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Moritz von Scheidt, 1 Yuqi Zhao, 2 Zeyneb Kurt, 2 Calvin Pan, 3 Lingyao Zeng, 1 Xia Yang, 2 Heribert Schunkert, 1,4 y Aldons J.
Lusis3, *
1 Deutsches Herzzentrum M € unchen, Technische Universit € at M € unchen, 80333 Munich, Alemania
2 Departamento de Biología Integrativa y Fisiología.
3 Departamento de Medicina, Microbiología y Genética Humana, Escuela de Medicina David Geffen Universidad de California,
Los Ángeles, Los Ángeles, CA 90095, EE.UU.
4 Deutsches Zentrum f € ur Herz- und Kreislauferkrankungen (DZHK), sitio asociado Munich Heart Alliance, 80336 Munich,
Alemania
Antecedentes:
Modelos de ratón en la investigación de la aterosclerosis
Perspectiva historica
Desde principios de 1900, el ratón ha sido el modelo animal clásico para el análisis genético. La
investigación sobre el ratón como modelo de aterosclerosis comenzó a fines de los años 70 y
principios de los 80 con esfuerzos para caracterizar el metabolismo de las lipoproteínas en plasma y
desarrollar dietas que promuevan el desarrollo de lesiones ateroscleróticas en ratones (LeBoeuf et
al., 1983, Lusis et al., 1983, Paigen et al., 1987, Reue et al., 1984, Roberts y Thompson, 1976). Los
ratones tienen niveles muy bajos de lipoproteínas aterogénicas y, a diferencia de los conejos, los
hámsters y algunos otros modelos animales, no desarrollan lesiones significativas cuando se les
alimenta con una dieta de tipo occidental con alto contenido de grasa y colesterol. Sin embargo, se
encontró que la adición de ácido cólico a tales dietas dio lugar a lesiones aórticas que correspondían
a lesiones tempranas de rayas grasosas en humanos (Paigen et al., 1987, Roberts y Thompson,
1976). A principios de la década de 1990, se crearon modelos de ratones con niveles de colesterol
muy altos y lesiones relativamente avanzadas mediante ingeniería genética, incluidos
los ratones knockout para apolipoproteína E ( Apoe - / - ) y knockout para el receptor LDL ( Ldlr - / - )
(Ishibashi et al., 1994, Li et al., 1993, Plump et al., 1992, Warden et al., 1993).
Se utilizaron dos enfoques para identificar los factores genéticos que contribuyen a la aterosclerosis
en el ratón. El primero involucró el análisis genético de la variación natural en el ratón mediante el
análisis del locus de rasgos cuantitativos (QTL), un método analítico para el mapeo de genes que
subyacen a rasgos complejos. Tales estudios revelaron la considerable complejidad genética de la
aterosclerosis, pero la mala resolución del mapeo QTL dificultó la identificación de genes
(Rodríguez et al., 2013). El segundo enfoque involucró el análisis de genes hipotetizados para
desempeñar un papel en la aterosclerosis basada en la biología conocida, conocida como "genes
candidatos". En la mayoría de los estudios, la expresión de los genes candidatos se modificó a
través de la ingeniería genética (por ejemplo, la orientación genética). , generalmente seguido de un
análisis sobre un fondo hiperlipidémico para evaluar el desarrollo de la lesión. Tales estudios se han
realizado para muchos cientos de genes (Stylianou et al., 2012). A continuación, preguntamos cómo
encajan los resultados de estos estudios con lo que se sabe sobre la aterosclerosis humana, en
particular los resultados de los GWAS humanos.
Patología
En modelos experimentales como Apoe - / - o Ldlr - / -En ratones alimentados con dietas
"occidentales", el desarrollo de lesiones ateroscleróticas es similar al observado en estudios
patológicos de la enfermedad humana. El primer evento perceptible es la acumulación de partículas
de lipoproteínas que contienen apolipoproteína B agregada en el espacio íntimo. A esto le sigue el
reclutamiento de monocitos de sangre a la íntima en los sitios de acumulación de lipoproteínas y la
transformación posterior a macrófagos. Estas células luego proceden a absorber las lipoproteínas a
través de los receptores del eliminador o la fagocitosis para dar lugar a "células espumosas"
cargadas de colesterol que son el sello distintivo de la aterosclerosis temprana. A medida que las
lesiones crecen en tamaño, se forma un núcleo necrótico formado por células de espuma, cristales
de colesterol y células apoptóticas.Lusis, 2000). Además de los monocitos, los linfocitos T se
reclutan para las lesiones y, en ciertos antecedentes genéticos, se produce una calcificación intimal
y medial (Rattazzi et al., 2005).
