizado con éxito los FIGURA 17H
patrones de bandas para condenar o absolver a sospechosos de Manejo forense de la identificación genética
casos criminales.
En muchos juicios. el análisis de los RFLP (polimorfismos de la long itud
Aunque los análisis de RFLP son un método exacto, tienen de los fragmentos de restricción) de muestras biológicas recuperadas
limitaciones. Entre ellas se encuentran las cantidades susta nciales en e l lugar de un delito proporciona una prueba concluyente de que un
de tiempo (6 a 8 semanas), el trabajo y la experiencia que se re- acusado (o un convicto) dejó o no rastros de su DNA úni co en la escena
quieren para obtener los perfiles de DNA. Una metodología más de un crimen.
17.2 RNA 659
PERSPECTIVA cont
se comparan no son idénticos, se dice que proceden de orígenes de interés, como el dejado en el lugar del crimen). La utilización
diferentes . Los resultados se dan en términos de probabilidades de de varios marcadores y la sensibilidad de la metodología reducen
una compatibilidad aleatoria (la probabilidad de que una persona la probabilidad de compatibilidad aleatoria hasta al menos uno en
elegida al azar tenga un perfil de DNA idéntico al de la muestra varios miles de millones.
RESUMEN : Los científicos forenses utilizan una técnica llam ada PCR para
amplificar el ONA recuperado del sitio de un crimen y generar el perfil genético único que
distingue a un individuo de todos los demás.
17.2 RNA
Durante muchos años se consideró que los ácidos ribonucleicos eran una clase de
polinucleótidos que participaban en algún aspecto de la síntesis de proteínas. Sin
embargo, una serie de pruebas que se acumulan con rapidez revelaron que los RNA
son moléculas sorprendentemente versátiles que realizan funciones que antes se pen-
saba que eran competencia exclusiva de proteinas. Son ejemplos la regulación de la
expresión génica, la diferenciación celular, la impronta genómica y la catálisis. Las
propiedades funcionales de los RNA se deben a su estructura. La estructura primaria
de los polilTibonucleótidos es similar a la de sus contrapartes de DNA, pero existen
varias diferencias.
1. El azúcar del RNA es ribosa en lugar de la desoxirribosa del DNA. La presen-
cia del grupo 2' -OH de la ribosa hace al RNA más reactivo que el DNA.
2. Las bases nitrogenadas del RNA se diferencian en cierta medida de las que
se observan en el DNA. En lugar de timina, las moléculas de RNA utilizan A = púrpura
Ul·acilo. Además, las bases de algunas moléculas de RNA son modificadas por C = rojo
Horquilla G = verde
diversas enzimas (p. ej ., metilasas, tiolasas y desaminasas). U = amarillo
3. A diferencia de la doble hélice del DNA, el RNA es monocatenario. Por esta
razón, el RNA puede enrollarse sobre sí mismo y formar estructuras tridi-
mensionales singulares y con frecuencia bastante complejas (Fig. 17.26). La
forma de estas estructuras la determina el apareamiento de bases complemen-
tarias de secuencias específicas de RNA, así como el apilamiento de bases
y las interacciones que ocurren entre regiones de doble cadena (formadas a
partir de regiones monocatenarias de la misma molécula o entre regiones mo-
nocatenarias de moléculas vecinas) y lazos de RNA libres. En las regiones Cadena
de doble cadena se aplican las reglas del apareamiento de bases, donde se individual
Lazo axial
unen A-U, G-U y G-c. Las regiones de RNA en lazo o de cadena individual
(ssRNA) contienen varias bases modificadas en las moléculas de RNA ma-
duro no mensajero. La composición de bases del RNA no sigue las reglas de (b)
(a)
Chargaff, porque las moléculas de RNA son monocatenarias.
4. Las moléculas de RNA tienen propiedades catalíticas debido a que pueden
FIGURA 17 . 26
formar estructuras tridimensionales complejas con hendiduras de unión . La
Estl"Uctura secundaria del RNA
mayoría de las moléculas de RNA catalítico, que se conocen como ribozimas,
catalizan autoesci sión o la rotura de otros RNA. Sin embargo, el ejemplo más (a) En las molécul as de RNA se producen
notable de actividad de ribozima es la formación de enlaces peptídicos dentro muchos tipos diferentes de estructuras
de los ribosomas. Suele requerirse un ion magnesio como cofactor para la secundarias. (b) Lazo ax ial. Obsérvese que
las horquillas y los lazos axiales de RNA se
catálisis por RNA, porque el Mg2+ estabiliza los estados de transición .
forman a causa de las sec uencias repetitivas
Los clases más destacadas de RNA son el RNA de transferencia, el RNA ribo- invertidas de los palíndromos de DNA (véase
somal y el RNA mensajero . A continuación se consideran la estructura y la función la pág. 641).
660 CA p íTU LO DIE C I SIETE Ácidos nucleicos
RNA de transferencia
Las moléculas de RNA de transferencia (tRNA) transportan los aminoácidos a los
ribosomas para su ensamblaje en las proteínas. Representan alrededor del 15% del
RNA celular y la longitud promedio de una molécula de tRNA es de 75 nucleótidos.
