Categoría taxonómica

TAXONOMÍA Y CRECIMIENTO BACTERIANO

La taxonomía es la ciencia de la clasificación y está constituida por dos subdisciplinas: la

identificación y la nomenclatura.
Siguiendo el sistema binomial de nomenclatura, a todos los organismos (incluidas las
bacterias) se les asigna un nombre de género y otro de especie. Los nombres de
especies y géneros son derivados griegos o latinos de alguna propiedad descriptiva
apropiada a la especie en cuestión, y se escriben en cursiva. Una particularidad en
taxonomía microbiana es el concepto de cepa que, en general, no se utiliza en
organismos superiores. Debido a que los microorganismos se dividen por fusión binaria,
una cepa es una población genéticamente idéntica obtenida a partir de una sola célula.
Cuando se aísla un nuevo organismo debe publicarse la descripción y el nombre
propuesto en la publicación oficial de registro para la taxonomía y clasificación de los
microorganismos: International Journal of Systematic Bacteriology (IJSB), y depositarse
en una colección de cultivos aprobada por la World Intellectual Property Organization
(WIPO). Los microorganismos depositados se conservan congelados o liofilizados y
constituyen la “cepa tipo” de la nueva especie. El IJSB publica periódicamente la lista de
nuevos nombres aprobados en el “Manual Bergey´s”, uno de los principales tratados de
taxonomía de los procariotas que está permanentemente actualizado (on line). Este
manual es un componente de información clásica y molecular sobre todas las especies
reconocidas de procariotas y contiene claves dicotómicas que son útiles para la
identificación.

Los taxones o grupos en que se clasifican los seres vivos se estructuran en una jerarquía
de inclusión, en la que un grupo abarca a otros menores y está, a su vez, subordinado a
uno mayor. A los grupos se les asigna un rango taxonómico o categoría
taxonómica que acompaña al nombre propio del grupo. Algunos ejemplos conocidos
son: género Homo, familia Canidae (cánidos), orden Primates, clase Mammalia (mamífe
ros), reino Fungi(hongos).
También son rangos los de especie y sus subordinados. El nombre de las especies se
distingue de los de taxones de otros rangos por consistir en dos palabras indisociables.
 CATEGORÍAS TAXONÓMICAS

 Dominio, la categoría que separa a los seres vivos por sus características
celulares. Por esta razón, existen dos sistemas de dominios: el más antiguo
(Prokaryota y Eukaryota), y el más reciente (Archaea, Bacteria y Eukarya).

 Reino: esta categoría divide a los seres vivos por su naturaleza en

común. Archaea y Bacteria son tanto reinos como dominios, por
ser unicelulares, procariontes y diferenciarse en otras características bioquímicas y
biofísicas. El dominio de Eukaryota se divide a su vez en cuatro
reinos: Protista (organismos unicelulares y eucariontes como
las células), Fungi(organismos heterótrofos como hongos y
levaduras), Plantae (organismos autótrofos sin locomoción)
y Animalia (organismos heterótrofos y locomotores)
 Filo o división :(fuera de la zoología), la categoría que agrupa a los seres vivos por
su mismo sistema de organización. Ejemplo: en el reino animal, los bivalvos,
los gasterópodos y los cefalópodos tienen el mismo tipo
de tejidos, reproducción, órganos y sistemas, por lo tanto se agrupan en el
filo Mollusca.

 Clase. Los filos (o divisiones) se dividen en clases por las características más
comunes que hay entre ellos, es decir, por las semejanzas mayores que existan
entre los integrantes de un filo. En el filo Mollusca, por ejemplo, hay miles de
moluscos y algunos de ellos, por ausencia de concha, se agrupan en la
clase Aplacophora.

 Orden. También ésta es una división de la categoría anterior; el orden es una división
de la clase que también se basa en características comunes de algunos seres
vivos dentro de una clase. Dentro de la clase Mammalia, por ejemplo, se encuentra
el orden Primates, que contiene a todos los seres vivos con cinco dedos, un patrón
dental común y una primitiva adaptación corporal.
 Familia es una división de la categoría precedente. Una familia es la agrupación
de seres vivos con características comunes dentro de su orden. Ejemplo: el
orden Primatesincluye la familia Hominidae, que comprende a los primates bípedos.

 Género. Es la categoría taxonómica que agrupa a las especies relacionadas entre

sí por medio de la evolución. De la familia Hominidae, por ejemplo, el
género Homocomprende a Homo sapiens y sus antecesores más próximos.

