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Aplicaciones de la biología
molecular en anatomía patológica
Correspondencia a: Ignacio Wistuba O. Casilla 114-D. Santiago, Chile. Tel 686-3209. Fax 639-5871.
E-mail: iwistuba@med.puc.cl
The rapid development of molecular biology techniques as well as recent progress in the
understanding of genetic and molecular basis of human diseases have had enormous impact in the
practice of clinical pathology. Since new diagnostic (molecular) tools are now available, the concept
of Molecular Pathology is emerging. Molecular Pathology is defined by the use of molecular biology
techniques and the type of specimens that are involved in its practice, basically ARN and ADN,
extracted from cytological and tissue specimens. Although most methods used in molecular
pathology and their applications are still under investigation and clinical validation they have great
potential in several areas of pathological diagnosis, particularly on infectious and neoplastic diseases.
Introduction of these techniques in pathology laboratories in our country should significantly
enhance the diagnostic and research skills in the field (Rev Méd Chile 2001: 791-804).
(Key-Words: Laboratory techniques and procedures; Molecular biology; Pathology, molecular)
Las pautas del manejo de los especímenes y las técnicas de biología molecular que se utilizan en
Patología Molecular han sido desarrolladas en laboratorios de investigación. Estas han sido
adaptadas a las muestras propias del trabajo anátomo-patológico, es decir a muestras de tejidos y
citológicas, ya sean especímenes frescos sin ningún tipo de fijación, o muestras preservadas en
diversos fijadores y bajo diversas condiciones. El ADN en su forma pura es estable a temperatura
ambiente por años. Sin embargo, las endonucleasas presentes en las células pueden degradar el
ADN en fragmentos pequeños, interfiriendo con los resultados de su examen. Aunque el ARN
también es estable en forma pura, se degrada muy fácilmente en presencia de la enzima
ribonucleasa, que se encuentra en altas cantidades en algunos tejidos e incluso está presente en el
medio ambiente. La fijación con alcohol de las muestras citológicas es óptima para la preservación
de ADN y de ellas es posible extraer ARN 1. La fijación en formalina, el fijador de uso rutinario en
muestras de tejidos en Anatomía Patológica, produce degradación y fragmentación del ADN y ARN
de tal manera que sólo es posible amplificar mediante PCR fragmentos cortos (<250 pares de bases
nitrogenadas) de cada uno de ellos2. Sin embargo, la preservación óptima de los tejidos para
procedimientos de biología molecular es su congelación inmediata después de obtenidos y la
preservación a lo menos a -70°C. Por ello, es aconsejable establecer en los laboratorios de Anatomía
Patológica bancos de tejidos, especialmente de tumores y los correspondientes tejidos normales, de
tal manera que este material se encuentre disponible para los estudios que requieran de análisis
moleculares.
Las técnicas propias del trabajo en Patología Molecular son todas aquellas que forman parte del
arsenal de la biología molecular (Tabla 1). Entre otras técnicas, los métodos de aislamiento de
células o tejidos utilizando procedimientos de microdisección han sido de gran importancia en el
desarrollo de la Patología Molecular, incentivando significativamente la participación de los anátomo-
patólogos en las investigaciones de alteraciones moleculares y genéticas de los tejidos normales y
anormales, y estimulando su capacitación en técnicas más propias de la biología molecular. La
microdisección de tejidos es una técnica que permite establecer una correlación exacta entre las
características citológicas e histopatológicas de los especímenes y los resultados de los análisis
genéticos y moleculares3. Mediante ella es posible aislar poblaciones celulares específicas desde un
conjunto heterogéneo de células mediante la visualización directa al microscopio (Figura 1). Las
técnicas de microdisección disponibles se basan en la manipulación directa o a través de aparatos de
micromanipulación o de un sistema semi-automatizado basado en energía láser infrarroja ("laser
capture microdissection, LCM"). Las células microdisecadas han sido utilizadas exitosamente en el
estudio de alteraciones genéticas y moleculares del cáncer mediante análisis de ADN, estudio de
expresión de genes en diversos tejidos mediante examen de ARN y más recientemente en estudios
de proteínas3. La aplicación de técnicas de microdisección ha cumplido, además, un papel relevante
en la identificación de nuevos genes supresores de tumores y de múltiples regiones cromosomales
con deleciones frecuentes en diversas neoplasias y sus lesiones precursoras, las que son candidatas
a contener genes supresores de tumores aún no identificados3,4. Además, la microdisección ha
permitido la detección de nuevos genes importantes en el desarrollo de neoplasias a través de la
detección de nuevos fragmentos de transcripción (ARN mensajero) y de proteínas alteradas en
células tumorales3.