Debido a que cada una de estas moléculas se une a un aminoácido específico, las
células poseen al menos una clase de tRNA para cada uno de los 20 aminoácidos
estándar. La estructura tridimensional de las moléculas de tRNA, que se asemeja a
una hoja de trébol alabeada (Fig. 17.27), es consecuencia en primera instancia de un
gran apareamiento de bases intracatenario. Las moléculas de tRNA contienen diver-
sas bases modificadas. Entre ellas se encuentran la seudouridina, la 4-tiouridina, la
l-metilguanosina y la dihidrouridina:
o
~0N-H
~;lN~O
I
Ribosa Ribosa Ribosa Ribosa
Seudouridina 4-Tiouridina 1-Metilguanosina Dihidrouridina
La estructura del tRNA le permite realizar dos funciones esenciales en las que inter-
vienen el extremo 3' y el lazo anticodón. El extremo 3' forma un enlace covalente
(a)
0- Brazo variable
~'- Tallo anticodón
FIGURA 17 .27
RNA de transferencia Py
\
(a) Estructura tridimensional de una molécula
de tRNA. (b) Representación esquemática
de una molécula de tRNA. Se indican las
posiciones de las bases que no varían y de las (b)
'--v----'
bases que varían con poca frecuencia. Anticodón
17.2 RNA 661
con un aminoácido específico. (Esta especificidad es posible gracias a que las en-
zimas llamadas sintetasas de aminoacil-tRNA unen cada aminoácido con su tRNA
correspondiente.) El lazo anticodón contiene una secuencia de tres pares de bases
que es complementaria con un triplete de bases del DNA que codifica un aminoácido
específico. La relación conformacional entre el extremo 3' Y el lazo anticodón per-
mite al tRNA alinear de manera correcta el aminoácido que porta durante la síntesis
proteínica. (Véase el Capítulo 19.) Los tRNA también poseen otras tres características
estructurales notables, denominadas lazo D, lazo T\jiC, y lazo variable. (La letra griega
psi, \ji, representa la seudouridina, una base modificada.) Estas estructuras facilitan la
unión específica a la sintetasa de aminoacil-tRNA apropiada y el alineamiento correc-
to del aminoacil-tRNA dentro del andamiaje nucleoproteínico del ribosoma. El lazo D
se conoce así porque contiene dihidrouridina. De modo similar, el lazo T\jiC contiene
la secuencia de bases timina, seudouridina y citosina. Los tRNA pueden clasificarse
con base en la longitud de su lazo variable. La mayOlía (cerca del 80%) de los tRNA
tienen lazos variables con 4 o 5 nucleótidos, mientras que otros tienen lazos variables
de hasta 20 nucleótidos.
RNA ribosomal
El RNA ribosomal (rRNA) es la forma más abundante de RNA en las células. (En la
mayoría de las células, el rRNA constituye aproximadamente el 80% del RNA total.)
La estructura secundaria del rRNA es muy compleja (Fig. 17.28). Aunque existen
diferencias entre las especies en las secuencias primarias de nucleótidos del rRNA,
la estructura tridimensional global de esta clase de moléculas está conservada. Como
sugiere su nombre, el rRNA es un componente de los ribosomas.
Como se ha descrito, los ribosomas son complejos ribonucleoproteínicos citoplás-
micos que sintetizan las proteínas. Los ribosomas de las células procariotas y de las
eucariotas tienen una forma y función semejantes, aunque se diferencian en tamaño
y composición química. Ambos tipos de ribosomas constan de dos subunidades de
tamaño desigual , que en general se denominan en términos de sus valores de S.
(S es una abreviatura de la unidad de Svedberg [o de sedimentación], que es una me-
dida de la velocidad de sedimentación en una centrífuga. Debido a que la velocidad
de sedimentación depende del peso molecular y de la forma de una partícula, los
valores de S no son necesariamente aditivos.) Los ribosomas procariotas (70 S) están
formados por una subunidad 50 S Y una subunidad 30 S, mientras que los ribosomas
eucariotas (80 S) contienen una subunidad 60 S y una subunidad 40 S.
En cada tipo de subunidad ribosomal se encuentran varias clases diferentes de
rRNA y de proteínas. La subunidad ribosomal grande de E. coli, por ejemplo, con-
tiene rRNA 5 S y 23 S y 34 polipéptidos. La subunidad ribosomal pequeña de E.
coli contiene un rRNA 16 S Y 21 polipéptidos. U na subunidad ribosomal eucariota
grande típica contiene tres rRNA (5 S, 5.8 S y 28 S) Y 49 polipéptidos; la subunidad
pequeña contiene un rRNA 18 S y alrededor de 30 polipéptidos. El rRNA sirve como
un andamiaje para el autoensamble de proteínas para formar la subunidad ribosomal
nativa y al parecer tiene funciones enzimáticas, en especial en las procariotas. (El
rRNA desnudo puede realizar con lentitud la función ribosomal nonnal.)
RNA mensajero
Como su nombre sugiere, el RNA mensajero (mRNA) es el transportador de la infor-
mación genética desde el DNA para la síntesis de proteínas. Las moléculas de mRNA,
que constituyen cerca del 5% del RNA celular, varían considerablemente de tamaño.
Por ejemplo, el número de bases del mRNA de E. coli varía de 500 a 6000.
El mRNA procariota y el eucariota se diferencian en varios aspectos. En primer
lugar, muchos mRNA procariotas son policistrónicos, es decir, contienen informa-
ción que codifica varias cadenas polipeptídicas. Por el contrario, el mRNA eucariota
codifica un solo polipéptido y por lo tanto se denomina monocistrónico. (Un cistrón
es una secuencia de DNA que contiene la información que codifica un polipéptido
y varias señales que se requieren para la función del ribosoma.) En segundo lugar,
los mRNA procariotas y los eucariotas se procesan de forma diferente. Al contrario
662 CAPíTULO DIECISIETE Ácidosnucleicos
FIGURA 17 .28
Estructura del rRNA
que los mRNA procariotas, que se traducen en proteínas por medio de los ribosomas
mientras que se sintetizan o inmediatamente después, los mRNA eucariotas se mo-
difican en gran medida. Estas modificaciones incluyen la formación de un casquete
(la unión de una 7-metilguanosina al residuo terminal S' ), el corte y empalme (la .
eliminación de los intrones) y la unión de un polímero de adenilato que se denomina
cola de poli (A). (En el Capítulo 18 se describen cada uno de estos procesos.)