Sin embargo, existen algunas diferencias distintas en comparación con la aterosclerosis
humana. Mientras que, como en los humanos, las lesiones en ratones tienden a ocurrir en regiones
de flujo sanguíneo alterado, los sitios principales de desarrollo de lesiones en ratones son la aorta y
las carótidas, no las arterias coronarias (Hu et al., 2005). Además, aunque el engrosamiento de la
íntima generalmente ocurre en lesiones tempranas en humanos, este no es el caso en ratones
(Schwartz et al., 1995). Además, los modelos de ratón rara vez muestran evidencia de rotura de la
lesión, un punto particularmente significativo, ya que aproximadamente tres cuartas partes de los
ataques cardíacos se producen por rotura de placa seguida de trombosis. Cabe señalar que ciertos
modelos de ratón, en particular el ratón combinado Srb-1 - / - / Apoe - / - , desarrollan lesiones
coronarias significativas, aunque no se han utilizado ampliamente en la investigación,
probablemente debido a la dificultad de la reproducción de alelos manipulados. un fondo de doble
nocaut (Zhang et al., 2005). Además, las lesiones en ciertos vasos, como la arteria innominada que
se ramifica desde la aorta, muestran una mayor complejidad que las lesiones aórticas, incluida la
presencia de fibrina en las lesiones, aunque no parecen ser un buen modelo para los estudios de los
mecanismos de rotura de la placa en humanos (Schwartz et al., 2007).
La mayoría de los estudios en ratones han evaluado solo el tamaño de las lesiones, no la
composición. Está claro que en los ratones, los antecedentes genéticos y los factores ambientales
pueden influir en el contenido relativo de macrófagos, células del músculo liso, linfocitos, depósitos
calcificados, colágeno y residuos necróticos (Bennett et al., 2006, Shaposhnik et al., 2007). Dada su
importancia en la vulnerabilidad de la placa, la evaluación cuantitativa de la composición de la
lesión es claramente de interés (Schwartz et al., 2000). Por otro lado, muchos estudios en humanos a
menudo carecen de cualquier caracterización patológica de las lesiones
ateroscleróticas. Específicamente, los GWAS a gran escala a menudo utilizan definiciones clínicas
para las manifestaciones de la enfermedad aterosclerótica que van desde los síntomas (p. Ej.,
Angina de pecho) y los hallazgos en estudios de imagen (p. Ej., Angiografía coronaria) hasta
manifestaciones clínicas (p. Ej., Infarto de miocardio y accidente cerebrovascular de gran tamaño).
Variación genética natural
Los estudios de variación natural en ratones se han centrado en la arquitectura genética general de la
aterosclerosis y las firmas moleculares asociadas con el desarrollo de lesiones (Hsu y Smith,
2013, Kayashima et al., 2015, Rodríguez et al., 2013, Welch, 2012). Por ejemplo, un gran cruce
entre las cepas C3H / HeJ y C57BL / 6J en un fondo Apoe - / - identificó numerosos loci
significativamente asociados con aterosclerosis, calcificación vascular y rasgos como la obesidad,
los niveles de insulina y los lípidos plasmáticos. El análisis de las vías usando ingenio reveló una
serie de vías fuertemente asociadas con la aterosclerosis, como el metabolismo del colesterol, la
fosforilación oxidativa mitocondrial y la inflamación (Wang et al., 2007).
Debido a la mala resolución del análisis de ligamiento en ratones (y humanos), muy pocos genes
nuevos que contribuyen a formas complejas de susceptibilidad a la aterosclerosis se identificaron en
base a cruces genéticos (Broeckel et al., 2002, Erdmann et al., 2013). Sin embargo, con el desarrollo
de tecnologías para la genotipificación de alta densidad, el mapeo de asociación de rasgos
complejos de resolución relativamente alta se ha hecho posible en ratones y en humanos. Dichos
análisis de asociación pueden realizarse utilizando poblaciones de ratones criados o utilizando
poblaciones de ratones criados después de la corrección de la estructura de la población (Bennett et
al., 2010, Valdar et al., 2006). Una ventaja del uso de ratones consanguíneos para tales análisis es
que se pueden examinar muchos fenotipos diferentes en los mismos antecedentes genéticos
(Bennett et al., 2015, Orozco et al., 2012, Parks et al., 2013).