Figura 1. Esquema en el que se representa la microdisección de tejido y algunas técnicas de biología molecular
que se pueden realizar a partir de este tipo de material. Paneles superiores: microfotografías con ejemplo de
microdisección de un carcinoma infiltrante (antes y después). Paneles inferiores: izquierda, ejemplo de estudio de
deleción o pérdida de heterocigocidad en una región del cromosoma 3p con un marcador microsatélite mediante
de amplificación por PCR y electroforesis (L, linfocitos; H, epitelio bronquial con hiperplasia; T, carcinoma
escamoso pulmonar); centro, análisis de mutación del codon 12 del gen K-RAS mediante amplificación por PCR
y uso de enzimas de restricción ("RFLP, restriction fragment lenght polymorphism") (L, linfocitos; D, epitelio
bronquial con displasia; CIS, carcinoma in situ bronquial; T, carcinoma pulmonar); derecha, secuenciación de
parte del exon 5 del gen TP53 en el que se muestra mutación puntual en el codon 177, CCC a TCC (L, linfocitos;
T, carcinoma pulmonar).
Los exámenes de diagnóstico molecular disponibles actualmente en Patología Molecular han sido
desarrollados inicialmente privilegiando la sensibilidad y la especificidad, con la esperanza que la
incorporación en el futuro de técnicas automatizadas permita disminuir su costo y tiempo de
ejecución. El número de exámenes de diagnóstico que emplean técnicas y principios de biología
molecular ha ido aumentando en los últimos años. Aunque existen diversos productos
comercialmente disponibles, sólo unos pocos han completado el proceso de aprobación de la
Administración de Alimentos y Drogas de Estados Unidos (Food and Drug Administration, FDA). Por
lo tanto, los propios laboratorios deben desarrollar y validar la mayoría de los exámenes de
diagnóstico molecular con utilidad clínica.
En cada análisis de diagnóstico molecular existen varias técnicas de biología molecular disponibles.
La elección de la técnica más apropiada para un determinado examen de diagnóstico debe ser muy
cuidadosa y basarse en el conocimiento acabado de las ventajas y desventajas de cada técnica, en el
equipamiento del laboratorio y en la experiencia de sus integrantes. En la Tabla 1 se ilustran los
métodos más importantes de biología molecular aplicados a Patología Molecular, y se indican las
ventajas y desventajas de las técnicas de uso más frecuente. En la actualidad, los exámenes de
diagnóstico molecular disponibles en Patología Molecular están referidos principalmente a la
detección de microorganismos, al diagnóstico de enfermedades hereditarias y al diagnóstico auxiliar
de neoplasias, especialmente en lo referente a estudios de predisposición genética, estudio de
población de riesgo, diagnóstico de determinados cánceres, estudio de micrometástasis, selección de
terapias y evaluación del pronóstico de la enfermedad.
Varios tipos virus pueden ser detectados en muestras de tejidos y células aisladas mediante la
utilización de técnicas de biología molecular, tales como hibridación in situ de ARN y ADN, y
amplificación por PCR6,7. La lista de agentes virales que han sido detectados mediante estas técnicas
en especímenes de tejidos y que tendrían importancia clínica incluye a adenovirus, citomegalovirus,
Epstein-Barr, hepatitis B y C, y subtipos de virus papiloma humano (VPH).
Los métodos de biología molecular han demostrado gran utilidad en microbiología tanto en la
detección de bacterias directamente en muestras clínicas, como en la confirmación de los cultivos
que de ellas se obtienen5. Mientras muchas de estas determinaciones se realizan en muestras tan
diversas como expectoración, lavado broncoalveolar, líquido céfalo-raquídeo, orina, aspirado
faríngeo, líquido articular y peritoneal, etc, sólo un número limitado de estas determinaciones tiene
utilidad práctica en muestras de tejidos en la actualidad. Una de las determinaciones de bacterias
más difundidas en Patología Molecular es la determinación de micobacteris en tejidos,
especialmente Mycobacterium tuberculosis y Mycobacterium avium8. La detección de micobacterias
al microscopio en los tejidos se caracteriza por una muy baja sensibilidad y se requiere de una gran
cantidad de bacilos (a lo menos 104 micobacterias/mL). El diagnóstico de infección de micobacterias
con técnicas de biología molecular, especialmente mediante amplificación por PCR de sus secuencias
de ADN, se considera un método de gran utilidad en el diagnóstico de infecciones por estas
bacterias, debido a su rapidez, alta sensibilidad y gran especificidad 8.
