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FACULTAD : CIENCIAS AGRARIAS
ESCUELA : AGRONOMIA
CURSO : BIOQUIMICA
CICLO : III
as enzimas son totalmente esenciales para todo ser vivo de ellas dependen una gran cantidad de
reacciones a nivel celular debemos de tomar en cuenta que las enzimas son proteínas que tienen la
capacidad de acelerar la velocidad de reacción de determinado compuesto
Hay muchísimos tipos de enzimas en un organismo vegetal no podríamos mencionar a todas pero
tambien están clasificadas de acuerdo a su modo de acción por tanto se toma en cuenta que si no
existieran las enzimas no se producirían muchísimas reacciones en las plantas y también en nuestro
organismo y estaríamos muertos por tal consecuencia
Por tanto podríamos definir a una enzima como una proteína que tiene la capacidad de acelerar
determinada reacción el cual va a dar en consecuencia un nuevo compuesto el cual en condiciones de
ausencia de la enzima no se podría obtener o tardaría muchísimo en lograrlo
I
as enzimas son moléculas de naturaleza proteica que catalizan reacciones químicas siempre que sea
termodinámicamente posible (si bien pueden hacer que el proceso sea más termodinámicamente
favorable) n estas reacciones las enzimas actúan sobre unas moléculas denominadas sustratos las
cuales se convierten en moléculas diferentes denominadas productos Casi todos los procesos en las
células necesitan enzimas para que ocurran a unas tasas significativas las reacciones mediadas por
enzimas se las denomina reacciones enzimáticas
ebido a que las enzimas son extremadamente selectivas con sus sustratos y su velocidad crece sólo
con algunas reacciones el conjunto (set) de enzimas sintetizadas en una célula determina el tipo de
metabolismo que tendrá cada célula su vez esta síntesis depende de la regulación de la expresión
génica
nzimas egetales
a enzima más importante para la planta es
u
isC
u
isC es la forma abreviada con que normalmente se designa a la enzima cuyo nombre completo
es ribulosa-1 5-bisfosfato carboxilasa oxigenasa sta enzima tiene un doble comportamiento que
justifica su nombre catalizando dos procesos opuestos Primero la fijación del C2 a una forma
orgánica lo que justifica su clasificación como carboxilasa Segundo la fotorrespiración en la que
actúa como oxigenasa del mismo sustrato a u
isC es la proteína más abundante en la biosfera
s la proteína más abundante del planeta su proporción en el estroma alcanza hasta más del 50 % del
total de proteínas Su abundancia se explica debido a que es una enzima relativamente lenta
Su función es la fijación del dióxido de carbono en la fase oscura o biosintética de la fotosíntesis
utilizando el TP y PH producidos en la fase luminosa o fotoquímica para la síntesis de
moléculas orgánicas como la glucosa
u isC de las plantas (izquierda) con 8x2 subunidades y de
bacterias (derecha) con 2 subunidades
structura de la u isC de la plantas
ijación del carbono
a uisC cataliza el primer paso y más significativo del Ciclo de Calvin en concreto de la fijación
del dióxido de carbono a una forma orgánica n la reacción se une una molécula de C2 a la cadena
hidrocarbonada de la ribulosa-15-bisfosfato una pentosa activada energéticamente por la
fosforilación de los dos carbonos situados en los extremos de la cadena través de un estado de
transición de seis carbonos se forman dos moléculas de ácido 3-fosfoglicérico
l ciclo de Calvin y la fijación del C2 por la uisC son propios de todos los organismos
autótrofos o se dan sólo en fotosintetizadores típicos ³como cianobacterias algas eucarióticas y
plantas que realizan la fotosíntesis oxigénica sino también en arqueas y bacterias dotadas de
metabolismos fotosintetizadores o quimiosintetizadores diversos a uisC es responsable de la
producción primaria de la que parte la circulación de energía en la biosfera a reacción de fijación del
carbono es en sí extremadamente ineficiente; y lo es más aún por la competencia con la función de
oxigenasa
structura