Los estudios de variación natural en ratones han revelado que la aterosclerosis es un rasgo
altamente complejo, que involucra a muchos genes que contribuyen a una variedad de factores de
riesgo. Un estudio reciente de un gran conjunto de cepas puras conocidas como el Hybrid Mouse
Diversity Panel (HMDP) reveló una fuerte evidencia de asociación con inflamación, señalización de
óxido nítrico y niveles de trimetilamina-N-óxido (TMAO), así como factores de riesgo tradicionales
tales como los niveles de lípidos en plasma. Además, el estudio proporcionó pruebas sólidas de las
interacciones gen por gen así como las interacciones gen por ambiente (Bennett et al., 2015).
Modelos de ingeniería y estudios de drogas
Para investigar los mecanismos que contribuyen a la susceptibilidad de la aterosclerosis, se han
examinado cientos de "genes candidatos" por sus efectos sobre la aterosclerosis en ratones. Dichos
genes candidatos fueron elegidos en base a hipótesis generadas a partir de la comprensión de la
aterosclerosis humana y, por lo tanto, están sesgados de forma inherente. Al relacionar los
resultados de dichos estudios con la genética de la aterosclerosis humana, se deben tener en cuenta
una serie de otras advertencias, incluidas las diferencias en el tamaño del efecto, el problema de los
"genes pasajeros" y algunas consideraciones estadísticas. Tales factores de confusión se discuten en
una sección posterior.
Tabla 1 Asociación de ortólogos humano-ratón con bases de datos de enfermedades humanas
Se enumeran los diez principales términos de DAVID asociados con 827 genes de aterosclerosis de
ratones derivados de la literatura. El "cambio en el pliegue" es el grado de enriquecimiento de los
genes de aterosclerosis de ratón dentro de cada categoría de genes, y "genes de ratón" es el
número de dichos genes. FDR, tasa de descubrimiento falso.
a Un ajustado por comparación múltiple.
b Calculado utilizando la prueba exacta de Fisher.
Revisamos exhaustivamente más de 9,000 publicaciones de PubMed que examinaron genes que
contribuyen a la aterosclerosis en ratones. Estos incluyeron un total de 827 genes de aterosclerosis
de ratón, según lo definido por un efecto significativo en el tamaño o la composición de la lesión
aterosclerótica cuando se perturba en un modelo de ratón. A nuestro entender, esto representa la
colección más completa de genes de ratón que tienen efectos significativos en la aterosclerosis en
modelos de ratón. Las citas para todos los genes incluidos se proporcionan en la Tabla S1 ,
disponible en línea. Los genes de ratón se clasificaron en tres grupos:
Las comparaciones de datos de ratón y humanos a nivel genético deben considerar las diferencias
genéticas. Para evaluar la superposición de genes entre las especies, se consideraron los homólogos
más recientes de ENSEMBL (Kersey et al., 2016). Después de los ajustes específicos de la especie,
19,583 genes humanos codificantes de proteínas podrían combinarse con 20,738 genes de ratón. Por
lo tanto, aproximadamente el 98,8% (19,583 de 19,815) de los genes humanos están representados
en el genoma del ratón y el 94,5% (20,738 de 21,936) de los genes del ratón están representados en
el genoma humano (Harrow et al., 2012, Mudge y Harrow, 2015).
