Aminoácidos

• Importancia biomédica, estructura y función

de los aminoácidos
• Clasificaciones
• Propiedades fisicoquímicas: carbono
asimétrico, isomerías, anfoterismo, punto
isoeléctrico, solubilidad y enlace peptídico.
Aminoácidos
• Se han descrito >300 aminoácidos, solo 20 (L-
α-aminoácidos) forman parte de las proteínas en los
vertebrados.

alanine
Aminoácidos
● Los seres humanos y otros animales superiores
carecen de la capacidad para sintetizar 10 de los 20 L-
α-aminoácidos comunes en cantidades adecuadas
para apoyar el crecimiento de lactantes o para
mantener la salud en adultos.

L tyrosine
Aminoácidos
● En consecuencia, la dieta del ser humano debe
contener cantidades adecuadas de estos
aminoácidos esenciales desde el punto de vista
nutricional.
*
Aminoácidos
• Muchas bacterias elaboran péptidos que contienen tanto
D-α-aminoácidos como L-α-aminoácidos, varios de los
cuales poseen valor terapéutico, entre ellos los
antibióticos bacitracina y gramicidina, y el agente
antitumoral bleomicina.
Enantiómeros, todos los aminoácidos en las proteínas de los humanos son L
• Además de ser moléculas necesarias para la
síntesis de proteínas, los aminoácidos cumplen
diversas funciones en el organismo.
• Transmisión nerviosa y la biosíntesis de
porfirinas, purinas, pirimidinas y urea.

• Estructura:
• A pH fisiológico el grupo carboxilo se disocia:

COOH ➔ COO- + H+

• El grupo amino se protona:

NH2 ➔ NH3+
Formación del enlace peptídico
Clasificación de los aminoácidos

• La naturaleza de sus cadenas laterales (R)

• Método de obtención

• Posición de su grupo amino

Aminoácidos con cadenas laterales
apolares (no polares)

• Las cadenas laterales no ganan ni pierden

electrones.
• No forman puentes de hidrógeno ni
enlaces iónicos.
• Localización en las proteínas: en proteínas
en solución se agrupan en la parte interior,
mientras que en proteínas de membrana
interactúan con lípidos.
Aminoácidos con cadenas laterales
polares sin carga

• Tienen carga neta de cero a pH fisiológico.

• Ser, Thr y Tyr tienen un grupo OH
• Asn y Gln tienen un grupo carbonilo y un
grupo amida
• Cys tiene un grupo SH
 Aminoácidos con cadenas laterales
ácidas
• Asp y Glu son donadores de protones
• A pH fisiológico se ionizan totalmente

Aminoácidos con cadenas laterales

básicas
• Sus cadenas laterales aceptan protones
• A pH fisiológico, Lys y Arg se ionizan totalmente
• His base débil
Método de obtención

*
Código de 1 letra Código de 3 letras Aminoácido
A Ala Alanina
C Cys Cisteina
D Asp Ácido Aspártico
E Glu Ácido Glutámico
F Phe Fenilalanina
G Gly Glicina
H His Histidina
I Ile Isoleucina
K Lys Lisina
L Leu Leucina
M Met Metionina
N Asn Asparagina
P Pro Prolina
Q Gln Glutamina
R Arg Arginina
S Ser Serina
T Thr Treonina
V Val Valina
W Trp Triptófano
Y Tyr Tirosina
Posición de su grupo amino
 Propiedades fisicoquímicas: anfoterismo, punto isoeléctrico, solubilidad y
enlace peptídico.

• Carbono asimétrico: es un átomo de

carbono que está enlazado con cuatro
sustituyentes diferentes.
 Excepciones

Glicina: 2 Hidrógenos unidos a su carbono α Prolina: iminoácido

 Isomería
• Dado que el carbono α está unido a cuatro
grupos químicos distintos, tiene la
propiedad de ser asimétrico o quiral.
• Los aminoácidos con carbono α quiral
existen en dos formas químicas distintas
denominadas D y L.
 Anfoterismo

• El comportamiento anfótero se refiere a

que, en disolución acuosa, los aminoácidos
son capaces de ionizarse, dependiendo del
pH, como un ácido (cuando el pH es
básico), como una base (cuando el pH es
ácido) o como un ácido y una base a la vez
(cuando el pH es neutro).
Titulación del ácido acético

HA H+ + A-
Ácido débil Protón Base conjugada

[H+] [A-]
Ka =
[HA]

[A-]
pH = pKa + log
[HA]
Formas iónicas de alanina en soluciones
ácidas, neutras y básicas

[H+] [II] [II]