a uisC que se observa en los plastos es una proteína oligómera formada por 16 polipéptidos que
son de dos tipos uno grande (subunidad ) y otro pequeño (subunidad S) sta estructura se observa
también en cianobacterias lo que no sorprende ya que al fin y al cabo los plastos eucarióticos derivan
evolutivamente de ellas por endosimbiosis n procariontes distintos de las cianobacterias la uisC
forma agregados más sencillos típicamente de dos subunidades grandes y dos pequeñas
TP sintasa
l complejo TP sintasa también denominada complejo o o 1-TP-sintasa ( = factor de
acoplamiento en inglés coupling factor) es una enzima situada en la cara interna de la membrana
interna de las mitocondrias y de la membrana de los tilacoides de los cloroplastos encargada de
sintetizar TP a partir de P y un grupo fosfato y la energía suministrada por un flujo de protones
(H+) esponde a la síntesis de TP según la hipótesis quimiosmótica de itchell a síntesis de TP
gracias a este enzima se denomina fosforilación oxidativa (mitocondrias) y fotofosforilación
(cloroplastos) a TP sintasa se puede imaginar como un motor molecular que produce una gran
cantidad de TP cuando los protones fluyen a través de ella a tasa de síntesis es grande el organismo
humano en fase de reposo puede formar unas 10 moléculas de TP por segundo ediante
experimentos in vitro se ha demostrado que la TP sintasa actúa de forma independiente respecto a la
cadena de transporte de electrones la adición de un ácido débil (por ejemplo ácido acético) a una
suspensión de mitocondrias aisladas es suficiente para inducir la biosíntesis de TP in vitro
otofosforilación
a fotofosforilación es un proceso de síntesis de TP a partir de P + fosfato llevado a cabo por las
TP-sintasas de la membrana del tilacoide en los cloroplastos de las células vegetales s un proceso
de la fase luminosa de la fotosíntesis en que se utiliza la energía liberada en el transporte de electrones
para bombear protones desde el estroma al interior del tilacoide con el fin de crear un gradiente
electroquímico el cual al disiparse por la salida de protones del tilacoide al estroma a través de las
TP-sintasas acopla esta energía protón-motriz a la fosforilación del P para formar TP a
energía necesaria la proporciona la luz que es captada por los pigmentos fotosintéticos
xisten dos tipos
£c <otofosforilación acíclica stán implicados ambos fotosistemas I y II; el flujo de electrones
que produce no es cíclico por lo que se sintetiza tanto TP como PH
£c <otofosforilación cíclica stá implicado sólo el fotosistema I; se realiza un bombeo de
hidrogeniones del estroma al espacio tilacoidal que contribuye a crear un gradiente
electroquímico de hidrogeniones y por tanto a la síntesis del TP sin que se produzca
PH
!n fotosistema es el conjunto mínimo de los compuestos necesarios para llevar a cabo el proceso de
fotosíntesis s un centro de reacción que se sitúa junto con otros muchos en las membranas de los
tilacoides Permite recibir la energía luminosa y transmitirla a lo largo de una cadena de reacciones
que la transforman en energía química
c as enzimas que producen energía (TP) a partir de la glucosa en las mitocondrias" en el proceso de la
respiración celular o aerobia# enzimas de la glucólisis" de la descarboxilación oxidativa de piruvato a
acetilCo y del ciclo de Krebs$
Piruvato
l piruvato es un compuesto orgánico muy importante en la bioquímica$ s un subproducto del
metabolismo de la glucosa" llamado glucólisis$ %na molécula de glucosa se divide en dos de ácido
pirúvico" que son utilizadas posteriormente para proveer energía" en una de dos formas$ Si hay
suficiente suministro oxígeno" el ácido pirúvico es el inicio de una serie de reacciones llamada ciclo de
Krebs$
Si no hay suficiente cantidad de oxígeno disponible" el ácido entra en una serie de reacciones llamado
metabolismo anaeróbico" creando el ácido láctico en animales (fermentación láctica) y etanol en
plantas (fermentación alcohólica)$ l piruvato proveniente de la glucólisis es convertido en lactato