 Especie. Es la categoría básica. Es usada para referirse a un grupo de individuos

que cuentan con las mismas características permitiendo la descendencia fértil
entre ellos. Ejemplo: un ser humano actual (Homo sapiens) puede relacionarse con
otro humano de sexo opuesto y reproducirse, teniendo descendencia fértil.

CATEGORÍAS SUBORDINADAS

La necesidad de pormenorizar la clasificación obligó a establecer categorías

intermedias que se forman, sobre todo, añadiendo prefijos a las existentes. Los prefijos
en uso son super-, sub- e infra-. Es necesario subrayar que algunas de las que se
deducen de esta regla no se usan en absoluto; en particular, supergénero, que es
sustituido por la tribu, y superespecie, que en botánica es sustituida por grex. También
hay casos comunes de subgénero, subespecie, variedad y raza, y no tan comunes,
como subtribu.
Aquí, en esta tabla, está el ejemplo de la especie Homo sapiens, explicando el por qué se
agrupan en diversas categorías.
¿Qué
Categoría Ejemplo Explicación
agrupa?
El dominio
agrupa a los
El dominio Eukaryota agrupa a todos los
seres vivos
organismos cuyas células
Dominio por sus Eukarya
poseen núcleodiferenciado y orgánulos de
característic
doble membrana (p. ej. mitocondrias).1
as
celulares.
Los
"subdominio
s" agrupan
a los
Este "subdominio" agrupa a aquellos
Subdomin miembros
Unikonta organismos eucariotas derivados de un
io de un
antepasado común unicelular con un solo cilio.1
dominio por
diferenciars
e de los
otros.
El "Infradominio" que agrupa a aquellos unicontos
Infradomi
"infradomini Opisthokonta derivados de un antepasado común unicelular
nio
o" agrupa a con el cilio orientado hacia atrás. Incluye
 los organismos tanto unicelulares como
miembros multicelulares: hongos y animales.1
de los
"subdominio
s" por otros
detalles
importantes.
El reino
agrupa a los Agrupa a organismos multicelulares de células
seres vivos eucariotas sin pared celular ni cloroplastos, que
Reino Animalia
por su pueden organizarse en tejidos y
naturaleza con reproducción sexual.2
en común.
El subreino
agrupa
también a
los A este subreino pertenecen todos los animales
miembros que cuentan con tejidos diferenciados, boca,
Subreino Eumetazoa
de un reino cavidad digestiva permanente, nervios, órganos
por sensoriales y músculos.3
característic
as
comúnes.
El
"infrarreino"
divide a los Este "infrarreino" agrupa a los animales
miembros con simetría bilateral y un eje antero-posterior,
de un tracto digestivo con boca y
Infrarreino Bilateria
subreino por ano, mesodermo (tercera capa
las embrionaria), cerebro más o menos
característic diferenciado o complejo y órganos excretores.4
as en
común.
El superfilo Este superfilo agrupa a los animales en los que
agrupa a Deuterostomi se forma el ano a partir
Superfilo
varios filos a del blastoporoembrionario.5 Es un grupo con
en uno solo. patrones corporales muy diversos.6
El filo junta
a todos los
seres vivos Son animales que presentan, al menos en
con el algún momento del desarrollo
Filo Chordata
mismo embrionario, notocorda, tubo neural hueco en
sistema de posición dorsal, hendiduras branquiales y cola.7
organizació
n.
El subfilo
Son aquellos cordados que
reúne a los
Subfilo Vertebrata poseen endoesqueleto segmentado, cartilagino
integrantes
so u óseo, cubriendo la médula espinal.7
del filo por
 característic
as
comunes.
El infrafilo
también
divide a los
integrantes
de la
categoría Gnathostoma Son aquellos vertebrados con mandíbulas
Infrafilo
anterior; ta articuladas.7
agrupa a los
integrantes
de un
subfilo en
un infrafilo.
Son gnatóstomos con cuatro extremidades
La tipo quiridio, formadas cada una por tres
superclase regiones.8 Incluye a aquellos taxones en los
Superclas
es un Tetrapoda que las extremidades están atrofiadas o
e
conjunto de perdidas secundariamente en su línea evolutiva
clases. (como en ballenas o serpientes). No debe
confundirse con el cuadrupedismo.
La clase
agrupa a los Tetrápodos de temperatura constante, poseen
seres vivos pelo en mayor o menor medida, en el cerebro
con han desarrollado el neocortex, las hembras
Clase Mammalia
semejanzas cuentan con glándulas mamariasque producen
entre sí que leche para alimentar a sus crías, tienen