Siguiendo la clasificación de los modelos de ratón, nuestra investigación reveló un total de 827
genes de ratón, de los cuales 535 (64.5%) fueron modelos de expresión génica reducida, 48 (5.8%)
fueron modelos de genes sobreexpresados y 244 (29.5%) fueron modelos de tratamiento
farmacológico. Se consideró que los genes que mostraron alteraciones significativas en el tamaño
de la lesión (808 genes) o la estabilidad de la placa (19) tienen un efecto sobre la aterosclerosis. En
total, 805 de nuestros 827 genes de ratones derivados de la literatura tienen un ortólogo humano
(97.3%). Estos 805 genes de ratón se combinaron con 797 genes únicos en humanos. Diez genes de
ratón ( Ang , Ang2 , Ang4 , Ang5 , Ang6 , Bglap , Bglap2 , Bglap3 ,Ces3a y Ces3b ) estaban
representados por tres genes humanos (ANG, BGLAP y CES). Los ratones con eliminación
de Apoe (68.6% de los estudios) o Ldlr (27.2%) sirvieron con mayor frecuencia como modelos para
los estudios de aterosclerosis. Por lo tanto, la gran mayoría de todos los modelos genéticos de
ratones se exploraron en el contexto de hipercolesterolemia excesiva, una condición que es similar a
la hipercolesterolemia familiar en el hombre. De los 827 genes, el 58.6% (485) de los genes se
describió para mediar los efectos pro-aterogénicos y el 41.2% (341) de los efectos anti-
aterogénicos; Pecam1 es un gen que afecta a la aterosclerosis de una manera específica del sitio, ya
sea positiva o negativamente (Goel et al., 2008).
Usando la herramienta de enriquecimiento de genes DAVID, observamos que las categorías
principales de enfermedades correspondientes a los 827 genes de ratones estaban fuertemente
asociadas con la aterosclerosis. Entre las diez principales enfermedades asociadas con los humanos,
seis están relacionadas directamente con CAD o aterosclerosis en humanos y dos representan
factores de riesgo conocidos de CAD. Las dos condiciones restantes son la enfermedad de
Alzheimer y la longevidad ( Tabla 1 ).
Tabla 2: consistencia de los factores de riesgo CAD humanos en modelos de ratones con
aterosclerosis
Factores de riesgo Efecto sobre la Referencia
concordantes aterosclerosis
Hipercolesterolemia ↑ Plump et al., 1992; van Ree et al., 1994
Niveles Elevados De ↑ Huszar et al., 2000; Powell-Braxton y otros, 1998
Lipoproteínas: LDL
Niveles Elevados De ↑ Knouff et al., 2004; VanderLaan et al., 2009
Lipoproteínas: VLDL
Niveles Elevados De ↓ Bérard et al., 1997; Feig et al., 2014;
Lipoproteínas: HDL
Niveles Elevados De ↑ Callow y otros, 1995; Schneider et al., 2005; Pedersen et al.,
Lipoproteínas: LPA 2010
Hipertrigliceridemia ↑ Voyiaziakis et al., 1998
Hipertensión ↑ Leong et al., 2015; Weiss et al., 2001; Wiesel et al., 1997
Enfermedades Inflamatorias: ↑ Rose et al., 2013
Artritis.
Enfermedades Inflamatorias: ↑ Ma et al., 2008
Lupus.
Enfermedades Inflamatorias: ↑ Karbach et al., 2014
Psoriasis.
Smoking ↑ Boué et al., 2012; Gairola et al., 2001; Lietz et al., 2013
Contaminación Del Aire ↑ Araujo, 2010; Soares et al., 2009; Sun et al., 2005
Dt1 ↑ In't Veld, 2014; Kunjathoor et al., 1996; Shen y Bornfeldt, 2007
Dt2 ↑ Jun et al., 2011; Rey, 2012; Renard et al., 2004; Schreyer et al.,
1998
Envejecimiento ↑ Merat et al., 2000; Rosenfeld et al., 2000
Angustia ↑ Kumari et al., 2003; Najafi et al., 2013; Roth et al., 2015
OTMA ↑ Gregory et al., 2015; Hartiala et al., 2014; Wang et al., 2011
Trombosis ↑ Schafer et al., 2003
Falta De Actividad Fisica ↑ Meissner et al., 2011; Pellegrin et al., 2009
Presencia Bacteriana ↑ Gibson et al., 2004; Lalla et al., 2003
Insuficiencia Renal ↑ Bro et al., 2003; Hewitson et al., 2015; Neven y
D'Haese, 2011
Sindrome Metabolico ↑ Kennedy et al., 2010
Factores De Riesgo Efecto sobre Athero -
Discordantes en humanos /
ratones
Obesidad ↑ / - (Lep ob / ob Chiba et al., 2008; Nishina et al., 1994; Plummer y
ratones) Hasty, 2008
Género masculino ↑ / Venegas-Pino et al., 2016
femenino ↑
↑ indica que el factor está asociado positivamente con la aterosclerosis, ↓ indica una asociación
negativa, y - indica que no hay asociación con la aterosclerosis.