Los métodos basados en la amplificación de secuencias de ADN mediante PCR serían también
herramientas útiles en el diagnóstico de micosis en muestras de tejidos o citologías 9. Existen varios
estudios en los que se ha demostrado la identificación exitosa de hongos mediante PCR,
especialmente en especímenes citológicos, tales como Aspergillus sp (lavados bronquiolo-
alveolares), Criptococo (tejido pulmonar), Candida sp (sangre y orina), y Pneumocystis
carinii (expectoración, lavado bronquiolo-alveolar, aspirados nasofaríngeos y tejido pulmonar). El
incremento significativo de las infecciones por Pneumocystis carinii en las últimas décadas estimuló
el desarrollo de exámenes rápidos y sensibles de diagnóstico basados en la detección de sus
secuencias génicas mediante PCR. Algunos de los estudios han reportado 100% de sensibilidad y
especificidad, en comparación con los métodos tradicionales, especialmente en el grupo de pacientes
VIH positivos10.
III. Patología molecular en el diagnóstico de neoplasias. Este campo es sin duda una de las áreas de
la Patología Molecular que ha experimentado el desarrollo más acelerado en los últimos años,
ayudando además en forma significativa a la incorporación de los anátomo-patólogos al estudio y
aplicación de los principios y las técnicas de biología molecular. Revisaremos brevemente el estado
actual de sus aspectos más importantes.
Mientras que la mayoría de la mutaciones de los genes responsables de los síndromes hereditarios
de cáncer son analizadas en ADN extraído de leucocitos sanguíneos, el ADN obtenido de tejidos
frescos o de archivos (fijados en formalina e incluidos en parafina) también puede ser utilizado,
especialmente en casos en que muestra de sangre o tejido no pueda ser obtenida. El análisis
específico del tejido tumoral también puede proveer de información para el diagnóstico de
condiciones que confieran susceptibilidad heredada al desarrollo de neoplasias. Este es el caso de la
enfermedad conocida como síndrome de Lynch o cáncer colorrectal no-poliposo hereditario, en el
cual el análisis del tumor permite identificar la inestabilidad de secuencias microsatélites de ADN,
también denominada errores de replicación11. En este análisis el ADN extraído de tejido normal y de
tumor deben ser analizados mediante amplificación por PCR para identificar el fenómeno de
inestabilidad de microsatélites, fenómeno que sugiere un defecto en los mecanismos de reparación
de ADN (Figura 2)12.
Figura 2. Estudio del fenómeno de inestabilidad genética o error de replicación en cáncer de colon. Ambos
paneles, amplificación por PCR y electroforesis de secuencias microsatélites BAT-25 y BAT-26 en ADN
extraído de linfocitos normales sanguíneos y de células tumorales de cáncer de colon. Flechas a la izquierda de
ambos paneles muestran posición de las secuencias normales y flechas a la derecha de los mismos indican
secuencias anormales propias de la inestabilidad genética. El fenómeno de inestabilidad genética en esta
neoplasia puede estar asociado a mutación de genes encargados de la reparación del ADN .
Detección precoz de cáncer con métodos moleculares. Se considera que la mayoría de las neoplasias
humanas serían precedidas por lesiones precursoras, las que presentarían características
morfológicas, histopatológicas y genéticas definidas. Sin embargo, estas lesiones preneoplásicas y su
secuencia han sido determinadas con certeza sólo en algunas neoplasias humanas, especialmente en
aquellas de origen epitelial (carcinomas). La aplicación de principios y técnicas de biología molecular
al diagnóstico precoz del cáncer está actualmente sólo en el plano de la investigación científica.