RNA no codificador
Como ya se mencionó, el conjunto total de transcritos de RNA producidos por
una célula se denomina transcriptoma. El análisis de transcriptomas ha revelado una
cantidad muy grande de RNA no codificadores (nc) funcionales. El conocimiento
actual, aunque incompleto, sugiere que los ncRNA forman una extensa y compleja
red reguladora. Entre los ncRNA más importantes están el microRNA, el RNA corto
interferente y el RNA nucleolar corto. Los microRNA (miRNA) y los RNA cortos
interferentes (siRNA) son de los ncRNA más pequeños y ambos intervienen en un
proceso de degradación de RNA llamado interferencia del RNA (RNAi). La RNAi,
alguna vez llamada silenciamiento del RNA, probablemente surgió como un meca-
nismo de defensa. Se emplea para desactivar o degradar moléculas de RNA con dos
fines: (1) regular la expresión génica en procesos de desarrollo mediante desactiva-
ción de genes seleccionados y (2) proteger células contra genomas de RNA vírico.
Los RNA nucleolares cortos (snoRNA) son RNA monocatenarios que contienen
de 70 a 1000 nucleótidos; facilitan modificaciones químicas del rRNA dentro del
nucléolo. Codificados dentro de los intrones de los genes de rRNA, los snoRNA son
un componente de la ribonucleoproteína nucleolar pequeña (snoRNP) . La función de
los snoRNA (más de 100 en el ser humano) es guiar la snoRNP por medio de aparea-
miento de bases hacia el sitio de secuencia específico en un rRNA diana. Las modifi-
caciones que OCUlTen durante el procesamiento del rRNA incluyen la metilación del
2/-0H de la ribosa y la isomerización de uridina para formar seudouridina.
"),~
"O-~
OH OH
Uridina Seudouridina
17.3 Virus 663
Hay cinco RNA nucleares cortos (snRNA): Ul, U2, U4, U5 y U6. Constituidos por
100 a 300 nucleótidos, los snRNA se combinan con varias proteínas para formar ribo- CONCEPTOS CLAVE
nucleoproteínas nucleares pequeñas (snRNP o "snurps"). Junto con otras proteínas, las • El RNA es un ácido nucleico que participa en
snRNP constituyen una máquina molecular llamada empalmosoma debido a su fun- varios aspectos de la síntesis de proteínas y
ción: el corte y empalme es un paso clave en el procesamiento de los mRNA eucariotas. en el control de la expresión génica.
Los empalmosomas escinden intrones del pre-mRNA y luego unen los exones. • Las clases más abundantes de RNA son el
RNA de transferencia, el RNA ribosomal y
el RNA mensajero.
• Algunos RNA no codificadores de importan-
Cuando se transcribe un gen, sólo una cadena de DNA actúa como molde para la cia son el miRNA, el siRNA, el snoRNA y
el snRNA .
síntesis de la molécula de RNA. Esta cadena se denomina antisentido (o no codifi-
cadora); la cadena de DNA que no se transcribe se denomina cadena con sentido (o
codificadora). La secuencia de bases de la cadena codificadora es la versión de DNA
del mRNA que se utiliza para sintetizar el producto polipeptídico del gen. El RNA
antisentido (el transcrito de la cadena de DNA antisentido) participa en la regulación
de la transcripción y de la traducción . Un RNA antisentido puede unirse específica-
mente a un mRNA correspondiente e impedir la traducción.
Debido a que la unión mRNA-RNA antisentido es tan específica, las moléculas
no codificadoras se consideran herramientas de investigación prometedoras. Nume-
rosos investigadores están utilizando las moléculas de RNA antisentido para estudiar
la función eucariota activando y desactivando de forma selectiva genes específicos.
La denominada genética inversa es también útil en la investigación médica. Aunque
se han encontrado problemas serios en la investigación de elementos antisentido (p.
ej., la inserción ineficaz de los oligonucleótidos dentro de las células y los elevados
costos de fabricación), la tecnología antisentido ha proporcionado ya un conocimien-
to valioso de los mecani smos de varias enfeQlledades (p. ej., cáncer e infecciones
víricas).
Considerando la siguiente secuencia de DNA con sentido:
SI -GCATICGAATIGCAGACTCCTGCAATICGGCAAT-3 I
17.3 VIRUS
Los virus carecen de la mayoría de las propiedades que diferencian a lo vivo de lo
muerto. Por ejemplo, los virus no pueden realizar sus propias actividades metabó-
licas. Sin embargo, en condiciones adecuadas pueden causar estragos en los seres
vivos. Los virus, que a menudo se describen como parásitos intracelulares obligados,
también pueden considerarse como elementos genéticos móviles debido a su estruc-
tura, es decir, cada uno de ellos consta de un trozo de ácido nucleico encerrado dentro
de una cubierta protectora. Una vez que un virus ha infectado una célula hospedado-
ra, su ácido nucleico puede secuestrar al de la célula y a su maquinaria de síntesis de
proteínas. Al acumularse los componentes del virus , se producen nuevas partícul as
víricas completas que luego libera la célula hospedadora. En muchas circunstancias,
se produce tal cantidad de virus que la célula hospedadora se lisa (se rompe). Por otra
parte, el ácido nucleico del virus puede insertarse en un cromosoma del hospedador,
lo que da lugar a la transformación de la célula, como se expone en el recuadro Bio-
química en perspectiva titulado "Modos de vida" víricos (págs. 665 a 670).