utilizando la encima lactatodeshidrogenasa y la coenzima H en la fermentación láctica$ n la
fermentación alcohólica es convertida en acetaldehido y luego en etanol$
c as enzimas vegetales responsables de la replicación o duplicación del ( polimerasa) " de la
transcripción ( polimerasa) y la traducción o síntesis de proteínas (peptidil transferasa)$
polimerasa
as polimerasas intervienen en la replicación del para dar a cada célula hija una copia del
original en el proceso de la mitosis $ levan a cabo la síntesis de la nueva cadena de
emparejando los desoxirribonucleótidos trifosfato (d TP) con los desoxirribonucleótidos
complementarios correspondientes del molde$ os d TP que se usan en la replicación del
contienen tres fosfatos unidos al grupo hidroxilo 5' de la desoxirribosa y dependiendo de la base
nitrogenada serán dTP " dTTP" dCTP o dGTP$ a reacción fundamental es una transferencia de un
grupo fosfato en la que el grupo 3'- &H actúa como nucleófilo en el extremo 3' de la cadena que está
en crecimiento$ l ataque nucleofílico se produce sobre el fosfato © (el más próximo a la
desoxirribosa) del desoxirribonucleósido 5' trifosfato que entra' liberándose pirofosfato inorgánico y
alargándose el (al formarse un nuevo enlace fosfodiéster)( diferencia de la mayoría de
procesos biológicos que ocurren en la célula en los que sólo se separa un grupo fosfato (Pi)' durante
la replicación se separan los dos últimos grupos fosfato' en forma de grupo pirofosfato (PP i) (
ste proceso se puede resumir en una ecuación química)
pesar de que la polimerasa sólo tiene un sitio activo para emparejar los cuatro d TPs
diferentes* la unión correcta de los pares de bases T* CG es posible basándose en la geometría de
éstos si la unión es incorrecta se produce un desplazamiento del fosfato © haciendo más difícil su
unión al extremo 3'-+H y ralentizando así el ritmo de catálisis, lo que da lugar a que la
polimerasa añada preferentemente las bases correctas-
as polimerasas pueden añadir hasta 1000 nucleótidos por segundo- sto es debido a su
naturaleza procesiva, es decir, el número de nucleótidos que son capaces de añadir cada vez que se
asocian al molde de que van a copiar- ado que la adición de los nucleótidos es un proceso que
dura unos milisegundos, la velocidad de catálisis va a depender del tiempo que la polimerasa
permanece unida al esto es de su procesividad-
l crecimiento de la cadena se produce en dirección 5' 3' ya que se requiere de un grupo 3'- +H
libre para el inicio de la síntesis puesto que éste es el que realiza el ataque nucleofílico sobre el fosfato
© del d TP de forma que las polimerasas requieren de un iniciador 3'-+H (que puede ser de
o ) llamado cebador que es sintetizado por la primasa- l extremo 3' del cebador se
denomina extremo cebador-
as polimerasas también realizan otras funciones durante el proceso de replicación- demás de
participar en la elongación desempeñan una función correctora y reparadora gracias a su actividad
exonucleasa 3' que les confiere la capacidad de degradar el partiendo de un extremo de éste- s
importante que existan estos mecanismos de corrección ya que de lo contrario los errores producidos
durante la copia del darían lugar a mutaciones-
polimerasa
as -polimerasas son un conjunto de proteínas con carácter enzimático capaces de polimerizar
los ribonucleótidos para sintetizar a partir de una secuencia de que sirve como patrón o
molde- a polimerasa más importante es la implicada en la síntesis del mensajero o
transcripción del
a polimerasa es la enzima soluble conocida de mayor tamaño puesto que mide unos 100 Å de
diámetro y es visible en micrografías electrónicas donde se observa unida al promotor en el
<unciones
a reacción química que cataliza la polimerasa consiste en la unión de ribonucleótidos
trifosfato adenosín trifosfato (TP) uracilo trifosfato ( .TP) guanina trifosfato (GTP) y citosina
trifosfato (CTP) liberándose los grupos fosfato