Trastornos inflamatorios sistémicos
Los trastornos inflamatorios sistémicos humanos, como la artritis reumatoide, el lupus y la
psoriasis, están fuertemente asociados con la CAD humana, aunque los fundamentos genéticos de
los dos trastornos pueden ser diferentes (del Rincón et al., 2001, Jansen et al.,2015, Wang et al.,
2012, Westerweel et al., 2007). De acuerdo, los modelos de ratón de la artritis reumatoide humana,
el lupus y la psoriasis también mostraron un aumento de las lesiones ateroscleróticas en los modelos
de ratón (Cao et al., 2013, Karbach et al., 2014, Ma et al., 2008, Rose et al., 2013).
De fumar
Fumar acelera el desarrollo de CAD en humanos (Kannel et al., 1968). En los modelos de ratón, la
exposición al humo del cigarrillo convencional provocó perturbaciones del metabolismo de los
lípidos, la función de las células endoteliales arteriales y el desarrollo de lesiones ateroescleróticas
(Boué et al., 2012). El cese de la exposición al humo condujo a una desaceleración de la progresión
de la placa y disminuyó la acumulación de lípidos pro-aterogénicos (Lietz et al., 2013).
La contaminación del aire
La contaminación del aire es un factor de riesgo para la aterosclerosis humana acelerada (Araujo,
2010). Los modelos de ratones expuestos a partículas ambientales concentradas a largo plazo
menores de 2,5 μm (que simulan el aire contaminado) mostraron una aceleración de la
aterosclerosis y la inflamación vascular (Sun et al., 2005).
Diabetes tipo 1
La diabetes tipo 1 (T1D) promueve la progresión de la CAD humana (Schnell et al., 2013). La T1D
en modelos de ratón fue inducida por estreptozotocina o por infección viral. Ambos métodos
resultaron en la formación acelerada de la lesión (Shen y Bornfeldt, 2007).
Diabetes tipo 2
La diabetes tipo 2 (T2D) es un factor de riesgo de la CAD humana (Reaven, 2003). La mayoría de
los modelos T2D de ratón se basan en un modelo deficiente en leptina, alimentación con grasa o
carbohidratos o disfunción de las células beta inducida genéticamente, y la mayoría mostró que la
T2D acelera la aterosclerosis (Jun et al., 2011
, Rey, 2012, Renard et al., 2004, Schreyer et al., 1998). Hubo algunos resultados contradictorios,
posiblemente debido a la participación del sistema inmunológico (Taleb et al., 2007) o efectos
ateroprotectores de la deficiencia de leptina en sí ( Lep ob / ob ) (Chiba et al., 2008).
Angustia
La angustia, aguda y crónica, es un factor de riesgo para el desarrollo y la progresión de la CAD
humana (Holmes et al., 2006). En un modelo de estrés crónico en ratones, los ratones fueron
expuestos repetidamente a agua helada. Los animales desarrollaron lesiones ateroscleróticas más
avanzadas y complejas (Heidt et al., 2014, Najafi et al., 2013).
Trimetilamina-N-óxido
El TMAO, derivado de la colina o la carnitina en la dieta a través de la acción de la microbiota
intestinal, ha demostrado recientemente ser un factor de riesgo para la EAC y la insuficiencia
cardíaca (Koeth et al., 2013). Las cepas puras de ratones exhiben variaciones en los niveles de
TMAO cuando se mantienen en una dieta occidental, y estas se asocian significativamente con la
aterosclerosis (Bennett et al., 2015). Los modelos de ratones experimentales revelaron que la
suplementación dietética con colina (que puede procesarse a TMAO) o TMAO en sí promovió la
aterosclerosis (Wang et al., 2011).
Trombosis
La trombosis está significativamente relacionada con la CAD humana (Davies, 1996). Una
investigación del inhibidor de la activación del plasminógeno 1 ( Pai1 ) en un modelo de ratón
mostró un fenotipo protrombótico con formación acelerada de lesiones (Schafer et al., 2003).
Falta de actividad física
La falta de actividad física es un factor de riesgo bien conocido de la CAD humana (Warburton et
al., 2006). Los estudios en modelos de ratones revelaron un desarrollo desacelerado de la
aterosclerosis en ratones sometidos a ejercicio (Meissner et al., 2011).
