Universidad de las Fuerzas Armadas “ESPE”

Departamento de Ciencias de la Vida y Agricultura

Ingeniería en Biotecnología
Biología Molecular II

Nombres: Silvana Romo, Andrea Viteri.

NRC: 5247
Fecha: 16/05/2018

Artículo Científico
“The Mechanisms of Action of Ribosome-Targeting Peptide Antibiotics”
Autores: Yury S. Polikanov, Nikolay A. Aleksashin, Bertrand Beckert y Daniel N. Wilson.
Revista: Frontiers in Molecular Biosciences
Fecha de publicación: 14 de mayo de 2018.

Los antibióticos tienen como objetivo dentro de la célula al ribosoma. Los antibióticos inhiben
procesos metabólicos vitales para las bacterias que se relacionan con la síntesis de pared celular,
proteínas y ácidos nucleicos. La especificidad de acción depende de que el fármaco bloquee una
enzima o sustrato no presenta en las células eucariotas. El aumento de bacterias resistentes a
fármacos ha reducido su actividad antibiótica, por ello se han realizado estudios sobre
antibióticos peptídicos que crean interacciones con el ribosoma inhibiendo así la traducción.

El ribosoma procariota está formado por dos subunidades, una pequeña (30S) y una grande
(50S) que se unen para formar un ribosoma (70S). El ARNr define al ribosoma como una
ribozima por la actividad catalítica que presenta. La subunidad 30S decodifica la información
genética proporcionada por el ARNm y la subunidad 50S tiene el centro catalítico peptidil
transferasa (PTC). Para la eficiencia de la traducción se requieren de factores proteicos. En el
proceso de inicio de la traducción ingresa el fMet-ARNt ifMet al sitio P para el reconocimiento del
codón de inicio. Todo el proceso sigue de manera similar a la traducción de proteínas en
eucariontes. El ARNt se asocia con el PTC para formar el enlace peptídico. Mientras el péptido
se va sintetizando, éste pasa por un túnel de salida en la subunidad grande, este túnel tiene la
función de regular la traducción en respuesta a cofactores como los fármacos.

En el proceso de traducción los antibióticos interfieren con la síntesis de proteínas uniéndose a

varios centros funciones del ribosoma, dificultando tanto la conformación como unión de
ligandos. Varios antibióticos inhiben las etapas de la traducción de proteínas: en la iniciación,
edeína, GE81112; en la elongación, estreptogaminas,ditromicina y en la terminación apidaecina.
Los antibióticos como la edeína, GE81112, Ditromicina, Viomicina y Capreomicina son
péptidos que una actividad frente a bacterias Gram positivas y negativas. Se unen la subunidad
30S evitando la formación del complejo de iniciación, inhibe la unción del ARNt iniciador al
sitio P, pero también hay supresión de la absorción del antibiótico en las bacterias en presencia
de medios de cultivos ricos en nutrientes. También pueden atrapar al factor de elongación
inhibiendo la translocación del ARNt mediada por EF-G. Se puede presentar una resistencia a
antibióticos que resulta de los ribosomas que tienen mutaciones en el ARNr 16S o 23S.

Las Odilorhabdinas, nueva clase de antibióticos peptídicos se producen por NRPS a partir de
bacterias Gram – negativas Xenorhabdus nematophila, las cuales viven simbióticamente con
nematodos que viven en el suelo. Los ODL interactúan simultáneamente con el Rrna 16S y el
lazo anticodón del tRNA del sitio A, lo que aumenta la afinidad del aminoacil-tRNA por el
ribosoma e impide la progresión del ribosoma a lo largo del mRNA.

Los antibióticos peptídicos se dirigen al clúster de la subunidad 50 S grande alrededor del PTC
donde se produce la formación del enlace peptídico, como la estreptogramina A, asi como
dentro del túnel de salida del péptido naciente, como se ve en las estreptograminas B.

A diferencia de los péptidos antimicrobianos (AMP) que matan las bacterias al romper la
membrana bacteriana, la subclases de péptidos antimicrobianos ricos en prolina (PrAMP)
pueden pasar a través de la membrana bacteriana sin dañarla y en su lugar inhibir el crecimiento
bacteriano atacando procesos intracelulares. Estas PrAMP interactúan con la chaperona DnaK,
surgiriendo que las PrAMP inhiben el crecimiento bacteriano al interferir con el plegamiento de
proteínas mediado por DnaK.

Las estructuras disponibles de antibióticos peptídicos en el ribosoma ilustran las diversas

maneras en que estos inhibidores interactúan con el ribosoma e interfieren con la traducción.