hay dentro la mandíbula formada por un único hueso.9
de un filo.
La subclase
Los terios son aquellos mamíferos en los que el
es una
Subclase Theria embrión se desarrolla en el interior del cuerpo
división de
materno.
la clase.
La
infraclase
es un grupo
inferior de
miembros Los placentarios son los mamíferos terios
de una vivíparos, cuyo embrión es retenido en el
Infraclase Placentalia
subclase, interior del cuerpo materno para su
que cuentan alimentación primaria hasta el parto.
con las
mismas
característic
as.
El Los
Magnorde
magnorden placentarios -
n
es un no se dividen
 conjunto de en
superórden magnórdenes
es. .
El
superorden
comúnment
e es un
conjunto de
"granórdene
s".
ATENCIÓN:
En este caso, el superorden Euarchontoglires
Cuando la
es un conjunto de órdenes, no de granórdenes.
clasificación
Por su estilo de vida de trepar plantas, se
es más
agrupa en este superorden a: roedores,
Superorde pequeña y Euarchontogli
lagomorfos, "musarañas de árbol" (Treeshrew,
n se usan las res
en inglés), colugos y primates. Se incluye
categorías
también al primate humano porque también
más simples
tiene un estilo de vida en medio de la flora
(superorden
(mundo vegetal).
, orden,
suborden e
infraorden),
el
superorden
es un
conjunto de
órdenes.
El
Euarchontogli
granorden
Granorde res no se
es un grupo -
n dividen en
de
granórdenes.
mirórdenes.
Primates y las órdenes de animales simiescos
adaptados para trepar árboles (En realidad,
El mirorden
Euarchonta no es considerado un mirorden
Mirorden es un grupo Euarchonta
pero tampoco un granorden. Es un clado, pero
de órdenes.
si contiene a un orden hablaríamos
técnicamente de un mirorden).
El orden es
una
agrupación
de
individuos
Los primates son aquellos mamíferos que
Orden de una Primates
tienen cinco dedos.
clase que
tienen
característic
as comunes
entre sí.
 El suborden
es una
división del
orden, Los haplorrinos son los primates que carecen
Suborden también por Haplorrhini de membranas y vibrisas en la nariz o el
característic hocico.
as comunes
de sus
miembros.
El
infraorden
Los monos y los simios, incluyendo al ser
es también
Infraorden Simiiformes humano, que tradicionalmente se conocen
es una
como "monos del Nuevo y Viejo Mundo".
división del
suborden.
El
parvorden
Monos con hocico más o menos recto y los
Parvorden divide a las Catarrhini
orificios nasales dirigidos hacia el frente.
infraórdenes
.
Superfami Un conjunto Los hominoideos son aquellas familias de
Hominoidea
lia de familias. primates que no poseen rabo.
La familia,
como antes
dicho, es la
agrupación
de seres
vivos que se Los homínidos son los primates capaces de
Familia Hominidae
encuentran caminar en dos patas.
en un
orden, por
característic
as comunes
entre ellos.
La
Subfamili subfamilia Los homíninos son los primates (con capacidad
Homininae
a divide a la bípeda) con forma antropomórfica.
familia.
La tribu es
una
agrupación Los homininis son los primates, con capacidad
Tribu de Hominini bípeda y forma antropomórfica, que caminan
individuos erguidos.
de una
subfamilia.
Las Los primates homininos son aquellos con
Subtribu subtribus Hominina locomoción únicamente bípeda y postura
proviene de erguida.
 una tribu,
por
característic
as
comunes,
también.
De las
familias
provienen
los géneros,
El género Homo, que significa "hombre" en
conjuntos
Género Homo latín, es el género que enmarca al ser humano
de especies
actual y todos sus ancestros.
relacionada
s entre sí
por la
evolución.
En las
especies de
un género,
algunas
pueden Homo no se
Subgéner
agruparse divide en -
o
entre sí por subgéneros.
característic
as comunes
de orden
menor.
Una especie
es un grupo
de
individuos
con las
mismas
característic Homo
Especie Comprende a todos los humanos actuales.
as, que sapiens
permiten
relacionarse
entre sí y
tener
descendenc
ia.
Las
Homo sapiens idaltu es una subespecie extinta,
subespecies
que contenía las mismas características de los
son
Subespeci Homo humanos actuales pero se diferenciaba por sus
divisiones
e sapiens idaltu rasgos parecidos a los de nuestros ancestros.
de una
A esto último se debe su nombre, que significa
especie por
"hombre sabio viejo (o anciano)".
característic
 as
comunes.