demás de la polimerización de los ribonucleótidos trifosfato la polimerasa tiene otras
funciones como
polimerasa en procariotas
n procariotas la misma enzima cataliza la síntesis de todos los tipos de m r y t
a polimerasa en procariotas en una gran molécula Para unirse a regiones promotoras
específicas la holoenzima requiere un factor con el que se reduce enormemente la afinidad con
regiones de inespecíficas aumentando la especificidad por regiones promotoras para formar la
holoenzima de cinco subunidades ©2' (~480 ka) a estructura de la polimerasa presenta
una ranura de 55 Å de longitud y una anchura 25 Å sta ranura permite el paso de la doble hélice de
que mide 20 Å a longitud de 55 Å puede aceptar la secuencia de 18 nucleótidos
Todas las unidades que forman la enzima funcionan conjuntamente para llevar a cabo las reacciones
de transcripción a subunidad ' participa en la unión del la subunidad contiene parte del
centro activo y la subunidad está implicada principalmente en la iniciación de la transcripción
disociándose del resto de la enzima una vez iniciada la transcripción
as polimerasas de los organismos procariontes funcionan de forma análoga aunque alguna
subunidad de la proteína difiera en su composición
[editar] polimerasa en eucariotas
as células eucariotas existen tres tipos de polimerasa cada uno especializado en síntesis de
determinados
Peptidil transferasa
a enzima peptidil transferasa es una aminoacil transferasam que realiza la función esencial de los
ribosomas Se encarga de la formación de enlaces peptídicos entre aminoácidos adyacentes durante la
traducción de mensajero y por tanto la síntesis proteica o obstante estas enzimas están
implicadas también en procesos no relacionados con la traducción
a peptidil transferasa es una ctividad enzimática presente en los ribosomas que cataliza la
formación de un enlace peptídico entre un nuevo aminoácido y la cadena peptídica naciente
participa en el proceso la síntesis de proteína; bueno se sabes que en el mecanismo de síntesis de
proteínas ocurre en dos etapas la transcripción y la traducción; sta fase ocurre en el citoplasma y
requiere de tres etapas llamadas inicio alargamiento y terminación
c largamiento sta etapa la podemos describir con ayuda de los siguientes puntos
£c n esta etapa el ribosoma empieza a leer los tripletes del m e inicia la formación del
polipéptido
£c l inicio de esta etapa el segundo codón del m se encuentra en el sitio o aminoacil de
la subunidad mayor
£c n t con un anticodón complementario lleva al aminoácido correspondiente hasta el
interior del ribosoma y lo ubica en el sitio en el lugar que le corresponde de acuerdo al
mensaje del m
£c Cuando los sitios p y a están ocupados una enzima llamada peptidil transferasa forma un
enlace entre los dos aminoácidos espués de esto el primer t es liberado
£c Posteriormente el ribosoma se mueve un codón a lo largo de la cadena del m y entra el
siguiente triplete; el ribosoma lo lee y un t específico se encarga de ubicar al aminoácido
dentro del sitio se forma el enlace entre este aminoácido y el anterior y se libera uno de los
t
£c l ribosoma continúa leyendo y traduciendo el mensaje hasta que recorre toda la fibra del
m
n resumen su importancia radica en que se encarga de romper o catalizar la formación de los enlaces
pépticos para permitir la traducción
a lista de las enzimas puede ser interminable pero aquí están las que son más importantes para las
plantas
C~ CSI~ S
c as enzimas son catalizadores de origen biológico que cumplen muchos requisitos para impulsar
nuevas industrias químicas
c a tecnología enzimática tiene múltiples aplicaciones como fabricación de alimentos los progresos
que están realizando actualmente la ingeniería genética y la biotecnología permiten augurar el
desarrollo cada vez mayor del uso de las enzimas
c a utilización de enzimas en los alimentos presentan una serie de ventajas porque la mayoría proviene
de los vegetales
c as enzimas utilizadas dependen de la industria y del tipo de acción que se desee obtener