K1 = pH = pK1 + log
[I] [I]
Curva de titulación de la alanina
 Proteínas

• Importancia biomédica, estructura y función de las

proteínas.
• Clasificaciones: simples y conjugadas; estructurales y
funcionales.
• Niveles estructurales: primaria, secundaria, terciaria,
cuaternaria y supramolecular.
• Desnaturalización y factores que la inducen.
Importancia biomédica, estructura y
función de las proteínas

• El término proteína deriva del griego

"proteos”.
• Constituyen el 50% del peso seco de la
célula (15% del peso total) por lo que
representan la categoría de biomoléculas
más abundante después del agua.
Oligopéptido: menos de 10 aminoácidos.
Polipéptido: más de 10 aminoácidos.
Proteína: más de 100 aminoácidos.
Fibrillas de colágeno en la piel
Modelo de superficie de la hormona del
crecimiento del humano
Estructura cuaternaria de la
hemoglobina
• Sin embargo su gran importancia biológica
reside en el elevado número de funciones
biológicas que desempeñan, y sobre todo en la
particular relación que las une con los ácidos
nucleicos, ya que constituyen el vehículo
habitual de expresión de la información
genética.
 Observaciones que no encajan en
este esquema
• Howard Ternin y otros demuestran que los virus
de RNA, pueden emplear su propio RNA para
sintetizar DNA.
• Existen distintos tipos de virus de RNA (dsRNA,
ssRNA +, ssRNA -, ssRNA RT) algunos son capaces
de replicar su propio RNA sin necesidad de
retrotranscribilo antes.
• Priones: Término acuñado por Stanley B.
Prusiner al investigar una serie de enfermedades
de carácter crónico e irreversibles que afectaban
al sistema nervioso central.
Estructuralmente está constituida
por α-hélices

Estructura primaria idéntica a la

proteína normal, por modificaciones
post-traduccionales (formación de
radicales SH y de puentes disulfuro)
hay un plegamiento anormal de la
proteína y se forman hojas β
plegadas.
Propuesta actual del Dogma Central de
la Biología Molecular
 Clasificación
• Por su composición química, las proteínas se
clasifican en dos clases:
– Las proteínas simples u holoproteínas son las que
están compuestas exclusivamente por aminoácidos.

– Las proteínas conjugadas o heteroproteínas son las

que están compuestas por aminoácidos y otra
sustancia de naturaleza no proteica que recibe el
nombre de grupo prostético.
 Clasificación

• Estructurales: son el tipo más abundante de entre

todos los tipos de proteínas de nuestro
organismo. Normalmente tienen estructura
fibrilar, proporcionan protección o sostén.

• Funcionales: intervienen en procesos químicos,

metabólicos y de transporte en el organismo, por
ejemplo hormonas, receptores y enzimas.
Niveles estructurales
• Estructura primaria: Es la
secuencia peptídica de una
proteína.
• Enfermedades genéticas con
sustituciones de aminoácidos
pueden resultar en plegamientos
inadecuados de proteínas y
perdida de la funcionalidad.
Niveles estructurales
• Estructura secundaria: es el
plegamiento que la cadena
peptídica adopta gracias a la
formación de puentes de
hidrógeno entre los átomos que
forman el enlace peptídico.
• α-hélices: mantiene su forma
por la presencia de los
puentes de hidrógeno que se
forman entre los átomos de
oxígeno del grupo carbonilo
de un aminoácido y el átomo
de hidrógeno del grupo amino
de otro aminoácido situado a
cuatro aminoácidos de
distancia en la cadena.
• Es una estructura anfipática porque posee
una parte hidrofílica y una parte
hidrófoba, lo que produce el
enrollamiento de esta estructura, de
manera que la parte hidrófoba no
interactúe con el agua.
• Hojas β plegadas:

Se forma por el posicionamiento paralelo de

dos cadenas de aminoácidos dentro de la
misma proteína, en el que los grupos N-H de
una de las cadenas forman enlaces de
hidrógeno con los grupos C=O de la opuesta.
Tiene naturaleza hidrofóbica.
 Estructuras supersecundarias
• Motivos: Las proteínas globulares se
forman por combinación de elementos
estructurales que constituyen patrones
definidos.
Niveles estructurales