Los virus han fascinado a los bioquímicos desde que se sospechó su existencia
a finales del siglo XIX. Impulsada en gran medida por la actuación de los virus en
numerosas enfermedades, la investigación vírica ha beneficiado en gran medida a la
bioquímica. Debido a que los virus subvierten la función celular normal para produ-
cir nuevos virus, una infección vírica puede proporcionar una visión única del meta-
bolismo celular. Por ejemplo, la infección de las células animales ha proporcionado
664 CAPÍTULO DIECISIETE Ácidosnucleicos
~
piloma induce la formación de papilomas, un tipo de verruga). En los últimos años,
los científicos han tratado de crear un sistema de clasificación sistemático basado
principalmente en la estructura vírica, aunque otros factores son también importantes
(p. ej. , el hospedador y la enfermedad que producen).
¿
Los virus se presentan en un conjunto desconcertante de tamaños y formas. Los
(d) & viriones (partículas víricas completas) tienen un diámetro que oscila entre 10 y
-400 nm . Aunque la mayoría de los virus son demasiado pequeños para poder verse
con el microscopio óptico, unos pocos (p. ej., los poxvirus) pueden verse debido a
que son tan grandes como las bacterias más pequeñas.
Los viriones simples están formados por una cápside (una cubierta proteínica
construida por moléculas proteínicas entrelazadas denominadas capsómeros), que
(e) encierra al ácido nucleico. (El término nucleocápside suele utilizarse para describir
el complejo formado por la cápside y el ácido nucleico.) La mayoría de las cápsides
son helicoidales o icosaédricas (estructuras de 20 lados formadas por capsómeros
triangulares). El ácido nucleico componente de los viriones es DNA o RNA. Aunque
(1)
la mayoría de los virus poseen DNA de bicatenario (dsDNA) o RNA de cadena in-
dividual (ssRNA) , se han observado algunos genomas con DNA de cadena sencilla
FIGURA 17 . 29
(ssDNA) y RNA dúplex (dsRNA). Existen dos clases de genomas ssRNA. Un geno-
ma de RNA de sentido positivo [( + )ssRNA] actúa como un rnRNA gigante, es decir,
Virus representativos
dirige la síntesis de un largo polipéptido que se rompe y se procesa en moléculas más
(a) Poxv irus. (b) Rabdovirus. (e) Virus de la pequeñas. Un genoma de RNA de sentido negativo [( - )ssRNA] es complementario
parotiditi s. (d) Baeteriófago de col a flexible. de la secuencia de bases que dirige la síntesis de las proteínas del virus. Los vims
(e) Viru s del herpes. (f) Virus del papiloma.
que utilizan genomas (- )ssRNA deben proporcionar una enzima, que se denomina
transcriptasa inversa, que sintetiza el rnRNA.
_CO
-,--N
_C_E_P_TO
-,--S
- ,--
Cl_A_V_E_ _ & =_:::;;;,
En los virus más complejos, la nucleocápside está rodeada por una cubierta mem-
branosa, que en general procede de la membrana plasmática o nuclear de la célula
hospedadora. Las proteínas de la cubierta, que codifica el genoma del virus, se in-
• Los virus están formados por un ácido nu-
c\eieo encerrado en una cubierta protectora. sertan en la cubierta membranosa durante el ensamblaje del virión. Las proteínas
El ácido nuc\eico puede ser DNA o RNA de que sobresalen de la superficie de la cubierta, que se denominan espículas, se cree que
cadena individual o de doble cadena. participan en la unión del virus a la célula hospedadora. En la Figura 17.29 se presen-
• En los virus sencillos la cubierta protectora, tan algunos vims representativos.
que se denomina eápside, está formada por
proteínas.
• En los viru s más compl ejos la nueleocápsi-
de, formada por ácido nuc\eico y prote ínas,
está rodeada por una cubierta membranosa
la
que procede de la ¡mem.brflpa d!; célula '
hospedadora. ., .
17.3 Virus 66 5
BIOQuíMICA EN PERSPECTIVA
"Modos de vida" víricos
¿Cómo infectan y dañan los virus a las células
hospedadoras? A pesar de la diversidad de las estructuras Bacteriófago T4
de los virus y de las clases de células hospedadoras que infectan, en
el ciclo vital de todos los virus hay varios pasos básicos: infección El bacteriófago T4 (Fig.
(penetración del virión o de su ácido nucleico en la célula hospe- 171) es un virus grande con
dadora), replicación (expresión del genoma del virus), maduración una cabeza icosaédrica y un a
(ensamblaje de los componentes del virus en los viriones) y libe- cola larga y compleja semejante a la estructura del T2 (pág. 638).
ración (emisión de los nuevos viriones por la célula hospedadora). La cabeza contiene dsDNA y la cola se engancha a la célula hos-
, Cada clase de virus debe ex plotar alguna de las reacciones metabó- pedadora e inyecta el DNA viral.
licas normales de sus células hospedadoras para completar el ciclo El ciclo vital del T4 (fig. · 17J) comienza con la adsorción del
vital debido a que los virus normalmente sólo poseen la informa- ~irión a la superficie de una célula de E. coli. Debido a que la pa-
1 ción genética suficiente para especificar la síntesis de sus propios red de la célula bacteriana es rígida, el virión completo no puede
componentes. Por esta razón , existen numerosas variaciones sobre penetrar en el interior y en su lugar se inyecta el DNA flexionando '
; estos pasos básicos. Este punto puede demostrarse comparando los y encogiendo el aparato de la cola. Una vez que ha entrado el
ciclos vitales de dos virus muy estudiados: el bacteriófago T4 y el DNA en la célula, el proceso infeccioso se completa y comienza
,1 virus de la inmunodeficiencia humana (VIH). la fase siguiente (replicación).
Fibras de la cola
CITOPLASMA
(a) (b)
FIGURA 171
Bacteriófago T4
(a) Estructura de un bucteriófago T4 intacto. (b) Penetración de la pared celular del hospedador por un bacteriófago e inyección del DNA vírico
(vDNA ). El vDNA dirige la síntes is. por parte de la célula hospedadora. de unas 30 proteínas que facilitan la producción de nuevos viriones.