Bacteriemia indebida
La bacteriemia indebida se asocia con la EAC. La enfermedad periodontal proporciona la entrada
más común para tales patógenos (Beck et al., 1996). Los modelos de infección oral con patógenos
periodontales mostraron aterosclerosis acelerada en ratones (Lalla et al., 2003).
Insuficiencia renal
La insuficiencia renal acelera la progresión de la CAD humana, especialmente cuando la carga de
calcificación es alta (Yerkey et al., 2004). Los modelos genéticamente modificados de ratón de
insuficiencia renal ( Fgf23 - / - o Klotho - / - ) o ratones en los que se inició la inducción con toxinas
urémicas, como el indoxil sulfato, mostraron aterosclerosis acelerada y lesiones altamente
calcificadas (Neven y D'Haese, 2011).
Síndrome metabólico
El síndrome metabólico, caracterizado por resistencia a la insulina, obesidad, presión arterial
elevada y dislipidemia, es un factor de riesgo para el desarrollo de la CAD humana (Isomaa et al.,
2001.). Varios modelos de ratones con síndrome metabólico muestran una formación acelerada de
lesiones (Kennedy et al., 2010).
Obesidad
La obesidad es un factor de riesgo establecido para la EAC en humanos. La obesidad también se
asocia positivamente con la aterosclerosis en ratones con dietas altas en grasa y colesterol (Kennedy
et al., 2010). Los ratones con deficiencia de leptina ( Lep ob / ob ) tienen un fenotipo obeso distinto,
pero están protegidos contra la aterosclerosis (Chiba et al., 2008, Nishina et al., 1994, Plummer y
Hasty, 2008). Este efecto puede estar relacionado con el aumento de tamaño de las lipoproteínas
en ratones obesos Lep ob / ob , lo que lleva a una menor penetración de las paredes arteriales (Nishina
et al., 1994) y la regulación de la presión arterial (Huby et al., 2016). La deficiencia del receptor de
leptina ( Lep db / db ), en contraste con la deficiencia de leptina, condujo a un aumento de los niveles
plasmáticos de leptina y aterosclerosis pronunciada, lo que sugiere que la leptina en sí promueve la
aterosclerosis (Wu et al., 2005).
Diferencias de sexo
En los seres humanos, los hombres muestran un inicio más temprano de CAD en comparación con
las mujeres. En los ratones, por otro lado, la aterosclerosis es generalmente más prominente en las
hembras, aunque esto depende del modelo de ratón y la dieta utilizada. La mayor susceptibilidad a
la aterosclerosis en ratones hembras se ha atribuido en parte a los genes codificados por los
cromosomas sexuales (Arnold et al., 2016, Link et al., 2015) y también a las diferencias en el
metabolismo de TMAO, un factor de riesgo potente para la aterosclerosis (Bennett et al., 2013). El
TMAO se produce por oxidación de la trimetilamina circulante, catalizada por la enzima flavina
monooxigenasa 3 (FMO3). En ratones, la expresión de FMO se suprime dramáticamente por la
testosterona y, por lo tanto, los niveles de TMAO son mucho más bajos en los machos en
comparación con las hembras (Bennett et al., 2013, Kloss et al., 1982). En contraste, los niveles de
expresión de FMO3 hepáticos son similares o solo ligeramente más bajos en hombres que en
mujeres, y los niveles de TMAO en circulación son similares en hombres y mujeres (Tang et al.,
2013).
Figura 1 Genes candidatos de CAD GWAS humanos: enfoque en genes y validados en ratones
El gráfico circular (izquierda) muestra genes candidatos humanos GWAS de CAD agrupados en
aquellos que aún no se han estudiado en ratones (azul), aquellos estudiados en modelos
experimentales con efectos consistentes (verde) o efectos inconsistentes (rojo), y aquellos sin
homólogo humano (blanco). ). El segundo gráfico circular muestra el porcentaje de genes que
contribuyen a los rasgos o funciones asociados con CAD (derecha). Los genes con efectos
pleiotrópicos se ordenan de acuerdo con su contribución más dominante.