Debido a que la identificación de las neoplasias incipientes y sus lesiones precursoras corresponden
al ámbito de la Anatomía Patológica, el papel de los anátomo-patólogos es fundamental en la
caracterización de las alteraciones moleculares de estas lesiones, como asimismo en el diseño de
estrategias de detección precoz de cáncer que las utilicen. A pesar de que la investigación en esta
área del conocimiento ha sido intensa en la última década, en la actualidad existen más
interrogantes que respuestas. ¿De qué manera la biología molecular producirá un impacto en la
detección precoz del cáncer? ¿Pueden las características genéticas de las células tumorales o
precursoras de cáncer ser utilizadas como marcadores de diagnóstico precoz de cáncer? ¿Cuál es la
sensibilidad y especificidad de estos marcadores para el estudio de población de riesgo de contraer
una neoplasia? Aunque aún no existen respuestas definitivas a estas interrogantes, revisaremos muy
brevemente los avances fundamentales en este campo con especial referencia a su impacto en
Anatomía Patológica.
Figura 3. Ejemplo de modelo secuencial de origen de una neoplasia. Resumen de la progresión de alteraciones
histopatológicas (microfotografías) y genéticas en el desarrollo de carcinoma escamoso de pulmón. Las
alteraciones moleculares pueden comenzar precozmente (epitelio bronquial histológicamente normal o con
alteraciones mínimas), en estadios intermedios (displasia del epitelio bronquial); o relativamente tardíos
(carcinoma in situ o tumor infiltrante).
Una de las aplicaciones del conocimiento de las alteraciones genéticas en las lesiones precursoras
humanas la constituye la evaluación de su utilidad como control de la progresión o regresión de las
mismas, y para el monitoreo de terapias quimio-preventivas. A pesar de la muy activa investigación
en este campo, existen por el momento sólo escasos ejemplos en los que la determinación de
alteraciones moleculares permitiría predecir la evolución de lesiones precursoras. Se ha demostrado,
por ejemplo, en cáncer de cuello uterino que la persistencia de secuencias génicas de VPH de alto
riesgo en lesiones precursoras es un factor predictivo positivo del riesgo de desarrollar esta
neoplasia26. Similares conclusiones se han alcanzado con respecto a la presencia de mutaciones del
gen TP53 en epitelio columnar metaplásico del esófago de Barret16 y en epitelios displásicos en las
colitis ulcerosa27 en adenocarcinomas de esófago y colon, respectivamente. Mientras este tipo de
estudios aún pertenecen al campo de la investigación, es muy probable que en el futuro sean parte
de herramientas de apoyo al diagnóstico de lesiones precursoras, y más aún, al estudio del riesgo de
que éstas progresen a lesiones malignas.
c) Distinción de doble tumor primario o metástasis. Aunque poco difundido, el empleo de principios y
técnica de biología molecular puede aplicarse al diagnóstico diferencial entre la presencia de tumores
primarios múltiples (sincrónicos o metacrónicos) y de metástasis en casos seleccionados en los
cuales las técnicas convencionales de Anatomía Patológica no permiten hacer esta distinción. En
estos casos ciertas anormalidades genéticas (mutaciones puntuales de oncogenes, deleciones
cromosomales o fenómeno de inestabilidad genética) pueden ser utilizadas en este diagnóstico
diferencial35,36.
f) Determinación del pronóstico. Aunque existen muchos estudios publicados en los que se ha
encontrado una correlación positiva entre la presencia de determinadas alteraciones genéticas y el
pronóstico de ciertas neoplasias, el resultado de muchos de estos estudios es controvertido. La
variabilidad de las técnicas y métodos de detección de las alteraciones genéticas y de las series
clínicas estudiadas explicarían en parte estas discordancias. El progreso en el conocimiento de las
alteraciones genéticas asociadas a la progresión tumoral, especialmente la invasión de tejidos y el
desarrollo de metástasis, sumado al desarrollo de técnicas de detección de alteraciones genéticas
más estandarizadas con grados crecientes de automatización, la mejor definición de las series
clínicas estudiadas y mayor uniformidad en el tratamiento anti-neoplásico, permitirán establecer con
mayor exactitud el valor pronóstico de las alteraciones genéticas en las neoplasias.
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Agradecimientos
El autor agradece a los Drs. Ignacio Duarte y Sergio González del Departamento de Anatomía Patológica de la Pontificia Universidad
Católica de Chile por la revisión crítica del manuscrito, y al Dr. Marco Arrese del Departamento de Gastroenterología de la Pontificia
Universidad Católica de Chile por su ayuda en la edición de este trabajo.
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