666 CAPíTULO DIECISIETE Ácidos nucleicos
FIGURA 17.1
Ciclo vital del bacteriófago T4
Fase
lisogénica( '"
Fase \ .
lítica ~
)
17.3 Virus 667
A los 2 minutos de la inyección del DNA del fago T4 en una célula como un profago, se replica cada vez que la célula sintetiza DNA.
de E. eoli, se detiene la síntesis de DNA, de RNA y de proteínas y Los transcritos de mRNA que se producen cuando se transcribe el
comienza la producción del mRNA del fago. El mRNA del fago codi- genoma del virus dirigen la síntesis de numerosas copias de sus
fica la síntesis de proteínas de la cápside y parte de las enzimas que se proteínas. Los nuevos virus, que se crean como copias del geno-
requieren para la replicación del genoma del virus y para el ensamblaje ma de RNA del virus, se empaquetan con proteínas del virus y se
de los componentes del virión. Además, se sintetizan otras enzimas liberan de la célula hospedadora por un proceso de "gemación".
que debilitan la pared celular de la célula hospedadora, de forma que El VIH contiene un núcleo cilíndrico dentro de su cápside.
puedan liberarse nuevos fagos para nuevas rondas de infección. Cerca Además de dos copias de su genoma (+ )-ssRNA, el núcleo con-
de 22 minutos después de ser inyectado el DNA vírico (vDNA), la tiene varias enzimas: transcriptasa inversa, ribonucleasa, integrasa
célula hospedadora (llena de varios centenares de nuevos viriones) se y proteasa. Las moléculas de RNA están recubiertas con varias
lisa. Tras la liberación, los virioncs se enganchan a bacterias cercanas, copias de dos proteínas de bajo peso molecular, p7 y p9. (Los nú-
iniciando de esta fOlma nuevas infecciones. meros en los nombres de éstas y otras proteínas indican su masa
El bacteriófago que inicia este denominado ciclo lítico se de- en kilodaltones; por ejemplo, p7 es una proteína con un a masa de
nomina virulento debido a que destruye sus células hospedado- 7ld).) El propio núcleo COI) forma de bala está formado por cente-
ras. Sin embargo, muchos fagos no destruyen en principio a sus núes de copias de p6 y las copias de p 17 forman un recubrimiento
hospedadores. Los denominados fagos temperados o lisogénicos interno de la cubierta del virus. La envoltura del VIH contiene dos
integran su genoma en el de la célula hospedadora. (El término proteínas víricas importantes, gp120 y gp41, además de proteínas
lisogenia describe una condición en la que el genoma del fago del hospedador.
se integra en el cromosoma del hospedador.) El genoma del virus La infección por el VIH se produce debido a la exposición di-
integrado (que se denomina profago) se copia junto con el DNA recta del tOlTente sanguíneo de una persona a los líquidos corpora-
del hospedador durante la división cel ul ar un tiempo indefinido. les de una persona infectada. La mayoría de los casos de infección
En ocasiones, los fagos lisogénicos pueden entrar en una fase por VIH se deben a contacto sexual, transfusiones sanguíneas y
lítica. Determinadas condiciones externas, como la luz UV o la transmisión perinatal de la madre al hijo. Una vez que el VIH ha
radiación ionizan te, activan al profago, el cual dirige la síntesis de entrado en el cuerpo, se cree que infecta a las células que portan el
nuevos viriones. Algunas veces, una célula bacter-iana que se lisa antígeno CD4 en sus membranas plasmáticas. El grupo principal
libera unos pocos viriones que contienen parte del DNA bacteria- de células que ataca el VIH son los linfocitos T-4 colaboradores
no junto con el DNA del fago. Cuando un virión así infecta una del sistema inmunitario. Esas células desempeñan una fUIlción
nueva célula hospedadora, este DNA se introduce en el genoma esencial en la regu lación de las actividades de otras células del sis-
del hospedador. Este proceso se denomina transducción. tema inmunitario. Ahora se sabe que la infección de las células T
requiere la interacción del complejo gp120-CD4 con un receptor
VIH de quimiocinas, que actúa como correceptor. (Los agentes qui-
El virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) es el agente cau- miotácticos del sistema inmunitario, llamados quimiocinas, es-
sal del síndrome de inmunodeficiencia adquirida (sida). Si no se tim ul an la unión de las células T al unirse a receptores locali zados
trata, el sida es una enfermedad mortal debido a que el VIH des- sobre la membrana plasmática de las células T.) En las primeras
truye el sistema inmunitario del cuerpo, dejándolo sin defensas fases de la infección, el cOITeceptor CCR5 (o menos a menudo el
frente a organismos patógenos (p. ej. , bacterias, protozoos, hon- CXCR4) ayuda al VIH a entrar en las cél ul as; otras células que
gos y otros virus) y a algunas formas de cáncer. se sabe son infectadas por el VIH son ciertas células intestinales
El VIH (Fig. 17K) pertenece a un grupo singular de virus RNA y del sistema nervioso central. Pruebas recientes sugieren que los
denominados retrovirus. Los retrovirus se denominan así debido seres humanos con dos copias de un gen que codifica una variante
a que contienen una actividad enzimática que se denomina trans- del receptor CCR5, CCR5-6.32, son resistentes a la infección por
criptasa inversa, la cual sintetiza una copia de DNA a partir de un el VIH. Al parecer e l CCR5-6.32 también protege contra la peste
genoma ssRNA. Un retrovirus típico consta de un genoma RNA y la viruela, pero aún conside rando las tres enfermedades, la parte
encemldo en una cápside proteínica. Enrollada alrededor de la de la población que se beneficia es relativamente pequeña.