NOMENCLATURA SEGÚN LA CATEGORÍA TAXONÓMICA

La nomenclatura establece una terminología que permite saber, a partir del sufijo de un
taxón cualquiera, cuál es su categoría taxonómica y dar cuenta de su posición en la
jerarquía sistemática. La siguiente tabla muestra esa nomenclatura:

Categoría Planta Alga Hongo Bacteria Animal

taxonómica \ Reino Plantae Protista Fungi Bacteria Animalia

División o Filo -phyta -mycota

Subfilo -phytina -mycotina

Clase -opsida -phyceae -mycetes

Subclase -idae -phycidae -mycetidae

Superorden -anae

Orden -ales

Suborden -ineae

Infraorden -aria

Superfamilia -acea -oidea

Familia -aceae -idae

Subfamilia -oideae -inae

Tribu -eae, ae -eae -ini

Subtribu -inae -ina

-us, -a, -um, -is, -os, -ina, -ium, -ides, -ella, -ula, -aster, -cola, -
Género
ensis, -oides, -opsis…
Por debajo de la categoría de género, todos los nombres de taxones son llamados
"combinaciones". La mayoría reciben también una terminación latina más o menos
codificada en función de la disciplina. Se distinguen varias categorías de combinaciones:

 Entre género y especie (subgénero, sección, subsección, serie, subserie, etc.), las
combinaciones son infragenéricas y binomiales
 En la categoría de especie, las combinaciones son específicas y binomiales
 Por debajo de la especie, las combinaciones son infraespecíficas y trinomiales.

CURVAS DE CRECIMIENTO

El crecimiento de una población no presenta un crecimiento constante en el tiempo.

Generalmente la velocidad de duplicación del número de células es muy lenta
inicialmente, después se incrementa constantemente y posteriormente disminuye. Por tal
motivo la gráfica de la curva de crecimiento presenta diferentes fases:
1- fase de latencia.
2- fase exponencial.
3- fase estacionaria.
4- fase de muerte.

1- Fase de latencia
Cuando se traslada una alícuota de una población microbiana a un medio de cultivo
nuevo, no ocurre crecimiento inmediatamente, sino después de cierto tiempo que se llama
fase de latencia. Esta fase puede ser más larga o más corta dependiendo de muchos
factores. Por ej., será larga si el cultivo iniciador es viejo, si la composición del medio
fresco es diferente al original, etc. La fase de latencia se produce porque los organismos
deben adaptarse a las nuevas condiciones antes de reproducirse. Generalmente si el
cultivo es viejo o en latencia, las células deben comenzar a sintetizar enzimas o factores
de crecimiento que ya no poseen. Similarmente, si el medio tiene una composición
diferente la célula debe sintetizar las enzimasnecesarias para degradar los nuevos
compuestos. Con fines prácticos industriales, se persigue que esta fase sea lo más corta
posible para tener mayor eficiencia y productividad del cultivo.

2- Fase exponencial
Es la verdadera fase de duplicación celular. La pendiente de la fase exponencial
depende de las características genéticas de los microorganismos y de las condiciones del
cultivo. En general, los procariotas crecen más rápidamente que los eucariotas y los
eucariotas pequeños lo hacen más rápidamente que los grandes. Si en la industria se
persigue la obtención de gran cantidad de células (por ej., producción de inoculantes), se
manejan las condiciones de producción tendiendo a que la fase exponencial sea larga y
de mucha pendiente (medio altamente nutritivo, control del pH, temperatura y aireación,
etc.).

3- Fase estacionaria
Se denomina fase estacionaria al periodo de tiempo donde no se detecta aumento o
disminución en el número de células. Generalmente esta fase se produce por agotamiento
de los compuestos nutritivos del medio de cultivo o por la producción de sustancias
metabólicas que inhiben el crecimiento celular (por ej., producción de ácido láctico que
baja el pH). Que no se detecte crecimiento no quiere decir que las células no se dividan,
sino que la tasa de muerte y la de división celular están balanceadas. Cuando se pretende
obtener un producto metabólico, se manejan las condiciones para que la fase exponencial
sea corta y de mucha pendiente y que el cultivo entre en fase estacionaria rápidamente,
donde se registra la mayor concentración del producto buscado.

