TRABAJO DE BIOINFORMATICA DEL 26-11-2018

ALDO FRANCISCO MORALES ORCCOTTOMA. MAESTRIA EN BIOTECNOLOGIA. CODIGO: 17047047

1° Buscamos en google: mirbase

2. Luego buscamos: miRNA 122

3. Para nuestro caso: Homo sapiens

4. Buscamos get sequence del mnu-mir-122 en mir base

5. Identificamos las referencias bibliográficas relacionados al miRNA

6. 4. Buscamos get sequence del mnu-mir-122 en mir base

>mmu-mir-122 MI0000256
AGCUGUGGAGUGUGACAAUGGUGUUUGUGUCCAAACCAUCAAACGCCAUUAUCACACUAAAUAGCU
Para la Secuencia precursora reemplazamos los U por T
7. Predicción de estructuras secundarias: usamos la herramienta RNAfold

8. Introducimos: AGCUGUGGAGUGUGACAAUGGUGUUUGUGUCCAAACCAUCAAACGCCAUUAUCACACUAAAUAGCU
Para la Secuencia precursora reemplazamos los U por T

9. MODIFICAMOS LAS OPCIONES DE HERRAMIENTAS

10. SEGUIMOS MODIFICANDO ESAS OPCIONES DE BUSQUEDAS

11. TOMAMOS EL formato viena

11. TOMAMOS EL formato CT

13. Obtenemos las estructuras secundarias

14. Vista en forna

15. VISTA COLOREADA:

16. Movemos con el cursor

17. Guardamos la imagen

18. Añadimos moléculas

19. Editamos la distribución

20. Base: AGCUGUGGAGUGUGACAAUGGUGUUUGUGUCCAAACCAUCAAACGCCAUUAUCACACUAAAUAGCU

Modificado:

AGGGGUGGAGUGUGACAAUGGUGUUUGUGUCCAAACCAUCAAACGCCAUUAUCACACUAAAUAGCU

21. Ubicación en ruta metabólica en KEGG

22. Ubicación en ruta metabólica en KEGG del miRNA-122

23. Ubicación en ruta metabólica en KEGG del miRNA-122

23. En otras especies

24. En el ncbi