cápside se encuentra una cubierta membranosa que se forma a Una vez que la proteína gp 120 de la cubierta del VIH se une al
partir de la bicapa lipídica de la célula hospedadora. antígeno CD4 y al receptor de quimiocinas en la célula T, la cu-
En el ciclo reproductor del retrovirus VIH (Fig . 17L), el pro- bierta del virus se fusiona con la membrana plasmática de la célula
ceso infeccioso comienza cuando e l virus se une a una célula hospedadora. Las dos cadenas de RNA se liberan al citoplasma. La
hospedadora. La unión, que tiene lugar entre la superficie g lu- transcriptasa inversa, un heterodímero con varias actividades enzi-
coproteínica del virus y los receptores específicos de la membra- máti cas, catali za a continuación la síntesis de un ssDNA utilizando
na plasmática, inicia un proceso de fusión entre la membrana de como molde el vRNA. La activ idad RNasa heterodimérica degrada
la célula hospedadora y la membrana del virus. A continuación, posteriormente el vRNA (RNA vira l). La misma proteína produce
la cápside del virus se libera dentro del citoplasma y la transcrip- un vDNA bicatenario mediante la formac ión de una cadena com-
tasa inversa del virus cataliza la síntesis de una cadena de DNA que plementaria del ssDNA. La integrasa del virus integra e l vDNA en
es complementaria del RNA del virus. Esta actividad enzimática el cromosoma de la célula hospedadora. El DNA provírico perma-
cataliza también la conversión del DNA de cadena individual en nece latente hasta que la célu la T infectada específica se activa por
una molécula bicatenaria. La vers ión del DNA dúplex del genoma una respuesta inmunitaria. El DNA provírico puede a continuación
vírico se traslada después al núcleo, donde se integra en el cromo- dirigir la síntesis de componentes del virus por parte de la célula.
soma de l hospedador. El genoma provírico integrado, que actúa Los virus recién sintetizados brotan de la célula infectada.
668 CAPíTULO DIECISIETE Ác idosnucleicos
HLA de
gp41 - - - - - - - - - = clase I
p6
p17
p24
Proteasa
Lípido
RNA
RT
FIGURA 17K
Estructura del VIH
La superficie del virus es una bicapa lipídica en la que están embebidas las glucoproteínas víricas gp 120 Y gp41 Y las proteínas
de membrana HLA (antígenos leucocitarios humanos) que se han cogido de las células hospedadoras. (Las proteínas HLA
son señales que protegen la partícula vírica del sistema inmunitario. que en general busca y destruye los invasores extraños.)
Recubriendo el interior de la cubierta hay centenares de copias de la proteína estructural p17. Dos copias del genoma de RNA
están contenidas dentro de una cápside con forma de bala formada por p6 y p24. Unidas al RNA están p7 y p9. Las enzimas
asociadas con el genoma del virus son la transcriptasa inversa (RT), la integrasa y la proteasa.
Las investigaciones recientes que utilizan chips con matrices La muerte celular se desencadena por varios mecanismos, en-
microscópicas de DNA (véase el recuadro Métodos bioquímicos tre los que se encuentran los siguientes:
titulado Genómica en el Cap. 18, págs. 700 a 707) han proporcio-
1. La activación vírica de los genes que inducen la apopto-
nado algunos de los detalles sobre los mecanismos moleculares
sis (muerte celular programada), un mecanismo celular
por medio de los cuales el VIH deteriora el funcionamiento de
normal mediante el cual las células responden a señales
los linfocitos T-4. Controlando la expresión del mRNA de más
externas como las que ocun'en durante los procesos del
de 6000 genes de manera sim ultánea, los investigadores han ras-
desarrollo.
treado las consecuencias de la infección por el VIH. Han observado
que a los 30 minutos de la infección, se suprime la expresión de 2. El brote simultáneo de numerosas partículas víricas de la
alrededor de 500 genes celulares y 200 se han activado. En horas, membrana celular puede desganar la membrana y producir
el mRNA de la célula hospedadora se ha sustituido en gran me- fugas masivas que no pueden repararse.
dida por mRNA del virus. El virus ha inutilizado la capacidad de
la célula para generar energía y reparar el daño del DNA que ha
causado el virus.
17.3 Virus 66 9
FIGURA 17L
Ciclo reproductor del VIH, un retrovirus
Tras unirse la partícula del virus a los receptores de superficie sobre la célula hospedadora (a), su cubierta se funde con la membrana
plasmática de la célula (b) , liberando así la cápside y su contenido [(vRNA) y varias enzimas del virus] al citoplasma (e). La enzima
del virus transcriptasa inversa cataliza la síntesis de una cadena de DNA complementaria del vRNA (d) y luego procede a formar una
segunda cadena de DNA que es complementaria de la primera. A continuación, el DNA bicatenario del virus (vDNA) se transfiere al
núcleo, donde se integra a sí mismo en un cromosoma del hospedador con la ayuda de la integrasa vírica (e). El provirus (el genoma
vírico integrado) se replica cada vez que la célula sintetiza un nuevo DNA. La transcripción del DNA del virus da lugar a la formación
de dos copias de transcritos de RNA: moléculas de RNA que actúan como el genoma vírico (f) y moléculas que codifican la síntesis de
proteínas del virus (p. ej. , transcriptasa inversa, proteínas de la cápside, proteínas de la cubierta e integrasa del virus) (g). Las moléculas
proteínicas se combinan con el genoma de vRNA durante la creación de nuevos virus (h) que brotan de la superficie de la célula
hospedadora (i) y luego proceden a infectar a otras células (j).
670 CAPíTULO DIECISIETE Ácidosnucleicos
Compárese esta ilustración con la original del dogma central (pág. 629). Descríbanse
las implicaciones de cada componente de estas figuras.