4- Fase de muerte
Cuando se desestabiliza el balance entre muerte y duplicación y se producen más
muertes que divisiones, comienza la fase de muerte del cultivo. Esta fase tiene una
pendiente exponencial negativa, que puede ser de la misma magnitud que la fase de
crecimiento exponencial. En la práctica industrial esta fase es importante para evaluar el
desarrollo de productos desinfectantes y esterilizantes, que pueden ser: a)
bacteriostáticos, b) bactericidas o c) bacteriolíticos. El efecto bacteriostático es el que
detiene el crecimiento pero no mata a la célula. Los agentes bactericidas matan a la célula
pero no se produce la lisis o ruptura de la célula, mientras que los bacteriolíticos matan a
la célula mediante la lisis lo que se observa como una disminución en el número de
células o de la turbidez después de añadir el agente.
 Bacteriostático Bactericida Bacteriolítico
Contaje de células totales
Contaje de células
viables

Tres tipos de acción de agentes antimicrobianos. En el tiempo indicado por la flecha se

añadió una sustancia inhibidora del crecimiento a un cultivo en fase exponencial de
crecimiento.

PRODUCTOS MICROBIOLÓGICOS DE CARÁCTER INDUSTRIAL

Los productos industriales obtenidos por procesos del metabolismo bacteriano son de dos
grandes grupos: alimenticios y farmacéuticos. En la actualidad también existe un amplio
desarrollo para la obtención de productos para la agricultura como son los inoculantes y
los bioinsecticidas como el Bacillus turigiensis. Dentro de los productos alimenticios se
incluyen los de consumo directo como pan, cerveza, vino, etc. y los insumos para la
industria alimenticia (enzimas, alcoholes, ácidos, etc.).
Los productos farmacéuticos más importantes son los antibióticos. El descubrimiento y
producción de los antibióticos fue un hito en la lucha por la salubridad humana. Los
antibióticos son productos secundarios del metabolismo de algunos microorganismos,
sintetizados para poder competir en el suelo frente a las bacterias. Por tal motivo no
afectan a las células eucarióticas y pueden ser utilizados en organismos superiores sin
dañar las células del enfermo. Los antibióticos típicos son: la penicilina (inhibe la síntesis
de la pared celular de las bacterias) producida por el hongo Penicillium y la estreptomicina
(inhibe la síntesis de proteínas en bacterias) producida por el actinomycete Streptomyces.
En la actualidad muchos antibióticos son sintetizados artificialmente y no a través de
cultivos microbianos. La producción de inoculantes es uno de los objetivos de la
Microbiología Agrícola y será extensamente desarrollado en otras unidades.
Todos estos procesos microbiológicos industriales se basan en la potenciación de
reacciones metabólicas que los microorganismos ya son capaces de llevar a cabo, con el
fin de aumentar la producción del compuesto de interés.

CULTIVOS CONTINUOS
Para la producción industrial de cualquiera de los productos biológicos se han
desarrollado tecnologías de alta precisión para evitar contaminaciones y optimizar el
rendimiento. Los cultivos son realizados en equipos de fermentación especiales con
condiciones controladas estrictamente.
Un cultivo continuo es esencialmente un cultivo de volumen constante, y para mantener
los cultivos de manera continua en fase exponencial se han desarrollado equipos
denominados quimiostatos, que consiste en evitar la fase estacionaria y de muerte
mediante la incorporación de medio de cultivo fresco a medida que se va utilizando el
sustrato original. Simultáneamente con la incorporación de medio fresco se retira el cultivo
bacteriano ya crecido. Se denomina turbidostato cuando la incorporación de nuevo medio
de cultivo se realiza según la tasa de crecimiento, evaluada por densidad óptica.

Medio fresco
Regulador
Depósito de flujo
de medio
Aire
estéril Espacio
estéril
con aire

Llave de
control Entrada
Cultivo
de flujo para la
aireación
forzada y la
Apertura agitación
para la
inoculación Rebosadero
y la salida
de aire Sifón de
rebosamiento
Recipiente Efluente
de cultivo con
células