Figura 2 Genes candidatos a CAD GWAS humanos que han sido probados en modelos
animales de ratón
Esta gráfica circular muestra una fracción de 244 genes candidatos humanos GWAS de CAD que
se han probado en modelos animales. Los números dentro del círculo representan los 22 pares
autosomas humanos. Los genes candidatos se ordenan de acuerdo con el SNP pico de GWAS. Los
genes marcados de verde ya se han estudiado en modelos de ratones y muestran efectos
significativos en la aterosclerosis. Se estudió la lipoproteína (a) (LPA), que no tiene ortólogo en
ratones, en un modelo de ratón transgénico. El rojo indica que la perturbación experimental del
gen en ratones no mostró un efecto significativo sobre la aterosclerosis. Los genes marcados con
azul son el tema de la investigación en curso en modelos de ratón.
Una forma de visualizar la concordancia de las vías asociadas a la aterosclerosis entre el humano y
el ratón es resumirlas en grupos. Utilizamos un análisis de componentes principales para reducir la
alta dimensionalidad de los datos para agrupar las vías según la superposición de sus genes
constituyentes ( Figura S2 ). En esta representación, cuanto más cerca estén las vías, mayor será el
porcentaje de genes compartidos. Dividimos los grupos de acuerdo con las funciones de sus genes,
con las siguientes categorías: antígeno, apoptosis, cáncer, ciclo celular, adhesión focal, sistema
inmunológico, inflamación, metabolismo de lípidos y lipoproteínas, función y proliferación de las
plaquetas y transcripción.
Problemas de confusión
Al evaluar la relevancia de los estudios en ratones para la CAD humana, hay una serie de posibles
factores de confusión que deben considerarse. A continuación, discutimos brevemente los más
significativos.
Tabla 3 Correlación de conjuntos de genes con el tamaño de la lesión y los lípidos en la sangre
en ratones HMDP
Aorta p valorar a Hígado p valorar a
Genes de aterosclerosis de ratón (827) 202 (24.4%) 2.08E − 109 156 (18.9%) 3.67E − 66
Genes CAD GWAS (244) 66 (27.0%) 5.38E − 36 27 (11,1%) 2.54E − 6
Genes CAD extendidos GWAS (880) 152 (17.3%) 6.17E − 65 98 (11.1%) 1.75E − 25
Adiposo p valorar a Hígado p valorar a
Genes LIPID GWAS (274) 116 (42,3%) 6.21E − 97 126 (46.0%) 3.77E − 111
El nombre y el tamaño de cada conjunto de genes, el tejido en el que se midió la expresión génica y
el número de genes correlacionados significativamente con el tamaño de la lesión en la aorta y el
hígado y con los lípidos en el tejido adiposo y el hígado. Los cálculos se basaron en los niveles de
expresión de genes de ratón.
a Calculado utilizando la prueba exacta de Fisher.
Es probable que centrarse en las rutas patógenas en lugar de los genes individuales sea una forma
más productiva de traducir la información de modelos animales a estudios humanos. De interés
inmediato es determinar con más detalle los factores que regulan estas vías e identificar los tejidos
en los que contribuyen a la aterosclerosis. Además, las rutas convergentes y divergentes entre las
especies reveladas en nuestra revisión comparativa pueden ayudar a guiar la selección de los
modelos apropiados en futuros estudios preclínicos. Además de la progresión de la lesión, algunos
estudios han sugerido una superposición de genes que controlan la regresión de la lesión en ratones
y humanos, lo que sugiere una posible vía para la investigación terapéutica (Ramsey et al.,
2014). Dadas las muchas ventajas de los ratones para estudiar la aterosclerosis, incluido el acceso a
los tejidos y la capacidad de controlar el medio ambiente, los estudios en ratones probablemente
continuarán abriendo el camino hacia la comprensión mecanicista.
Contribuciones de autor
MVS realizó la búsqueda bibliográfica de genes de ratón. Todos los autores participaron en los
análisis de los datos y revisaron críticamente el manuscrito, que fue escrito por MVS, HS y AJL.
Expresiones de gratitud
Este trabajo fue apoyado por subvenciones de la Fondation Leducq ( CADgenomics : Understanding
CAD Genes, 12CVD02), el Ministerio Federal Alemán de Educación e Investigación (BMBF) en el
marco o el concepto de investigación y financiamiento e: Med ( e: AtheroSysMed , subvención
01ZX1313A -2014), el Séptimo Programa Marco de la Unión Europea FP7 / 2007-2013 en virtud
del acuerdo de subvención n. HEALTH-F2-2013-601456 ( CVgenes -at-target), la DFG como parte
de Sonderforschungsbereich CRC 1123 (B2), y NIH otorga HL28481 y HL30568.