Lecturas recomendadas 67 1
Lecturas recomendadas
Beck, s., and Olek, A. (eds.), The Epigenome: Molecular Hide and Brown , T. A., GellOl71eS 3. Garland, New York, 2007.
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6 7 2 CAP í TULO DI E C I S I ETE Ácidosnucleicos
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Palabras clave
agente intercalador, 635 epigenético, 645 min isatélites, 652 ribozima, 659
agente no a[qui lante, 635 empalmosomas, 663 mutación por transición, 633 RNA cortos interferentes, 662
alquilación, 634 exón,650 mutación por transversión, 634 RNA de transferencia, 660
análogos de [as bases, 634 expresión génica, 629 mutaciones puntuales, 633
RNA mensajero, 661
apoptosis, 668 eucromatina, 648 nucleohistonas, 645
RNA no codificador, 662
biología molecular, 626 genes, 626 nucleosomas, 645
RNA nuclear corto, 663
cadena antisentido, 663 genética, 626 operón, 650
RNA nucleo[ar corto, 662
cadena con sentido, 663 genoma,627 perfil de DNA, 658
polimorfismo de la longitud de RNA ribosomal, 661
centró meros, 651 heterocromatina, 648
los fragmen tos de restricción, secuencias intergénicas, 650
ciclo lítico, 667 hibridación, 656
658
cistrón,661 hibridac ión de Southern, 657 SINE, 652
profago, 667
cromatina, 645 hidroxiapatita, 653 telómeros, 65 1
proteoma, 629
cromosoma, 642 huellas de DNA, 658 tipificación de DNA, 658
reglas de Chargaff, 639
desnaturalización, 654 identificación genética, 658 traducción, 629
repetición entremezclada en todo
DNAA,640 intrón, 650 el genoma, 652 transcripción, 627
DNA B, 640 LINE, 652 repeticiones en tándem, 651 transcriptoma,627
DNA satélite, 651 lisogenia, 667 repeticiones cortas en tándem, 658
transcrito, 627
DNA Z, 640 metaboloma, 629 replicación, 627
transducción, 667
efecto hipocrómico, 654 método de term inación de cade- retro posones, 652
na, 657 transposición, 652
elemento genético móv il , 652 retrovirus, 667
microRNA, 662 transposó n, 652
elementos transponibles del DNA, ribonucleoproteína nuclear pe-
652 microsatélites. 652 queña, 663 transposo nes de RNA, 652
Preguntas de revisión
Estas preguntas están disei'iadas para poner a prueba el conocimiento del lector sobre los conceptos clave expuestos en este capítulo,
antes de pasar al siguiente. El lector puede comparar sus respuestas con las soluciones que se proporcionan al fina l del libro yen la Guía
de estudio de apoyo, si así lo desea.
3. Descríbase la estructura de orden superior del DNA que se 18. Proporciónese la cadena complementaria y el RNA de trans-
denomina superenrollamiento. cripción que se produce a partir del siguiente segmento de
4. Defínanse los siguientes términos: DNA:
-a. reglas de Chargaff 5' -AGGGGCCGTTATCGTT- 3'
b. efecto hipocrómico 19. Defínanse los siguientes términos:
c. transposón a. transcriptoma
d. familia Alu b. RNA no codificador
e. tran scriptoma c. RNA corto nucleolar
5. Escríbanse tres propiedades biológicas facilitadas por el super- d. microsatélite
enrollamiento. e. RNA corto interferente
6. Menciónense tres diferencias entre el DNA de las eucari otas y 20. ¿Qué son las poliaminas y cuál es su función e n la estructura
el de las procariotas. deIDNA?
7. Descríbase la estructu ra de un nucleosoma. 21. Defínanse los siguiente s términos :
8. Defínanse los siguientes términos: a. cadeña consentido
a. DNA satélite b. efecto hipocrómico
b. corte y empalme c. transposición
c. método de terminación de la cadena d. transcrito
d. desnaturali zac ión del DNA e. elemento genético móvi{
e. retroposón 22. Descríbanse las características estructurales que estabil izan las
~Descríbanse las diferencias estructurales entre el RNA y el moléculas de RNA.
DNA. 23 . ¿Cómo se retienen los patrones de metilación del DNA de una
10. ¿Cuáles son las tres formas más com unes del RNA? ¿Qué generación celular a la siguiente? Véase el recuadro Bioquí-
funciones tienen en la célula? mica e n perspectiva disponible en línea sobre epigenética y el
11. El DNA Z recibe su nombre de la conformación en zig-zag epigenoma.
de los grupos fosfato. ¿Qué características de la molécula de 24. ¿Qué causaría más daño a una célula: un error en la replica-
DNA permiten que se forme esta estructura distintiva? ción del DNA o un error en su transcripción?
12. Existe un par de bases cada 0 .33 nm de DNA y la longitud 25. Cuando un hidrocarburo aromático se intercala entre dos pares
total del DNA de una cél ula humana es de 2 m. Calcúlese el de bases api ladas, ¿qué efecto es posible en la estructura del
número de pares de bases de una sola célula. Suponiendo que DNA?
en el cuerpo humano hay 10 14 células, calcúlese la longitud 26. ¿Qué efectos pueden tener las moléculas de hidrocarburos
total del DNA. Compárese esta distancia con la que existe intercaladas e n la replicación del DNA?
entre la Tierra y el Sol ( 1.5 X 108 km). 27. La AZT se usa en el tratamiento del sida. Examínese su es-
13. Defínanse los siguientes términos: tructura y sugiérase su mecanismo de acción.
- a. telómero
b. minisatélite
c. perfil de DNA
d. intrón
e. exón
14. Una muestra de DNA contiene 2 1% de adeni na. ¿Cuál es su
composición porcentual de bases?