• Estructura terciaria: Es la
disposición tridimensional de
todos los átomos que
componen la proteína y es
responsable directa de sus
propiedades biológicas.
• Dominios: unidades
estructurales funcionales.
Ejemplos de dominios
 Interacciones que estabilizan la
estructura terciaria
• Puentes disulfuro: enlace covalente
formado por dos grupos sulfidrilo (-SH),
cada uno de ellos perteneciente a un
residuo de cisteína, se unen de manera
covalente para formar un residuo de
cistína
 Interacciones que estabilizan la
estructura terciaria
• Interacciones hidrofóbicas: Los
aminoácidos con cadenas laterales no
polares tienden a localizarse en el interior
de la proteína, en donde se asocian con
otras cadenas no polares, mientras que los
aminoácidos polares suelen localizarse en la
superficie de la proteína, para que la
estructura resultante sea lo más estable
posible.
Interacciones hidrofóbicas
 Interacciones que estabilizan la
estructura terciaria
• Puentes de hidrógeno: Las
cadenas laterales de aminoácidos
que contienen H unido a O2 o a N
pueden asociarse con átomos ricos
en electrones
• Interacciones iónicas: Grupos con
carga negativa en las cadenas
laterales de los aminoácidos
pueden interactuar con grupos de
carga positiva de otros
aminoácidos.
 Plegamiento de proteínas
• Todas estas interacciones determinan
el plegamiento de una proteína ➔
Estructura 3D

• Proteínas chaperonas: función de

estabilizar las proteínas desplegadas,
desplegarlas para su translocación a
través de membranas o para su
degradación, y/o ayudarlas para su
correcto plegamiento y ensamblaje
 Plegamiento inadecuado de
proteínas

• Proteínas mal
plegadas
normalmente son
degradadas.
 Trastornos asociados al plegamiento
erróneo de proteínas
• Depósitos de placa amiloide. Agregados de
β-amiloide son neurotóxicos.

• Enfermedades por priones. Encefalopatías

espongiformes transmisibles.
– Enfermedad de las vacas locas
– Scrapie
 Enfermedades por priones en humanos

• Kuru: En lenguaje de tribus nativas de Nueva Guinea

significa “temblor con fiebre” causada por un prion
transmitido por la ingestión de tejidos cerebrales de
personas difuntas con la intención de adquirir la sabiduría
durante los ritos funerarios.
• El insomnio familiar fatal es una enfermedad hereditaria
muy rara. Es de herencia autosómica dominante y está
originada por una mutación en el codon 178 del gen PRNP
situado en el cromosoma 20 humano.
Provoca una degeneración cerebral que afecta al tálamo y
provoca insomnio persistente, deterioro de memoria,
dificultad para moverse y finalmente coma.
 Estructura Cuaternaria de las
proteínas

• Se forma mediante la unión de enlaces débiles de

varias cadenas polipeptídicas con estructura
terciaria para formar un complejo proteico.
• Las interacciones no covalentes que mantienen
esta estructura son las mismas interacciones no
covalentes que mantienen la estructura terciaria:
puentes de Hidrogeno, interacciones ionicas,
atracciones hidrofobicas y fuerzas de Van der
Waals.
• Para tener una estructura cuaternaria:

a) La proteína debe estar formada por mas de

una cadena peptídica.
b) Las cadenas peptídicas que la forman no
pueden estar unidas por enlaces covalentes
entre ellas.

Ejemplos: Hemoglobina, mioglobina e insulina

 Estructura supramolecular

• En muchos casos, las proteínas se agrupan

entre sí, y/o con otros grupos de
biomoléculas para formar estructuras
supramoleculares de orden superior y que
tienen un carácter permanente.
 Estructura supramolecular de proteínas
• Las proteínas α y β-tubulina forman dímeros que
se ensamblan para constituir filamentos largos
llamados microtúbulos
 Estructura supramolecular de
proteínas y otras biomoléculas

• Cuando las proteínas se asocian con ácidos

nucleicos pueden originar asociaciones
supramoleculares como los ribosomas,
nucleosomas o virus.
• Cuando las proteínas se asocian con lípidos
pueden originar asociaciones supramoleculares
como las lipoproteínas del plasma sanguíneo y las
membranas biológicas.
• Cuando las proteínas se asocian con azúcares
pueden originar asociaciones
supramoleculares como los proteoglicanos o
los peptidoglicanos.
 Desnaturalización

• Se llama desnaturalización de las proteínas

a la pérdida de las estructuras de orden
superior, quedando la cadena
polipeptídica reducida a un polímero sin
estructura tridimensional fija.
• Causas:
– Factores físicos: Temperatura
– Agentes químicos: Disolventes orgánicos,
detergentes, pH.

• Efectos:
– Cambio en la viscosidad
– Disminución de la solubilidad
– Perdidas de las propiedades biológicas
 Enzimas
• Proteínas que catalizan reacciones químicas
en los seres vivos, siempre y cuando sean
termodinámicamente posibles.
• 6 clases principales
L ascorbic acid