15. La temperatura de fusión de una molécula de DNA incremen-
ta al aumentar el contenido de bases Gc. ¿Por qué?
16. Defínanse los siguientes términos:
a. transversión
b. e pigenética
c. agente intercalador
d. UNE AZT
e. SINE
J 2.--.?rganícense los términos siguientes de forma jerárquica:
a. cromosoma 28. Las reglas de Chargaff se aplican al DNA, pero no al RNA.
b. gen ¿Por qué?
c. nucleosoma 29. ¿Cómo y por qué se modifican las bases del tRNA?
d. par de bases nucleotídicas 30. ¿Cómo afecta el agua la estructura del DNA?
674 CAPíTULO DIECISIETE Ácidosnucleicos
31. En condiciones fisiológicas , el DNA se encuentra en forma de de sus genes. Durante este proceso, varios cientos de genes
DNA B. Sin embargo, las horquillas de RNA y los híbridos mitocondriales se transfirieron al genoma nuclear. Sin embar-
DNA-RNA adoptan la estructura de DNA A. Considerando las go, las mitocondrias ret iene n un genoma con la capacidad de
diferencias estructurales cntre el DNA y el RNA, explíquese producir varias proteínas de transporte de electrones. Revísese
este fenómeno. el transporte electrón ico mitocondrial y sugiérase una razón
32. ¿Qué características estructurales de l DNA producen la for- por la cual estos organelos generadores de energía retuvieron
mación de los surcos mayor y menor? los genes que producen este conjunto de moléculas.
33. Explíquese en términos generales cómo participan las poli- 45. J2!1rante el proceso infeccioso, los virus pueden incorporar
aminas en la consec ución de una estructura muy comprim ida segmentos del genoma del hospedador en sus estructuras.
del DNA. Explíq uese el modo en que este fenómeno puede contribuir a
34. Al co ntrario de la doble hélice del DNA, el RNA se encuentra la aparición de nuevas enfermedades o exacerbar patologías
como una cadena individual. ¿Qué efectos tiene esto sobre la existentes.
estructura del RNA? 46. Se ha calculado que cada grupo fosfato del DNA B puede
35. Jerome Vinograd encontró que el DNA circular de un polio- formar enlaces de hidrógeno con seis moléculas de agua.
mavirus se separa en dos bandas diferentes cuando se centrifu- Esbócese un diagrama de un en lace fosfodiéster de DNA con
ga. Una banda consta de DNA superenrollado y la otra de sus moléculas de agua unidas.
DNA laxo. ¿Cómo podría identificarse cada banda? 47. Los agentes alquilantes son compuestos que reaccionan con
36. El 5-bromouracilo es un análogo de la timina que normalmen- grupos hidro xi lo y amino para formar moléculas alquiladas.
te se aparea con la aden ina. Sin embargo, el 5-bromouracilo a Por ejemplo:
menudo se aparea con la guanina. ¿Por qué?
37. El flujo de información genética va del DNA al RNA y a las
proteínas. En determinados virus, el flujo de información va
del RNA al DNA. ¿Es posible que dicho flujo de información
comience desde las proteínas? ¿Por qué?
38. El VIH es un retrovirus. Sugiéranse razones por las que la
producción de una vacuna para evitar la infección por el VIH
es tan difícil de conseguir.
39._ Se desea aislar DNA mitocondrial sin rastros de DNA nuclear.
¿Cómo se realizaría esta tarea? Citosina N-Metilaminocitosina
40. A diferencia del DNA de en lace y del DNA desproteinizado,
los segmentos de DNA enro llados en los núcleos de histonas Cuando un individuo se expone accidentalmente a estas
son relativamente resistentes a las acc iones hidrolíticas de las sustancias, diversos sistemas fisiológicos son afectados a
nucleasas. ¿Por qué? través de alteraciones del genoma. No es raro que una de las
41. El conjunto de moléculas de mRNA presente dentro de una consecuencias sea cáncer (prol iferación celular descontrolada
célula cambia con el tiempo. Explíquese la causa. a causa del daño genómico) cuando ocurre una serie de tales
42. El DNA y el RNA son moléculas con gran cantidad de infor- exposiciones. Aplicando los conocimientos adquiridos sobre
mación. Explíquense la significancia y las implicaciones de el genoma, sugiérase en términos generales cómo podría
esta afimlación. producirse cáncer.
43. Se ha resuelto finalmente el caso de un asesinato de un niño 48. ~os gemelos idénticos comienzan la vida con genomas y
de 10 años en un pequeño poblado gracias a los esfuerzos de - - epigenomas idénticos. ¿Cómo cambian éstos con la edad?
un detective que aprovechó una nueva base de datos estatal de Sugiérase el modo en que podrían usarse tales cambios como
DNA que contiene muestras de DNA de criminales condena- un recurso forense. [Sugerencia: Consúltese el recuadro Bio-
dos. Explíqllese cómo se resolvió este caso, comenzando co n química en perspectiva disponib le en línea sobre epigenética y
la llegada de una unidad de peritos forenses al lugar del asesi- el epigenoma, cO'Tespondiente a este capítulo.]
nato. ¿Qué avances tecnológicos hicieron posible la resolución 49. Se ha sugerido que el DNA de restos fósiles podría extraerse,
del caso? clonarse y emplearse para revivir especies extintas. Coménte-
44. Algunos organismos se encuentran bajo considerable presión se sobre la factibilidad de esta idea.
para aligerar sus genomas a fin de operar de manera más 50. El fluorouracilo es un análogo estructural de la timina. El flúor
eficiente. Como resultado, las mitocondrias de las eucariotas promueve la enolización. ¿Cómo se utiliza este efecto en el
han perdido en mayor o menor grado la abrumadora mayoría tratamiento del cáncer?